BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476894
Length=5534
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G77300.1 | Symbols: EFS, SDG8, CCR1, ASHH2, LAZ2 | histone m... 6704 0.0
> AT1G77300.1 | Symbols: EFS, SDG8, CCR1, ASHH2, LAZ2 | histone
methyltransferases(H3-K4 specific);histone methyltransferases(H3-K36
specific) | chr1:29039922-29049302 REVERSE LENGTH=5791
Length=5791
Score = 6704 bits (3630), Expect = 0.0
Identities = 4127/4366 (95%), Gaps = 38/4366 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATTGCAAGGAAAACGGTATTAGTGACGCTTCTGGGTGCGATATTGATGCTAACTCT 60
||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 136 ATGGACTGTAAGGAAAACGGTGTTGGTGACGCTTCTGGGTGCAATATTGATGCTAACTCT 195
Query 61 CTGGCCTCAAATCTTGCGATGGACATCAATGAAGATTTCTATGAGAAGTTGAGTTCTTGT 120
||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 196 CTGGCCTCAAATCTTGCGATGAATACCAATGAAGATTTCTATGAGAAATTGAGTTCTCGT 255
Query 121 GGGCACAATATAGATTCAGTCAGTAGTTTGGAGACTCCTCAGGTTGCTTCAGT-TGGAAA 179
||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||
Sbjct 256 GGGCAAAATTTAGATTCAGTCAGTAGTTTGGAGATTCCTCAGACTGCTTCA-TCTGTAAA 314
Query 180 ACATATGATAGAAGGCCAAGGGAAGTGTTTTATAGAGATTGAGCAGATGGGAGACGGGAA 239
|||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 315 CCATACGATTGAAGGCCAAAGGAAGTGCTTTACAGAGATTGAGCAGATGGGATACGGGAA 374
Query 240 CAGTAATAGTGAAGAAGATGCTGGAAACACTGATGATGGTCTCTATGTTTGTTACAACGC 299
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||
Sbjct 375 CAGTAATAGTCAAGAAGATGCTGGAAACACTGATGATGATCTATATGTTTGTTACAATGC 434
Query 300 TGATGACACTC-GGAAGCAGGGAGTGGTTTCAGGTGAGCTTGAACGAACTCACGGAGTAA 358
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | |||
Sbjct 435 TGATGACACTCAGG-AGCAGGGAGTGGTTTCAGGTGAGCTTGAACAAAGTCAAGAATTAA 493
Query 359 TTTGTGATGCTGATTTACTGGTAAATTGCAACAAGCTGGATGATGGAAAGGAAAGTCAGG 418
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 TTTGTGATACTGATTTACTGGTAAATTGCAACAAGCTGGATGATGGAAAGGAAAGTCAGG 553
Query 419 ACACAAATCTGTCCCTTGTATCCATCGTTTCTGGGAGTATGCAAGAGAAAGGAGCTCCTC 478
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 554 ACACAAATGTGTCCCTTGTATCCATTTTTTCTGGGAGTATGCAAGAGAAAGAAGCTCCTC 613
Query 479 AGGCTAAAGAAGATGAAGGTTGTGGTGGCACAACATTGCCTATAGGGGGCAATGGAATAG 538
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 614 AGGCTAAAGAAGATGAAGGTTATGGTGGCACAACATTGCCTATAGGGGGCAGTGGAATAG 673
Query 539 ATAATGAATCAACTTTTGTGAATGATGCACCAGAACAATTCGAGTCTTTGGAAACCACAA 598
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674 ATACGGAATCAACTTTTGTGAATGATGCACCAGAACAATTCGAGTCTTTGGAAACCACAA 733
Query 599 AGCAGAGAAAACCTGATGAAGTTGATAGTGGTGGTATTAGTTATACGTTTGATGATGGAG 658
|||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 734 AGCACATAAAACCTGATGAAGTTGAAAGTGATGGTATTAGTTATAGGTTTGATGATGGAG 793
Query 659 GTAAGGAAGGGAA-AAATGAACCATCGAGTGATCAAGATAATGGTTCTTCTGATGATATA 717
|||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 794 GTAAGGAA-GGAAGAAATGGACCATCGAGTGATCTAGATACTGGTTCTTCTGATGATATA 852
Query 718 TCTCTCATTCAGAGTTTTTCGTTTCCAGATTCGCTATTGGACTCTAGTGTATTTGGCTGT 777
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 TCTCTCAGTCAGAGTTTTTCGTTTCCAGATTCGTTATTGGACTCTAGTGTATTTGGCTGT 912
Query 778 AGCGCCACAGAAAATTATCTGGAGGATGCAAGTGATATTGAAGGCAATGTGCCTATTGTG 837
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 913 AGCGCCACAGAAAGTTATCTGGAGGATGCAATTGATATTGAAGGCAATGGGACTATTGTT 972
Query 838 GTATCCCCTTCATTAGCTATCACAGAAATGTTAAATAATCATGACGGTGGCCTATGTTCA 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 973 GTATCCCCTTCATTAGCTATCACAGAAATGTTAAATAATGATGATGGTGGCCTATGTTCA 1032
Query 898 TATGATCTTAACGATATCACAGTCACAGAGACAATCAATCCAGAGTTGAAGTTGGTACAT 957
||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 1033 CATGATCTTAACAAGATCACAGTCACAGAGACGATCAATCCAGATTTGAAGTTGGTACGT 1092
Query 958 GAGGATGA-GCTTGACACTGATCTTTCCGAGAAGAATGAAAAGATGCTGAAAAACCATGT 1016
|||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1093 GAGGAT-AGGCTTGACACTGATCTTTCCGTGATGAATGAAAAGATGCTAAAAAACCATGT 1151
Query 1017 TGGGGATTCATCAAGTGAAAGTGCCGTGGCCGCTTTAAGTATGAATAATGGTATGGCTGC 1076
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 TGGGGATTCATCAAGTGAAAGTGCCGTGGCCGCTTTGAGTATGAATAATGGTATGGCTGC 1211
Query 1077 TGATCTGAGAGCTGAAAATTTCAGTCAGATTTCACCCATAGACGACAAATCTTTTTG-TA 1135
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| | ||
Sbjct 1212 TGATCTGAGAGCTGAAAATTTCAGTCAGAGTTCACCCATAGACGAAAAAAC-TTTAGATA 1270
Query 1136 TGGAAGCCAATTCCCCTATTACTGACTCTTCTTTGATATGGAATTTTCCATTGAACTTTG 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 TGGAAGCCAATTCCCCTATTACTGACTCTTCTTTGATATGGAATTTTCCATTGAACTTTG 1330
Query 1196 GAAATGGAGGCATCGAAGTCTGTAATCCTGACAATGCAGTTGAGCCACTCAGAATAATAG 1255
||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1331 GAAGTGGAGGAATCGAAGTCTGTAATCCTGAAAATGCAGTTGAGCCACTCAGAATAGTAG 1390
Query 1256 ACGACAATGGCAGAATAGGTGGTGAAGTTGCTTCTGCATCAGGGACTAATTTTTGTGAAA 1315
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1391 ATGACAATGGCAGAATAGGTGGTGAAGTTGCTTCTGCATCAGGGAGTGATTTTTGTGAAG 1450
Query 1316 CTGGCTTGTCTTCTTCCCGAAGGAAGACCCGAGATGGTAAACAATGTAAAGTGGCGCAGA 1375
||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1451 CTGGCATGTCTTCTTCCCGAAGGAAGGCCCGAGACGGGAAACAATGTAAAGTGGTGCAGA 1510
Query 1376 CAAAAATGAGTGCTCGCCATCCAAGAAAATCCACTAGAAAGAAACAATCAGAAAGAAACC 1435
|||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1511 CAAAAACGAGTGCTCGCCATCTGAGAAAATCCTCTAGAAAGAAACAATCAGAAAGAGACA 1570
Query 1436 TTGAATCTATTTTCAAGTGTTCAAAGCAGAAAAGGAGCTCTCTTTTAAAAACAAGCCGTT 1495
|||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1571 TTGAGTCAATTTTCAAGTGCTCAAAGCAGAAGAGGAGCTCTCTTTTAAAAACAAGTCGTT 1630
Query 1496 CATTTGAGTGGGGATTACCAAGCAAGACCACTGAAATCTTCTTACAGAGCAAAAATATTC 1555
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1631 CATCTGAGTGGGGATTACCAAGCAAGACCACTGAAATCTTCTTACAGAGCAATAATATTC 1690
Query 1556 CCTATGATGGACCTCCGCATCATGAACCACAGAGACCTCAGGGCAATCTTAATAATGGAC 1615
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1691 CCTATGATGGACCTCCGCATCATGAACCACAGAGATCTCAGGGAAATCTTAATAATGGAG 1750
Query 1616 AGCATAATAGAAGTTCTCATAAC-GGATATGTTGAAGGATCTAACAGAAACATCCAAGCA 1674
||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751 AGCATAATAGAAGTTCTCATAACGGGA-ATGTAGAAGGATCTAACAGAAACATCCAAGCA 1809
Query 1675 TCAAGTGGCTCTTGCCTTCGTTTGAAAGTTAAATTTGGTAAATCAGGTGGCCAAAATCCT 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 TCAAGTGGCTCTTGCCTTCGTTTGAAAGTTAAATTTGGTAAATCAGGTGGCCAAAATCCT 1869
Query 1735 TTGAACATTACAGTCTCTAAGGTCAGTGGTAACTCTTTGCCTGCTAATGGTATTGTTAAA 1794
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||
Sbjct 1870 CTGAACATTACAGTCTCTAAGGTCAGTGGTAACTCCTTACCTGGTAATGGTATTGTAAAA 1929
Query 1795 GCAGGAACATGTTTAGAATTGCTAGGATCAGCAAATTTTGCTGAGGATAAACCGCAAACT 1854
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 1930 GCAGGAACATGTTTAGAATTGCCAGGATCAGCACATTTTGGTGAGGATAAAATGCAAACT 1989
Query 1855 GTGGAAAC-AAGAGAGGACTTGGTAGAGAAAAGCAACCCTGTGGAGATAGTTTCATATCT 1913
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1990 GTGGAAACTAA-AGAGGACTTGGTAGAGAAAAGCAACCCTGTGGAGAAAGTTTCATATCT 2048
Query 1914 GCAGTCATCTGATTCTATGAGGGATAAGAAAAATAATCAAGACGCTGCGGGTTTATGTAG 1973
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2049 TCAGTCATCTGATTCTATGAGGGATAAGAAATATAACCAAGACGCTGGGGGTTTATGTAG 2108
Query 1974 GAAGCTGGGTGGTGATGTTTTAGATGATGACCCACATCTTTCCTCTATTATAATGGTTGA 2033
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2109 GAAGGTGGGTGGTGATGTTTTAGATGATGACCCACACCTTTCCTCTATTAGAATGGTTGA 2168
Query 2034 AGAGTGCGAGAGGGCCACTGGAACACGGTCCCTGGACGCTGAAACTTCACCAGATTCTGA 2093
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2169 GGAGTGCGAGAGGGCCACTGGAACGCAGTCCCTGGACGCTGAAACTTCACCAGATTCTGA 2228
Query 2094 AGTTATCAACTCTGTGCCTGAATCCATTACCAATATTGAACATAAAGAGGGTTTGCATCA 2153
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2229 AGTTATCAACTCTGTGCCTGATTCCATTGTCAATATTGAACATAAAGAGGGTCTGCATCA 2288
Query 2154 TGGTTTTTTCACCACTCCAGAAGATGTGGTCAAGAAGAACAGAGTAGTAGAAAAAGAAGA 2213
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2289 TGGTTTTTTTAGCACTCCAGAAGATGTGGTCAAGAAGAACAGAGTATTAGAAAAAGAAGA 2348
Query 2214 TGAATTGCTG-GCTTCAAAATCTCCTTTGGAAAATGGTTCACATCTAATTCCCAGTGCaa 2272
|||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2349 TGAATTGC-GTGCTTCAAAATCTCCTTCAGAAAATGGTTCACATCTAATTCCCAATGCAA 2407
Query 2273 aaaaaGGTAAACATTCC-AAGTCTAAAAGTAATGGAACAAAGAAAGGGAAATCCAAGATT 2331
|||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2408 AAAAAGCTAAACA-TCCGAAGTCTAAAAGTAATGGAACAAAGAAAGGTAAATCCAAGTTT 2466
Query 2332 TCCGAATCTGCCAAAGACGGGAGAAAAAATGAATCACATGAGGGGGTAGAGCAACGCAAA 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2467 TCCGAATCTGCCAAAGACGGGAGAAAAAATGAATCACATGAAGGGGTAGAGCAACGCAAA 2526
Query 2392 TCCCTGAATACCAGTATTGGAAGGGATGATAGTGATTATCTTGAAGTAGGGAGAATAGAG 2451
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2527 TCCCTGAATACCAGTATGGGAAGGGATGATAGTGATTATCCTGAAGTAGGGAGAATAGAG 2586
Query 2452 TCTCACAAAACAACAGGTGCCCTTCTAGATACTGATATTGGGAAAATCAGTGCCACTTAT 2511
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2587 TCTCACAAAACAACAGGTGCCCTTCTAGATGCTGATATTGGGAAAACCAGTGCCACTTAT 2646
Query 2512 GGTACCATATCATCAGATGTGACCAATGTGGAAACGGTTGTGGATGTTACTATTGAAGAT 2571
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2647 GGTACCATATCATCAGATGTGACCCATGGGGAAATGGTTGTGGATGTTACTATTGAAGAT 2706
Query 2572 AGCTATTCCACAGAGAGTGCCTGGGTTCGATGTGATGATTGCTTTCAATGGCGACGAATA 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2707 AGCTATTCCACAGAGAGTGCCTGGGTTCGATGTGATGATTGCTTTAAATGGCGACGAATA 2766
Query 2632 CCTGCTTCTGTTGTAGGATCAATTGACGAGAGCTCCAGATGGATCTGTTTGAACAACTCA 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2767 CCTGCTTCTGTTGTAGGATCAATTGACGAGAGCTCTAGATGGATCTGTATGAACAACTCA 2826
Query 2692 GATAAAAAATTTGCGGATTGCTCAAAATCTCAAGAGATGTCAAATGAAGAAATTAATGAA 2751
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2827 GATAAAAGATTTGCGGATTGCTCAAAATCTCAAGAGATGTCAAATGAAGAAATTAATGAA 2886
Query 2752 GAGTTGGGAATAGGACAGGATGAAGCAGATGCATATGATTGTGATGCGGCTAAAAGAGGG 2811
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GAGTTGGGCATAGGACAGGATGAAGCAGATGCATATGATTGTGATGCGGCTAAAAGAGGG 2946
Query 2812 AAAGAAAAGGAACAAAAGAGCAAGCGTTTGACAGGTAAGCAAAAGGCGTGCTTCAAGGCT 2871
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2947 AAAGAAAAGGAACAGAAGAGCAAGCGTTTGACAGGTAAGCAAAAGGCGTGCTTCAAGGCT 3006
Query 2872 ATAAAAACAAACCAGTTTCTTCATCGCAATCGTAAATCTCAAACAATTGATGAGATAATG 2931
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3007 ATAAAAACAAACCAGTTCCTTCATCGCAATCGTAAATCTCAAACAATTGACGAGATAATG 3066
Query 2932 GTTTGTCACTGCAAACCACCACCTGATGGTAGGTTGGGTTGTGGAGAAGAATGCCTCAAT 2991
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3067 GTTTGTCACTGCAAACCATCACCTGATGGTAGGTTGGGTTGTGGAGAAGAATGCCTCAAT 3126
Query 2992 AGAATGCTTAACATTGAATGTCTTCAAGGTACCTGCCCAGCTGGCGATTTGTGCTCAAAT 3051
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3127 AGAATGCTTAACATTGAATGTCTTCAAGGTACCTGTCCAGCTGGCGATTTGTGTTCAAAT 3186
Query 3052 CAGCAGTTTCAAAAACGGAAGTATGTTAAGTTTGAGAGATTCCAATCCGGTAAGAAGGGT 3111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3187 CAGCAGTTTCAAAAACGGAAGTATGTTAAGTTTGAGAGATTCCAATCCGGTAAGAAGGGT 3246
Query 3112 TATGGCCTGAGATTGCTCGAGGATGTACGAGAGGGGCAATTCCTTATTGAATATGTTGGA 3171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3247 TATGGCCTGAGATTGCTCGAGGATGTACGAGAGGGGCAATTCCTAATTGAATATGTTGGA 3306
Query 3172 GAGGTGCTTGATATGCAATCCTATGATACTCGCCAAAAAGAATATGCTTGCAAGGGTCAG 3231
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3307 GAGGTGCTTGATATGCAATCCTATGAGACTCGCCAAAAAGAATATGCTTTCAAGGGTCAG 3366
Query 3232 AAACATTTCTATTTCATGACACTAAATGGGAATGAGGTAATAGATGCTGGTGCAAAGGGA 3291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3367 AAACATTTCTATTTCATGACACTAAATGGGAATGAGGTAATAGATGCTGGTGCAAAGGGA 3426
Query 3292 AACCTAGGGCGTTTCATTAACCATAGCTGTGAACCAAACTGCCGTACTGAAAAGTGGATG 3351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3427 AACCTAGGGCGTTTCATTAACCATAGCTGTGAACCAAACTGCCGTACTGAAAAGTGGATG 3486
Query 3352 GTGAATGGTGAAATTTGCGTTGGAATATTCTCCATGAAAGACCTTAAGAAGGGTCAAGAG 3411
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3487 GTGAATGGTGAAATTTGCGTTGGAATATTCTCCATGCAAGACCTTAAGAAGGGTCAAGAG 3546
Query 3412 TTGACATTTGACTACAACTATGTGAGGGTTTTTGGTGCTGCCGCCAAAAAGTGCTATTGT 3471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3547 TTGACATTTGACTACAACTATGTGAGGGTTTTTGGTGCTGCCGCCAAAAAGTGCTATTGT 3606
Query 3472 GGGTCATCGCATTGCAGAGGGTATATTGGGGGAGATCCTCTGAATGGTGATGTAATTATT 3531
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3607 GGATCATCACATTGCAGAGGGTATATTGGGGGAGATCCTCTGAATGGTGATGTAATTATT 3666
Query 3532 CAAAGTGATTCAGATGAAGAGTATCCTGAACTTGTGATCCTTGATGATGATGAAAGTGGA 3591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3667 CAAAGTGATTCAGATGAAGAGTATCCTGAACTTGTGATCCTTGATGATGATGAAAGTGGA 3726
Query 3592 GAAGGAATCTTAGATGCAACATCTAGGACCTTCATTGATGACGCTGACGAGCAAATGCCA 3651
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3727 GAAGGAATCTTAGGTGCAACATCTAGGACCTTCACTGATGACGCTGACGAGCAAATGCCA 3786
Query 3652 CAGAACTCTGAAACGGTTAATGGTTCCAAGGACCTTGCTCCTGATAATGCCCAATCACAG 3711
|||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3787 CAGAGCTTTGAAAAGGTTAATGGTTACAAGGACCTTGCTCCTGATAATACCCAAACACAG 3846
Query 3712 AGCTCAGTATCTGTAAAACTTCCTGAGAGAGTAATTCCTCCACCTCTTCTTCAGCCAACT 3771
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3847 AGCTCAGTATCTGTAAAACTTCCAGAGAGAGAAATTCCTCCACCTCTTCTTCAGCCAACT 3906
Query 3772 GAAGTTTTGAAGGAACTTCCGTCAGGCATAGCTGTTAGTGCTGTCCAGCAAGAGGTTCCC 3831
|||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3907 GAAGTTTTGAAGGAACTTTCGTCAGGCATATCTATTACTGCTGTCCAGCAAGAGGTTCCC 3966
Query 3832 GTTGAAAAGAAGACTAAAAACACATCTCCCACGTCCAGTTCTCTTAGCAGACTGTCCTCG 3891
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3967 GCTGAAAAGAAGACTAAAAGCACATCTCCCACGTCCAGTTCTCTTAGCAGAATGTCCCCG 4026
Query 3892 GGTGGTGCAAATACTGATATGACGACAAAGCATGGATCGGGAGAAGATAAAAAGATACTT 3951
|||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4027 GGTGGTACAAATTCTGATAAGACGACAAAGCATGGATCAGGAGAAGATAAAAAGATACTT 4086
Query 3952 CCACGGCCTCGTCCTCGTCCTCGTTTGAAAACTTCTCGCTCATCTGTTTCTAGTAAGCGA 4011
||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4087 CCACG---TC--C-TCGTCCTCGTATGAAAACTTCTCGCTCATCTGAGTCTAGTAAGCGA 4140
Query 4012 GACAAAGGAGGTATTTTATC-TGGTGTTAACAAAGCACAGATTATACCAGTCAATAAGTT 4070
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 4141 GACAAAGGAGGTATTT-ATCCTGGTGTTAACAAAGCACAGGTTATACCAGTTAATAAGTT 4199
Query 4071 ACAACAGCAACCTATCAAATCTAAAAGATCAGAGGAAGTTTCTTCCAGCGGGTGTATTGA 4130
|||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | || ||
Sbjct 4200 GCAACAGCAGCCCATCAAATCTAAAGGATCAGAGAAAGTTTCTCCCAG----T--ATCGA 4253
Query 4131 AACATTTGAAGGGAAACTGAACGAGTTACTAGATGCCGTAGGAGGGATAAGCAAGCGGAG 4190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4254 AACATTTGAAGGGAAACTGAACGAGTTACTAGATGCCGTAGGAGGGATAAGCAAGCGGAG 4313
Query 4191 GGATTCAGCAAAAGGCTACTTGAAACTTCTGCTGCTCACTGCCGCTTCCCGAGGCAC--A 4248
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 4314 GGATTCAGCAAAAGGCTACTTGAAACTTCTGCTGCTCACTGCCGCTTCGCGAGGCACGGA 4373
Query 4249 -GAAGGAGGAACCTATTGCAGCAATCGAGATCTTTCAATGATTCTTGATGCCCTTTTGAA 4307
|||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4374 TGAAGAAGGAATTTAT---AGCAATCGAGATCTTTCAATGATTCTTGATGCCCTTTTGAA 4430
Query 4308 GACAAAGTCAAAATCTGTTTTAGTTGACGTAATCAACAAGAATGGT 4353
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 4431 GACAAAGTCAAAATCTGTTTTAGTGGACATAATCAACAAGAATGGT 4476
Score = 1677 bits (908), Expect = 0.0
Identities = 1044/1110 (94%), Gaps = 8/1110 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4431 GGTTCATCGA-ATTGCACGGAGCTTCCGAGACAGATGGATACCTAAACATTTTAGAAAAC 4489
||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4680 GGTTCAT-AATATTGCGCGGAGCTTCCGAGACAGATGGATACCTAAGCATTTTAGAAAAC 4738
Query 4490 CTTGGCGCATCGACAGGGAGGAGAGATCGGAGTCTATGAGGTCACCTATAAACAGCAGGT 4549
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4739 CTTGGCGCATCAACAGGGAGGAGAGATCGGAGTCTATGAGGTCACCTATAAACAGAAGGT 4798
Query 4550 TCAGAGCTTCACAAGAACCTCGATATGAACATCGGTCCCCAAGACCTGCAGAACCAGCTG 4609
||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4799 TCAGAGCATCACAAGAACCTCGATATGATCATCAGTCCCCAAGACCTGCAGAACCAGCTG 4858
Query 4610 CGTCTGTCACACCATCAATGGCTGCAACTCCTGAAACAGCATCTGTATCTGAGGGATATT 4669
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4859 CGTCTGTCACATCATCAAAGGCTGCAACTCCTGAAACAGCATCTGTATCTGAGGGATATT 4918
Query 4670 CAGAACCTAATTCCAGTCTTCCTGAGACAAATGGACGCAAGCGCAAAAGCAGATGGGACC 4729
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4919 CAGAACCTAATTCCGGTCTTCCTGAGACAAATGGACGCAAGCGCAAAAGCAGATGGGACC 4978
Query 4730 AGCCGTCTAAGACAAAAGAACAAAGAACCATGACTATCTCGTCTCAACAAAGAGATGAAA 4789
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||
Sbjct 4979 AGCCGTCTAAGACAAAAGAACAAAGAATCATGACTATCTTGTCCCAACAAACAGATGAAA 5038
Query 4790 CTAATGGTAATCAGGATGTCCAAGATGACCTTCCACCCGGGTTTTCATCACCCTGCACAG 4849
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5039 CTAATGGAAATCAGGATGTCCAAGATGACCTTCCACCCGGGTTTTCATCACCCTGCACAG 5098
Query 4850 ATGTGCCTGATGCGATTACTGCACAGCCGCAACAAAAGTTCCTTTCTCGCTTACCAGTAT 4909
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5099 ATGTGCCTGATGCAATTACTGCACAGCCGCAACAAAAGTTCCTTTCTCGCTTACCAGTTT 5158
Query 4910 CCTATGGGATCCCACTTAGCATTGTTCATCAATTTGGTTCACCCGGCAAAGAGGACCCGA 4969
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5159 CCTATGGGATTCCACTTAGCATTGTTCATCAATTTGGTTCACCTGGCAAAGAGGACCCGA 5218
Query 4970 CCACCTGGTCCGTTGCTCCTGGGATACCGTTCTATCCATTTCCACCTCTACCGCCAGTGT 5029
|||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5219 CCACCTGGTCTGTTGCTCCTGGCATGCCGTTCTATCCATTTCCACCTCTACCGCCAGTGT 5278
Query 5030 CTCATGGTGAGTTTTTCGCTAAGAGAAATGTAATAGCCTGTTCCTCCTCCATTCGAAACC 5089
|||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 5279 CTCATGGTGAGTTTTTTGCTAAGAGAAACGTAAGAGCCTGTTCCTCGTCCATGGGAAACC 5338
Query 5090 CGACTTACTCCAATGAGATCTTACCGGCTACACCTGTGACTGACTCAACTGCTCCAAACC 5149
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||
Sbjct 5339 TGACTTACTCCAATGAGATCTTACCAGCTACACCTGTGACTGACTCGACCGCTCCAACCC 5398
Query 5150 GGAAGAGAGAGA-GTT--CATTTGATATAGGAACAACTTACTTTCGGCAACAGAAACAGA 5206
| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5399 GTAAGAGAGAGTTGTTTTCATCTGATATAGGGACAACTTACTTTCGGCAACAGAAACAGA 5458
Query 5207 ACGTTCCTCCATGGTTGCGGAACAACGGGTGGGAGAAAACAGTAAACAGCTCTATACCTG 5266
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 5459 GTGTTCCTCCATGGTTGCGGAACAATGGGGGGGAGAAAACAGCAAACAGCCCTATACCTG 5518
Query 5267 GGAATCTAACTTTAGAGAAGAAGCTCAACAGTTAAGTATTCATAATTTTAGAGAAGTACA 5326
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5519 GAAATCTAACTTTAGAGAAGAAGCTCAACAGTTAAGTATTCTTAATTTTAGAGAAGTACA 5578
Query 5327 GTCGATGAAGTTGAAATGGAGACAGTGCAGGTCTTAAAGGAGAATTACAGTGATTGATTG 5386
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5579 GTCGATGAAGTTGAAATGGAGACAATGCATCTCTTAAAGGAGAATTACAGTGATTGATTG 5638
Query 5387 GTTTATTTGGCTCATAGGAAAATCAATCCCCTTTAGGGGAGTCATGTGCGTTTCGTTTCT 5446
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 5639 GTTTATTTGGCCCATAGGAAAATCAATCCCCTCTAGGGGAGTCATATGCGTTTC-TTTCC 5697
Query 5447 T-TCCCTTTCCTTTCTTTAGTATATTCTAAATTCTTTTATAATTAAAA-GTCACATTTCA 5504
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||
Sbjct 5698 TATCCCTCTCCTTTCTTTAGTATATTCTAAATTCTTTTACAATCAAAAAGTCCCATTTCA 5757
Query 5505 ATGTAAAAGAAATCACATTCTTTAATCTTT 5534
||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5758 ATGTAAAAGCAATCACATTCTTTAATCTTT 5787
Score = 122 bits (66), Expect = 3e-26
Identities = 79/85 (93%), Gaps = 1/85 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4347 GAATGGTATTAGAGTATCTTGCCACAAGGGAAATCCTTGCACTGGAGCATATAATCAGAA 4406
||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4551 GAA-GGTATTAGAGTATCTTGCCACAAGGAAAATCCTTGCACTGGAGCATATAATCAGAA 4609
Query 4407 GACCTCCTTGCGTAGGGATGGAAAG 4431
| ||||||| | ||||||||||||
Sbjct 4610 GGCCTCCTTTTGCAGGGATGGAAAG 4634
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 276269355101
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5