BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg473583
Length=4710
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G34260.1 | Symbols: FAB1D | FORMS APLOID AND BINUCLEATE CELL... 7164 0.0
> AT1G34260.1 | Symbols: FAB1D | FORMS APLOID AND BINUCLEATE CELLS
1A | chr1:12485967-12492169 FORWARD LENGTH=4741
Length=4741
Score = 7164 bits (3879), Expect = 0.0
Identities = 4465/4744 (94%), Gaps = 55/4744 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACGCCTACTGAGTCTTTGTCTAGTAGTGAACGCTCTCTTTCTGGTGAGTGTTCGGTT 60
||||| ||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGACTCCTTCTAATTCTTTATCTAGCAGTGAACGCTCTCTCTCTGGTGAGTGTTCTGTT 60
Query 61 GATGGAAA------TGATAGGGGTAATGAAGATGAATGTTCAAGTCATAGTAGTC---AA 111
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 61 GATGGAAACTCTTGTGATAGGGGTATTGAAGATGAATGTTCAAGTCATAGTAGTCAAGAA 120
Query 112 GA--T-G-A-T----ATGGAGCATAAGGTAGATCGGTTAGAGCGTAAGTCCAAGAGCATG 162
|| | | | | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 GATGTGGAATTAACGAAGGAGGTTAAGGTAGATCGGTTAGAGCGTAAGTCGAAGAGCATG 180
Query 163 CCGAGTGACATTCTAGATATTTTGGATGAAAAATCGAAAGGAAATGGTGTTGAGAATGTG 222
|||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 181 CCGAGTGATATTCTCGACATTTTGGATGAGAAATCGAAAGAAAACAGTGTTGAGAATGTG 240
Query 223 CAGTTCTTATCTGATCGGGAAGATGATAGTGATGATGTTCCAGTTTGGGAGCCTCCGGAA 282
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 241 CAGTTTTTATCTGATCGTGAAGATGATAGTGATGATGTTCCAGTTTGGGAGCCACCTGAA 300
Query 283 CCGGAAAATCCAGAAGATGAAGTAGATGGAGTTTTTGCCGATGATGATGATGATTGCTGT 342
|||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 301 CCGGAAAATCCAGAAGATGAGGTGGATGGTGTTTTTGCTGATGATGATGATGATTGTTGT 360
Query 343 GATGGCTCTAAGTGGAACAAAGCAAGTTTATTAGGGGAATTGAGTGAGGAAAGTAGTGAA 402
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 361 GATGGTTCTAAGTGGAACAAAGCAAGTTTGTTAGGGGAGTTGAGTGATGAAAGTAGTGAA 420
Query 403 AAGAGAAAGGTTTATGAAGAAAATCGAAGAGTGATGCTTGAGGAGGCAGATTCAAAGTTT 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 421 AAGAGAAAGGTTTATGAAGAAAATCGAAGAGTGATGCTTGAGGAGGCTGATTCAAAGTTT 480
Query 463 AAGTTCATTGTTAGTCACCTTATTAAGTCGGCTGGGTTGTCTATAGAAGAAAGTGGATAT 522
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 481 AAGTTCATTGTTAGTCAGCTTATTAAGTCGGCTGGGTTTTCTATTGAAGAAAGTGGATAT 540
Query 523 TGGATAGAGATTGTTGCTAGGTTATGCTGGGAGGCTGCTTCAATGTTGAAGCCAGCTATT 582
||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGGTTTGAGATAGTTGCTAGGTTATGCTGGGAGGCTGCTTCTATGTTGAAGCCAGCTATT 600
Query 583 GACGGCAAATCTGTTGATCCTACTGAGTACATCAAAGTGAAATGCATAGCAACTGGTTCT 642
||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GACGGCAAATCAGTTGATCCCACTGAGTATATCAAAGTGAAATGCATAGCAACTGGTTCT 660
Query 643 TGCATTGACAGTGAAGTTTTCAAAGGCCTTGTTTTCAAGAAACATGCCGCTCTTAAACAC 702
||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 661 TGCGTTGACAGTGAAGTTTTCAAAGGCCTGGTTTTCAAAAAACATGCTGCTCTTAAACAC 720
Query 703 ATGGCAACTAAGTATGATCATCCTAGAATAATGTTAGTCGAAGGAGTACTGGGTCATCCG 762
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATGGCAACTAAGTATGAGCATCCTAGAATAATGTTAGTCGAAGGAGTACTGGGTCATCCG 780
Query 763 ATAAGTGGGTTTTCGTCTCTCCAATCAGTGAATCAGGACAATGATTATCAACTGAAGTAT 822
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 781 ATAAGTGGATTTTCGTCTCTCCAATCAGTGAATCAGGACAATGAGTATCTACTGAAGTAT 840
Query 823 GTGAAGCCTGTTGTTGATATCATAGAAGCTTCCAAGCCGGACGTCATGCTGGTGGAAAAG 882
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 841 GTGAAGCCTGTTGTTGATATCATAGAAGCTTCCAAGCCTGACGTGATGCTGGTGGAAAAG 900
Query 883 TCTGTTTCACGTGATATCCAAAAGTCTATTCTTGATAAAGGGGTCACTCTAGTGTTTGAC 942
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 901 TCTGTTTCACGTGATATCCAAAAGACTATTCTTGATAAAGGGGTCACTCTGGTGTTTGAC 960
Query 943 ATGAAGCTCCACCGTCTACAGAGAATTTCTCGATGCATTGGTTCACCAATT-TTGTCAGT 1001
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 961 ATGAAGCTCCACCGTCTACAGAGGATTTCTCGATGCATTGGTTCACCAATTCTT-TCAGT 1019
Query 1002 TGACTCTCTGTCTAGTCAGAAGTTAAAGCATTGTGATTCCTTTCGCATCGAGAAAATAGT 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1020 TGACTCTCTGTCTAGTCAGAAGTTAAAGCATTGTGATTCCTTTCGTATCGAGAAAATTGT 1079
Query 1062 TGAGGAGCATAATGCTATGGGCGAATCCGAGAAGAAGCCAACTAAGACGCTGATGTTTTT 1121
|||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1080 CGAGGAGCATAATGCCGCGGGTGAATCCGACAAGAAGCCAACTAAAACACTGATGTTTTT 1139
Query 1122 AGAGGGTTGCCCTACCCGCCTTGGCTGCACGATTTTACTTAAAGGATGCCACAGTGATAG 1181
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1140 AGAGGGTTGCCCTACCCGCCTTGGCTGCACGATTTTACTTAAAGGATGCCACAGCGAGAG 1199
Query 1182 GTTGAAAAAGGTCAAAGAAGTAGTTCAATATTCATTTATCATGGCATATCATCTAATGCT 1241
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GTTGAAAAAGGTCAAAGAAGTAGTACAATATTCATTTATCCTGGCATATCATCTAATGCT 1259
Query 1242 GGAGGCCTCTTTCCTTGCTGATCGGCATACAATGTTCTCAACCATCTTTACAAAGGAATC 1301
|||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
Sbjct 1260 GGAGGCTTCTTTCCTCGCTGACCGGCATACAATGTTCTCAACCATCTTTGCAAAAGAAGC 1319
Query 1302 TACATCATGTGTTGTGGATGTGGAAATTGAAAAACTTCCACTATCTCCTTCTCCTCGTGT 1361
||||||| || ||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct 1320 TACATCA--TG-TGT---TGTGGAAATAGAAAATTTTTCACCATCTCCTTCTCCTCGTGA 1373
Query 1362 ATCTGCCTCTGAAGCAGTTGATATTCCAGTGTATAATGGATTCGATGAACAATCTATTCA 1421
|||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1374 ATCTCCCTCTGAAGCAGTTGATATTCCTGTGTCTAATGGATTCGATGAACAAACTATTCA 1433
Query 1422 GATAAATGGGGAAGCAGATGGTGAGAAAGTTGGAACTTGGGAATCAGATGGAGATCATGT 1481
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 GATTAATGGGGAAGCAGATGGTGAGAAAGTTGGAACTTGGGAATCAGATGGAGATCATGT 1493
Query 1482 GTTCTCTCACGAGCCATATAATCCAGTTATTTTCACTGGGTTCTCATCTTTATCTGCCAG 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 GTTCTCTCACGAGCCATATAATCCAGTTATTTTTACTGGGTTCTCATCTTTATCTGCCAG 1553
Query 1542 ATTAAGTAAATATTTAGGCTTTGTTCAAAATCCGGAGTCAGTTCCAGTTTCTGTGGATAA 1601
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 ATTAAGTAAATATTTAGGCTTTGTTCAAAATCCGGAGTCAGTTCCAGTTTCTGTGGATAC 1613
Query 1602 AGATGTATCGAATGTCAGCAATCTTGATTCGATAAGGGAATCTGCGGAAGATACTGAAGA 1661
||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1614 AGATGTATCGACTACCAGCAATCTTGATTCGATTAGGGAATCTGAGGAAGATACTGCAGA 1673
Query 1662 AAAGAATGAGGATAAACAACCAATGTTATTTGATCCTGAGATTCCAGTAAACTCGAGTTC 1721
||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 1674 AAAGAATGAGGATAAACAACCTCTTTTACTTGATCCTGAGCTCCCAGTAAACTCGAGTTC 1733
Query 1722 AGAAGATGGAG---ACAAGTCGCAAACGGAGAATGATATTGAGAGCACCTTGGAGTCTCA 1778
||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 AGATGATGGAGACAACAAGTCGCAAACGGAAAATGATATTGAGAGCACCTTGGAGTCTCA 1793
Query 1779 GAGTATATTGGTCTTAGTGTCAAAGAGGAATACCCTTAGGGGGATAATGTGTGACCAAAG 1838
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1794 GAGTATATTGGTTTTAGTGTCAAAGAGGAATGCCCTCAGGGGGATAATGTGTGATCAAAG 1853
Query 1839 GCATTTTTCACACATTAAGTTTTACAAACACTTTGATGTTCCCTTGGAAAAATTCCTGCG 1898
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 GCATTTTTCACACATCAAGTTTTACAAGCACTTTGATGTTCCCTTGGAAAAATTCCTGCG 1913
Query 1899 CGATATGTTTAATCAGAGAAACCTATGCCAAACGTGCAATGAATTTCCGGAGGCACATCT 1958
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||
Sbjct 1914 CGATATGTTTAATCAGAGAAATCTATGCCAAACGTGTGTTGAATTTCCAGAAGCACATCT 1973
Query 1959 TTACTATTATGCTCATCAAAATAAGCAACTAACAATCCAAATCAAGCGAATTCCGGTAGC 2018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1974 TTACTATTATGCTCATCAAAATAAGCAACTAACAATCCAAATCAAGCGAATTCCAGTAGC 2033
Query 2019 AAAAGGTTTGTCTGGTGAAGCAAAAGGAAAAATCTGGATGTGGAGTCGTTGTGGAAAGTG 2078
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 AAAAGGTTTGGCTGGTGAGGCAAAAGGAAAAATCTGGATGTGGAGTCGTTGTGGAAAGTG 2093
Query 2079 TAAAACAAAGAATTCGTCCCGGAAATCAACAAAACGAGTGCTGATATCAACTGCTGCTCG 2138
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 TAAAACAAAGAATGCGTCCCGGAAATCCACAAAACGAGTGCTGATATCAACTGCTGCTCG 2153
Query 2139 TAGCTTGTCATTTGGAAAGTTTTTGGAGCTCAGCTTTTCTCAGCACACTTTTCTGAATAG 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2154 TAGCTTGTCATTTGGAAAGTTTTTGGAGCTCAGCTTTTCTCAGCAAACTTTTCTGAACAG 2213
Query 2199 ATCATCTAGCTGTGGGCACTCTTTCGACAGTGACTTCCTTCACTTCTTTGGATTAGGCTC 2258
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 ATCGTCTAGCTGTGGGCACTCTTTCGACAGTGACTTCCTTCACTTCTTTGGATTAGGCTC 2273
Query 2259 CATGGTTGCTATGCTCAGTTACTCCCAAGTCACATCCTACACAGTGTCTCTGCCACCCAT 2318
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2274 CATGGTTGCTATGCTCAGTTACTCCCAAGTCGCATCCTACACAGTGTCTCTACCACCCAT 2333
Query 2319 GAAGCTGGAATCTAGCATTTTAATAAAAGCTGGTTGGCTTGAGAAAGAATTCCAAATAGT 2378
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 2334 GAAGCTGGAATCTAGCATTTTAATAAAAGCAGGTTGGCTTGAGAAAGAATTTCAAACAGT 2393
Query 2379 ATTCACTAAAGGGATCTCTTTGTTCGGA-GACGCTACTGGTTTTCTTAAGAGACTAAGAT 2437
|||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 ATTCACTAAAGGGATCTCCTTGTTC-GAGGACGCTGCTGGTTTTCTTAAGAGACTAAGAT 2452
Query 2438 CACAATT--C-AATTCAGATCTCAGATATCAGCGTGCACACAAACTCCTTTCTAACATTG 2494
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 CACAATTCACAAATTCAGATCTCAGATATCAGCGTGCACGCAAACTCCTTTCTAACATTG 2512
Query 2495 AGGAGTTGCTGAAGCACGAGCGTCGCGTATTTGAGGAAAACATCAAGAACTCGTTTGACA 2554
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2513 AGGAGTTGCTGAAGCACGAGCGTTGCATATTTGAGGAAAACATCAAGAACTCGTTCGACA 2572
Query 2555 AGGCTAAAACCATAGATGATGTTTCACACAGACTGCTCCGCTTAAACCGCATGAGGTGGG 2614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 AGGCTAAAACCATAGATGATGTTTCACACAGACTGCTCCGCTTAAACCGCATGAGGTGGG 2632
Query 2615 AACTTCTGCTTCAAGCTCTCATCTGGAACTATCGGTTACAGTCGCTTGTTTTATCTGATC 2674
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2633 AACTTCTGCTTCAAGCTCTCATCTGGAACTACCGGTTGCAGTCGCTGGTTTTATCTGATC 2692
Query 2675 GTTTGCTACCTTCAAATGATGAGACGGAGATAAATGAACAAGGTTTGAAGACTGTTTCCG 2734
||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 GTTTGCTACCTTCAAGTGATGAGACGAAGATATATGAACAAGGTTTGAAGACTGTTTCCG 2752
Query 2735 AGGCTGGAATGACCAGATATGAAAATGATGACAAAGTTTCTGATTCTGGTAGCAATGGAG 2794
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 AGGCTGGAATGACCAGATATGAAAATGATAACAAAGTTTCTGATTCTGGTAGCAATGGAG 2812
Query 2795 TCATGGACACTCCAGTTGTTGAAGACAAAGATATACCAATCGCTGGAGCGTCTGTTGGGG 2854
||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GCATAGACACTCCACTTGTTGAACACAAGGATATACCAATCGCTGGAGCGTCTGTTGGGG 2872
Query 2855 ACAATGTTCAGATGGAAGAATCGTATGTGCCTGAAGACAATGAATCACAAACTTTGCGCA 2914
|||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2873 ACAATGATCAGATGGCAGAATCCTATGTGCCTGAAGATAATGAATCGCAAACTTTGTGCA 2932
Query 2915 GCTCCAGTCCCGATTCAACCTCTCCCATCAACAATCATTTCGACACTCATTTGGCTGTTA 2974
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2933 GCTCCAGTCCCGATACAACCTCTCCCATCAACAATCATTTTGACACTCATTTGGCTGTTA 2992
Query 2975 ATGTCCATTCAACCAATGGAAAAGAAGCGGACAAATCAATTCCAGTTACTGGAGATTCAT 3034
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2993 ATGTACATTCAACCAATGGACAAGAAGCGGACAAATCAATTCCAGTTACTGGAGAGTCTT 3052
Query 3035 TGGATGATGAGGTTGCTACCTCTAATGGGCCATACATCTTAGGTTGGGATGAATGGTTTT 3094
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053 TGGATGATGAGGTTTCTACCTCTAATGGGCCACACATCTTAGGTTGGGATGAATGGTTTT 3112
Query 3095 GGCTGCCATTTGAAGAGCTACGCTCGAAGCGGATTGTCGATATTGAGAAGGAATACTTGT 3154
||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 GGCTGCCATTTGAGGAACTACGCTCGAAGCGGATTGTTGATATTGAGAAGGAATACTTGT 3172
Query 3155 TGAAATTTGAGTATGTTAACAACTTCACACAAGAAAACCTACAGACGGTGAACCAGATAA 3214
||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 TGAAATTCGAGTATGTTAACAACTTTACCCAAGAAAACCTACAGACGGTGAACCAGATAA 3232
Query 3215 TCACTGAGGAAAGTTCTCGTCTGCGCATCTCTTTGAGGGATGATGATTTCATTGTGTCAG 3274
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3233 TCACCGAGGAAAGTTCTCGTCTGCGCATCTCGTTGAGGGATGATGATTTTATTGTGTCAG 3292
Query 3275 ACTATGAAGATGAGCTGTCCAGCCTAATTGCTTGCGCGCTTGCCCACCTGAACAATGATG 3334
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3293 ACTATGAAGACGAGCTGTCCAGCCTAATTGCTTGTGCACTTGCCCATCTGAACAATGAAG 3352
Query 3335 AGAGCAGAAAGCCTCTTTCAAGGTGTATACATGGATCTCTTCAAGGGTTCTTAGATAATA 3394
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3353 AGAGCAAAAAGCCTCTTTCAAGGTGTATACATGGATCTCTTCAAGGGTTCTTAGATAATA 3412
Query 3395 ATCAAGATTCTAAGCAAACTGACTGTGAGGTTTCCCGTTTCTCGAGTGAGAGTACAAATC 3454
|||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3413 ATCAGGATTCTAAGCAAACTGACCGAGACGTTTCCCGTTTCTCGAGTGAGAGTACAAATC 3472
Query 3455 GGTTGGAAACACTACCCCCTCCAGAGGTCCTTGTTACTTTTGGGTCACTCAAATCAATTG 3514
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3473 GGTTGGAAACACTACCCCCTCCAGAGGTCCTCGTTACTTTTGGGTCAGTCAAATCAGTTG 3532
Query 3515 GAAAACCCAAATACTCTATCGTGTCCCTATATGCAGATGATTTCCGCGAGCTCAGAAAAC 3574
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3533 GAAAACCCAAGTACTCTATCGTGTCCCTGTATGCAGATGATTTCCGTGACCTCAGAAAAC 3592
Query 3575 GCTCTTGTTCATCAGAGCTTGATTATATAGCTTCACTAAGCCGTTGTAAGCCATGGGATG 3634
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3593 GCTGTTGTTCATCAGAGCTTGACTATATAGCTTCACTAAGCCGCTGTAAGCCATGGGATG 3652
Query 3635 CTAAGGGTGGGAAGAGCAAATCCGTGTTCGCTAAGACTTTGGATGATAGGTTCATCGTAA 3694
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3653 CCAAAGGTGGGAAGAGCAAATCCGTGTTCGCTAAGACTTTGGATGATAGGTTCATCGTAA 3712
Query 3695 AAGAGATCAAGAAGACAGAGTATGAATCATTTGTGACATTTGCTCCGGAGTATTTCAAAT 3754
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 3713 AAGAGATCAAGAAGACAGAGTACGAATCATTTGTGACTTTTGCTACGGAGTATTTCAAAT 3772
Query 3755 ACATGAAGGACTCGTATGATCTAGGCAACCAGACTTGTCTTGCCAAAGTTCTTGGGATCC 3814
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3773 ACATGAAGGACTCGTATGATTTAGGCAACCAGACTTGTCTTGCCAAAGTTCTTGGGATCC 3832
Query 3815 ATCAGGTAACTGTAAGGCAGCCAAAGGGTGGTGGGAAAGAGATACGGCACGACCTGATGG 3874
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3833 ATCAGGTAACTGTAAGGCAGCCAAAGGGTGGCGGGAAAGAGATACGGCACGACCTGATGG 3892
Query 3875 TCATGGAGAATCTCAGTTTTGGCAGAAAAGTTACTCGCCAGTATGATCTCAAAGGCGCTC 3934
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3893 TCATGGAGAATCTGAGTTTTAGCAGAAAAGTTACTCGCCAGTATGATCTCAAAGGCGCTC 3952
Query 3935 TGCATGCTCGGTTT-ACAGCCACTTCTGCTAATGGCGCAGAAGATGTTCTATTGGATCAG 3993
| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3953 TACATGCTC-GTTTCACAGCCACTTCTGCTAATGGCGAAGACGATGTTCTATTGGATCAG 4011
Query 3994 AACTTTGTCAACGACATGAACAAATCCCCACTTTACGTTAGCAAAACATCAAAGCAAAAT 4053
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4012 AACTTTGTCAACGACATGAACAAATCCCCGCTTTACGTTAGCAAAACATCAAAACAAAAT 4071
Query 4054 CTCCAAAGAGCGGTTTATAATGACACCAGCTTCCTAACCAGCATAAACGTGATGGACTAC 4113
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4072 CTCCAAAGAGCGGTTTATAACGACACCAGCTTCCTAACCAGTATAAACGTGATGGACTAC 4131
Query 4114 TCGCTGCTGGTTGGAGTTGATGATGAGAATCATGAGCTAGTGTGTGGGATCATCGATTAT 4173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4132 TCGCTGCTGGTTGGAGTTGATGATGAGAATCATGAGCTAGTGTGTGGGATCATCGATTAT 4191
Query 4174 CTGAGACAATACACATGGGACAAGCAGTTAGAGACATGGGTGAAATCGTCTTTGGTGGTG 4233
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4192 CTGAGACAATACACATGGGACAAGCAGTTAGAGACATGGGTGAAATCGTCTTTGGTGGTA 4251
Query 4234 CCAAAGAATGTGCAGCCGACAGTGATCAGCCCGATTGATTACAAGACGAGGTTCAGGAAA 4293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4252 CCAAAGAATGTGCAGCCGACAGTGATCAGCCCGATTGATTACAAGACAAGGTTCAGGAAA 4311
Query 4294 TTCATGAAGACACATTTCTTGTGCGTCCCTGACCAGTGGTGCGATCAAGGGGACTCTTAA 4353
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||
Sbjct 4312 TTCATGAAAACGCATTTCTTGTGCGTCCCTGACCAGTGGTGCGACCAAGGAGACTCGTAA 4371
Query 4354 GGGCAAAAAGCATATGATTATAGCTTGAAAGTAGAAGATATTTGCTTATACCCGGTCTA- 4412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||
Sbjct 4372 GGGCAAAAAGCATATGATTATAGCTTGAAAGTAGAAGTTATTTGATTATAATCGGTCTAT 4431
Query 4413 ATCTCTCatatatatat-atTTTGACaaaaaaaaaaaa-aTCTCTC--ATATGATTCTTT 4468
||||||||||||||| | ||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||
Sbjct 4432 ATCTCTCATATATAT-TGATT---A-AAAAAAAAAATATATCTCTCTCATATGATTCTTT 4486
Query 4469 CATTTGATTAA--ACTTCACATGTATATAGAGACAGCTCCAGTTTTTATCTACCCCATCA 4526
||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4487 CATTTGATTTTTTACTTCACTTGTATATAGAGACAACTCCAGTTTTTATCTACCCCATCA 4546
Query 4527 TTGTGCAGTTTTTTAGCAAGTTTCTGGGGTAGATTTTAAGTGATTGGATTGTCTCTTGTG 4586
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4547 TTGTGCAGTTTTTTAGCAAGTTTCTGGGGTGGATTT-AAGTGATTGGATTGTCTCTTGTG 4605
Query 4587 TCTGTCTTTTCTCCATTTCATTGAAAGGCAGATTCAAGCAAGTGAAAGTCTGTACTTaaa 4646
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4606 TCTGTCTTTTCTCCATTTCATTGAAAGGCAGATTCAGGCAAGTGAAAGTCTGTACT-AAA 4664
Query 4647 aaaaaaaaaaCAAAGTGTCAGTTGGTACATGTGAAAGTATTGTTTTTGTATAAGAAAGAA 4706
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4665 AAAAA-----CAAAGTGTCAGTTGGTACATGTGAAAGTATTGTTTTTGTATAAGAAAGAA 4719
Query 4707 GAAA 4710
||||
Sbjct 4720 GAAA 4723
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 234931794069
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5