BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg475624
Length=6108
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
ATCG01280.1 | Symbols: YCF2.2 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA ty... 3083 0.0
ATCG00860.1 | Symbols: YCF2.1 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA ty... 3083 0.0
AT3G32895.1 | Symbols: | transposable element gene | chr3:1343... 124 8e-27
AT5G66530.1 | Symbols: | Galactose mutarotase-like superfamily... 60.2 2e-07
> ATCG01280.1 | Symbols: YCF2.2 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA
type, core | chrC:145291-152175 REVERSE LENGTH=6885
Length=6885
Score = 3083 bits (1669), Expect = 0.0
Identities = 1679/1683 (99%), Gaps = 3/1683 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3165 GAGGAAAAAACGGAGTCTTTGCCTaaaaaaaTGCGTTGACAAAGGGCAGATGGATAGAAC 3224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3624 GAGGAAAAAACGGAGTCTTTGCCTAAAAAAATGCGTTGACAAAGGGCAGATGGATAGAAC 3683
Query 3225 CTTTCAACGAGATAATAGTGCTTTTTCAACTCTCTCAAAATGGAATCTATTCCAAACATA 3284
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3684 CTTTCAACGAG---ATAGTGCTTTTTCAACTCTCTCAAAATGGAATCTATTCCAAACATA 3740
Query 3285 TATGCCATGGTTCTTTACTTCGACAGGGTACAAATATCTAAATTTGATATTTTTAGATAC 3344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3741 TATGCCATGGTTCTTTACTTCGACAGGGTACAAATATCTAAATTTGATATTTTTAGATAC 3800
Query 3345 TTTTTCAGACCTATTGCGGATACTAAGTAGCAGTCAAAAATTTGTATCCATTTTTCATGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3801 TTTTTCAGACCTATTGCGGATACTAAGTAGCAGTCAAAAATTTGTATCCATTTTTCATGA 3860
Query 3405 TATTATGCATGGATTAGATATATCATGGCGAATTCTTCAGAAAAAATTGTGTCTTCCACA 3464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3861 TATTATGCATGGATTAGATATATCATGGCGAATTCTTCAGAAAAAATTGTGTCTTCCACA 3920
Query 3465 AAGGAATCTGATAAGTGAGATTTCGAGTAAGTCTTTACATAATCTTCTTCTGTCCGAAGA 3524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3921 AAGGAATCTGATAAGTGAGATTTCGAGTAAGTCTTTACATAATCTTCTTCTGTCCGAAGA 3980
Query 3525 AATGATTCATCGAAATAATGAGTCATCATTGATATCGACACATCTGAGATCGCCAAATGT 3584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3981 AATGATTCATCGAAATAATGAGTCATCATTGATATCGACACATCTGAGATCGCCAAATGT 4040
Query 3585 TCGTGAGGTCCTCTATTCAATCCTTTTCCTTCTTCTTGTTGCTGGATATATCGTTCGTAC 3644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4041 TCGTGAGGTCCTCTATTCAATCCTTTTCCTTCTTCTTGTTGCTGGATATATCGTTCGTAC 4100
Query 3645 ACATCTTCTCTTTGTTTCCCGAGCCTATAGTGAGTTACAGACAGAGTTCGAAAAGATCAA 3704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4101 ACATCTTCTCTTTGTTTCCCGAGCCTATAGTGAGTTACAGACAGAGTTCGAAAAGATCAA 4160
Query 3705 ATCTTTGATGATTCCATCATACATGATTGAGTTGCGAAAACTTCTGGATAGGTATCCTAC 3764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4161 ATCTTTGATGATTCCATCATACATGATTGAGTTGCGAAAACTTCTGGATAGGTATCCTAC 4220
Query 3765 ATCTGAACTGAATTCTTTCTGGTTAAAGAATCTTTTTCTAGTTGCTCTGGAACAATTAGG 3824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4221 ATCTGAACTGAATTCTTTCTGGTTAAAGAATCTTTTTCTAGTTGCTCTGGAACAATTAGG 4280
Query 3825 AGATTGTCTAGAAGAAATACGGGGTTCTGGCGGCAACATGCTATGGGGTGGTGATCCCGC 3884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4281 AGATTGTCTAGAAGAAATACGGGGTTCTGGCGGCAACATGCTATGGGGTGGTGATCCCGC 4340
Query 3885 TTATGGGGTCAAATCAATACGTTCTAAGAAGAAAGATTTGAAAATAAATTTCATCGATAT 3944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4341 TTATGGGGTCAAATCAATACGTTCTAAGAAGAAAGATTTGAAAATAAATTTCATCGATAT 4400
Query 3945 CATCGATCTCATAAGTATCATACCAAATCCCATCAATCGAATCACTTTTTCGAGAAATAC 4004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4401 CATCGATCTCATAAGTATCATACCAAATCCCATCAATCGAATCACTTTTTCGAGAAATAC 4460
Query 4005 GAGACATCTAAGTCATACAAGTAAAGAGATCTATTCATTGATAAGaaaaagaaaaaaCGT 4064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4461 GAGACATCTAAGTCATACAAGTAAAGAGATCTATTCATTGATAAGAAAAAGAAAAAACGT 4520
Query 4065 GAGCGGTGATTGGATTGATGATAAAATAGAATCCTGGGTCGCGAACAGTGATTCGATTGA 4124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4521 GAGCGGTGATTGGATTGATGATAAAATAGAATCCTGGGTCGCGAACAGTGATTCGATTGA 4580
Query 4125 TGATAAAGAAAGAGAATTCTTGGTTCAGTTCTCCACCTTAAGGGCAGAAAAAAGGATTGA 4184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4581 TGATAAAGAAAGAGAATTCTTGGTTCAGTTCTCCACCTTAAGGGCAGAAAAAAGGATTGA 4640
Query 4185 TCAAATTCTATTGAGTCTGACTCATAGTGATCATTTATCAAAGAATGACTCTGGTTATCA 4244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4641 TCAAATTCTATTGAGTCTGACTCATAGTGATCATTTATCAAAGAATGACTCTGGTTATCA 4700
Query 4245 AATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTA 4304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4701 AATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTA 4760
Query 4305 TCTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCA 4364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4761 TCTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCA 4820
Query 4365 TTATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTC 4424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4821 TTATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTC 4880
Query 4425 TCATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGAT 4484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4881 TCATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGAT 4940
Query 4485 AGGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGT 4544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4941 AGGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGT 5000
Query 4545 TCCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGtttttttAT 4604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5001 TCCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGTTTTTTTAT 5060
Query 4605 TGATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGA 4664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5061 TGATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGA 5120
Query 4665 ACTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTC 4724
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5121 ACTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTT 5180
Query 4725 GGAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTG 4784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5181 GGAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTG 5240
Query 4785 CATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCT 4844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5241 CATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCT 5300
Query 4845 CGG 4847
|||
Sbjct 5301 CGG 5303
Score = 2355 bits (1275), Expect = 0.0
Identities = 1316/1334 (99%), Gaps = 9/1334 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1685 AGAAATCTTTATTGGTTCTACCTCCTATTTTTTATGAAGAAAATGAATCTTTTTATCGAA 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988 AGAAATCTTTATTGGTTCTACCTCCTATTTTTTATGAAGAAAATGAATCTTTTTATCGAA 2047
Query 1745 GGATCAGAAAAAATTGGGTCCGGATCTCCTGCGGGAATTATTTGGAAGATCCAAAAAGAG 1804
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2048 GGCTCAGAAAAATTTGGGTCCGGATCTCCTGCGGGAATTATTTGGAAGATCAAAAAAGAG 2107
Query 1805 TGGTATTTGCTAGCAACAACATAATGGAGGCAGTCAATCAATATAGATTGATCCGAAATA 1864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108 TGGTATTTGCTAGCAACAACATAATGGAGGCAGTCAATCAATATAGATTGATCCGAAATA 2167
Query 1865 TGATTCAAATCCAATTCCAATATAGTCCCTATGGGTACATAAGAAATGTATTGAATCGAT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 TGATTCAAATCCAATTCCAATATAGTCCCTATGGGTACATAAGAAATGTATTGAATCGAT 2227
Query 1925 TCTTTTTAATGAAGAGACCTGATCGCAACTTCGAATATGGAATTCAAAGGGATATAATAG 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2228 TCTTTTTAATGAAGAGACCTGATCGCAACTTCGAATATGGAATTCAAAGGGATCTAATAG 2287
Query 1985 GAAATGATACTCTGAATCATAGAACTATAATGAAAGATACGATCAACCAACATTTATCGA 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288 GAAATGATACTCTGAATCATAGAACTATAATGAAAGATACGATCAACCAACATTTATCGA 2347
Query 2045 ATTTGAAAAAGAGTCAGAAGAAATGGTTCGATCCTCTTATTTTTCTTTCTCAAACCGAGA 2104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2348 ATTTGAAAAAGAGTCAGAAGAAATGGTTCGATCCTCTTATTTTTCTTTCTCAAACCGAGA 2407
Query 2105 GATCCATAAATCGGGATCCTAATGCATATAGATACAAATGGTCCAATGGGAGCAAGAATT 2164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2408 GATCCATAAATCGGGATCCTAATGCATATAGATACAAATGGTCCAATGGGAGCAAGAATT 2467
Query 2165 TCCAGGAGCATTTGGAACATTTCGTTTCTGAGCGGAAGAGCCGTTTTCAAGCAGTGTTCG 2224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2468 TCCAGGAGCATTTGGAACATTTCGTTTCTGAGCGGAAGAGCCGTTTTCAAGTAGTGTTCG 2527
Query 2225 ATCAATTATGTATTAATAAATATTTGATTGATTGGTCTGAGGTTATTGATAAAAAAGATT 2284
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2528 ATCAATTATGTATTAATCAATATTCGATTGATTGGTCTGAGGTTATTGATAAAAAAGATT 2587
Query 2285 TGTCTAAGTCActtcgtttctttttgtctaagttacttcgtttctttttgtccaagttac 2344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 TGTCTAAGTCACTTCGTTTCTTTTTGTCTAAGTTACTTCGTTTCTTTTTGTCCAAGTTAC 2647
Query 2345 ttctttttttGTCCAAGTTACTTCTCTTTTTGTCTAACTCACTTCCTTTTTTCTTTGTGA 2404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2648 TTCTTTTTTTGTCCAAGTTACTTCTCTTTTTGTCTAACTCACTTCCTTTTTTCTTTGTGA 2707
Query 2405 GTTTCGAGAATATCCCTATTCATAGGTCTGAGATCCACATCTATGAATTGAAAGGTCCGA 2464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2708 GTTTCGAGAATATCCCTATTCATAGGTCTGAGATCCACATCTATGAATTGAAAGGTCCGA 2767
Query 2465 ACGATCAACTCTGCAATCAGTTGTTAGAATCAATAGGTCTTCAAATCGTTCATTTGAAAA 2524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2768 ACGATCAACTCTGCAATCAGTTGTTAGAATCAATAGGTCTTCAAATCGTTCATTTGAAAA 2827
Query 2525 AGTTGAAACCCTTTTTATTGGATGATCATAATACTTCTCAAAAATCGAAATTCTTGATCA 2584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2828 AGTTGAAACCCTTTTTATTGGATGATCATAATACTTCTCAAAAATCGAAATTCTTGATCA 2887
Query 2585 ATGGAGGAACAATATCACCATTTTTGTTCAATAAAATACCAAAGTGGATGATTGACTCAT 2644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2888 ATGGAGGAACAATATCACCATTTTTGTTCAATAAAATACCAAAGTGGATGATTGACTCAT 2947
Query 2645 TCCATACTAGAAAGAATCGCAGGAAATCTTTTGATAACACGGATTC--C-TATTTCTCAA 2701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 2948 TCCATACTAGAAAGAATCGCAGGAAATCTTTTGATAACACGGATTCAGCCTATTTCTCAA 3007
Query 2702 TCGTATCCCACGATCAAGACAATTGGCTGAATCCCGTGAAACCATTTCAGAGAAGTTCAT 2761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3008 TCGTATCCCACGATCAAGACAATTGGCTGAATCCCGTGAAACCATTTCAGAGAAGTTCAT 3067
Query 2762 TGATATCTTCTTTTTCTAAAGCAAATCGACTTCGATTCTTGAATAATCCACATCACTTCT 2821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3068 TGATATCTTCTTTTTCTAAAGCAAATCGACTTCGATTCTTGAATAATCCACATCACTTCT 3127
Query 2822 GCTTCTATTGTAACAAAAGATTCCCTTTTTATGTGGAAAAGGCCCGTCTCAATAATTCTG 2881
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3128 GTTTCTATTGTAACAAAAGATTCCCTTTTTATGTGGAAAAGGCCCGTCTCAATAATTCTG 3187
Query 2882 ATTTTACGT--A--T--GGACAATTCCTCACTATCTTGTTCATTCACAACAAAATATTTT 2935
||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3188 ATTTTACGTTTACGTATGGACAATTCCTCACTATCTTGTTCATTCACAACAAAACATTTT 3247
Query 2936 CTTCGTGCGGTGGTaaaaaaaaaCATGCTTTTTTGGAGAGAGATACTATTTCACCTTCGT 2995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3248 CTTCGTGCGGTGGTAAAAAAAAACATGCTTTTTTGGAGAGAGATACTATTTCACCTTCGT 3307
Query 2996 CAATCGAGTCACAG 3009
||||||||||||||
Sbjct 3308 CAATCGAGTCACAG 3321
Score = 2085 bits (1129), Expect = 0.0
Identities = 1145/1153 (99%), Gaps = 0/1153 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAGGACATCAATTAAAATCCTGGATTTTCGAATTGAGAGAAATAGTGAGAGAGATC 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAGGACATCAATTCAAATCCTGGATTTTCGAATTGAGAGAAATAGTGAGAGAGATC 60
Query 61 AAGAATTCTCACTATTTCTTAGATTCATGGACCCAATTCAATTCAGTGGGATCTTTCATT 120
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAGAATGCTCACTATTTCTTAGATTCATGGACCCAATTCAATTCAGTGGGATCTTTCATT 120
Query 121 CATAtttttttCCACCAAGAACGTTTTAGAAAACTCTTGGACCCTCGAATTTTTAGTATC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 121 CATATTTTTTTCCACCAAGAACGTTTTAGAAAACTCTTGGACCCTCGGATTTTTAGTATC 180
Query 181 CTACTTTTGCGCAATTCACAGGGTTCAACAAGCAATCGATATTTCACGATCAAGGGTGTA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTACTTTTGCGCAATTCACAGGGTTCAACAAGCAATCGATATTTCACGATCAAGGGTGTA 240
Query 241 GTACTATTTGTAGTAGCGGCCCTTCTATATCGTATTAACAATCGAAATATGGTCGAAAGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTACTATTTGTAGTAGCGGCCCTTCTATATCGTATTAACAATCGAAATATGGTCGAAAGC 300
Query 301 AAAAATCTCTATTTGAAAGGGCTTCTTCCTATACCTATGAATTCCATTGGACCCAGAAAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AAAAATCTCTATTTGAAAGGGCTTCTTCCTATACCTATGAATTCCATTGGACCCAGAAAT 360
Query 361 GATACATCGGAAGAATCTTTTGGGTCTTGCAATATCAATAGGTTGATTGTTTCGCTCCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GATACATCGGAAGAATCTTTTGGGTCTTGCAATATCAATAGGTTGATTGTTTCGCTCCTG 420
Query 421 TATCTTACAAAAGGAAAAAAGATCTCTGAGAGCTGTTTCCGGGATCCGAAAGAGAGTACT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TATCTTACAAAAGGAAAAAAGATCTCTGAGAGCTGTTTCCGGGATCCGAAAGAGAGTACT 480
Query 481 TGGGTTCTCCCAATAACTCAAAAGTGTATCATGCCTGAATCTAACTGGAGTTCGCGGTGG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGGGTTCTCCCAATAACTCAAAAGTGTATCATGCCTGAATCTAACTGGAGTTCGCGGTGG 540
Query 541 TGGAGGAACTGGATCGGAAAAAAGAGGGATTTTTGTTGTAAGATATCTAATGAAACCGTC 600
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGGAGGAACTGGATCGGAAAAAAGAGGGGTTTTTGTTGTAAGATATCTAATGAAACCGTC 600
Query 601 GCTGGAATTGATATCTCATTTAAAGAGAAAGATATCAAATATCTGGAGTTTCTTTTTGTA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCTGGAATTGATATCTCATTTAAAGAGAAAGATATCAAATATCTGGAGTTTCTTTTTGTA 660
Query 661 TATTATATGGATGATCCGATCCGCAAGGGCCATGATTGGGAATTGTTTGATCGTCTTTCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TATTATATGGATGATCCGATCCGCAAGGGCCATGATTGGGAATTGTTTGATCGTCTTTCT 720
Query 721 CCGAGTAAGAGGCGAAACATAATCAACTTTAATTCGGGACAGCTATTCGAAATCTTAGTG 780
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CCGAGTAAGAGGCGAAACATAATCAACTTGAATTCGGGACAGCTATTCGAAATCTTAGTG 780
Query 781 AAAGACTGGATTTGTTATCTCATGTTTGCTTTTCGTGAAAAAATACCAATTGAAGTGGAG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AAAGACTGGATTTGTTATCTCATGTTTGCTTTTCGTGAAAAAATACCAATTGAAGTGGAG 840
Query 841 GGTTTCTTCAAACAACAAGGAGCTGGGTCAACTATTCAATCAAATGATATTGAGCATGTT 900
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGTTTCTGCAAACAACAAGGAGCTGGGTCAACTATTCAATCAAATGATATTGAGCATGTT 900
Query 901 TCCCATCTCTTCTCGAGAAACAAGTGGGCTATTTCTTTGCAAAATTGTGCTCAATTTCAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TCCCATCTCTTCTCGAGAAACAAGTGGGCTATTTCTTTGCAAAATTGTGCTCAATTTCAT 960
Query 961 ATGTGGCAATTCCACCAAGATCTCTTCGTTAGTTGGGGGAAGAATCCGCACGAATCGGAt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATGTGGCAATTCCACCAAGATCTCTTCGTTAGTTGGGGGAAGAATCCGCACGAATCGGAT 1020
Query 1021 ttttttAGGAAATTATCGAGAGAGAATTGGATTTGGTTAGACAATGTGTGGTTGGTAAAC 1080
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TTTTTTAGGAAAATATCGAGAGAGAATTGGATTTGGTTAGACAATGTGTGGTTGGTAAAC 1080
Query 1081 AAGGATAGATTTTTTAGCAAGGTACGAAACGTATCGTCAAATATTCAATATGATTCTACA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AAGGATAGATTTTTTAGCAAGGTACGAAACGTATCGTCAAATATTCAATATGATTCTACA 1140
Query 1141 AGATCTAGATTCG 1153
|||||||| ||||
Sbjct 1141 AGATCTAGTTTCG 1153
Score = 1615 bits (874), Expect = 0.0
Identities = 887/893 (99%), Gaps = 1/893 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5060 AGAAGAAATCATGTAACGAAGGGGATTCTTATTTGTACAAATGGTACTTCGAGCTTGGAA 5119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5801 AGAAGAAATCATGTAACGAAGGGGATTCTTATTTGTACAAATGGTACTTCGAGCTTGGAA 5860
Query 5120 CGAGCATGAAGACATTCACGATACTTCTTTATCTTTTGAGTTGTTCTTCCGGATCGGTCG 5179
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5861 CGAGCATGAAGAAATTCACGATACTTCTTTATCTTTTGAGTTGTTCTGCCGGATCGGTCG 5920
Query 5180 CTCAAGACCTTTGGTCTCTACCCGTACCCGATGaaaaaaaTAGGATCACTTCTTATGGAT 5239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5921 CTCAAGACCTTTGGTCTCTACCCGTACCCGATGAAAAAAATAGGATCACTTCTTATGGAT 5980
Query 5240 TCGTTGAGAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGCGCTTTGGTGG 5299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5981 TCGTTGAGAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGCGCTTTGGTGG 6040
Query 5300 GATCCTCACGGACAGAAAAAGATTGCAGTCAGTTTGATAATGATCGAGTGACATTGCTTT 5359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6041 GATCCTCACGGACAGAAAAAGATTGCAGTCAGTTTGATAATGATCGAGTGACATTGCTTT 6100
Query 5360 TTCGCTCCGAACCAAGGGATCCCTTATATATGATGCAAGATGGATCTTGTTCTATCGTTG 5419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6101 TTCGCTCCGAACCAAGGGATCCCTTATATATGATGCAAGATGGATCTTGTTCTATCGTTG 6160
Query 5420 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 5479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6161 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 6220
Query 5480 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 5539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6221 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 6280
Query 5540 TATGGCGCCCTCGGGGCTTTCTATTTGATTGTATCGAAAGGCCTAATGAATTGGGATTTC 5599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6281 TATGGCGCCCTCGGGGCTTTCTATTTGATTGTATCGAAAGGCCTAATGAATTGGGATTTC 6340
Query 5600 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 5659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6341 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 6400
Query 5660 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGTGGAACCATGCTGTACCAGAGACGAGATAGGT 5719
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6401 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGCGGAACCATGCAGTACCAGAGACGAGATAGGT 6460
Query 5720 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 5779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6461 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 6520
Query 5780 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 5839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6521 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 6580
Query 5840 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 5899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6581 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 6640
Query 5900 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATT-TTCATT 5951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 6641 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATTGTTGATT 6693
Score = 750 bits (406), Expect = 0.0
Identities = 411/413 (99%), Gaps = 1/413 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1148 GATTCGGAATATCACTATCACACATTGATCAATCAAAGAGAGA-TCAACAACTAAAAGAA 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1231 GATTCGGAATATCACTATCACACATTGATCAATCAAAGAGAGATTCAACAACTAAAAGAA 1290
Query 1207 AGATCGATTCTTTTGGATCCTTCCTTTATTCAAACGGAAGGAAGAGAGATAGAATCAGAC 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 AGATCGATTCTTTTGGATCCTTCCTTTATTCAAACGGAAGGAAGAGAGATAGAATCAGAC 1350
Query 1267 CGATTCCCTAAATACCTTTCTGGCTATTCCTCAATGCCCCGGCTATTCACGGAACGTGAG 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 CGATTCCCTAAATACCTTTCTGGCTATTCCTCAATGCCCCGGCTATTCACGGAACGTGAG 1410
Query 1327 AAGCGAATGAATAATCATCTGCTTCCGGAAGAAAGCGAAGAATTTCTTGGGAATCCTACA 1386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 AAGCGAATGAATAATCATCTGCTTCCGGAAGAAAGCGAAGAATTTCTTGGGAATCCTACA 1470
Query 1387 AGAGCCATTCGTTCTTTTTTCTCTGACAGATGGTCAGAACTTTATCTGGGTTCGAATCCT 1446
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1471 AGAGCCATTCGTTCTTTTTTCTCTGACAGATGGTCAGAACTTCATCTGGGTTCGAATCCT 1530
Query 1447 ACTGAGAGGTCCACTAGGGATCAGAAATTGTTGAAGAAAGAACAAGATGTTTCTTTTGTC 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 ACTGAGAGGTCCACTAGGGATCAGAAATTGTTGAAGAAAGAACAAGATGTTTCTTTTGTC 1590
Query 1507 CCTTCCAGGCGATCGGAAAATAAAGAAATAGTTAATATATTCAAGATAATTAC 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 CCTTCCAGGCGATCGGAAAATAAAGAAATAGTTAATATATTCAAGATAATTAC 1643
Score = 291 bits (157), Expect = 7e-77
Identities = 161/163 (99%), Gaps = 0/163 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5946 TTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGATCCGAGAGTTATCAGTATTTATC 6005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6723 TTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGATCCGAGAGTTATCAGTATTTATC 6782
Query 6006 AAATCTGTTCCTATCTAATGGAACGCTATTGGATCGAATGACAAAGACATTGTTGaaaaa 6065
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6783 AAATCTGTTCATATCTAACGGAACGCTATTGGATCGAATGACAAAGACATTGTTGAAAAA 6842
Query 6066 aaGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCATGTAA 6108
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6843 AAGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCATGTAA 6885
Score = 283 bits (153), Expect = 1e-74
Identities = 158/160 (99%), Gaps = 2/160 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3008 AGAGCTATTTACTCGATTGCAGACATTTCTGG-ACACCTCTAATAGAGGGACAAAGAGTC 3066
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3427 AGAGCTATTTACTCGATTGCAGACATTTCTGGAACACCTCTAATAGAGGGACAAAGAGTC 3486
Query 3067 AATTTTGAAAGAACGTATTGTCAAACTCTTTCAGATATG-ATCTATCCGATTCAGAAGAG 3125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3487 AATTTTGAAAGAACGTATTGTCAAACTCTTTCAGATATGAATCTATCCGATTCAGAAGAG 3546
Query 3126 AAGAGCTTGCATCAGTATCTCAATTTCAATTCAAACATGG 3165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3547 AAGAGCTTGCATCAGTATCTCAATTTCAATTCAAACATGG 3586
Score = 235 bits (127), Expect = 4e-60
Identities = 127/127 (100%), Gaps = 0/127 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4935 TGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTATCAATTAGTATTACACAGAAGAA 4994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5565 TGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTATCAATTAGTATTACACAGAAGAA 5624
Query 4995 ATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTTCATAGACAAACTTGGGATTTGCG 5054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5625 ATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTTCATAGACAAACTTGGGATTTGCG 5684
Query 5055 ATCCCAG 5061
|||||||
Sbjct 5685 ATCCCAG 5691
Score = 230 bits (124), Expect = 2e-58
Identities = 127/128 (99%), Gaps = 1/128 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1560 AAGAGAGA-TTCAAGAAATGGCAGATCTATTCACTCTATCAATAACCGAGCCGGATCTGG 1618
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 AAGAGAGATTTCAAGAAATGGCAGATCTATTCACTCTATCAATAACCGAGCCGGATCTGG 1891
Query 1619 TGTATCATAAGGGATTTGCCTTTTCTATTGATTCCTACGGATTGGATCAAAGACAATTCT 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 TGTATCATAAGGGATTTGCCTTTTCTATTGATTCCTACGGATTGGATCAAAGACAATTCT 1951
Query 1679 TGAAGGAG 1686
||||||||
Sbjct 1952 TGAAGGAG 1959
Score = 141 bits (76), Expect = 8e-32
Identities = 76/76 (100%), Gaps = 0/76 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4846 GGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTCACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTC 4905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5447 GGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTCACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTC 5506
Query 4906 ACTTGGAAAAGAAAAT 4921
||||||||||||||||
Sbjct 5507 ACTTGGAAAAGAAAAT 5522
> ATCG00860.1 | Symbols: YCF2.1 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA
type, core | chrC:86474-93358 FORWARD LENGTH=6885
Length=6885
Score = 3083 bits (1669), Expect = 0.0
Identities = 1679/1683 (99%), Gaps = 3/1683 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3165 GAGGAAAAAACGGAGTCTTTGCCTaaaaaaaTGCGTTGACAAAGGGCAGATGGATAGAAC 3224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3624 GAGGAAAAAACGGAGTCTTTGCCTAAAAAAATGCGTTGACAAAGGGCAGATGGATAGAAC 3683
Query 3225 CTTTCAACGAGATAATAGTGCTTTTTCAACTCTCTCAAAATGGAATCTATTCCAAACATA 3284
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3684 CTTTCAACGAG---ATAGTGCTTTTTCAACTCTCTCAAAATGGAATCTATTCCAAACATA 3740
Query 3285 TATGCCATGGTTCTTTACTTCGACAGGGTACAAATATCTAAATTTGATATTTTTAGATAC 3344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3741 TATGCCATGGTTCTTTACTTCGACAGGGTACAAATATCTAAATTTGATATTTTTAGATAC 3800
Query 3345 TTTTTCAGACCTATTGCGGATACTAAGTAGCAGTCAAAAATTTGTATCCATTTTTCATGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3801 TTTTTCAGACCTATTGCGGATACTAAGTAGCAGTCAAAAATTTGTATCCATTTTTCATGA 3860
Query 3405 TATTATGCATGGATTAGATATATCATGGCGAATTCTTCAGAAAAAATTGTGTCTTCCACA 3464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3861 TATTATGCATGGATTAGATATATCATGGCGAATTCTTCAGAAAAAATTGTGTCTTCCACA 3920
Query 3465 AAGGAATCTGATAAGTGAGATTTCGAGTAAGTCTTTACATAATCTTCTTCTGTCCGAAGA 3524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3921 AAGGAATCTGATAAGTGAGATTTCGAGTAAGTCTTTACATAATCTTCTTCTGTCCGAAGA 3980
Query 3525 AATGATTCATCGAAATAATGAGTCATCATTGATATCGACACATCTGAGATCGCCAAATGT 3584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3981 AATGATTCATCGAAATAATGAGTCATCATTGATATCGACACATCTGAGATCGCCAAATGT 4040
Query 3585 TCGTGAGGTCCTCTATTCAATCCTTTTCCTTCTTCTTGTTGCTGGATATATCGTTCGTAC 3644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4041 TCGTGAGGTCCTCTATTCAATCCTTTTCCTTCTTCTTGTTGCTGGATATATCGTTCGTAC 4100
Query 3645 ACATCTTCTCTTTGTTTCCCGAGCCTATAGTGAGTTACAGACAGAGTTCGAAAAGATCAA 3704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4101 ACATCTTCTCTTTGTTTCCCGAGCCTATAGTGAGTTACAGACAGAGTTCGAAAAGATCAA 4160
Query 3705 ATCTTTGATGATTCCATCATACATGATTGAGTTGCGAAAACTTCTGGATAGGTATCCTAC 3764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4161 ATCTTTGATGATTCCATCATACATGATTGAGTTGCGAAAACTTCTGGATAGGTATCCTAC 4220
Query 3765 ATCTGAACTGAATTCTTTCTGGTTAAAGAATCTTTTTCTAGTTGCTCTGGAACAATTAGG 3824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4221 ATCTGAACTGAATTCTTTCTGGTTAAAGAATCTTTTTCTAGTTGCTCTGGAACAATTAGG 4280
Query 3825 AGATTGTCTAGAAGAAATACGGGGTTCTGGCGGCAACATGCTATGGGGTGGTGATCCCGC 3884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4281 AGATTGTCTAGAAGAAATACGGGGTTCTGGCGGCAACATGCTATGGGGTGGTGATCCCGC 4340
Query 3885 TTATGGGGTCAAATCAATACGTTCTAAGAAGAAAGATTTGAAAATAAATTTCATCGATAT 3944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4341 TTATGGGGTCAAATCAATACGTTCTAAGAAGAAAGATTTGAAAATAAATTTCATCGATAT 4400
Query 3945 CATCGATCTCATAAGTATCATACCAAATCCCATCAATCGAATCACTTTTTCGAGAAATAC 4004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4401 CATCGATCTCATAAGTATCATACCAAATCCCATCAATCGAATCACTTTTTCGAGAAATAC 4460
Query 4005 GAGACATCTAAGTCATACAAGTAAAGAGATCTATTCATTGATAAGaaaaagaaaaaaCGT 4064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4461 GAGACATCTAAGTCATACAAGTAAAGAGATCTATTCATTGATAAGAAAAAGAAAAAACGT 4520
Query 4065 GAGCGGTGATTGGATTGATGATAAAATAGAATCCTGGGTCGCGAACAGTGATTCGATTGA 4124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4521 GAGCGGTGATTGGATTGATGATAAAATAGAATCCTGGGTCGCGAACAGTGATTCGATTGA 4580
Query 4125 TGATAAAGAAAGAGAATTCTTGGTTCAGTTCTCCACCTTAAGGGCAGAAAAAAGGATTGA 4184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4581 TGATAAAGAAAGAGAATTCTTGGTTCAGTTCTCCACCTTAAGGGCAGAAAAAAGGATTGA 4640
Query 4185 TCAAATTCTATTGAGTCTGACTCATAGTGATCATTTATCAAAGAATGACTCTGGTTATCA 4244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4641 TCAAATTCTATTGAGTCTGACTCATAGTGATCATTTATCAAAGAATGACTCTGGTTATCA 4700
Query 4245 AATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTA 4304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4701 AATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTA 4760
Query 4305 TCTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCA 4364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4761 TCTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCA 4820
Query 4365 TTATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTC 4424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4821 TTATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTC 4880
Query 4425 TCATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGAT 4484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4881 TCATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGAT 4940
Query 4485 AGGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGT 4544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4941 AGGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGT 5000
Query 4545 TCCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGtttttttAT 4604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5001 TCCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGTTTTTTTAT 5060
Query 4605 TGATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGA 4664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5061 TGATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGA 5120
Query 4665 ACTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTC 4724
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5121 ACTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTT 5180
Query 4725 GGAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTG 4784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5181 GGAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTG 5240
Query 4785 CATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCT 4844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5241 CATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCT 5300
Query 4845 CGG 4847
|||
Sbjct 5301 CGG 5303
Score = 2355 bits (1275), Expect = 0.0
Identities = 1316/1334 (99%), Gaps = 9/1334 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1685 AGAAATCTTTATTGGTTCTACCTCCTATTTTTTATGAAGAAAATGAATCTTTTTATCGAA 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988 AGAAATCTTTATTGGTTCTACCTCCTATTTTTTATGAAGAAAATGAATCTTTTTATCGAA 2047
Query 1745 GGATCAGAAAAAATTGGGTCCGGATCTCCTGCGGGAATTATTTGGAAGATCCAAAAAGAG 1804
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2048 GGCTCAGAAAAATTTGGGTCCGGATCTCCTGCGGGAATTATTTGGAAGATCAAAAAAGAG 2107
Query 1805 TGGTATTTGCTAGCAACAACATAATGGAGGCAGTCAATCAATATAGATTGATCCGAAATA 1864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108 TGGTATTTGCTAGCAACAACATAATGGAGGCAGTCAATCAATATAGATTGATCCGAAATA 2167
Query 1865 TGATTCAAATCCAATTCCAATATAGTCCCTATGGGTACATAAGAAATGTATTGAATCGAT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 TGATTCAAATCCAATTCCAATATAGTCCCTATGGGTACATAAGAAATGTATTGAATCGAT 2227
Query 1925 TCTTTTTAATGAAGAGACCTGATCGCAACTTCGAATATGGAATTCAAAGGGATATAATAG 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2228 TCTTTTTAATGAAGAGACCTGATCGCAACTTCGAATATGGAATTCAAAGGGATCTAATAG 2287
Query 1985 GAAATGATACTCTGAATCATAGAACTATAATGAAAGATACGATCAACCAACATTTATCGA 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288 GAAATGATACTCTGAATCATAGAACTATAATGAAAGATACGATCAACCAACATTTATCGA 2347
Query 2045 ATTTGAAAAAGAGTCAGAAGAAATGGTTCGATCCTCTTATTTTTCTTTCTCAAACCGAGA 2104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2348 ATTTGAAAAAGAGTCAGAAGAAATGGTTCGATCCTCTTATTTTTCTTTCTCAAACCGAGA 2407
Query 2105 GATCCATAAATCGGGATCCTAATGCATATAGATACAAATGGTCCAATGGGAGCAAGAATT 2164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2408 GATCCATAAATCGGGATCCTAATGCATATAGATACAAATGGTCCAATGGGAGCAAGAATT 2467
Query 2165 TCCAGGAGCATTTGGAACATTTCGTTTCTGAGCGGAAGAGCCGTTTTCAAGCAGTGTTCG 2224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2468 TCCAGGAGCATTTGGAACATTTCGTTTCTGAGCGGAAGAGCCGTTTTCAAGTAGTGTTCG 2527
Query 2225 ATCAATTATGTATTAATAAATATTTGATTGATTGGTCTGAGGTTATTGATAAAAAAGATT 2284
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2528 ATCAATTATGTATTAATCAATATTCGATTGATTGGTCTGAGGTTATTGATAAAAAAGATT 2587
Query 2285 TGTCTAAGTCActtcgtttctttttgtctaagttacttcgtttctttttgtccaagttac 2344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 TGTCTAAGTCACTTCGTTTCTTTTTGTCTAAGTTACTTCGTTTCTTTTTGTCCAAGTTAC 2647
Query 2345 ttctttttttGTCCAAGTTACTTCTCTTTTTGTCTAACTCACTTCCTTTTTTCTTTGTGA 2404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2648 TTCTTTTTTTGTCCAAGTTACTTCTCTTTTTGTCTAACTCACTTCCTTTTTTCTTTGTGA 2707
Query 2405 GTTTCGAGAATATCCCTATTCATAGGTCTGAGATCCACATCTATGAATTGAAAGGTCCGA 2464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2708 GTTTCGAGAATATCCCTATTCATAGGTCTGAGATCCACATCTATGAATTGAAAGGTCCGA 2767
Query 2465 ACGATCAACTCTGCAATCAGTTGTTAGAATCAATAGGTCTTCAAATCGTTCATTTGAAAA 2524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2768 ACGATCAACTCTGCAATCAGTTGTTAGAATCAATAGGTCTTCAAATCGTTCATTTGAAAA 2827
Query 2525 AGTTGAAACCCTTTTTATTGGATGATCATAATACTTCTCAAAAATCGAAATTCTTGATCA 2584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2828 AGTTGAAACCCTTTTTATTGGATGATCATAATACTTCTCAAAAATCGAAATTCTTGATCA 2887
Query 2585 ATGGAGGAACAATATCACCATTTTTGTTCAATAAAATACCAAAGTGGATGATTGACTCAT 2644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2888 ATGGAGGAACAATATCACCATTTTTGTTCAATAAAATACCAAAGTGGATGATTGACTCAT 2947
Query 2645 TCCATACTAGAAAGAATCGCAGGAAATCTTTTGATAACACGGATTC--C-TATTTCTCAA 2701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 2948 TCCATACTAGAAAGAATCGCAGGAAATCTTTTGATAACACGGATTCAGCCTATTTCTCAA 3007
Query 2702 TCGTATCCCACGATCAAGACAATTGGCTGAATCCCGTGAAACCATTTCAGAGAAGTTCAT 2761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3008 TCGTATCCCACGATCAAGACAATTGGCTGAATCCCGTGAAACCATTTCAGAGAAGTTCAT 3067
Query 2762 TGATATCTTCTTTTTCTAAAGCAAATCGACTTCGATTCTTGAATAATCCACATCACTTCT 2821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3068 TGATATCTTCTTTTTCTAAAGCAAATCGACTTCGATTCTTGAATAATCCACATCACTTCT 3127
Query 2822 GCTTCTATTGTAACAAAAGATTCCCTTTTTATGTGGAAAAGGCCCGTCTCAATAATTCTG 2881
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3128 GTTTCTATTGTAACAAAAGATTCCCTTTTTATGTGGAAAAGGCCCGTCTCAATAATTCTG 3187
Query 2882 ATTTTACGT--A--T--GGACAATTCCTCACTATCTTGTTCATTCACAACAAAATATTTT 2935
||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3188 ATTTTACGTTTACGTATGGACAATTCCTCACTATCTTGTTCATTCACAACAAAACATTTT 3247
Query 2936 CTTCGTGCGGTGGTaaaaaaaaaCATGCTTTTTTGGAGAGAGATACTATTTCACCTTCGT 2995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3248 CTTCGTGCGGTGGTAAAAAAAAACATGCTTTTTTGGAGAGAGATACTATTTCACCTTCGT 3307
Query 2996 CAATCGAGTCACAG 3009
||||||||||||||
Sbjct 3308 CAATCGAGTCACAG 3321
Score = 2085 bits (1129), Expect = 0.0
Identities = 1145/1153 (99%), Gaps = 0/1153 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAGGACATCAATTAAAATCCTGGATTTTCGAATTGAGAGAAATAGTGAGAGAGATC 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAGGACATCAATTCAAATCCTGGATTTTCGAATTGAGAGAAATAGTGAGAGAGATC 60
Query 61 AAGAATTCTCACTATTTCTTAGATTCATGGACCCAATTCAATTCAGTGGGATCTTTCATT 120
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAGAATGCTCACTATTTCTTAGATTCATGGACCCAATTCAATTCAGTGGGATCTTTCATT 120
Query 121 CATAtttttttCCACCAAGAACGTTTTAGAAAACTCTTGGACCCTCGAATTTTTAGTATC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 121 CATATTTTTTTCCACCAAGAACGTTTTAGAAAACTCTTGGACCCTCGGATTTTTAGTATC 180
Query 181 CTACTTTTGCGCAATTCACAGGGTTCAACAAGCAATCGATATTTCACGATCAAGGGTGTA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTACTTTTGCGCAATTCACAGGGTTCAACAAGCAATCGATATTTCACGATCAAGGGTGTA 240
Query 241 GTACTATTTGTAGTAGCGGCCCTTCTATATCGTATTAACAATCGAAATATGGTCGAAAGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTACTATTTGTAGTAGCGGCCCTTCTATATCGTATTAACAATCGAAATATGGTCGAAAGC 300
Query 301 AAAAATCTCTATTTGAAAGGGCTTCTTCCTATACCTATGAATTCCATTGGACCCAGAAAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AAAAATCTCTATTTGAAAGGGCTTCTTCCTATACCTATGAATTCCATTGGACCCAGAAAT 360
Query 361 GATACATCGGAAGAATCTTTTGGGTCTTGCAATATCAATAGGTTGATTGTTTCGCTCCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GATACATCGGAAGAATCTTTTGGGTCTTGCAATATCAATAGGTTGATTGTTTCGCTCCTG 420
Query 421 TATCTTACAAAAGGAAAAAAGATCTCTGAGAGCTGTTTCCGGGATCCGAAAGAGAGTACT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TATCTTACAAAAGGAAAAAAGATCTCTGAGAGCTGTTTCCGGGATCCGAAAGAGAGTACT 480
Query 481 TGGGTTCTCCCAATAACTCAAAAGTGTATCATGCCTGAATCTAACTGGAGTTCGCGGTGG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGGGTTCTCCCAATAACTCAAAAGTGTATCATGCCTGAATCTAACTGGAGTTCGCGGTGG 540
Query 541 TGGAGGAACTGGATCGGAAAAAAGAGGGATTTTTGTTGTAAGATATCTAATGAAACCGTC 600
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGGAGGAACTGGATCGGAAAAAAGAGGGGTTTTTGTTGTAAGATATCTAATGAAACCGTC 600
Query 601 GCTGGAATTGATATCTCATTTAAAGAGAAAGATATCAAATATCTGGAGTTTCTTTTTGTA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCTGGAATTGATATCTCATTTAAAGAGAAAGATATCAAATATCTGGAGTTTCTTTTTGTA 660
Query 661 TATTATATGGATGATCCGATCCGCAAGGGCCATGATTGGGAATTGTTTGATCGTCTTTCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TATTATATGGATGATCCGATCCGCAAGGGCCATGATTGGGAATTGTTTGATCGTCTTTCT 720
Query 721 CCGAGTAAGAGGCGAAACATAATCAACTTTAATTCGGGACAGCTATTCGAAATCTTAGTG 780
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CCGAGTAAGAGGCGAAACATAATCAACTTGAATTCGGGACAGCTATTCGAAATCTTAGTG 780
Query 781 AAAGACTGGATTTGTTATCTCATGTTTGCTTTTCGTGAAAAAATACCAATTGAAGTGGAG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AAAGACTGGATTTGTTATCTCATGTTTGCTTTTCGTGAAAAAATACCAATTGAAGTGGAG 840
Query 841 GGTTTCTTCAAACAACAAGGAGCTGGGTCAACTATTCAATCAAATGATATTGAGCATGTT 900
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGTTTCTGCAAACAACAAGGAGCTGGGTCAACTATTCAATCAAATGATATTGAGCATGTT 900
Query 901 TCCCATCTCTTCTCGAGAAACAAGTGGGCTATTTCTTTGCAAAATTGTGCTCAATTTCAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TCCCATCTCTTCTCGAGAAACAAGTGGGCTATTTCTTTGCAAAATTGTGCTCAATTTCAT 960
Query 961 ATGTGGCAATTCCACCAAGATCTCTTCGTTAGTTGGGGGAAGAATCCGCACGAATCGGAt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATGTGGCAATTCCACCAAGATCTCTTCGTTAGTTGGGGGAAGAATCCGCACGAATCGGAT 1020
Query 1021 ttttttAGGAAATTATCGAGAGAGAATTGGATTTGGTTAGACAATGTGTGGTTGGTAAAC 1080
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TTTTTTAGGAAAATATCGAGAGAGAATTGGATTTGGTTAGACAATGTGTGGTTGGTAAAC 1080
Query 1081 AAGGATAGATTTTTTAGCAAGGTACGAAACGTATCGTCAAATATTCAATATGATTCTACA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AAGGATAGATTTTTTAGCAAGGTACGAAACGTATCGTCAAATATTCAATATGATTCTACA 1140
Query 1141 AGATCTAGATTCG 1153
|||||||| ||||
Sbjct 1141 AGATCTAGTTTCG 1153
Score = 1615 bits (874), Expect = 0.0
Identities = 887/893 (99%), Gaps = 1/893 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5060 AGAAGAAATCATGTAACGAAGGGGATTCTTATTTGTACAAATGGTACTTCGAGCTTGGAA 5119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5801 AGAAGAAATCATGTAACGAAGGGGATTCTTATTTGTACAAATGGTACTTCGAGCTTGGAA 5860
Query 5120 CGAGCATGAAGACATTCACGATACTTCTTTATCTTTTGAGTTGTTCTTCCGGATCGGTCG 5179
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5861 CGAGCATGAAGAAATTCACGATACTTCTTTATCTTTTGAGTTGTTCTGCCGGATCGGTCG 5920
Query 5180 CTCAAGACCTTTGGTCTCTACCCGTACCCGATGaaaaaaaTAGGATCACTTCTTATGGAT 5239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5921 CTCAAGACCTTTGGTCTCTACCCGTACCCGATGAAAAAAATAGGATCACTTCTTATGGAT 5980
Query 5240 TCGTTGAGAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGCGCTTTGGTGG 5299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5981 TCGTTGAGAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGCGCTTTGGTGG 6040
Query 5300 GATCCTCACGGACAGAAAAAGATTGCAGTCAGTTTGATAATGATCGAGTGACATTGCTTT 5359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6041 GATCCTCACGGACAGAAAAAGATTGCAGTCAGTTTGATAATGATCGAGTGACATTGCTTT 6100
Query 5360 TTCGCTCCGAACCAAGGGATCCCTTATATATGATGCAAGATGGATCTTGTTCTATCGTTG 5419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6101 TTCGCTCCGAACCAAGGGATCCCTTATATATGATGCAAGATGGATCTTGTTCTATCGTTG 6160
Query 5420 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 5479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6161 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 6220
Query 5480 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 5539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6221 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 6280
Query 5540 TATGGCGCCCTCGGGGCTTTCTATTTGATTGTATCGAAAGGCCTAATGAATTGGGATTTC 5599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6281 TATGGCGCCCTCGGGGCTTTCTATTTGATTGTATCGAAAGGCCTAATGAATTGGGATTTC 6340
Query 5600 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 5659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6341 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 6400
Query 5660 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGTGGAACCATGCTGTACCAGAGACGAGATAGGT 5719
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6401 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGCGGAACCATGCAGTACCAGAGACGAGATAGGT 6460
Query 5720 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 5779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6461 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 6520
Query 5780 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 5839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6521 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 6580
Query 5840 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 5899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6581 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 6640
Query 5900 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATT-TTCATT 5951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 6641 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATTGTTGATT 6693
Score = 750 bits (406), Expect = 0.0
Identities = 411/413 (99%), Gaps = 1/413 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1148 GATTCGGAATATCACTATCACACATTGATCAATCAAAGAGAGA-TCAACAACTAAAAGAA 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1231 GATTCGGAATATCACTATCACACATTGATCAATCAAAGAGAGATTCAACAACTAAAAGAA 1290
Query 1207 AGATCGATTCTTTTGGATCCTTCCTTTATTCAAACGGAAGGAAGAGAGATAGAATCAGAC 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 AGATCGATTCTTTTGGATCCTTCCTTTATTCAAACGGAAGGAAGAGAGATAGAATCAGAC 1350
Query 1267 CGATTCCCTAAATACCTTTCTGGCTATTCCTCAATGCCCCGGCTATTCACGGAACGTGAG 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 CGATTCCCTAAATACCTTTCTGGCTATTCCTCAATGCCCCGGCTATTCACGGAACGTGAG 1410
Query 1327 AAGCGAATGAATAATCATCTGCTTCCGGAAGAAAGCGAAGAATTTCTTGGGAATCCTACA 1386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 AAGCGAATGAATAATCATCTGCTTCCGGAAGAAAGCGAAGAATTTCTTGGGAATCCTACA 1470
Query 1387 AGAGCCATTCGTTCTTTTTTCTCTGACAGATGGTCAGAACTTTATCTGGGTTCGAATCCT 1446
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1471 AGAGCCATTCGTTCTTTTTTCTCTGACAGATGGTCAGAACTTCATCTGGGTTCGAATCCT 1530
Query 1447 ACTGAGAGGTCCACTAGGGATCAGAAATTGTTGAAGAAAGAACAAGATGTTTCTTTTGTC 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 ACTGAGAGGTCCACTAGGGATCAGAAATTGTTGAAGAAAGAACAAGATGTTTCTTTTGTC 1590
Query 1507 CCTTCCAGGCGATCGGAAAATAAAGAAATAGTTAATATATTCAAGATAATTAC 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 CCTTCCAGGCGATCGGAAAATAAAGAAATAGTTAATATATTCAAGATAATTAC 1643
Score = 291 bits (157), Expect = 7e-77
Identities = 161/163 (99%), Gaps = 0/163 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5946 TTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGATCCGAGAGTTATCAGTATTTATC 6005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6723 TTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGATCCGAGAGTTATCAGTATTTATC 6782
Query 6006 AAATCTGTTCCTATCTAATGGAACGCTATTGGATCGAATGACAAAGACATTGTTGaaaaa 6065
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6783 AAATCTGTTCATATCTAACGGAACGCTATTGGATCGAATGACAAAGACATTGTTGAAAAA 6842
Query 6066 aaGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCATGTAA 6108
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6843 AAGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCATGTAA 6885
Score = 283 bits (153), Expect = 1e-74
Identities = 158/160 (99%), Gaps = 2/160 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3008 AGAGCTATTTACTCGATTGCAGACATTTCTGG-ACACCTCTAATAGAGGGACAAAGAGTC 3066
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3427 AGAGCTATTTACTCGATTGCAGACATTTCTGGAACACCTCTAATAGAGGGACAAAGAGTC 3486
Query 3067 AATTTTGAAAGAACGTATTGTCAAACTCTTTCAGATATG-ATCTATCCGATTCAGAAGAG 3125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3487 AATTTTGAAAGAACGTATTGTCAAACTCTTTCAGATATGAATCTATCCGATTCAGAAGAG 3546
Query 3126 AAGAGCTTGCATCAGTATCTCAATTTCAATTCAAACATGG 3165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3547 AAGAGCTTGCATCAGTATCTCAATTTCAATTCAAACATGG 3586
Score = 235 bits (127), Expect = 4e-60
Identities = 127/127 (100%), Gaps = 0/127 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4935 TGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTATCAATTAGTATTACACAGAAGAA 4994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5565 TGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTATCAATTAGTATTACACAGAAGAA 5624
Query 4995 ATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTTCATAGACAAACTTGGGATTTGCG 5054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5625 ATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTTCATAGACAAACTTGGGATTTGCG 5684
Query 5055 ATCCCAG 5061
|||||||
Sbjct 5685 ATCCCAG 5691
Score = 230 bits (124), Expect = 2e-58
Identities = 127/128 (99%), Gaps = 1/128 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1560 AAGAGAGA-TTCAAGAAATGGCAGATCTATTCACTCTATCAATAACCGAGCCGGATCTGG 1618
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 AAGAGAGATTTCAAGAAATGGCAGATCTATTCACTCTATCAATAACCGAGCCGGATCTGG 1891
Query 1619 TGTATCATAAGGGATTTGCCTTTTCTATTGATTCCTACGGATTGGATCAAAGACAATTCT 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 TGTATCATAAGGGATTTGCCTTTTCTATTGATTCCTACGGATTGGATCAAAGACAATTCT 1951
Query 1679 TGAAGGAG 1686
||||||||
Sbjct 1952 TGAAGGAG 1959
Score = 141 bits (76), Expect = 8e-32
Identities = 76/76 (100%), Gaps = 0/76 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4846 GGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTCACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTC 4905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5447 GGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTCACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTC 5506
Query 4906 ACTTGGAAAAGAAAAT 4921
||||||||||||||||
Sbjct 5507 ACTTGGAAAAGAAAAT 5522
> AT3G32895.1 | Symbols: | transposable element gene | chr3:13431016-13435542
FORWARD LENGTH=4527
Length=4527
Score = 124 bits (67), Expect = 8e-27
Identities = 86/95 (91%), Gaps = 1/95 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 946 TGTGCTCAATTTCATATGTGGCAATTCCACCAAGATCTCTTCGTTAGTTGGGGGAAGAAT 1005
||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3093 TGT-CTGAATTTCATATGTGGCAATTCCACCAAGATATCTTCGTTAGTTGGGGCAAGAAT 3035
Query 1006 CCGCACGAATCGGAtttttttAGGAAATTATCGAG 1040
|||||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||
Sbjct 3034 CCGCACTAATCAGATTTTTTTGGGAAAATATTGAG 3000
> AT5G66530.1 | Symbols: | Galactose mutarotase-like superfamily
protein | chr5:26553744-26555691 REVERSE LENGTH=1117
Length=1117
Score = 60.2 bits (32), Expect = 2e-07
Identities = 32/32 (100%), Gaps = 0/32 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3595 CTCTATTCAATCCTTTTCCTTCTTCTTGTTGC 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 CTCTATTCAATCCTTTTCCTTCTTCTTGTTGC 39
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 304810713280
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5