BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg475328
Length=4144
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G59820.1 | Symbols: ALA3 | aminophospholipid ATPase 3 | chr1... 6636 0.0
> AT1G59820.1 | Symbols: ALA3 | aminophospholipid ATPase 3 | chr1:22011328-22020294
FORWARD LENGTH=4184
Length=4184
Score = 6636 bits (3593), Expect = 0.0
Identities = 4002/4190 (96%), Gaps = 65/4190 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 AAAATTTTCAAAAACATTTAATTTTAATTTTTATTTCAAGCCAAAGAAAAGAAGGGAGCG 61
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||
Sbjct 9 AAAATTTTCAAAAACATTTAATTTTAATTTTAATTTCAAGCC-----AAATTCGGGAGCG 63
Query 62 ACTTTCCAAAGACGAAC-AAGCCATTGAAACGGAAGAGAAAGCTGCTCCTTTGGTCCTCT 120
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 64 ACTTTCCAAAGACGAACAAAGCCATTGAAACGGAAGAGAAGGCTGCTCCTTTGGTCCTCT 123
Query 121 CTGTTTCTA-----GATTC-CA-C-C-G----TCG-ATTCAG-ATCTCTACCT-TGCCCA 164
||||||||| ||||| | | | | ||| | || | ||| | | | | |
Sbjct 124 CTGTTTCTACCGTCGATTCAGATCTCTGCCTCTCGCAATC-GAATCAATTTGTGTAACGA 182
Query 165 ATCGAATC-AA-T-TAG-GGTTACGAA-TCGACGCGAA-T-AATAGTGGTG-AAGAAGTC 216
||||| | || | ||| ||| | ||| |||| | || | || || ||| ||| | |
Sbjct 183 ATCGACGCGAATTATAGTGGTGAAGAAGTCGA--C-AATTCGATTGTTGTGTAAGTTGAC 239
Query 217 --GAGGATTGGATCGAG-GTGAATCCCTCTTAAATGGTTCGATCGGGTAGTTTTAGCGTT 273
||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GAGAGGATTGGATCG-GTGTGAATTCCTCCTAAATGGTTCGATCGGGTAGTTTTAGCGTC 298
Query 274 GATTCGTCCGCGACTCATCGTCGGACTCCGTCTCGAACGGTGACGTTGGGTCATATTCAA 333
||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 299 GATTCTTCGGCGACTCATCAACGGACTCCGTCTCGAACGGTTACGTTGGGTCATATTCAA 358
Query 334 CCTCAGGCTCCGACTTATCGTACCGTTTATTGTAATGATCGAGAGTCTAATCAACCCGTC 393
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 359 CCACAGGCTCCGACTTATCGTACCGTTTATTGTAATGATCGGGAATCTAATCAACCCGTC 418
Query 394 CGGTTCAAGGTACACCGGAATTCGATTTCTACAACAAAGTATAATGTTTTCACATTTCTG 453
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CGGTTCAAGG------GTAATTCGATTTCTACAACAAAGTATAATGTTTTCACATTTCTG 472
Query 454 CCCAAGGGTTTGTTTGAACAGTTTAGGCGCATAGCGAACATATACTTTCTTGGAATTTCG 513
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473 CCCAAGGGTCTGTTTGAACAGTTTAGGCGCATAGCGAACATATACTTTCTTGGAATTTCG 532
Query 514 TGTCTATCAATGACACCAATCAGTCCTGTGAGTCCAATAACAAATGTAGCTCCACTGTCA 573
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 TGTCTATCAATGACACCAATAAGTCCTGTGAGTCCAATAACAAATGTAGCTCCACTGTCA 592
Query 574 ATGGTGCTTCTTGTTTCTCTGATTAAAGAGGCTTTCGAAGACTGGAAACGGTTTCAAAAT 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGGTGCTTCTTGTTTCTCTGATTAAAGAGGCTTTCGAAGACTGGAAACGGTTTCAAAAT 652
Query 634 GATATGTCCATAAATAATAGCACAGTGGAGATCTTACAAGATCAACAGTGGGTATCTATT 693
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 GATATGTCCATAAATAATAGCACAGTGGAAATCTTACAAGATCAACAGTGGGTATCTATT 712
Query 694 CCCTGGAGAAAGTTGCAAGTTGGAGATATTGTCAAGATaaaaaaaGATGGATTTTTCCCG 753
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 CCGTGGAGAAAGTTGCAAGTTGGAGATATTGTCAAGATAAAAAAAGATGGATTTTTCCCA 772
Query 754 GCAGATATTCTTTTCCTGTCCAGCACTAATGCTGATGGTATCTGCTACGTTGAGACTGCA 813
||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 GCAGATATTCTTTTCATGTCCAGTACTAATTCTGATGGTATCTGCTACGTTGAGACTGCA 832
Query 814 AACCTAGATGGAGAAACAAATTTAAAAATAAGAAAGGCCCTTGAAAGAACATGGGATTAC 873
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 833 AACCTAGATGGAGAAACAAATTTGAAAATAAGAAAGGCACTTGAAAGGACATGGGATTAC 892
Query 874 TTGGTACCAGAGAAAGCTTATGAGTTTAAAGGTGAAATTCAGTGTGAGCAACCAAACAAT 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 TTGGTACCAGAGAAAGCTTATGAGTTTAAAGGTGAAATTCAGTGTGAGCAACCAAACAAT 952
Query 934 TCTCTGTACACTTTCACTGGGAACCTTATAGTCCAAAAGCAGACGTTACCTCTCTCTCCG 993
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 TCTCTGTACACTTTTACTGGGAACCTTGTAGTCCAAAAGCAGACGTTACCTCTCTCTCCG 1012
Query 994 GACCAGCTTTTATTGCGTGGATGCAGTCTTAGGAATACAGAATACATAGTTGGAGCTGTA 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 GACCAGCTTTTATTGCGTGGATGCAGTCTTAGGAACACAGAATACATAGTTGGAGCTGTA 1072
Query 1054 GTTTTTACTGGTCATGAGACGAAGGTGATGATGAATGCCATGAATGCTCCTTCCAAAAGA 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 GTTTTTACTGGTCATGAGACGAAGGTGATGATGAATGCCATGAATGCTCCTTCCAAAAGA 1132
Query 1114 AGTACGCTGGAAAAGAAGCTTGACAAACTCATTATTACAATCTTTTGTGTCCTTGTCACA 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1133 AGTACGCTGGAAAAGAAGCTTGACAAACTCATTATTACAATATTTTGTGTCCTTGTCACG 1192
Query 1174 ATGTGTCTGATTGGAGCTATAGGCTGTTCAATTGTGACGGATCGTGAGGACAAATACTTG 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 ATGTGTCTGATTGGAGCTATAGGCTGTTCAATTGTGACGGATCGTGAGGACAAATACTTG 1252
Query 1234 GGTCTTCATAAGTCAGATTGGGAATACCGTAATGGACTCATGATAGGGTTTTTCACCTTT 1293
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1253 GGTCTTCATAACTCAGATTGGGAATACCGCAATGGACTCATGATAGGATTTTTCACCTTT 1312
Query 1294 TTCACGCTAGTCACTCTGTTCTCATCAATTATACCAATCTCCCTTTATGTTTCTATTGAG 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TTCACGCTAGTCACTCTGTTCTCATCAATTATACCAATCTCCCTTTATGTTTCTATTGAG 1372
Query 1354 ATGATCAAGTTTATCCAGTCGACCCAGTTTATCAACCGAGATCTTAGTATGTATCATGCT 1413
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1373 ATGATCAAGTTTATCCAGTCGACCCAGTTTATCAACCGCGATCTTAATATGTATCATGCT 1432
Query 1414 GAAACAAATACCCCTGCCTCGGCCAGGACTTCTAATTTGAACGAGGAGCTTGGACAGGTG 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 GAAACAAATACCCCTGCCTCGGCCAGGACTTCTAATTTGAACGAGGAGCTTGGACAGGTG 1492
Query 1474 GAATACATATTTTCTGATAAAACCGGAACGCTGACGAGAAATTTGATGGAGTTCTTCAAA 1533
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 GAATACATATTTTCCGATAAAACCGGAACACTGACAAGAAATTTGATGGAGTTCTTCAAA 1552
Query 1534 TGTTCAATTGGAGGTATAAGTTATGGATGTGGTGTCACTGAAATAGAAAGAGGAATCGCT 1593
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1553 TGTTCAATTGGAGGTGTAAGTTATGGATGTGGTGTCACTGAAATAGAAAAAGGAATCGCT 1612
Query 1594 CAGCGTCATGGCTTAAAAGTTCAAGAGGAGCAAAGGTCGACTGGTGCAATAAGAGAAAAA 1653
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1613 CAGCGTCATGGCTTAAAAGTTCAAGAGGAGCAAAGGTCCACGGGTGCAATAAGAGAAAAA 1672
Query 1654 GGATTTAATTTTGATGATCCAAGGCTAATGCGGGGAGCTTGGAGAAACGAACCTAATCCT 1713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 GGATTTAATTTTGATGATCCAAGGCTAATGCGGGGAGCTTGGAGAAACGAACCTAATCCT 1732
Query 1714 GATCTTTGCAAGGAACTTTTTAGATGCCTGGCCATCTGTCACACTGTCCTTCCTGAAGGT 1773
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 GATCTTTGCAAGGAACTGTTTAGATGCCTGGCCATCTGTCACACTGTCCTTCCTGAAGGT 1792
Query 1774 GATGAGTCCCCTGAGAAGATTGTTTATCAAGCTGCATCTCCAGATGAAGCTGCCTTAGTT 1833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 GATGAGTCCCCTGAGAAGATTGTTTATCAAGCTGCATCTCCAGATGAAGCTGCCTTAGTT 1852
Query 1834 ACTGCTGCCAAGAATTTTGGATTCTTCTTTTATAGGCGTACTCCTACTATGGTGTATGTT 1893
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1853 ACTGCTGCCAAGAATTTTGGATTCTTCTTTTATAGGCGTACTCCAACTATGGTGTATGTT 1912
Query 1894 CGCGAGTCTCATGTGGAGAAGATGGGAAAGATTCAAGACGTGGCCTATGAGATCCTAAAT 1953
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CGCGAGTCTCATGTGGAGAAGATGGGAAAGATTCAAGACGTGGCCTATGAGATCCTAAAC 1972
Query 1954 GTTCTCGAGTTCAACAGTACTAGGAAGCGCCAGTCTGTTGTATGTCGTTTCCCTGATGGA 2013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1973 GTTCTCGAGTTCAACAGTACTAGGAAGCGCCAGTCTGTTGTATGTCGTTTCCCAGATGGA 2032
Query 2014 AGGCTTGTACTCTACTGTAAGGGCGCTGATAATGTTATCTTTGAGAGATTGGCTAATGGT 2073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 AGGCTTGTACTCTACTGTAAGGGCGCTGATAATGTTATCTTTGAGAGATTGGCTAATGGT 2092
Query 2074 ATGGACGATGTTAGGAAAGTAACAAGAGAACATTTGGAACATTTTGGGTCTTCTGGATTG 2133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 ATGGACGATGTTAGGAAAGTAACAAGAGAACATTTGGAACATTTTGGGTCTTCTGGATTG 2152
Query 2134 CGTACCCTTTGCCTAGCCTATAAAGATTTAAACCCTGAAACCTATGATAGTTGGAATGAA 2193
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 CGTACCCTTTGCCTAGCCTATAAAGATTTAAATCCTGAAACCTATGATAGTTGGAATGAA 2212
Query 2194 AAGTTCATCCAAGCCAAATCTGCATTACGAGACCGTGAGAAGAAGTTAGATGAGGTGGCA 2253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 AAGTTCATCCAAGCCAAATCTGCATTACGAGACCGTGAGAAGAAGTTAGATGAGGTGGCA 2272
Query 2254 GAACTTATCGAGAAGGATCTTATCCTCATCGGATCAACTGCAATAGAAGACAAACTTCAG 2313
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2273 GAACTCATCGAGAAGGATCTTATCCTCATCGGATCAACTGCGATAGAAGACAAACTTCAG 2332
Query 2314 GAAGGGGTCCCTACCTGCATAGAAACATTATCAAGAGCTGGAATTAAGATCTGGGTGTTA 2373
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 GAAGGGGTGCCTACCTGCATAGAAACATTATCAAGAGCTGGAATTAAGATCTGGGTGTTA 2392
Query 2374 ACAGGGGACAAAATGGAAACGGCTATTAATATTGCATATGCATGCAACTTGATCAACAAT 2433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 ACAGGGGACAAAATGGAAACGGCTATTAATATTGCATATGCATGCAACTTGATCAACAAT 2452
Query 2434 GAAATGAAACAATTTGTCATCAGTTCTGAAACGGATGCAATTAGAGAAGCTGAAGAAAGG 2493
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2453 GAAATGAAACAATTTGTCATTAGTTCTGAAACCGATGCAATCAGAGAAGCTGAAGAAAGG 2512
Query 2494 GGTGATCAAGTTGAGATTGCTCGTGTTATCAAAGAAGAAGTAAAGAGGGAGCTGAAAAAG 2553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 GGTGATCAAGTTGAGATTGCTCGTGTTATCAAAGAAGAAGTAAAGAGGGAGCTGAAAAAG 2572
Query 2554 AGCCTTGAAGAAGCTCAACACTCTCTGCATACAGTAGCTGGACCAAAATTGTCTCTCGTT 2613
|| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 AGTCTTGAGGAAGCTCAACACTCTTTGCATACCGTAGCTGGACCAAAATTGTCTCTCGTT 2632
Query 2614 ATTGATGGAAAGTGTTTAATGTATGCATTAGACCCGAGTTTACGTGTGATGCTGCTCAGC 2673
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2633 ATTGATGGCAAGTGTTTAATGTATGCATTAGACCCGAGTTTACGCGTGATGCTGCTCAGC 2692
Query 2674 TTGAGCTTGAACTGTACTTCAGTTGTATGCTGTCGTGTTTCTCCGTTACAGAAAGCACAG 2733
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 TTGAGCTTGAACTGTACTTCAGTTGTATGCTGTCGTGTATCTCCGTTACAGAAAGCACAG 2752
Query 2734 GTGACAAGTTTGGTGAGAAAAGGGGCACAAAAGATTACACTTAGTATTGGTGATGGGGCC 2793
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 GTGACAAGCTTGGTGAGAAAAGGGGCACAAAAGATTACTCTTAGTATTGGTGATGGGGCC 2812
Query 2794 AATGATGTTAGCATGATTCAAGCCGCTCATGTTGGTATAGGAATAAGTGGGATGGAGGGA 2853
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AATGATGTTAGCATGATTCAAGCTGCTCATGTTGGTATAGGAATAAGTGGGATGGAGGGA 2872
Query 2854 ATGCAAGCTGTGATGGCTAGTGATTTTGCCATTGCTCAGTTCAGATTTCTTACAGATTTG 2913
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 ATGCAAGCTGTGATGGCTAGTGATTTTGCCATTGCTCAGTTCAGATTTCTTACAGATTTA 2932
Query 2914 CTTCTTGTCCATGGACGGTGGTCATATCTTAGAATCTGCAAGGTTGTCATGTATTTCTTC 2973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 CTTCTTGTCCATGGACGGTGGTCATATCTTAGAATCTGCAAGGTTGTCATGTATTTCTTC 2992
Query 2974 TACAAGAATCTGACCTTCACTTTGACTCAGTTTTGGTTCACATTTCGAACTGGATTTTCT 3033
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 TACAAGAATCTTACCTTCACTTTGACTCAGTTTTGGTTCACATTTCGAACTGGATTTTCT 3052
Query 3034 GGGCAAAGGTTCTATGATGATTGGTTCCAGTCATTGTTTAATGTTGTATTTACAGCTCTT 3093
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053 GGGCAAAGGTTTTATGATGATTGGTTCCAGTCATTGTTTAATGTTGTATTTACAGCTCTT 3112
Query 3094 CCTGTCATTGTCCTTGGGCTGTTTGAGAAGGATGTGAGTGCATCCCTTTCGAAAAGATAT 3153
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 CCTGTCATCGTCCTTGGGCTGTTTGAGAAGGATGTGAGTGCATCCCTTTCGAAAAGATAT 3172
Query 3154 CCAGAACTGTATAGAGAGGGAATACGTAACTCATTTTTCAAATGGAGAGTTGTAGCAGTA 3213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 CCAGAACTGTATAGAGAGGGAATACGTAACTCATTTTTCAAATGGAGAGTTGTAGCAGTA 3232
Query 3214 TGGGCTTCTTCTGCTGTGTATCAGTCTCTTGTCTGCTATCTCTTCGTGACCACCTCATCT 3273
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 3233 TGGGCTACTTCTGCTGTGTATCAGTCTCTTGTCTGCTATCTCTTTGTGACAACCTCATCT 3292
Query 3274 TTCGGTGCTGTAAATTCATCAGGCAAAGTATTTGGTCTCTGGGATGTTAGCACAATGGTG 3333
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 TTCGGTGCTGTAAATTCATCAGGCAAAGTATTTGGCCTCTGGGATGTTAGCACAATGGTC 3352
Query 3334 TTCACATGTCTGGTGATTGCTGTTAATGTGCGCATTCTTTTGATGAGCAATTCCATTACC 3393
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3353 TTCACATGTCTGGTGATTGCTGTGAATGTGCGCATTCTTTTGATGAGCAATTCCATTACC 3412
Query 3394 AGATGGCATTATATCACAGTCGGTGGGAGTATTCTTGCATGGCTCGTTTTTGCTTTCATA 3453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3413 AGATGGCATTATATCACAGTCGGTGGGAGTATTCTTGCATGGCTCGTTTTTGCTTTCGTA 3472
Query 3454 TACTGCGGGATTATGACACCACATGATAGGAATGAAAATGTCTACTTTGTCATATATGTC 3513
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3473 TACTGCGGGATTATGACACCACATGATAGGAATGAAAATGTCTACTTTGTCATATATGTT 3532
Query 3514 CTGATGAGTACCTTCTATTTCTATTTCACATTGTTGCTTGTTCCCATTGTCTCTCTTCTA 3573
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3533 CTGATGAGTACATTCTATTTCTACTTCACATTGTTGCTTGTTCCCATTGTCTCTCTTCTA 3592
Query 3574 GGCGATTTCATCTTCCAAGGGGTGGAGAGATGGTTCTTCCCTTATGATTATCAGATCGTT 3633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3593 GGCGATTTCATCTTCCAAGGGGTGGAGAGATGGTTCTTCCCGTATGATTATCAGATCGTT 3652
Query 3634 CAAGAAATACATAGGCACGAGTCAGATGCAAGCAAGGCAGATCAGCTGGAGGTAGAGAAC 3693
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3653 CAAGAAATACATAGGCACGAGTCAGATGCAAGCAAGGCAGATCAGCTGGAGGTAGAGAAT 3712
Query 3694 GAGCTCACACCTCAAGAGGCGAGAAGCTATGCGATATCCCAGTTGCCTCGGGAGCTCTCA 3753
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 3713 GAGCTCACACCTCAAGAGGCGAGAAGCTATGCGATATCACAATTGCCTCGGGAGCTCTCA 3772
Query 3754 AAGCACACTGGGTTTGCGTTTGATTCACCAGGTTATGAATCCTTCTTTGCGTCTCAGTTA 3813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3773 AAGCACACTGGGTTTGCGTTTGATTCACCAGGTTATGAATCTTTCTTTGCGTCTCAGTTA 3832
Query 3814 GGTATTTACGCACCACAGAAGGCGTGGGATGTGGCAAGGAGAGCCAGTATGAGGTCACGG 3873
|| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3833 GGGATATACGCGCCACAGAAGGCGTGGGATGTGGCAAGGAGAGCCAGTATGAGATCACGG 3892
Query 3874 CCTAAGGTACCGAAGAAGTAAAGAACCGATATATAATATCTTATTGCTAATTGTCTTTGT 3933
|| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3893 CCAAAGGTACCGAAGAAGTAAAGATCCAATATATAACATATTATTGCTAATTGTCTTTGT 3952
Query 3934 ACATTTAGGCAATGT--T----TT------TT---GTTAGGGCCTTTAGTTTTAAAATAT 3978
||||||||||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3953 ACATTTAGGCAATGTCATCGGCTTGGGGGGTTTTTGTTAGGGCCTTTAGTTCTAAAATAT 4012
Query 3979 ATGTAGAAAATATACTTC-TT-AGGTGTTTTATGTTTGTGTTTTGCTTTAAATGCCATTT 4036
||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4013 ATGTAGAAAATATGCTTCATTTAGGTGTTTTATGTTTGTGTTTTGCTTTAAATGCCATTT 4072
Query 4037 TTCATAGCTCCATTATATGACTCATGTGGAGAGGCAAA-CATTAGGA-CCCAATACTTCT 4094
| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| |
Sbjct 4073 T-CATAGCTCCATT-TATGACTAATGTGGAGAGGCAAGGCGTTAGGAACCCAATACTTGT 4130
Query 4095 TCCCCATGTACATAAATTTGATTTTATTACACCTTTGAGGTCATTATTTC 4144
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 4131 TCCCCATGTACATAAAATTGATTTTATTACACCTTTGAGTTTATTATTTC 4180
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 206537304331
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5