BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476480
Length=3495
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G73460.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein | ... 5640 0.0
AT1G73450.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein | ... 5005 0.0
> AT1G73460.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein
| chr1:27620122-27625092 FORWARD LENGTH=3703
Length=3703
Score = 5640 bits (3054), Expect = 0.0
Identities = 3373/3524 (96%), Gaps = 34/3524 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACGGACCAAAGCTCTGTTGATGGGATTTTAGAGTTTCTTAGGAATAATCGTTTCTCT 60
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGACGGACCAGAGCTCTGTTGATGGGATTTTAGAGTTTCTTAGGAATAATCGCTTCTCT 60
Query 61 CAAGCTGAGGAAGCTTTGCGTAATGAGCTTAGTAACCGGTCTGACATTAATGGCTTTCTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAAGCTGAGGAAGCTTTGCGTAATGAGCTTAATAACCGGTCTGACATTAATGGCTTTCTT 120
Query 121 CAGAAACTTAAGCTTGAGGATAAAGATTCAAATGAAAA--------G----GAACTTCGC 168
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 121 CAGAAACTTAAGCTGGAGGATAAAGATTCAAATGAAAAGGCTGCTGGTAATGAACTTCGG 180
Query 169 AGGTCAGGTTCTCGAGATAGTGAAGTCTCCAAGGAGCTGATTGTTAAAGAGGTAGACTGT 228
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 181 AGGTCAGGTTCTCGAGATAGTGAAGTCTCCAAGGAGCTGATTGTGAAAGAGGTAGACTGT 240
Query 229 GGGACTAGCACCAATGGGTCTGTTATCAAGTGGGAAAATGGTCCGGCTGCTGACAAACCG 288
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||
Sbjct 241 GGGACTAGCACCAATGGGTCTGTTATCAAGTGGGAAAATGGTGCGACGGCGGACAATCCG 300
Query 289 AGCAAGAAGGAAGCGGTTGTATCAAGTGAGATGAGCTTCACATTCTCCAAAAATTCAGGT 348
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 301 AGCAAGAAGGAACCAGTTGTATCAAGTGAGATGAGCTTTACATTCTCCAAGAATTCAGGT 360
Query 349 GATGCTGCTGCT-CT--TGATGCTCATTCCTATAAATTTACTTCCGGAAATGGTACCTTG 405
|||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||
Sbjct 361 GATGCTGCTGCTCCTCCTGATGCCCATTCCTATAAATTTACTTCCAGAAATGGCACCGTG 420
Query 406 GAGCCTTATCGAAACATTGATGATA--A-TAGTAGTAGTTTGGTGGATTCT-TACGCATT 461
||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| | || |||||
Sbjct 421 GAGCCTTCTCGAAACATTGATGATAGTAGTAGTAGCAGCTTGGTGGATT-TATATGCATT 479
Query 462 CGAACAGTCGAGGCATGGGAATTTAGCTGATATCGATAAGAAGATAGTGGAAACTGGTGA 521
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CGAACAGTCGAGGCATGGGAATTTCGCTGATATCGATAAGAAGATAGTGGAAACTGGTGA 539
Query 522 AGATATCGTTTTCTTTGGCAATAAGAGTACTTTATGGTCTGGAAATTCTACTAAACGGAA 581
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 540 AGATATCGTTTTCTTTGGCAATAAGAGTACTTCATGGTCTGGAAATTCTAGTAAAGGGAA 599
Query 582 TTCCGGGTCCAAAATAATGGAGA-CAAATGAGATTGATCGGCTAGTTGAAAATTCTGGAA 640
|||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 600 CTCCGGGTCGAAAATAAAGGA-ACCAAATGAGATTCATCGGCTTGTTGAAAACTCTGGAA 658
Query 641 AGCATGACAGCTATAAGGGTAGCATTCTTTTAAGAACTGAAGATGTCGTAGATACCTCAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AGCATGACAGCTATAAGGGTAGCATTCTTTTAAGATCTGAAGATGTCGTAGATACCTCAG 718
Query 701 AGAACTGGAAAGAGTGTTCTGTTGATACTCTTTTTCATTCTTCCAGAGGGGATGCATCAA 760
|||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 719 CGAACTGGAGAGAGTGTTCTGTTAAGACTCTTTTTCAATCTTCGAGAGGGGATGCGTCAA 778
Query 761 CCAGTTACAATCTGGTTAGCAGCTCGAACAAAAGAGAGGGAAAGAAAAAGGCAGACATTA 820
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 779 ACAGTTACAATCTGGTTAGCAGCTCGGACAAGAGAGAGGGAAAGAAGAAGGCAGACATTA 838
Query 821 GTGATGTGAGGGTGGCAATCAAGGAGCAGGAGAGCGAGGTGGCAAGAGCTTTATTCTTTG 880
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GTGATGTGAGGGTGGCAATCAAGGAGCAGGAGAGTGAGGTGGCAAGAGCTTTATTCTTTG 898
Query 881 GTAAATCTCAATCCACTTTTGATGACAAAACCATCAGCAGCTTAGGTTTTCCACTTGTAT 940
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 GTAAATCTCAATCCACTTTTGATGACAAAAATATCAGCAGCTTAGGTTTTCCACTTGTAT 958
Query 941 ATGATACCCGCAAGGAAGAGTTTCCTAGG-TTGCCTCCTGTTAAGCTCAAGTCTGAAGAC 999
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 ATGATACCCGCAAGGAAGAGTTTCCTAGGCTT-CCTCCTGTTAAGCTCAAGTCTGAAGAC 1017
Query 1000 AATCCTCTGAGTCTTCACTGTGAAGAAAAATTTGAACGTGATGGTTCAGGTCCAAGGCTA 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 AATCCTCTGAGTCTTCACTGTGAAGAAAAATTTGAACGTGATGGTTCAGGTCCAAGGCTA 1077
Query 1060 ATCAATGATGAGGAGGCCCTTCTCATAGGCTCATACCTTGATGTTCCCATTGGACAAGAA 1119
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 ATCAATGATGAGGACGCCCTTCTCATAGGCTCATACCTTGATGTTCCCATTGGACAAGAA 1137
Query 1120 ATTAGCTCATCAGGTGGGAAAAAATCTGCTGGGGGAAACTGGCTTTCAGTAAGTCAGGGA 1179
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ATTAGCTCATCAGGTGGGAAAAAATCTACTGGGGGAAACTGGCTTTCAGTAAGTCAGGGA 1197
Query 1180 ATAGCAGAGGACGCATCTGATCTTGTTTCCGGTTTTGCTACTATTGGTGATGGTTTAAGT 1239
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 ATAGCAGAGGACGCATCTGATCTTGTTTCGGGTTTTGCTACTATTGGTGATGGTTTAAGT 1257
Query 1240 GAATCTGTTGACTACCGTAATGAATACTGGGACTCTGACGAGTATGAGGACGATGACGAC 1299
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1258 GAATCTGTTGACTATCGTAATGAATACTGGGACTCTGATGAGTATGAGGATGATGACGAC 1317
Query 1300 ATTGGTTATGTCAGACAACCTATTGAAGATGAAACATGGTTTCTTGCCCATGAAATTGAT 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 ATTGGTTATGTCAGACAACCTATTGAAGATGAACCATGGTTTCTTGCCCATGAAATTGAT 1377
Query 1360 TATCCAAGTGATCATGAGAAAGGAACGACCCGCGGAAGTCCTGATCACCATGGAAGAGAT 1419
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1378 TATCCAAGTGATCATGAGAAAGGAACGACCCGTGGAAGTCCTGATCACCATGAAAGAGAT 1437
Query 1420 GCAAACAAAGACG-AGGATGATCAGTCTTATGCCGAGGAGGCTTCTTATATATCTGGAGA 1478
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GCAAACAAAGACGCA-GATGATCAGTCTTATGCCGAGGAGGCTTCTTATATATCTGGAGA 1496
Query 1479 ACAGTATCTCCAATCAAAAGATGCTGAACCTATTTCTTCAGAAAATGACCGAAGACTTAC 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 ACAGTATCTCCAATCAAAAGATGCTGAACCTATTTCTTCAGAAAATGACCGAAGACTTAC 1556
Query 1539 GGTCTCAGAAATTTATCCAGCTAGCAAGAAAAATGATTTATTAGCCCAATATGATGGGCA 1598
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 AGTCTCAGAAATTTATCCAGCTAGCAAGAAAAATGATTTATTAGCCCAATATGATGGGCA 1616
Query 1599 ATTAATGGAGGAGGAATTGCTCAATTCGATGCGTGACGAGCCTGTTTGGCAGGGGTTTGT 1658
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 TTTAATGGATGAGGAATTGCTCAGTTCGATGCGTGATGAGCCTGTTTGGCAGGGGTTTGT 1676
Query 1659 AGCTCAGTCAAATGAACTTGTCACGTTAGGTGATAAGAAAGGCATAAATGTCCATCGAAA 1718
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 AGCTCAGTCAAATGAACTTCTCATGTTAGGTGATAAGAAAGGCATAAATGTCCATCGAAA 1736
Query 1719 ATCTCATCTTGATGATGTTTACCTCGAAGATGATCAGCATGATTCAGTCAGGTCAATTGG 1778
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1737 ATCTCATCGTGATGATGTTTACGTCGAAGATGATCAGCATGATTCGGTCAGGTCAATTGG 1796
Query 1779 TGTGGGGATTAATAGTGATGCAGCTGATTTTGGCAGTGAAGTACGTGACAGTTTGGCTGG 1838
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 CGTGGGTATTAATAGTGATGCAGCTGATTTTGGCAGTGAAGTACGTGACAGTTTGGCTGG 1856
Query 1839 AGGTAGCAGTGAGGGAGATTTTGAGTACTCTCGTGATCATGATCCTGTAGCATCCAGGTT 1898
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 AGGTAGCAGTGAGGGAGATTTTGAGTACTCCCGTGATCATGATCCTGTAGCATCCAGGTT 1916
Query 1899 TAAACAGCTTTACTCCGAGTCAGATAAGAAACATATTGATGGCCCAAACAAGAATAAACA 1958
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1917 TAAACAACTTTACTCCGAGTCAGATAAGAAACATATTGATGCCCCAAACAAGAATAAACA 1976
Query 1959 GA-AAGCAAGTAAAAATGATGGTCCAGATTACATTATAGATAATGATTCAAGCGGAAGTT 2017
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 -ACAAGCAAGTAAAAATGATGGTCCAGATTACATTGCAGATAATGATTCAAGCGGAAGTT 2035
Query 2018 TTCATGTGAAGATTCAAACTGATGGTGGTTTTTCGTTTGGTTCGTCACAAAAAGATGGGC 2077
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2036 TTCATGTGAAGATTCAAACTGATGGTGGTTTTTCGTTTGGTTCGTCCCAAAAAGATGGGC 2095
Query 2078 AGT---T--A-GCAGAATCTAGTAAATCATTATGGTCAGGCAATCGCGAAACAGTAACCA 2131
||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 2096 AGTCAATGCATGCGGAATCTAGTAAATCATTATGGTCAGGCAATCACGAAACGGTAACCA 2155
Query 2132 GAGATAGGAACGCCGAACGTTTGAGTGCTTCAACAGCTACGGATGATATGGTTGCAACTT 2191
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 GAGATAGGAACACCGAACGTTTGAGTGCTTCAACAGCTATGGATGATATGGTTGCAACTT 2215
Query 2192 GGAGACGAAAAAGTAGTGATTCGTCAAGTTCTCATAGTTCTGTGAAAGATAATAAAGCAA 2251
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2216 GGAGACGAAAAAGTAGTGATTCATCAAGTTCTCATAGTTCTGTGAAAGATAATAATGCAA 2275
Query 2252 CGTCTATAAAATCTGTAAACTCATCTCCCTCTTCTCTGTCAAATTATGCTTGCGAAGAAA 2311
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2276 CGTCCATAAAATCTCTAAACTCATCTCCCTCTTCTCTGTCAAATTATGCTTGTGAAGAAA 2335
Query 2312 GAAAGCATGCTGATAAAGAAGATGATAGAAATGATAGTAGTGAAGTAGGGGATGACAATG 2371
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2336 GAAAGCATGCTGATAAAGAAGATGATAGAAATGATAGTAGTGAAATAGAGGATGACAATG 2395
Query 2372 CGACAGCACTTGATGATGAAGAGGCAGTGGCTGTCCAAGAGCAAGTTAGACAAATTAAGG 2431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 CGACAGCACTTGATGATGAAGAGGCAGTGGCTGTCCAAGAGCAAGTTAGACAAATTAAGG 2455
Query 2432 CCCAAGAGGAGGAGTTTGAAACCTTTGACCTCAAAATTGTGCATCGAAAAAACAGGACTG 2491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 CCCAAGAGGAGGAGTTTGAAACCTTTGACCTCAAAATTGTGCATCGAAAAAACAGGACTG 2515
Query 2492 GTTTTGAAGAGGAAAAGAACTTTAACGTGGTTTTAAATTCGGTCATTGCTGGGCGGTACC 2551
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 GTTTCGAAGAGGAAAAGAACTTTAACGTGGTTTTAAATTCGGTCATTGCTGGGCGGTACC 2575
Query 2552 ATGTCACTGAGTACCTTGGATCAGCAGCCTTCAGTAAAGCCATACAAGCGCATGACTTAC 2611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 ATGTCACTGAGTACCTTGGATCAGCAGCCTTCAGTAAAGCCATACAAGCGCATGACTTAC 2635
Query 2612 AGACAGGAATGGACGTCTGTATAAAGATTATAAAGAACAACAAAGACTTCTTTGACCAAA 2671
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2636 AGACAGGAATGGATGTCTGTATAAAGATCATAAAGAACAACAAAGACTTTTTTGACCAGA 2695
Query 2672 GTCTTGACGAGATAAAACTTTTGAAGTATGTCAACAAGCATGATCCTGCTGACAAATACC 2731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696 GTCTTGACGAGATAAAACTTTTGAAGTATGTCAACAAGCATGATCCTGCTGACAAATACC 2755
Query 2732 ATCTTCTAAGGTTGTATGATTACTTTTACTACCGGGAGCACTTGCTCATTGTATGTGAAC 2791
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2756 ATCTTCTACGGTTGTATGATTACTTTTACTACCGCGAGCACTTGCTAATTGTATGTGAAC 2815
Query 2792 TTCTTAAGGCCAATCTATACGAATTCCACAAATTTAACAGAGAATCAGGTGGTGAAGTTT 2851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2816 TTCTTAAGGCCAATCTATACGAATTCCACAAATTTAACAGAGAATCAGGTGGTGAAGTTT 2875
Query 2852 ATTTCACGATGCCAAGATTGCAGTCAATCACTATCCAGTGTCTCGAATCTCTTCAGTTTC 2911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2876 ATTTCACGATGCCAAGATTGCAGTCAATCACTATCCAGTGTCTCGAATCACTTCAATTTC 2935
Query 2912 TACATGGCCTTGGACTTATACACTGTGATTTGAAGCCTGAGAACATATTGGTGAAAAGCT 2971
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2936 TACATGGCCTTGGACTTATACACTGTGATTTGAAGCCTGAGAACATATTGGTTAAAAGTT 2995
Query 2972 ATAGCAGATGTGAAATAAAAGTCATTGACCTTGGAAGTAGCTGTTTCGAGACAGATCACC 3031
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2996 ATAGCAGATGTGAAATAAAGGTCATTGACCTTGGAAGTAGCTGTTTCGAGACAGACCACC 3055
Query 3032 TATGCTCCTATGTCCAGTCAAGGTCATATCGAGCACCAGAAGTCATTTTGGGACTTCCTT 3091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 TATGCTCCTATGTCCAGTCAAGGTCATATCGAGCACCAGAAGTCATTTTGGGACTTCCTT 3115
Query 3092 ATGATAAAAAGATAGATGTGTGGTCTCTTGGATGCATTTTGGCTGAACTGTGTACAGGCA 3151
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 ATGATAAAAAGATAGATGTGTGGTCTCTTGGGTGCATTTTGGCTGAACTGTGTACAGGCA 3175
Query 3152 ACGTTCTTTTCCAAAATGATTCTCCAGCCAGTTTGCTAGCAAGGGTAATGGGAATCGTAG 3211
||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3176 ACGTTCTCTTCCAGAATGATTCGCCAGCCAGTTTGCTAGCAAGGGTTATGGGAATCGTAG 3235
Query 3212 GATCTTTCGATAATGAAATGCTTACCAAGGGGCGTGATTCCCACAAATATTTCACCAAAA 3271
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3236 GATCTTTCGATAATGAAATGCTTACCAAGGGACGTGATTCCCACAAATACTTCACAAAAA 3295
Query 3272 ACCGAATGCTCTATGAGCGGAACCAGGAAAGCAACAGACTGGAGTACCTGATACCGAAAA 3331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 3296 ACCGAATGCTCTATGAGCGGAACCAGGAAAGCAACAGATTGGAGTACCTGATACCAAAAA 3355
Query 3332 GAACATCCTTGAGACATCGGCTGCCAATGGGAGACCAAGGATTCACAGACTTTGTGGCTC 3391
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 GAACATCGTTGAGACATCGGCTGCCAATGGGAGACCAAGGATTCACAGACTTTGTGGCTC 3415
Query 3392 ATCTTCTTGAGATAAACCCAAAGAAGCGTCCTTCTGCAGCAGAGGCTCTCAAGCACCCTT 3451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3416 ATCTTCTTGAGATAAACCCAAAGAAGCGTCCTTCTGCAGCAGAGGCTCTGAAGCACCCTT 3475
Query 3452 GGCTTTCATACCCATACGAACCGATATCAGCTTAAACAATTGGT 3495
|||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 3476 GGCTTTCATATCCATACGAACCAATCTCTGCTTAAACAATTGGT 3519
> AT1G73450.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein
| chr1:27613856-27618897 FORWARD LENGTH=3721
Length=3721
Score = 5005 bits (2710), Expect = 0.0
Identities = 3278/3533 (93%), Gaps = 115/3533 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 GACCAAAGCTCTGTTGATGGGATTTTAGAGTTTCTTAGGAATAATCGTTTCTCTCAA-GC 65
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 7 GACCAAAGCTCTGTTGATGGGATTTTAGAGTTTCTTAGGAATAATCGTTTCTCT-AACGC 65
Query 66 TGAGGAAGCTTTGCGTAATGAGCTTAGTAACCGGTCTGACATTAATGGCTTTCTTCAGAA 125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 TGAGGAAGCTTTGCGTAATGAGCTTAGTAACCGGTCTGACATTAATGGCTTTCTTCAGAA 125
Query 126 ACTTAAGCTTGA-G-----GA-T-----AAAGATTCAAATG--A-A---AA--G----GA 161
||||| ||| || | || | ||||||||||||| | | || | ||
Sbjct 126 ACTTATGCTGGAGGAAAAAGATTCAAGCAAAGATTCAAATGAAAGAGCTAATGGTAAAGA 185
Query 162 ACTTCGCAGGTCAGGTTCTCGAGATAGTGAAGTCTCCAAGGAGCTGATTGTTAAAGAGGT 221
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||
Sbjct 186 ACTTCGGAGGTCAGGTTCTCGAGATAGTGAAGTCTCCAAGGAGCTGGTTGTGAAAGAAGT 245
Query 222 AGACTGTGGGACTAGCACCAA-TGGGTCTGTTATCAAGTGGGAAAATGGTCCGGCTGCTG 280
||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 246 AGATTGTGGGACTAGCA-CAACTGGGTCTGTTATCAAGTGGGAAAATGGTGCGGCTGCTG 304
Query 281 ACAAACCGAGCAAGAAGGAAGCGGTTGTATCAAGTGAGATGAGCTTCACATTCTCCAAAA 340
| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 305 AGAACCCGAGCAAGAAGGAAACGTTTGTACCAAGTGAGATGAGCTTTACATTCTCCAAGA 364
Query 341 ATTCAGGTGATGCTGCTGCT-CT--TGATGCTCATTCCTATAAATTTACTTCCGGAAATG 397
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 365 ATTCAGGTGATGCTGCTGCTCCTCCTGATGCTCATTCCTATGAATTTACTTCCGGCAATG 424
Query 398 GTACCTTGGAGCCTTATCGAAACATTGATGAT-A-A-TAGTAGTAGTTTGGTGGATTCTT 454
|||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 425 GTACTTTGGAGCCTTATGGAAACATTGATGATAATAGTAGTAGTAGTTTGGTTGATTCAT 484
Query 455 ACGCATTCGAACAGTCGAGGCATGGGAATTTAGCTGATATCGATAAGAAGATAGTGGAAA 514
| ||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 ATGCAATCGAACAGT-------T--G------GCTGACATCGATAAGAAGATAGTGGAAA 529
Query 515 CTGGTGAAGATATCGTTTTCTTTGGCAATAAGAGTACTTTATGGTCTGGAAATTCTACTA 574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 530 CTGGTGAAGATATCGTTTTCTTTGGCAATAAGAGTACTTTATTGTCTGGAAATTCTAGTA 589
Query 575 AACGGAATTCCGGGTCCAAAATAATGGAGA-CAAATGAGATTGATCGGCTAGTTGAAAAT 633
|| |||| |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 590 AAGGGAACTCCGGGTCGAAAATAA-AGAAACCAAATGAGATTGATCAGCTAGGTGAAATT 648
Query 634 TCTGGAAAGCATGACAGCTATAAGGGTAGCATTCTTTTAAGAACTGAAGATGTCGTAGAT 693
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 649 TTTGGAAAGCATGACAGCTATAAGGGTAGCGTTCTTTTAAGAACTGAAGATGTCATAGAT 708
Query 694 ACCTCAGAGAACTGGAAAGAGTGTTCTGTTGATACTCTTTTTCATTCTTCCAGAGGGGAT 753
||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 709 ACCTCAGAGAACTGGAAAGAGCGTTCTGTTAAGACTCTTTTTCAATCTTCGAGAGGGGAT 768
Query 754 GCATCAACCAGTTACAATCTGGTTAGCAGCTCGAACAAAAGAGAGGGAAAGAAAAAGGCA 813
|| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 GCGTCAAACAGTTACAATCTGGTTAGCAGCTCGGACAAAAGAGAGGGAAAGAAAAAGGCA 828
Query 814 GACATTAGTGATGTGAGGGTGGCAATCAAGGAGCAGGAGAGCGAGGTGGCAAGAGCTTTA 873
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 GAGATTAGTGATGTGAGGGTGGCAATCAAGGAGCAGGAGAGCGAGGTGGCAAGAGCTTTA 888
Query 874 TTCTTTGGTAAATCTCAATCCACTTTTGATGACAAAACCATCAGCAGCTTAGGTTTTCCA 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCTTTGGTAAATCTCAATCCACTTTTGATGACAAAAACATCAGCAGCTTAGGTTTTCCA 948
Query 934 CTTGTATATGATACCCGCAAGGAAGAGTTTCCTAGG-TTGCCTCCTGTTAAGCTCAAGTC 992
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 949 CTTGTATTTGATACCCGCAAGGAAGAGTTTCCTAGGCTT-CCTCCTGTTAAGCTCAAGTC 1007
Query 993 TGAAGACAATCCTCTGAGTCTTCACTGTGAAGAAAAATTTGAACGTGATGGTTCAGGTCC 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 TGAAGACAATCCTCTGAGTCTTCACTGTGAAGAAAAATTTGAACGTGATGGTTCAGGTCC 1067
Query 1053 AAGGCTAATCAATGATGAGGAGGCCCTTCTCATAGGCTCATACCTTGATGTTCCCATTGG 1112
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 AAGGCTAATCAATGATGATGAGGCCCTTCTCATAGGCTCATACCTTGATGTTCCCATTGG 1127
Query 1113 ACAAGAAATTAGCTCATCAGGTGGGAAAAAATCTGCTGGGGGAAACTGGCTTTCAGTAAG 1172
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 ACAAGAAATTAGCTCATCAGGTGGAAAAAAATCTGGTGGGGGAAACTGGCTTTCAGTAAG 1187
Query 1173 TCAGGGAATAGCAGAGGACGCATCTGATCTTGTTTCCGGTTTTGCTACTATTGGTGATGG 1232
||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 TCAGGGAAT--------A-GCA---GATCTTGTTTCTGGTTTTGCTACTATTGGTGATGG 1235
Query 1233 TTTAAGTGAATCTGTTGACTACCGTAATGAATACTGGGACTCTGACGAGTATGAGGACGA 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1236 TTTAAGTGAATCTGTTGACTACCGTAATGAATACTGGGATTCTGACGAGTATGAGGATGA 1295
Query 1293 TGACGACATTGGTTATGTCAGACAACCTATTGAAGATGAAACATGGTTTCTTGCCCATGA 1352
|| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1296 TGGCGACATTGGGTATGTCAGGCAACCTATTGAAGATGAAACATGGTTTCTTGCCCACGA 1355
Query 1353 AATTGATTATCCAAGTGATCATGAGAAAGGAACGACCCGCGGAAGTCCTGATCACCATGG 1412
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1356 AATTGATTATCCAAGTGATCATGAGAAAGGTACGACCCGTGGAAGTCCTGATCACCAT-G 1414
Query 1413 A-AGAGATGCAAACAAAGACGAGGATGATCAGTCTTATGCCGAGGAGGCTTCTTATATAT 1471
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||
Sbjct 1415 ATAGAGATGCAAACAAAGACGAGGATGATCAGTCTTATGCAGAGGATGAGTCTTATTTAT 1474
Query 1472 CTGGAGAACAGTATCTCCAATCAAAAGATGCTGAACCTATTTCTTCAGAAAATGACCGAA 1531
| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 CCGGTGAACGGTATCTCCAATCAAAAGATGCTGAACCTATTTCTTCAGAAAATGACCGAA 1534
Query 1532 GACTTACGGTCTCAGAAATTTATCCAGCTAGCAAGAAAAATGATTTATTAGCCCAATATG 1591
||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1535 GACTTACAGTCTCAGAAATTTATCCAGCTTGTAAGAAAAACGATTTATTAGCCCAATATG 1594
Query 1592 ATGGGCAATTAATGGAGGAGGAATTGCTCAATTCGATGCGTGAC-GAGCCTGTTTGGCAG 1650
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 1595 ATGGGCAATTAATGGATGAGGACTTGCTCAATTCGATGCG-GACTGAGCCTGTTTGGCAG 1653
Query 1651 GGGTTTGTAGCTCAGTCAAATGAACTTGTCACGTTAGGTGATAAGAAAGGCATAAATGTC 1710
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654 GGTTTTGTAGCTCAGTCAAATGAACTTGTCATGTTAGGTGATAAGAAAGGCATAAATGTC 1713
Query 1711 CATCGAAAATCTCATCTTGATGATGTTTACCTCGAAGATGATCAGCATGATTCAGTCAGG 1770
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1714 CATCGAAAATCTCATCTTGATGATGTTTACGTCGAAGATGATCAGCATGATTCGGTCAGG 1773
Query 1771 TCAATTGGTGTGGGGATTAATAGTGATGCAGCTGATTTTGGCAGTGAAGTACGTGACAGT 1830
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TCAATTGGTGTGGGTATTAATAGTGATGCAGCTGATTTTGGCAGTGAAGTACGTGACAGT 1833
Query 1831 TTGGCTGGAGGTAGCAGTGAGGGAGATTTTGAGTACTCTCGTGATCATGATCCTGTAGCA 1890
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 TTGGCTGGAGGTAGCAGTGAGGGAGATTTTGAGTACTCGCGTGATCATGATCCTGTAGCA 1893
Query 1891 TCCAGGTTTAAACAGCTTTACTCCGAGTCAGATAAGAAACATATTGATGGCCCAAACAAG 1950
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1894 TCCAGGTTTAAACAGCTTTACTCCGAGTCAGATAAGAAACATATTGATGGCCAAAATAAG 1953
Query 1951 AATAAACAGAAAGCAAGTAAAAATGATGGTCCAGATTACATTATAGATAATGATTCAAGC 2010
||| ||| | || || | | | | | || | | ||||||||| ||
Sbjct 1954 AAT------AAA-C-AG----AA--A--G--C-----A-AGTA-A-A-AATGATTCAGGC 1986
Query 2011 GGAAGTTTTCATGTGAAGATTCAAACTGATGGTGGTTTTTCGTTTGGTTCGTCACAAAAA 2070
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1987 GGAAGTTTTCATGTGAAGATTCAAACTGATGGTGATTTTTCGTTTGGCTCGTCACAAAAA 2046
Query 2071 GATGGGCAG-T--T--A-GCAGAATCTAGTAAATCATTATGGTCAGGCAATCGCGAAACA 2124
||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2047 GATGGGCAGTTAATGCATGCAGAATCTAGTAAATCATTATGGTCCGGCAATCGTGAAACG 2106
Query 2125 GTAACCAGAGATAGGAACGCCGAACGTTTGAGTGCTTCAACAGCTACGGATGATATGGTT 2184
||||| |||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2107 GTAACTAGAGATAGAAATACTGAACTTTTAAGTGCTTCAACAGCTACAGATGATATGGTT 2166
Query 2185 GCAACTTGGAGACGAAAAAGTAGTGATTCGTCAAGTTCTC-ATAGTTCTGTGAAAGATAA 2243
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||
Sbjct 2167 GCAACTTGGAGACAAAAAAGTAGTGATTCATCAAGTTCTCGA-AGTTCTGTGAAAGAAAA 2225
Query 2244 TAAAGCAACGTCTATAAAATCTGTAAACTCATCTCCCTCTTCTCTGTCAAATTATGCTTG 2303
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2226 TAATGCAACGTCCATAAAATCTGTAAACTCATCTCCCTCTTCTCTGTCAAATTATGCTCG 2285
Query 2304 CGAAGAAAGAAAGCATGCTGATAAAGAAGATGATAGAAATGATAGTAGTG-AAGTAGGGG 2362
|| ||||||||||||||||| |||| | | | ||||||||| |||| ||| || ||
Sbjct 2286 CGGAGAAAGAAAGCATGCTG----AGAA-A-G--A-AAATGATAGCAGTGAAAG-AGAGG 2335
Query 2363 ATGACAATGCGACAGCACTTGATGATGAAGAGGCAGTGGCTGTCCAAGAGCAAGTTAGAC 2422
||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2336 ATGGCCATGCGACAGCACTTGATGATGAAGAGGCCGTGGCTGTACAAGAGCAAGTTAGAC 2395
Query 2423 AAATTAAGGCCCAAGAGGAGGAGTTTGAAACCTTTGACCTCAAAATTGTGCATCGAAAAA 2482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 AAATTAAGGCCCAAGAGGAGGAGTTTGAAACCTTTGACCTCAAAATTGTGCATCGAAAAA 2455
Query 2483 ACAGGACTGGTTTTGAAGAGGAAAAGAACTTTAACGTGGTTTTAAATTCGGTCATTGCTG 2542
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 ACAGGACTGGTTTCGAAGAGGAAAAGAACTTTAACGTGGTTTTAAATTCGGTCATTGCTG 2515
Query 2543 GGCGGTACCATGTCACTGAGTACCTTGGATCAGCAGCCTTCAGTAAAGCCATACAAGCGC 2602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 GGCGGTACCATGTCACTGAGTACCTTGGATCAGCAGCCTTCAGTAAAGCCATACAAGCGC 2575
Query 2603 ATGACTTACAGACAGGAATGGACGTCTGTATAAAGATTATAAAGAACAACAAAGACTTCT 2662
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 ATGACTTACAGACAGGAATGGATGTCTGTATAAAGATTATAAAGAACAACAAAGACTTCT 2635
Query 2663 TTGACCAAAGTCTTGACGAGATAAAACTTTTGAAGTATGTCAACAAGCATGATCCTGCTG 2722
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 TTGACCAGAGTCTTGACGAGATAAAACTTTTGAAGTATGTCAACAAGCATGATCCTGCTG 2695
Query 2723 ACAAATACCATCTTCTAAGGTTGTATGATTACTTTTACTACCGGGAGCACTTGCTCATTG 2782
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2696 ACAAATACCATCTTCTACGGTTGTATGATTACTTTTACTACCGGGAGCACTTGCTAATTG 2755
Query 2783 TATGTGAACTTCTTAAGGCCAATCTATACGAATTCCACAAATTTAACAGAGAATCAGGTG 2842
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2756 TATGTGAACTTCTTAAGGCCAATCTATACGAGTTCCACAAATTTAACAGAGAATCAGGTG 2815
Query 2843 GTGAAGTTTATTTCACGATGCCAAGATTGCAGTCAATCACTATCCAGTGTCTCGAATCTC 2902
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2816 GTGAAGTTTATTTCACGATGCCAAGGTTGCAGTCAATCACTATCCAGTGTCTCGAATCAC 2875
Query 2903 TTCAGTTTCTACATGGCCTTGGACTTATACACTGTGATTTGAAGCCTGAGAACATATTGG 2962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2876 TTCAGTTTCTACATGGCCTTGGACTTATACACTGTGATTTGAAGCCTGAGAATATATTGG 2935
Query 2963 TGAAAAGCTATAGCAGATGTGAAATAAAAGTCATTGACCTTGGAAGTAGCTGTTTCGAGA 3022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 TGAAAAGCTATAGCAGATGTGAAATAAAAGTCATTGACCTTGGAAGTAGCTGTTTCGAGA 2995
Query 3023 CAGATCACCTATGCTCCTATGTCCAGTCAAGGTCATATCGAGCACCAGAAGTCATTTTGG 3082
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 CAGACCACCTATGCTCCTATGTCCAGTCAAGGTCATATCGAGCACCAGAAGTCATTTTGG 3055
Query 3083 GACTTCCTTATGATAAAAAGATAGATGTGTGGTCTCTTGGATGCATTTTGGCTGAACTGT 3142
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 3056 GACTTCCTTATGATAAAAAGATAGATGTGTGGTCTCTTGGGTGCATTTTAGCTGAACTAT 3115
Query 3143 GTACAGGCAACGTTCTTTTCCAAAATGATTCTCCAGCCAGTTTGCTAGCAAGGGTAATGG 3202
|||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3116 GTACAGGCAACGTTCTCTTCCAGAATGATTCGCCGGCCAGTTTGCTAGCAAGGGTTATGG 3175
Query 3203 GAATCGTAGGATCTTTCGATAATGAAATGCTTACCAAGGGGCGTGATTCCCACAAATATT 3262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3176 GAATCGTAGGATCTTTCGATAATGAAATGCTTACCAAGGGACGTGATTCCCACAAATACT 3235
Query 3263 TCACCAAAAACCGAATGCTCTATGAGCGGAACCAGGAAAGCAACAGACTGGAGTACCTGA 3322
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3236 TCACAAAAAACCGAATGCTCTATGAGCGGAACCAGGAAAGCAACAGATTGGAGTACCTGA 3295
Query 3323 TACCGAAAAGAACATCCTTGAGACATCGGCTGCCAATGGGAGACCAAGGATTCACAGACT 3382
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 TACCAAAAAGAACATCGTTGAGACATCGGCTGCCAATGGGAGACCAAGGATTCACAGACT 3355
Query 3383 TTGTGGCTCATCTTCTTGAGATAAACCCAAAGAAGCGTCCTTCTGCAGCAGAGGCTCTCA 3442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3356 TTGTGGCTCATCTTCTTGAGATAAACCCAAAGAAGCGTCCTTCTGCAGCAGAGGCTCTGA 3415
Query 3443 AGCACCCTTGGCTTTCATACCCATACGAACCGATATCAGCTTAAACAATTGGT 3495
|||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||||
Sbjct 3416 AGCACCCTTGGCTTTCATACCCATACGAGCCAATCTCTGCTTAAACAACTGGT 3468
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 173978958324
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5