BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg474047
Length=3867
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G49040.1 | Symbols: SCD1 | stomatal cytokinesis defective / ... 6373 0.0
> AT1G49040.1 | Symbols: SCD1 | stomatal cytokinesis defective
/ SCD1 protein (SCD1) | chr1:18139234-18148981 REVERSE LENGTH=3904
Length=3904
Score = 6373 bits (3451), Expect = 0.0
Identities = 3741/3881 (96%), Gaps = 19/3881 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGAACGACTTGGATaaaaaaaCAAAGGAGCCCGAATTGAAGCAACTAC-TTT-T-C-TC- 55
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||
Sbjct 3 CGAACGACTTGGCCAAAAAAACAAAGGAGGCCGAATTGAAGCAACTACTTTTCTCCATCA 62
Query 56 -CAT---CATCGACGAAATCCGCC-AAAACTGATCTCACA-TTGAAAACCCAGATCATGC 109
||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||
Sbjct 63 TCATCACCATCGGCGAAATCCGCCAAAAATTGATCTC-CATTTGGAAATCCAGATCATGC 121
Query 110 ACTAGAACCC-AGTTTTTAGATCTCG-AGGAAGACAATGGGTCGGATCTTCGAGTACTTC 167
||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 122 TCTAGAGCCCTAG--TTTAGATCTCGAAGGAAGACAATGGGACGGATCTTCGAGTACTTC 179
Query 168 GTCGTGTGCGGACTTGGTCCAGAGATACGAACCGTAGATGGAGATCTTGGATTCCATGGA 227
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GTCGTGTGCGGACTTGGTCCAGAGATGCGAACCGTGGATGGAGATCTTGGATTCCATGGA 239
Query 228 ATGCAAACATTCTACTTGCCTGCTCTTCTCGACCAGTTCCCTCCTACTGATCAATCTCCT 287
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 ATGCAAACATTCTACTTGCCTGCTCTTCTTGACCAGTTCCCTCCTACTGATCAATCTCCT 299
Query 288 TACCCTGCCCCTCCCCCTCAGCTTCCTACTTGTGTTCTTCCTGCTGGGGTGGAGTTCCAT 347
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TACCCTGCCCCTCCTCCTCAGCTTCCTACTTGTGTTCTTCCTGCTGGGGTGGAGTTCCAT 359
Query 348 TCTTCTGGGTTTGTTTCCAGTGACCCTGCAAGTTTCCCACGGAGCTATCCCATAGTCTTG 407
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TCTTCTGGTTTTGTTTCCAGTGACCCTGCAAGTTTCCCACGGAGCTATCCCATAGTCTTG 419
Query 408 ACGGAGGGTGATGGATCAAAAATATTTGTCAGTTGCATTGCATTTCGGGATCGAGTCTGT 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 ACGGAGGGTGATGGATCAAAAATATTTGTCAGTTGCATTGCATTTCGGGATCGAGTCTGT 479
Query 468 GAGGATATTATTGAAGCTTATCGCTTACCGCCGAATACATACGCAGACAAGTGTATCTGT 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GAGGATATTATTGAAGCTTATCGCTTACCGCCGAATACATACGCAGACAAGTGTATCTGT 539
Query 528 CTTGTGTCTCACGCCCCCAATTTCCGTGTTCTTCGTAATTCTCTCGAAGAGATTTTTGTT 587
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CTTGTGTCTCATGCCCCCAATTTCCGTGTTCTTCGTAATTCTCTCGAAGAGATTTTTGTT 599
Query 588 CTTTGCTTCTCTTCAGAAGGAAGCTGTAAACCACTGTGGGATATTATCACCTATATGGTA 647
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 600 CTTTGCTTCTCTTCAGAAGGAAGCTGTAAGCCATTGTGGGATATTATCGCCTATATGGTA 659
Query 648 TCTAATGTGCCATTGCCGACTCCCGGAAAAGACAGAGTCTTGTTTGCTGTCGAGAATTGC 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TCTAATGTGCCATTGCCGACTCCCGGAAAAGACAGAGTCTTGTTTGCTGTCGAGAATTGC 719
Query 708 CTGCTCTCTGTGGAAGCACCTCCAGAGGATAGTCTTCCTCAGGCAGATATATCTCTCCAG 767
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CTGCTCTCGGTGGAAGCACCTCCAGAGGATAGTCTTCCTCAGGCAGATATATCTCTCCAG 779
Query 768 CCTCTTGTACAATGCTTGGATGTCGACAACTTGATTAAGCTGTTTACATCTGTTCTAGTT 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 780 CCTCTTGTACAATGCTTGGATGTCGACAACTTGATTAAGCTGTTTACATCTGTACTAGTT 839
Query 828 GAAAGGAGGATTTTGATTCGATCTAATAAGTATTCACTTTTGACTCTGGTGTCTGAATCC 887
||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GAAAGGAGGATTTTGATTCGATCCAACAAGTATTCGCTTTTGACTCTGGTGTCTGAATCC 899
Query 888 ATATGTCATATGATTTATCCTTTCCGATGGCAGCAAGTCTACATTCCATTACTATTTTTT 947
||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 ATATGTCATTTGATTTATCCTTTTCGATGGCTGCAAGTCTACATTCCATTACTATTTTTT 959
Query 948 AGTGGAGTAGACTACATTGATGCACCAACACCATATATGATGGGTCTCCACTCTGATGTC 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 AGTGGAGTAGACTACATTGATGCACCAACACCATATATGATGGGTCTCCACTCTGATGTC 1019
Query 1008 GATACGTCCTATCTTGCTATGGAAGGCGTTGTAGTGGTGGATCTTGACTTTAACCAAATC 1067
||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1020 GATACATCCAATCTTGCTATGGATGGCGTTGTAGTGGTGGATCTTGACATAAACCAAATT 1079
Query 1068 ACTACTTCGGAAGAGATACCTCCGATACCAGAGCCTGAGCTCAGCGCTTTGCGAAACGAT 1127
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1080 ACTACTTCTGAAGAGATACCTCAGATACCAGAGCCTGAGTTCAGCACTTTGCGAAACGAT 1139
Query 1128 ATCTTGAAACTACTGCACCCTAATGTCGTCGGGATTGATCAGTTGAAGGGCTTTGGTAGT 1187
|||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1140 ATCTTGAAACTACTGCACCCTAATGTTGTAGCGATTGATCAGTTGAAGGGCTTTGGTAAT 1199
Query 1188 TCTGTTGAGCAGTCCCCCAAAAGCCTTAGCAAACCTTGGGGAGAGGATCATGACCTTCAA 1247
|| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TCCGTTGAGCAGTGCCCTAAAAGCCTTAGCAAACCTTGGGGAGAGGATCATGACCTTCAA 1259
Query 1248 CTCAGGGTTATATTCTTAAAGTTTTTTGCATCTATCTTGGGTGGCTACCGCAATTTCATA 1307
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CTCAGGGTTATATTCTTAAAGTGTTTTGCATCTATCTTGGGTGGCTACCGCAATTTCATA 1319
Query 1308 GAAAACAAAGTTTTTAGCAGTGATGCGTTTCTGAAGAGACGGTCTCGTACCACAAATCAG 1367
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1320 GAAAACAAAGTTTTTAGCACTGATGCGTTTCTGAAGAGACGGTCTCGTTCCACAAATCAG 1379
Query 1368 CCACCAGAGCCTATGTTGGTTCAATTCTTGGGCTCTTTTGCATTCCTCGATTACCTTGAA 1427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CCACCAGAGCCTATGTTGGTTCAATTCTTGGGCTCTTTTGCATTCCTCGATTACCTTGAA 1439
Query 1428 AGGCGTCTAAGCTCTGATGAGAACAGTACTAATCTCCTTGAGAAGTTACAAGATGCAGTT 1487
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 AGGCGTCTAAGCTCTGATGAGAAGAGTACTAATCTCCTTGAGAAGTTACAAGATGCAGTT 1499
Query 1488 GGAAGGGGTCAAGATGCGATGTCGATTCTGCCTAAATCTTCTATGGAGCCTGAAATAATC 1547
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GGAAGGGGTCAAGATGCAATGTCGATTCTGCCTAAATCTTCTATGGAGCCTGAAATAATC 1559
Query 1548 ACAATAGCTGAGCCAGAAGTTGAAGAATCAGCCACCAGGTATACCTATGACAGGTTTCCT 1607
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 ACAATAGCCGAGCCAGAAGTTGAAGAATCAGCCACCAGGTATACCTATGACAGGTTTCCT 1619
Query 1608 GCTAATGTTCGGTCAGAGGAACAAGAAGAAAAGCGAAAGCAGATCCTTGCAGCAGCAAGC 1667
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GCGAGTGTTCGGTCAGAGGAACAAGAAGAAAAGCGAAAGCAGATCCTTGCAGCAGCAAGC 1679
Query 1668 GGGGCTCTTGAATCCAATGGAAGGCATCCTCCAAGCTCACCGCCAGGGAAGAACACAAAA 1727
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1680 GGGGCTCTTGAATCCAATGGAAGGCACCCTCCAAGCTCACCGCCAGGGAAGAACACCAAA 1739
Query 1728 GAAGACAATTTCAGTTCAATGGAGAGGGCTGCAGAAAGAGAACGAATGGTCTTGGATATA 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 GAAGACAATTTCAGTTCAATGGAGAGGGCTGCAGAAAGAGAACGAATGGTCTTGGATATA 1799
Query 1788 CAAGTCAAGTTGCAGGGATTATGGCTCCGTCTTCTGAAACTAGGTTCAGATGAAGATCCT 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1800 CAAGTCAAGTTGCAGGGATTATGGCTCCGTCTTCTGAAACTGGGTTCAGATGAAGATCCT 1859
Query 1848 CTTTCTTCATTCGAATACGGCACAATATTGGCTCTCATCGAATCTGATGCTGAGGGGATT 1907
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 CTTTCTTCATTCGAATACGGCACAATATTGGCTCTGATTGAATCTGATGCTGAGGGGATT 1919
Query 1908 GGTGGGAGTGGCTTTATTGAGTGTATACGAGAGCATTTGTATTCGGGCTGGCATGGTCGA 1967
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1920 GGTGGGAGTGGCTTTATCGAGTGTATACGAGAGCATCTGTATTCGGGCTGGCATGGTCAA 1979
Query 1968 TTGACCGAGGAGCAGTTCATTGCGGTCAAAGAATTGCTCAAAATGGCTGTTGGCCGTGCT 2027
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1980 TTGTCCGAGGAGCAGTTCATTGCGGTCAAAGAATTGCTCAAAATGGCTGTGGGCCGTGCT 2039
Query 2028 GCTTCAAGAAGCGATTTGTCGACAGTGCGGGACGCACTTGAAGTTTCTGCAGAAATGTTC 2087
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 GCTTCAAGAAGCGATTTGTCGACAGTGCGGGATGCACTTGAAGTTTCTGCAGAAATGTTC 2099
Query 2088 AAGAAGGATGCCAATAATGTTTCAGACTATGTTCAGCGTCATCTCATCTCCATACCCATC 2147
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AAGAAGGATGCCAATAATGTCTCTGACTATGTTCAGCGTCATCTCATCTCCATACCCATC 2159
Query 2148 TGGGAGGAGTTAAGATTCTGGGAGGGTTACTTCGAGTATCTCATGGAGCAGCCTGCGAAT 2207
||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2160 TGGGAGGAGTTGAGATTTTGGGAAGGTTACTTCGAGTATCTCATGGAGCAGCCTGCAAAT 2219
Query 2208 GAATCAGTGAACTATGCTACGTTGGTCACAGCCAGGCTAATCATAGTGGCATCACATATG 2267
||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GAATCTGTGAACTATGCTACTTTGGTCACAGCCAGACTAATCATAGTGGCATCACATATG 2279
Query 2268 GCTGGCTTGGGACTTCCTGATACAGAAGCTTGGAACATGATCGAAACAATAGCAGAGAAA 2327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2280 GCTGGCTTGGGACTTCCTGATACAGAAGCTTGGAACATGATCGAGACAATAGCAGAGAAA 2339
Query 2328 CAAAAACTTGGATACAAATTACTGATTAAACTCAGAGGGTTCCTGTCGCATGTTCAGCAA 2387
||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 CAAAAGCTTGGATATAAATTACTGATTAAACTTAGAGGGTTCCTGTCGCATGTTCAGCAA 2399
Query 2388 CTTCGTGTAGGCTATTGGGGTGCTTCTTCATTTAAGCAGCAGGCCATATCTTCTGGGTTG 2447
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2400 CTTCGTGTCGGCTATTGGGGTGCTTCTTCATTTAAGCAGCAGGCCATATCTGCTGGGTTG 2459
Query 2448 CCATCCCCACGTCCAAAAGATGTCTCTGTCTCTGATGAAACCCAGCAACCCTCAGAAGCT 2507
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 CCATCCCCGCGTCCAAAAGATGTCTCTGTCTCTGATGAAACCCAGCAACCCTCAGAAGCT 2519
Query 2508 TCTGGAAGGAGTTGGGTTCAGAGTATGTTTAGCAGAGATACAGCATCGAGAGCGAACTCG 2567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 TCTGGAAGGAGTTGGGTTCAGAGTATGTTTAGCAGAGATACAGCATCGAGAGCGAACTCG 2579
Query 2568 TTCAGTCGTGTTCGTAAGTGGGTATCTGATAATGCATCTTCAGACATAACTGCTGCTGCG 2627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 TTCAGTCGTGTTCGTAAGTGGGTATCTGATAATGCATCTTCAGACATAACTGCTGCTGCG 2639
Query 2628 CAGAAGAAAATCCAGACCAATGTACGTGTTCTGAAGGGTCATGGCGGTGCTGTCACTGCC 2687
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2640 CAGAAGAAAATTCAGACCAATGTACGTGTTCTGAAGGGTCACGGTGGTGCTGTCACTGCC 2699
Query 2688 TTGCACTCTGTGACAAGAAGGGAGGTCTGTGATCTTGTGGGCGATCGCGAGGATGCTGGA 2747
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 TTGCACTCTGTGACAAGAAGGGAAGTCTGTGATCTTGTGGGCGATCGCGAGGATGCTGGG 2759
Query 2748 TTCTTTATCAGCGGTAGTACAGACTGTCTGGTTAAAATTTGGGATCCAAGTCTTCGTGGT 2807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2760 TTCTTTATCAGCGGTAGTACAGACTGTCTGGTTAAAATTTGGGATCCAAGTCTGCGTGGT 2819
Query 2808 TCTGAACTCCGAGCAACTTTGAAAGGACATACTGGAACCGTGCGTGCTATAAGCTCTGAC 2867
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 TCTGAACTTCGAGCAACTTTGAAAGGACATACTGGAACCGTGCGTGCTATAAGCTCTGAC 2879
Query 2868 AGAGGAAAGATAGTTTCAGGATCAGATGATCAATCTGTGATCGTATGGGACAAACAGACA 2927
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 AGAGGAAAGATAGTTTCAGGATCAGATGATCTATCTGTGATCGTATGGGACAAACAGACA 2939
Query 2928 ACTCAACTTCTAGAAGAACTGAAAGGCCATGATGCACAGGTAAGTTGTGTCAAGATGCTT 2987
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 ACTCAACTTCTAGAAGAACTGAAAGGCCATGATTCACAGGTAAGTTGTGTCAAGATGCTT 2999
Query 2988 TCAGGCGAACGTGTCCTCACAGCTGCACATGATGGAACAGTTAAGATGTGGGATGTTCGA 3047
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3000 TCAGGCGAACGTGTCCTCACTGCTGCACATGATGGAACAGTTAAGATGTGGGACGTTCGA 3059
Query 3048 ACCGATATGTGTGTTGCAACTGTTGGCCGATGCTCTAGTGCCATTCTTTCGCTTGAATAT 3107
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3060 ACCGATATGTGTGTTGCAACTGTTGGCCGATGCTCTAGTGCCATTCTTTCACTAGAATAT 3119
Query 3108 GATGACTCCACAGGAATCTTGGCTGCTGCTGGCAGAGATACGGTTGCAAATATATGGGAT 3167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 GATGACTCCACAGGAATCTTGGCTGCTGCTGGCAGAGATACGGTTGCAAATATATGGGAT 3179
Query 3168 ATTCGGTCAGGTAAGCAAATGCATAAGCTGAAAGGGCATACCAAATGGATACGATCAATT 3227
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 ATTCGTTCAGGAAAGCAAATGCATAAGCTGAAAGGGCATACCAAATGGATACGATCAATT 3239
Query 3228 CGAATGGTTGAAGATACCTTAATTACTGGAAGTGATGACTGGACAGCAAGAGTGTGGTCT 3287
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 CGAATGGTCGAAGATACCTTGATTACTGGAAGTGATGACTGGACAGCAAGAGTGTGGTCT 3299
Query 3288 GTCTCCAGAGGATCATGCGATGCAGTGTTGGCATGCCATGCTGGGCCAGTACAATCTGTT 3347
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3300 GTCTCCAGAGGATCATGCGATGCTGTTTTGGCATGCCATGCTGGGCCAGTACAATCTGTT 3359
Query 3348 GAATACTCCGCATTTGACAAAGGAATAATCACAGGCTCGGCTGATGGGTTGCTACGCTTT 3407
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3360 GAATACTCCCCGTTTGACAAAGGAATAATCACAGGCTCGGCGGATGGGTTGCTACGCTTT 3419
Query 3408 TGGGAAAATGACGACGGCGGCATTAAATGCGTGAAGAACATAACGCTCCATAGTTCTTCT 3467
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3420 TGGGAAAATGACGAAGGCGGCATTAAATGCGTGAAAAACATAACACTCCATAGTTCTTCT 3479
Query 3468 ATACTATCAATCAACGCTGGTGAAAATTGGTTAGGCATTGGAGCAGCAGATAACTCAATG 3527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 ATACTATCAATCAACGCTGGTGAAAATTGGTTAGGCATTGGAGCAGCAGATAACTCAATG 3539
Query 3528 TCTCTTTTCCATCGTCCTTCTAGTGCCGGAACCAAAGTCTCAGGCTGGCAACTTTATAGA 3587
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 TCTCTTTTCCATCGTCCTTCTAACGCCGGAACCAAAGTCTCAGGCTGGCAACTTTATAGA 3599
Query 3588 GTACCACAAAGAACAGCCGCCGTGGTGAGATGTGTTGCGTCAGATCTCGAGAGGAAACGG 3647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 GTACCACAAAGAACAGCCGCCGTGGTGAGATGTGTTGCGTCAGATCTCGAGAGGAAACGG 3659
Query 3648 ATATGTAGCGGTGGCCGGAATGGAGTTCTCCGGCTGTGGGATGCCACCATCAACATCTGA 3707
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 ATATGTAGCGGTGGCCGAAATGGAGTTCTCCGGCTGTGGGATGCCACCATCAACATCTGA 3719
Query 3708 TT-TGTCTTCCACAACTTTGTCTTTGTGTATCTTTTAACCTTATGTGTTGTTGTTACCTT 3766
|| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 3720 TTATGTCTTCCACAACTTTTTCTTTGTGTAT-TTTTAAGAGTATGTGTTATTGTTACCTT 3778
Query 3767 GTATGTTTGCTTATGCCCTTCGAGATTTGTGGTTTAACAAAAATTTTGttttttttttAT 3826
||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||
Sbjct 3779 GTATGTTTGCTTATGTTCTTTGAGATATGTGGTTTAAGAAAA-TTTTGATTTTCTTTTAT 3837
Query 3827 ATATGTTTTCTCAGTGATTCTTGTTTCGATCGATCCACTAA 3867
|||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 3838 ATATGTTTTCTCAGTGATTCTTGTTTTGATCAATCCACTAA 3878
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 192641061120
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5