BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg474789
Length=5229
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G40480.1 | Symbols: EMB3012 | embryo defective 3012 | chr5:1... 7635 0.0
> AT5G40480.1 | Symbols: EMB3012 | embryo defective 3012 | chr5:16213222-16224058
FORWARD LENGTH=5987
Length=5987
Score = 7635 bits (4134), Expect = 0.0
Identities = 4606/4836 (95%), Gaps = 23/4836 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTACTTCTTCAATCTACTCTCCTTTGTTTGCGTTGATGTAGCAAAACAAAGAACaaaaaa 60
||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 83 CTACTTCTTCAATTTACTCTCATTCGTTTGCGTTGATGTAGCAAAACAAA-AAC--CAAA 139
Query 61 aTGGTTCGTTTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCTTGCTATCGGCTGGAGAAATT 120
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |
Sbjct 140 ATGGTTCCCGTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCTTGCTCTCTGCTGGAGAGAGT 199
Query 121 TCATCGCAATTAGGTTCTGGTCCACACATTACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCGAAG 180
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 200 TCATCGCAATTAGTTTCTGGTCCACACATCACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCCAAG 259
Query 181 ATGAAGAACCCAGTTGATTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCATGG 240
|||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 ATGAAGAATCCGGTTGAGTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCATGG 319
Query 241 GATCATCATGACATTCTCTCAGTTATACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCGTTGCTCAACC 300
||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| || |||
Sbjct 320 GATCATCATGATATTCTATCAGTCACACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCATTGTTCGACC 379
Query 301 AGCGCGCGTCTGAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAGGAGACTGCAGTTTATGGC 360
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 380 AGCGCGCGTCTCAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAGGAGACTGCAGTTTATGCC 439
Query 361 ACTGATATACAGACCGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTGTTTATTGACAACTTCTCACGG 420
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 440 ACTGATATACAGACTGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTCTTTATTGACAACTTCTCACGG 499
Query 421 ATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGACTTTCCTTGCTTAGAGTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 500 ATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGTCTTTCCATGCTTAGAGTC 559
Query 481 CGCGCTTTTGATAATGAAGAAAACGAATTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATGTGG 540
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 560 CGCGCTTTTGATAATGAAGATAACGAGTTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATTTGG 619
Query 541 AAGCTGATGCCTGAAAGTGGTGGATCAACGCATCACCTTGCTCATGTGCCTTTGAAGGAA 600
||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 AAGCTAATGCCTGAGAGTGGTGGATCAACACATCATCTTGCTCATGTGCCTTTGAAGGAA 679
Query 601 TCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTGGATATCCAGAAAAAGCTTGCA 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 680 TCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTAGATATCCAGAAAAAGCTTGAA 739
Query 661 GATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTCGTGAAGGGAACCAAAATTGGACATGAGAAG 720
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 740 GATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTTGTGAAGGGAACTAAAATTGGACATGAGAAG 799
Query 721 GTTTCAGTACATCTGCTTGAGGATCCTCTGACCCATATATCCGATGAAATAGTACTAACT 780
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||
Sbjct 800 GTTTCAGTTCATCTGCTTGAGGCTCCTCTGACCCATATAGCTGATGAAATTGTATTAACG 859
Query 781 GTGGCAGAGGCCATGTCTCTTGAACCTCGTTCACCAGTCTATGTCCTGATGGGAGCTTCT 840
|| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 GTTGCAGAAGCCATGTCTCTTGAACCTCGCTCACCTGTCTATGTCCTGATGGGAGCTTCT 919
Query 841 TTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGAAAATGTTCCTCAAGCCGTGCATCTACCATCA 900
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 920 TTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGGAAATGTTCCTCAAGCCGTGGATCTACCATCA 979
Query 901 CCACATCATAGATGGTCTGTGTTGAACACTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATAGGT 960
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 CCACATCATAGATGGTCTGTGTTAAACTCTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATAGGT 1039
Query 961 CTGACTAAAGGGTTAAGCTTGGGGTTAACAACTGTTGTTGTTGAGGATACCCGGGTCGCT 1020
|||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 CTGACTAAAGCGTTAAGCTTGGGGGTAACAACAGTTGTTGTTGAGGATACCCGGGTCGCT 1099
Query 1021 GGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTCTTATCTTGTACATA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 GGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTCTTATCTTGTACATA 1159
Query 1081 TCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCGAAACCTTTTCCATCATCTATG 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 TCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCCAAACCTTTTCCATCATCTATG 1219
Query 1141 CATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGAAGA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 CATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGAAGA 1279
Query 1201 CCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAAGAA 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280 CCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAAGAT 1339
Query 1261 TCAGATTATTGGAAAATCTTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAGCAA 1320
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1340 TCAGATTATTGGAAAATCGTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAGCGA 1399
Query 1321 AATTCTAGAATTTTGAACGCAATGTCACCAGGGTTAGGAGAGCTAACAGCTACATTGACC 1380
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 1400 AATTCTAGAATTTTGAACGCAATCTCACCAGGATTAGGAGAGCTGACATCTACATTGACT 1459
Query 1381 TACTTCAGTGGGCATCAGGAATCAAAAGAAGTTCTCAAAATTGTCCAAGAAATTATGGTT 1440
||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1460 TACTTCAGTGGGCATCAAGAGTCAAAAGAGGTTCTCAAGGTTGTCCAAGAAATTAGGGTT 1519
Query 1441 TGTGAGAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTAAAGATGACACACCTAAGATTCTACTCCCT 1500
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1520 TGTGAAAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTGAAGATGACACACCTAAGGTTCTACTCCCA 1579
Query 1501 TGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAATTGTTACAGGAGGTTGTGCAAAAGCA 1560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1580 TGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAATTGTGACAGGAGGTTGTGCAAAAGCA 1639
Query 1561 TCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATGAGCATTTTTTCGGTGTCAGCTTATGGA 1620
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1640 TCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATAAGCATTTTGTCGGTGTCAGCTTATGGA 1699
Query 1621 ATTATCCAGGCAAAGAGGCCTGGAATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCAACTTTTGATTCA 1680
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1700 ATTATCCAGGCAAAGAGGCCCGGTATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCGACTTTCGATTCA 1759
Query 1681 CAAAATTTTGATGAGGTTATCGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGTTGCAA 1740
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760 CAAAATTTTGATGAGGTTATTGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGTTGCAA 1819
Query 1741 AACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGAAGGCT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820 AACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGAAGGCT 1879
Query 1801 TCAAATGGTGCCTCTTTCTCTAGATGTGATGCTTTTAATTCATTGATAAAGTGGAAGACG 1860
| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1880 TTAAATGGTGCAACGTTCTCTAGATGTGATGCTTTTAATTCATTGATAAAGTGGAAGACG 1939
Query 1861 GGGAGTGACTCTTTTGTTATTGTTAATGCGACATCTGAGATGATGATGTTGGACGAACTA 1920
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940 GGGAGTGAGTCTTTTGTTATTGTTAATGCAACATCTGAGATGATGATGTTGGACGAACTA 1999
Query 1921 AGAAGCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCGCAGGCTTCTATATATACTTCATCTCCTGGC 1980
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2000 AGAAGCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCACGGGCTTCTATATATACTGCATCTACTGGC 2059
Query 1981 CGCACAGTACTCCAAGCAACTTTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCGTTGAGT 2040
||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2060 CGCACAGTATTACAAGCAACTCTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCTTTGAGT 2119
Query 2041 GAATCAATAGATTTGAAAGCAACTTTAAGTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCTGTCAGA 2100
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120 GAATCAATAGATTTGAAAGCAACTTTAACTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCTGTCAGA 2179
Query 2101 CAAGATAGCGACGGGAATCATCACGGTGGATATTTGTTTGATAAGGCACAAGAAGAAACT 2160
|||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2180 CAAGATAGTGACGGGAATCATCATGGTGGATATTGGTTTGATAAGGCACAAGAGGAAACT 2239
Query 2161 GATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGGACATATGTTGACGTTATGCTTCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2240 GATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGTACATATGTTGACGTTATGCTTCTG 2299
Query 2221 GGGGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACATTGTAT 2280
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2300 GGTGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACATTATAT 2359
Query 2281 GAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTGCATCATGAGTTTGACCGCCATGCT 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 2360 GAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTCCATCATGAGGTTGACCGCCGTGCT 2419
Query 2341 AACATATATAGAATTTCGTGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTTGCGTGGG 2400
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2420 AACATGTATAGAATTTCATGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTTGCGTGGG 2479
Query 2401 TATCTGGTGGGTATGGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTCTGTTCAT 2460
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2480 AATCTGCTGGGTATAGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTCTGTTCAT 2539
Query 2461 TGCAGCTTCCCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCTTGATGTG 2520
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2540 TGCAGCTTACCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCTTGATGTG 2599
Query 2521 ATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCCTGTGACT 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2600 ATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCCTGTGACT 2659
Query 2581 GTGGCAAATGGGCAGATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGGAGAAGCT 2640
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2660 GTGGCAAATGGGCAAATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGGAGAAGCT 2719
Query 2641 TTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAACTGACCAGTTGCAACAATTTGGCA 2700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2720 TTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAATTGACCAGTTGCAACAATTTGGCA 2779
Query 2701 TACTGGGACGATGATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTAGCCGGGAGAGATTTCTGGCT 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2780 TACTGGGACGATGATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTGGCTGGGAGAGATTTCTGGCT 2839
Query 2761 CTTCGCAACGAATCAGGATTGTGCACTGTCCGAGCCACCGTTTCTGGTATTGATTATTC- 2819
|| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2840 CTACGCAATGAATCAGGATTGTGCACTGTTCGAGCCACCGTTTCTGGTATTGATTATTCT 2899
Query 2820 ---A--------TACTCAACTCCGCTTCCACAAGGTTCTCAAAGTACTCTCACTGATGCT 2868
| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2900 TTCAAAAGCCAATACTCAACTCTGCTTCCACAAGGTTCTGAAAGTACTCTCACTGATGCT 2959
Query 2869 GTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGTCTTTTTC 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 GTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGTCTTTTTC 3019
Query 2929 AATCCTAATGCCAAGGTAAATTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGAAGCAGTT 2988
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3020 AATCCTAATGCCAAGGTAAACTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGAAGCAGTT 3079
Query 2989 GTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATGCTCGCAA 3048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080 GTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATGCTCGCAA 3139
Query 3049 ATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACACTCGTGACAGTATACGACATTGGGGTT 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3140 ATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACAATCGTGACAGTATACGACATTGGAGTT 3199
Query 3109 TCTTCTCCACTTTCAGCACTTGCGTTGATTAAAGTTGCAGATGTGGACTGGATAAAGATT 3168
||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3200 TCTCCTCCACTTTCAGCTCTTGCGTTGATAAAAGTTGCAGATGTGGACTGGATAAAGATT 3259
Query 3169 GCATCTGGGGATGAGACAAGTATAATGGAAGGAAGTTCACACTCCATTGATCTCTTGACT 3228
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3260 GCATCTGGGGATGAGATAAGTATAATGGAAGGAAGTACACACTCCATTGATCTCTTGACT 3319
Query 3229 GGCATTGACGATGGGATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACCCACTTATGGACATTATGGTG 3288
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3320 GGCATTGACGATGGAATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACTCACTTATGGACATTATGGTG 3379
Query 3289 CATATTGAGGATGATCTCGTGGAGCATGTCACTGTTGATGATAATTCACTTTCGGTCGGT 3348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||
Sbjct 3380 CATATTGAGGATGATCTCGTGGAGCATGTCACTGTTGATGAGGATTCACTTTCTGTTGGT 3439
Query 3349 GAACACGTGGGAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCACAACCCTA 3408
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3440 GAACACGTGGCAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCACAACCCTA 3499
Query 3409 TATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGATAAAGTACTAAGCCAGACTATTAAAGTCGAA 3468
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3500 TATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGGTAAAGTGCTAAGCCAAACTATTAAAGTCGAA 3559
Query 3469 GTTTATTCCCCTCCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCCGGTGCTTCTTAT 3528
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3560 GTTTATTCCCCACCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCTGGTGCTTCCTAT 3619
Query 3529 GTGCTCACTGTTGTAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCACTGTGGAT 3588
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3620 GTGCTCACTATTGAAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCACTGTGGAT 3679
Query 3589 AGCGAAGTGGCAAAGGTTGAAAAATCAGGACGCCTATACGCAACATCACCCGGCAACACG 3648
| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3680 AACGAAGTTGCAAAGATCGAAAAATCAGGACGCCTATATGCAACATCTCCCGGCAACACG 3739
Query 3649 ACAATCTATGCAACGATTTACGGGAGTGAAGGTACTGTAATTTGTCAGGCAATTGGCAAT 3708
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3740 ACAATCTATGCAACAATTTACGGGAGTGAAGGTGCTGTAATTTGTCAGGCAATTGGAAAT 3799
Query 3709 GCTGAAGTAGGACTTCCTGCTGCTGCGATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTGTGGCCGTT 3768
|| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3800 GCCGAAGTAGGACTTCCTGCTACTGCAATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTGTGGCCGTT 3859
Query 3769 GGTCATGAAATGCCTACGTCCCCATTATTTCCTGAGGGAGACCTTTTGTCTTTTTATGAG 3828
|| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3860 GGCCATGAAATGCCTGTATCCCCATCATTTCCTGAGGGTGACCTTTTATCTTTTTATGAG 3919
Query 3829 CTCTGCAGTGCATACAAGTGGACTATTGAAGATGAGAAGGTGTTAATTTTCATTGCATCA 3888
|||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3920 CTCTGCAGCGCTTACAAATGGACTATTGAAGATGAAAAGGTGTTAATTTTCATTGCATCA 3979
Query 3889 TCCATCAATGTGGAAGAGAATGCTGCTGGCTTTATCAATGTCGTCCAAGGAAGATCAGCT 3948
||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3980 TCCATCAATGTGGAAGAGAATGCTG--G-CTTTGTTAATGTCGTCCAAGGAAGATCAGCT 4036
Query 3949 GGCAAAACCAGAATCACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGTACTCT 4008
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4037 GGCAAAACCAGAGTTACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGTACTCT 4096
Query 4009 GAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTCTTTCG 4068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4097 GAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTCTTTCG 4156
Query 4069 CTTGGCGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTATTACCT 4128
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4157 CTTGGGGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTATTACCT 4216
Query 4129 TCATCT-CTAGAGCCACAGAAGCATAGGGATGGCCAAAGTCACAGAGGCAATAGAGTCTA 4187
|||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4217 TCATCTTC-AGAGCCACAGAAGCATAGAGATGGACAAAGTCACAGAGGCAATATAGTCTA 4275
Query 4188 TTCCATATTGAAAGACTGTAGCTCTCCGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCAATTAA 4247
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4276 CTCCATATTGAAAGACTGCAGCTCTCGGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCAATTAA 4335
Query 4248 TGGTGGAAGTGTCAAAACAACAGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAAGACCG 4307
||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4336 TGGCGGGAGTGTCAAAACAACTGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAAGACCG 4395
Query 4308 CACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGTGTGAGGGTTGCAGAGGTTGCTCAAATAAG 4367
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4396 CACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGCGTGAGAGTTGCAGAGGTTGCTCAAATAAG 4455
Query 4368 AATGAAGAGTGAGGGGATCCCGTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTCGGCGGTGAACTTGA 4427
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4456 AATGAAGAGTGAGGGGATCCCTTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTTGGCGGTGAACTTGA 4515
Query 4428 ACTTCCAATAAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGTGTTAT 4487
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4516 ACTTCCAATAAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGTGTTAC 4575
Query 4488 TACATACAATGTTGAAACTAATCATCGGGATGTTGTGTATGTTAAGACTGTCAATGACCA 4547
|||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||
Sbjct 4576 TACATACAATGTCGAAACCAATCATCGTGATGTTGTATTTATTAAGACTGTCAATGACCA 4635
Query 4548 ACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCCATTGG 4607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4636 ACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCCATTGG 4695
Query 4608 CGGCAAAAATCTCAGGAAATCAGACTACGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCTCATATCTTTCC 4667
| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4696 TG--ATAA-TCTCAGGAAATCAGATTACGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCGCATATCTTTCC 4752
Query 4668 TCAAAACCCAGTCATTCACACTGGAAATTTGTTAAATTTCAGCATAGCAGGGGCTGATCA 4727
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 4753 TCAAAACCCGGTCATTCACACTGGAAATTTGTTAAATTTCAGCATAACAGGGGCTGATAA 4812
Query 4728 TGAAGTCTCTGGTCAATGGGTTACATCAAACAGAAGTGTCCTATCCGTCAATGTGGCATC 4787
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4813 TGAAGTCACTGGTCAATGGTTTACATCAAACAGAAGTGTCATATCCGTCAATGTGGCATC 4872
Query 4788 TGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCA 4823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4873 TGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCA 4908
Score = 377 bits (204), Expect = 5e-103
Identities = 316/366 (86%), Gaps = 23/366 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 4886 CTACAGGCCAAAGTGTAGAAATTGATGTCT-CATATGAGACGGGCGAGTCCCTAGTAGCT 4944
|||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| || || ||||| |||||||||
Sbjct 5547 CTACTGGCCAAATTGTAGAAATCGATGTCTGC-TATGACACAGGAGAGTCACTAGTAGCT 5605
Query 4945 TCGTCTAAAGATGGATACTCTTTTTTGTTCAAGATACTATGGTGCGTTTTGGTGTGGGCT 5004
|||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |
Sbjct 5606 TCGTCTAAAGATGGTTACTCTGTTTTGTTGAAGATACTATGGGGCGTTTTGGTGTTGGTT 5665
Query 5005 ATATCAGGGATCATCTCGATGAAAGTGATAG---G----GT-----------CTA---GA 5043
|||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||| ||
Sbjct 5666 GTATCAGTGATCATCTTGATGAAAGTGATAGATCGACAAGTGCCCACAGGAGCTACTGGA 5725
Query 5044 ATTGCAACAAACAGTGGAACTGCAGGACCGGGAACACCAGAAAGAAGAAGCGGTGCAGTA 5103
| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5726 ACGGCAACATACAGTGGAAATGCAGCACAGGGAACACCAGAAAGAAGAAGCGGCACAGTT 5785
Query 5104 ATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACCGTTTATGGAGTATGTGAAGAGAACA 5163
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5786 ATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACCATTTATGGAGTATGTGAAGAGAACA 5845
Query 5164 GTGGATGAAACTCCCTATTACAGAAGAGAAGGAAGAAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACT 5223
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5846 GTGGATGAAACTCCCTACTACAGAAGAGAAGGAAGAAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACT 5905
Query 5224 ATGTAG 5229
||||||
Sbjct 5906 ATGTAG 5911
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 260968437486
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5