BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg475134

Length=3945
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT1G62020.1 | Symbols:  | Coatomer, alpha subunit | chr1:229195...  6482    0.0  
  AT2G21390.1 | Symbols:  | Coatomer, alpha subunit | chr2:915200...  4724    0.0  


> AT1G62020.1 | Symbols:  | Coatomer, alpha subunit | chr1:22919534-22924024 
FORWARD LENGTH=4098
Length=4098

 Score = 6482 bits (3510),  Expect = 0.0
 Identities = 3804/3947 (96%), Gaps = 15/3947 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAGAGTAACAGAGTTAAGGGTCTGAGCTTTCACCCTAAA  60
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct  152   ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAAAGTAACAGAGTTAAGGGACTGAGTTTTCACCCTAAA  211

Query  61    CGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTTTGGGATTATCGTATG  120
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  212   CGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTATG  271

Query  121   GGTACTTTGATCGATAGATTCGATGAGCACGAAGGACATGTTCGTGGTGTTCATTTCCAC  180
             ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  272   GGTACTTTGATCGATAGATTCGACGAACACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCAC  331

Query  181   AATTCACAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTAC  240
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332   AATTCTCAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTAC  391

Query  241   AAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTTGGCCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCAG  300
             ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392   AAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTAGGGCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCAG  451

Query  301   TTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGTATATGG  360
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct  452   TTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCAAGTGATGATCAAACTATCCGTATATGG  511

Query  361   AACTGGCAATCAAGGACTTGTGTTTCTGTTTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGT  420
             |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512   AACTGGCAATCACGGACTTGTGTTTCTGTATTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGT  571

Query  421   GCTTCTTTCCATCCGAAAGAAGATCTCGTCGTATCAGCTTCTTTAGATCAGACTGTCCGT  480
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct  572   GCTTCTTTCCATCCGAAAGAAGACCTCGTCGTATCAGCTTCGTTAGATCAGACTGTTCGT  631

Query  481   GTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGACATCATGAGG  540
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  632   GTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGATATCATGAGG  691

Query  541   TTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCTATAGTCAAGTACGTTCTT  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct  692   TTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCCATTGTCAAGTACGTTCTT  751

Query  601   GAAGGTCATGACAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTCATTGTC  660
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  752   GAAGGTCATGATAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTTATTGTC  811

Query  661   TCCGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCCGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAG  720
             || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812   TCGGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAG  871

Query  721   GTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAACAG  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  872   GTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAACAG  931

Query  781   GACATAATTGTGTCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAGCGA  840
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932   GACATAATTGTATCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAGCGA  991

Query  841   ACTGGACTTCAAACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCACCCT  900
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  992   ACTGGACTTCAGACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCACCCT  1051

Query  901   GAGATGAATCTACTAGCAGCAGGTCATGACAGCGGCATGATCGTGTTCAAACTTGAGAGA  960
             ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct  1052  GAGATGAATCTACTAGCAGCAGGACATGACAGTGGCATGATTGTGTTCAAGCTTGAGAGA  1111

Query  961   GAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATTCTTG  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1112  GAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATTCTTG  1171

Query  1021  CGGTACTACGAATATTCAACTCAAAGAGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCCTGGT  1080
             |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1172  CGGTACTATGAATATTCAACTCAAAGGGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCCGGGT  1231

Query  1081  ACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCGACTGAAAATGCAGTT  1140
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1232  ACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCCACTGAAAATGCAGTT  1291

Query  1141  TTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGATAGT  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1292  TTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCGTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGATAGT  1351

Query  1201  GTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACCGGTGGCTCTGCAGTATTC  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1352  GTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACAGGTGGCTCTGCAGTATTC  1411

Query  1261  ATTGCCCGTAACCGGTTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTCAAGAAT  1320
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1412  ATTGCCCGTAACCGATTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAAGTGCTAGTCAAGAAT  1471

Query  1321  CTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTTTTAT  1380
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1472  CTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTCCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTTTTAT  1531

Query  1381  GCCGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATATTTGACCTCCAG  1440
             || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1532  GCTGGGACTGGGAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATCTTTGACCTCCAG  1591

Query  1441  CAAAGGCTTGTTCTTGGTGAACTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTCTAGT  1500
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1592  CAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTCCAGT  1651

Query  1501  GATATGGAGAGGGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATAATTATCGCGAGCAAAAAACTT  1560
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1652  GATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATCGCGAGCAAAAAACTT  1711

Query  1561  GTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGATAAC  1620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1712  GTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGATAAT  1771

Query  1621  GGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGATAGT  1680
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1772  GGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGATAGT  1831

Query  1681  GGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCGATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATACAATC  1740
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1832  GGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATACAATC  1891

Query  1741  TTCTGCTTGGATCGGGATGGGAAAAACAAGGCTATCACCATCAATGCAACCGAGTACATT  1800
             || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1892  TTTTGCTTGGATCGGGATGGCAAAAACAAGGCTATCACCATTAATGCAACCGAGTACATT  1951

Query  1801  TTCAAGCTTTCACTTCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAACTCC  1860
             |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1952  TTCAAGCTTTCACTGCTGAGGAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAACTCT  2011

Query  1861  CAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTATCTGCAGCAAAAAGGATTCCCTGAAGTTGCT  1920
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| 
Sbjct  2012  CAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTACCTGCAGCAGAAAGGATTCCCTGAAGTTGCC  2071

Query  1921  CTCCATTTTGTTGAAGATGAAAGGATCCGATTCAACCTGGCTCTTGAAAGTGGCAACATC  1980
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2072  CTCCATTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAATCTGGCTCTTGAAAGTGGCAACATC  2131

Query  1981  AGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACTTGGG  2040
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2132  AGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACTTGGA  2191

Query  2041  GTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTAGAGTTTGCATACCAGCAGACAAAG  2100
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2192  GTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTTGAGTTTGCATACCAGCAGACAAAG  2251

Query  2101  AACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGTAATTTGGATAAGCTTTCAAAG  2160
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct  2252  AACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGAAATTTGGACAAGCTTTCAAAG  2311

Query  2161  TTGATGAAGATTGCGGAAGTAAAGAACAACGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTCTCTAC  2220
             |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2312  TTGATGAAGATTGCAGAAGTGAAGAACAACGTAATGGGACAGTTTCACAATGCTCTCTAC  2371

Query  2221  CTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCT  2280
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2372  CTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCT  2431

Query  2281  TATATTACGGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGAGCTA  2340
             ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2432  TATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGAGTTA  2491

Query  2341  GGAGACAATGTGCCCTCCTTACCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGACA  2400
             |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2492  GGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGACA  2551

Query  2401  CCCATCATGTGCGGTGGTGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGA  2460
             ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2552  CCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTTCTTAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGA  2611

Query  2461  GGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAGGAGGATGCTGAAGGTGATTGG  2520
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||
Sbjct  2612  GGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAAGAAGATGTTGAAGGGGATTGG  2671

Query  2521  GGTGAGGAACTTGACATAAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGACATCGAAGACATCTTG  2580
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||
Sbjct  2672  GGTGAGGAACTTGACATTAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGATATTGAAGACATTTTG  2731

Query  2581  GCGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGATGGGGAGGTCTTGAT  2640
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| 
Sbjct  2732  GCGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGATGGGGA---CTTGAA  2788

Query  2641  GACTTGGAGCTCCCACCCGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTAATGCCCGTTCATCA  2700
             ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
Sbjct  2789  GACTTGGTGCTCCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTAATGCACGTTCATCT  2848

Query  2701  GTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATCTGGAGCCAGAAATCTTCT  2760
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2849  GTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGAGCTGGAGCCAGAAATCTTCT  2908

Query  2761  CTTGCTGCTGAGCAAGCTGCAGCGGGAAGCTTTGACACTGCAATGCGCCTGCTCCACAGA  2820
             ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2909  CTTGCTGCTGAGCAAGCCGCAGCGGGAAGCTTCGACACTGCAATGCGTCTGCTCCACAGA  2968

Query  2821  CAGCTTGGTATAAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTTGATCTGTTCAATGGC  2880
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2969  CAGCTTGGTATCAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTAGATCTGTTCAATGGC  3028

Query  2881  AGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCACTTGCCATTGAGCGT  2940
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3029  AGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATGTCCTGTGGTTCCACTTGCCATTGAGCGT  3088

Query  2941  GGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTTCGTGGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTC  3000
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3089  GGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTCCGTAGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTC  3148

Query  3001  TCTCAGCTAGACGAGAAGCTTAAATCCGGCTACAAAGCCACAACAAGTGGGAAATTCACT  3060
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct  3149  TCTCAGCTAGACGAGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAACAACTGGGAAATTCACT  3208

Query  3061  GAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTCCACACCATCCCTCTAGTGGTAGTCGAGTCA  3120
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  3209  GAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTGCACACCATCCCTCTAGTGGTAGTCGAGACA  3268

Query  3121  AGAAGAGAAGTCGATGAGGTGAAGGAACTAATCGTTATCGTTAAAGAATATGTCCTTGGT  3180
             ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3269  AGAAGAGAAGTGGATGAGGTCAAGGAATTAATCGTTATCGTTAAAGAATATGTCCTTGGT  3328

Query  3181  CTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTC  3240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3329  CTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTC  3388

Query  3241  GCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTACGGCTTGCGCTGCTTAGT  3300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3389  GCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTACGGCTTGCGCTGCTTAGT  3448

Query  3301  GCAATGGGCGTCTGCTTCAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGCTTCTAATTTTGCCAGAAGA  3360
             |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3449  GCAATGGGTGTCTGCTACAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGCTTCTAATTTCGCCAGAAGA  3508

Query  3361  CTATTGGAAACAAGCCCAGTGGATAGCCAGGCCAAGATGGCTAGAAAAGTTGTACAAGCC  3420
             || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct  3509  CTGTTGGAAACAAGCCCAGTTGATAGCCAAGCCAAGATGGCTAGACAAGTTGTGCAAGCC  3568

Query  3421  GCTGAAAGTAACATGACCGATGAAACCAAGCTTAACTACGACTTCAGGAATCCATTTGTG  3480
             |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct  3569  GCTGAACGTAACATGACCGATGAAACAAAGCTTAACTACGACTTCAGGAACCCTTTTGTG  3628

Query  3481  GTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACAGAAAGACGTCTCATGTCCTTAC  3540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3629  GTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACAGAAAGACGTCTCATGTCCTTAC  3688

Query  3541  TGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCA  3600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3689  TGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCA  3748

Query  3601  GTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTCTCCATCTCAAGTCCGGTGATCAATT  3660
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3749  GTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGTTATGCTCTCCATCTCAAGTCCGGTGATCAATT  3808

Query  3661  TTCAGATTTCATAATCAATACAGAGATGCTCTATTAACAGAATAAGAATGTTGAGCTTTT  3720
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct  3809  T-CAGATTTCATAATCAATACAGAGATGCTCTATTAACAGAATAAGAGTGTTGAACTTTT  3867

Query  3721  GGTGTTTTTGTGATTGTGTACTTACCAATCAGGTTTGTGGATTTTTCTCGTTGCAGGTTT  3780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  3868  GGTGTTTTTGTGATTGTGTACTTACCAATCAGGTTTGAGGATTTTTCTCGTTGCAGGTTT  3927

Query  3781  TTCTATTACTCTTTTTAAAGTTGTTTCTTATCTTTTAGTAACAACAACACATGAGAACTT  3840
             ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||
Sbjct  3928  TT--ATTACTCTTTTAAAAGTTGTTTCTTATCTTTTAGTA-CA-CA-----TGAGAACTT  3978

Query  3841  TAGCTTCTTGCTTTATAATTTCT-TTTT-GATGCATAGTAGTGCTGGATGATTTTTAATT  3898
             ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | || |||||
Sbjct  3979  TAGCTTCTTGCTTTATAATTTCTCTTTTTGATGCATAGTAGCACTGGATAACTTGTAATT  4038

Query  3899  TCAATTTCGAAAATTATGGTTTACTTGTGAAATTATGATTTTATAAA  3945
             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4039  TCAATTTCGGAAATTATGGTTTACTTGTGAAATTATGATTTTATAAA  4085


> AT2G21390.1 | Symbols:  | Coatomer, alpha subunit | chr2:9152006-9156878 
FORWARD LENGTH=4190
Length=4190

 Score = 4724 bits (2558),  Expect = 0.0
 Identities = 3317/3684 (90%), Gaps = 49/3684 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAGAGTAACAGAGTTAAGGGTCTGAGCTTT-CACCCTAA  59
             ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct  233   ATGCTGACCAAGTTCGAGACCAAGAGTAACCGAGTTAAGGGTCTGAG-TTTCCACCCTAA  291

Query  60    ACGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTTTGGGATTATCGTAT  119
             |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  292   ACGACCATGGATTCTCGCGAGTTTACACAGTGGTGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTAT  351

Query  120   GGGTACTTTGATCGATAGATTCGATGAGCACGAAGGACATGTTCGTGGTGTTCATTTCCA  179
             ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  352   GGGTACTTTGATCGACAGATTTGATGAGCACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCA  411

Query  180   CAATTCACAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTA  239
             ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  412   CAACTCACAGCCTTTATTCGTCTCTGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTTTGGAACTA  471

Query  240   CAAAAAC-CACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTTGGCCATCTTGATTATATCCGCACGGTTC  298
             | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
Sbjct  472   C-AAAACTCACAGGTGTCTTTTCACTCTTCTCGGGCATCTTGATTATATCCGCACTGTCC  530

Query  299   AGTTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGTATAT  358
             | || || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  531   AATTTCACCACGAAAACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGCATTT  590

Query  359   GGAACTGGCAATCAAGGACTTGTGTTTCTGTTTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGT  418
             |||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591   GGAACTGGCAGTCTAGGACTTGTATTTCCGTGTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGT  650

Query  419   GTGCTTCTTTCCATCCGAAA-GAAGATCTCGTCGTATCAGCTTCTTTAGATCAGACTGTC  477
             |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||  | ||||||||||||
Sbjct  651   GTGCTTCTTTCCATCC-AAAGGAAGATCTTGTTGTATCAGCATCACTGGATCAGACTGTC  709

Query  478   CGTGTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGACATCATG  537
             ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||
Sbjct  710   CGTGTTTGGGACATTGGTGCTCTTAAGAAGAAGTCAGCATCTCCTGCTGATGACCTCATG  769

Query  538   AGGTTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCTATAGTCAAGTACGTT  597
              | || | ||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| 
Sbjct  770   CGATTTAGTCAGATGAATTCTGATCTTTTTGGAGGGGTTGACGCTATAGTTAAGTACGTC  829

Query  598   CTTGAAGGTCATGACAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTCATT  657
             |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||
Sbjct  830   CTTGAAGGTCATGATAGAGGAGTCAACTGGGCTTCTTTTCATCCCACACTTCCTCTCATT  889

Query  658   GTCTCCGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCCGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGG  717
             ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890   GTCTCTGGTGCCGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGG  949

Query  718   GAGGTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAA  777
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  950   GAGGTGGATACATTGCGAGGTCATATGAATAACGTTTCATCCGTTATGTTCCATGCAAAA  1009

Query  778   CAGGACATAATTGTGTCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAG  837
             |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1010  CAGGACATTATCGTGTCAAACTCTGAGGATAAAAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAG  1069

Query  838   CGAACTGGACTTCAAACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCAC  897
             ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1070  CGAACTGGAATCCAAACTTTTCGTCGTGAGCATGACCGATTCTGGATTCTTGCAGTTCAC  1129

Query  898   CCTGAGATGAATCTACTAGCAGCAGGTCATGACAGCGGCATGATCGTGTTCAAACTTGAG  957
             |||||||| |||||||| |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||||
Sbjct  1130  CCTGAGATTAATCTACTTGCAGCAGGACATGACAATGGTATGATTGTTTTCAAACTTGAG  1189

Query  958   AGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGA-TT  1016
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||
Sbjct  1190  AGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGTGATTCGTTATTCTATGCCAAAGATAGATTT  1249

Query  1017  CTTGCGGTACTACGAATATTCAACTCAAAGAGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCC  1076
             | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1250  C-TGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAAAGATTCCCAAGTTATTCCTATACGGCGTCC  1308

Query  1077  TGGTACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCGACTGAAAATGC  1136
             |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct  1309  TGGTACCCCAAGCTTGAATCAAAGTCCGAGGACTTTATCCTACAGTCCGACAGAAAATGC  1368

Query  1137  AGTTTTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGA  1196
             ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1369  AGTCTTAATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTACGAGTTGTACATCATACCGAAAGA  1428

Query  1197  TAGTGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACCGGTGGCTCTGCAGT  1256
             ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||
Sbjct  1429  TAGCGTTGGCAGGAGTGATGTTGTACAAGATGCAAAGAGGGGGACAGGGGGTTCTGCGGT  1488

Query  1257  ATTCATTGCCCGTAACCGGTTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTCAA  1316
              |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct  1489  GTTCATTGCTCGAAATCGGTTTGCTGTTCTGGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGTTAGTGAA  1548

Query  1317  GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTT  1376
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1549  GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTTTACCTATTCCCACAGATGCTATCTT  1608

Query  1377  TTATGCCGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATATTTGACCT  1436
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1609  TTATGCTGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTGGTTATATTTGACCT  1668

Query  1437  CCAGCAAAGGCTTGTTCTTGGTGAACTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTC  1496
              || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1669  TCAACAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCGTTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTC  1728

Query  1497  TAGTGATATGGAGAGGGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATAATTATCGCGAGCAAAAA  1556
             ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct  1729  TAACGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATTGCGAGCAAAAA  1788

Query  1557  ACTTGTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGA  1616
             |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1789  ACTTGTCCTACAGTGCACGCTTCATGAGACAATACGTGTGAAAAGTGGAGCATGGGACGA  1848

Query  1617  TAACGGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGA  1676
              || ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1849  CAATGGTGTCTTCATTTACACTACTCTGAACCACATCAAGTACTGTCTGCCTAATGGAGA  1908

Query  1677  TAGTGGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCGATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATAC  1736
             ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1909  TAGTGGAATCATCAGAACCCTGGATGTCCCAATCTACATCACCAAGGTGTCTGGAAATAC  1968

Query  1737  AATCTTCTGCTTGGATCGGGATGGGAAAAACAAGGCTATCACCATCAATGCAACCGAGTA  1796
             |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct  1969  AATCTTTTGCTTGGACCGGGATGGGAAAAACAGGGCTATCACCATTAATGCAACCGAATA  2028

Query  1797  CATTTTCAAGCTTTCACTTCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA  1856
             ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2029  CATTTTCAAGCTTGCACTACTGAGAAAGAAATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA  2088

Query  1857  CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTATCTGCAGCAAAAAGGATTCCCTGAAGT  1916
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct  2089  CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATCGCTTATCTTCAGCAGAAAGGATTTCCTGAAGT  2148

Query  1917  TGCTCTCCATTTTGTTGAAGATGAAAGGATCCGATTCAACCTGGCTCTTGAAAGTGGCAA  1976
             ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2149  TGCCCTACACTTTGTTGAAGACGAGAGGATCCGATTCAACTTGGCTCTTGAAAGTGGCAA  2208

Query  1977  CATCAGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACT  2036
             ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2209  CATCAGTGTAGCTGTTGCATCCGCTACAGAGATTAATGAGAAAGACCACTGGTATAGACT  2268

Query  2037  TGGGGTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTAGAGTTTGCATACCAGCAGAC  2096
              || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct  2269  CGGAGTGGAAGCTCTTCGTCAAGGAAATTCTAGAATTGTTGAGTTTGCGTACCAGCAGAC  2328

Query  2097  AAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGTAATTTGGATAAGCTTTC  2156
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct  2329  AAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTATATCTCATTACTGGCAATTTAGACAAGCTGTC  2388

Query  2157  AAAGTTGATGAAGATTGCGGAAGTAAAGAACAACGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTCT  2216
             |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2389  AAAGTTGATGAAGATTGCAGAGGTGAAGAACAATGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCACT  2448

Query  2217  CTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCT  2276
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2449  CTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTAGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCT  2508

Query  2277  AGCTTATATTACGGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGA  2336
             ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct  2509  AGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAACTGACATTGCTGAGCGACTAGCAATTGA  2568

Query  2337  GCTAGGAGACAATGTGCCCTCCTTACCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACC  2396
             |||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2569  GCTAGGAGACAATGTGCCTTCATTGCCTGAAGGGAAGACTCCATCGCTTTTAATGCCACC  2628

Query  2397  GACACCCATCATGTGCGGTGGTGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGA  2456
             | | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2629  GTCTCCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTACTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGA  2688

Query  2457  AGGAGGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATG-AG--G-AG--GATGCTGA  2510
             ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||  | ||  |||| |||
Sbjct  2689  AGGAGGACTTGAGAGTGCAAACAGAGG-GG--CTGTTGATGAAGAAGAAGAAGATGTTGA  2745

Query  2511  AGGTGATTGGGGTGAGGAACTTGAC--A-TAAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGACAT  2567
             ||| || |||||||||| |||||||  | |  ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2746  AGGCGACTGGGGTGAGGGACTTGACAAATTCGATGTTGATGGAATGGAGAACACAGACAT  2805

Query  2568  CGAAGACATCTTGG-CGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGAT  2626
             ||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct  2806  CGAAGCCATATTGGATGG-TGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAGACGACGAGGAAGGTGGAT  2864

Query  2627  GGGGAGGTCTTGATGACTTGGAGCTCCCACCCGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTA  2686
             |||||   | |  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2865  GGGGA---C-T--TGACTTGGATCTTCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTA  2918

Query  2687  ATGCCCGTTCATC-AGTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATCTGG  2745
             | || |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2919  ACGCACGTTCATCTA-CTTTTGTGACACCTCCTCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATTTGG  2977

Query  2746  AGCCAGAAATCTTCTCTTGCTGCTGAGCAAGCTGCAGCGGGAAGCTTTGACACTGCAATG  2805
             || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct  2978  AGTCAGAAATCTTCCCTTGCTGCTGAGCAGGCTGCAGCAGGAAGCTTCGACACTGCAATG  3037

Query  2806  CGCCTGCTCCACAGACAGCTTGGTATAAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTT  2865
             ||  |||||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct  3038  CGTTTGCTCCACAGGCAGCTTGGCATTAAGAACTTTGCGCCTTTGAAATCGATGTTTCTT  3097

Query  2866  GATCTGTTCAATGGCAGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCA  2925
             |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3098  GATCTGTTCAGTGGGAGCCATAGCTATCTGCGTGCCTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCT  3157

Query  2926  CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTTCGTGGCCCACCAGCT  2985
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct  3158  CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGTGAGTCTTCCAGTCCTAACGTCCGTGGCCCGCCAGCT  3217

Query  2986  CTTGTTTATGATTTCTCTCAGCTAGACG-AGAAGCTTAAATCCGGCTACAAAGCCACAAC  3044
             ||||||| ||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct  3218  CTTGTTTTTGATTTCTCTCAGCTTGAAGCA-AAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAAC  3276

Query  3045  AAG-TGGGAAATTCA-CTGAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTCCACACCATCCC-  3101
              || ||||||| | | |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| 
Sbjct  3277  -AGCTGGGAAACT-ATCTGAGGCTCTTCGTGTCTTCCTCTCTATTCTCCAAACCATCCCA  3334

Query  3102  TCTAGTGGTAGTCGAGTCAAGAAGAGAAGTCGATGAGGTGAAGGAACTAATCGTTATCGT  3161
             | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || | || ||
Sbjct  3335  T-TGGTGGTAGTTGAGTCAAGAAGAGAAGTAGATGAGGTTAAGGAACTGGTCATCATTGT  3393

Query  3162  TAAAGAATATGTCCTTGGTCTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCC  3221
             ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3394  TAAAGAATATGTCCTCGGTCTTCAATTGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCC  3453

Query  3222  GGTGAGGCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTT  3281
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
Sbjct  3454  GGTGAGGCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTTCACTCACTGTAAACTTCAAACACCTCACCT  3513

Query  3282  ACGGCTTGCGCTGCTT-AGTGCAATGGGCGTCTGCTTCAAGGCAAAGAACCTCGCCACTG  3340
             |||||| ||| | ||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||| | || ||||
Sbjct  3514  ACGGCTCGCG-TACTTCAGTGCAATGACCGTCTGCTACAAGTCAAAGAACATGGCTACTG  3572

Query  3341  CTTCTAATTTTGCCAGAAGACTATTGGAAACAAGCCCAG-TG--GATAGCCAGGCCAAGA  3397
             || || | || ||||||||  | ||||| |||| ||||  |   || |||||||||| ||
Sbjct  3573  CTGCTCACTTCGCCAGAAGTTTGTTGGATACAAACCCAACTATTGAGAGCCAGGCCAGGA  3632

Query  3398  TGGCTAGAAAAGTTGTACAAGCCGCTGAAAGTAACATGACCGATGAAACCA-AGCTTAAC  3456
              ||||||| ||||| | ||||| |||||| | |||||||| |||| ||| | | || |||
Sbjct  3633  CGGCTAGACAAGTTATGCAAGCAGCTGAACGCAACATGACAGATGCAACAACA-CTCAAC  3691

Query  3457  TACGACTTCAGGAATCCATTTGTGGTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGA  3516
             |||||||| || || || |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||
Sbjct  3692  TACGACTTTAGAAACCCGTTTGTGATATGCGGGTCCACTTATGTGCCAATCTACAAAGGA  3751

Query  3517  CAGAAAGACGTCT-CATGTCCTTACTGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAA  3575
             ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct  3752  CAGAAAGACGT-TGCATGTCCTTACTGCACTGCCCGGTTTGTACCAAGCCAGGAAGGTAA  3810

Query  3576  CATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCAGTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTC  3635
             ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3811  CATTTGCTCGGTCTGTGATCTTGCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGCTTGCTATGCTC  3870

Query  3636  T-CCATCTCAAGTCCGGTGATCAA  3658
             | || ||||||||||||||| |||
Sbjct  3871  TGCC-TCTCAAGTCCGGTGAACAA  3893



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 196554082674


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5