BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg476612 Length=2538 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 3884 0.0 AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 1738 0.0 > AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | chr1:28086800-28089367 FORWARD LENGTH=2568 Length=2568 Score = 3884 bits (2103), Expect = 0.0 Identities = 2426/2576 (94%), Gaps = 46/2576 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCCAGATCCTTTTTTCTTAGT 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCAAGATCATTTTTTCTTAGT 60 Query 61 GGAACGAGACCTAGTGCTGGTGATGGAAATTCTTGTACATGCGCTGAGGATGAAAGTTGC 120 ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 61 GGATCGAGACCGAGTGCTGCTGATGGAAATTCTTGTACATGTGCTGAGGATGAAAGTGGC 120 Query 121 GTCTCAAAACGCCAACAAATTAGGACTGAAGTTGTACAAACTGG-AAAGAAAGTATCTAA 179 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||| Sbjct 121 GTCTCGAAACGCCAGCAAATTAGGACTGAAGTTGTACAGACTGGTAAA-AGAGCATCTAA 179 Query 180 TCTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAATATATTACCAGTAGAGTCTTGTAAACCGCCGGTGGT 239 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| Sbjct 180 TTTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAGTATATTACCAGTAGAGGCTGGTAAACCGCTGGTGGT 239 Query 240 CCCGAAGTCGGTTGAGCATTTCACTCGACCATTGCTTCTTCCGCAGCATGTATCCTCTCC 299 ||| ||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 240 CCCAAAGACGGTTGAGCATTTCACCCGGCCATCGCTTCTTCCGCAACATGTTTCCTCTCC 299 Query 300 TGCTTTGCC--GG---G--GA------AAA-CA-GATTCTGCTATTATTAAAGATGATGT 344 ||||||||| || | || ||| || | |||||||||||||||||| || || Sbjct 300 TGCTTTGCCAGGGAAAGCAGATTCTGTAAATCATGCTTCTGCTATTATTAAAGAAGACGT 359 Query 345 GGGGGCACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGCTGGTAATGGTATTGGAACTGTAAATTT 404 ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 360 GGGGGTACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGC------TGGTATTGGAAATGTAAATTT 413 Query 405 ATTGTCAGATGTAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTCGGTTT 464 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 414 ATTGTCAGATATAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTTGGTTT 473 Query 465 GCCTAAAAGCTGTTTGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTCGA-GTGTAAAGTCTTCAAATG 523 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 474 GCCTAAAAGCTGTATGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTC-AGGTGTAAAGTCTTCAAATG 532 Query 524 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTACCCTAGGTCCGCAGACCGAGTTG 583 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 533 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTATCCTAGGTCCGCTGACCGAGTTC 592 Query 584 CTATAAACAGCTCTCCAAGTA-T---TAA-C--C-AA-G-CG-T-C-----A----TTTG 622 ||||||||||||||||| ||| | || | | || | || | | | |||| Sbjct 593 CTATAAACAGCTCTCCAGGTACTAAGCAAGCTTCAAATGACGTTGCTGGGAAGTCGTTTG 652 Query 623 AAGCTCATGATTTACTCTCAAACACTGCCTCTGGAAAGAGGAAAAGCATGCCACAAAGAA 682 ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 653 AAGCTCATGATTTACTCTCTAACAATGTCTCTGGAAAGAGGAAAATCATGCCACAAAGAC 712 Query 683 CCTATATTGATTCAACCAGGTATGCATCTGGTGGTTGTGACTATAATGTGCATTCTTCGG 742 |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 713 CCTATACTGATTCAACCAGGTATGCGTCGGGTGGTTGTGACTATAGTGTGCATTCTTCGG 772 Query 743 ATGACAGAACGATAATATCCTCTGTTGAAGGTTTCGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 802 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 773 ATGACAGGACGATAATATCTTCTGTTGAAGGTTTTGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 832 Query 803 GAGTGACTCCAGGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGTATTGTAACCCTGGATACGTTGTAG 862 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct 833 AAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAACCCTGGATATGTTGTAG 892 Query 863 AAAATGTTTCTGGTATATTGCGGAGATTCAAATGGGGACATGCTGCTGAAGAGGCCCTTC 922 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 893 AAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAGTGGGGACATGCTGCCGAAGAGGCCCTTC 952 Query 923 ACAATTTCGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 982 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 953 ACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 1012 Query 983 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATG 1042 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1013 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTCAAGCATG 1072 Query 1043 ACGGGCATACTTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGCGA 1102 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1073 ATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGAGA 1132 Query 1103 TAAACAGGCTTCTTGATGAGATGGTTAAAGATGGATGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1162 |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1133 TAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1192 Query 1163 ACCGGCTCATCCATAGCTACGGCCGTGCAAATTACCTCAATGAAGCTATGAATGTTTTTA 1222 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 1193 ACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAAAGAAGCGATGAATGTTTTTA 1252 Query 1223 AGCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGACA 1282 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1253 ATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGATA 1312 Query 1283 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTGGACATTGCCTTGGACATGTACCAAAGAATGCAAGCAG 1342 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct 1313 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATATGTACCAAAGAATGCAAGAAG 1372 Query 1343 CAGGGCTTTCTCCTGATACTTTCACCTACAGTGTTATAATAAATTGTCTTGGAAAAGCGG 1402 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1373 CAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAATAAACTGTCTTGGAAAAGCGG 1432 Query 1403 GCCACTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACCCCTA 1462 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1433 GCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACTCCTA 1492 Query 1463 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1493 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1552 Query 1523 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACATACA 1582 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1553 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACCTACA 1612 Query 1583 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTTG 1642 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1613 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTCG 1672 Query 1643 CTGAGATGCAATGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1702 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1673 CTGAGATGCAACGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1732 Query 1703 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTGGAAAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCACG 1762 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1733 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCAAG 1792 Query 1763 CCGGTCTGCAACCTAATGTTCCCACATGCAATTCCCTTCTCAGCACACTCCTTAGGGTTC 1822 ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 1793 CCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCTTCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCC 1852 Query 1823 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1882 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1853 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1912 Query 1883 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1942 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1913 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1972 Query 1943 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGCCATCCGGCTCACATGTTTCTCCTCA 2002 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1973 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGTCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCA 2032 Query 2003 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2062 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2033 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2092 Query 2063 ATTTTATGCACAGTGAGGATAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2122 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2093 ATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2152 Query 2123 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGTTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGTTA 2182 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct 2153 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTA 2212 Query 2183 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATAAATCTCC 2242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| Sbjct 2213 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCC 2272 Query 2243 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCTAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2273 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2332 Query 2303 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGAATGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2362 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2333 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2392 Query 2363 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2393 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2452 Query 2423 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACGGAGAACGGGAACTCGGGCTGTTTTGTAGGATGCGGAG 2482 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 2453 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACTGAGAACGGGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAG 2512 Query 2483 AGCCTCTCAAGAAGTGGTTGCTTGAATCATATGTCGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2538 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2513 AGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAATCATATGTTGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2568 > AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | chr1:6528984-6532614 FORWARD LENGTH=3156 Length=3156 Score = 1738 bits (941), Expect = 0.0 Identities = 1486/1750 (85%), Gaps = 34/1750 (2%) Strand=Plus/Plus Query 772 GGTTTCGGTAAACCCTCAAG-GGAAATGATGAGAGTGA-CTCCAGGGACTGCTCCAACAC 829 |||||| |||| | || || ||||||||||| || || || |||||||||||| ||| Sbjct 1239 GGTTTCAGTAATTCTTC-AGTGGAAATGATGAAAG-GACCTTCAGGGACTGCTCTGACAT 1296 Query 830 CTAGGCAGTATTGTAA-CCCTGGATACGTTGTAGAAAATGTTT-CTG-GTATATTGCGGA 886 | || ||||||||||| || ||| || |||| |||||||||| | | || | || || | Sbjct 1297 CAAGACAGTATTGTAATTCC-GGACACATTGTGGAAAATGTTTCCAGCGT-T-TTACGAA 1353 Query 887 GATTCAAATGGGGACATGCTGCTGAAGAGGCCCTTCACAATTTCGGTTTCAGGATGGATG 946 |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || | Sbjct 1354 GATTCAGGTGGGGGCCTGCTGCTGAAGAGGCCCTTCAAAATCTAGGTTTGAGGATAGACG 1413 Query 947 CATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATAATTATGCG-AATGCGCTTGGTTTC 1005 |||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||| | ||||| ||||||||| Sbjct 1414 CATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAGCAGATGAATGACTATG-GAAATGCTCTTGGTTTC 1472 Query 1006 TTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATGACGGGCATACTTATACCACTATG 1065 ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1473 TTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATG 1532 Query 1066 GTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGCGATAAACAGGCTTCTTGATGAGATG 1125 || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||| Sbjct 1533 GTTGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATTTGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATG 1592 Query 1126 GTTAAAGATGGATGTAAGCCAAATACTGTTACATATAACCGGCTCATCCATAGCTACGGC 1185 |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| Sbjct 1593 GTTAGAGATGGATGTCAGCCAAACACAGTTACATATAACCGACTTATCCACAGCTATGGC 1652 Query 1186 CGTGCAAATTACCTCAATGAAGCTATGAATGTTTTTAAGCAGATGCAAGAGGCTGGTTGT 1245 ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || Sbjct 1653 CGTGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAATGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGC 1712 Query 1246 GAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGACATCCATGCTAAAGCTGGATTTCTG 1305 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1713 AAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTTATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTT 1772 Query 1306 GACATTGCCTTGGACATGTACCAAAGAATGCAAGCAGCAGGGCTTTCTCCTGATACTTTC 1365 ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| Sbjct 1773 GACATTGCCATGGATATGTACCAGAGAATGCAGGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTC 1832 Query 1366 ACCTACAGTGTTATAATAAATTGTCTTGGAAAAGCGGGCCACTTACCTGCTGCCCATAGG 1425 || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | | Sbjct 1833 ACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGGAAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAG 1892 Query 1426 CTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACCCCTAATTTGGTCACATTCAACATCATG 1485 ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 1893 CTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAAGGTTGTACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATG 1952 Query 1486 ATAG-CTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTGCGTTGAAGCTCTACAGAGACAT 1544 || | | ||||||||||| ||| | || ||| ||| |||||||||||| ||| | ||||| Sbjct 1953 ATGGAC-TTGCATGCCAAAGCGAGAAACTATCAGAATGCGTTGAAGCTTTACCGTGACAT 2011 Query 1545 GCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACATACAGTATTGTTATGGAGGTACTTGG 1604 |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 2012 GCAAAACGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGTGACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGG 2071 Query 1605 ACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTTGCTGAGATGCAA-TGTAAGAACT 1663 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || || | Sbjct 2072 ACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGCTGTTTTCACCGAGATGCAACAG-AAAAATT 2130 Query 1664 GGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACTTGTGGGGAAAAGCTGGCAATG 1723 || |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| Sbjct 2131 GGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTTGGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATG 2190 Query 1724 TGGAAAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCACGCCGGTCTGCAACCTAATGTTC 1783 ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| Sbjct 2191 TGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAAGCAATGCTTCATGCTGGTCTGCGACCTAATGTTC 2250 Query 1784 CCACATGCAATTCCCTTCTCAGCACAC-TCCTTAGGGTTCACAGGAT-GTCTGAAGCCTA 1841 | |||||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||| ||| | ||||||| || Sbjct 2251 CTACATGCAACTCCCTTCTTAGTAC-CTTCCTTAGGGTTAACAAGATAG-CTGAAGCTTA 2308 Query 1842 TAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTTCTTTGCAGACATACACATT 1901 | | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || Sbjct 2309 TGAGTTATTACAAAACATGCTGGCGCTTGGTCTACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTT 2368 Query 1902 GCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTC-AAACTTTGACATGGGCTTT-TGTGGCCAG 1959 || ||||| |||||||| |||| ||| || |||| |||| ||||| ||| ||||||||| Sbjct 2369 ACTCTTGAGCTGTTGCACGGATGGTCGGTCAAAAC-TTGATATGGG-TTTCTGTGGCCAG 2426 Query 1960 CTAATGGC-AGTCTCAGGCCATCCGGCTCACATGTTTCTCCTCAAAATGCCACCTGCAGG 2018 | ||||| || | |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| || Sbjct 2427 TTGATGGCAAG-CACAGGTCATCCAGCACATATGTTTCTCCTCAAGATGCCAGCTGCGGG 2485 Query 2019 TCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTC-AGCAACTTCCTTGATTTTATGCACAGTG 2077 ||| |||||| |||| ||||| | |||| | | ||| ||||| ||| ||||||| || | Sbjct 2486 TCCGGATGGCGAAAACGTGCGCAACCATG-CGAACAATTTCCTGGATCTTATGCATAGCG 2544 Query 2078 AGGATAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATTTTCTCCACAAGTCAG 2137 |||| || |||||||||||||||||| |||| || || || || ||||| || ||||| | Sbjct 2545 AGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGTGGTTGACTTTCTACATAAGTCCG 2604 Query 2138 GTCTAAAAGAAGAGGCTGGTTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGTTAAGAATGTGTATCCAG 2197 | | |||||||||||| || || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| | Sbjct 2605 GGCAAAAAGAAGAGGCCGGATCTGTCTGGGAAGTTGCTGCACAAAAGAATGTGTTTCCTG 2664 Query 2198 ATGCATTGAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATAAATCTCCATGTAATGTCGGAAG 2257 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | Sbjct 2665 ATGCATTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATCAATCTCCATGTAATGTCAGAGG 2724 Query 2258 GAACTGCAGTCATCGCACTTTCTAGGACACTTGCATGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTTT 2317 |||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct 2725 GAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACGCTTGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTAGCTT 2784 Query 2318 CAGGAGA-ATGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGAAGTAGAGTC 2376 ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2785 CAGGA-ACTTGCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTC 2843 Query 2377 ACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACATATTCAACTTC-CC 2435 || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || Sbjct 2844 ACCGGTACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAGGAGCTGCTGAACATCTTTGG-TTCACC 2902 Query 2436 GTTTTTCACGGAGAACGGGAACTCGGGCTGTTTTGTAGGATGCGGAGAGCCTCTCAAGA- 2494 |||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| || | Sbjct 2903 GTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCAGGTTGTTTCGTTGGAAGCGGAGAGCCTCTTAACAG 2962 Query 2495 AGTGGTTGCT 2504 | |||||||| Sbjct 2963 A-TGGTTGCT 2971 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 125969193873 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5