BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg475840
Length=2689
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G67420.2 | Symbols: | Zn-dependent exopeptidases superfamil... 4368 0.0
> AT1G67420.2 | Symbols: | Zn-dependent exopeptidases superfamily
protein | chr1:25255232-25260430 FORWARD LENGTH=2873
Length=2873
Score = 4368 bits (2365), Expect = 0.0
Identities = 2583/2691 (96%), Gaps = 4/2691 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGTTTTGGAAGATGAGCTCAAGAGACGCCACTGCATTCAAATTCCTCTTCTCAATC 60
||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 180 ATGCCGTTTTGGAAGATGAGCGCAAGAGATGTCACTGGATTCAAATTCCTCTTCTCACTC 239
Query 61 GTCTTCATCTACGCTCTAATGTCAGCGATTGTTTACTCCGTCCTCCACATGAAATTCATC 120
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GTCTTCATCTACGCTTTAATGTCAGCTATTGTTTACTCCGTCCTCCACATGAAATTCATC 299
Query 121 TCTCCGCTTCCCGCAAACGCTCCTCTTGAACGATTCTCCGAAGCTAGAGCCGTCGAACAC 180
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TCTCCGCTTCCGGCAAACGCTCCTCTCGAACGATTCTCTGAAGCTAGAGCCGTCGAACAC 359
Query 181 ATCCGCGTCTTGGCTGAAGAGATCGATGGTCGTCAGGAAGGACGACCAGGACTCAAAGAA 240
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 360 ATCCGTGTCTTGGCTGAAGAGATCGATGGTCGTCAGGAAGGACGACCTGGACTTAAAGAA 419
Query 241 GCTGCAATATACATAAAATCGCAATTGGAGATGGTGAAGGAGAGAGCTGGACCAAATCTA 300
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 420 GCTGCAACGTATATAAAATCGCAATTGGAGATGGTGAAGGAGAGAGCTGGACCAAATTTA 479
Query 301 AGGATTGAAGTGGAGGAGACTCAGGTGGATGGTTCCTTTAGCATGATGTTTCTAGGTCAC 360
||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 480 AGGGTTGAAGTGGAAGAGACTCAAGTGGATGGTTCCTTTAGCATGATGTTTCTAGGACAC 539
Query 361 AGCATTTCACTTGGATATAGAAACCATACTAATATACTTATGCGTATCTCGTCAATGAAT 420
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AGCATATCACTTGGATACAGAAACCATACTAATATACTTATGCGTATCTCGTCAATGAAT 599
Query 421 TCTCTTGACACTGATGCATCTGTATTGATGAATGCACATTATGACAGTCCTGTTAACTCC 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TCTCTTGACACTGATGCATCTGTATTGATGAATGCACATTATGACAGTCCTGTTAACTCT 659
Query 481 CCTGGAGCTGGTGATTGTGGGTCATGTGTAGCATCACTACTTGAATTAGCAAGACTGGTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CCTGGAGCTGGTGATTGTGGGTCATGTGTAGCATCACTACTTGAATTAGCAAGACTGGTA 719
Query 541 GTGGATTCTGGTTGGGTCCCGCCTCGACCTGTCATTTTTCTCTTCAATGGTGCTGAAGAG 600
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GTGGATTCTGGTTGGGTCCCGCCTCAACCTGTAATTTTTCTCTTCAATGGTGCTGAAGAG 779
Query 601 CTTTTTATGCTGGGCTCACACGGCTTCATGACGAAGCATAAGTTGAAAGATACCATTGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CTTTTTATGCTGGGCTCACACGGCTTCATGACGAAGCATAAGTTGAAAGATACCATTGGA 839
Query 661 GCTTTTATAAACGTGGAAGCTTCTGGGACTGGGGGCATTGATCTGGTCTGCCAATCAGGG 720
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GCTTTTATAAACGTGGAAGCCTCTGGGACAGGGGGTATTGATCTGGTCTGCCAATCAGGG 899
Query 721 CCTGGCTCGTGGCCGTCCTATGTCTACTCTCAAGCTGCAGTGTATCCAATGGCACAGAGT 780
|||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CCTGGCTCGTGGCCATCTTATGTCTACTCTCAAGCAGCAGTGTATCCAATGGCACAGAGT 959
Query 781 TCTGCACAGGATGTTTTCCCTGTAATTCCTGGAGACACCGATTACAGAATGTTTGCAGAA 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TCTGCACAGGATGTTTTCCCTGTAATTCCTGGAGACACAGATTACAGAATGTTTGCAGAA 1019
Query 841 GATTATGCAGACATTCCCGGGCTAGACATTATCTTTCTTCTGGGCGGTTACTACTACCAT 900
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GATTATGCCGACATTCCCGGGCTAGACATTATCTTTCTTCTGGGCGGTTACTACTACCAT 1079
Query 901 ACTACCTTTGATACAGTGGACAGAATAGTACCTGGAAGCATGCAAGCACGTGGAGAAAAC 960
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 ACTACCTTCGATACAGTGGACAGAATAGTACCTGGAAGCATGCAAGCACGTGGAGAAAAC 1139
Query 961 TTAATCAGCGTGCTTACAGCCTTCACGAGTTCTTCTAAGCTAAAGGTTGCTAGTGAAAGG 1020
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 TTAATCAGCGTGCTTAAAGCCTTCGCGAGTTCTTCTAGGCTAAAGGTTGCTAGTGAAAGA 1199
Query 1021 AAGTCGCTTGACGTGGATGCTAACAGTGACATGGTTGAAAGAGCTGTTTTCTTTGATTAC 1080
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AAGACGCTTGACGTGGATGCCAACAGTGACATGGTTGAAAGAGCTGTTTTCTTTGATTAC 1259
Query 1081 TTAACATGGTTCATTGTGTACTATCCAAGAAGAGTAGCCATGGTACTTCACAACATTCCA 1140
|||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TTAACATGGTTCATGGTGTTCTACCCAAGAAGAGTAGCTTTCGTACTTCACAACATTCCA 1319
Query 1141 GCTGCTTTGTTCCTTTGTGTTCCTTTCTTTTTGTATATGATGGACCCTAGGACAAACCCT 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1320 GCTGCTTTGTTCCTTTGTGTTCCTTTCTTTTTGTATATGATGGACCCTAGGACACACCCT 1379
Query 1201 TGGTTATCAGTCTTCTGGGCTTTCTGGAAAGGAGTTATGCACCATTTCGCTGGGATTTTA 1260
| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1380 TTGTTATCATTCTTCTGGGCTTTCTTTAAAGGAGTTATGCACCATTTCGCCGGGATCTTA 1439
Query 1261 CTTGGTGTGATATTCCCTGTTCTCTTCGCAGTCATTAGATTGTTCTTTGCTTATCCCATG 1320
|||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CTTGGTGTAATAGTCCCTGTTCTCTTTGCAGTCATCAGATTGTTCTTTGCTTATCCCATG 1499
Query 1321 AGCTGGTTTGCTCATTCATACTTAGCTTTCTTGATGTTCATCCCCTGCTCATTTTTTGGC 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 AGCTGGTTTGCTCATTCATACTTAGCTTTCTTGATGTTCATCCCCTGCTCATTTTTTGGC 1559
Query 1381 CTTTTAATTCCAAGAGCTATCTCTGATCGTGTCTCAAATTTTCAAGGTGTTTCATCCAAG 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 CTTTTAATTCCAAGAGCTATCTCTGATCGTGTCTCACATTTTCAAGGTGTTTCATCCAAG 1619
Query 1441 AAGATTATGACAGTTGAACCATCTGATGAAGCAAGGTTTTGGGGAGCATTTGGTTTCTAT 1500
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1620 AAAATTATGAAAGTTGAACCATCTGATGAAGCAAGGTTTTGGGGAGCATTTGGGTTCTAT 1679
Query 1501 GCTTTTGCAACTTCGGCATATTTTTTCGCTGGATTAAATGGAGGATTCATGACATTTGTC 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GCTTTTGCAACTTCGGCATATTTTTTCGCTGGATTAAATGGAGGATTCATGACATTTGTC 1739
Query 1561 ATCTGCATTTCTATGCTACTAGGTTGGATTGCTTTCTGTTTGTCAGTCAAGTCCTATGGC 1620
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 ATCTCCATTTCTATGCTACTAGGGTGGATTGCTTTCTATTTGTCAGTCAAGTCCTATGGC 1799
Query 1621 TATAATTCGATCAAGTCTCCCATGTTTTATGTGATAGCTCTTGTTCCATACCTTCTGTAT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1800 TATAATTCGATCAAGTCTCCCATGTTTTATGTGATAGCTCTTGTTCCATGCCTTCTGTAT 1859
Query 1681 TCTCTCTATTTTGGTGGTATTCTTGCACTATTATTAATTGAGAAGACGGGAATGATGGGA 1740
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 TCTCTCTATTTTGGTGGTATTCTTACACTATTATTAATTGAGAAGACGGGAATGATGGGA 1919
Query 1741 GCAATTCCACCACCTTATGGATTTTATCTAGCAGATGTAGCAGTAGCTGCAGTTATTGGA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1920 GCAATTCCACCACCTTATGGATTTTATCTAGCAGATGTAGCAGTAGCTGCAGTCATTGGA 1979
Query 1801 ATCGTCACCGGCTTGTGTTTGGGCCCAATAATACCAATTTGTGATCGTTGGCTGGCCAAA 1860
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 ATCGTCACCGGCTTGTGTTTGGGTCCAATAATACCAATTTGTGATCGTTGGCTGGCCAAG 2039
Query 1861 TCGTCGATCTTGAAATTCTTG-TTGCACTTCACTGTGGTCATGTTGGCGGTATCATCACA 1919
||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 TCGTCGATCTTGAAATTCTTGCTT-CACTTCACTGTAGTCATGTTGGCGGTATCATCACA 2098
Query 1920 GTTCTTTCCTTATAGCAAAGATGCACCGAAGAGAGTTGTACTCCAACACACATTCATCTC 1979
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 GTTCTTTCCTTATAGCAAAGATGCACCAAAGAGAGTTGTACTCCAACACACATTCATCTC 2158
Query 1980 TGCAGGTGGGAATGAAATCACAGGCTCAAGTTATGATTTAGCTGTCATTGATGCAAATTC 2039
| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2159 TACTGGTGGAAATGAAATCACAGGCTCAAGTTATGATTTAGCTGTCATTGATTCAAATTC 2218
Query 2040 TATTGAGTTCGTTTTTAAGCATGCTCCGGAGGTGGCAAAGGAACTTCATGTTGGCCCTTC 2099
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 TATGGAGTTCATTTTTAAGCATGCTCCGGAGGTGGCAAAGGAACTTCATGTTGGCCCTTC 2278
Query 2100 TTTTTCATTGGGAAACGCTGAAGCGTCTCCTCAAGAAGCTTGGGTGGCACTTTTCCCTAT 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2279 TTTTTCATTGGGAAACGCTGAAGCGTCTCCTCAAGAAGCTTGGATGGCACTTTTCCCTAT 2338
Query 2160 TTCCTGTGTAATAACAAAAAACGGGAGGTTCCCTGCTAAAGCCAACAATATTTCGGAGCG 2219
||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2339 TTCATGTGTATTAACAACAAACGGGAGGTTCCCTGCTAAAGCCAACAATATTTTAGAACG 2398
Query 2220 ATATAGCCAATTCCCACACCTACAAACTCATAAACCGCAAACAACATTTGAAAACGGAAC 2279
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2399 ATATAGCCAATTCCCACTCCTACAAGCGCATAAACCGCAAACAACATTTGAAAATGGAAC 2458
Query 2280 TCGCAGAGTTCATCTGGAACTCTCTCTGGGGTCGTTGGAGGAGATTTGGGTCACAGTTCT 2339
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 2459 TCGCAGAGTTCATCTGGAGCTCTCTCTGGGGTCGTTGGAGGAGATTTGGGTCACGGTTTT 2518
Query 2340 GAACATAACCGGACCGTTATCAGGATGGTCCTTCGCAGATGGCAAACCTCCAGCACCTGA 2399
|||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 GAACATAACCGGACCGTTATCAGGGTGGTCCTTTGCCGATGGCAAACCTCCAGCACCTGA 2578
Query 2400 ACTCCCACCGGGTGGTCCTCCCTCGTACATATTGAGACTGAGTGGCAACAGCGATGAGAA 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 ACTCCCACCGGGTGGTCCTCCCTCGTACATATTGAGACTGAGTGGCAACAGCGATGAGAA 2638
Query 2460 GTGGAACTTCTGGTTAGAAGCAAGTAGCGAAGAAGAAGTGAGAGTAGATGTAGCTGTTCT 2519
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 GTGGAACTTCTGGTTAGAGGCAAGTAGTGAAGAAGAAGTGAGAGTAGATGTAGCTGTTCT 2698
Query 2520 TGATCAGCGTCTTGATGAAGAAACTATACATTTGAAGGGTCTTTTCCCAAAATGGTCCGA 2579
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 TGATCAACGTCTTGATGAAGAAACTATACATTTGAAGGGTCTTTTCCCAAAATGGTCCGA 2758
Query 2580 TGTCATTGCCTACACTAGTTTTCTTTCTACATACTTGTTCTAATCATAGACTATTTGATA 2639
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||
Sbjct 2759 TGTCATTGCCTACACTAGTTTTCTTTCTACTTACTTGTTCTGATCGTAGACTATTTCATA 2818
Query 2640 TTCTCCTTTTGCCT-TTTCTAAAACATTAGAGAATAAATAAATCCGTTCTT 2689
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 TTCTCCTTTTGA-TATTTCTAAAACATTAGAGAATAAATAAATCCGTTCTT 2868
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 133544402266
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5