BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg474153
Length=4036
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G50240.2 | Symbols: FU | Protein kinase family protein with ... 6408 0.0
> AT1G50240.2 | Symbols: FU | Protein kinase family protein with
ARM repeat domain | chr1:18607047-18614162 FORWARD LENGTH=4053
Length=4053
Score = 6408 bits (3470), Expect = 0.0
Identities = 3853/4040 (95%), Gaps = 17/4040 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCAATCGCGTTCAGATATGGGTGTCGAGGATTATCATGTGATAGAGCTCGTCGGTGAAGG 60
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 CCAATCGTGTTCAGATATGGGTGTCGAGGATTATCATGTGATAGAGCTTGTCGGTGAAGG 60
Query 61 CTCTTTTGGGAGGGTTTACAAAGGAAGACGGAAGTATACAGGCCAGACGGTGGCGATGAA 120
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATCTTTTGGGAGGGTTTACAAAGGAAGACGCAAGTATACCGGCCAGACGGTGGCGATGAA 120
Query 121 GTTCATCATGAAACAAGGAAAGAGTGACAAGGATATACATAGTCTAAGGCAAGAAATCGA 180
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTCATCATGAAACAAGGAAAGACTGACAAGGATATACATAGTCTAAGGCAAGAAATCGA 180
Query 181 GATATTGCGGAAGCTCAAGCATGAGAATATCATTGAAATGCTCGACTCCTTTGAAAACGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GATATTGCGGAAGCTCAAGCATGAGAATATCATTGAAATGCTCGACTCCTTTGAAAACGC 240
Query 241 ACGAGAGTTCTGTGTTGTCACTGAGTTTGCCCAAGGTGAATTGTTTGAGATTCTTGAAGA 300
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ACGAGAGTTCTGTGTCGTCACTGAGTTTGCCCAAGGTGAATTGTTTGAGATTCTTGAAGA 300
Query 301 TGACAAGTGCCTTCCGGAAGAACAAGTTCAAGCAATCGCAAAGCAGTTGGTAAAAGCATT 360
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 301 TGACAAGTGCCTTCCCGAAGAGCAAGTTCAAGCAATCGCAAAGCAATTGGTAAAAGCATT 360
Query 361 -GCATTACTTGCATTCTAACCGTATAATTCACCGTGACATGAAGCCACAAAACATACTTA 419
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 361 AG-ATTACTTGCATTCCAACCGTATAATTCACCGTGACATGAAGCCACAAAACATTCTTA 419
Query 420 TTGGTGCTGGGTCTGTCGTTAAGCTATGTGATTTTGGTTTTGCTCGAGCTATGTCTACCA 479
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 420 TTGGTGCTGGCTCTGTCGTTAAGCTATGTGATTTTGGTTTTGCTCGAGCTATGTCCACCA 479
Query 480 ACACTGTGGTTTTGCGATCCATTAAAGGCACTCCGCTGTACATGGCGCCAGAGCTTGTGA 539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 480 ACACTGTGGTTTTGCGATCCATTAAAGGCACTCCGCTGTACATGGCACCAGAGCTTGTGA 539
Query 540 GAGAAAAACCATACAATCGCACTGTCGACCTGTGGTCTCTTGGTGTTATATTGTATGAGT 599
|||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 540 AAGAACAGCCATACGATCGCACTGTCGACCTGTGGTCTCTTGGTGTTATATTGTACGAGT 599
Query 600 TATATGTAGGTCAACCTCCGTTCTACACCAATTCTGTGTATGCTCTCATTCAG-CACATT 658
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 600 TATATGTAGGTCAGCCTCCCTTCTACACCAATTCTGTGTATGCTCTCATTC-GTCACATT 658
Query 659 GTTAAGGATCCTGTCAAATATCCTGATGAAATGAGTCCTTATTTCAAAAGCTTTTTGAAA 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 659 GTTAAGGATCCTGTCAAATATCCTGATGAAATGAGTACTTATTTCGAAAGCTTTTTGAAA 718
Query 719 GGATTGCTCAACAAGGAGCCCCAAAATCGATTAACCTGGCCTGCTCTTCTTGAGCACCCC 778
||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 719 GGATTGCTCAACAAGGAACCCCACAGTCGATTAACCTGGCCTGCTCTTCGTGAGCACCCT 778
Query 779 TTCGTTAAAGAATCACAAGAAGAAGTTGAAGCCAGGGAAATCCAAACTTCAGTAGTTGAC 838
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 779 TTCGTTAAAGAAACACAAGAAGAAGTTGAAGCCAGGGAAATCCATACTGCAGTAGTTGAC 838
Query 839 CATAAGGCAGCTTGGATGCTCAAAGGAAATGGAGGGCAACAGAGAAATGAAAAGTGCGAC 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AATAAGGCAGCTTGGATGCTCAAAGGAAATGGAGGGCAACAGAGAAATGAAAAGTGCGAC 898
Query 899 TCTGTGACCCTGGTTGAGAACATGTCTGCTACAAAAGTTCTAGCTGACGTTCAGTCAGAT 958
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TCAGTGACCCTGGTTGAGGACATGTCTGCTACAAAAGGTCTAGCTGACGTTCAGTCAGAT 958
Query 959 ATGAAGAGTGCTGTCAATGTAAATTCTCCACCC-CATGAGGATTTTCTTGGATTCCCAAC 1017
||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||
Sbjct 959 ATGAAGAGTGCTGTCAAAGTAAATTCTCCACCCAC-TGAGGATTTTGTGGGATTCCCAAC 1017
Query 1018 CCAAGAGGAGATAAAAAGTTCAGGTAACGCAACACTGGACAAATTGGAAAATACATCTCG 1077
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1018 CCAAGAGGAGATAAAAAGTTCAGGTAACCCAACACTGGACAAATTGGAAAATACATCCCG 1077
Query 1078 CACTGTTAAAGGTGCACAAGTTATAGGTGAAGATGATAAAGCATTGGATCTTGTCTTGCT 1137
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1078 CACTGTTAAAGGTGCACAAGTTATAGGTGAAAATGATAAAGCATTGGACCTTGTTTTGCT 1137
Query 1138 GTCACTGGAAAGATTTTCAAAATCACCAGATTCTAAAAGGGACAAAGATGTTGCTTGCTC 1197
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 GTCACTGGAAAGATTTTCAAAATCGCCAGATTCTAAAAGGGACAAAGATGTTGCTTGCTC 1197
Query 1198 TGTTCAGTCCCTCAGGATCATTTCCAATTTGGTTGCAGTTCGTGCCATAGTTTCAGTTGG 1257
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TGTTCAGTCCCTCAGGATCATCTCCAATTTGGTTGCAACTCGTGCCATAGTTTCAGTTGG 1257
Query 1258 ACTGATTGAGAAAATAACGTGTGCACTGCTAGACTTTACTGACGCTCTTGTTGGGATGAA 1317
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ACTGATTGAGAAAATAACATGTGCACTGCTAGACTTTACTGACGCTCTTGTTGGGATGAA 1317
Query 1318 ATCATCCGAGTTCAACAAAATAATACCAAAGAGTCTTTCAGTCACTAAAAACTTGGTAGG 1377
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 ATCACCCGAGTTCAACAACATAATACCAAAGAGTCTTTCAGTCACTAAAAACTTGGTAGG 1377
Query 1378 GCATATTGAAGGCAATAGCATACATAGTTCCTATATCAGGCACTGGGCCAAAGTAGTGGA 1437
|||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1378 GCATGTTGAAGGCAATAACATACATAGTTCTTACATCAGGCACTGGACCAAAGTAGTGGA 1437
Query 1438 AATCTTCGTACAGGTCGTTGGATGGAAAGAAGAGGGAACTGGTAGAATTATATATGAGGC 1497
||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 AATCTTCATACAGGTCGTTAGATGGGAAGAAGAGGGAACTGGTAGAATTATATATGAGGC 1497
Query 1498 CTGTTCTTGCATCACAACAATGTTATCTCGAGTTGCCGAAGATCTTAAATCTTCAACTCC 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 CTGTTCTTGCATCACAACAATGTTATCTCGAGTTGCCCAAGATCTTAAATCTTCAACTCC 1557
Query 1558 TGATTCTGTTTCTAAACAGATTTTGGAGCATGCTAACATGTCTCGCTTAGTTGATCATTT 1617
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1558 TGATTCTGTTTCTAAACAGATTTTGGAGCATGCTAACATGTCTCGCATAGTTGATCATTT 1617
Query 1618 GTGTCTTTGTCTGGCTTCTTCTGGGTCGAGTTTAACTTCCGGCACTTCACAAATGTTAGC 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1618 GTGTCTTTGTCTGGCTTCTTCTGGGTCGAGTTTAACTTCCGGCTCTTCGCAAATGTTAGC 1677
Query 1678 AGCTGCCTGTGAAGCTTGTAGCGCAATATGGATTCTCATAGATACTTCCGAAACATTCTT 1737
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 AGCTGCCTGTGAAGCTTGTCGAGCAATATGGATTCTCATAGATACTTCCGAAACATTCTT 1737
Query 1738 CAAGAATGATAATGTGAACATATTACCTCTAGATGCTTTGCAGAACAGTCTCTCTCAGCA 1797
|||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1738 CAAGAACGATGATGTAAACATATTACCTCTAGATGCCTTGCAGAACCGTCTCTCTCAGCA 1797
Query 1798 TGAAAAAGGAAACAGTGAGTGGGGTCCATTATCTGAGAAACTTGTTGATACAGTGACAAG 1857
||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1798 TGACATAGGAAACAGTGAGTGGGGTCCGTTATCTGAGAAACTTGTCGATACAGTGACAAG 1857
Query 1858 AACATATCTCCGATCAAAGCATGTGCAAGTTGCTATCGGTCATTGCCTTCACCAACGAGT 1917
| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 AGCATATCTCCGATCAAAGCATGTGCAAGTTGCTGTTGGTCATTGCCTTCACCAACGAGT 1917
Query 1918 GGAGGCTCCATTGGTTTCTGCAATTCAGCTCTTGTCAAGATGCTGCCTTCACAATGGAAT 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1918 GGAGGCTCCATTGGTTTCTGCAATTCAGCTCTTGTCAAGATGCTGCCTTCATAATGGAAT 1977
Query 1978 TATGCCTAGCATGCTTTGTGGTCTTCCCAGTTCACTGCCTGTTACGACCGTAGTCAGTGG 2037
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1978 TCTGCCTAGCATGCTTTGTGGTCTTCCCAGTTCACTGCCTATTACGACCGTAGTCAGTGG 2037
Query 2038 TGGAGAGGATGGTACAGTTATTTCAGAATTATTTTCTATACTATCCTATGCAACATTATC 2097
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2038 TGGAGAGGATGGTACAGTTATTTCAGAAATATTTTCTATACTATCATACGCAACATTATC 2097
Query 2098 AAGCAAAGACCAACAAACAAGAGaaaaaaaTAACTTCGAGGGCAGACTAAACAATCTGGT 2157
|||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 AAGCAAAGACCAGCAAACAGGAGAAAAAGATAACTTCGAGGGCAGACTAAACAATCTGGT 2157
Query 2158 ATTCCATTCATGCCTTCTGTTGGCAACAGTTGCTCAATGTTTGAAGTTGACTGGGAGAAA 2217
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2158 GTTCCATTCATGCCTTATGTTGGCAACAGTTGCTCAATGTTTGAAGTTAACTGGGAGAAA 2217
Query 2218 TTCTGCCCTGTTAATGCTTACAACTTCTCCAAGGAAGCATCTACATCGTCTTACTGCTAT 2277
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 2218 TTCTGTTCTGTTAATGCTTACAACTTCTCCAAAGAAGCATCAACATCGTCTTTCTGCTAT 2277
Query 2278 AGCCAATCACATTGCCTCAGATGATAAAATTGAAGCTTCTCTTCAGAATCACTCTGCTTC 2337
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 AGCCAATCACATTGCCTCAGATGATAAAATCGAAGCTTCTCTTCAGAATCACTCTGCTTC 2337
Query 2338 AGCTATGCTTGCTCTCGCATCTATTCTCTCTCTTGAAAAAGGATCTTCTGCTGAATCTTC 2397
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2338 AGCTATGCTTGCTCTCGCATCTATTCTCGCTCTTGAAAAAGGATCTTCTGCTGGATCTTC 2397
Query 2398 TGTCTCTGAGATTGCGGTACCTCTGATTCCTCGAGCTACTAAGCTTTGTTATCATCTTAG 2457
|||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 TGTCTCTGAGCTAGTGGTGTCTCTGATTCCTCGAGCTACTAAGCTTTGTTATCATCTTAG 2457
Query 2458 ACCTATGCCAAGTCATGAAGGTGAAGTCATCTCTCATTCTGCCAATTTTACCAAATGGCA 2517
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 2458 GCCTATGCCAAGTAATGAAGGTGAAGTCATCTCTCATTCTGCCAATTATGCCAAATGGCA 2517
Query 2518 CGGACTTCTGGATGGATGTATCGGTTTATTAGAATCCAGATTGAAGTGGGGAGGACCTTT 2577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 2518 CGGACTTCTGGATGGATGTATCGGTTTATTAGAATCCAGATTGAAGTGGGGTGGACCTCT 2577
Query 2578 AACTGTGCAGCAGCTTATTGCTAGTGGTACGCCATTGCTTCTTATAAATCTGTTAGCTGG 2637
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2578 AGCTGTGCAGCAGCTTATTGCTAGTGGTACGCCATTGCTTCTCATAAATCTGTTAGCTGG 2637
Query 2638 CAAACTTTCAAATGCTTCCCCAGATGACATCAAGAAAACACCCAACCGGATTGGCTTGTC 2697
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2638 CAAACTTTCAAATGCTTCCCCAGAGGACATCAAGAAGACATCCAACCGGATTGGCTTGTC 2697
Query 2698 CCCTGTTGGCGTTTTATGGACTGTCTCTTCCATTTGCCACTGTCTTTCAGGCGGCACTTT 2757
|||| |||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct 2698 CCCTATTGGCGTTGTATGGACTATTTCGTCCATATGCCACTGTCTTTCGGGTGGCAC--- 2754
Query 2758 AACTTTCCGTCAGGTTCTTGTGAAGATTGAAAACATGAAGCTGATTACTTGTTTACTATC 2817
|||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2755 AACTTTCCGTCAGGTTCTTGTGAAAATCGAAACCATGAAGCTAATTACTTGTTTACTATC 2814
Query 2818 TGATGCTCATATCAAGCTAGTAAAGAACTGGGGAGGTCCGGGGGGAGGAAAAGATGGAGT 2877
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2815 TGATGCTCATATCAAGCTAGTAAAGAGCTGGGGAGGTCCGGGGGGAGGAAAAGATGGGGT 2874
Query 2878 CAGAGAGACAATAAATGTGATAATTGATCTCTTAGCATTTCCTTTTGTTGCTCTACAAAG 2937
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2875 CAGAGAGACAATAAATGTGATAATTGATCTCCTAGCATTTCCTTTTGTTGCTCTGCAAAG 2934
Query 2938 TCAACCAGGTTCGTTATCTGCCACAGCCTCTGTAAATAGTGGATTTATTCTCAACAT-GG 2996
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2935 TCAACCAGGTTCGTTATCTGCCACAGCTTCTGTAAATAGTGGATTCATTCTCAACATTGG 2994
Query 2997 ATTCTCCTGGGGTGAGAGTGTGCATGGAAGATAGAGATTTGCTAAAAGCTATAGAAGAGG 3056
| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 CT-CTCCTGGTGTGAGAGTATGCATGGAAGATAGAGATTTGCTAAAAGCTATAGAAGAGG 3053
Query 3057 ATATGGACAAATACATAAAAGTCCTCCTGGAGGTGGGAGTTCCGAGTTTAATCCTACGTT 3116
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3054 ATATGGACAAATACATAATAGTCCTCCTGGAGGTGGGAGTGCCGAGTTTAATCCTACGTT 3113
Query 3117 GCTTGGAACATTTGGAAATAAAAGATTTAGTAAGGCCCGTTGCTTTTCTTGCCAAAATGG 3176
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 GCTTGGATCATTTGGAATTAAAAGATTTAGTAAGGCCCGTTGCTTTTCTTGCCAAAATGG 3173
Query 3177 TGGGTCGTCCACGTCTTGCGGTAGAGCTCGTGAGCAAAGGTCTGTTAGATCCTAACAGAA 3236
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3174 TGGGTCGTCCACGTCTTGCTGTAGATCTCGTGAGCAAAGGTCTGTTAGATCCTAATAGAA 3233
Query 3237 TGAAAAAATTACTCAACCAATCAAGTCCAAGAGAAGTCATACTTGATATTTTGATGATCA 3296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3234 TGAAAAAATTACTCAACCAATCAAGTCCAAGAGAAGTCATACTTGATATTTTGATGATCA 3293
Query 3297 TATCTGATCTATCTAGGATGGATAAGGCTTTCTATAAATACATCGGGGAGGCTTCTGTTT 3356
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3294 TATCTGATCTATCGAGGATGGATAAGGCTTTTTATAAATACATCGGCGAGGCTTCTGTTT 3353
Query 3357 TGCAGCCTTTGAAGGAATTTCTTACCCATGTGGATCCAAATATACGTGCAAAAGCTTGTA 3416
| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3354 TACAGCCTTTGAAAGAATATCTTACCCATGTGGATCCAAATATACGTGCAAAAGCTTGTA 3413
Query 3417 GTGCTCTTGGCAATATGTGCAGGCACAATGGATATTTCTACAGCTCTCTTGCGGAACATC 3476
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3414 GTGCTCTTGGCAATATGTGCAGACACAATGGATATTTCTACAGCGCTCTTGCGGAACATC 3473
Query 3477 AAATCATCGGTCTCCTCATTGATCGATGCGCTGATCCGGACAAACGAACACAAAAATTCG 3536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3474 AAATCATCGGTCTCCTCATTGATCGATGCGCTGATCCGGACAAACGAACACAGAAATTCG 3533
Query 3537 CTTGCTTTGCTATTGGAAATGCTGCTTACCATAACGACACGTTGTATGAAGAGCTACGAC 3596
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3534 CTTGTTTTGCTATTGGAAATGCGGCTTACCATAACGACACGCTGTATGAAGAGCTAAGAA 3593
Query 3597 GATCTATAACGCAGCTAGCAAACGTCTTGACCACTGCTGAAGAAGACAAGACAAAAGCAA 3656
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3594 GATCTATAACGCAGCTAGCAAACGTTTTGACCACGGCTGAAGAAGACAAGACAAAAGCAA 3653
Query 3657 ACGCTGCTGGTGCATTGAGCAACCTTGTCCGAAACTCCAACAAACTCTGTGAAGATATAG 3716
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3654 ACGCGGCTGGTGCATTGAGCAACCTTGTCCGAAACTCCAACAAACTCTGTGAAGATATAG 3713
Query 3717 TCTCCAAAGGAGCTTTACAAACGTTACTGAGGCTAGTTGCCGATTGCTCGACTCTTGCCT 3776
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3714 TCTCCAAGGGAGCTTTACAAACGTTACTGAGGCTAGTTGCGGATTGCTCGACTCTTGCCT 3773
Query 3777 TGAACCCAAGCAAGAAAGAGACAGTGAGTGAGTCACCGCTCAAGATCGCACTCTTCTCAT 3836
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3774 TGAACCCAAGCAAGAAAGAGACAGCGAGTGAGTCACCGCTCAAGATTGCACTCTTCTCAT 3833
Query 3837 TGGCTAAAATGTGTTCGAACCACCAGATTTGCAGACAGTTCGTGAAGTCATCAGAGTTGT 3896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3834 TGGCTAAAATGTGTTCGAACCACCAGATTTGCAGACAGTTTGTGAAGTCATCAGAGTTGT 3893
Query 3897 TCCCGGTCATCGCAAGGCTTAAGCAATCCCCTGAGGCTAACATTGCTCACTATGCTTCAG 3956
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3894 TCCCGGTCATTGCAAGGCTTAAACAATCCCCTGAGGCTAACATTGCTCACTATGCTTCAG 3953
Query 3957 TTATTGTCGCCAAAGTCGGTGGTGATTCTGATTCCTAAGAAAAATTACGTCCCTGTAAAT 4016
||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 3954 TTATTGTCGCCAAAGTCAGTGGTGAGTCT--T----AAGAAAACTTACTTCCCTGTAAAT 4007
Query 4017 TTATTGTGTTAAGACATCGT 4036
|||||||| |||||||||||
Sbjct 4008 TTATTGTGGTAAGACATCGT 4027
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 201119274487
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5