BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476534
Length=4268
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G73960.1 | Symbols: TAF2 | TBP-associated factor 2 | chr1:27... 7086 0.0
> AT1G73960.1 | Symbols: TAF2 | TBP-associated factor 2 | chr1:27805045-27814446
REVERSE LENGTH=4314
Length=4314
Score = 7086 bits (3837), Expect = 0.0
Identities = 4131/4275 (97%), Gaps = 12/4275 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAAGGAACATGGCAAAGGCTCGGAAGCCGAAGAACGAGGAAGCTCCTGGCGCCAAGAC 60
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4 AAAAAGGAACATGGCCAAGGCTCGAAAGCCGAAGAACGAGGAAGCTCCTGGCGCGAAGAC 63
Query 61 TTCGGAGAACACTGGAGCTAAAGTTCTTCACCAGAAGCTCTTTCTTTCTATCGACTTCAA 120
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 64 TTCAGAGAACACTGGAGCTAAAGTTCTTCACCAGAAACTCTTTCTCTCTATTGACTTCAA 123
Query 121 AAAACGCCAAATCTACGGTTACACAGAGTTAGAAGTGAGTGTGCCAGATATTGGTATAGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 124 AAAACGCCAAATCTACGGTTACACAGAGTTAGAAGTGAGTGTGCCAGATATTGGTATTGT 183
Query 181 GGGACTACACGCAGAGAACTTGGGAATTGAGAGTGTTTTGGTAGATGGGGAACCTACTGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 GGGACTACACGCAGAGAACTTGGGAATTGAGAGTGTTTTGGTAGATGGGGAACCTACTGT 243
Query 241 ATTTGAGTACTATCCGCACCATCAGAACTCTGAAACTGAGAGTAATTGGAACTCGGTCAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
Sbjct 244 ATTTGAGTACTATCCGCACCATCAGAACTCTGAAACTGAAAGTAACTGGAACTCGGTCTC 303
Query 301 AGACCCTA-CTTCAGCAGCTGATGCCGCGGCCATGGAATATGTTGGGGTTCTTAAGAGAG 359
||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 304 TGACCC-AGCTTCAGCAGCTGATGCTGCGGCCATGGAATATGTCGGGGTTCTTAAGAGAG 362
Query 360 AAGACACTGCAAATTTACTGATCAATTGTTGCAAGCCCTCTAAGGATCTATCTGAACAGC 419
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 363 AAGACACTGCAAATTTACTGATCAACTGTTGCAAGCCTTCTAAGGATTTATCTGAACAGC 422
Query 420 TGGATAATGTGACTTTAGAAAATGGTTCCCAATCTTCCGGGGAGGTAAAACAGAATGTTA 479
|||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 423 TGGACAGTGTGACTTTAGAAAACGGTTCCCAATCTTCAGGGGAGGCAAAACAGAATGTTA 482
Query 480 AATTGATTCGGATTAACTACTGGGTAGAGAAAATAGAGGCAGGAATTCATTTTGATGGGA 539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 483 AATTGATTCGGATTAACTACTGGGTAGAGAAAATAGAGTCAGGAATTCATTTTGATGGGA 542
Query 540 ACATTGTACATACTGATAACCAGATGAGACGTGCCCGTTGTTGGTTTCCTTGCATAGATG 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 543 ACATTGTACATACTGATAACCAGATGAGACGTGCTCGTTGTTGGTTTCCTTGTATTGATG 602
Query 600 ATGAGTACCATCGTTGCAGTTTCGATTTAGAATTTACTGTTCCGCACAACTTTGTGGCTG 659
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 ATGAGTACCATCGTTGCAGTTTCGATTTGGAATTCACTGTTCCGCACAACTTTGTGGCTG 662
Query 660 TTAGTGTTGGGAAACTACTCTACCAGGTTATGTGCAAAGAAGATACTACTCGTAAAACGT 719
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 663 TTAGTGTTGGGAAATTACTCTACCAGGTTATGTGCAAAGAAGATACTACTCAAAAAACGT 722
Query 720 ATGTTTATGAACTAGCTATTCCTATCGCACCGCGGTGGGTGTCTTTAGTCGCAGGACCAT 779
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 723 ATGTTTATGAACTAGCTATTCCTATTGCACCGCGGTGGGTGTCTTTAGTTGCAGGACCAT 782
Query 780 TGGAAGTCCTTCCAGATCGGACCAACTTTCTCATATCTAACTTGTGTTTACCGCATGATC 839
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 783 TGGAAATCCTTCCAGATCAGACCAACTTTCTCATATCTAACTTGTGTTTGCCGCATGATC 842
Query 840 TCTCGAGGCTTCGTAATACAATGGAATTTTTCCATGAAGCTTATAGCTACTATGAGGATT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 TCTCGAGGCTTCGTAATACAATGGAATTTTTCCATGAAGCTTATAGCTACTATGAGGATT 902
Query 900 ATTTAAGCGCGAACTTTCCATTTGGATTCTACAAGCAAGtttttttACCTCCTGAAATGG 959
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 903 ATTTAAGTGCGAACTTTCCATTTGGATTCTACAAGCAAGTATTTTTACCTCCTGAAATGG 962
Query 960 TTGTTACCTCGTCGACTTCGGGAGCTTCCTTGAGTATCTTTAGCTCCCACATGCTATATG 1019
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 963 TTGTTACTTCGTCGACTTCGGGAGCTTCCTTGAGTATCTTTAGCTCCCACATACTATATG 1022
Query 1020 ACGAGAGGGTTATTGATCAGACAATAGATACACGCATTAAACTTGCTTCTGCGTTAGCAA 1079
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 ATGAGAGGGTTATTGATCAGACAATAGATACACGCATTAAACTTGCTTCTGCGTTAGCAA 1082
Query 1080 AACAGTGGTTTGGAGTTTATATTACTCCTGAATCACCAAATGATGATTGGCTCCTCGATG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1083 AACAGTGGTTTGGAGTTTATATTACTCCTGAATCACCAAATGATGATTGGCTCCTTGATG 1142
Query 1140 GTCTTGCTGGTTTCTTAACGGATATGTTTATCAAGCAGTTTTTGGGAAATAATGAAGCAC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 GTCTTGCTGGTTTCTTAACGGATATGTTTATCAAGCAGTTTTTGGGAAATAATGAAGCAC 1202
Query 1200 GATACCGGAGATACAAGGCAAATTGTGCTGTCTGTAAAGCTGATGATAGTGGTGCAATGT 1259
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 GATATCGGAGATACAAGGCAAATTGTGCTGTCTGTAAAGCTGATGATAGTGGTGCAATGT 1262
Query 1260 GCTTGAGCGCATCTCCTTCTTGCAAGGACCTATTTGGAACTCATTCTATTGGGATGCATG 1319
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1263 GCTTGAGCTCATCTCCTTCTTGCAGGGACCTATTTGGAACTCATTCTATTGGAATGCATG 1322
Query 1320 GGAAGATACGATCATGGAAATCAGGAGCAGTCCTTCAGATGTTGGAGAAGCAAATGGGCT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 GGAAGATACGATCATGGAAATCAGGAGCAGTCCTTCAGATGTTGGAGAAGCAAATGGGCT 1382
Query 1380 CAGACTCGTTTCGTAAAATATTGCAGAAAATTATTTCTCGAGCCAAGGATCCATCTAATT 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 CAGACTCGTTTCGTAAAATATTGCAGAAAATTATTTCTCGAGCCAAGGATCCATCTAATT 1442
Query 1440 CTATACGGTCTCTTAGCACGAAGGAGTTCCGGCAATTTGCTAATAAGATTGGAAATCTTG 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 CTATACGGTCTCTTAGCACGAAGGAGTTCCGGCAATTTGCTAATAAGATTGGAAATCTTG 1502
Query 1500 AGCGTCCATTTCTTAAAGAATTTTTTCAGCGATGGGTTTCATCTTGTGGTTGTCCCGTGC 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1503 AGCGTCCATTTCTTAAAGAATTTTTTCAGCGATGGGTTGCATCTTATGGTTGTCCCGTGC 1562
Query 1560 TAAGGATTGGGTTGTCTTACAACAAAAGGAAAAACAATGTTGAAATGGCTGCTCTGCGCG 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1563 TAAGGATTGGGTTGTCTTACAACAAAAGGAAAAACAATGTTGAAATGGCTGCTCTGCGAG 1622
Query 1620 AATGCACGGCTGCACTGGATGCAAGGTTATCAGTTATTGGGGCTACTTCTGATTCAGAAA 1679
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 AATGCACGGCTGCACTGGATGCAAGATTATCAGTTATAGGGGCTACTTCTGATTCAGAAA 1682
Query 1680 GCCGGGATGTGGATGCTGGCTGGCCGGGTATTATGAGTATAAGGGTTTATGAACTCGATG 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 GCCGGGATGTGGATGCTGGCTGGCCGGGTATTATGAGTATAAGGGTTTATGAACTCGATG 1742
Query 1740 GAATGTCTGATCATCCAAAGTTGCCTATGGCTGGAGATAGATGGCAGCTACTGGAATTAC 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743 GAATGTCTGATCATCCAAAGTTGCCTATGGCTGGAGATAGATGGCAGCTACTGGAATTAC 1802
Query 1800 CATGTCATTCTAAACTTGCTGCTAAACGCTATCAAAAACCAAAGAAGGGAGGGAAACCTG 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 CATGTCATTCTAAACTTGCTGCTAAACGCTATCAAAAACCAAAGAAGGGAGGGAAACCTG 1862
Query 1860 ATGGGGCTGAAGACAATGTTGATGCTATAGCACCGTTAGAAAATAAATCGAGCATTGAAT 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1863 ATGGGGCTGAAGACAATGTTGATGCTATAGCACCGTTAGAAAATAAAACGAGCATTGAAT 1922
Query 1920 CTCCCTTGGCTTGGATTAAAGCTGACCCTGAGATGGAATATATTGCTGAGATTCACCTTC 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 CTCCCTTGGCTTGGATTAAAGCTGACCCTGAGATGGAATATATTGCTGAGATTCACCTTC 1982
Query 1980 ATCAGCCCCTACAAATGTGGGTCAATCAACTAGAGAAGGATGGAGATGTTGTTGCTCAGG 2039
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1983 ATCAGCCCCTACAAATGTGGGTCAATCAACTAGAGAAGGACGGAGATGTTGTTGCTCAGG 2042
Query 2040 CACAAGCAATTGCGTCACTTGAAGCCTTAAAACAACACTCCTTTTCCATTGTGAATGCGC 2099
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2043 CACAAGCAATTGCGTCACTTGAAGCCTTAAAACAACACTCCTTTTCCATTGTGAATGCAC 2102
Query 2100 TCAAAAATGTTCTCTCTGACTCCAAGGTCTTCTGGAGAATACGTATTGGGGCAGCGTTTG 2159
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2103 TCAAAAATGTCCTCACTGACTCCAAGGTCTTCTGGAGAATACGTATTGCGGCAGCGTTTG 2162
Query 2160 CATTGGCTAAAACAGCATCAGAGGAGACTGACTGGGCGGGTTTGCAACATCTAATAAAGT 2219
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 CATTGGCTAAAACAGCATCAGAGGAGTCTGACTGGGCGGGTTTGCAACATCTAATAAAGT 2222
Query 2220 TTTATAAAAGTAGAAGATTTGATGCAGAGATTGGACTCCCCAAGCCGAATGACTTCCACG 2279
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2223 TTTATAAGAGTAGAAGATTTGATGCAGAGATTGGACTCCCCAAGCCGAATGACTTCCGCG 2282
Query 2280 ATTTCCCAGAATATTTTGTGCTTGAGGCCATTCCACATGCCATTGCAACAGTTAGGGGTG 2339
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2283 ATTTCCCAGAATATTTTGTGCTTGAGGCCATTCCACATGCCATTGCAATAGTTAGGGGTG 2342
Query 2340 CTGAGGGGAAAAGCCCTCGAGAAGCTGTTGAATTTATCTTACAGCTTCTGAAGTACAATG 2399
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2343 CTGAGGGGAAAAGCCCTAGAGAAGCTGTTGAATTTATCTTACAGCTTCTGAAGTACAATG 2402
Query 2400 ACAACAGTGGGAAT-CGGTATTCTGATGTATTCTGGCTTGCTGTGCTTGTTCAGTCAGTT 2458
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2403 ACAACAGTGGGAATTCG-TATTCTGATGTATTCTGGCTTGCTGTGCTTGTTCAGTCAGTT 2461
Query 2459 GGTGATCTCGAATTCTGTCAGCAGAGTCTAACGTTTTTGGCCCCTCTTCTGAAGCGCATT 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2462 GGTGATCTCGAATTCTGTCAGCAGAGTCTAACGTTTTTGGCCCCTCTTCTGAAGCGCATT 2521
Query 2519 GACAGACTCTTGCAGTTTGACAGGTTGATGCCAAGCTACAATGGCATCTTGACAATTAGC 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2522 GACAGACTCTTGCAGTTTGACAGGTTGATGCCAAGCTACAATGGCATCTTGACAATTAGC 2581
Query 2579 TGCATCCGAACATTGGCACAGACTGCTCTCAAGCTTTCTGATTCCATCAGTTTCGATCAC 2638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2582 TGCATCCGAACATTGGCACAGACTGCTCTCAAGCTTTCTGATTCCATCAGTTTCGATCAC 2641
Query 2639 ATCTGTAAACTTATTGAACCTTTCCGAAATTCGGATACAATATTGCAAATTCGTATAGAA 2698
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642 ATCTGTAAACTTATTGAACCTTTCCGGAATTCGGATACAATATTGCAAATTCGTATAGAA 2701
Query 2699 GCAAGTAGGGCACTTCTTGACATCGAGTACCAATCCAAAGGCATAAGTTCCACACTTTTG 2758
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2702 GGAAGTAGGGCACTTCTTGACATCGAGTACCAATCCAAAGGCATAAGTTCCGCACTTTTG 2761
Query 2759 TTGTTTATGAAATATGTGGTAGAAGAATCATCTTTGAGAGGGCAGGTAAAATTGTGTGTA 2818
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762 TTGTTTATGAAATATTTGGTAGAAGAATCATCTTTGAGAGGGCAGGTAAAATTGTGTGTA 2821
Query 2819 CACACAATGCGGTTATGTCAAATAGCAGTTGGGTGTGACTCAGACGATTGTGTCGACACT 2878
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2822 CACACAATGCGGTTATGTCAAATAGCAGTTGGATGTGACTCAGACGATTGTGTCGACACT 2881
Query 2879 GTTAGTCTTCTGGATTTGCTGCATCTATTCAAGAGCCATGTAGTATTCAACAATGAACTT 2938
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2882 GTTACTCTTCTGGATTTGCTGCATCTATTCAAGAGCCATGTAGTATTTAACAATGAACTT 2941
Query 2939 CTTCGCTACTACTTGTTCTGCATTTTTCAAATTCTCGCGGGAAGACCCCCAACGTTGTTT 2998
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2942 CTTCGCTACTACTTGTTCTGCATTTTTCAAATCCTCGCTGGAAGACCCCCAACGTTGTTC 3001
Query 2999 GGTGTGCCCAAAGAAAAACCTTTGCAGCTTGTTGATGTGGAGGCCTGCATTGAGCCGAAA 3058
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3002 GGAGTTCCCAAAGAAAAACCTTTGCAGCTTGTTGATGTGGAGGCCTGCATTGAACCGAAA 3061
Query 3059 AATGTATTTTCGGTTCCGGGAACAGAGGCAGGGGAGCCTTCACT---GGCACTTGGAGAT 3115
|||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3062 AATGTATTTTTGGTTCCCGGAGCAGAGGCAGGGGAGCCTTCACTTTCGGCACTTGGAGAT 3121
Query 3116 GCCAACGGACAATCGCTGGATGTTGCTCCTTATGGTGTTCCAATAAGACCACAGGAAATG 3175
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3122 GCCAAAGGACAATCGCTGGATGTTGCTCCTTATGGTGTTCCAATAATACCACAGGAAATG 3181
Query 3176 TTCATGCCTATTGTTCCTGAACTAAAGTTGCCAGAACCTGTTGCAGCGTATGATGAGACA 3235
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 TTCATGCCTATTGTTCCTGAACTGATGTTGCCAGAACCTGTTGCAGCGTATGATGAGACA 3241
Query 3236 CAGCATCTTGAACCTCGCATGGAAAGTCAAAACCAACCTTCACATGAAAATCCCATCGTT 3295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3242 CAGCATCTTGAACCTCGCATGGAAAGTCAAAACCAACCTTCACATGAAAATCCCATCGTT 3301
Query 3296 CATGAGATTCCGTCGGATGGTGAAGGTCCAACAGAAGAATTCGCTAATAGGGAAGCAAAC 3355
||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 3302 CATGAGATTCCATCAGATGTTGAAGGTCCAACAGAAGAATTAGCTCATAGGGAAGCAAAC 3361
Query 3356 CCTCCAACAAAGGAACCTCAAAAAGAACCTGATGTGGTTTCTGTGTCTGTTAGTCATGAG 3415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3362 CCTCCAACAAAGGAACCTCAAAAAGAACCTGATGTGGTTTCTGTGTCTGTTAGTCATGAG 3421
Query 3416 GTGAAGAAGTCTGTTATACGGATCAAGGTCAGACCATCTGGTGCAACCAGCAGAGCCGAG 3475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3422 GTGAAGAAGTCTGTTATACGGATCAAGGTCAGACCATCTGGGGCAACCAGCAGAGCGGAA 3481
Query 3476 GGATCAGCACGAACCATAGAAAGATCTCAAGGGATTGTGGTACGCCATGATATAGACAGA 3535
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3482 GGATCAGCACGAACTATAGAAAGATCTCAAGGGATTGTGGTACGCCATGATATAGACCGA 3541
Query 3536 GGACAAACTAGTTCAGCTTCAGTGGACGCCCCACAGAGAATCTCAACTGATGCTGTGAGC 3595
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3542 GGTCAAACTAGTTCAGCTTCAGTGGACGCCCCACAGAGAATCTCAACTGACGCTGTGAGC 3601
Query 3596 ATAAGCAATCAGAATCACGTGGAGGAAGTAAACTCGTGTCACGATGTTGGTTCTCGCATG 3655
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3602 ATAAGCAATCAGAATCACGTGGAGGAAGTAAATTCGTGTCACGATGTTGGTTCTCGCATG 3661
Query 3656 ACTGCGAGTATCGGCAGTGTAAAATTTGCAAGCGAAGGCGATACTTTTGGGAAAGAGTTG 3715
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3662 ACTGCAAGCATCGGCAGTGTAAAATTTGCAAGCGAAGGCGATATTTTTGGGAAAGAGTTG 3721
Query 3716 CAATGCACTGCTGAGTCTGGGAAAACTTCGACAAGCCAGAAAGCAGATAATAACAACCAA 3775
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3722 CAATGCACTGCTGAGTCTGGGAAACCTTCGACAAGCCAGAAAGCAGATAATAACAACCGA 3781
Query 3776 ACAGTAGCGCCTAGCATCTTACCACTAGACCATAGTATGGAAAACGAGGCACAGCAGAAA 3835
|| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3782 ACTGTACCACCTAGCTTCTTACCACTAGACCACAGTATGGAAAACGAGGCGCAGCAGAAA 3841
Query 3836 TACGCGAGCCTTCAAACACTTTCGGTTGGTaaagaaaaggaaaagaagaaagacaaggaa 3895
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3842 TACGCGAGCCTCCAAACACTTTCGATTGGTAAAGAAAAGGAAAAGAAGAAAGACAAGGAA 3901
Query 3896 aagaaagagaagaagaggaaaagagaagaccccgtttatctagagaagaaaagattaaag 3955
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 3902 AAGAAAGAGAAGAAGAGGAAAAGAGAAGATCCCGTTTATCTAGAGAAGAAACGGTTAAAG 3961
Query 3956 aaagagaagaaacgaaaggagaaggaaaTGGCGAAGCTCGTGAGCAGCTCTTCAGATCCA 4015
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||
Sbjct 3962 AAAGAGAAGAAACGAAAGGAGAAGGAAATGGCGAAGCTCGTGAGCAGCACTACGGATCCA 4021
Query 4016 GCTACAAAGAAGATAGAGAGTGTAGCGGAGGCTAAAGCAGAAGAAGCAAGTGATGGTGCC 4075
|||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4022 GCTAAAAAGAAGATAGAGAGTGTTGCGGAGGTTAAAGAAGAAGAACCAAGTGATGGTGCC 4081
Query 4076 ATGTTGATTAAGGTTGAACCAAAGGCTGAGCCATCAGCAGCAACAGAAGCTCGTCCGCTT 4135
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| | ||||||
Sbjct 4082 ATGTTGATTAAGGTTGAACCAAAGACTGAACCATCAACAGCA---GAAGCTAGACCGCTT 4138
Query 4136 CCCAAATTCAGAATCAAACTGAAAAGCAAAGCGTTCAACAACTCATAAGGTAAGATCCGA 4195
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4139 CCCAAATTCCGAATCAAACTGAAAAGCAAAGCGTTCAACAACTCATAAGGTTAGATCCGA 4198
Query 4196 GCCAGTCTCTCCC-GCGAATATCTGAGTAGTA-CTTAGATTTCCAAAAGCTTTGTTGTTG 4253
||||||| ||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4199 GCCAGTCCCTCCCCGCCAAAATCTGAGTAGTAACTTTTATTTCCAAAAGCTTTGTTGTTA 4258
Query 4254 CAACTTGCAAGGTGT 4268
|||||||||||||||
Sbjct 4259 CAACTTGCAAGGTGT 4273
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 212758005263
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5