BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg475147
Length=1911
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G61820.1 | Symbols: BGLU46 | beta glucosidase 46 | chr1:2283... 2532 0.0
AT1G61810.3 | Symbols: BGLU45 | beta-glucosidase 45 | chr1:2283... 1362 0.0
> AT1G61820.1 | Symbols: BGLU46 | beta glucosidase 46 | chr1:22835078-22838615
FORWARD LENGTH=2096
Length=2096
Score = 2532 bits (1371), Expect = 0.0
Identities = 1608/1720 (93%), Gaps = 25/1720 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 126 TATATTCAGTAGGTAGAAATTGGGGAA-TTTTAAAATAGTAGACAAGACTGCCCCCAAAA 184
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Sbjct 203 TATATTCAGTAGGTAGAAATTGGGGAATTTTTAAAA-AGTTGACAAGACTG-CCCCAAAA 260
Query 185 TCTCAATAATGCATTTAAAATATTCTG-AA-ATTTTCATATAAATATAGACACGTATAGA 242
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Sbjct 261 TCGCAATGATGCATTTAAAATATTCTGCAATTTTTTCATATAAATATAGACACGTATAGA 320
Query 243 TAAGAGCACACACCAAAACCACAGAAGACATACAC--G--AG-aaaaaaa--aaGATGAA 295
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Sbjct 321 TAAGAGTGCACA-CAAAACCACAGACGACATACACGAGAAAGAAAAAAAACCAAAATGAA 379
Query 296 AAGTTTTGCCAACTTTGCAATTCCGTTTTTATTACAAAGCTTATTGTTTCCTCTTTACAG 355
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Sbjct 380 AACTTTTGCCAACTTTGCAATTCTGTTTTTATTACAAAGCTTATTGTTTCCTCTTTACAG 439
Query 356 TTCATGTCTTCATCAAACTTCAGATGATTCATCTCTATTTCCTTCTGATTTCTTCTTTGG 415
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Sbjct 440 TTCATGCCTTCATCAAACTTCAGATGATTCATCTCCATTTCCTTCTGATTTCCTCTTTGG 499
Query 416 CACAGCTTCTTCTGCTTTCCAGTATGAAGGTGCCTTCTTAACCGATGGAAAAGGTCTGAA 475
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Sbjct 500 CACAGCTTCTTCTGCTTTCCAGTATGAAGGTGCCTTCTTAACCGATGGAAAAGGTCTGAA 559
Query 476 CAATTGGGATGTCTTTGCCCATGAAAACCCTGGGAAAATAGTTGATGGGAGCAATGGAGA 535
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Sbjct 560 CAATTGGGATGTCTTTGCCCATGAAAACCCTGGGAAAATAGTTGATGGAAGCAATGGAGA 619
Query 536 CATAGCCACGGATCAATATCATCGATATATGGAAGATATCCAATCAATGTCTTTTCTTGG 595
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Sbjct 620 CATAGCTACGGACCAATATCATCGATATATGGAAGATATCCAATCAATGAATTTTCTTGG 679
Query 596 AGTCAACAGTTACAGATTATCAATTTCTTGGTCTAGAGTCTTACCTAATGGAAGATTTGG 655
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Sbjct 680 AGTCAATAGTTACAGATTATCTATTTCCTGGTCTAGAGTCTTACCTAATGGAAGATTTGG 739
Query 656 AGGTATTAATTATAAGGGAATAAAGTATTACAACAATTTGATCGACGCTCTCATTAGAAA 715
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Sbjct 740 AGTTATTAATTATAAGGGAATAAAGTATTACAACAATTTGATCGACGCTCTTATTAAAAA 799
Query 716 AGGGATTACACCATTTGTGACGTTGAACCATTTCGACTATCCTCAAGAACTCGAGAACCG 775
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Sbjct 800 AGGGATTACACCATTTGTGACGTTGAACCACTTCGACTATCCTCAAGAACTCGAGAACCG 859
Query 776 GTTCAAAAGTTGGTTAAGCTCCGAGATGCAGAGTGATTTCGGGTACTTAGCTGATATATG 835
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Sbjct 860 GTTCAAGAGTTGGTTAAGCTCCGAGATGCAGAAAGATTTCGGGTACTTAGCTGATATATG 919
Query 836 TTTCAAACATTTTGGAGACCGAGTTAAACACTGGATCACGATTAACGAACCAAACCAACA 895
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Sbjct 920 TTTCAAACATTTTGGAGACCGAGTTAAACACTGGATCACGATTAACGAACCAAACCAACA 979
Query 896 AATAATCTTAGCCTACCGAAGTGGTTTATTTCCACCATCCCGGTGCTCCATGCCATACGG 955
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Sbjct 980 TATAAGCTTAGCATATCGAAGTGGTTTGTTTCCACCAGCGCGGTGCTCCATGCCATACGG 1039
Query 956 AAATTGTACTCAGGGGAACTCGGAAACTGAGCCGTTTATAGCCGCTCATAATATGATCCT 1015
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Sbjct 1040 AAATTGTACTCACGGGAACTCAGAAACTGAGCCTTTTATAGCCGCTCATAATATGATCCT 1099
Query 1016 CGCACATGCAAAGGCGATTCAAATATACCGAACCAAATATCAAAAAGAACAAAGGGGAAT 1075
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Sbjct 1100 CGCACATGCAAAGGCGATTCAAATATACCGAACCAAATATCAAAGAGAACAAAAGGGAAT 1159
Query 1076 CATTGGCATTGTGGTACAAACATCATGGTTTGAACCCATAAGCGATTCGATTG-TGGATA 1134
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Sbjct 1160 CATTGGCATTGTGGTACAAACATCATGGTTTGAACCCATAAGCGATTCGATTGCTG-ATA 1218
Query 1135 AAAATGCTGCCGAGAGAGCTCAATCATTTTATTCAAATTGGATTCTAGATCCCGTTGTAT 1194
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1219 AAAATGCTGCCGAGAGAGCTCAATCATTTTATTCAAATTGGATTCTAGATCCCGTTGTGT 1278
Query 1195 ATGGGAAGTATCCGGAAGAAATGGTAAATATACTTGGATCAGCTTTGCCAAGATTTTCGA 1254
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Sbjct 1279 ATGGGAAATATCCGGAAGAAATGGTGAATCTACTTGGATCAGCTTTGCCAAAATTTTCGA 1338
Query 1255 GTAATGAAATGAATAGCATAAAGAATTACAAATCAGACTTTTTGGGTATTAATCACTACA 1314
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Sbjct 1339 GCAATGAAATGAACAGCCTAATGAGCTATAAATCAGACTTTTTGGGTATTAATCACTATA 1398
Query 1315 CAAGTTACTTCATCCAAGATTGTTTGATCACTGCTTGTAATTCTGGATCTGGAGATGGAG 1374
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Sbjct 1399 CAAGTTACTTCATACAAGATTGTTTGATCACTGCTTGTAATTCTGGA---G-AC--GGAG 1452
Query 1375 CTTCTAAAAGCGAAGGATTCGCCCTCAAATTAGACCGGAAAGGCAATGTTTCAATCGGTG 1434
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Sbjct 1453 CTTCTAAAAGCGAAGGATTAGCCCTCAAATTGGACCGGAAAGGAAATGTTTCCATCGGAG 1512
Query 1435 AACTTACTGACGTCAATTGGCAGCATATTGATCCTAACGGTTTCAAGAA-GATGTTAAAT 1493
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Sbjct 1513 AACTGACCGACGTAAATTGGCAGCATATTGATCCTAACGGATTCA-GAAAGATGTTGAAT 1571
Query 1494 TACCTTAAAAATAGGTACCACAACATGCCAATGTTCATCACAGAAAATGGTTTCGGAAAC 1553
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Sbjct 1572 TACCTAAAAAATAGGTACCACAACATACCAATGTACATCACCGAAAATGGTTTCGGACAG 1631
Query 1554 TTGCAAAAACCCGAGACGACGGTTAAAGAACTTCTGGATGATACAAAAAGGATACAATAC 1613
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Sbjct 1632 TTGCAAAAACCAGAGACAACAGTTGAAGAACTTCTGCATGATACAAAAAGGATACAATAC 1691
Query 1614 ATGAGTGGATATTTGGATGCTTTGAAAGAAGCAATGAGGGATGGAGCAAATGTGAAGGGA 1673
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Sbjct 1692 TTGAGTGGATATTTGGATGCTTTGAAAGCAGCAATGAGGGATGGAGCAAATGTGAAGGGA 1751
Query 1674 TATTTCGCATGGTCACTATTAGATAATTTCGAATGGTTGTACGGATACAAGCTTCGATTT 1733
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Sbjct 1752 TATTTCGCATGGTCACTATTAGATAATTTTGAATGGTTGTACGGATACAAGGTTCGATTT 1811
Query 1734 GGTTTATTCCACGTTGATTATACAACTCTGAAAAGGACACCAAAGCAATCAGCTTCATGG 1793
|| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1812 GGGCTATTCCACGTTGATTTTACAACTTTGAAAAGGACACCAAAGCAATCAGCTACATGG 1871
Query 1794 TACAAGAACTTCATTGAACAGCACAGT-AATATAGGAGAT 1832
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Sbjct 1872 TACAAGAACTTCATTGAACAGAAC-GTGAATATAGAAGAT 1910
Score = 122 bits (66), Expect = 9e-27
Identities = 80/86 (93%), Gaps = 4/86 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAACGTACGAAATTAGATGGAGTTGTTATAGGCACACGTTCatatatt-aaattttaatg 59
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Sbjct 9 TAACGTACGAAATTAGATGGAGTTG-T-TAGGCACA-TTTCATATATTAAAATTTTAATG 65
Query 60 attttcttataaactttatgatattt 85
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Sbjct 66 ATTTTCTTTTAAACTTTATGATATTT 91
> AT1G61810.3 | Symbols: BGLU45 | beta-glucosidase 45 | chr1:22830015-22834728
FORWARD LENGTH=1696
Length=1696
Score = 1362 bits (737), Expect = 0.0
Identities = 1195/1411 (85%), Gaps = 52/1411 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 381 GATTCATCTCTATTTCCTTCTGATTTCTTCTTTGGCACAGCTTCTTCTGCTTTCCAGTAT 440
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Sbjct 120 GATTCATCTCCATTTCCTTCTGATTTCCTCTTTGGTACAGCTTCTTCCGCTTACCAGTAT 179
Query 441 GAAGGTGCCTTCTTAACCGATGGAAAAGGTCTGAACAATTGGGATGTCTTTGCCCATGAA 500
|||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||
Sbjct 180 GAAGGTGCGTTCTTGACTGATGGAAAAAGTTTGAACAATTGGGATGTCTTTACGCATAAA 239
Query 501 AACCCTGGGAAAATAGTTGATGGGAGCAATGGAGACATAGCCACGGATCAATATCATCGA 560
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Sbjct 240 AATCCTGGGAAAATACTTGACAAGAACAATGCAGATAGAGCTGTGGACCAATATAATCGA 299
Query 561 TATATGGAAGATATCCAATCAATGTCTTTTCTTGGAGTCAACAGTTACAGATTATCAATT 620
| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||
Sbjct 300 TTTTTGGAGGACATCCAATTAATGTCTTTTCTTGGAGTGAACAGTTATAGGTTTTCAATT 359
Query 621 TCTTGGTCTAGAGTCTTACCTA-ATGGAAGATTTGGAG-GTATTAATTATAAGGGAATAA 678
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Sbjct 360 TCTTGGTGTAGAATCTTACCTAGA-GGAAGATTTGGAGAG-ATTAATTATTTGGGGATAA 417
Query 679 AGTATTACAACA-ATTTGATCGACGCTCTCATTAGAAAAGGGATTACACCATTTGTGACG 737
|||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||
Sbjct 418 AGTATTACAACATATTT-ATCGATGCTCTCATTAGTAGAGGGATTAAACCATTTGTGACG 476
Query 738 TTGAACCATTTCGACTATCCTCAAGAACTCGAGAACCGG-TTCAAAAGTTGGTTAAGCTC 796
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Sbjct 477 TTGAACCATGTCGACTATCCTCAAGAACTCGAGGACCGGTTTC-AAAGTTGGTTAAACCC 535
Query 797 CGAGATGCAG-AGTG-ATTTCGGGTACTTAGCTGATATATGTTTCAAACATTTTGGAGAC 854
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Sbjct 536 CGAGATGCAGAAG-GAATTT-GGTTATTTAGCCGATATATGTTTCAAGCATTTTGGAAAC 593
Query 855 CGAGTTAAACACTGGATCACGATTAACGAACCAAACCAACAAATAATCTTAGCCTACCGA 914
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Sbjct 594 CGAGTTAAATACTGGACCACGCTTAACGAACCAAATCAACAATTAATCTTAGGCTATCTA 653
Query 915 AGTGGTTTATTTCCACCATCCCGGTGCTCCAT-GCCATACGGAAATTGTA-CTCAGGGGA 972
| ||| ||||||||| || || |||||| | ||||||||| || |||| | |||||||
Sbjct 654 ACAGGTAAATTTCCACCCTCTCGTTGCTCC-TCGCCATACGGGAACTGTAGC-CAGGGGA 711
Query 973 ACTCGGAAACTGAGCCGTTT-ATAGCCGCTCATAATATGATCCTCGCACATGCAAAGGCG 1031
| || ||||| || || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||
Sbjct 712 ATTCAGAAACCGAACC-TTTCATAGCCGCACATAACATGATCCTTGCACACGCAAAAGCG 770
Query 1032 ATTCAA-ATATACCGA-ACCAAATATCAAAAAGAACAAAGGGGAATCATTGGCATTGTGG 1089
|| || ||||| | | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 771 GTT-AACATATA-CAAGACCAAATATCAGAAAGAACAAAAGGGAAGCATTGGCATTGTGG 828
Query 1090 TACAAACATCATGGTTTGAACCCATAAGCGATTCGATTGTGGATAAA-AATGCTGCCGAG 1148
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Sbjct 829 TACAAACATCATGGTTTGAACCCATTAGTGATTCCAATGCGGATAAAGAA-GCTGCTGAG 887
Query 1149 AGAGCTCAATCATTTTATTCAAATTGGATTCTAGATCCCGTTGTATATGGGAAGTATCCG 1208
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 888 AGAGCTCAATCATTTTACTCTAATTGGATTCTAGATCCCGTTATATATGGGAAATATCCA 947
Query 1209 GAAGAAATGGTAAATATACTTGGATCAGCTTTGCCA-AGATTTTCGAGTAATGAAATGAA 1267
||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||
Sbjct 948 AAAGAAATGGTAGATATTCTTGGACCAGCCTTGCCACA-ATTTTCGAGCAATGAAGTGAA 1006
Query 1268 TAGCATAAAGAATTACAAAT-CAGACTTT--TTGGGTATTAATCACTACACAAGTTACTT 1324
| | || |||| | | | |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1007 GAACTTAGAGAAGT-CGAGGGCAGA-TTTCGTTGG-TATTAATCACTATACAAGTTACTT 1063
Query 1325 CATCCAAGATTGTTTGATCACTGCTTGTAATTCTGGATCTGGAGATGGAGCTTCTAAAAG 1384
||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||| ||| |
Sbjct 1064 CATTCAAGATTGTTTGACCTCTGCTTGTAATACTGGA-C---A--TGGAGCTTTTAAG-G 1116
Query 1385 C-GAAGGAT-TCGCCCTCAAATTAGACCGGAAAGGCAATGTTTCAATCGGTGAACTTACT 1442
| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||
Sbjct 1117 CCGAAGGATAT-GCTCTCAAGTTAGACCGGAAAGGCAATGTTACTATAGGAGAACTTACC 1175
Query 1443 GACGTCAATTGGCAGCATATTGATCCTA-ACGGTTTCAAGAAGATGTTAAATTACCTTAA 1501
|| || |||||||||||||||||||| | | || ||| | |||||| | ||||| ||||
Sbjct 1176 GATGTAAATTGGCAGCATATTGATCCCACA-GGATTCCACAAGATGCTGAATTAT-TTAA 1233
Query 1502 AA-ATAGGTACCACAA-CATGCCAATGTTCATCACAGAAAATGGTTTCGGAAACTTGCAA 1559
|| ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||
Sbjct 1234 AAGATAGGTACC-CAAACATGCCAATGTTCATAACTGAAAACGGTTTTGGAGACTTGCAA 1292
Query 1560 AAACCCGAGACGACGGTTAAAGAACTTCTGGATGATACAAAAAGGATACAATACATGAGT 1619
||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1293 AAACCTGAAACAACGGATAAAGAACTTCTAAATGATACAAAAAGGATCCAATACATGAGT 1352
Query 1620 GGATATTTGGATGCTTTGA-AAGAAGCAATGAGGGATGGAGCAAATGTGAAGGGATATTT 1678
||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1353 GGATACTTAGAAGCTTT-ACAAGCAGCAATGAGGGATGGAGCAAATGTGAAGGGTTATTT 1411
Query 1679 CGCATGGTCACTATTAGATAATTTCGAATGGTTGTACGGATACAAGCTTCGATTTGGTTT 1738
| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||| |
Sbjct 1412 TGTGTGGTCACTATTAGACAATTTTGAGTGGTTGTTCGGATACAAGGTTCGGTTTGGTCT 1471
Query 1739 ATTCCACGTTGAT-TATACAACTCTGAAAAG 1768
|||||| || ||| || |||||||| |||||
Sbjct 1472 ATTCCATGTGGATCTA-ACAACTCTTAAAAG 1501
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 94628027325
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5