BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg474136
Length=1729
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G50010.1 | Symbols: TUA2 | tubulin alpha-2 chain | chr1:1851... 2706 0.0
AT4G14960.2 | Symbols: TUA6 | Tubulin/FtsZ family protein | chr... 2305 0.0
AT1G04820.1 | Symbols: TUA4, TOR2 | tubulin alpha-4 chain | chr... 2268 0.0
> AT1G50010.1 | Symbols: TUA2 | tubulin alpha-2 chain | chr1:18517586-18520000
FORWARD LENGTH=1775
Length=1775
Score = 2706 bits (1465), Expect = 0.0
Identities = 1633/1712 (95%), Gaps = 20/1712 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAACCTAGAAATCG-AAAAATCAGATCTAGATCT-AAAGAAGAGCGTCTTCATAAAC 58
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 20 TAAAAACCTAGAAATCGAAAAAATCAGATCTAGATCTAAAAGAAGAGCGTCTTCATAAAC 79
Query 59 GCCcttcttcttcttcttcgtgttcttccctgcaaatctagtttctagatcttttctttc 118
| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 G-CC--CTTCTTCTTCTTCGTCTTCTTCCCTGCAAATCTAGTTTCTAGATCTTTTCTTTC 136
Query 119 ttcCGCGAAACGAAAATGAGAGAGTGCATTTCGATCCACATTGGTCAGGCCGGTATCCAG 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 TTCCGCGAAACGAAAATGAGAGAGTGCATTTCGATCCACATTGGTCAGGCCGGTATCCAG 196
Query 179 GTCGGAAACGCTTGCTGGGAGCTTTATTGTCTTGAACATGGCATTCAGCCTGATGGTCAG 238
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 197 GTCGGAAATGCTTGCTGGGAGCTTTACTGTCTTGAACATGGCATTCAGCCTGATGGCCAG 256
Query 239 ATGCCCAGTGACAAGACTGTAGGCGGAGGTGACGATGCTTTCAACACCTTCTTCAGTGAA 298
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 ATGCCGAGTGACAAGACTGTTGGCGGAGGTGACGATGCTTTCAACACCTTCTTCAGTGAG 316
Query 299 ACCGGTGCAGGGAAGCACGTCCCACGTGCTGTCTTTGTTGATCTTGAGCCAACTGTGATC 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 ACCGGTGCAGGGAAGCACGTCCCACGTGCTGTCTTTGTTGATCTTGAGCCAACTGTGATC 376
Query 359 GATGAGGTCAGGACTGGTACTTACCGTCAGCTTTTCCACCCTGAACAACTCATCAGCGGT 418
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 377 GATGAGGTCAGGACTGGTACTTACCGTCAGCTTTTCCACCCTGAGCAACTCATCAGCGGT 436
Query 419 AAAGAAGACGCAGCTAACAACTTCGCCCGTGGACATTACACCATTGGGAAAGAGATTGTT 478
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 AAAGAAGACGCAGCTAACAATTTCGCCCGTGGGCATTACACCATTGGGAAAGAGATTGTT 496
Query 479 GATCTGTGTTTGGACCGTATCAGAAAGCTCGCTGATAACTGTACTGGTCTCCAAGGATTC 538
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 GATCTGTGCTTGGACCGTATCAGAAAGCTCGCTGATAACTGTACTGGTCTCCAAGGATTC 556
Query 539 CTCGTCTTCAACGCTGTTGGTGGAGGGACTGGATCTGGTCTTGGATCTCTCCTCCTTGAG 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 CTCGTCTTCAACGCTGTTGGTGGAGGGACTGGATCTGGTCTTGGATCTCTCCTCCTTGAG 616
Query 599 AGACTTTCTGTTGACTATGGCAAAAAGTCCAAGTTGGGTTTCACTGTTTACCCATCTCCA 658
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 617 AGACTTTCTGTTGACTACGGGAAAAAGTCCAAGTTGGGTTTCACAGTTTACCCATCTCCA 676
Query 659 CAGGTCTCCACCTCTGTTGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTCTCCACTCACTCACTCTTG 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 CAGGTCTCCACCTCTGTTGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTCTCCACTCACTCACTCTTG 736
Query 719 GAACACACTGATGTCTCCATCCTCCTCGACAATGAAGCTATCTATGACATCTGCAGACGC 778
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 GAACACACTGATGTCTCTATCCTCCTCGACAATGAAGCTATCTATGACATCTGCAGACGT 796
Query 779 TCCCTAAGCATTGAGAGACCAACCTACACCAACCTCAACCGTCTTGTCTCTCAGGTTATT 838
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 797 TCCCTAAGCATTGAGAGACCCACCTACACCAACCTCAACCGTCTCGTCTCTCAGGTTATC 856
Query 839 TCTTCCTTGACTGCTTCTCTGAGGTTCGATGGAGCCTTGAATGTTGATGTCACTGAGTTC 898
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 857 TCATCCTTGACTGCTTCTCTGAGGTTCGATGGTGCCTTGAATGTTGATGTGACTGAGTTC 916
Query 899 CAAACCAACTTGGTCCCATACCCAAGAATCCACTTTATGCTTTCCTCCTATGCCCCAGTC 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 CAAACCAACTTGGTCCCATACCCAAGAATCCACTTCATGCTTTCCTCCTATGCCCCAGTC 976
Query 959 ATCTCTGCAGAGAAGGCCTTCCATGAGCAACTCTCAGTTGCTGAGATCACAAACAGTGCT 1018
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 ATCTCCGCAGAGAAGGCCTTCCATGAGCAGCTCTCGGTTGCTGAGATCACAAACAGTGCT 1036
Query 1019 TTTGAGCCAGCTTCCATGATGGCTAAGTGTGACCCTCGTCACGGGAAGTACATGGCCTGC 1078
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1037 TTTGAGCCAGCATCCATGATGGCAAAGTGTGACCCTCGTCACGGAAAGTACATGGCTTGC 1096
Query 1079 TGTTTGATGTACCGTGGTGATGTTGTCCCCAAGGATGTGAACGCAGCTGTTGGCACAATC 1138
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1097 TGTTTGATGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGATGTGAACGCAGCTGTTGGCACCATC 1156
Query 1139 AAGACCAAGCGCACTATTCAGTTTGTTGACTGGTGTCCCACTGGGTTCAAGTGTGGTATC 1198
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1157 AAGACCAAGCGTACTATTCAGTTTGTGGACTGGTGTCCTACTGGATTCAAGTGTGGAATC 1216
Query 1199 AACTACCAGCCACCAACTGTTGTTCCAGGAGGTGATCTTGCTAAAGTGCAGAGAGCTGTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1217 AACTACCAGCCACCAACTGTTGTTCCAGGAGGTGATCTTGCTAAAGTCCAGAGAGCTGTG 1276
Query 1259 TGTATGATCTCAAACTCTACCAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCCCGTATTGATCACAAGTTT 1318
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 TGTATGATCTCAAACTCCACCAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCCCGTATTGATCACAAGTTT 1336
Query 1319 GATCTTATGTACGCCAAACGTGCTTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGTATGGAAGAA 1378
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 GATCTTATGTACGCAAAACGTGCTTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGTATGGAAGAA 1396
Query 1379 GGTGAATTCTCAGAGGCTCGTGAGGATCTTGCAGCATTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTT 1438
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1397 GGAGAATTTTCAGAGGCTCGTGAGGATCTTGCAGCATTGGAGAAGGATTACGAAGAGGTT 1456
Query 1439 GGTGCTGAAGGTGGTGACGATGAGGATGATGAAGGAGAGGAGTACTAAGAAGAAGGGTGT 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 1457 GGTGCTGAAGGTGGTGACGATGAGGATGATGAAGGAGAGGAGTACTAAGAAG--GT-TGT 1513
Query 1499 GGGTTTTATGTGGGCTTTCTGTTATCTCGTGTTTGTGTGAATGGGCTCGAAACTCTTACG 1558
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1514 CGGTTTTATGTGGGATTTCTATTATCTCGTGTTTGTGTGAATAGGCTCGAAACTCTTACG 1573
Query 1559 AGTCCTAGTTGTGTTTTTCAAAAACCATATTTCTATCTCTTGCTTGTGGCGGTAGCCATT 1618
|||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 AGTCGTACTTGTGTTTT-CAAAAACCATATTTCTATCTCTTGCTTGTGGCGGTAGCCATT 1632
Query 1619 TGATTTCTA-TTA-TCTAGTT-C-G-T--T-TGTTCATTTCCAAGAACTGAATTTAAGAT 1670
|| || ||| || | | ||| | | | | | ||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 1633 TG-TT-CTAGTTCGTTT-GTTTCTGATAATATTTTCATCTCCAAGAACTGAATTTAAGCT 1689
Query 1671 GGGTTTGGTTTGAATTGATTGTCCAAAACCTA 1702
||||||||||| ||| |||||||||||| |||
Sbjct 1690 GGGTTTGGTTTAAATCGATTGTCCAAAATCTA 1721
> AT4G14960.2 | Symbols: TUA6 | Tubulin/FtsZ family protein | chr4:8548492-8550453
REVERSE LENGTH=1764
Length=1764
Score = 2305 bits (1248), Expect = 0.0
Identities = 1531/1660 (92%), Gaps = 50/1660 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 AACCTAGAAATCGAAAAATCAGATCTAGATCTAAAGAAGAGCGTCTTCATAAACGCCctt 64
||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 AACCTAGAAATCG-AAAAT---ATC-AGATCTAAAGAAGAGCGTCTTCATAAACG----- 73
Query 65 cttcttcttcttcgtgttcttccctgcaaatctagtttctagatcttttctttcttcCGC 124
| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 74 ---C--C--CTTCGTCTTCTTCCCTGCAAATCTATTTTCTAGATC-TTTCTTTCTTCCGC 125
Query 125 GAAACGAAAATGAGAGAGTGCATTTCGATCCACATTGGTCAGGCCGGTATCCAGGTCGGA 184
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 126 GAAACGACAATGAGAGAGTGCATTTCGATCCACATTGGTCAGGCTGGTATTCAAGTCGGA 185
Query 185 AACGCTTGCTGGGAGCTTTATTGTCTTGAACATGGCATTCAGCCTGATGGTCAGATGCCC 244
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 186 AATGCTTGCTGGGAGCTTTACTGTCTTGAACATGGCATTCAGCCTGATGGCCAGATGCCT 245
Query 245 AGTGACAAGACTGTAGGCGGAGGTGACGATGCTTTCAACACCTTCTTCAGTGAAACCGGT 304
||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246 GGTGACAAGACTGTTGGTGGAGGTGATGATGCTTTCAACACCTTCTTCAGTGAAACCGGT 305
Query 305 GCAGGGAAGCACGTCCCACGTGCTGTCTTTGTTGATCTTGAGCCAACTGTGATCGATGAG 364
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 306 GCAGGTAAGCACGTCCCACGTGCTGTCTTTGTTGATCTTGAGCCAACTGTGATCGACGAG 365
Query 365 GTCAGGACTGGTACTTACCGTCAGCTTTTCCACCCTGAACAACTCATCAGCGGTAAAGAA 424
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 366 GTCAGGACTGGTACTTACCGTCAGCTTTTCCACCCTGAACAACTCATCAGTGGTAAAGAA 425
Query 425 GACGCAGCTAACAACTTCGCCCGTGGACATTACACCATTGGGAAAGAGATTGTTGATCTG 484
||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 GACGCTGCTAACAATTTCGCCCGTGGTCATTACACCATTGGGAAAGAGATTGTTGATCTC 485
Query 485 TGTTTGGACCGTATCAGAAAGCTCGCTGATAACTGTACTGGTCTCCAAGGATTCCTCGTC 544
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 486 TGCTTGGACCGGATCAGAAAGCTCGCTGATAACTGTACTGGTCTTCAAGGATTCCTTGTT 545
Query 545 TTCAACGCTGTTGGTGGAGGGACTGGATCTGGTCTTGGATCTCTCCTCCTTGAGAGACTT 604
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 546 TTCAACGCTGTTGGTGGTGGGACTGGATCTGGTCTTGGATCTCTTCTCCTTGAGAGACTT 605
Query 605 TCTGTTGACTATGGCAAAAAGTCCAAGTTGGGTTTCACTGTTTACCCATCTCCACAGGTC 664
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 TCTGTTGACTATGGGAAAAAGTCCAAGTTGGGTTTCACTGTTTACCCATCTCCACAGGTG 665
Query 665 TCCACCTCTGTTGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTCTCCACTCACTCACTCTTGGAACAC 724
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 666 TCTACCTCTGTGGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTCTCCACTCACTCTCTCTTGGAACAC 725
Query 725 ACTGATGTCTCCATCCTCCTCGACAATGAAGCTATCTATGACATCTGCAGACGCTCCC-T 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 726 ACTGATGTCTCCATCCTCCTCGACAATGAAGCTATCTATGACATCTGTAGACGCTCCCTT 785
Query 784 AAGCATTGAGAGACCAACCTACACCAACCTCAACCGTCTTGTCTCTCAGGTTATTTCTTC 843
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 786 AA-CATTGAGAGACCTACCTACACCAACCTCAACCGTCTCGTCTCTCAGGTTATTTCTTC 844
Query 844 CTTGACTGCTTCTCTGAGGTTCGATGGAGCCTTGAATGTTGATGTCACTGAGTTCCAAAC 903
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 845 CTTGACTGCTTCTCTGAGGTTCGATGGTGCCTTGAATGTTGATGTTACTGAGTTCCAAAC 904
Query 904 CAACTTGGTCCCATACCCAAGAATCCACTTTATGCTTTCCTCCTATGCCCCAGTCATCTC 963
||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 905 CAACTTGGTTCCATACCCAAGGATCCACTTCATGCTTTCGTCCTATGCACCAGTCATCTC 964
Query 964 TGCAGAGAAGGCCTTCCATGAGCAACTCTCAGTTGCTGAGATCACAAACAGTGCTTTTGA 1023
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 965 CGCGGAGAAGGCCTTCCATGAGCAACTCTCAGTTGCTGAGATCACGAACAGTGCCTTTGA 1024
Query 1024 GCCAGCTTCCATGATGGCTAAGTGTGACCCTCGTCACGGGAAGTACATGGCCTGCTGTTT 1083
|| |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1025 ACCTGCTTCCATGATGGCAAAGTGTGACCCGCGACATGGAAAGTACATGGCTTGCTGTTT 1084
Query 1084 GATGTACCGTGGTGATGTTGTCCCCAAGGATGTGAACGCAGCTGTTGGCACAATCAAGAC 1143
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1085 GATGTACCGTGGTGATGTAGTCCCCAAGGATGTGAACGCAGCGGTTGGCACCATCAAGAC 1144
Query 1144 CAAGCGCACTATTCAGTTTGTTGACTGGTGTCCCACTGGGTTCAAGTGTGGTATCAACTA 1203
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 CAAGCGAACTATTCAGTTTGTTGACTGGTGTCCTACTGGATTCAAGTGTGGTATCAACTA 1204
Query 1204 CCAGCCACCAACTGTTGTTCCAGGAGGTGATCTTGCTAAAGTGCAGAGAGCTGTTTGTAT 1263
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1205 CCAGCCACCAACTGTTGTTCCTGGAGGTGATCTTGCTAAAGTCCAGAGAGCTGTTTGTAT 1264
Query 1264 GATCTCAAACTCTACCAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCCCGTATTGATCACAAGTTTGATCT 1323
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 GATCTCAAACTCAACCAGTGTTGCTGAGGTATTCTCCCGTATTGATCACAAGTTTGATCT 1324
Query 1324 TATGTACGCCAAACGTGCTTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGTATGGAAGAAGGTGA 1383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1325 TATGTACGCCAAACGTGCTTTCGTTCACTGGTATGTTGGTGAGGGTATGGAAGAAGGAGA 1384
Query 1384 ATTCTCAGAGGCTCGTGAGGATCTTGCAGCATTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTTGGTGC 1443
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1385 ATTCTCAGAGGCTCGTGAGGATCTTGCAGCATTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTCGGTGC 1444
Query 1444 TGAAGGTGGTGACGATGAGGATGATGAAGGAGAGGAGTACTAAGAAGAAGGGTG-TG--- 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |
Sbjct 1445 TGAAGGTGGTGACGATGAGGATGATGAAGGAGAGGAATACTAAGAAGAATGTTTCTTAAA 1504
Query 1500 ----GG-TTTTATGT-GGGCTTT-CTGT-T-ATCTCGTGTTTGTG-TGAATGGG--CTCG 1547
|| |||| ||| ||| ||| || | | |||||||||| ||| |||||||| ||||
Sbjct 1505 AATTGGATTTTGTGTTGGGTTTTTCTCTATTATCTCGTGTT-GTGATGAATGGGGGCTCG 1563
Query 1548 AAACTCTTACGAGTCCTAGTTGTGT-TTTT-CAAAAACC-ATATTTCTATCTCTTGCTTG 1604
||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||| |
Sbjct 1564 AAACTCTTACGAGTCTTAGTTGTGTGTTTTTCTAAA-CCTATATTTCTATCTCTTGCTGG 1622
Query 1605 TGGCGGTAGCCATTTGATTTCTATTATCTAGTTCGTTTGT 1644
||| | || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 TGG---T-----TT-GATTTCTATTATCTAGTTCGTTTGT 1653
> AT1G04820.1 | Symbols: TUA4, TOR2 | tubulin alpha-4 chain | chr1:1356191-1358386
REVERSE LENGTH=1703
Length=1703
Score = 2268 bits (1228), Expect = 0.0
Identities = 1438/1535 (94%), Gaps = 31/1535 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 128 ACGAAAATGAGAGAGTGCATTTCGATCCACATTGGTCAGGCCGGTATCCAGGTCGGAAAC 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 115 ACGAAAATGAGAGAGTGCATTTCGATCCACATTGGTCAGGCTGGTATCCAGGTCGGAAAT 174
Query 188 GCTTGCTGGGAGCTTTATTGTCTTGAACATGGCATTCAGCCTGATGGTCAGATGCCCAGT 247
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 175 GCTTGCTGGGAGCTGTACTGTCTTGAACATGGCATTCAGCCTGATGGCCAGATGCCGAGT 234
Query 248 GACAAGACTGTAGGCGGAGGTGACGATGCTTTCAACACCTTCTTCAGTGAAACCGGTGCA 307
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 GACAAGACTGTTGGTGGAGGTGACGATGCTTTCAACACCTTCTTCAGTGAAACCGGTGCA 294
Query 308 GGGAAGCACGTCCCACGTGCTGTCTTTGTTGATCTTGAGCCAACTGTGATCGATGAGGTC 367
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 295 GGTAAGCACGTCCCACGTGCTGTCTTTGTTGATCTTGAGCCAACTGTGATCGACGAGGTC 354
Query 368 AGGACTGGTACTTACCGTCAGCTTTTCCACCCTGAACAACTCATCAGCGGTAAAGAAGAC 427
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 AGGACTGGTACTTACCGTCAGCTTTTCCACCCTGAACAACTCATCAGCGGTAAAGAAGAT 414
Query 428 GCAGCTAACAACTTCGCCCGTGGACATTACACCATTGGGAAAGAGATTGTTGATCTGTGT 487
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 415 GCAGCTAACAATTTCGCCCGTGGTCATTACACCATTGGGAAAGAGATTGTTGACCTGTGC 474
Query 488 TTGGACCGTATCAGAAAGCTCGCTGATAACTGTACTGGTCTCCAAGGATTCCTCGTCTTC 547
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 TTAGACCGTATCAGAAAGCTTGCTGATAACTGTACTGGTCTCCAAGGATTCCTCGTCTTC 534
Query 548 AACGCTGTTGGTGGAGGGACTGGATCTGGTCTTGGATCTCTCCTCCTTGAGAGACTTTCT 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 AACGCTGTTGGTGGAGGGACTGGATCTGGTCTTGGATCTCTCCTCCTTGAGAGACTTTCT 594
Query 608 GTTGACTATGGCAAAAAGTCCAAGTTGGGTTTCACTGTTTACCCATCTCCACAGGTCTCC 667
|||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GTTGACTACGGGAAAAAGTCCAAGTTGGGTTTCACAGTTTACCCATCTCCACAGGTCTCT 654
Query 668 ACCTCTGTTGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTCTCCACTCACTCACTCTTGGAACACACT 727
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 655 ACCTCCGTTGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTCTCCACTCACTCTCTCTTGGAACACACT 714
Query 728 GATGTCTCCATCCTCCTCGACAATGAAGCTATCTATGACATCTGCAGACGCTCCCTAAGC 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GATGTCTCCATCCTCCTCGACAATGAAGCTATCTATGACATCTGCAGACGCTCCCTAAGC 774
Query 788 ATTGAGAGACCAACCTACACCAACCTCAACCGTCTTGTCTCTCAGGTTATTTCTTCCTTG 847
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 ATTGAGAGACCAACCTACACCAACCTCAACCGCCTCGTCTCTCAGGTTATTTCTTCCTTG 834
Query 848 ACTGCTTCTCTGAGGTTCGATGGAGCCTTGAATGTTGATGTCACTGAGTTCCAAACCAAC 907
||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 ACTGCTTCTCTGAGGTTTGATGGTGCCTTAAATGTTGATGTCACTGAGTTCCAAACCAAC 894
Query 908 TTGGTCCCATACCCAAGAATCCACTTTATGCTTTCCTCCTATGCCCCAGTCATCTCTGCA 967
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 895 TTGGTCCCATACCCAAGAATCCACTTCATGCTTTCCTCCTATGCCCCAGTCATCTCCGCA 954
Query 968 GAGAAGGCCTTCCATGAGCAACTCTCAGTTGCTGAGATCACAAACAGTGCTTTTGAGCCA 1027
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GAGAAAGCCTTCCATGAGCAACTCTCAGTTGCTGAGATCACAAACAGTGCTTTTGAGCCA 1014
Query 1028 GCTTCCATGATGGCTAAGTGTGACCCTCGTCACGGGAAGTACATGGCCTGCTGTTTGATG 1087
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1015 GCTTCCATGATGGCTAAGTGTGACCCACGTCACGGAAAGTACATGGCTTGCTGTTTGATG 1074
Query 1088 TACCGTGGTGATGTTGTCCCCAAGGATGTGAACGCAGCTGTTGGCACAATCAAGACCAAG 1147
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1075 TACCGTGGTGATGTTGTCCCCAAGGATGTAAACGCAGCTGTTGGCACCATCAAGACCAAG 1134
Query 1148 CGCACTATTCAGTTTGTTGACTGGTGTCCCACTGGGTTCAAGTGTGGTATCAACTACCAG 1207
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CGCACTATTCAGTTTGTTGACTGGTGTCCTACTGGATTCAAGTGTGGTATCAACTACCAG 1194
Query 1208 CCACCAACTGTTGTTCCAGGAGGTGATCTTGCTAAAGTGCAGAGAGCTGTTTGTATGATC 1267
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1195 CCACCAACAGTTGTTCCAGGAGGTGATCTTGCTAAAGTCCAGAGAGCTGTTTGCATGATC 1254
Query 1268 TCAAACTCTACCAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCCCGTATTGATCACAAGTTTGATCTTATG 1327
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 TCAAACTCGACCAGTGTTGCTGAGGTGTTCTCCCGTATTGATCACAAGTTTGATCTTATG 1314
Query 1328 TACGCCAAACGTGCTTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGTATGGAAGAAGGTGAATTC 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1315 TACGCCAAACGTGCTTTCGTTCACTGGTATGTGGGTGAGGGTATGGAAGAAGGAGAATTC 1374
Query 1388 TCAGAGGCTCGTGAGGATCTTGCAGCATTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTTGGTGCTGAA 1447
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1375 TCAGAGGCACGTGAGGATCTTGCAGCATTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTCGGTGCTGAA 1434
Query 1448 GGTGGTGACGATGAGGATGATGAAGGAGAGGAGTACTAAGAAGAAGGGTG-TG------- 1499
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |
Sbjct 1435 GGTGGTGACGATGAAGATGATGAAGGAGAGGAATACTAAGAAGAATGTTTCTAAAAACTT 1494
Query 1500 -GGTTTTATGTGGGCTTTCTGT-TA-TCTCGTGTTTGTGTGAATGGGCTCGAAACTCTTA 1556
|| ||| |||||| ||||| | || |||||| || ||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 1495 TGGATTTGTGTGGG-TTTCTCTATAATCTCGTCTT-GTGAGAATGGGCTCAAAACTCTTG 1552
Query 1557 CGAGTCCT-AGT--TGTGT-TTTTCAAAAACCATATTTCTATCTCTTGCTTGTGGCGGTA 1612
||||| | | | ||||| |||| |||| || || |||| | |||| || || ||
Sbjct 1553 GGAGTCTTTAATCGTGTGTGTTTT-AAAA-CC-TACTTCTCTATCTT--TT----CG-TA 1602
Query 1613 GCCAT-TTGAT-T-TCTATTATCTAGTTCGTTTGT 1644
||||| || || | ||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1603 GCCATGTT-ATCTCTCTATTATCTATTTCCTTTGT 1636
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 85491528135
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5