BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg476044 Length=2088 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G69200.1 | Symbols: FLN2 | fructokinase-like 2 | chr1:260158... 3269 0.0 > AT1G69200.1 | Symbols: FLN2 | fructokinase-like 2 | chr1:26015877-26018493 FORWARD LENGTH=2120 Length=2120 Score = 3269 bits (1770), Expect = 0.0 Identities = 1993/2100 (95%), Gaps = 18/2100 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGAGCTTAAACCCCAATCTCCCTC-AAACTCATAAACTTATTGCTCTCCTGTGTTGATTT 59 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| Sbjct 1 AGAGCTTAAACCCCAATCTCCCTCAAAACTCATAAACATATTGCTCTCCTTTGTTCATTT 60 Query 60 CTGGGTTTAGGCTTCTTTCGACTTTATGGGTTTCGGAGCTTAGTTTCAGTACAATTTCGT 119 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 61 CTGGGTTTACGCTTCTTTCGACTTTATGGGTTTCGGAGCTTAGTTTTACTACAATTTCG- 119 Query 120 TTTGG-AAAGAGCTCTTATTTGATGTCCATGGCGTCTCTCTCCTTCACCCAATTCTTATC 178 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TTTGGAAAAGAGCTCTTATTTGATGTTCATGGCGTCTCTCTCCTTCACCCAATTCTTATC 179 Query 179 ATTTCCCAGATGCAATGCAGATGTTCCTTGTCTGCTCCAGTCGC-TGGGTTTTGTGAAGT 237 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 180 ATTCCCCAGATGCAATGCAGATGTTCCTTGTCTGCTCCAGTCGCAT-GGTTTTGTGAAGT 238 Query 238 TTAGAGGTGAAAGATGGAATGGGAAACAAAGCTTTTCTATGGCTGCTGGTAGGAGAAAGT 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 TTAGAGGTGAAAGATGGAATGGGAAACAAAGCTTTTCTATGGCTGCTGGTAGGAGAAAGT 298 Query 298 TATCAGAGTCAGCACCTCTTGAAGACGAAGGCAATGATGGAAACGGGGCGGTTGGGGGGA 357 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | Sbjct 299 TATCAGAGTCAGCACCTCTTGAAGAAGAAGGTAATGATGGAAACGGTGCGGTTGTGGGAA 358 Query 358 AGAAACCATCGAAAAGTGTTAAGAGAACAACGAAGAAGAAGGTGGTAG-CAACTGATGAA 416 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| Sbjct 359 AGAAACCATCTAAAAGTGTTAAGAGAACAACGAAGAAGAAGGTTGTGGTTAA-GGATGAA 417 Query 417 TCATTAGAAGAAAGTTCTGAACTTTTGGTAGATAGTGATGATGTTTTAGACAAGGAAAGC 476 |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 CCATTAGAAGAAATTTCTGAATTTTTGGTTGATAATGATGATGTTTTAGACAAGGAAAGC 477 Query 477 ACTGTCTCAGCTTCGAAACC---AAAGACAAGAACTAGAAAGAAAGCTGCAGCAGCTTCT 533 | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 478 ATTGTCTCAGCTTTGAAACCAAAAAAGACAAGAACTAGAAAGAAAGCTGCAGCAGCTTCT 537 Query 534 TCTGATGTGGAGGAAGTAAAAACCGAGAAGAAAGTGAGACGAAAGAGGACTGTTAAGAAA 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 TCTGATGTGGAGGAAGTAAAAACCGAGAAGAAAGTGAGACGAAAGAGGACTGTTAAGAAA 597 Query 594 GATAAAGAAACGGAGGATGATTTAGCTACTAGTACTC-ATGATGAGGTTAGTGATGTCGA 652 |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| Sbjct 598 GATAAAGATGTGGAGGATGATTTAGCTACTATTA-TGGATGCTGAGGTTAGTGATGTCGA 656 Query 653 GGAAGCCTTGGCTGTTGAAAGCACTGATACCGAGAGTGAAGAAGAAGAGATTGATCTGAG 712 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 GGAAGCATTGGCTGTTGAAAGCACTGATACAGAGAGTGAAGAAGAAGAGATTGATCTGAG 716 Query 713 TAAACATGACAG-TGAAGATATTAGTCACACATATGGATGGCCTCCGCTTGTGTGTTGCT 771 ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 717 TAAACATGA-AGGTGAAGATATTAGTCACACTTATGGATGGCCTCCTCTCGTGTGTTGCT 775 Query 772 TTGGATCTGCACAACATGCTTTTGTGCCCTCGGGAAGGCCAGCAAACAGGCTATTAGATT 831 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 776 TTGGATCTGCACAACATGCTTTTGTGCCTTCGGGAAGGCCAGCAAACAGGCTATTAGATT 835 Query 832 ATGAACTACATGAACGGATGAGAGACGCAAAGTGGGCCCCGGAGAAGTATATCCGGGCTC 891 |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 836 ATGAACTACACGAACGGATGAGAGATGCAAAGTGGGCTCCAGAGAAGTATATCCGGGCTC 895 Query 892 CTGGAGGATGTGCAGGAGGTGTTGCTATTGCCCTTGCAAGCTTGGGTGGTAAGGTTGCCT 951 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 896 CTGGAGGATGTGCAGGAGGTGTTGCTATTGCTCTTGCAAGCTTGGGTGGTAAGGTTGCTT 955 Query 952 TTATGGGCAAACTCGGGGATGATGACTATGGTCAAACCATGTTGTATTACCTGAATGTGT 1011 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 956 TTATGGGCAAACTTGGGGCTGATGACTATGGTCAAGCCATGTTGTATTATCTGAATGTGT 1015 Query 1012 GCAAGGTCCAAACTAGATCAGTTAAGATTGATAGTAAAAAGGTTACGGCTTGTTCTACTA 1071 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct 1016 GCAAAGTCCAAACTAGATCAGTTAAGATTGATGGTAAAAGGGTTACGGCGTGTTCTACTA 1075 Query 1072 TGAAGATTAGCAAGAGAGGTCGCTTGAAATCGACTTGTATCAAGCCCTGTGCAGAGGATT 1131 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 1076 TGAAGATCAGCAAGAGAGGTCGCTTGAAATCGACTTGTATTAAGCCATGTGCAGAGGATT 1135 Query 1132 CTCTTTCAAAATCTGAAATCAACGTTGATGTGCTCAAAGAGGCGAAAATGTTCTACTTCA 1191 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1136 CACTTTCAAAATCTGAAATCAACGTTGATGTGCTCAAAGAGGCGAAAATGTTCTACTTCA 1195 Query 1192 GCACGCATTCTCTACTCGATAAGAAGATGAGGTCAACTACGATACAAGCCATCAAGATAT 1251 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1196 GCACGCATTCTCTACTCGATAAGAAGATGATGTCAACTACGATACAAGCCATCAAGATAT 1255 Query 1252 CAAAGCAACTAGGCAATGTCATTTTCTATGACTTGAATCTCCCTTTACCACTATGGCAGT 1311 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1256 CAAAGCAACTAGGCAATGTCATTTTTTATGACTTGAATCTCCCTTTACCACTATGGCACT 1315 Query 1312 CCAGCGAAGAAACCAAGTCTTTCATACAGGAAGTGTGGGATCTTGCAGACATAATTGAAA 1371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| Sbjct 1316 CCAGCGAAGAAACCAAGTCTTTCATACAGGAAGTGTGGAATCTTGCAGACGTCATTGAAA 1375 Query 1372 TCACAAAACAGGAACTTGAGTTCTTATGCGGAATCGAGCCAACTGAAGAGTTCGATACAG 1431 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1376 TCACAAAACAGGAACTTGAATTCTTATGCGGAATCGAGCCTACTGAAGAGTTCGATACAG 1435 Query 1432 AAAACAATGACATCAGTAAGTTTGTCCATTATCCACCAGAAACTGTGGAGCAGCTTTGGC 1491 ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1436 AAAACAATGACATCAGTAAGTTTGTCCATTACCCGCCAGAAACTGTGGAACAGCTTTGGC 1495 Query 1492 ATGAAAATCTCAAGGTCTTGTTTGCGACCAATGGCACTTCTAAGATCCATTACTATACCA 1551 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1496 ATGAAAATCTCAAGGTCTTGTTTGTGACCAATGGCACTTCTAAGATCCATTACTATACCA 1555 Query 1552 AAGAGCACAATGGTGCTGTTTCCGGAATGGAGGATGCTCCCATTACTCCTTTCACAAGGG 1611 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1556 AAGAGCACAATGGTGCTGTTTCCGGAATGGAGGATGTTCCCATTACTCCTTTTACAAGGG 1615 Query 1612 ATATGTCAGCATCTGGAGATGGCATCGTTGCAGGTCTAATAAGAATGCTTACGGTTCAAC 1671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1616 ATATGTCAGCATCTGGAGATGGCATCGTTGCAGGTCTAATAAGAATGCTTACGGTTCAGC 1675 Query 1672 CAGATCTTATGAACAATAAAGGGTACCTGGAACGCACAGCAAGATATGCAATTGAGTGTG 1731 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1676 CAGATCTTATGAACAATAAAGGGTACCTGGAACGCACAGCGAGATATGCAATTGAGTGTG 1735 Query 1732 GGGTTGTTGATCAATGGTTGCTGGCACAAACCCGAGGATATCCTCCTAAGGATGACATGg 1791 | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1736 GTATTATTGATCAATGGTTGCTGGCACAAACCCGAGGATATCCTCCAAAGGATGACATGG 1795 Query 1792 aagaagaagatgatgatgaagaaga---tgaagTGGAATCAGATCCAAACGGTATAAGAT 1848 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1796 AAGAAGAAGAAGATGATGAAGAAGAAGATGAAGTGGAATCAGATCCAAACGGTATAAGAT 1855 Query 1849 CGATAACTGAGAGGGAATACCGAACCTCAAAGCCTTATGATGAACCAGATGGTCCATATG 1908 ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1856 CGATAACAGAGAAGGAATACAGAACCTCAAAGCCTTATGATGAACCAGATGGTCCATACG 1915 Query 1909 TTATGAAACCGGTCGAGGAAAGGGAATACAAGAAGTTAGAGCTTGTTGGCTCAATGTTTG 1968 |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1916 TTATGAAACCAGTAGAGGAAAGGGAGTACAAGAAGTTAGAGCTTGTTGGCTCAATGTTTG 1975 Query 1969 AAGATGGTAGTTTATGATTTTCATAAGATTTGATATTATTTCTGTTAGTCAGCTTTTTTC 2028 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1976 AAGATGGTAGTTTATGATTTTCATAAGATTTGATAATGTTTCTGTTAGTCAGCTTTTTTT 2035 Query 2029 -CCTGTTCGCATCTTACAACATCTTGGTAGTGTGAATTTTTGTCATATGTTTTAATATCT 2087 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2036 TCCTGTTCACATCTTACAACATCTTAGTAGTGTGAATTTTTGTCATATGTTTTGATATCT 2095 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 103513523790 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5