BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg475145
Length=3798
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G61850.1 | Symbols: | phospholipases;galactolipases | chr1:... 5297 0.0
> AT1G61850.1 | Symbols: | phospholipases;galactolipases | chr1:22856188-22862225
FORWARD LENGTH=4065
Length=4065
Score = 5297 bits (2868), Expect = 0.0
Identities = 3033/3115 (97%), Gaps = 2/3115 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 685 GAAAACACTTCCTATTTTGGGGCATCTAGGCACAAGCTAAGTGCCTTCTCTCCCCTTATA 744
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 952 GAAAACACTTCCTATTTTGGGGCATCTAGGCACAAGCTCAGTGCCTTCTCTCCCCTTATA 1011
Query 745 TTCCGTTCTTCGTCTTGTCATCATCCTCTTCTAGCATCTACATTGGTGAAAATAATGCAA 804
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1012 TTCCGTTCGTCGTCTTGTCATCATCCTCTTCTAGCATCTACATTGGTGAAGATAATGCAA 1071
Query 805 GATGAAGGAAACCGTTCTGTTATTGGTAAAGATGAAAATGCGGTGAGGCAGCTTATAAGT 864
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 GATGAAGGAAATCGTTCTGTTATTGGTAAAGATGAAAATGCGGTGAGGCAGCTTATAAGT 1131
Query 865 ATGATAACTAGTGACAATCGCCACGTGGTTGAGCAAGCTTGTGTTGCTTTATCATCTCTC 924
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 ATGATAACTAGTGACAATCAACACGTGGTTGAGCAAGCTTGTGTTGCTTTATCATCTCTT 1191
Query 925 GCTCGAGATGTTGGCGTAGCAATGCAGCTGATGAAGTGTGATATTATGAAACCAACTGAA 984
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 1192 GCTCGAGATGTTGGCGTAGCAATGCAGCTGATGAAGTGTGATATAATGAAGCCGACTGAA 1251
Query 985 ACTGTTCTGAAATCTTCGGCCCCGGACGAAGTTATATCCGTTTTACAAGTCGTGGTCACC 1044
|| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 ACAGTTCTGAAATCTTCGTCCCCAGACGAAGTGATATCCGTTTTACAAGTCGTGGTCACC 1311
Query 1045 TTAGCTTTTGTATCTGATTCCGTTTCTCAGAAGATGCTCACCAAGGATATGCTGAAAGCC 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1312 TTAGCTTTTGTATCTGATTCCGTTTCTCAGAAGATGCTCACCAAGGATATGCTAAAAGCT 1371
Query 1105 TTAAAATCCTTGTGTGCCCATAAGAATCCTGAAGTTCAAAGACAAGCCTTATTAGCAGTT 1164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 TTAAAATCCTTGTGTGCCCATAAGAATCCTGAAGTTCAAAGACAAGCCTTATTAGCAGTT 1431
Query 1165 GGGAACTTGGCCTTCTGTTTAGAAAACCGTCGTATTCTGATTACTTCAGAGAGCTTGAGG 1224
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1432 GGGAACTTGGCCTTCTGTTTAGAAAATCGTCGTATTCTGATTACTTCAGAGAGTTTGAGA 1491
Query 1225 GAGTTATTGATGCGGTTAACTGTTACACCTGAACCACGAGTCAACAAAGCTGCGGCTAGA 1284
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1492 GAGTTATTGATGCGGTTAATTGTCACACCTGAACCACGAGTCAACAAAGCTGCGGCTCGA 1551
Query 1285 GCTTTGGCAATTCTTGGCGAAAATGAAATTCTGCGACGTTCCATAAAAGGCAGGCAAGTA 1344
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GCTTTGGCAATTCTTGGAGAAAATGAAATTCTGCGACGTTCCATAAAAGGCAGGCAAGTA 1611
Query 1345 CCAAAACAGGGACTGCGGATTCTCACCATGGATGGAGGTGGAATGAAAGGTCTTGCAACG 1404
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 CCAAAACAGGGACTGCGGATACTCACCATGGATGGAGGAGGAATGAAAGGTCTTGCAACG 1671
Query 1405 GTGCAGATTCTTAAGGAGATTGAGAAGGGAAGTGGCAAGCCTATACATGAACTATTCGAC 1464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1672 GTGCAGATTCTTAAGGAGATTGAGAAGGGAAGTGGCAAGCCTATTCATGAACTATTCGAC 1731
Query 1465 CTTATATGTGGCACATCAACAGGAGGAATGCTAGCTATTGCCCTTGGTGTCAAGCTTATG 1524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732 CTTATATGTGGCACATCAACAGGAGGAATGCTAGCTATTGCCCTTGGTGTCAAGCTTATG 1791
Query 1525 ACACTGGAACAATGTGAAGAAATTTACAAGAATCTAGGAAAGCTTGTTTTTGCTGAATCT 1584
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 ACATTGGAACAATGTGAAGAAATTTACAAGAATCTAGGAAAGCTTGTTTTTGCTGAATCT 1851
Query 1585 GTCCCAAAGGACAATGAAGCTGCAAGTTGGCGGGAAAAGTTGGATCAGCTATATAAAAGT 1644
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 GTCCCAAAGGACAATGAAGCTGCAAGCTGGCGGGAAAAGTTGGATCAGCTATATAAAAGT 1911
Query 1645 TCATCGCAAAGTTTCAGAGTTGTTATCCATGGATCTAAGCACAGTGCAAACGAGTTCGAG 1704
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1912 TCATCGCAAAGTTTTAGAGTTGTTATCCATGGATCTAAGCACAGTGCAAACGAGTTTGAG 1971
Query 1705 AGACTGTTAAAGGAAATGTGTGCTGATGAGGATGGAGATCTACTAATAGAATCAGCTGTG 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 AGACTGTTAAAGGAAATGTGTGCTGATGAGGATGGAGATTTACTAATAGAATCAGCTGTG 2031
Query 1765 AAGAATGTTCCAAAAGTCTTTGTTGTATCTACTCTTGTTAGTGTGATGCCTGCGCAACCA 1824
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 AAGAATGTTCCAAAAGTATTTGTTGTATCTACTCTTGTTAGTGTGATGCCTGCGCAACCA 2091
Query 1825 TTTATATTTCGGAACTACCAGTATCCTGTTGGAACACCGGAGATGTCATATGCATTTTCA 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 2092 TTTATATTTCGGAACTACCAGTATCCTGTTGGAACACCGGAAATGTCGTATGCATTTTCA 2151
Query 1885 GATCATTCAGGCGGCAGTACACTAACTTCATCAACTGCCAGTGATCAAGCTGGCTACTAC 1944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 GATCATTCAGGCGGCAGTACACTAACTTCATCAACTGCCAGTGATCAAGCTGGCTACTAC 2211
Query 1945 AAGCAAAGTGCTTTTATGGGAAGTTGTAAGCATCAGGTTTGGCAAGCGATACGAGCATCA 2004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 AAGCAAAGTGCTTTTATGGGAAGTTGTAAGCATCAGGTTTGGCAAGCGATACGAGCATCA 2271
Query 2005 TCAGCTGCTCCATATTATCTTGATGATTTTTCAGTTGGTACAAACTCATATCGCTGGCAA 2064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 TCAGCTGCTCCATATTATCTTGATGATTTTTCAGTTGGTACAAACTCATATCGCTGGCAA 2331
Query 2065 GATGGTGCAATAGTGGCAAACAATCCTACAATCTTTGCCATCAGAGAAGCACAACTTCTA 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 GATGGTGCAATAGTGGCAAACAATCCTACAATCTTTGCCATCAGAGAAGCACAACTTCTA 2391
Query 2125 TGGCCTGACACAAAAATTGATTGCTTGGTTTCGATTGGCTCTGGCTCTGTACCAACAAGG 2184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 TGGCCTGACACAAAAATTGATTGCTTGGTTTCGATTGGCTCTGGCTCTGTACCAACAAGG 2451
Query 2185 CCACGGAAAGGTGGATGGCGTTATTTAGATACTGGGCAAGTACTGATTGAGAGTGCATGC 2244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 GTACGGAAAGGTGGATGGCGTTATTTAGATACTGGGCAAGTACTGATTGAGAGTGCATGC 2511
Query 2245 TCAGTGGAACGGGTTGAAGAAGCTCTAAGCACATTGCTCCCTATGTTGCCAGAAATACAA 2304
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 TCAGTGGAACGTGTTGAAGAAGCTCTAAGCACATTGCTCCCTATGTTGCCAGAAATACAA 2571
Query 2305 TATTTTCGGTTCAACCCAGTTGATGATCGCTGCGGAATGGAGTTGGATGAGACTGATCCA 2364
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 TATTTTCGGTTCAACCCAGTTGACGATCGCTGTGGAATGGAGTTGGATGAGACTGATCCA 2631
Query 2365 GCGATCTGGCTAAAATTGGAAGCTGCGATTGAAGAATTCATACAAAGCAATTCCCAAGTA 2424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2632 GCGATCTGGCTAAAATTGGAAGCTGCGATTGAAGAATTCATACAAAGCAATCCCCAAGTA 2691
Query 2425 TTTAAAAACGCATGCGAGAGATTAACACTCCCCTTCCTAAACGATGAGAAATGGTGTGAG 2484
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 TTTAAAAACGTATGCGAGAGATTAACACTCCCCTTCCTAAACGATGAGAAATGGTGTGAT 2751
Query 2485 AATTTGAAACCAC-AGTTTATGAATGGAAAGCTACCAAATAGCAGAGTAGAGAGCAGTCC 2543
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2752 AATTTGAAACCACGA-TTTATGAATGGAAAGCTACCAAATAGCAGAGTAGAGAGCAGTCC 2810
Query 2544 TTCTCTAGGATGGAGACGCAATGTTTTGCTTATGGAGGCTCAGCATAGTCCTGACTCAGG 2603
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 TTCTCTTGGATGGAGACGCAATGTTTTGCTTATGGAGGCTCAGCATAGTCCTGACTCAGG 2870
Query 2604 GAGAGTAAAGTATCATGCTCGTGCGCTTGAGTCATTTTGTTCGAATAATGGAATAAAGTT 2663
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871 GAGAGTAAAGTATCATGCTCGTGCGCTCGAGTCATTTTGTTCGAATAATGGAATAAAGTT 2930
Query 2664 ATCCTCATTACATACTACTGCTACTCCTGGATGCCCGAAACCATCTCCAGGGACTGCTTT 2723
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2931 ATCCTCATTACATACTACTGCTACTCCTGGATGCCAAAAACCATCTCCAGGAACTGCTTT 2990
Query 2724 TCCCACTCCATTTACCTCTCCTCTTATATCTGGAAGCTTGCCTCCGAGCCCCCTTCTCTT 2783
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2991 TCCCACACCATTTACCTCTCCTCTTATAACTGGAAGCTTGCCTCCGAGCCCCCTTCTCTT 3050
Query 2784 CACTCCTGATCTTGGCCCACAAAAGTTCAATAGGATTGATATGGTTCCGCCACTTAGCTT 2843
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 CACTCCTGAGCTTGGCCCACAAAAGTTCAATAGGATTGATATGGTTCCGCCACTTAGCTT 3110
Query 2844 GGATGGGGGTCATGGTGGAAAGACGGTTATGTCGCCTCCATCATCTCCTCCACGACAAAG 2903
||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3111 GGATGGGGGACATGTTGGGAAGACGGTTATGTCGCCTCCATCATCTCCTCCGCGACAAAG 3170
Query 2904 ACAACTCTATCTTCCATTACGACAGATGCATGAAAAGTTACAGAATTTACCCCAAGTGGG 2963
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3171 ACAACTCTATCTTCCACTACGACAGATGCATGAAAAGTTACAGAATTTACCCCAAGTGGG 3230
Query 2964 GATCATACATCTCTCACTTCAAAATGATTCTAATGGTTCAATACTGAGTTGGCAAAACGA 3023
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3231 GATCTTACATCTCTCACTTCAAAATGATTCTAATGGTTCAATACTGAGTTGGCAAAATGA 3290
Query 3024 TGTATTTGTGGTTGCTGAACCTGGAGATCTCGCTGATAAGTTTCTCCAAAGCGTCAAAGT 3083
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TGTATTTGTGGTTGCTGAACCTGGAGATCTAGCTGATAAGTTTCTCCAAAGCGTCAAAGT 3350
Query 3084 CAGTATATTGTCAGTCATGCAAAGTAATCGCCGAAAGGCTGCATCAGTTCTTTCCAATAT 3143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3351 CAGTATATTGTCAGTCATGCAAAGTAATCGCCGAAAGGCTGCATCAGTTCTTTCCAATAT 3410
Query 3144 CTACTCAATCTCGGATTTGGTGCGTAGCAAGAAATGCTTCCAGGTTGGAAATATCATCCA 3203
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3411 CTGTTCAATCTCGGATTTGGTGCGTAGCAAGAAATGCTTCCAAGTTGGAAATATCATCCA 3470
Query 3204 CCGTTATATCGGACGCCAAACCCTAGTGATGGAAGATGATCAAGAAATCGCATCATTTAT 3263
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3471 CCGTTATATTGGACGCCAGACCCTAGTGATGGAAGATGATCAAGAAATTGCATCGTTTAT 3530
Query 3264 GTTCCGCAGAACTGTCCCTTCGGCACACTTGACTCCTGATGATATTCGCTGGATGGTAGG 3323
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 GTTCCGCAGAACTGTACCTTCGGCACACTTGACTCCTGATGATATTCGCTGGATGGTAGG 3590
Query 3324 AGCATGGAGAGATAGGATAATAGTCTTCTCAGGAACATTTGGACCAACACAAGCTGTCGT 3383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3591 AGCATGGAGAGATAGGATAATAGTCTTCTCAGGAACATTTGGACCAACACAAGCTGTAGT 3650
Query 3384 TAAAGCCTTTTTGGACTCTGGTGCAAAAGCTGTGATTGGTCCATCAAACGAGCCACTAGA 3443
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3651 TAAAGCCTTTTTGGACTCTGGTGCCAAAGCTGTGATTGGTCCATCAAACGAGCCACAAGA 3710
Query 3444 GACGCCACTAATCACATCCCAAGGCTCATCTGAATACAACATTGTAGATCAGAACGGAAA 3503
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 3711 GACACCACTAATCACATCCCAAGGCTCATCTGAGTACAACATTGGAGATCAGAACGGGAA 3770
Query 3504 GTTTGAGATTggagaagaagaagacgaagaagaagaagtgaacgaggaaatggaaaggga 3563
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 3771 GTTTGAGATTGGAGAAGAAGAAGACGAAGATGAAGAAGTAAACGAGGAAACGGAAAGGGA 3830
Query 3564 agagatggaaCCACCGACACCGACAAGTGACTGGGAAGATAGCGACCACGAGAAAACAAA 3623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3831 AGAGATGGAACCACCGACACCGACAAGTGACTGGGAAGATAGCGACCACGAGAAAACAAA 3890
Query 3624 CAGAGACGATAAGTGTTGTGGTCTTTGGGAAGATGATGAAGAAGAAGTGTCTGAGTTTGT 3683
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3891 CAGAGACGGTAAGTATTGTGGTCTTTGGGAAGATGATGAAGAAGAAGTGTCTGAATTTGT 3950
Query 3684 TTGCCAGTTATATGATCAGTTGTTCAGAGAGAATTCAAGAGTTGATGTTGCTCTTCAAAA 3743
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3951 TTGCCAGTTATATGATCAGTTGTTCAGAGAGAACTCAAGAGTTGATGTTGCTCTTCAAAA 4010
Query 3744 AGCTCTTGCCTCTCATCGAAAGCTCAGGTACACTTGTCATCTTCCTAATGTATAG 3798
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4011 AGCTCTTGCCTCTCATCGAAAGCTCAGGTACACTTGTCATCTTCCTAATGTATAG 4065
Score = 1031 bits (558), Expect = 0.0
Identities = 632/668 (95%), Gaps = 4/668 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCTTCGT-CGTGTTCTTCTCCATCCGCGGTGGAGGATCCGGAATTAGGGTTCCGTAT 59
|||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 130 ATGTCTTC-TACATGTTCTTCTCCATCCGCCGTGGAGGATCCTGAATTAGGGTTTCGGAT 188
Query 60 TGATTTAGATTGGACAGCAGGCGATTCGGAGGATCAGGTAGCGTTGCGATTGGAATCGCA 119
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 TGATTTAGATTGGACGGCAGGCGATTCGGAGGATCAGGTAGCGTTGCGATTGGAATCGCA 248
Query 120 GTTAATGGTGGCTTTACCTGCACCGCATGATACAGTGGTGGTTGAATTGAAGGGAATTGG 179
| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 GCTGATGGTGGCTTTGCCTGCACCGCATGATACAGTAGTGGTTGAATTGAAGGGAATTGG 308
Query 180 AGATGGCGATGAAGGT-GTTATAGAGAATGTTGGATTAGAGATGAGAGTTGAGAAACGTA 238
|||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 309 CGATGACGATGAAGGTGGTT-TAGAGAATGTTGGATTAGAGATGAGAGTTGAGAAACGGA 367
Query 239 GGGAGCCTTTGCGAGCAGTTACATTGATGAAAGCGGTTGGTTCTGGTCAGCAGTATGATG 298
| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 368 GAGAGCCGTTACGAGCAGTTACATTGATGAAAGCGGTTGGTTCCGGTCAGCAGTACGACG 427
Query 299 GTGTAGGCGTTTTGACTAGGCTAATGCGGTCTGATATGATGCCTGCAGCCATTCCTGCGC 358
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 GTGTCGGCGTTTTGACAAGGCTAATGCGGTCTGATATGATGCCTGCAGCCATTCCTGCGC 487
Query 359 CGGCTATCGATGTTGCGTCATCTTGTGGGGTGCATTGGAAGACTGTGACTTCGTTGAGTC 418
|||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 CGGCTATCGACGTTGCTTCTTCTTGTGGGGTGCATTGGAAGACTGTGACTTCGTTGAGTC 547
Query 419 TATCTGGTTGTGGTTTATTGGTAATGCCAGTTGAAGTGACTGAGTTACCTCTTCTTGAGA 478
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 548 TATCTGGTTGTGGTTTATTGGTAATGCCAGTTGAAGTGACTGAGTTACCTCTGCTTGAGA 607
Query 479 AGCTATGCCTTGAGCACAATAAATTGTCAGTTTTGCCACCTGAGATAGGGAAGCTGAAAA 538
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 608 AGCTATGCCTTGAGCACAATAAACTGTCAGTTTTGCCACCTGAGATAGGGAAGCTGAAGA 667
Query 539 ATCTTAAGATACTTAGAGTTGACAATAACATGCTTATTTCTGTGCCAGTGGAACTAAGAC 598
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 668 ACCTTAAGATACTTAGGGTTGACAATAACATGCTTATTTCTGTCCCAGTGGAACTAAGAC 727
Query 599 AGTGTGCGGGTCTTGTTGAATTGTCGTTGGAACACAATAAACTTGTCCGGCCTCTTCTTG 658
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 AGTGTGTAGGTCTTGTTGAATTGTCGTTGGAACACAATAAACTTGTCCGGCCTCTTCTTG 787
Query 659 ATTTCAGG 666
||||||||
Sbjct 788 ATTTCAGG 795
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189179542053
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5