BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg475134
Length=3945
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G62020.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr1:229195... 6482 0.0
AT2G21390.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr2:915200... 4724 0.0
> AT1G62020.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr1:22919534-22924024
FORWARD LENGTH=4098
Length=4098
Score = 6482 bits (3510), Expect = 0.0
Identities = 3804/3947 (96%), Gaps = 15/3947 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAGAGTAACAGAGTTAAGGGTCTGAGCTTTCACCCTAAA 60
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 152 ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAAAGTAACAGAGTTAAGGGACTGAGTTTTCACCCTAAA 211
Query 61 CGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTTTGGGATTATCGTATG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 212 CGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTATG 271
Query 121 GGTACTTTGATCGATAGATTCGATGAGCACGAAGGACATGTTCGTGGTGTTCATTTCCAC 180
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 GGTACTTTGATCGATAGATTCGACGAACACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCAC 331
Query 181 AATTCACAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTAC 240
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 AATTCTCAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTAC 391
Query 241 AAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTTGGCCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCAG 300
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 392 AAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTAGGGCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCAG 451
Query 301 TTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGTATATGG 360
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 452 TTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCAAGTGATGATCAAACTATCCGTATATGG 511
Query 361 AACTGGCAATCAAGGACTTGTGTTTCTGTTTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGT 420
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 AACTGGCAATCACGGACTTGTGTTTCTGTATTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGT 571
Query 421 GCTTCTTTCCATCCGAAAGAAGATCTCGTCGTATCAGCTTCTTTAGATCAGACTGTCCGT 480
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 572 GCTTCTTTCCATCCGAAAGAAGACCTCGTCGTATCAGCTTCGTTAGATCAGACTGTTCGT 631
Query 481 GTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGACATCATGAGG 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 632 GTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGATATCATGAGG 691
Query 541 TTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCTATAGTCAAGTACGTTCTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 692 TTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCCATTGTCAAGTACGTTCTT 751
Query 601 GAAGGTCATGACAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTCATTGTC 660
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 752 GAAGGTCATGATAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTTATTGTC 811
Query 661 TCCGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCCGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAG 720
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 TCGGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAG 871
Query 721 GTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAACAG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 GTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAACAG 931
Query 781 GACATAATTGTGTCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAGCGA 840
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 GACATAATTGTATCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAGCGA 991
Query 841 ACTGGACTTCAAACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCACCCT 900
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 ACTGGACTTCAGACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCACCCT 1051
Query 901 GAGATGAATCTACTAGCAGCAGGTCATGACAGCGGCATGATCGTGTTCAAACTTGAGAGA 960
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1052 GAGATGAATCTACTAGCAGCAGGACATGACAGTGGCATGATTGTGTTCAAGCTTGAGAGA 1111
Query 961 GAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATTCTTG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 GAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATTCTTG 1171
Query 1021 CGGTACTACGAATATTCAACTCAAAGAGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCCTGGT 1080
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1172 CGGTACTATGAATATTCAACTCAAAGGGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCCGGGT 1231
Query 1081 ACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCGACTGAAAATGCAGTT 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1232 ACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCCACTGAAAATGCAGTT 1291
Query 1141 TTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGATAGT 1200
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292 TTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCGTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGATAGT 1351
Query 1201 GTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACCGGTGGCTCTGCAGTATTC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1352 GTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACAGGTGGCTCTGCAGTATTC 1411
Query 1261 ATTGCCCGTAACCGGTTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTCAAGAAT 1320
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1412 ATTGCCCGTAACCGATTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAAGTGCTAGTCAAGAAT 1471
Query 1321 CTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTTTTAT 1380
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 CTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTCCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTTTTAT 1531
Query 1381 GCCGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATATTTGACCTCCAG 1440
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1532 GCTGGGACTGGGAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATCTTTGACCTCCAG 1591
Query 1441 CAAAGGCTTGTTCTTGGTGAACTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTCTAGT 1500
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1592 CAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTCCAGT 1651
Query 1501 GATATGGAGAGGGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATAATTATCGCGAGCAAAAAACTT 1560
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1652 GATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATCGCGAGCAAAAAACTT 1711
Query 1561 GTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGATAAC 1620
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 GTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGATAAT 1771
Query 1621 GGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGATAGT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 GGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGATAGT 1831
Query 1681 GGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCGATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATACAATC 1740
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 GGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATACAATC 1891
Query 1741 TTCTGCTTGGATCGGGATGGGAAAAACAAGGCTATCACCATCAATGCAACCGAGTACATT 1800
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1892 TTTTGCTTGGATCGGGATGGCAAAAACAAGGCTATCACCATTAATGCAACCGAGTACATT 1951
Query 1801 TTCAAGCTTTCACTTCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAACTCC 1860
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1952 TTCAAGCTTTCACTGCTGAGGAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAACTCT 2011
Query 1861 CAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTATCTGCAGCAAAAAGGATTCCCTGAAGTTGCT 1920
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2012 CAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTACCTGCAGCAGAAAGGATTCCCTGAAGTTGCC 2071
Query 1921 CTCCATTTTGTTGAAGATGAAAGGATCCGATTCAACCTGGCTCTTGAAAGTGGCAACATC 1980
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 CTCCATTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAATCTGGCTCTTGAAAGTGGCAACATC 2131
Query 1981 AGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACTTGGG 2040
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 AGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACTTGGA 2191
Query 2041 GTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTAGAGTTTGCATACCAGCAGACAAAG 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2192 GTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTTGAGTTTGCATACCAGCAGACAAAG 2251
Query 2101 AACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGTAATTTGGATAAGCTTTCAAAG 2160
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 2252 AACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGAAATTTGGACAAGCTTTCAAAG 2311
Query 2161 TTGATGAAGATTGCGGAAGTAAAGAACAACGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTCTCTAC 2220
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 TTGATGAAGATTGCAGAAGTGAAGAACAACGTAATGGGACAGTTTCACAATGCTCTCTAC 2371
Query 2221 CTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCT 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 CTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCT 2431
Query 2281 TATATTACGGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGAGCTA 2340
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2432 TATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGAGTTA 2491
Query 2341 GGAGACAATGTGCCCTCCTTACCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGACA 2400
|||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492 GGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGACA 2551
Query 2401 CCCATCATGTGCGGTGGTGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGA 2460
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2552 CCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTTCTTAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGA 2611
Query 2461 GGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAGGAGGATGCTGAAGGTGATTGG 2520
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||
Sbjct 2612 GGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAAGAAGATGTTGAAGGGGATTGG 2671
Query 2521 GGTGAGGAACTTGACATAAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGACATCGAAGACATCTTG 2580
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||
Sbjct 2672 GGTGAGGAACTTGACATTAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGATATTGAAGACATTTTG 2731
Query 2581 GCGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGATGGGGAGGTCTTGAT 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2732 GCGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGATGGGGA---CTTGAA 2788
Query 2641 GACTTGGAGCTCCCACCCGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTAATGCCCGTTCATCA 2700
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2789 GACTTGGTGCTCCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTAATGCACGTTCATCT 2848
Query 2701 GTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATCTGGAGCCAGAAATCTTCT 2760
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2849 GTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGAGCTGGAGCCAGAAATCTTCT 2908
Query 2761 CTTGCTGCTGAGCAAGCTGCAGCGGGAAGCTTTGACACTGCAATGCGCCTGCTCCACAGA 2820
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2909 CTTGCTGCTGAGCAAGCCGCAGCGGGAAGCTTCGACACTGCAATGCGTCTGCTCCACAGA 2968
Query 2821 CAGCTTGGTATAAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTTGATCTGTTCAATGGC 2880
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2969 CAGCTTGGTATCAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTAGATCTGTTCAATGGC 3028
Query 2881 AGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCACTTGCCATTGAGCGT 2940
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3029 AGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATGTCCTGTGGTTCCACTTGCCATTGAGCGT 3088
Query 2941 GGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTTCGTGGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTC 3000
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3089 GGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTCCGTAGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTC 3148
Query 3001 TCTCAGCTAGACGAGAAGCTTAAATCCGGCTACAAAGCCACAACAAGTGGGAAATTCACT 3060
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 3149 TCTCAGCTAGACGAGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAACAACTGGGAAATTCACT 3208
Query 3061 GAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTCCACACCATCCCTCTAGTGGTAGTCGAGTCA 3120
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3209 GAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTGCACACCATCCCTCTAGTGGTAGTCGAGACA 3268
Query 3121 AGAAGAGAAGTCGATGAGGTGAAGGAACTAATCGTTATCGTTAAAGAATATGTCCTTGGT 3180
||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3269 AGAAGAGAAGTGGATGAGGTCAAGGAATTAATCGTTATCGTTAAAGAATATGTCCTTGGT 3328
Query 3181 CTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTC 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3329 CTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTC 3388
Query 3241 GCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTACGGCTTGCGCTGCTTAGT 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3389 GCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTACGGCTTGCGCTGCTTAGT 3448
Query 3301 GCAATGGGCGTCTGCTTCAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGCTTCTAATTTTGCCAGAAGA 3360
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3449 GCAATGGGTGTCTGCTACAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGCTTCTAATTTCGCCAGAAGA 3508
Query 3361 CTATTGGAAACAAGCCCAGTGGATAGCCAGGCCAAGATGGCTAGAAAAGTTGTACAAGCC 3420
|| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 3509 CTGTTGGAAACAAGCCCAGTTGATAGCCAAGCCAAGATGGCTAGACAAGTTGTGCAAGCC 3568
Query 3421 GCTGAAAGTAACATGACCGATGAAACCAAGCTTAACTACGACTTCAGGAATCCATTTGTG 3480
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3569 GCTGAACGTAACATGACCGATGAAACAAAGCTTAACTACGACTTCAGGAACCCTTTTGTG 3628
Query 3481 GTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACAGAAAGACGTCTCATGTCCTTAC 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3629 GTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACAGAAAGACGTCTCATGTCCTTAC 3688
Query 3541 TGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCA 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3689 TGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCA 3748
Query 3601 GTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTCTCCATCTCAAGTCCGGTGATCAATT 3660
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3749 GTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGTTATGCTCTCCATCTCAAGTCCGGTGATCAATT 3808
Query 3661 TTCAGATTTCATAATCAATACAGAGATGCTCTATTAACAGAATAAGAATGTTGAGCTTTT 3720
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 3809 T-CAGATTTCATAATCAATACAGAGATGCTCTATTAACAGAATAAGAGTGTTGAACTTTT 3867
Query 3721 GGTGTTTTTGTGATTGTGTACTTACCAATCAGGTTTGTGGATTTTTCTCGTTGCAGGTTT 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3868 GGTGTTTTTGTGATTGTGTACTTACCAATCAGGTTTGAGGATTTTTCTCGTTGCAGGTTT 3927
Query 3781 TTCTATTACTCTTTTTAAAGTTGTTTCTTATCTTTTAGTAACAACAACACATGAGAACTT 3840
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct 3928 TT--ATTACTCTTTTAAAAGTTGTTTCTTATCTTTTAGTA-CA-CA-----TGAGAACTT 3978
Query 3841 TAGCTTCTTGCTTTATAATTTCT-TTTT-GATGCATAGTAGTGCTGGATGATTTTTAATT 3898
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| | || |||||
Sbjct 3979 TAGCTTCTTGCTTTATAATTTCTCTTTTTGATGCATAGTAGCACTGGATAACTTGTAATT 4038
Query 3899 TCAATTTCGAAAATTATGGTTTACTTGTGAAATTATGATTTTATAAA 3945
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4039 TCAATTTCGGAAATTATGGTTTACTTGTGAAATTATGATTTTATAAA 4085
> AT2G21390.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr2:9152006-9156878
FORWARD LENGTH=4190
Length=4190
Score = 4724 bits (2558), Expect = 0.0
Identities = 3317/3684 (90%), Gaps = 49/3684 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAGAGTAACAGAGTTAAGGGTCTGAGCTTT-CACCCTAA 59
||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 233 ATGCTGACCAAGTTCGAGACCAAGAGTAACCGAGTTAAGGGTCTGAG-TTTCCACCCTAA 291
Query 60 ACGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTTTGGGATTATCGTAT 119
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 292 ACGACCATGGATTCTCGCGAGTTTACACAGTGGTGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTAT 351
Query 120 GGGTACTTTGATCGATAGATTCGATGAGCACGAAGGACATGTTCGTGGTGTTCATTTCCA 179
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 352 GGGTACTTTGATCGACAGATTTGATGAGCACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCA 411
Query 180 CAATTCACAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTA 239
||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 412 CAACTCACAGCCTTTATTCGTCTCTGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTTTGGAACTA 471
Query 240 CAAAAAC-CACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTTGGCCATCTTGATTATATCCGCACGGTTC 298
| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
Sbjct 472 C-AAAACTCACAGGTGTCTTTTCACTCTTCTCGGGCATCTTGATTATATCCGCACTGTCC 530
Query 299 AGTTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGTATAT 358
| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 531 AATTTCACCACGAAAACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGCATTT 590
Query 359 GGAACTGGCAATCAAGGACTTGTGTTTCTGTTTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGT 418
|||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GGAACTGGCAGTCTAGGACTTGTATTTCCGTGTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGT 650
Query 419 GTGCTTCTTTCCATCCGAAA-GAAGATCTCGTCGTATCAGCTTCTTTAGATCAGACTGTC 477
|||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||||||
Sbjct 651 GTGCTTCTTTCCATCC-AAAGGAAGATCTTGTTGTATCAGCATCACTGGATCAGACTGTC 709
Query 478 CGTGTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGACATCATG 537
||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||
Sbjct 710 CGTGTTTGGGACATTGGTGCTCTTAAGAAGAAGTCAGCATCTCCTGCTGATGACCTCATG 769
Query 538 AGGTTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCTATAGTCAAGTACGTT 597
| || | |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 770 CGATTTAGTCAGATGAATTCTGATCTTTTTGGAGGGGTTGACGCTATAGTTAAGTACGTC 829
Query 598 CTTGAAGGTCATGACAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTCATT 657
|||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 830 CTTGAAGGTCATGATAGAGGAGTCAACTGGGCTTCTTTTCATCCCACACTTCCTCTCATT 889
Query 658 GTCTCCGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCCGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGG 717
||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 GTCTCTGGTGCCGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGG 949
Query 718 GAGGTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAA 777
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 950 GAGGTGGATACATTGCGAGGTCATATGAATAACGTTTCATCCGTTATGTTCCATGCAAAA 1009
Query 778 CAGGACATAATTGTGTCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAG 837
|||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 CAGGACATTATCGTGTCAAACTCTGAGGATAAAAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAG 1069
Query 838 CGAACTGGACTTCAAACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCAC 897
||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070 CGAACTGGAATCCAAACTTTTCGTCGTGAGCATGACCGATTCTGGATTCTTGCAGTTCAC 1129
Query 898 CCTGAGATGAATCTACTAGCAGCAGGTCATGACAGCGGCATGATCGTGTTCAAACTTGAG 957
|||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||
Sbjct 1130 CCTGAGATTAATCTACTTGCAGCAGGACATGACAATGGTATGATTGTTTTCAAACTTGAG 1189
Query 958 AGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGA-TT 1016
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1190 AGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGTGATTCGTTATTCTATGCCAAAGATAGATTT 1249
Query 1017 CTTGCGGTACTACGAATATTCAACTCAAAGAGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCC 1076
| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1250 C-TGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAAAGATTCCCAAGTTATTCCTATACGGCGTCC 1308
Query 1077 TGGTACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCGACTGAAAATGC 1136
|||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1309 TGGTACCCCAAGCTTGAATCAAAGTCCGAGGACTTTATCCTACAGTCCGACAGAAAATGC 1368
Query 1137 AGTTTTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1196
||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 AGTCTTAATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTACGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1428
Query 1197 TAGTGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACCGGTGGCTCTGCAGT 1256
||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||
Sbjct 1429 TAGCGTTGGCAGGAGTGATGTTGTACAAGATGCAAAGAGGGGGACAGGGGGTTCTGCGGT 1488
Query 1257 ATTCATTGCCCGTAACCGGTTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTCAA 1316
|||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1489 GTTCATTGCTCGAAATCGGTTTGCTGTTCTGGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGTTAGTGAA 1548
Query 1317 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1376
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTTTACCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1608
Query 1377 TTATGCCGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATATTTGACCT 1436
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1609 TTATGCTGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTGGTTATATTTGACCT 1668
Query 1437 CCAGCAAAGGCTTGTTCTTGGTGAACTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTC 1496
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 TCAACAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCGTTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTC 1728
Query 1497 TAGTGATATGGAGAGGGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATAATTATCGCGAGCAAAAA 1556
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1729 TAACGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATTGCGAGCAAAAA 1788
Query 1557 ACTTGTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGA 1616
|||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1789 ACTTGTCCTACAGTGCACGCTTCATGAGACAATACGTGTGAAAAGTGGAGCATGGGACGA 1848
Query 1617 TAACGGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGA 1676
|| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1849 CAATGGTGTCTTCATTTACACTACTCTGAACCACATCAAGTACTGTCTGCCTAATGGAGA 1908
Query 1677 TAGTGGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCGATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATAC 1736
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1909 TAGTGGAATCATCAGAACCCTGGATGTCCCAATCTACATCACCAAGGTGTCTGGAAATAC 1968
Query 1737 AATCTTCTGCTTGGATCGGGATGGGAAAAACAAGGCTATCACCATCAATGCAACCGAGTA 1796
|||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1969 AATCTTTTGCTTGGACCGGGATGGGAAAAACAGGGCTATCACCATTAATGCAACCGAATA 2028
Query 1797 CATTTTCAAGCTTTCACTTCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 1856
||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 CATTTTCAAGCTTGCACTACTGAGAAAGAAATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 2088
Query 1857 CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTATCTGCAGCAAAAAGGATTCCCTGAAGT 1916
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2089 CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATCGCTTATCTTCAGCAGAAAGGATTTCCTGAAGT 2148
Query 1917 TGCTCTCCATTTTGTTGAAGATGAAAGGATCCGATTCAACCTGGCTCTTGAAAGTGGCAA 1976
||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2149 TGCCCTACACTTTGTTGAAGACGAGAGGATCCGATTCAACTTGGCTCTTGAAAGTGGCAA 2208
Query 1977 CATCAGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACT 2036
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 CATCAGTGTAGCTGTTGCATCCGCTACAGAGATTAATGAGAAAGACCACTGGTATAGACT 2268
Query 2037 TGGGGTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTAGAGTTTGCATACCAGCAGAC 2096
|| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2269 CGGAGTGGAAGCTCTTCGTCAAGGAAATTCTAGAATTGTTGAGTTTGCGTACCAGCAGAC 2328
Query 2097 AAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGTAATTTGGATAAGCTTTC 2156
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct 2329 AAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTATATCTCATTACTGGCAATTTAGACAAGCTGTC 2388
Query 2157 AAAGTTGATGAAGATTGCGGAAGTAAAGAACAACGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTCT 2216
|||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2389 AAAGTTGATGAAGATTGCAGAGGTGAAGAACAATGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCACT 2448
Query 2217 CTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCT 2276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 CTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTAGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCT 2508
Query 2277 AGCTTATATTACGGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGA 2336
||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 2509 AGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAACTGACATTGCTGAGCGACTAGCAATTGA 2568
Query 2337 GCTAGGAGACAATGTGCCCTCCTTACCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACC 2396
|||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2569 GCTAGGAGACAATGTGCCTTCATTGCCTGAAGGGAAGACTCCATCGCTTTTAATGCCACC 2628
Query 2397 GACACCCATCATGTGCGGTGGTGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGA 2456
| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2629 GTCTCCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTACTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGA 2688
Query 2457 AGGAGGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATG-AG--G-AG--GATGCTGA 2510
||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || | || |||| |||
Sbjct 2689 AGGAGGACTTGAGAGTGCAAACAGAGG-GG--CTGTTGATGAAGAAGAAGAAGATGTTGA 2745
Query 2511 AGGTGATTGGGGTGAGGAACTTGAC--A-TAAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGACAT 2567
||| || |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2746 AGGCGACTGGGGTGAGGGACTTGACAAATTCGATGTTGATGGAATGGAGAACACAGACAT 2805
Query 2568 CGAAGACATCTTGG-CGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGAT 2626
||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 2806 CGAAGCCATATTGGATGG-TGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAGACGACGAGGAAGGTGGAT 2864
Query 2627 GGGGAGGTCTTGATGACTTGGAGCTCCCACCCGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTA 2686
||||| | | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 GGGGA---C-T--TGACTTGGATCTTCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTA 2918
Query 2687 ATGCCCGTTCATC-AGTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATCTGG 2745
| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2919 ACGCACGTTCATCTA-CTTTTGTGACACCTCCTCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATTTGG 2977
Query 2746 AGCCAGAAATCTTCTCTTGCTGCTGAGCAAGCTGCAGCGGGAAGCTTTGACACTGCAATG 2805
|| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 2978 AGTCAGAAATCTTCCCTTGCTGCTGAGCAGGCTGCAGCAGGAAGCTTCGACACTGCAATG 3037
Query 2806 CGCCTGCTCCACAGACAGCTTGGTATAAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTT 2865
|| |||||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3038 CGTTTGCTCCACAGGCAGCTTGGCATTAAGAACTTTGCGCCTTTGAAATCGATGTTTCTT 3097
Query 2866 GATCTGTTCAATGGCAGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCA 2925
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3098 GATCTGTTCAGTGGGAGCCATAGCTATCTGCGTGCCTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCT 3157
Query 2926 CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTTCGTGGCCCACCAGCT 2985
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 3158 CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGTGAGTCTTCCAGTCCTAACGTCCGTGGCCCGCCAGCT 3217
Query 2986 CTTGTTTATGATTTCTCTCAGCTAGACG-AGAAGCTTAAATCCGGCTACAAAGCCACAAC 3044
||||||| ||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3218 CTTGTTTTTGATTTCTCTCAGCTTGAAGCA-AAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAAC 3276
Query 3045 AAG-TGGGAAATTCA-CTGAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTCCACACCATCCC- 3101
|| ||||||| | | |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3277 -AGCTGGGAAACT-ATCTGAGGCTCTTCGTGTCTTCCTCTCTATTCTCCAAACCATCCCA 3334
Query 3102 TCTAGTGGTAGTCGAGTCAAGAAGAGAAGTCGATGAGGTGAAGGAACTAATCGTTATCGT 3161
| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | || ||
Sbjct 3335 T-TGGTGGTAGTTGAGTCAAGAAGAGAAGTAGATGAGGTTAAGGAACTGGTCATCATTGT 3393
Query 3162 TAAAGAATATGTCCTTGGTCTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCC 3221
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3394 TAAAGAATATGTCCTCGGTCTTCAATTGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCC 3453
Query 3222 GGTGAGGCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTT 3281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
Sbjct 3454 GGTGAGGCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTTCACTCACTGTAAACTTCAAACACCTCACCT 3513
Query 3282 ACGGCTTGCGCTGCTT-AGTGCAATGGGCGTCTGCTTCAAGGCAAAGAACCTCGCCACTG 3340
|||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| | || ||||
Sbjct 3514 ACGGCTCGCG-TACTTCAGTGCAATGACCGTCTGCTACAAGTCAAAGAACATGGCTACTG 3572
Query 3341 CTTCTAATTTTGCCAGAAGACTATTGGAAACAAGCCCAG-TG--GATAGCCAGGCCAAGA 3397
|| || | || |||||||| | ||||| |||| |||| | || |||||||||| ||
Sbjct 3573 CTGCTCACTTCGCCAGAAGTTTGTTGGATACAAACCCAACTATTGAGAGCCAGGCCAGGA 3632
Query 3398 TGGCTAGAAAAGTTGTACAAGCCGCTGAAAGTAACATGACCGATGAAACCA-AGCTTAAC 3456
||||||| ||||| | ||||| |||||| | |||||||| |||| ||| | | || |||
Sbjct 3633 CGGCTAGACAAGTTATGCAAGCAGCTGAACGCAACATGACAGATGCAACAACA-CTCAAC 3691
Query 3457 TACGACTTCAGGAATCCATTTGTGGTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGA 3516
|||||||| || || || |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||
Sbjct 3692 TACGACTTTAGAAACCCGTTTGTGATATGCGGGTCCACTTATGTGCCAATCTACAAAGGA 3751
Query 3517 CAGAAAGACGTCT-CATGTCCTTACTGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAA 3575
||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 3752 CAGAAAGACGT-TGCATGTCCTTACTGCACTGCCCGGTTTGTACCAAGCCAGGAAGGTAA 3810
Query 3576 CATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCAGTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTC 3635
||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3811 CATTTGCTCGGTCTGTGATCTTGCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGCTTGCTATGCTC 3870
Query 3636 T-CCATCTCAAGTCCGGTGATCAA 3658
| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 3871 TGCC-TCTCAAGTCCGGTGAACAA 3893
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 196554082674
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5