BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476612
Length=2538
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 3884 0.0
AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 1738 0.0
> AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr1:28086800-28089367 FORWARD LENGTH=2568
Length=2568
Score = 3884 bits (2103), Expect = 0.0
Identities = 2426/2576 (94%), Gaps = 46/2576 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCCAGATCCTTTTTTCTTAGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCAAGATCATTTTTTCTTAGT 60
Query 61 GGAACGAGACCTAGTGCTGGTGATGGAAATTCTTGTACATGCGCTGAGGATGAAAGTTGC 120
||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 61 GGATCGAGACCGAGTGCTGCTGATGGAAATTCTTGTACATGTGCTGAGGATGAAAGTGGC 120
Query 121 GTCTCAAAACGCCAACAAATTAGGACTGAAGTTGTACAAACTGG-AAAGAAAGTATCTAA 179
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||
Sbjct 121 GTCTCGAAACGCCAGCAAATTAGGACTGAAGTTGTACAGACTGGTAAA-AGAGCATCTAA 179
Query 180 TCTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAATATATTACCAGTAGAGTCTTGTAAACCGCCGGTGGT 239
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||
Sbjct 180 TTTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAGTATATTACCAGTAGAGGCTGGTAAACCGCTGGTGGT 239
Query 240 CCCGAAGTCGGTTGAGCATTTCACTCGACCATTGCTTCTTCCGCAGCATGTATCCTCTCC 299
||| ||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 240 CCCAAAGACGGTTGAGCATTTCACCCGGCCATCGCTTCTTCCGCAACATGTTTCCTCTCC 299
Query 300 TGCTTTGCC--GG---G--GA------AAA-CA-GATTCTGCTATTATTAAAGATGATGT 344
||||||||| || | || ||| || | |||||||||||||||||| || ||
Sbjct 300 TGCTTTGCCAGGGAAAGCAGATTCTGTAAATCATGCTTCTGCTATTATTAAAGAAGACGT 359
Query 345 GGGGGCACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGCTGGTAATGGTATTGGAACTGTAAATTT 404
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 360 GGGGGTACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGC------TGGTATTGGAAATGTAAATTT 413
Query 405 ATTGTCAGATGTAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTCGGTTT 464
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 414 ATTGTCAGATATAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTTGGTTT 473
Query 465 GCCTAAAAGCTGTTTGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTCGA-GTGTAAAGTCTTCAAATG 523
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 474 GCCTAAAAGCTGTATGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTC-AGGTGTAAAGTCTTCAAATG 532
Query 524 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTACCCTAGGTCCGCAGACCGAGTTG 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 533 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTATCCTAGGTCCGCTGACCGAGTTC 592
Query 584 CTATAAACAGCTCTCCAAGTA-T---TAA-C--C-AA-G-CG-T-C-----A----TTTG 622
||||||||||||||||| ||| | || | | || | || | | | ||||
Sbjct 593 CTATAAACAGCTCTCCAGGTACTAAGCAAGCTTCAAATGACGTTGCTGGGAAGTCGTTTG 652
Query 623 AAGCTCATGATTTACTCTCAAACACTGCCTCTGGAAAGAGGAAAAGCATGCCACAAAGAA 682
||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 653 AAGCTCATGATTTACTCTCTAACAATGTCTCTGGAAAGAGGAAAATCATGCCACAAAGAC 712
Query 683 CCTATATTGATTCAACCAGGTATGCATCTGGTGGTTGTGACTATAATGTGCATTCTTCGG 742
|||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 713 CCTATACTGATTCAACCAGGTATGCGTCGGGTGGTTGTGACTATAGTGTGCATTCTTCGG 772
Query 743 ATGACAGAACGATAATATCCTCTGTTGAAGGTTTCGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 802
||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 ATGACAGGACGATAATATCTTCTGTTGAAGGTTTTGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 832
Query 803 GAGTGACTCCAGGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGTATTGTAACCCTGGATACGTTGTAG 862
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 833 AAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAACCCTGGATATGTTGTAG 892
Query 863 AAAATGTTTCTGGTATATTGCGGAGATTCAAATGGGGACATGCTGCTGAAGAGGCCCTTC 922
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 893 AAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAGTGGGGACATGCTGCCGAAGAGGCCCTTC 952
Query 923 ACAATTTCGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 982
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 ACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 1012
Query 983 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATG 1042
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1013 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTCAAGCATG 1072
Query 1043 ACGGGCATACTTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGCGA 1102
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1073 ATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGAGA 1132
Query 1103 TAAACAGGCTTCTTGATGAGATGGTTAAAGATGGATGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1162
|||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 TAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1192
Query 1163 ACCGGCTCATCCATAGCTACGGCCGTGCAAATTACCTCAATGAAGCTATGAATGTTTTTA 1222
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1193 ACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAAAGAAGCGATGAATGTTTTTA 1252
Query 1223 AGCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGACA 1282
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1253 ATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGATA 1312
Query 1283 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTGGACATTGCCTTGGACATGTACCAAAGAATGCAAGCAG 1342
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1313 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATATGTACCAAAGAATGCAAGAAG 1372
Query 1343 CAGGGCTTTCTCCTGATACTTTCACCTACAGTGTTATAATAAATTGTCTTGGAAAAGCGG 1402
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1373 CAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAATAAACTGTCTTGGAAAAGCGG 1432
Query 1403 GCCACTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACCCCTA 1462
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1433 GCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACTCCTA 1492
Query 1463 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1552
Query 1523 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACATACA 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1553 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACCTACA 1612
Query 1583 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTTG 1642
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1613 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTCG 1672
Query 1643 CTGAGATGCAATGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1702
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 CTGAGATGCAACGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1732
Query 1703 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTGGAAAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCACG 1762
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1733 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCAAG 1792
Query 1763 CCGGTCTGCAACCTAATGTTCCCACATGCAATTCCCTTCTCAGCACACTCCTTAGGGTTC 1822
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1793 CCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCTTCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCC 1852
Query 1823 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1912
Query 1883 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1972
Query 1943 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGCCATCCGGCTCACATGTTTCTCCTCA 2002
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1973 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGTCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCA 2032
Query 2003 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2092
Query 2063 ATTTTATGCACAGTGAGGATAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2122
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 ATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2152
Query 2123 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGTTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGTTA 2182
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2153 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTA 2212
Query 2183 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATAAATCTCC 2242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2213 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCC 2272
Query 2243 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCTAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2332
Query 2303 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGAATGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2362
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2392
Query 2363 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2452
Query 2423 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACGGAGAACGGGAACTCGGGCTGTTTTGTAGGATGCGGAG 2482
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2453 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACTGAGAACGGGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAG 2512
Query 2483 AGCCTCTCAAGAAGTGGTTGCTTGAATCATATGTCGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2538
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 AGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAATCATATGTTGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2568
> AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr1:6528984-6532614 FORWARD LENGTH=3156
Length=3156
Score = 1738 bits (941), Expect = 0.0
Identities = 1486/1750 (85%), Gaps = 34/1750 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 772 GGTTTCGGTAAACCCTCAAG-GGAAATGATGAGAGTGA-CTCCAGGGACTGCTCCAACAC 829
|||||| |||| | || || ||||||||||| || || || |||||||||||| |||
Sbjct 1239 GGTTTCAGTAATTCTTC-AGTGGAAATGATGAAAG-GACCTTCAGGGACTGCTCTGACAT 1296
Query 830 CTAGGCAGTATTGTAA-CCCTGGATACGTTGTAGAAAATGTTT-CTG-GTATATTGCGGA 886
| || ||||||||||| || ||| || |||| |||||||||| | | || | || || |
Sbjct 1297 CAAGACAGTATTGTAATTCC-GGACACATTGTGGAAAATGTTTCCAGCGT-T-TTACGAA 1353
Query 887 GATTCAAATGGGGACATGCTGCTGAAGAGGCCCTTCACAATTTCGGTTTCAGGATGGATG 946
|||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |
Sbjct 1354 GATTCAGGTGGGGGCCTGCTGCTGAAGAGGCCCTTCAAAATCTAGGTTTGAGGATAGACG 1413
Query 947 CATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATAATTATGCG-AATGCGCTTGGTTTC 1005
|||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||| | ||||| |||||||||
Sbjct 1414 CATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAGCAGATGAATGACTATG-GAAATGCTCTTGGTTTC 1472
Query 1006 TTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATGACGGGCATACTTATACCACTATG 1065
||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 TTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATG 1532
Query 1066 GTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGCGATAAACAGGCTTCTTGATGAGATG 1125
|| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||
Sbjct 1533 GTTGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATTTGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATG 1592
Query 1126 GTTAAAGATGGATGTAAGCCAAATACTGTTACATATAACCGGCTCATCCATAGCTACGGC 1185
|||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||
Sbjct 1593 GTTAGAGATGGATGTCAGCCAAACACAGTTACATATAACCGACTTATCCACAGCTATGGC 1652
Query 1186 CGTGCAAATTACCTCAATGAAGCTATGAATGTTTTTAAGCAGATGCAAGAGGCTGGTTGT 1245
||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||
Sbjct 1653 CGTGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAATGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGC 1712
Query 1246 GAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGACATCCATGCTAAAGCTGGATTTCTG 1305
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1713 AAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTTATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTT 1772
Query 1306 GACATTGCCTTGGACATGTACCAAAGAATGCAAGCAGCAGGGCTTTCTCCTGATACTTTC 1365
||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1773 GACATTGCCATGGATATGTACCAGAGAATGCAGGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTC 1832
Query 1366 ACCTACAGTGTTATAATAAATTGTCTTGGAAAAGCGGGCCACTTACCTGCTGCCCATAGG 1425
|| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | |
Sbjct 1833 ACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGGAAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAG 1892
Query 1426 CTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACCCCTAATTTGGTCACATTCAACATCATG 1485
||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 1893 CTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAAGGTTGTACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATG 1952
Query 1486 ATAG-CTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTGCGTTGAAGCTCTACAGAGACAT 1544
|| | | ||||||||||| ||| | || ||| ||| |||||||||||| ||| | |||||
Sbjct 1953 ATGGAC-TTGCATGCCAAAGCGAGAAACTATCAGAATGCGTTGAAGCTTTACCGTGACAT 2011
Query 1545 GCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACATACAGTATTGTTATGGAGGTACTTGG 1604
|||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 2012 GCAAAACGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGTGACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGG 2071
Query 1605 ACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTTGCTGAGATGCAA-TGTAAGAACT 1663
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || || |
Sbjct 2072 ACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGCTGTTTTCACCGAGATGCAACAG-AAAAATT 2130
Query 1664 GGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACTTGTGGGGAAAAGCTGGCAATG 1723
|| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 2131 GGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTTGGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATG 2190
Query 1724 TGGAAAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCACGCCGGTCTGCAACCTAATGTTC 1783
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||
Sbjct 2191 TGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAAGCAATGCTTCATGCTGGTCTGCGACCTAATGTTC 2250
Query 1784 CCACATGCAATTCCCTTCTCAGCACAC-TCCTTAGGGTTCACAGGAT-GTCTGAAGCCTA 1841
| |||||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||
Sbjct 2251 CTACATGCAACTCCCTTCTTAGTAC-CTTCCTTAGGGTTAACAAGATAG-CTGAAGCTTA 2308
Query 1842 TAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTTCTTTGCAGACATACACATT 1901
| | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2309 TGAGTTATTACAAAACATGCTGGCGCTTGGTCTACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTT 2368
Query 1902 GCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTC-AAACTTTGACATGGGCTTT-TGTGGCCAG 1959
|| ||||| |||||||| |||| ||| || |||| |||| ||||| ||| |||||||||
Sbjct 2369 ACTCTTGAGCTGTTGCACGGATGGTCGGTCAAAAC-TTGATATGGG-TTTCTGTGGCCAG 2426
Query 1960 CTAATGGC-AGTCTCAGGCCATCCGGCTCACATGTTTCTCCTCAAAATGCCACCTGCAGG 2018
| ||||| || | |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| ||
Sbjct 2427 TTGATGGCAAG-CACAGGTCATCCAGCACATATGTTTCTCCTCAAGATGCCAGCTGCGGG 2485
Query 2019 TCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTC-AGCAACTTCCTTGATTTTATGCACAGTG 2077
||| |||||| |||| ||||| | |||| | | ||| ||||| ||| ||||||| || |
Sbjct 2486 TCCGGATGGCGAAAACGTGCGCAACCATG-CGAACAATTTCCTGGATCTTATGCATAGCG 2544
Query 2078 AGGATAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATTTTCTCCACAAGTCAG 2137
|||| || |||||||||||||||||| |||| || || || || ||||| || ||||| |
Sbjct 2545 AGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGTGGTTGACTTTCTACATAAGTCCG 2604
Query 2138 GTCTAAAAGAAGAGGCTGGTTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGTTAAGAATGTGTATCCAG 2197
| | |||||||||||| || || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| |
Sbjct 2605 GGCAAAAAGAAGAGGCCGGATCTGTCTGGGAAGTTGCTGCACAAAAGAATGTGTTTCCTG 2664
Query 2198 ATGCATTGAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATAAATCTCCATGTAATGTCGGAAG 2257
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
Sbjct 2665 ATGCATTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATCAATCTCCATGTAATGTCAGAGG 2724
Query 2258 GAACTGCAGTCATCGCACTTTCTAGGACACTTGCATGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTTT 2317
|||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2725 GAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACGCTTGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTAGCTT 2784
Query 2318 CAGGAGA-ATGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGAAGTAGAGTC 2376
||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2785 CAGGA-ACTTGCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTC 2843
Query 2377 ACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACATATTCAACTTC-CC 2435
|| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||
Sbjct 2844 ACCGGTACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAGGAGCTGCTGAACATCTTTGG-TTCACC 2902
Query 2436 GTTTTTCACGGAGAACGGGAACTCGGGCTGTTTTGTAGGATGCGGAGAGCCTCTCAAGA- 2494
|||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| || |
Sbjct 2903 GTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCAGGTTGTTTCGTTGGAAGCGGAGAGCCTCTTAACAG 2962
Query 2495 AGTGGTTGCT 2504
| ||||||||
Sbjct 2963 A-TGGTTGCT 2971
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 125969193873
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5