BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476259
Length=2398
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G71270.1 | Symbols: POK, TTD8, ATVPS52 | Vps52 / Sac2 family... 3856 0.0
AT1G71300.1 | Symbols: | Vps52 / Sac2 family | chr1:26874064-... 2798 0.0
> AT1G71270.1 | Symbols: POK, TTD8, ATVPS52 | Vps52 / Sac2 family
| chr1:26863587-26870015 FORWARD LENGTH=2471
Length=2471
Score = 3856 bits (2088), Expect = 0.0
Identities = 2302/2403 (96%), Gaps = 23/2403 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaaga--CTCTAATGGCGGACTCAAACTGA 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACTCTCTAATGGCGGACTCAAACTGA 86
Query 63 TTTCAGACTCAAAAGCATTCTGTTTTCGTTCTCTACTTGAAGATATTTCGAA-TCTTAAT 121
|||| | || |||||| ||||||| |||| |||||||| |||| || |||||||
Sbjct 87 TTTC-G-------AGGATTCTGATTTCGTTTTCTAGTTGAAGATCTTTC-AACTCTTAAT 137
Query 122 CTCCTTAGGGAGATGTCAGACATTTCCATTGACGCATTGGGCCAAACTGTGGGCGACTTC 181
||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 138 CTCATTAGGAAGATGTCCGACATTTCCATTGACGCATTGGGCCAAACTATGGGGGACTTT 197
Query 182 AGTAATCATGAGAAAATTGGATTTGATTTAGGAGCATTTGTCGGAGACTTGGCTTTTGAA 241
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 198 AGTAATCATGAGAAACTTGGATTTGATTTAGGAGCATTTGTTGGAGACTTGGCTTTTGAA 257
Query 242 GAAGATTCAGGCAGTGAGGATATATCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGT 301
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 GAAGATTCAGGCAGTGAGGATATTTCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGT 317
Query 302 GAAAGTGATGAGGTTGTTTCCAATATACTATCCAGTGGTGCCAAACTTAGAGAATATGCG 361
|||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 318 GAAAGTGATGAGGTTGTTGCCAATATACTGTCTAGTGGTGACAAACTTAGAGAATATGCA 377
Query 362 AAAGGGGTTGAAAACAATCTACGGAAGGTCGAATTGGATTCAATTGAGGATTACATAAAA 421
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 378 AAAGGGGTTGAAAACAATCTACGCAAGGTTGAATTGGATTCAATCGAGGATTACATAAAG 437
Query 422 GAAAGTGACAACCTTGTCTCACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCTTGTCA 481
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 438 GAAAGTGACAACCTAGTCTCACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCCTGTCA 497
Query 482 CAAATGGAAACTCTCCTCAGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATA 541
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 CAAATGGAAACTCTTCTCAGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATA 557
Query 542 AAGATTCTTCAAGAAAAGTCAATGGACATGGGTTTGAGATTGAAAAACCGCAGGGTGGCT 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 AAGATTCTTCAAGAAAAGTCAATGGACATGGGTTTGAGATTGAAAAACCGCAGGGTGGCT 617
Query 602 GAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTA 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 GAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTA 677
Query 662 ATTGTCGATGGAGAGGTGAATGAGGAGTATATGAAAACGCTTGAAATTCTGAGTAAGAAG 721
||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 ATTGTTGACGGAGAGGTGAATGAAGAGTATATGAAAACGCTTGAAATTCTGAGTAAGAAG 737
Query 722 CTGAAATTTGTAGAAGCAGATCAAGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCGTTAAAAGATGTAGAG 781
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 CTAAAATTTGTAGAAGCAGATCAGGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCGTTAAAAGATGTAGAG 797
Query 782 CCTGAGCTCGAAAAGCTCCGGCAAAAAGCTATTTCCAAGGTGTATGATTTTATTGTCCAG 841
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 CCTGAGCTCGAAAAGCTTCGGCAGAAAGCTATTTCCAAGGTGTATGATTTTATTGTCCAG 857
Query 842 AAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTA 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 AAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTA 917
Query 902 TTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAAGAACATGGAAAAGAAGTGTTTATGGAT 961
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 TTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAGGAACATGGAAAAGAAGTGTTTATGGAT 977
Query 962 GTCCGTGCTGCATACATTGATACCATGAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCGTGCTTAT 1021
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 978 GTTCGTGCTGCATACATTGATACCATGAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCGTGCTTAT 1037
Query 1022 ATTCAAGCACTTGAGAAACTACAGTTAGATATAGCCACCGCATATGACTTAATTGGGGTA 1081
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 ATTCAAGCACTTGAGAAACTACAGTTAGATATAGCCACAGCATATGACTTAATTGGGGTA 1097
Query 1082 GAGACTAGAACCACGGGCCTCTTCTCAAGAGCTAGGGAACCACTAAAGAACCGCTCTGCC 1141
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 GAGACCAGAACCACCGGCCTCTTCTCAAGAGCTAGGGAGCCACTAAAGAACCGCTCTGCC 1157
Query 1142 GTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATAAAAATTATAAAGGAAATTGATCAACCTGCTTTGATC 1201
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 GTTTTTGCTTTGGGTGACAGGATAAAAATTATAAAGGATATTGATCAACCTGCTTTGATC 1217
Query 1202 CCGCACATAGCCGAAGCCAGCTCTCTCAAATATCCTTATGAAGTGCTCTTCAGGAGCTTG 1261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1218 CCGCACATAGCCGAAGCCAGCTCTCTCAAATATCCTTATGAAGTGCTCTTCAGGAGCCTG 1277
Query 1262 CACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATATTTTGTGATGATTTCTTTGGT 1321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 CACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATGTTTTGTGATGATTTCTTTGGT 1337
Query 1322 GAAGAGTCCATATTCTATGAAATTTTTGCGGGTCCATTTTCTGTCATCGATGAGCACTTC 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 GAAGAGTCCATATTCTATGAAATTTTTGCGGGTCCATTTTCTGTCATCGATGAGCACTTC 1397
Query 1382 AATCCCGTTCTTTCAAACTGTTTTGATGCTATCGGCCTGATGCTTATGATTCGCATAATA 1441
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 AATCCCGTTCTTTCAAACTGTTTTGATGCTATTGGCCTGATGCTTATGATTCGCATAATA 1457
Query 1442 CACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGGATTCCATGCCTGGACTCATATCTGGAC 1501
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 CACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGAATTCCATGCCTGGACTCATATCTGGAC 1517
Query 1502 AAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTCGTTTCAAGATGGTGTTTGACTCACACCTCAGCAGT 1561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1518 AAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTCGTTTCAAGATGGTGTTTGACTCACACCTTAGCAGT 1577
Query 1562 CTGCGAGATGCAAACATTAAGACATTATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATG 1621
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1578 CTGAGAGATGCAAACATTAAGACATTATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATG 1637
Query 1622 AGACGTTATGCTGAATTCACGGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGAATATGGAGATGGG 1681
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1638 AGGCGTTATGCTGAATTCACGGCTTCGTTTATTCACCTAAACGTTGAATATGGAGATGGG 1697
Query 1682 CAGCTTGATATAAATCTGGAGCGGTTAAGAATGGCTGTAGATGGCTTGATTCTCAAGCTT 1741
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1698 CAGCTTGATATAAATCTGGAGCGGTTAAGAATGGCTGTAGATGGGTTGATTCTCAAGCTT 1757
Query 1742 GCAAAGTTGTTCCCAAGGCCAAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAAATAACTACGATATG 1801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 GCAAAGTTGTTCCCAAGGCCAAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAAATAACTACGATATG 1817
Query 1802 ACAATCGCTGTGTTGAAGGAAGCTGGACCAGAAGGTGGCAAAATTCAAATGCATTTTGAG 1861
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 ACAATCGCTGTACTGAAGGAAGCTGGACCAGAAGGTGGGAAAATTCAAATGCATTTTGAG 1877
Query 1862 GAATTGCTAAAGAGTAACACTTCATTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCAGT 1921
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878 GAAATGCTAAAGAGTAACACTTCATTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCAGT 1937
Query 1922 GATTTGATCAAATTCGTGAAAAGTCGAGCCTCTGAGGATTCAAG-TTCAAATCCAGAGAG 1980
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1938 GATTTGATCAAATTCGTGAAAAATCGAGCTTCTGAGGATTCGAGCTT-AAATCCAGAGAG 1996
Query 1981 GTCCATCACAGTTGCGGAAGTAGAGCCACTGGTGAAAGACTTTGGAAGCAGATGGAAGAC 2040
|||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 GTCCATTACAATTGCTGAAGTAGAGCCACTGGTGAAGGACTTTGGAAGCAGATGGAAGAC 2056
Query 2041 AGCGATTGAGTTGATGGACAAAGATATCATAACTTCCTTCAGTAACTTCTTGTGTGGTAT 2100
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057 AGCGATTGAGTTGATGGACAAAGACATCATAACTTCCTTCAGTAACTTCTTGTGTGGTAT 2116
Query 2101 GGATATTTTGAGAGCTGCATTGACACAACTATTGCTCTATTACACAAGGCTCACAGACTG 2160
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2117 GGATATTTTGAGAGCTGCATTGACACAACTATTGCTCTATTACACAAGACTCACAGACTG 2176
Query 2161 CATCAAGAAGATGGATGGTGGATCTGCTCTGAACAGGGATCTTGTCTCCATTCAATCTAT 2220
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2177 CATCAAGAAGATAGATGGTGGATCTGCTCTGAATAGGGATCTTGTCTCCATCCAATCTAT 2236
Query 2221 TATGTACGAGATCAGGAAATACTCCAAGACTTTCTGAAAGATAACATATGTGGCTCCTTA 2280
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2237 CATGTACGAGATCAGGAAATACTCCAAGACTTTCTGAAAGATAGCATATGTGGCTCCTTA 2296
Query 2281 ATGAAGAGTATGTAAGATAAGTCAAACCTTTCAAAGTGAAACTTAAGCCAGTCTTCTGGG 2340
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||
Sbjct 2297 ATGAAGAGTATGTAAGATAAGTCAAAATTTTCAAAGTGAATCTAAAGCCAGTATTATGGG 2356
Query 2341 T---TA-TG-ATGTATCTTTCAAACCAGTAAGATAGAGTTCCTCCAATGTCTGTCTTTTG 2395
| || || || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2357 TCAGTAATGTATCTATCTTTCAAACCAGTAAGA--G--TTCCTCTAATGTCTTTCTTTTG 2412
Query 2396 CTA 2398
|||
Sbjct 2413 CTA 2415
> AT1G71300.1 | Symbols: | Vps52 / Sac2 family | chr1:26874064-26878340
FORWARD LENGTH=2187
Length=2187
Score = 2798 bits (1515), Expect = 0.0
Identities = 1876/2050 (92%), Gaps = 25/2050 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 251 GGCAGTGAGGATATATCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAAGTGAT 310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GGCAGTGAGGATATATCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAAGTGAC 201
Query 311 GAGGTTGTTTCCAATATACTATCCAGTGGTGCCAAACTTAGAGAATATGCGAAAGGGGTT 370
||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 202 GAGGTTGTTGCCAATATACTGTCCAGTGGTGACAAACTTAGAGAATATGCCAAAGGTGTT 261
Query 371 GAAAACAATCTACGGAAGGTCGAATTGGATTCA----A--TTG----------A--GGAT 412
|||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||
Sbjct 262 GAAAACAATCTACGGAAGGTTGAATTGGATTCAGTTGAGGTTGCTATTCTCTTACCTGAT 321
Query 413 TACATAAAAGAAAGTGACAACCTTGTCTCACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTGACAGC 472
||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 322 TACATAAAAGAAAGTGATAAACTAGTCTCACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTAACTGC 381
Query 473 ATCTTGTCACAAATGGAAACTCTCCTCAGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGT 532
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 ATCTTGTCACAAATGGAAACTCTTCTCAGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGT 441
Query 533 TCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAAGTCAATGGACATGGGTTTGAGATTGAAAAACCGC 592
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 442 TCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAATTCAATGGACATGGGTTTGAGACTGAAAAATCGA 501
Query 593 AGGGTGGCTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACATTATAGTGCCACCAAAGATG 652
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 502 AGGGTGACTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACTTTATAGTACCACCAAAGATG 561
Query 653 ATAGATGTAATTGTCGATGGAGAGGTGAATGAGGAGTATATGAAAACGCTTGAAATTCTG 712
|| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||
Sbjct 562 ATTCATGTAATTGTTGATGGAGAGGTGAATGAAGAGTATATCAAAACACTTGGAATTCTG 621
Query 713 AGTAAGAAGCTGAAATTTGTAGAAGCAGATCAAGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCGTTAAAA 772
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 622 AGCAAGAAGCTGAAATTTGTAGAAACAGATCAAGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCATTAAAA 681
Query 773 GATGTAGAGCCTGAGCTCGAAAAGCTCCGGCAAAAAGCTATTTCCAAGGTGTATGATTTT 832
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 682 GATGTAGAGCCTGAGCTTGAAAAGCTCCGGCAAAAAGCTATTTCCAAGGTTTATGATTTT 741
Query 833 ATTGTCCAGAAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACAG 892
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 ATTGTTCAGAAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACAG 801
Query 893 AGTGTGTTATTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAAGAACATGGAAAAGAAGTG 952
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 AGTGTGTTTTTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAAGAACATGGAAAAGAAGTG 861
Query 953 TTTATGGATGTCCGTGCTGCATACATTGATACCATGAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTT 1012
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 862 TTTATGGATGTCCGCGCTGCATACATAGATACCATGAACAAGGTGCTAAGTGCACATTTT 921
Query 1013 C-GTGCTTATATTCAAGCACTTGAGAAACTACAGTTAGATATAGCCACCGCATATGACTT 1071
| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||
Sbjct 922 CAGT-CTTATATTCAAGCATTTGAGAAACTACAGTTAGATATAGCCACATCAAACGACTT 980
Query 1072 AATTGGGGTAGAGACTAGAACCACGGGCCTCTTCTCAAGAGCTAGGGAACCACTAAAGAA 1131
||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||
Sbjct 981 GATTGGTGTGGACACTAGAAGCACTGGCCTCTTCTCAAGATCTAAGGAGCCACTAAAGAA 1040
Query 1132 CCGCTCTGCCGTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATAAAAATTATAAAGGAAATTGATCAACC 1191
||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 CCGTTGTGCCGTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATACAAATTATAAAGGAAATTGATCAACC 1100
Query 1192 TGCTTTGATCCCGCACATAGCCGAAGCCAGCTCTCTCAAATATCCTTATGAAGTGCTCTT 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 TGCTTTGATCCCGCACATAGCCGAAGCCAGCTCTCTCAAGTATCCTTATGAAGTGCTCTT 1160
Query 1252 CAGGAGCTTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATATTTTGTGATGA 1311
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1161 CAGGAGCTTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATCTTTTGTGAAGA 1220
Query 1312 TTTCTTTGGTGAAGAGTCCATATTCTATGAAATTTTTGCGGGTCCATTTTCTGTCATCGA 1371
||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |
Sbjct 1221 TTTCTTTGGTGAACAGTCTATATTTTATGAAATATTTGCGGGCCCATTCTCTGTTATCTA 1280
Query 1372 TGAGCACTTCAATCCCGTTCTTTCAAACTGTTTTGATGCTATCGGCCTGATGCTTATGAT 1431
||||||||| || |||| || |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1281 TGAGCACTTGGATTCCGTCCTCTCAAGCTGTTATGATGCTATCGGTTTGCTGCTTATGAT 1340
Query 1432 TCGCATAATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGGATTCCATGCCTGGACTC 1491
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1341 TCGCATTATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGGATTCCATGCCTGGATTC 1400
Query 1492 ATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTCGTTTCAAGATGGTGTTTGACTCACA 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||
Sbjct 1401 ATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTCGTTTTAAGACGGTGTTTGACTTGCA 1460
Query 1552 CCTCAGCAGTCTGCGAGATGCAAACATTAAGACATTATGGGAAGATGATGTTCATCCTCA 1611
| || ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1461 CATCGGCAGTCTGCGAAATGCAAACATAAATACAATATGGGAAGATGATGTGCATCCTCA 1520
Query 1612 CTATGTCATGAGACGTTATGCTGAATTCACGGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGAATA 1671
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 CTATATCATGAGACGTTATGCTGAATTCACGGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGAATA 1580
Query 1672 TGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATCTGGAGCGGTTAAGAATGGCTGTAGATGGCTTGAT 1731
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1581 TGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATTTGGAGCGTTTAAGAATGGCAGTAGACAGCTTGAT 1640
Query 1732 TCTCAAGCTTGCAAAGTTGTTCCCAAGGCCAAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAAATAA 1791
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||
Sbjct 1641 TCTTAAGCTTGCAAAGTTGTTCCCAAGGCCAAAGCAACAGATGGTGTTTCTCATTAACAA 1700
Query 1792 CTACGATATGACAATCGCTGTGTTGAAGGAAGCTGGACCAGAAGGTGGCAAAATTCAAAT 1851
||| |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1701 CTATGATATGACCATTGCTGTGCTGAAGGAAGCTGAACCAGAGGGTGGGAAAATTCAAAT 1760
Query 1852 GCATTTTGAGGAATTGCTAAAGAGTAACACTTCATTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGA 1911
||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 1761 GCATTTTGAGGAATTACTAAAGAGCAACACTTCCTTATTTGCGGAAGAATTGCTGGTGGA 1820
Query 1912 GCATTTCAGTGATTTGATCAAATTCGTGAAAAGTCGAGCCTCTGAGGATTCAAGTTCAAA 1971
||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 1821 GCATTTCAGTGATATGATCAAATTTGTTAAAAGCCGAGCCAATGAGGATTCAAGTCCAAA 1880
Query 1972 TCCAGAGAGGTCCATCACAGTTGCGGAAGTAGAGCCACTGGTGAAAGACTTTGGAAGCAG 2031
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1881 TTTAGAGAGGTCCATCACAGTTGCTGAAGTAGAGCCGCTGGTGAAGGACTTTGGAAGCAG 1940
Query 2032 ATGGAAGACAGCGATTGAGTTGATGGACAAAGATATCATAACTTCCTTCAGTAACTTCTT 2091
||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1941 ATGGAAGACAGCGATAGAATTGATGCACAAAGATATCATAACTTGCTTTAGTAACTTCTT 2000
Query 2092 GTGTGGTATGGATATTTTGAGAGCTGCATTGACACAACTATTGCTCTATTACACAAGGCT 2151
|||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2001 GTGTGGTATGGATATTTTGATAGCTGGAATGACACAACTTTTGCTTTATTACACAAGACT 2060
Query 2152 C-ACAGACTGCATCAAGAAGATGGATGGTGGATCTGCTCTGAACAGGGATCTTGTCTCC- 2209
| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
Sbjct 2061 CGA-AGACTGTATCAAGAAGATAGATGGTGGATCTGCTCTCAACAGGGATATTGTCAACT 2119
Query 2210 ATTCAATCTATTATGTACGAGATCAGGAAATACTCCAAGACTTTCTGAAAGATAACATAT 2269
|| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120 AT-CAATCAATCATGTTCGAGATCAAGAAATACAAAAAGACTTTCTGAAAGATAACATAT 2178
Query 2270 GTGGCTCCTT 2279
|||||||||
Sbjct 2179 -TGGCTCCTT 2187
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 119075692740
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5