BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg474074
Length=6118
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G49340.2 | Symbols: ATPI4K ALPHA | Phosphatidylinositol 3- a... 9304 0.0
AT1G51040.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein | ... 1546 0.0
> AT1G49340.2 | Symbols: ATPI4K ALPHA | Phosphatidylinositol 3-
and 4-kinase family protein | chr1:18252355-18264462 FORWARD
LENGTH=6582
Length=6582
Score = 9304 bits (5038), Expect = 0.0
Identities = 5349/5499 (97%), Gaps = 21/5499 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 623 CTAGTCCTGGCGACGATGG-AACTAGCCATGGTTCCAATGTATCCTCTAAGAGTTCATCG 681
||||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 668 CTAGTCCTGGCGATGA-GGTGGCTAGCCATGGGTCCAATTTATCCTCTAAGAGTTCATCG 726
Query 682 TCTGTAGTGGTGGATGGGGGTAGTATTGTATGGAAGATTGGTGTTGATCAGCTGAGCTTT 741
||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 TCTGTAGTGATGAATGGGGGTAGTATTGTGTGGAAGAGTGGTGTTGATCAGCTGAGCTTT 786
Query 742 GGATTTAGCGAGGGGAGTGGAGGTGCTAACCCTGTTTTTAGACAACTAGTGGCTTCTTTT 801
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 787 GGATTTAGCGAGGGGAGTGGAGGTGCTAACCCTGTTTTTAGACAACAAGTTGCTTCTTTT 846
Query 802 GAAGACGAATCCATTGAGAGCTTGGAGAAGCAAGAGATTGCCTTTAGATTGATAACCCAT 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 GAAGACGAATCCATTGAGAGCTTGGAGAAGCAAGAGATTGCCTTTAGATTGATAACCCAT 906
Query 862 ATTTTGGAGAAAGTTAAAATTGATTCCAAACTTCAGGATCAAGTGAGAATTATAGCCAAG 921
|||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 907 ATTTTGGATAAAGTCAAAATTGACTCTAAACTTCAGGATCAAGTGAGATTTATAGCCAAG 966
Query 922 AGGAAGCTTCAGACCATGTCTGCATTTCTGAAGTCAACAAAGCGAGACTGGAACGAACAA 981
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 967 AGGCAGCTTCAGTCCATGTCTGCATTTCTGAAGTCAAGAAAGCGAGACTGGAACGAACAG 1026
Query 982 GGCCCAGTTCTGAAAACTAGAGTCAATG-CAATGCTGTCTGTTTATCAGGCTGCAGCTAA 1040
|||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 GGCCAAGTTCTGAAAACTAGAGTCAATGCCAA-ACTGTCTGTTTATCAGGCTGCAGCTAA 1085
Query 1041 AATGAAAATCAAGAGCCTGGTGTCTCTTGAAACAGATGGAAAAACTTCTAAAAGGTTGGT 1100
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086 AATGAAAATCAAGAGCCTCGTGTCTCTTGAAACAGATGGAAAAACTTCTAAAAGGTTGGT 1145
Query 1101 CCTGGAGACGCTTGCATTGCTTTTAGATGCTGCAGATGCCTGCTTGACATCTGTGTGGCG 1160
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 CCTGGAGACGCTTGCATTACTTTTAGATGCTGCAGATGCCTGCTTGACATCTGTGTGGCG 1205
Query 1161 GAAAATGAAGGCCTGTGAAGAACTGTTCGATTCTCTGCTTTCTGGGATTGCGAAGATTGC 1220
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1206 TAAAATGAAGGCCTGTGAAGAACTGTTCGACTCTCTGCTTTCTGGGATTGCAAAGATTGC 1265
Query 1221 AGTGGCAAGAGGAGGGCAGCCACTTCGCGGGTTGCTCATCCGACTTAAACCACTGGTACT 1280
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1266 AGTGGCAAGAGGAGGGCAGCCTCTTCGCGTGTTGCTCATCCGACTTAAACCACTGGTACT 1325
Query 1281 GGCTGTCTGTGCAAAGCCAGATACTTGGGTTGGCAATCAAGGGGCTATGCTTGAGAGCGT 1340
||||||||| | | || | | || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1326 AGCTGTCTGT-----G-C----AC-T--GCCGG--ATCAAGGGGCTATGCTTGAGAGCAT 1370
Query 1341 ATTTAAGACTAGTTGTGAGATTATTGAATCTGCCTGGGCCAAGGACCGGGCTCCAGTGGA 1400
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1371 ATTTAAGACTAGTTGTGTGATTATTGAATCTGCCTGGGCCAAGGACCGAGCTCCAGTGGA 1430
Query 1401 CAACTTCATT-TCGGGGTTAGCTTCAAGTATTCGTGAAAGAAATGATTATGAAGAACAGG 1459
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 CAACTTCATTAT-GGGGTTAGCTTCAAGTATTCGTGAAAGAAATGATTATGAAGAACAGG 1489
Query 1460 TTGATAGAGAGAAGCAAGTACCTGCTGTACAGCTTAATGTGATTCGGCTGCTAGCTGATC 1519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 TTGATAGAGAGAAGCAAGTACCTGCTGTACAGCTTAATGTGATTCGGCTGCTAGCTGATC 1549
Query 1520 TCAATGTTGCTGTTAAGAAGCCGGAAGTAGCTGACATGATTTTACCACTTTTTATTGAAA 1579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 TCAATGTTGCTGTTAAGAAGCCGGAAGTAGCTGACATGATTTTACCACTTTTTATTGAAA 1609
Query 1580 GCCTGGAAGAGGGTGATGCTTCGAGTCCTAGCTTTTTGCGACTCCAACTTCTTGATGCTG 1639
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 GCTTGGAAGAGGGTGATGCTTCGACTCCTAGCTTTTTGCGACTCCAACTTCTTGATGCTG 1669
Query 1640 TTTCTAGGATAGCAACATTAGGGTTTGATAAGTCTTACCGTGAGACAGTAGTTCTGATGA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 TTTCTAGGATAGCAACATTAGGGTTTGATAAGTCTTACCGTGAGACAGTAGTTCTGATGA 1729
Query 1700 CCAGAAGTTATTTGAGCAAATTATCGAGTGTAGGATCTGTAGAAAGCAAAACGTCAGCAC 1759
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 CCAGAAGTTATTTGAGCAAACTATCAAGTGTAGGATCTGTAGAAAGCAAAACGTCAGCAC 1789
Query 1760 CGGAAGCCACAACCGAGCGTGTAGAGACTCTTCCTGCAGGTTTTCTTACAATTGCCAGTG 1819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 CGGAAGCCACAACCGAGCGTGTAGAGACTCTTCCTGCAGGTTTTCTTACAATTGCCAGTG 1849
Query 1820 GTCTTATGGATACAAAATTGCGTTCGGACTACCGCCATCGTTTGCTTTCCTTGTGTTCAG 1879
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 GTCTTATGGATACAAAATTGCGTTCAGACTACCGCCATCGTTTGCTTTCCTTGTGTTCAG 1909
Query 1880 ATGTAGGCTTGGCTGCTGAGTCCAAAAGTGGAGGGAGTGGTGTGGATTTTTTAGGGCCTC 1939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1910 ATGTAGGCTTGGCTGCTGAGTCCAAAAGTGGAGGGAGTGGTGTGGATTTCTTAGGCCCTC 1969
Query 1940 TTCTTCCCGCTGTTGCAGAAATATGTTCAGATTTTGATCCTACTACGGATGTGGAACCTT 1999
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1970 TTCTTCCTGCTGTTGCAGAAATATGTTCAGATTTTGATCCTACTATGGATGTGGAACCTT 2029
Query 2000 CACTTTTGAAGTTGTTTCGCAATCTCTGGTTTTATATAGCCCTCTTTGGCTTAGCACCTC 2059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 CACTTTTGAAGTTGTTTCGCAATCTCTGGTTTTATATAGCCCTCTTTGGCTTAGCACCTC 2089
Query 2060 CTATTGTGAAAACTCCGACACCACCCCTGAAGTCAACCTCCAATTCAGTGAACAGTGTGG 2119
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 CTATTGTGAAAACTCCGACACCACCACTGAAGTCAACCTCCAATTCAGTGAACAGTGTGG 2149
Query 2120 GAAGCATGAGTGCAACTGCTTTGCAAGCTGTGGGAGGTCCTTACTTGTGGAACACTCAGT 2179
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||
Sbjct 2150 GAAGTATGAGTGCAACTGCTTTGCAAGCTGTGGGCGGTCCTTACATGTGGGACAATCAGT 2209
Query 2180 GGGCCCTAGCTGTTCAGCGAATTGCTCAAGGCACTcccccccTTGTCGTCAGTTCAGTAA 2239
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2210 GGGCTCTAGCTGTTCAGCGAATTGCTCAAGGCACTCCTCCCCTTGTCGTCAGTTCTGTAA 2269
Query 2240 AATGGCTTGAAGACGAATTAGAACTCAATGCACTTCACAATCCTGGTAGCCGCCGAGGAA 2299
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 AATGGCTTGAAGACGAATTAGAACTCAACGCACTTCACAATCCTGGTAGCCGCCGAGGAA 2329
Query 2300 ATGGAAATGAGAAAGTAGCTTCAACCCAGAGACTTGCTCTTTCAACTGCCTTAGGTGGCA 2359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 ATGGAAATGAGAAAGTAGCTTCAACCCAGAGACTTGCTCTTTCAACTGCCTTAGGTGGCA 2389
Query 2360 GAGTTGACGTTGCAGCAATGAACACAATCTCAGGGGTGAAGGCTACCTATTTGCTTGCTG 2419
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 GAGTTGACGTTGCAGCAATGAACACTATCTCAGGGGTGAAGGCTACCTATTTGCTTGCTG 2449
Query 2420 TGGCTTTTTTGGAGATCATACGTTTTATTAGCAACGGGGGTATCCTTAATGGTGACTCAA 2479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2450 TGGCTTTTTTGGAGATCATACGTTTTATTAGCAACGGGGGTATCCTTAATGGTGAATCAA 2509
Query 2480 GTGTATCTGCCTCTAGAAGTGCCTTCAGTTGTGTGTTCGAATATCTGAAAACTCCAAATC 2539
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 GCGTTTCTGCCTCTAGAAGTGCCTTCAGTTGTGTGTTCGAATATCTGAAAACTCCAAATC 2569
Query 2540 TTACTCCTGCTGTTTCCCAGTGTTTGACGGCAATTGTGCATAGAGCCTTTGAAACAGCAG 2599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 TTACTCCTGCTGTTTCCCAGTGTTTGACGGCAATTGTGCATAGAGCCTTTGAAACAGCAG 2629
Query 2600 TCTCATGGCTGGAAGATCGAATATCTCTTACTGGGAAAGATGCTCGTAATAGAGAACTGA 2659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 TCTCATGGCTGGAAGATCGAATATCTCTTACTGGGAAAGATGCTCGTAATAGAGAACTGA 2689
Query 2660 CAACATATGCACATGCATGTTTCCTCATAAAGAGCATGTCACAGAGAGATGAGCACGTCC 2719
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 CAACGTATGCACATGCATGTTTCCTCATAAAGAGTATGTCACAGAGAGATGAGCACGTCC 2749
Query 2720 GAGATATCTCTGTGAACCTGTTGACTCAGCTACGAGACAAATTTCCTCAGGTCCTCTGGC 2779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 GAGATATCTCTGTGAACCTGTTGACTCAGCTACGAGACAAATTTCCTCAGGTCCTCTGGC 2809
Query 2780 ATTCGTCATGTCTGGATAGTTTGCTGTTTTCAGTTCATGACAATACACCTTCAACTGTTG 2839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 ATTCGTCATGTCTGGATAGTTTGCTGTTTTCAGTTCATGACAATACACCTTCAACTGTTG 2869
Query 2840 TCAATGATCCTGCTTGGACTGCTGCTGTTCGATCCTTATACCAGAAAGTTGTACGAGAAT 2899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 TCAATGATCCTGCTTGGACTGCTGCTGTTCGATCCTTATACCAGAAAGTTGTACGAGAAT 2929
Query 2900 GGATCATAATATCACTTTCATATGCTCCATGCACCAGTCAGGGTTTGCTTCAGGATAAGC 2959
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2930 GGATCATAATATCGCTTTCATATGCTCCATGCACCAGTCAGGGTCTGCTTCAGGATAAGC 2989
Query 2960 TGTGCAAAGCAAACACATGGCAGCGAGCACAAACTACAACTGATGTGGTTTCTCTTCTAT 3019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 TGTGCAAAGCAAACACATGGCAGCGAGCACAAACTACAACTGATGTGGTTTCTCTTCTAT 3049
Query 3020 CTGAGATAAAAATTGGAACTGGAAAAAATGAACTTTGGTCTGGGATAAGAACTGCTAATA 3079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 CTGAGATAAAAATTGGAACTGGAAAAAATGAACTTTGGTCTGGGATAAGAACTGCTAATA 3109
Query 3080 TCCCAGCTGTGATGGCTGCAGCAGCTGCAGCGTCAGGGGCAAACTTAAAAGTTTCTGAAG 3139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 TCCCAGCTGTGATGGCTGCAGCAGCTGCAGCGTCAGGGGCAAACTTAAAAGTTTCTGAAG 3169
Query 3140 CCTTTAACTTGGAAGTACTTGGTACTGGTGTAGTCAGTGCAACGGTAAAGTGCAACCATG 3199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 CCTTTAACTTGGAAGTACTTGGTACTGGTGTAGTCAGTGCAACGGTAAAGTGCAACCATG 3229
Query 3200 CTGGAGAAATTGCTGGCATGCGAAGGTTGTACAACAGTATTGGTGGATTTCAATCTGGCT 3259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3230 CTGGAGAAATTGCTGGCATGCGAAGGTTGTACAACAGTATTGGTGGATTTCAATCTGGCT 3289
Query 3260 CGACACCTAGTGGTTTTGGTGGTGGCCTTCAAAGGTTAATATCTGGAGCATTTTCCCAGG 3319
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 CGACACCTAGTGGTTTTGGTGGTGGCCTTCAAAGATTAATATCTGGAGCATTTTCCCAGG 3349
Query 3320 CACCACAACCAGAAGATGATTCATTTAATGAGATGTTAATTGCCAGGTTTGTGCGTCTTC 3379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3350 CACCACAACCAGAAGATGATTCATTTAATGAGATGTTAATTGCCAGGTTTGTGCGTCTTC 3409
Query 3380 TTCAGCAATTTGTAAATACTGCTGAAAAGGGTGGAGAGGTGGAGAAGTCGCAATTCCGAG 3439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3410 TTCAGCAATTTGTAAATACTGCTGAAAAGGGTGGAGAGGTGGAGAAGTCGCAATTCCGAG 3469
Query 3440 AAACTTGTTCCCAAGCAACTGCATTACTTCTGTCAAACCTGGGTGGTGAGTCGAAAACAA 3499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3470 AAACTTGTTCCCAAGCAACTGCATTACTTCTGTCAAACCTGGGTGGTGAGTCGAAAACAA 3529
Query 3500 ATGTCGAAGGCTTTTCTCAATTACTGCGTCTCCTTTGTTGGTGTCCAGCATATATATCTA 3559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3530 ATGTCGAAGGCTTTTCTCAATTACTGCGTCTCCTTTGTTGGTGTCCAGCATATATATCTA 3589
Query 3560 CTCCAGATGCTATGGAAACTGGAATTTTTATATGGACCTGGTTGGTCTCTGCTGCTCCTC 3619
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3590 CTCCAGACGCTATGGAAACTGGAATTTTTATATGGACCTGGTTGGTTTCTGCTGCTCCTC 3649
Query 3620 AACTGGTATCTCTTGTCCTTGCCGAGCTTGTTGATGCATGGATATGGACAATTGATACAA 3679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 AACTGGTATCTCTTGTCCTTGCCGAGCTTGTTGATGCATGGATATGGACAATTGATACAA 3709
Query 3680 AGCGAGGACTCTTTGCATCTGATGTACGATACTCTGGCCCAGCTGCAAAATTAAGACCCC 3739
| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3710 AACGTGGTCTCTTTGCATCTGATGTACGATACTCTGGCCCAGCTGCAAAATTAAGACCCC 3769
Query 3740 ATCTTTCCCCAGGGGAACCAGAAGATCCACCGGAAAGTGACCCTGTTGAGCAGATAGTCG 3799
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3770 ATCTTTCCCCAGGGGAACCAGAAGATCCACCTGAAAGTGACCCTGTTGACCAGATAGTTG 3829
Query 3800 CTCACAGACTGTGGCTTGGGTTTTTGATTGATCGTTTTGAGGTTGTTCGACATAATAGTG 3859
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3830 CTCACAGACTGTGGCTTGGATTTTTGATAGATCGTTTTGAGGTTGTTCGACATAATAGTG 3889
Query 3860 CGGAGCAACTGTTGCTGCTAGGTCGGATGTTACAACGGAGTACAGACCTTGACTGGTGCT 3919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3890 CGGAGCAACTGTTGCTGCTAGGTCGGATGTTACAACGGAGTACAGACCTTGAATGGTGCT 3949
Query 3920 TTACTCGCCACCCTGCAGCTGCTGGTACCtttttttCTTTGATGCTCCTTGGACTGAAAT 3979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3950 TTACTCGCCACCCTGCAGCTGCTGGTACCTTTTTTTCTTTGATGCTCCTTGGACTGAAAT 4009
Query 3980 TCTGCTCATGCCAAACACAAGGCAATATGCAGAAATTTAGATCTGGACTCCAGCTCTTAG 4039
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 4010 TCTGCTCATGCCAAACACAAGGCAACATGCAGAAATTTCGATCTGGACTCCAGCTTTTAG 4069
Query 4040 AAGATCGAATCTACAGGACGTCTTTAGGCTGGTTTGCTCATCAGCCAGAGTGGTATGATG 4099
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4070 AAGATCGAATCTATAGGACGTCTTTAGGCTGGTTTGCTCATCAGCCAGAGTGGTATGATG 4129
Query 4100 TAAATATTCCAAATTTTTGTCAGAGCGAGGCTCTATCTGTTTCAGTTTTTGTTCACTTTT 4159
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4130 TAAATATTCCAAATTTTTGTCATAGCGAGGCTCTATCTGTTTCAGTTTTTGTTCACTTTT 4189
Query 4160 TATCAAACGAGCTATCAGAATCAAGTCAATCTGATTCCAAAGGAAAACCTCGTGAAAGTG 4219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4190 TATCAAACGAGCTATCAGAATCAAGTCAATCTGATTCCAAAGGAAAACCTCGTGAAAGTG 4249
Query 4220 GGAATTTGATTGATGTGACTGATCAGTATCATCCTGTCTGGGGTGAGATGGACAACTACA 4279
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4250 GGAATTTGATTGATGTGACTGATCAGTATCATCCCGTCTGGGGTGAGATGGACAACTACA 4309
Query 4280 CTGTGGGAAAAGAAAAAAGGAAGCAGTTGCTTTTAATGCTCTGCCAGCATGAAGCTGACA 4339
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 CTCTGGGAAAAGAAAAAAGGAAGCAGTTGCTTTTAATGCTCTGCCAGCATGAAGCTGACA 4369
Query 4340 GGCTTGATGTTTGGGCACAACCTATTAGTTCAAAGGACAGTCCATATTCGCGGCTTAAAA 4399
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 4370 GGCTTGACGTTTGGGCACAACCTATTAGTTCAAAGGACAGTCCGTATTCGCGGCTGAAAA 4429
Query 4400 TAAGCTCTGAGAAATGGACCGAATATGCTAAAACGGCCTTTTCAGTGGATCCTCGCATTG 4459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 TAAGCTCTGAGAAATGGACCGAATATGCTAAAACGGCCTTTTCAGTGGATCCTCGCATTG 4489
Query 4460 CTTTATCAGTCGCCTCAAGATTTCCGGCAAATGCTTCTGTAAAATCTGAAGTCACTCAGC 4519
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4490 CTTTATCAGTTGCCTCAAGATTTCCGGCAAATGCTTCTGTGAAATCTGAAGTCACTCAGC 4549
Query 4520 TGGTTCAGACAAATATAGTAGATCTTCGTACAATTCCTGAGGCATTGCCGTATTTTGTTA 4579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4550 TGGTTCAGACAAATATAGTAGATCTTCGTACAATTCCTGAGGCATTGCCGTATTTTGTTA 4609
Query 4580 CACCAAAAAACGTTGAAGAGAACTCAGTGCTGTTGCAGCAGCTACCGCACTGGGCTGCTT 4639
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4610 CACCGAAAAATGTTGAAGAGAACTCAGTGCTGTTGCAGCAGCTACCGCACTGGGCTGCTT 4669
Query 4640 GTTCAATTACACAGGCTCTTGAGTTCCTCACGCCTGCTTATAAGGGACATCCACGTGTCA 4699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4670 GTTCAATTACACAGGCTCTTGAGTTCCTCACGCCTGCTTATAAGGGACATCCACGTGTCA 4729
Query 4700 TGGCATATGTCCTACGAGTTTTAGAGTCCTACCCTCCTGAGCGAGTTACTTTTTTCATGC 4759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4730 TGGCATATGTCCTACGAGTTTTAGAGTCCTACCCTCCTGAACGAGTTACTTTTTTCATGC 4789
Query 4760 CGCAGTTGGTGCAGTCTTTGCGCTATGATGAAGGGAGGCTAGTTGAAGGGTATCTTCTTA 4819
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4790 CGCAGTTGGTGCAGTCTTTGCGCTATGATGATGGGAGGCTAGTTGAAGGGTATCTTCTTA 4849
Query 4820 GAGCTACCCAAAGAAGTGACATATTTGCCCATATTCTCATTTGGCATTTGCAGGGTGAGA 4879
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4850 GAGCTACCCAAAGAAGTGACATATTTGCCCACATTCTCATTTGGCATTTGCAAGGTGAGG 4909
Query 4880 ATGTTCAGGAAACTCCGAAGGATGGTTCTATCGATAAGAATGCGGCATTCCAAGTAATTT 4939
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4910 ATGTGCAGGAAACTCCGAAGGATGGTTCTATCGATAAGAATGCGGCATTCCAAGAAATTT 4969
Query 4940 TGCCAGTGGTTCGGCAGCATATCATTGATGGTTTCAGTCCCAATGCCTTGGACATGTTCA 4999
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4970 TGCCACAGGTTCGGCAGCATATCATTGATGGTTTCAGCCCCAACGCCTTGGACATGTTCA 5029
Query 5000 CTAGAGAGTTTGACTTCTTTGACAAGGTTACTTCTATTTCTGGGGTGCTATTTCCTCTTC 5059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||
Sbjct 5030 CTAGAGAGTTTGACTTCTTTGACAAGGTTACTTCTATATCTGGGGTGTTATTCCCTCTTC 5089
Query 5060 CAAAGGAAGAACGCAGAGCCGGTATTAGGAGGGAGTTGGAGAAAATTGAAATGCAGGGAG 5119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5090 CAAAGGAAGAACGCAGAGCCGGTATTAGGAGGGAGTTGGAGAAAATTGAAATGCAGGGAG 5149
Query 5120 ATGACCTTTATTTGCCAACTGCTCCTAACAAGCTTGTTAGGGGTATCCGTGTAGACAGTG 5179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5150 ATGACCTTTATTTGCCAACTGCTCCTAACAAGCTTGTTAGGGGTATCCGTGTAGACAGTG 5209
Query 5180 GAATACCCTTACAATCAGCTGCCAAAGTCCCTATTATGATAACTTTTAACGTTGTTGATC 5239
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5210 GAATACCCTTACAATCAGCTGCCAAAGTCCCTATCATGATAACTTTTAACGTTATTGATC 5269
Query 5240 GTGATGGTGACCACAGTGATGTAAAACCACAGGCTTGCATTTTCAAGGTTGGAGATGATT 5299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5270 GTGATGGTGACCACAGTGATGTAAAACCACAGGCTTGCATTTTCAAGGTTGGAGATGATT 5329
Query 5300 GCCGGCAAGATGTTCTTGCCCTTCAAGTGATATCTCTTCTTAGAGACATATTTCAAGCGG 5359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5330 GCCGGCAAGATGTTCTTGCCCTTCAAGTGATATCTCTTCTTAGAGACATATTTCAAGCAG 5389
Query 5360 CTGGTCTTAATCTTTATCTTTTTCCATATGGAGTACTCCCAACTGGTGCGGAGAGGGGCA 5419
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5390 CTGGTCTTAACCTTTATCTTTTTCCATATGGAGTACTCCCAACTGGTGCGGAAAGGGGCA 5449
Query 5420 TAATTGAGGTTGTGCCTAATACAAGAAGCAGAAGTCAAATGGGTGAAACTACCGACGGGG 5479
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 5450 TAATTGAGGTGGTGCCTAATACAAGAAGCAGAAGTCAAATGGGTGAGACTACTGACGGGG 5509
Query 5480 GTTTGTATGAGATTTTCCAACAAGACTATGGACCCGTCGGCTCAACCACCTTTGAAACAG 5539
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5510 GTTTGTATGAGATTTTTCAACAAGACTATGGACCCGTCGGCTCAACCACCTTTGAAACAG 5569
Query 5540 CACGAGAGAACTTCCTTATCAGCAGTGCCGGTTACGCTGTGGCTAGTCTTTTACTCCAGC 5599
|||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5570 CACGGGAGAACTTCCTCATCAGTAGTGCCGGTTATGCAGTGGCTAGTCTTTTACTCCAGC 5629
Query 5600 CCAAAGACAGACACAATGGAAATCTCCTCTTCGATGACGTGGGAAGACTTGTCCACATCG 5659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5630 CCAAAGACAGACACAATGGAAATCTCCTCTTCGATGACGTGGGAAGACTTGTCCACATCG 5689
Query 5660 ACTTTGGTTTCATTTTGGAAACTTCACCTGGTGGAAACATGCGGTTTGAGAGTGCTCATT 5719
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||
Sbjct 5690 ACTTTGGTTTCATTTTGGAAACTTCGCCTGGTGGGAACATGCGATTCGAGAGTGCTCATT 5749
Query 5720 TCAAACTGAGCCACGAAATGACCCAATTGCTAGATCCCTCGGGTGTTATGAAAAGCAAAA 5779
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5750 TCAAACTGAGCCACGAAATGACTCAGTTGCTAGATCCCTCGGGTGTTATGAAAAGCAAAA 5809
Query 5780 CATGGCATCAGTTTGTGAGCTTGTGCGTCAAGGGGTACTTAGCTGCTCGGCGGCAGATGG 5839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5810 CATGGCATCAGTTTGTGAGCTTGTGCGTCAAGGGGTACTTAGCTGCTCGGCGGCAGATGG 5869
Query 5840 ACGGAATCATCAGCACGGTGCAAATGATGCTAGAAAGTGGATTGCCTTGCTTTAGCAGAG 5899
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5870 ATGGAATCATCAGCACGGTGCAAATGATGCTAGAAAGTGGGTTGCCTTGCTTTAGCAGAG 5929
Query 5900 GAGATCCAATTGGTAATCTTAGGAAAAGATTTCACCCAGAAATGAGCGAACGTGAAGCTG 5959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5930 GAGATCCAATTGGTAATCTTAGGAAAAGATTTCACCCAGAAATGAGCGAACGTGAAGCTG 5989
Query 5960 CACACTTCATGATTCATGTATGTACGGACGCATATAACAAGTGGACTACGGCTGGATACG 6019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5990 CACACTTCATGATTCATGTATGTACGGACGCATATAACAAGTGGACTACTGCTGGATACG 6049
Query 6020 ACTTGATTCAATATTTGCAACAAGGCATCGAGAAGTAAGAAGAACAAGAGGGAACTTGAT 6079
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 6050 ACTTGATTCAGTATTTGCAACAAGGCATCGAGAAGTAAGAAGAAGAAGAGGGAACTTAAT 6109
Query 6080 GATATCCGAAATCAGAGTTATATAATTTGCAGGTAAAAA 6118
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6110 GATATCCGAAACCAGAGTTATATAATTTGCAGGTAAAAA 6148
Score = 981 bits (531), Expect = 0.0
Identities = 596/627 (95%), Gaps = 6/627 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGGCACTGACGGAGCTTTGTGACATTATAGCAGAGAATCCGAAGCAATTCTCGGAG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGCACTGACGGAGCTTTGTGACATTATAGCAAAGAATCCGAAGCAATTCTCGGAG 60
Query 61 AAATTAGCTTGGATATGCGGTCGTTGTCCACAAACGGAATGGCTTCTCGCTGAATCGCCC 120
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAGTTAGCTTGGATATGCGGTCGTTGTCCACAAACGGAATGGCTTCTCGCTGAATCGCCC 120
Query 121 AGGGTTTCTCGGAGTCATCTCAACGCGGTTTTAGCCGTTGCTCGGATTATCTCCAAAAAT 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 121 AGGGTTTCTCGGAGTCATCTCAACGCTGTTTTAGCCGTTGCTCGGATCATCTCCAAGAAT 180
Query 181 CCAGAATCAATCGATAATCGTGCCAAATCCGTCGTGAATGAGTTTCTCAGCGCTATACCT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCAGAATCAATCGATAATCGTGCCAAATCCGTCGTTAATGAGTTTCTCAGCGCTATACCT 240
Query 241 GCATCGTTCCGCCGTTCCTTCTGGCCGCATTCGTTTCC-TTCGCAG-TCGATCTCTTCGT 298
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||
Sbjct 241 GCATCGTTCCGCCGTTCCTTCTGGCCGCATTC-TTTCCCTTCGCAGCT-GATCTCTTCGT 298
Query 299 TTTATTGTGATTTCTTGAGTTATCTTTCGTGTGCGGCGGATCTATCGCCGGAATTTGGTA 358
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 299 TTTATTGTGATTTCTTGAGTTATCTTTCGTGTGCGGCGGATCTATCCCCGGAATTTGGTA 358
Query 359 CCGAGGTTGCTAGGTTTACAGGGGAAGTTGTGATAGCCGCTATTGCACCGAGTTCTGGTG 418
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CAGAGGTTGCTAGGTTTACAGGGGAAGTTGTGATAGCCGCTATTGCACCGAGTTCTGGTG 418
Query 419 -TGAGCGACGGGGATCCAGCAATTTCTAAGGCTTTTTTGGTCGCACTTTCTCAGAATTTT 477
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 419 AT-AGCGACGGGGATCCAGCAATTTCTAAGGCTTTCTTGGTCGCGCTTTCTCAGCATTTC 477
Query 478 CCGTCGATTCTGCAATCTGATGGGGATAAGTTGATTTTAATGCTGCTTGATCAGTTTGTT 537
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 CCGTCGATTCTGCAGTCTGATGGAGATAAATTGATAACAATGCTGCTTGATCAGTTTGTT 537
Query 538 GTGAACCGTGCTCCTGCCTCTCCCAAGGACCAGCGGCAACAGAACTCGGCTAACTCTGAA 597
|||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 538 CTGAACCGTGCTCCTGCTTCGCCCAAGGAACAGCGGCAGCAGAACTCGGCTAACTCTGAA 597
Query 598 ACTGAAACCTCGTCGTCTCAGGGCTCT 624
||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 598 ACTGATACTTCGTCGTCTCAGGGCTCT 624
> AT1G51040.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein
| chr1:18920658-18923314 FORWARD LENGTH=1578
Length=1578
Score = 1546 bits (837), Expect = 0.0
Identities = 1124/1260 (89%), Gaps = 30/1260 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4801 GTTGAAGGGTATCTTCTTAGAGCTACCCAAAGAAGTGACATATTTGCCCATATTCTCATT 4860
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 346 GTTGAAGGGTATCTTCTTAGAGCTGCCCAAAGAAGTGACATATTTGCTCATACCCTCATT 405
Query 4861 TGGCATTTGCAGGGTGAGAATGTTCAGGAAACT-CCGAAGGATGGTTCTATCGATAAGAA 4919
|||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||| |||||| || ||||||||||
Sbjct 406 TGGCATTTACAGGGTGAGTCTGTTGAGGAAA-TAGTGAAAGATGGTGCTTTCGATAAGAA 464
Query 4920 TGCGGCATTCCAAGTAATTTTGCCAGTGGTTCGGCAGCATATCATTGATGGTTTCAGTCC 4979
||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 465 TGCATCATTCCAAGAAATCTTGTCAGACGTTCGGCAGCATATCGTTGATGGTTTCACTCC 524
Query 4980 CAATGCCTTGGACATGTTCACTAGAGAGTTTGACTTCTTTGACAAGGTTACTTCTATTTC 5039
||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 525 CAAGGCCTTGAATTTTTTCAGTAGAGAGTTTGACTTCTTTGAAAAGGTCACATCTATTTC 584
Query 5040 TGGGGTGCTATTTCCTCTTCCAAAGGAAGAACGCAG-AGCCGGTATTAGGAGGGAGTTGG 5098
||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 585 TGGGGCATTACTTCCTCTTCCAAAGGAAGAACG-AGTAGCTGGTATTAGGAGGGAATTGG 643
Query 5099 AGAAAATTGAAATGCAGGGAGATGACCTTTATTTGCCAACTGCTCCTAACAAGCTTGTTA 5158
||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || |
Sbjct 644 AGAAAATCAAAATGCAAGGAGAAGATCTTTATCTGCCGACTGCTCCTAACAAGCTCGTCA 703
Query 5159 GGGGTA-TCCGTGTAGACAGTGGAATACCCTTACAATCAGCTGCCAAAGTCCCTATTATG 5217
||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 704 GGGTTATTCAG-GTAGACAGTGGAATACCCCTACAATCAGCTGCCAAAGTCCCTATCATG 762
Query 5218 ATAACTTTTAACGTTGTTGATCGTGATGGTGACCACAGTGATGTAAAACCACAGGCTTGC 5277
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||
Sbjct 763 ATAACCTTTAACGTTGTTGATCTTGATGGTGACCACAATGATGTGAAACCTCAAGCTTGT 822
Query 5278 ATTTTCAAGGTTGGAGATGATTGCCGGCAAGATGTTCTTGCCCTTCAAGTGATATCTCTT 5337
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 823 ATTTTCAAGGTTGGAGATGATTGCCGTCAAGATGTTCTTGCCCTGCAAGTGATATCTCTT 882
Query 5338 CTTAGAGACATATTTCAAGCGGCTGGTCTTAATCTTTATCTTTTTCCATATGGAGTACTC 5397
||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 883 CTTGGAGACATATTTCAAGCTGTTGGTCTTAATCTCTATCTTTTTCCATATGGAG---T- 938
Query 5398 CCAACTGGTGCGGAGAGGGGCATAATTGAGGTTGTGCCTAATACAAGAAGCAGAAGTCAA 5457
||| | | | || | |||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 939 ---ACT--T-C---------C--AACT---GTTGTGCCAAATACACGAAGCAGAAGTCAA 978
Query 5458 ATGGGTGAAACTACCGACGGGGGTTTGTATGAGATTTTCCAACAAGACTATGGACCCGTC 5517
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||
Sbjct 979 ATGGGTGAAACAACCGACGGGGGTTTGTATGAGATTTTTCAACAAAACTATGGACTCGTT 1038
Query 5518 GGCTCAACCACCTTTGAAACAGCACGAGAGAACTTCCTTATCAGCAGTGCCGGTTACGCT 5577
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||
Sbjct 1039 GGCTCAACCACCTTTGAAACAGCACGAGCGAACTTCCTCATAAGCAGTGCCGGGTATGCT 1098
Query 5578 GTGGCTAGTCTTTTACTCCAGCCCAAAGACAGACACAATGGAAATCTCCTCTTCGATGAC 5637
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1099 GTGGCTAGTCTTTTACTCCAGCCCAAAGATAGACACAACGGAAATCTCCTTTTCGATGAC 1158
Query 5638 GTGGGAAGACTTGTCCACATCGACTTTGGTTTCATTTTGGAAACTTCACCTGGTGGAAAC 5697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 GTGGGAAGACTTGTCCACATCGACTTTGGTTTCATTTTGGAAACTTCACCTGGTGGAAAC 1218
Query 5698 ATGCGGTTTGAGAGTGCTCATTTCAAACTGAGCCACGAAATGACCCAATTGCTAGATCCC 5757
||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1219 ATGAGGTTCGAAAATGCTCATTTCAAACTGAGCCACGAAATGACCCAGTTGCTAGATCCT 1278
Query 5758 TCGGGTGTTATGAAAAGCAAAACATGGCATCAGTTTGTGAGCTTGTGCGTCAAGGGGTAC 5817
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1279 TCAGGTGTTATGAAAAGCAAAACATGGCATCAGTTTGTGAGCTTGTGCGTCAAGGGATAC 1338
Query 5818 TTAGCTGCTCGGCGGCAGATGGACGGAATCATCAGCACGGTGCAAATGATGCTAGAAAGT 5877
||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 TTAGCTGCTCGCCGGTACATGGACGAAATCATTAGCACGGTGCAAATGATGCTAGAAAGT 1398
Query 5878 GGATTGCCTTGCTTTAGCAGAGGAGATCCAATTGGTAATCTTAGGAAAAGATTTCACCCA 5937
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1399 GGATTGCCTTGCTTTAGCAGAGGAGATCCAATAGGTAATCTTAGGAAAAGATTCCACCCA 1458
Query 5938 GAAATGAGCGAACGTGAAGCTGCACACTTCATGATTCATGTATGTACGGACGCATATAAC 5997
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || || ||||||
Sbjct 1459 GAAATGAGCGAACGTGAAGCTGCACTCTTTATGATTAATGTATGTACCGATGCTTATAAC 1518
Query 5998 AAGTGGACTACGGCTGGATACGACTTGATTCAATATTTGCAACAAGGCATCGAGAAGTAA 6057
|| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1519 AAATGGACTACTGCTGGATATGACTTGATTCAGTATTTGCAACAAGGCGTTGAGAAGTAA 1578
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 305312046690
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5