BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg474290
Length=2451
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G51720.1 | Symbols: | Amino acid dehydrogenase family prote... 3980 0.0
> AT1G51720.1 | Symbols: | Amino acid dehydrogenase family protein
| chr1:19180772-19186532 FORWARD LENGTH=2469
Length=2469
Score = 3980 bits (2155), Expect = 0.0
Identities = 2362/2459 (96%), Gaps = 26/2459 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTCTTTTTGTTGGTTTCTTATTATTTTGCGTCTGCAAT---AATCGCTCTGGTCGATTT 57
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 16 TCTCTTTTTGTTGGTTTTTTATTATTTTGCGTCTGCAATACCAATCGCTTTGGTCGATTT 75
Query 58 ATCTTTATCCCCCCGCTCAAAGCTCCCATCAGAATCGGCGAAGACA-CATAAATTATCAA 116
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct 76 ATCTTTAT--CCCCGCTCAAAGCTCTCATCAGAATCTGCGAAGACACCA-AAATTATCAA 132
Query 117 CAAGTTCGAGCCGAACAGACTTTATGTCTCTTTAGTCTTTAGCGACAATTGTCTTTGTGG 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 133 CAAGTTCGAGCCGAACAGACTTTATGTCTCTTTAGTCTTAAGCGACAATTGTCTTTGTGG 192
Query 177 GTTTCTCTTTTTCGGCGACCCGTCGCTACAGGCAAAGTCGTCATTTAGAGCACCGTACCA 236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||
Sbjct 193 GTTTCTCTTTTTCGGCGACCCGTCGCTACAGGCAAAGTTGTCATTTCGAGCATCGTACCA 252
Query 237 AGTGTAAGATACATACAGTTGCTGGTAGTCAGCAAAAGAGAAGCTAAGGGGGAGTTAAAA 296
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 253 AGTGTAAG----ATACAGTTGCTGGTAGTCAGCAAAAGTGAAGCTAAGGGGGAGTTAAAA 308
Query 297 CTGTGATGCTGAATGTTTGGGCCAACAGGTGGGCTGGGGATGAATCCCTCAATGGATGAT 356
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 CTGTGATGCTGAATGTTTGGACCAACAGGTGGGTTGGGGATGAATCCCTCAATGGATGAT 368
Query 357 ATGAACTTAATCCAGCAGGCACAAAGACATCAGCTTGTTGTAAGTAATCTTGGGGAAGAG 416
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 ATGAACTTAATCCAGCAAGCACAAAGGCATCAGCTTGTTGTAAGTAATCTTGGGGAAGAG 428
Query 417 ATTGATTTGGAAATTGGACCTGGAGAGGATGATGCTGCTTTTGCTAACAATTCATTGATT 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 ATTGATTTGGAAATTGGACCTGGAGAGGATGATGCTGCTTTTGCTAACAATTCATTGATT 488
Query 477 GGCGGGCCTCCACGGGAACCCTCCACTGGGGAACATGATGAAACAAAGCATATGGTTTTG 536
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 GGCGGGCCTCCACGGGAGCCCTCCACTGGGGAACATGATGAAACAAAGCATATGGTTTTG 548
Query 537 GTATCTGACCTGCCCAGTGAGGATCAGGATATGTCAAAAGGTCA-ACCGGCGAAGAGAAA 595
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct 549 GTATCTGACCTTCCCAGTGAGGATCAGGATATTTCAAAGGGT-ACACCGGCGAAGAGAAA 607
Query 596 GAAAAAAGTTGTTAAACGGTGGAGAGAGGAATGGGCTGACACGTACAAGTGGGCGTATGT 655
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 608 GAAAAAAGTTGTCAAACGGTGGAGAGAGGAATGGGCTGACACGTACAAGTGGGCTTATGT 667
Query 656 TGATCTGAAGGATGGAACAGCTAGGATATTCTGCTCTATTTGCAGAGAGTATGGTAGAAA 715
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 668 TGATATGAAGGATGGTACAGCTAGGATATTCTGCTCTATTTGCAGAGAATATGGTAGAAA 727
Query 716 ACATCGAAGAAATCCTTACGGAAATGAAGGAAGTAGAAACATGCAGATGAGTGCTCTAGA 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 728 ACATCGAAGAAATCCTTACGGAAATGAAGGAAGTAGAAACATGCAGATGAGTGCTTTAGA 787
Query 776 AGAACACAACAATAGTTTGCTACACAAAGAGGCTTTGCGTCTCCAAACGGCTTCCAAAGA 835
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 GGAACACAACAATAGTTTGCTACACAAAGAGGCTCTGCGTCTCCAAACGGCTTCCAAAGA 847
Query 836 TAAGATTGTTGTTGACAAGCCCATTTATGTGAAGACTCTTATGTCAAAGAGTGCTGGTTC 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 848 TAAGATTGTTGTTGACAAGCCCATTTATGTGAAGACTGTCATGTCAAAGAGTGCTGGTTC 907
Query 896 AATTGTTGAGGGTGCCCTGAAACGAGATCCTAATGAGATTGAATTTGTTCAATCTGTTCA 955
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 908 AATTGTTGAGGGTGCCCTGAAACGAGATCCTAATGAAATTGAGTTTGTTCAATCTGTACA 967
Query 956 AGAATCAGTGCATGCTCTAGAGCGGGTAATTGCAAAAAATTCTCATTATGTAAATATCAT 1015
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 968 AGAATCTGTGCATGCTCTAGAGCGGGTGATTGCAAAAAATTCTCATTATGTCAATATCAT 1027
Query 1016 GGAGCGGCTACTAGAACCTGAACGTATGATAGTCTTTCGAGTTCCATGGATTGATGACCG 1075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 GGAGCGGCTACTAGAACCTGAACGTATGATAGTCTTTCGAGTTCCATGGATTGATGACCG 1087
Query 1076 TGGTGAAACACATGTAAACCGCGGCTTTAGAGTTCAGTTCAATCAAGCACTGGGTCCATG 1135
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1088 TGGTGAAACACATGTAAACCGTGGCTTTAGAGTTCAGTTCAACCAAGCTCTGGGTCCATG 1147
Query 1136 TAGGGGAGGTATCCGATTTCATCCATCCATGAACTTAAGCATTGCCAAATTTCTTGGCTT 1195
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 TAGGGGAGGTATCCGATTTCACCCATCCATGAACTTAAGCATTGCCAAATTTCTTGGCTT 1207
Query 1196 TCAGCAGACGTTGAAAAATGCTCTGTCACCATATAAACTGGGAGGGGCTTCTGGTGGAAG 1255
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208 TCAGCAGACGTTGAAGAATGCTCTGTCACCATATAAACTGGGAGGGGCTTCTGGTGGAAG 1267
Query 1256 CGACTTTGATCCTAAAGGAAAAAGTGACAATGAGATTATGAGATTTTGCCAAAGTTTCAT 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 CGACTTTGATCCTAAAGGAAAAAGTGACAATGAGATTATGAGATTTTGCCAAAGTTTCAT 1327
Query 1316 GAATGAGATGTACAGATATATGGGTCCTGACAAAGATCTTCCTTCAGAGGAGGTTGGTGT 1375
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1328 GAATGAGATGTACAGATATATGGGTCCTGACAAAGATCTTCCGTCAGAGGAGGTTGGTGT 1387
Query 1376 TGGAACTCGGGAAATGGGATATCTTTTTGGACAATACAGACGACTTGCTGGTCAGTTTCA 1435
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 TGGTACTCGGGAAATGGGATATCTTTTTGGACAATATAGACGACTTGCTGGTCAGTTTCA 1447
Query 1436 GGGAAGTTTTACAGGACCGCGGATATATTGGGCTGCTTCTAGCCTCAGAACTGAAGCTAG 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448 GGGAAGTTTTACAGGACCGCGGATATATTGGGCTGCTTCTAGCCTCAGAACTGAAGCTAG 1507
Query 1496 TGGCTATGGCGTGGTGTACTTTGCACGACTTATGCTTGCAGATATGAATAAGGAAATAAA 1555
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508 TGGCTATGGCGTGGTGTACTTTGCACGACTTATACTTGCAGATATGAATAAGGAAATAAA 1567
Query 1556 GGGACTAAGATGTGTCGTGAGTGGTTGTGGGAAGATTGCGATGCATGTTGTAGAGAAGCT 1615
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568 GGGACTAAGATGTGTCGTGAGTGGTTGCGGGAAGATTGCGATGCATGTTGTAGAGAAGCT 1627
Query 1616 AATTGCTTGTGGAGCCCATCCGGTTACAGTTTCAGATTCAAAAGGATATTTGGTGGACGA 1675
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AATTGCTTGTGGAGCCCATCCGGTTACTGTTTCAGATTCAAAAGGATATTTGGTGGACGA 1687
Query 1676 TGACGGATTTGATTATATGAAACTTGCATTCTTGAGAGATATAAAATCCCAACAGAGAAG 1735
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1688 TGATGGATTTGATTATATGAAACTTGCATTCTTGAGAGATATAAAATCTCAACAGAGAAG 1747
Query 1736 TCTGAGAGACTATTCCAAGACCTATGCAAGGGCGAAATACTTTGATGAAGTAAAGCCGTG 1795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1748 TCTGAGAGACTATTCCAAGACCTATGCAAGGGCGAAATACTTTGATGAATTAAAGCCTTG 1807
Query 1796 GAATGAAAGGTGTGACGTGGCATTTCCTTGTGCTTCTCAGAATGAGGTTGATCAAGCAGA 1855
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1808 GAATGAAAGGTGTGATGTGGCATTTCCTTGTGCTTCTCAGAATGAAGTTGATCAAGCGGA 1867
Query 1856 TGCCATTAATCTGGTCAATGCAGGCTGCCGCTTACTGGTAGAAGGTTCAAACATGCCGTG 1915
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1868 TGCCATTAATCTGGTCAATGCAGGATGCCGTTTACTGGTAGAAGGTTCAAACATGCCGTG 1927
Query 1916 TACAGCTGAAGCAGTCGATGTTTTCAGAAAGGCGAATGTTCTGATTGCTCCTGCTATTGC 1975
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1928 TACAGCTGAAGCAGTCGATGTTTTCAGAAAGGCGAATGTTCTGATTGCTCCTGCCATTGC 1987
Query 1976 TGCTGGAGCTGGAGGAGTTGCTGCTGGTGAAATCGAAGTACTCCGTGAATCGAATTCAAT 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1988 TGCTGGAGCTGGAGGAGTTGCTGCTGGTGAAATCGAAGTACTCCGTGAATCTAATTCAAT 2047
Query 2036 GCAGTGGTCAGCAGAAGATTTTGAGTCTAGATTACAGGAAGCACTGAAGCAGACTTATGA 2095
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2048 GCAATGGTCAGCAGAAGATTTTGAGTCTAGATTACAGGAAGCACTGAAGCAGACTTATGA 2107
Query 2096 AAAAGCTCTTAAAGCAGCAAATGATTTCGGTTATCAGAAAGAAAGTCCTGAGGCACTTCT 2155
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2108 AAAAGCTCTTAAAGCAGCAAATGATTTCGGTTATCAAAAAGAAAGTCCTGAGGCACTACT 2167
Query 2156 TCATGGAGCAACGATTGCAGCATTTTTGAACATAGCTCAAGCTATGACAGACCAAGGTTG 2215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 2168 TCATGGAGCAACGATTGCAGCATTTTTGAACATAGCTCAAGCCATGACGGACCAAGGTTG 2227
Query 2216 TGTCTAGCTAAAAAATGGCCCTGCATCATGAGTACCAGCAGGAGTTCTGTTTGAAAACGT 2275
|||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2228 TGTCTAGC-AAAA--TGGCCCTGCATCTTAAGTACCGGCAGGAGTTCTGT---AAA-CGT 2280
Query 2276 AATGAAGTAACAGTGGACTCTCTGTAACATATTAGACGCATATCTATATCATTATTTAGA 2335
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||
Sbjct 2281 AATGAAGTAACATTGGACTCTCTGTAACATATTAGATGGAAATCTATATCATTATTTAGA 2340
Query 2336 AATTACATACTCTGATAGGAATAATA--TTTTATCAGCCATAGTATGTTAACTTGAGTTA 2393
|||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2341 AATTACATACTCTGATAGGAATAA-ACCTTTT-TCAGCCATAGTATGTTAACTTAAGTTA 2398
Query 2394 TGTGACCTG-CAAAGATGGAAGATACTGATAACGCAGAGCTTAAACAAGGTTACAAGGG 2451
|||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2399 TGTGAC-TAACAAAGATGGAAGAAACTGATAACGCAGAGCTTAAACAAGGTTGCAAGGG 2456
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 121604669832
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5