BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476613
Length=3895
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G74770.1 | Symbols: | zinc ion binding | chr1:28089571-2809... 4019 0.0
> AT1G74770.1 | Symbols: | zinc ion binding | chr1:28089571-28094834
REVERSE LENGTH=3904
Length=3904
Score = 4019 bits (2176), Expect = 0.0
Identities = 2609/2815 (93%), Gaps = 42/2815 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGAGGCGGAAATCTTCATTCCCTTCCGCCCGAAAA----T--G---CT---TC---T 45
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || || |
Sbjct 1 ATGGGAGGCGGAAATCTTCATTCCCTTCCGCCGGAAAACGCTTCCGTTTCTGCATCTTAT 60
Query 46 GCGGTTACCGTTGGAAATACCAAGCTTTCTGATGCTCCGGTTCTTTTCTTCGTTTACTGC 105
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCGGTGACCGTTGGAAATACCAAGCTTTCTGATGCTCCGGTTCTTTTCTTCGTTTACTGC 120
Query 106 CACAAGGCTTTTCGTGCTCAGCTGGTGGACCTCCGGCGTTTCGCTACTGACGCTGCAGAA 165
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 121 CACAAGGCTTTCCGTGCTCAGCTGGTGGAGCTCCGGCGTTTCGCTACTGACGCTGCTGAA 180
Query 166 GCTGATTCCTTTAGCGGGGATCTGGCGGTGGAGCTCTCCCGGAAGTTTGAGTTTTTGAAG 225
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 GCCGATTCCTTTAGTGGGGATCTGGCGGTGGAGCTCTCCCGGAAGTTTGAGTTCTTGAAG 240
Query 226 CTTGTATATAAGTATCATAGTGCAGCTGAAGATGAGGTTATATTTTTGGCGCTTGATAAA 285
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 241 CTTGTATATAAGTATCATAGCGCAGCTGAAGATGAGGTTATATTTTTGGCGCTAGATAAA 300
Query 286 CGAGTAAAAAACATAGTTTCTAATTATTCACTTGAGCATGCTGGCACAGATGATCTCTTC 345
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CGAGTGAAAAACATAGTTTCTAATTACTCACTTGAGCATGCTGGCACAGATGATCTCTTT 360
Query 346 ACCTCAATTTTTCATTGGCTACATGTTCTTGAGGAAGAAATAGGAAGCACAAGTGATGTT 405
||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 361 ACCTCAATTTTCCACTGGCTACATGTTCTTGAAGAAGAAATAGGAAGTAGAAGCGATGTA 420
Query 406 CTTCGTGAAGTTATATTATGTATAGGCACCATTCAATCATCTATATGCCAACATATGCTT 465
|||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTTCGTGAAGTTATTTTATGCATAGGCACCATCCAGTCATCTATATGCCAACATATGCTT 480
Query 466 AAAGAAGAGCGTCAGGTCTTTCCTTTGTTAATTGAGAAGTTCTCTTTCCGAGAACAGGCG 525
||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 481 AAAGAAGAGCGGCAGGTGTTTCCTTTGTTAATAGAGAAGTTTTCTTTCCGAGAACAAGCA 540
Query 526 TCACTTGTGTGGCAATTCATATGTAGTGTTCCAGTGATGGTGCTTGAAGACTTTTTGCCA 585
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCACTTGTGTGGCAATTCATTTGTAGTGTTCCAGTGATGGTGCTTGAAGACTTTTTGCCA 600
Query 586 TGGATGATGTCTTATCTCTCTCACGAGGAGAAAATTGAAGTTGAGAATTGCATTAAAGAT 645
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 601 TGGATGATCTCTCATCTCTCTCACGAGGAGAAAATTGAAGTTGAGAATTGTATAAAAGAT 660
Query 646 GTTGCCCCAGCTGAAGACTCAATGCAACAGGTCATAAGCTCTTGGCTTCTTGACGACAGT 705
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 661 GTTGCCCCAAATGAAGACTCATTGCAACAGGTCATAAGCTCTTGGCTGCTTGACGATAGT 720
Query 706 CAATCTTCTTATGGGACTCCTACAGAGATCATGAAAGGAGTCCAGTATGTTAATGTGTCT 765
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAATCTTCTTGTGGGACTCCTACAGAGATCATGAAAGGAGTCCAGTATGTTAATGTGTCT 780
Query 766 AAAAGTATGAAGAAATCACCTGAGTCACATCCGTCCAGCGGATGTTTTCAACGGTTTTGG 825
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 781 AAAAGTTTGAAGAAATCACCTGAGTCACATCCGTCAAGCGGATGTTTTCAACGCTTTTGG 840
Query 826 GAGTGGAGTAAAAAGTCCCTTTCTATTCCAAATGTAGGACGTAGCCCGATTCATGGTCTT 885
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 841 GAGTGGAGTAAAAAGTCCCTTTCAATTCCAAATGTAGGACGGAGCCCAATTCATGGTCTT 900
Query 886 CGACTTTTTCAAAATGCAATTGAAAAGGATTTGAGAGATATTCAAGAAGGATTATG-CAG 944
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 901 AGACTTTTTCAAAATGCAATTGAAAAAGATTTGAGAGATATTCAAGAAGGATTATGCCA- 959
Query 945 AGCAAAATTCTC-AAGCCTTCTTGTGGACCTTGATGTACTGATGGCCCGATTAAACTTCC 1003
|||||||||| | || |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 960 AGCAAAATTC-CAAACCCTTATTTTGGATCTTGATGTACTGATGGCTAGATTAAACTTCC 1018
Query 1004 TTGCTGATGTCCTTGTTTCTTATAGCAATGCATTTAAGAAGTTCTTTCACCCAGTGTTAG 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TTGCTGATGTCCTTGTTTCTTATAGCAATGCATTTAAGAAGTTCTTTCACCCAGTGTTAG 1078
Query 1064 AAGAAATGACAGCTCGCCCCTCTTCAACTGCCAAACAATTCAACATAGATGGTTGTCTTG 1123
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1079 AAGAAATGACAGCTCGCCGCTCTTCAACTGCCAAACAGTTCAACATAGATGATTGTCTTG 1138
Query 1124 AGAATTTTCAGAGATT-TCTATACAAAAGTGCTGATGATAAAACAAGGACAGATGATTTT 1182
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||
Sbjct 1139 AGAATTTTCAGAGATTGT-TATACAAAAGTGCTGATGATAAAACAAAGACGGACAATTTT 1197
Query 1183 CTATTGCAGCTTCAGGAGGAACTTGAGTCCCTTATAGTACAAGTAACAAATCAATTTTCT 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |
Sbjct 1198 CTATTGCAGCTTCAGGAGGAACTTGAGTCCCTTATAATCCAAGTAACAAAGCAATTTGCC 1257
Query 1243 GTACAGCGAACAGAGGTATTCCCAATCATCAGCAAGAATTGCAACCATGAAATGCAGAAG 1302
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ATACAGAGAACAGAGGTATTCCCAATCATCAGCAAGAATTGCAACCATGAAATGCAGAAG 1317
Query 1303 CAGCTCCTATACACAAGCATTCATGTCTTACCTCTTGGATTGCTAAAGTGTGTCATACTT 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1318 CAGCTCCTATACACAAGCATTCATGTCTTACCTCTTGGATTACTAAAGTGTGTCATACTT 1377
Query 1363 TGGTTTTCTGCTCATCTATCAGAAGAGGAATCTCAATCAATTCTTCATTTCTTAAGTTTG 1422
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 TGGTTTTCTGCTCATTTATCAGAAGAAGAATCTCAATCCATTCTTCATTTCTTAAGTTTG 1437
Query 1423 GAAGATTCTTCTCCCAAGAAATCATTTCCACGCCTCTTGCTACAGTGGCTTCGTTTTGGC 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GAAGATTCTTCTCCCAAGAAATCATTTCCACGCCTCTTGCTACAGTGGCTTCGTTTTGGC 1497
Query 1483 TACTCAGGAAAAACCTCTGTTGAAACTTTTTGGAAACAGCTGGCA-GTGATGTTCAAAGT 1541
|| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||
Sbjct 1498 TATTCAGGCAAAACCTCTGTTGAAAGATTTTGGAAACAGTTGG-ATGTTATGTTCAAAGT 1556
Query 1542 AAGATGTTCCTGCCAAAAAGATCACAATGAAGAAGCATCAGGATCATTTTCCAACCAAAC 1601
|||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 AAGATGTTCCTGCCAAAAGGAGCACACTGAAGAAGCATCAGGATCATTTTCCAACCAAAC 1616
Query 1602 ACAGATGCAACTATGCAAAGGATCTAAAGTTGTTTGTCCTAGAAAGAAAGATAAGTCTTC 1661
|||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 ACAGCTGCAACTATGTAAAGTATCTAAAGATGTTTATCCTAGAAAGAAAGATAAGTCTTC 1676
Query 1662 AACCTGCTTCATGTCAATGGATCTAGCTGCTGGAGACATGTATGAGACACCTTACTCTAG 1721
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1677 AACCTGCTTCATGTCAATGGATCTAGCTGTTGGAGACATGTATGAGACACCTTACTCAAG 1736
Query 1722 TCGAATGAATCAGCAAATGATTTTCTCGGGAAAGCTCAAGCCTCCTCTCCATCTTCCAAA 1781
|||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1737 TCGAATGAATCAACAAATGACTTTCTCAGGAAAGCTTAAGCCTCCTCTCCATCTCCCAGA 1796
Query 1782 tttttttGGTGAGAAGAATATGGATGATCC-ATCGATAATGGATGTAAAACCAATTGACC 1840
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1797 TTTTTTTGGTGAGAAGAATATGGATGATCCTAT-GATTATGGATGTTAAACCAATTGACC 1855
Query 1841 TCCTTTTCTTCTTCCATAAGGCAATGAAGATGGATTTGGACTACCTTGTTTGTGGATCGG 1900
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 TCCTTTTCTTCTTCCACAAGGCAATGAAGATGGATTTGGACTACCTTGTTTGTGGATCAA 1915
Query 1901 CAAGATTGGCAGCCGACTTTCGGTTCCTCGCGGAGTTTCAACAGCGATTCCATATGATAA 1960
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||
Sbjct 1916 CAAGATTGGCAGCCGACTTTCGTTTCCTCGCGGAGTTTCAGCAACGGTTCCATATGATAA 1975
Query 1961 AGTTCTTGTATCAGATACATTCGGATGCAGAGGATGAAATTGCATTTCCAGCATTGGAGG 2020
|||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1976 AGTTTTTGTATCAGATACATTCTGATGCAGAAGATGAGATTGCATTTCCAGCATTGGAAG 2035
Query 2021 CCAAGGGACAACTTAAAAACATTAGTCACTCATTTGGCATTGATCATGAGCTAGAAACTA 2080
|||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 CCAAGGGACAGCTAAAAAACATTAGTCACTCGTTTAGCATTGATCATGAGCTAGAAACTA 2095
Query 2081 AACACTTCGACAAAGTTTCATTCATTTTGAATGAGATGGCAGAACTGAACATGTTGGTTT 2140
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 2096 AACACTTCGACAAAGTTTCGTTCATTTTGAATGAGATGTCAGAGCTGAACATGTTGGTTT 2155
Query 2141 CTACCATAAATACCAATGCAG-TGGACCACCATCGAAAGACGAAGTATGAGCGGTTATGT 2199
||||||| ||||||| ||||| || ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2156 CTACCATCAATACCACTGCAGCTG-ACCACGACCGAAAAATGAAGTATGAGCGGTTATGT 2214
Query 2200 CTGAGTCTCCAAGAGATTTGCAAATCTATGCACAAGCTGTTGTCTGAGCATATCCAACAT 2259
|| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 CTCAGTCTCCGAGAGATTTGCAAATCAATGCACAAGCTATTGTCTGAGCATATCCAACAT 2274
Query 2260 GAAGAAACTGAGCTATGGGGTCCATTCAGGAACTGCTTCTCTATTGAAGAACAAGAGAAA 2319
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 GAAGAAACTGAGCTTTGGGGTCTATTCAGGAACTGCTTCTCTATTGAAGAACAAGAGAAA 2334
Query 2320 ATGATAGGATGCATGCTTGGGAGAATAAGTGGGGAAATATTGCAGGATATGATTCCTTGG 2379
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 ATCATAGGATGCATGCTCGGGAGAATAAGTGGGGAAATATTGCAGGATATGATTCCTTGG 2394
Query 2380 TTAATGGAATCATTGACTTCTGATGAACAGCTTGCCGCGATGTCCTTGTGGCGCCAAGTA 2439
||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2395 TTAATGGAATCTTTAACCTCTGATGAACAGCTTGCCGCGATGTCCTTGTGGCGCCAAGCA 2454
Query 2440 ACTAGGAAAACAATGTTTGTCGAATGGCTAACAGAATGGTACAACGGTCATGTTTTACAA 2499
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2455 ACAAGGAAAACAATGTTTGTCGAATGGCTAACAGAATGGTATAACGGTCATGTTTTACAA 2514
Query 2500 GAGGAAGCAGGAGAAGCAAACAATGATCCATTTGGGGATTCAGATCCACTAGAGATTGTT 2559
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 GAGGAAGCAGGAGAAGCAAACAACGATCCATTTGGGGATTCAGATCCACTAGAGATTGTC 2574
Query 2560 TGGAAGTATCTCTTTGAAGCAGCTGCTGATGGGGACATAGGGAGCA-----A-C--C-TT 2610
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| | | | ||
Sbjct 2575 TGGAAGTATCTCTTTGAAGCATCTGCTGATGGGGAAAAAGGGAGCATGCGCAGCAGCCTT 2634
Query 2611 GTCCAACTCTCAGAA-ACAGACTTC-ACGGGTATGATGAATCAGCCACCTCATAATAACA 2668
|| ||||| | ||| || || || || ||||| ||||||||||| |||| |||| |||
Sbjct 2635 CTCAAACTCCC-GAAGAC-GAATTTTACAGGTATTATGAATCAGCCTCCTCCTAATTACA 2692
Query 2669 ATGTTGAACTCGGCAACAAAGAGGAGAAGGATCTAGAACGCTCAGAAAGTAAAAAGATAT 2728
| |||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2693 AGGTTGAAGTTGGCAAAAAAGAGGAAAAAGATCTAGAACGGTCAGAAAGTAAAAAGATAT 2752
Query 2729 GTAGAGGAGCTGACCAAAAGAGGGACAAAGAACAAACTGACAACAATTTC-CAGA 2782
| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||
Sbjct 2753 GCAGAGGATCTAACCAAGAGGGGGACAAAGAACAAACTGACAA-AATGTCTCAGA 2806
Score = 1690 bits (915), Expect = 0.0
Identities = 1031/1089 (95%), Gaps = 0/1089 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2807 AAATGTCTCAGAAGGTTAGCCAGTTTGGTCCATCCAAGAGATATGAACAATTGTTAACAA 2866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 2795 AAATGTCTCAGAAGGTTAGCCAGTTTGGTCCATCCAAGAAATATGAACAACTGTTAACAA 2854
Query 2867 TGAGTGAGGAAGAACTTGTGGTTGTGATTAAGAAAATATCATGCGACTCTTCCTTGAATC 2926
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2855 TGAGTGAAGAAGAACTTGTGGTTGTGATTAAGAAAATATCATGCGACTCTTCCCTGGATC 2914
Query 2927 CTCAGAAGAAATCCTATATCAAGCAGAATTTGTTAATGAGTCGGTGGAATATCTCACAAC 2986
||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2915 CTCAGAAGAAAGACTATATCAAGCAGAACTTGTTAATGAGTCGGTGGAATATCTCACAAC 2974
Query 2987 GTACAAATATTTTGGAACCATCATCTCTCTCAAGCAACATGGAAACAGTTCCTGGTCAAC 3046
||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2975 GTACATATAATTTGGAACCATCCTCTCTCTCGAGCAACATGGAAACAGTTCATGGTCAAC 3034
Query 3047 ATCCATCATATCGAGATCCTCATAGTTTGATCTTTGGTTGCAATCATTACAAGAGAAAAT 3106
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3035 ATCCATCATATCGAGATCCTCACAGTTTGATCTTTGGTTGCAATCACTACAAGAGAAATT 3094
Query 3107 GCAAGCTTTTTGCTCCTTGTTGTGACAAGCTGTTCACATGTATACGATGCCATGATGAAG 3166
| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3095 GTAAACTTCTTGCTCCTTGTTGTGACAAGCTCTTCACATGTATACGATGCCATGATGAAG 3154
Query 3167 AAGCTGATCACTCGGTGGATAGGAAACAGATTACAAAGATAATGTGCATGAAATGCCTCT 3226
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3155 AAGCTGATCACTCGGTGGATAGGAAACAGATTACAAAGATGATGTGCATGAAATGCCTCT 3214
Query 3227 TGATCCAGCCGATTGGTGCAAATTGCTCAAATACTTCATGTAAATCGTCAATGGGAAAAT 3286
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 3215 TGATTCAACCGATTGGTGCAAATTGCTCAAATACTTCGTGCAAGTCGTCAATGGGAAAAT 3274
Query 3287 ACTTTTGCCAAATATGCAAATTATATGACGATGAAAGGAAAATATATCACTGCCCTTACT 3346
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3275 ACTTCTGCAAAATATGCAAATTATATGACGATGAAAGGAAAATTTATCACTGTCCTTACT 3334
Query 3347 GCAACCTCTGCCGGGTAGGGAAAGGACTGGGCATTGATTACTTCCATTGCATGAAATGCA 3406
|||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3335 GCAACCTCTGTCGAGTAGGGAAAGGATTGGGTATTGACTACTTCCACTGCATGAAATGCA 3394
Query 3407 ATGCTTGCATGTCACGTACCTTAGTAGAGCATGTTTGCAGGGAAAAGTGCTTAGAAGATA 3466
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3395 ATGCTTGTATGTCACGTACCTTAGTAGAGCATGTTTGCAGGGAAAAGTGCTTAGAAGATA 3454
Query 3467 ATTGCCCTATATGCCACGAGTATATCTTCACCTCCAGCTCTCCTGTGAAGGCTCTTCCTT 3526
|||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3455 ATTGTCCGATTTGCCATGAGTATATCTTCACCTCCAGCTCCCCAGTGAAGGCTCTTCCTT 3514
Query 3527 GCGGTCACTTGATGCACTCCACATGCTTTCAGGAGTACACATGTTCACATTACACATGCC 3586
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515 GTGGTCACTTGATGCACTCCACATGCTTTCAGGAGTACACATGTTCACATTACACATGCC 3574
Query 3587 CTATCTGCAGCAAGTCACTAGGAGATATGCAGGTCTACTTTAAGATGTTAGACGCATTGC 3646
|| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3575 CTGTCTGCAGCAAGTCGCTTGGAGATATGCAGGTCTACTTTAAGATGTTAGACGCATTGC 3634
Query 3647 TTGCAGAAGAGAAGATGCCTGATGAATACTCCAACAAAACTCAGGTGATCTTGTGTAATG 3706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3635 TTGCAGAAGAGAAGATGCCTGATGAATACTCCAACAAAACTCAGGTGATCTTGTGTAATG 3694
Query 3707 ACTGTGGAAGAAAAGGAAATGCTCCTTACCATTGGCTTTACCACAAATGCACAAGCTGTG 3766
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3695 ATTGTGGAAGAAAAGGAAATGCTCCTTACCATTGGCTTTACCACAAATGCACAACCTGTG 3754
Query 3767 GCTCCTACAATTCAAGGCTCCTTTAGATCTCTCTCCAATTTTCCTTTTCCATTGACATTA 3826
|||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3755 GCTCCTACAACTCAAGGCTCCTTTAGATTTTTCTCCAATTTTCCTTTTCCATTGACATCA 3814
Query 3827 TTGTAGAATCAGCTGTCCATGTAGTACATGGCTGATAAGAAAACATTTTTGTAACATTTG 3886
|||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3815 TTGTAGAACCAGCCGTCTATGTAGTACATGGCTGGTAAGAAAACATTTTTGTAACATTTG 3874
Query 3887 ATGTTGTAC 3895
||| |||||
Sbjct 3875 ATGATGTAC 3883
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 194045735524
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5