BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476563
Length=4544
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G74260.1 | Symbols: PUR4 | purine biosynthesis 4 | chr1:2792... 7432 0.0
> AT1G74260.1 | Symbols: PUR4 | purine biosynthesis 4 | chr1:27922833-27927904
REVERSE LENGTH=4536
Length=4536
Score = 7432 bits (4024), Expect = 0.0
Identities = 4379/4551 (96%), Gaps = 22/4551 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGAGGAGAGACCAGACAAGAACTGTGTGTCGACTGCCGTACTCTCGGAGTCGGAGCTTC 60
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGAAGAGAGACCAGACAAGAACTCTGTGTCGACTGCCGTACTCTCGGAGTCGGAGCTTC 60
Query 61 GGTCCCGTTAAGACAGTAAAACAGAAAAACCCTAAACCGCT-TTTTCACTTTGTTTGCTG 119
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGTCCCGTTAAGACAGTAACAGAGAAAAACCCTAAACC-CTCTTTTCACTTTGTTTGCTG 119
Query 120 TTCCTGTCATCTCTGGCGACGATGAATACCTCCCAAGCAACTCGTGCGGCTCTGTTCCTA 179
|||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 120 TTCCGGTCATATCTCGCGACGATGAATACCTCCCAAGCAACTCGTGCGGCTCTGTTTCTA 179
Query 180 AACGGTTCCAATAGACAAGCAATGCTTTTGCAGAGATGCCAGAGAAGCTCAACAAGTCAA 239
|||||||||||||||||||| |||||||||| | | | | | ||||||| ||||||
Sbjct 180 AACGGTTCCAATAGACAAGCGATGCTTTTGC----A-G-C-G-G-AGCTCAATGAGTCAA 230
Query 240 TTGTGGGGTTCTGTTGGAATGAGAACTTCACGGTTGTCTCTGAATCGAACTAAAGCTGCT 299
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 231 TTGTGGGGTTCTGTTAGAATGAGAACTTCACGGCTGTCTCTGAATCGAACAAAAGCTGTT 290
Query 300 AGCTTGAGATGTTCTGCTCAACCTAATAAGCCGAAAGCAGCTGTTTCTACTGGTTCTTTT 359
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 AGCTTGAGATGTTCTGCTCAACCTAATAAACCTAAAGCAGCTGTTTCTACTGGTTCTTTT 350
Query 360 GTTTCTGCTGATGAGCTACCGAGCTTGGTTGAGAAACCTGCTGCTGAGGTTATCCATTTC 419
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 GTTACTGCTGATGAGCTACCAAGCTTGGTTGAGAAACCTGCTGCTGAGGTTATCCATTTT 410
Query 420 TATCGCGTGCCTTTGATTCAAGAAAGTGCAAACGCGGAACTCCTCAAGGCGGTTCAAACC 479
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 411 TATCGCGTGCCTTTGATTCAAGAAAGCGCGAACGCGGAACTCCTCAAGGCTGTTCAAACC 470
Query 480 AAAATCGGCAACCAGATTGTCTGTTTGACCACAGAACAGTGTTTCAATATCGGGCTTGAA 539
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 471 AAAATCAGCAACCAGATTGTCAGTTTGACTACAGAACAGTCTTTCAATATTGGGCTTGAA 530
Query 540 TCCAAGTTAAAAGACGAAAAGCTTTCTGTTCTGAAGTGGATTCTTCAAGAAACATATGAG 599
|||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 TCCAAGTTAAAAGATGAAAAACTTTCTGTTCTAAAGTGGATTCTTCAAGAAACATATGAG 590
Query 600 CCAGAGAATTTAGGTACGGATAGTTTTCTTGAGAGGAAGAAGCAAGAAGGACTCCATGCT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 CCAGAGAATTTAGGTACGGATAGTTTTCTTGAGAGGAAGAAGCAAGAAGGACTCCATGCT 650
Query 660 GTAATTGTTGAAGTTGGTCCCAGATTGTCTTTTACAACAGCATGGTCCACCAATGCGGTT 719
|| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 GTTATTGTTGAAGTTGGCCCCAGATTGTCTTTCACAACAGCATGGTCCACCAATGCGGTT 710
Query 720 TCGATATGTAAAGCATGTGGGTTAAACGAGGTGACTCGCTTAGAAAGGTCGAGGAGATAT 779
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 711 TCGATATGTAGAGCATGTGGGTTAGACGAGGTGACTCGCTTGGAAAGGTCAAGGAGGTAC 770
Query 780 CTTTTGTTCAGCAAGGAGCCACTGTTAGAAAATCAAATAAAGGAATTTGCTGCAATGGTT 839
||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 771 CTTTTGTTCAGCAAGGAGCCACTTTTGGAAAATCAGATAAAAGAATTTGCTGCAATGGTT 830
Query 840 CACGACAGAATGACCGAGTGTGTGTACTCCCAAAGGCTGGTTTCATTTGAGACAAATGTG 899
|| || |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 831 CATGATAGAATGACCGAGTGCGTGTACACTCAAAAGCTGGTTTCATTCGAGACGAATGTG 890
Query 900 GTTCCAGAGGAAGTAAAGTATGTGCCTGTGATGGAGAAGGGTCGGAAGGCGCTGGAAGAA 959
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 GTTCCAGAAGAAGTGAAGTATGTGCCTGTGATGGAGAAGGGTCGGAAGGCGCTGGAAGAA 950
Query 960 ATCAACCAGGAGATGGGTTTAGCCTTTGATGAGCAAGATTTGCAGTATTATACTAGACTT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 ATCAACCAGGAGATGGGTTTAGCCTTTGATGAGCAAGATTTGCAGTATTATACTAGACTT 1010
Query 1020 TTCAGAGAGGACATTCAGCGTGATCCTACCAATGTGGAGCTATTTGATATCGCCCAATCC 1079
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1011 TTCAGAGAGGACATTAAGCGTGATCCTACCAATGTGGAGCTATTTGATATCGCTCAATCC 1070
Query 1080 AACAGCGAGCACAGTCGACACTGGTTCTTTGCTGGGAACATGGTTATTGATGGAAAGCCA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 AACAGCGAGCACAGTCGACACTGGTTCTTTGCTGGGAACATGGTTATTGATGGAAAGCCA 1130
Query 1140 ATGGATAGGTCTCTTATGCAGATTGTAAAGAGCACTTGGGAGGCAAATCGAAATAATTCT 1199
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 ATGGATAAGTCTCTTATGCAGATTGTAAAGAGCACTTGGGAGGCAAATCGAAATAATTCT 1190
Query 1200 GTCATTGGGTTTAAGGATAACTCTAGTGCTATTAGAGGCTTTCTGGTGAACCAGCTACGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 GTCATTGGGTTTAAGGATAACTCTAGTGCTATTAGAGGCTTTCTGGTGAACCAGCTACGG 1250
Query 1260 CCTCTACTCCCTGGTTCTGTGTGCCTACTTGATGTCAGTGCACGTGATCTCGACATATTG 1319
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 CCTCTACTTCCTGGTTCTGTGTGCTTACTTGATGTCAGTGCACGTGATCTCGACATATTG 1310
Query 1320 TTTACTGCTGAGACCCATAATTTCCCTTGTGCTGTGGCTCCTTATCCTGGTGCTGAGACA 1379
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 TTCACTGCTGAAACCCATAATTTCCCTTGTGCTGTGGCTCCTTATCCTGGTGCTGAGACA 1370
Query 1380 GGTGCTGGAGGTCGAATCAGGGATACACATGCAACAGGAAGAGGTTCTTTTGTGGTTGCA 1439
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 GGTGCTGGAGGTCGAATCAGAGATACACATGCAACAGGAAGAGGTTCTTTTGTGGTTGCA 1430
Query 1440 TCCACTTCTGGTTACTGTGTTGGTAACCTTAACATGGAGGGATCTTATGCTCCATGGGAA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 TCCACTTCTGGTTACTGTGTTGGTAACCTTAACATGGAGGGATCTTATGCTCCATGGGAA 1490
Query 1500 GACTCGTCTTTCCAATACCCATCGAACCTAGCGTCACCTCTACAGATACTCATCGACGCT 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 GACTCGTCTTTCCAATACCCATCGAACCTAGCATCACCTCTACAGATACTCATCGACGCT 1550
Query 1560 AGTAATGGTGCGTCTGACTATGGGAACAAATTCGGAGAGCCCATGATTCAGGGATATACC 1619
||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 AGTAATGGTGCATCTGACTATGGTAACAAATTTGGAGAGCCCATGATTCAGGGATATACT 1610
Query 1620 AGGACTTTTGGAATGAGACTTCCAAGTGGGGATAGACGAGAATGGTTGAAGCCGATTATG 1679
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 AGGACTTTTGGAATGAGACTGCCAAGTGGGGATAGACGAGAATGGTTGAAGCCGATTATG 1670
Query 1680 TTCAGTGCAGGGATTGGACAGATTGATCATACTCATATAACTAAAGGGGAGCCAGAGGTT 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 TTCAGTGCAGGGATTGGACAGATTGATCATACTCATATAACTAAAGGGGAGCCAGAGGTT 1730
Query 1740 GGGATGCTTGTTGTTAAGATTGGTGGACCTGCTTACCGCATTGGCATGGGAGGAGGAGCA 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 GGGATGCTTGTTGTTAAGATTGGTGGACCTGCTTACCGCATTGGCATGGGAGGAGGAGCA 1790
Query 1800 GCTTCGAGTATGGTTAGTGGTCAGAATGATGCAGAGCTTGATTTCAATGCTGTGCAACGT 1859
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 GCTTCGAGTATGGTTAGTGGCCAGAATGATGCAGAGCTTGATTTCAATGCTGTGCAACGT 1850
Query 1860 GGAGATGCTGAGATGTCTCAGAAGTTGTACCGTGTTGTCCGTGCTTGTATTGAGATGGGT 1919
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAGATGCTGAAATGTCTCAGAAGTTGTACCGTGTTGTTCGTGCTTGTATTGAGATGGGT 1910
Query 1920 GAGAAGAATCCCATTATCAGCATTCATGATCAAGGTGCTGGTGGAAACTGCAATGTTGTC 1979
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 GAGAAGAATCCTATTATCAGCATTCATGATCAAGGTGCTGGTGGAAACTGCAATGTTGTC 1970
Query 1980 AAAGAGATTATTTATCCACAGGGTGCAGAGATCGACATAAGAGCGGTTGTTGTGGGTGAT 2039
|| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 AAGGAAATTATTTATCCACAGGGTGCAGAGATTGACATAAGAGCGGTTGTTGTGGGTGAT 2030
Query 2040 CATACTATGTCGGTGTTGGAGATTTGGGGAGCAGAATATCAAGAGCAAGATGCGATTTTG 2099
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 CATACTATGTCGGTGTTGGAGATATGGGGAGCAGAATATCAAGAGCAAGATGCGATTTTG 2090
Query 2100 GTGAAAGCTGAGAGTCGGGAGATTTTGCAATCGATCTGTAAGAGGGAAAGGCTTTCGATG 2159
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 GTGAAAGCTGAGAGCCGGGAGATTTTGCAATCAATCTGTAAGAGGGAAAGGCTTTCGATG 2150
Query 2160 GCTGTGATTGGAACAATTAATGGGGGAGGTCGCTGTACTTTAATTGACAGCACAGCTGCA 2219
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151 GCTGTGATTGGAACAATTAATGGGGGTGGTCGCTGTACTTTAATTGACAGCACAGCTGCA 2210
Query 2220 GCGAAGTGCAGTAAAGAAGGGCTACCTCCACCTCCACCTGCTGTGGATCTTGAACTCGAG 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 GCGAAGTGCAGTAAAGAAGGGCTACCTCCACCTCCACCTGCTGTGGATCTTGAACTCGAG 2270
Query 2280 AAGGTTCTTGGTGATATGCCTAAGAAGACGTTTGAGTTCAACCGCATTGCTTATGCACGG 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271 AAGGTTCTTGGTGATATGCCTAAGAAGACGTTTAAGTTCAACCGCATTGCTTATGCACGG 2330
Query 2340 GAGCCACTTGATATTGCTCCTGGTATTACATTGATGGATTCTTTGAAAAGGATG-T-TGC 2397
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | | | |
Sbjct 2331 GAGCCACTTGATATTGCTCCTGGAATTACATTGATGGATGCTTTGAAAA-GA-GTTCTCC 2388
Query 2398 GATTACCATCAGTTTCTTCGAAA-CGGTTCTTGACAACCAAAGTGGATAGATGTGTGACA 2456
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2389 GATTACCATCAGTTTCTTC-AAAGCGGTTCTTGACAACCAAAGTGGATAGATGTGTGACA 2447
Query 2457 GGTCTTGTTGCCCAGCAGCAAACAGTTGGACCATTGCAGATCACACTTGCTGATGTTGCA 2516
||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2448 GGTCTTGTTGCTCAGCAACAAACAGTTGGGCCATTGCAGATCACGCTTGCTGATGTTGCA 2507
Query 2517 GTTATTGCACAGACATTCACAGATATAACAGGTGGTGCGTGTGCTATTGGCGAGCAACCG 2576
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2508 GTTATTGCACAGACATTCACAGATCTAACAGGTGGTGCATGTGCCATTGGTGAGCAACCG 2567
Query 2577 ATCAAAGGCTTGCTTGATCCAAAAGCCATGGCTAGACTAGCTGTTGGAGAGGCTTTGACA 2636
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2568 ATCAAAGGCTTGCTTGATCCAAAAGCCATGGCTAGGCTAGCTGTTGGAGAGGCTTTGACA 2627
Query 2637 AATCTGGTTTGGGCAAAGGTCACTGCACTTTCTGATGTTAAAGCCAGTGGTAACTGGATG 2696
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2628 AATCTGGTTTGGGCAAAGGTCACTGCACTTTCTGATGTTAAAGCTAGTGGTAACTGGATG 2687
Query 2697 TATGCTGCCAAGCTTGAAGGAGAAGGATCAGCGATGTATGATGCTGCGATTGCTCTATCT 2756
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 TATGCTGCCAAGCTTGAAGGAGAAGGATCAGCAATGTATGATGCTGCGATTGCTCTATCT 2747
Query 2757 GAAGCGATGATTGAACTTGGCATTGCAATTGATGGTGGAAAAGACAGTCTTTCAATGGCA 2816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 GAAGCGATGATTGAACTTGGCATTGCAATTGATGGTGGAAAAGACAGTCTTTCAATGGCA 2807
Query 2817 GCTCATGCAGACGGTGAGGTTGTTAAAGCTCCAGGAAATCTTGTGATTAGTGCCTATGTT 2876
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 GCTCATGCGGACGGTGAGGTTGTTAAAGCTCCAGGAAATCTTGTGATTAGTGCCTATGTT 2867
Query 2877 ACATGTCCAGACATAACAAAGACAGTGACTCCGGATCTAAAGCTAGGAGGTGATGATGGT 2936
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2868 ACCTGTCCAGACATAACAAAGACAGTGACTCCGGATCTAAAGCTCGGAGGTGATGATGGT 2927
Query 2937 ATTCTCTTGCATGTTGATTTGGCAAAGGGAAAGCGGAGATTAGGTGGATCTGCACTGGCT 2996
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2928 ATTCTCTTGCATGTTGATTTGGCAAAGGGAAAGAGGAGATTGGGTGGATCTGCACTGGCT 2987
Query 2997 CAGGTTTTCGGTCAGATTGGAAACGACTGTCCTGATCTTGATGATGTTCCATATCTGAAA 3056
|||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2988 CAGGTTTTTGGTCAGATAGGAAATGACTGTCCTGATCTTGATGATGTTCCATATCTGAAA 3047
Query 3057 AACGTTTTCGAGGGCATTCAAGCTCTCATTGCAGAAAACTTGGTATCTGCTGGACATGAC 3116
||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3048 AACGTTTTCGATGGCGTTCAAGCTCTCATTGCAGAAAACTTGGTATCTGCTGGACACGAC 3107
Query 3117 ATCAGTGATGGTGGACTAGTTGTAACAGCTTTGGAAATGGCTTTTGCGGGAAACAAAGGT 3176
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3108 ATCAGTGATGGTGGACTGGTAGTAACAGCTTTGGAAATGGCTTTTGCTGGAAACAAAGGT 3167
Query 3177 ATAAATCTCGACTTGGCTTCGAATGGAATTAGCCTTTTTGAGACTTTGTTTTCTGAAGAA 3236
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 ATAAATCTCGACTTGGCTTCAAATGGAATTAGCCTTTTTGAGACTTTGTTTTCTGAAGAA 3227
Query 3237 CTTGGTCTCGTGATGGAGATTAGTAAGACAAACTTAGACGCTGTGATGGAAAAACTCTGT 3296
|||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3228 CTTGGTCTCGTGCTTGAGATTAGTAAGACAAACCTGGACGCTGTGATGGAAAAACTCCGT 3287
Query 3297 GGTTTCAATGTTACTGCTGAGATCATTGGAAATGTCACTGATTCGCCTATGATAGAGGTA 3356
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3288 GCTTTCGATGTTACTGCTGAGATCATTGGAAATGTCACTGATTCGCCTCTGATAGAGGTA 3347
Query 3357 AAAGTGGATGGGATTACTCATTTGAGTGAGAAAACTTCATTCCTAAGAGACATGTGGGAA 3416
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3348 AAAGTGGATGGGATTACTCATTTGAGTGAGAAAACTTCATTCCTCAGAGACATGTGGGAA 3407
Query 3417 GACACCAGTTTCCAGCTAGAAAAGCTGCAAAGATTGGCATCTTGTGTAGAGATGGAGAAA 3476
||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 GACACCAGTTTCCAGTTGGAAAAGCTGCAACGATTGGCATCTTGTGTAGAGATGGAGAAA 3467
Query 3477 GACGGTTTGAAGTTTAGGCATGAGCCTACTTGGAAACTCTCATTTACTCCTTCCTCGACC 3536
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3468 GAAGGTTTGAAGTTTAGGCATGAGCCTAATTGGAAACTCTCATTTATTCCATCCTCGACC 3527
Query 3537 AACAATAAATATATGTCTCAAGATGTTAAGCCAAAAGTAGCAGTGATCCGAGAGGAAGGC 3596
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3528 AACAATAATTATATGTCTCAGGATGTTAAGCCAAAAGTAGCAGTGATCCGAGAAGAAGGC 3587
Query 3597 AGCAATGGAGACAGAGAAATGTCAGCTGCATTTTATGCTGCCGGTTTTGAACCTTGGGAC 3656
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3588 AGCAATGGAGACAGAGAAATGTCAGCTGCATTTTACGCTGCCGGTTTTGAACCTTGGGAC 3647
Query 3657 GTGACAGTGTCTGATCTTCTAGCCGGAGATATCACCCTTGACCAGTTCCGCGGTATTGTG 3716
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3648 GTGACAGTGTCTGATCTTCTAGCTGGAGACATCACCCTTGATCAGTTCCGCGGTATTGTG 3707
Query 3717 TTTGTGGGAGGGTTCAGTTATGCAGATGTTCTCGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCA 3776
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3708 TTTGTGGGAGGGTTCAGTTATGCGGATGTTCTCGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCA 3767
Query 3777 ATAAGGTTCAATGAGCCTGTGTTGAGTCAATTTCAGGAGTTCTACAAAAGACCAGACACG 3836
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3768 ATAAGGTTCAACGAGCCTGTGTTGAGTCAATTTCAGGAGTTCTACAAAAGACCAGACACG 3827
Query 3837 TTCAGTCTTGGAATCTGCAATGGATGTCAGTTAATGGCTCTGTTAGGATGGGTTCCAGGT 3896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3828 TTCAGTCTTGGAATCTGCAATGGATGTCAGTTAATGGCTCTGTTAGGATGGGTTCCAGGT 3887
Query 3897 CCTCAAGTTGGCGGGTCACTTGACACCTCGCAGCCGAGGTTTGTTCACAACGAATCAGGA 3956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3888 CCTCAAGTTGGCGGGTCACTTGACACCTCGCAGCCGAGGTTTGTTCACAACGAATCAGGA 3947
Query 3957 AGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACTATAAAGGACTCGCCATCGATAATGCTGAAA 4016
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3948 AGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCATAAAGGACTCGCCATCGATAATGCTGAAA 4007
Query 4017 GGAATGGAGGGAAGTACTTTAGGGGTTTGGGCGGCACACGGAGAAGGTCGGGCTTATTTC 4076
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4008 GGAATGGAGGGAAGTACTTTAGGGGTTTGGGCGGCGCACGGAGAAGGACGGGCTTATTTC 4067
Query 4077 CCAGACGAAGGAGTCTTGGACCATATGCTTCACTCAGATTTGGCACCATTGAGATACTGT 4136
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4068 CCGGACGAAGGAGTCTTGGACCATATGCTTCACTCAGATTTGGCACCATTGAGATACTGT 4127
Query 4137 GATGATGATGGGAACGTGACTGAAGCGTACCCTTTTAACCTCAATGGTTCACCGTTGGGA 4196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4128 GATGATGATGGGAACGTGACTGAAGCGTACCCTTTTAACCTCAATGGTTCACCGTTGGGA 4187
Query 4197 ATAGCGGCTATATGTTCACCTGATGGGAGACATTTAGCGATGATGCCTCATCCTGAACGT 4256
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4188 ATAGCGGCTATATGTTCACCTGATGGGAGACATTTGGCGATGATGCCTCATCCTGAACGT 4247
Query 4257 TGTTTCTTGATGTGGCAGTTTCCATGGTACCCAACAAGCTGGGACGTTGAGAAAGCTGGG 4316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4248 TGTTTCTTGATGTGGCAGTTTCCATGGTACCCAACAAGCTGGGACGTTGAGAAAGCTGGC 4307
Query 4317 CCGAGTCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGCAAGGGACTGGTTAGAGTCATGTTAAGCC 4376
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4308 CCGAGCCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGCAAGGGACTGGTTAGAGTCGTGTTAAGCG 4367
Query 4377 TGTTTCTTAA-TATAATTTTTATCTGCA-CGATTTTATTGTGCATTTGGTGTTTTGCAGA 4434
||||| || | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4368 TGTTTTTTTAGTATAATTTTTATCTGCATC-ATTTTGTTGTGCATTTGGTGTTTTGCAGA 4426
Query 4435 GTCTTTGAAAGTTGTCGACAAATCATGTGCTTTT-AGTGAGACTTGATGAGTGCTTTTTG 4493
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4427 GTCTTTGAAAGTTGTCGACAAATCATGTGCTTTTTAGTGAGACTTGATGTGTGCTTTTTG 4486
Query 4494 TCCTTCACGTTGTATTTAAATTCTGGAAATTTAAGTATGAGTTACTCTCTT 4544
|||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 4487 TCCTTCACGTTGTATTCAAACTCTGGAAATT-AAGCATGAGTTACTCTCTT 4536
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 226604081531
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5