BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg473899
Length=2664
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G47550.2 | Symbols: SEC3A | exocyst complex component sec3A ... 4501 0.0
AT1G47560.1 | Symbols: SEC3B | exocyst complex component sec3B ... 4333 0.0
> AT1G47550.2 | Symbols: SEC3A | exocyst complex component sec3A
| chr1:17457122-17464386 FORWARD LENGTH=3206
Length=3206
Score = 4501 bits (2437), Expect = 0.0
Identities = 2591/2667 (97%), Gaps = 3/2667 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGAAATCAAGCGCCGACGATGAAGAGCTCCGGCGAGCTTGTGAGGCAGCGATCGAA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 50 ATGGCGAAATCAAGCGCCGACGATGAAGAGCTTCGGCGAGCTTGCGAGGCCGCGATCGAA 109
Query 61 GGAACCAAGCAATCGATCGTTATGTCGATACGCGTCGCCAAGAGTCGCGGTGTTTGGGGA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 GGAACCAAGCAATCGATCGTTATGTCGATACGTGTCGCCAAGAGTCGCGGTGTTTGGGGC 169
Query 121 AAGTCTGGAAAATTGGGTCGACAAATGGCTAAACCTAGAGTTCTCGCTCTTTCCGTCAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 170 AAGTCTGGAAAATTGGGTCGACAAATGGCTAAACCCAGAGTTCTCGCTCTTTCCGTCAAA 229
Query 181 TCGAAGGGTCAACGGAAGAAAGCGTTTCTTCGAGTGATGAAGTATTCAAGTGGAGGAGTT 240
|| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 TCAAAGGGTCCACGAAAGAAAGCATTTCTTCGAGTCATGAAGTATTCAAGTGGAGGAGTT 289
Query 241 CTTGAGCCTGCTAAAATGTATAAACTCAAGCATCTGTCGAAGGTGGAAGTCATAACTAAT 300
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 290 CTGGAGCCTGCAAAAATGTATAAACTCAAGCATCTGTCAAAGGTGGAAGTCATAACTAAT 349
Query 301 GACCCAAGTGGATGCACTTTTACCCTGGGGTTTGATAATCTCAGGAGTCAAAGTGTTGCT 360
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GACCCAAGTGGATGCACTTTCACACTGGGGTTTGATAATCTCAGGAGTCAAAGTGTTGCT 409
Query 361 CCTCCTCAGTGGACCATGCGCAACACTGATGACAGGAACCGACTTTTAGTTTGCATATTG 420
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 CCTCCACAGTGGACCATGCGCAACACTGATGACAGGAACCGACTTTTAGTTTGCATATTG 469
Query 421 AACATATGCAAAGACGTATTAGGCCGCCTTCCGAAAGTTGTTGGTATAGATATCGTCGAG 480
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 470 AACATATGCAAAGACGTATTAGGCCGCCTTCCAAAAGTTGTTGGTATAGATATTGTCGAG 529
Query 481 ATGGCCCTTTGGGCTAAGGATAACACTCCAGTAGTCACTACTCAAAGAAGTACAGAAGAT 540
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 ATGGCCCTTTGGGCAAAGGATAACACTCCAGTAGTCACTACTCAAAGAAGTACAGAAGAT 589
Query 541 GGGGGGCCTGTTGCTGAAACTGTAACAGAAAGTGACTTGAAAGTTACTGTTGAGAAAGAA 600
|||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GGGGAGCCTGTTGCTGAATCTGTAACAGAAAGCGACTTGAAAGTTACTGTTGAGAAAGAA 649
Query 601 CTAGTCTCTCAGGCCGAGGAAGAGGATATGGAGGCTCTCTTGGGAACTTATGTAATGGGC 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 650 CTAGTCTCTCAGGCCGAGGAAGAGGATATGGAGGCTCTGTTGGGAACTTATGTAATGGGC 709
Query 661 ATTGGTGAAGCTGAGGCATTTTCTGAAAGGCTAAAGCGGGAGCTCCAAGCGCTTGAAGCG 720
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 710 ATTGGTGAAGCTGAGGCATTTTCTGAAAGGCTGAAGCGAGAGCTCCAAGCGCTTGAAGCG 769
Query 721 GCAAATGTACATGCAATTCTGGAAAGCGAACCATTAGTAGATGAGGTTTTGAATGGACTA 780
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 GCAAATGTACATGCAATTCTTGAAAGCGAACCATTAGTAGATGAGGTTTTGAATGGACTA 829
Query 781 GAGGCAGCAACAAATATTGTTGATGACATGGATGAATGGTTAGGAATATTCAACGTTAAA 840
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 830 GAGGCAGCAACAAATATCGTTGATGACATGGATGAATGGTTAGGAATATTCAACATTAAA 889
Query 841 CTTAGACACATGAGGGAAGACATTGAATCGATAGAAACTCGAAACAACAAGTTAGAGATG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 CTTAGACACATGAGGGAAGACATTGAATCGATAGAAACTCGAAACAACAAGTTAGAGATG 949
Query 901 CAGTCTGTAAACAATAAAGCTCTTATTGAGGAACTTGATAAAGTTATTGAGAGACTGCGT 960
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 CAGTCTGTAAACAATAAAGCTCTCATTGAGGAACTTGATAAAGTTATTGAGAGACTGCGT 1009
Query 961 GTGCCTTCTGAGTATGCAGCATCCCTAACAGGAGGCTCATTTGATGAAGCCGACATGCTC 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1010 GTGCCTTCTGAGTATGCAGCATCCCTAACAGGAGGCTCATTTGATGAAGCAGACATGCTC 1069
Query 1021 CAGAATATTGAGGCTTGCGAGTGGTTAGCCAAAGCTTTAAGGGGTCTTGAAGTGCCCAAC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070 CAGAATATTGAGGCTTGCGAGTGGTTAGCCAAAGCTTTAAGGGGTCTTGAAGTGCCCAAC 1129
Query 1081 TTAGACCCGATCTATGCTAATATGCGAGCTGTAAAGGAGAAACGAGCAGAACTAGAAAAA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 TTAGACCCGATCTATGCTAATATGCGAGCTGTAAAAGAGAAACGAGCAGAACTAGAAAAA 1189
Query 1141 TTAAAAGCTACTTTTGTGAGGAGAGCTTCAGACTTCTTGAGAAACTACTTTGCTAGTCTG 1200
||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1190 TTAAAAGCTACTTTTGTAAGGAGAGCTTCGGAGTTCTTGAGAAACTACTTTGCTAGTTTG 1249
Query 1201 GTAGATTTCATGGTCAGCGACAAAAGCTACTTTTCTCAGAGAGGGCAGCTGAAGAGGCCT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 GTAGATTTCATGGTCAGCGACAAAAGCTACTTTTCTCAGAGAGGGCAGCTGAAGAGGCCT 1309
Query 1261 GACCATGCTGATTTGCGGTACAAATGCAGAACATATGCTCGTCTTTTGCAACATTTAAAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 GACCATGCTGATTTGCGGTACAAATGCAGAACATATGCTCGTCTTTTGCAACATTTAAAG 1369
Query 1321 GGTCTTGATAAGAATTGTTTGGGACCATTGAGAAAAGCATACTGCAGCTCCCTGAACTTG 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 GGTCTTGATAAGAATTGTTTGGGACCATTGAGAAAAGCATACTGCAGCTCCCTGAACTTG 1429
Query 1381 CTCCTTCGTCGAGAGGCTCGTGAATTCGCGAATGAGCTTCGTGCAAGCACAAAAGTATCA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1430 CTCCTTCGTCGAGAGGCTCGTGAATTCGCGAATGAGCTTCGTGCAAGCACAAAAGTATCA 1489
Query 1441 CGAAATCCTACTGTCTGGCTAGAAGGATCTACGGGTTCTAGTCAGAATGCAAACACTGAC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 CGAAATCCTACTGTCTGGCTAGAAGGATCTACGGGTTCTAGTCAGAATGCAAACACTGAC 1549
Query 1501 ACCTCTGCAGTGTCAGATGCTTATGCCAAAATGCTAACAATATTCATCCCGCTTCTTGTA 1560
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 ACCTCTGCAGTGTCAGATGCTTATGCCAAGATGCTAACAATATTCATCCCGCTTCTTGTA 1609
Query 1561 GATGAGAGTTCCTTTTTTGCGCACTTTATGTGCTTTGAGGTACCAGCTCTTGCTCCTCCT 1620
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1610 GATGAGAGTTCCTTTTTTGCGCACTTCATGTGCTTTGAGGTACCTGCTCTTGCTCCTCCT 1669
Query 1621 GGAGGTGCTGGCAATGATAAGAAAAGCCAGTCCAACAATGACGATGGTAATGATGATGAT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 GGAGGTGCTGGCAATGATAAGAAAAGCCAGTCCAACAATGACGATGGTAATGATGATGAT 1729
Query 1681 GATCTGGGGATCATGGACATTGATGAAACTGACAAGAAAACTGGTAAAAACTCCCCAGAC 1740
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 1730 GATTTGGGGATCATGGACATTGATGAAACTGACAAGAAACCTGGTAAAAACTCTCCAGAC 1789
Query 1741 CTGACGGCACTGAATGAATCTCTTCAAGATTTACTTGATGGTATTCAGGAGGATTTCTAT 1800
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 CTGACGGCATTGAATGAGTCTCTTCAAGATTTACTTGATGGTATTCAGGAGGATTTCTAT 1849
Query 1801 GCTGTTGTTGACTGGGCATATAAAATAGATCCCCTACGGTGTATATCAATGCATGGTATA 1860
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1850 GCTGTTGTTGACTGGGCATATAAAATAGACCCCCTACGGTGTATTTCAATGCATGGTATA 1909
Query 1861 ACTGAACGTTATCTATCTGGTCAGAAAGCTGATGCTGCAGGATTTGTTCGCCTTTTGCTT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 ACTGAACGTTATCTATCTGGTCAGAAAGCTGATGCTGCAGGATTTGTTCGCCTTTTGCTT 1969
Query 1921 GGAGATCTGGAGTCGAGAGTTTCTATGCAATTCAGCCGT-T-TT-GTGGATGAAGCTTGT 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||
Sbjct 1970 GGAGATCTGGAGTCGAGAGTTTCTATGCAATTCAGCCGTGTATTTGTGGATGAAGCTTGT 2029
Query 1978 CACCAAATTGAAAGAAATGAACGTAATGTAAGACAGATGGGTGTCTTGCCATATATTCCA 2037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 CACCAAATTGAAAGAAATGAACGTAATGTAAGACAGATGGGTGTCTTGCCATATATTCCA 2089
Query 2038 AGATTTGCAGCACTTGCTACTCGTATGGAACAGTACATACAAGGGCAATCTAGAGATTTG 2097
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 AGATTTGCAGCACTTGCTACTCGTATGGAACAATACATACAAGGGCAATCTAGAGATTTG 2149
Query 2098 GTTGATCAGGCATACACAAAATTTGTAAGCATAATGTTCGTGACCCTCGAAAAAATTGCC 2157
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2150 GTTGATCAGGCATACACAAAATTTGTGAGCATAATGTTTGTGACCCTCGAGAAAATTGCC 2209
Query 2158 CAGCAAGATCCAAAATATGCAGATATTCTCCTTTTAGAAAACTATGCTGCTTTTCAAAAT 2217
|| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2210 CAACAAGATCCTAAATATGCAGATATTCTCCTGTTAGAAAACTATGCTGCTTTTCAGAAT 2269
Query 2218 AGCCTGTATGACCTGGCTAATGTTGTACCCACATTAGCCAAGTTCTATCACCAGGCAAGT 2277
|||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2270 AGCCTGTATGACCTGGCTAATGTTGTGCCGACTTTAGCCAAGTTTTATCACCAGGCAAGT 2329
Query 2278 GAAGCATATGAACAAGCTTGTACGCGCCACATTAGCATGATAATTTACTACCAATTCGAA 2337
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2330 GAAGCATATGAACAAGCTTGTACGCGCCACATTAGCATGATAATTTACTATCAATTCGAA 2389
Query 2338 AGGCTTTTCCAGTTTGCTAAAAAGATTGAGGATCTCATGTATACTATCACCCCTGAAGAG 2397
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 AGACTTTTCCAGTTTGCTAAAAAGATTGAGGATTTCATGTATACTATCACCCCTGAAGAG 2449
Query 2398 ATACCATTCCAGCTTGGTTTGTCGAAAATGGAACTTCGGAAGATGTTAAAATCAAGCTTG 2457
|||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2450 ATACCATTCCAGCTTGGTTTATCGAAAGTAGAACTCCGGAAGATGTTAAAATCAAGCCTG 2509
Query 2458 TCAGGGGTGGACAAATCGATTGCAGCAATGTATAAAAAGTTGCAGAAGAATTTAGCATCG 2517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2510 TCAGGGGTGGACAAATCGATTGCAGCAATGTATAAAAAGTTGCAGAAGAATCTAGCATCA 2569
Query 2518 GAGGAGTTGCTACCATCGTTGTGGGATAAATGCAAGAAAGAGTTTCTGGACAAGTACGAG 2577
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 GAGGAGTTGCTACCATCGTTGTGGGATAAATGCAAGAAGGAGTTTCTGGACAAGTACGAG 2629
Query 2578 AGCTTCGTGCAGCTCGTAGCCAAAGTATACCCGAGTGAAAACGTTCCTGGAGTAACTGAA 2637
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 AGCTTCGTGCAGCTCGTAGCCAAAGTTTATCCGAGTGAAAACGTTCCTGGAGTAACTGAA 2689
Query 2638 ATGAGGGGACTTTTGGCTTCCATGTAA 2664
||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 2690 ATGAGAGGACTTCTGGCTTCCATGTAA 2716
> AT1G47560.1 | Symbols: SEC3B | exocyst complex component sec3B
| chr1:17466751-17473294 FORWARD LENGTH=2768
Length=2768
Score = 4333 bits (2346), Expect = 0.0
Identities = 2561/2667 (96%), Gaps = 6/2667 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGAAATCAAGCGCCGACGATGAAGAGCTCCGGCGAGCTTGTGAGGCAGCGATCGAA 60
||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 1 ATGGCCAAGTCAAGCGCCGACGATGAAGAGCTTCGGCGAGCTTGCGAGGCGGCAATCGAA 60
Query 61 GGAACCAAGCAATCGATCGTTATGTCGATACGCGTCGCCAAGAGTCGCGGTGTTTGGGGA 120
|| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGCACCAAGCAATCGATCGTCATGTCGATACGTGTGGCCAAGAGTCGCGGTGTTTGGGGC 120
Query 121 AAGTCTGGAAAATTGGGTCGACAAATGGCTAAACCTAGAGTTCTCGCTCTTTCCGTCAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAGTCTGGAAAATTGGGTCGACAAATGGCTAAACCCAGAGTTCTCGCTCTTTCCGTCAAA 180
Query 181 TCGAAGGGTCAACGGAAGAAAGCGTTTCTTCGAGTGATGAAGTATTCAAGTGGAGGAGTT 240
|||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCGAAGGGTCCACGAAAGAAAGCAATTCTTCGAGTCATGAAGTATTCAAGTGGAGGAGTT 240
Query 241 CTTGAGCCTGCTAAAATGTATAAACTCAAGCATCTGTCGAAGGTGGAAGTCATAACTAAT 300
|| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 241 CTGGAGCCTGCTAAAATGTATGACCTCAAGCATCTGTCAAAGGTGGAAGTCATAACTAGT 300
Query 301 GACCCAAGTGGATGCACTTTTACCCTGGGGTTTGATAATCTCAGGAGTCAAAGTGTTGCT 360
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GACCCAAGTGGATGCACATTTACCCTCGGGTTTGATAATCTCAGGAGTCAAAGTGTTGCT 360
Query 361 CCTCCTCAGTGGACCATGCGCAACACTGATGACAGGAACCGACTTTTAGTTTGCATATTG 420
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCTCCACAGTGGACCATGCGCAACACTGATGACAGGAACCGACTTTTAGTTTGCATATTG 420
Query 421 AACATATGCAAAGACGTATTAGGCCGCCTTCCGAAAGTTGTTGGTATAGATATCGTCGAG 480
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 421 AACATATGCAAAGACGTATTAGGCCGCCTTCCAAAAGTTGTTGGTATAGATATTGTCGAG 480
Query 481 ATGGCCCTTTGGGCTAAGGATAACACTCCAGTAGTCACTACTCAAAGAAGTACAGAAGAT 540
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATGGCCCTTTGGGCAAAGGATAACACTCCAGTAGTCACTACTCAAAGAAGTACAGAAGAT 540
Query 541 GGGGGGCCTGTTGCTGAAACTGTAACAGAAAGTGACTTGAAAGTTACTGTTGAGAAAGAA 600
|||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGGGAGCCTGTTGCTGAATCTGTAACAGAAAGCGCCTTGAAAGTTACTGTTGAGAAAGAA 600
Query 601 CTAGTCTCTCAGGCCGAGGAAGAGGATATGGAGGCTCTCTTGGGAACTTATGTAATGGGC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 601 CTAGTCTCTCAGGCCGAGGAAGAGGATATGGAGGCTCTCTTGGGAACTTATGTGATTGGC 660
Query 661 ATTGGTGAAGCTGAGGCATTTTCTGAAAGGCT-AAAGCGGGAGCTCCAAGCGCTTGAAGC 719
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||
Sbjct 661 ATTGGTGAAGCTGAGGCATTTTCTGAAAGGCTGAAA-CGAGAGCTTCAGGCGCTTGAAGC 719
Query 720 GGCAAATGTACATGCAATTCTGGAAAGCGAACCATTAGTAGATGAGGTTTTGAATGGACT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GGCAAATGTACATGCAATTCTGGAAAGCGAACCATTAGTAGATGAGGTTTTGAATGGACT 779
Query 780 AGAGGCAGCAACAAATATTGTTGATGACATGGATGAATGGTTAGGAATATTCAACGTTAA 839
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 780 AGAGGCAGCAACAAATATCGTTGATGACATGGATGAATGGTTAGGAATATTCAACATTAA 839
Query 840 ACTTAGACACATGAGGGAAGACATTGAATCGATAGAAACTCGAAACAACAAGTTAGAGAT 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 840 ACTTAGACACATGAGGGAAGACATTGAATCGATAGAAATTCGAAACAACAAGTTAGAGAT 899
Query 900 GCAGTCTGTAAACAATAAAGCTCTTATTGAGGAACTTGATAAAGTTATTGAGAGACTGCG 959
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GCAGTCTGTAAACAATAAAGCTCTCATTGAGGAACTTGATAAAGTTATTGAGAGACTGCG 959
Query 960 TGTGCCTTCTGAGTATGCAGCATCCCTAACAGGAGGCTCATTTGATGAAGCCGACATGCT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 960 TGTGCCTTCTGAGTATGCAGCATCCCTAACAGGAGGCTCATTTGATGAAGCAGACATGCT 1019
Query 1020 CCAGAATATTGAGGCTTGCGAGTGGTTAGCCAAAGCTTTAAGGGGTCTTGAAGTGCCCAA 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TCAGAATATTGAGGCTTGCGAGTGGTTAGCCAAAGCTTTAAGGGGTCTTGAAGTGCCCAA 1079
Query 1080 CTTAGACCCGATCTATGCTAATATGCGAGCTGTAAAGGAGAAACGAGCAGAACTAGAAAA 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CTTAGACCCGATCTATGCTAATATGCGAGCTGTAAAAGAGAAACGAGCAGAACTAGAAAA 1139
Query 1140 ATTAAAAGCTACTTTTGTGAGGAGAGCTTCAGACTTCTTGAGAAACTACTTTGCTAGTCT 1199
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1140 ATTAAAAGCTACTTTTGTAAGGAGAGCTTCAGAGTTCTTGAGAGACTACTTTGCTAGTCT 1199
Query 1200 GGTAGATTTCATGGTCAGCGACAAAAGCTACTTTTCTCAGAGAGGGCAGCTGAAGAGGCC 1259
||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GGTAGATTTCAAGTTCAGTGACAAAAGCTACTTTTCTCAGAGAGGGCAGCTGAAGAGGCC 1259
Query 1260 TGACCATGCTGATTTGCGGTACAAATGCAGAACATATGCTCGTCTTTTGCAACATTTAAA 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1260 TGACCATGCTGATTTGCGGTACAAATGCAGAACATATGCTCGTCTTATGCAACATTTAAA 1319
Query 1320 GGGTCTTGATAAGAATTGTTTGGGACCATTGAGAAAAGCATACTGCAGCTCCCTGAACTT 1379
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GGGTCTTAATAAGAATTGTTTGGGACCATTGAGAAAAGCATACTGCAGCTCCCTGAACTT 1379
Query 1380 GCTCCTTCGTCGAGAGGCTCGTGAATTCGCGAATGAGCTTCGTGCAAGCACAAAAGTATC 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GCTCCTTCGTCGAGAGGCTCGTGAATTCGCGAAGGAGCTTCGTGCAAGCACAAAAGTATC 1439
Query 1440 ACGAAATCCTACTGTCTGGCTAGAAGGATCTACGGGTTCTAGTCAGAATGCAAACACTGA 1499
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 ACGAAATCCTACTGTTTGGCTAGAAGGATCTACGGGTTCTAGTCAGAATGCAAACACTGA 1499
Query 1500 CACCTCTGCAGTGTCAGATGCTTATGCCAAAATGCTAACAATATTCATCCCGCTTCTTGT 1559
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CACCTCTGCAGTGTCAGATGCTTATGCCAAGATGTTAACAATATTCATCCCGCTTCTTGT 1559
Query 1560 AGATGAGAGTTCCTTTTTTGCGCACTTTATGTGCTTTGAGGTACCAGCTCTTGCTCCTCC 1619
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1560 AGATGAGAGTTCCTTTTTTGCGCACTTCATGTGCTTTGAGGTACCTGCTCTTGCTCCTCC 1619
Query 1620 TGGAGGTGCTGGCAATGATAAGAAAAGCCAGTCCAACAATGACGATGGTAATGATGATGA 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1620 TGGAGGTGCTGGCAATGATAAGAAAAGCCAGTCCAACAATGACGATGGTAATGATAATGA 1679
Query 1680 TGATCTGGGGATCATGGACATTGATGAAACTGACAAGAAAACTGGTAAAAACTCCCCAGA 1739
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 1680 TGATTTGGGGATCATGGACATTGATGAAGCTGACAAGAAACCTGGTAAAAACTCTCCAGA 1739
Query 1740 CCTGACGGCACTGAATGAATCTCTTCAAGATTTACTTGATGGTATTCAGGAGGATTTCTA 1799
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 CCTGACGGCATTGAATGAATCTCTTCAAGATTTACTTGATGGTATTCAGGAGGATTTCTA 1799
Query 1800 TGCTGTTGTTGACTGGGCATATAAAATAGATCCCCTACGGTGTATATCAATGCATGGTAT 1859
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TGCTGTTGTTGACTGGGCATATAAAATAGACCCCCTACGGTCTATATCAATGCATGGTAT 1859
Query 1860 AACTGAACGTTATCTATCTGGTCAGAAAGCTGATGCTGCAGGATTTGTTCGCCTTTTGCT 1919
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 AACCGAACGTTATCTATCTGGTCAGAAAGCTGATGCTGCAGGATTTGTTCGCCTTTTGCT 1919
Query 1920 TGGAGATCTGGAGTCGAGAGTTTCTATGCAATTCAGCCGTTTTGTGGATGAAGCTTGTCA 1979
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 TGGAGATCTGGAGTCGAGAATTTCTATGCAATTCAGCCATTTTGTGGATGAAGCTTGTCA 1979
Query 1980 CCAAATTGAAAGAAATGAACGTAATGTAAGACAGATGGGTGTCTTGCCATATATTCCAAG 2039
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CCAAATTGAAAAAAATGAACGTAATGTAAGACAGATGGGTGTCTTGCCATATATTCCAAG 2039
Query 2040 ATTTGCAGCACTTGCTACTCGTATGGAACAGTACATACAAGGGCAATCTAGAGATTTGGT 2099
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2040 ATTTGCAGCACTTGCTACTCGTATGGAACAGTACATACAAGGGCAATCTAGAAATTTGGT 2099
Query 2100 TGATCAGGCATACACAAAATTTGTAAGCATAATGTTCGTGACCCTCGAAAAAATTGCCCA 2159
||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2100 TGATCAGGCGTACACAAAATTTGTGAGCATACTGTTTGTGACCCTCGAGAAAATTGCCCA 2159
Query 2160 GCAAGATCCAAAATATGCAGATATTCTCCTTTTAGAAAACTATGCTGCTTTTCAAAATAG 2219
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 2160 ACAAGATCCTAAATATGCAGATATTCTCCTTTTGGAAAACTATGCTGCTTTTCAAACTTG 2219
Query 2220 CCTGTATGACCTGGCTAATGTTGTACCCACATTAGCCAAGTTCTATCACCAGGCAAGTG- 2278
||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2220 CCTGTTTGACCTGGCTAATGTTGTGCCGACTTTAGCCAAGTTCTATGACCAGGCAA-TGG 2278
Query 2279 AAGCATATGAACAAGCTTGTACGCGCCACATTAGCATGATAATTTACTACCAATTCGAAA 2338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2279 AAGCATATGAACAAGCTTGTACGCGCCACATTAGCATGATAATTTACTATCAATTCGAAA 2338
Query 2339 GGCTTTTCCAGTTTGCTAAAAAGATTGAGGATCTCATGTATACTATCACCCCTGAAGAGA 2398
| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 GACTTTTCCTGTTTGATAAAAAGATTAAGGATCTCATGTATACTATCACCCCTGAAGAGA 2398
Query 2399 TACCATTCCAGCTTGGTTTGTCGAAAA-TGGAACTTCGGAAGATGTTAAAATCAAGCTTG 2457
||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2399 TACCATTCCAGCTTGGTTTATC-AAAAGTGGAACTCCGGAAGATGTTAAAATCAAGCCTG 2457
Query 2458 TCAGGGGTGGACAAATCGATTGCAGCAATGTATAAAAAGTTGCAGAAGAATTTAGCATCG 2517
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 TCAGGGGTGGACAAATCGATTGCAGCAATGTATAAAAAGTTGCAGAAGAATTTAGCATCA 2517
Query 2518 GAGGAGTTGCTACCATCGTTGTGGGATAAATGCAAGAAAGAGTTTCTGGACAAGTACGAG 2577
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 GAGGAGTTGCTACCATCGTTGTGGGATAAATGCAAGAAGGAGTTTCTGGACAAGTACGAG 2577
Query 2578 AGCTTCGTGCAGCTCGTAGCCAAAGTATACCCGAGTGAAAACGTTCCTGGAGTAACTGAA 2637
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2578 AGCTTCGTGCAGCTCGTAGCCAAAGTTTACCCGAGTGAAAACGTTCCTGGGGTAACTGAA 2637
Query 2638 ATGAGGGGACTTTTGGCTTCCATGTAA 2664
||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 2638 ATGAGAGGACTTCTGGCTTCCATGTAA 2664
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 132290228691
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5