BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476910
Length=7066
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G77460.1 | Symbols: | Armadillo/beta-catenin-like repeat ; ... 1.153e+04 0.0
> AT1G77460.1 | Symbols: | Armadillo/beta-catenin-like repeat
; C2 calcium/lipid-binding domain (CaLB) protein | chr1:29103763-29111921
FORWARD LENGTH=7084
Length=7084
Score = 1.153e+04 bits (6245), Expect = 0.0
Identities = 6829/7105 (96%), Gaps = 63/7105 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TATTGCTATTCTCCAATTGATCCAACGAAACTA-GGAATCCATTCTTTGttttttttttt 59
||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||
Sbjct 3 TATTGTTGTTCTCCAATTGATCCAACGAAACTACGAAATCCATTCTTTG----TTTTATT 58
Query 60 tttttATTTGCCCTAGGATTCTGTGATCC-A----TG--------GTCGCTGATTCTGGA 106
|||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||
Sbjct 59 TTTTTA---GCCCTAGGATTCTGTGATCCAATCTCTGTTTTCTTCTTCGCTGATTCTGG- 114
Query 107 AAGG-TCTGTTGCTTCTTTTGAATTTCCAGAAGCGGAACTTTGCAGGTTAGGTGTTACTT 165
|||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 115 AAGGTTCTTTTGCTTC-TTTGAATTTCTAGAAGCGGAACTTTGAAGGTTAAGTGTTACTT 173
Query 166 TGAGCGGAGAGATGGATTCTGTCTCGGAACTTT-TATCCCCGGCGCCGTTTGGTGATTTT 224
||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 174 TGACCGGACAGATGGATTCTGACTCGGAACTTTATAT-CCCGGCGCCGTTTGGAGATTTT 232
Query 225 ACGGTGATGCGGATTTTGAGTTAGAAGCGAGGCGGAGTGACTGATTTCGTAGCTTTCTTC 284
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||
Sbjct 233 ACGGTGATGCGGATTTTGAGTTAGAAGCGACGCGGA--GA--GATTTCATAGGTTTCTTC 288
Query 285 TGCA-C-C-TTCCACTAGGTGTGTAATCTAAAAG-AG-TG-TTTATGCAGATGTTGAAGG 338
|||| | | |||||| | | | || | | | | | | | | || |||||||||||
Sbjct 289 TGCACCACATTCCAC---GAG-G-AAACCAGAGGCTGAAGCTAAAAGC-GATGTTGAAGG 342
Query 339 CCTTCCTTCCTGGAACGC---AGGAGGAAACATCATCTTCTTTGCAGTCTGGGAAACTCA 395
|||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 343 CCTTTCTTCCTGGAACGCAGGAGGAGGAAACATTATCTTCTTTGCAGTCTGGGAAAGTCG 402
Query 396 ATGCAAAAATGGAAATGGACGACCCAGAGAAGGCAATGGCTACAGTTGCTCAGCTCATAG 455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 ATGCAAAAATGGAAATGGACGACCCAGAGAAGGCAATGGCTACAGTTGCTCAGCTCATAG 462
Query 456 AGCAACTTCATGCGAAAACATCTTCTCCGCAAGACAAAGAACTCACAACAGCTCGTCTAC 515
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 463 AGCAACTTCATGCGAAAACATCTTCACCGCAAGATAAAGAACTCACAACAGCTCGTCTAC 522
Query 516 TAGGTATTGCAAAAGGCAAAAGGGAGGCAAGAAGGCTGATCGGTTCGTATGGCCAAGCAA 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 TAGGTATTGCAAAAGGCAAAAGGGAGGCAAGAAGGCTCATCGGTTCGTATGGCCAAGCAA 582
Query 576 TGCCTTTATTTATTTCCATGCTTAGAAATGGGACGAGTATGGCCAAAGTAAATGTCGCTT 635
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 583 TGCCTTTATTTATTTCCATGCTTAGAAATGGGACGACTTTGGCCAAAGTAAATGTCGCTT 642
Query 636 CAATCCTTTGTGTTTTATGCAAAGACAAAGACTTGCGACTAAAAGTTCTTCTAGGAGGAT 695
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 643 CAATCCTTTGTGTATTGTGCAAAGACAAAGACTTGCGACTAAAAGTGCTTCTAGGAGGAT 702
Query 696 GCATCCCGCCATTACTCTCGGTTTTGAAGTCTGGAACCATTGAAACTAGAAAAGCAGCCG 755
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 703 GCATCCCGCCATTACTCTCGGTTTTGAAGTCCGGAACCATGGAAACTAGAAAAGCAGCAG 762
Query 756 CAGAAGCTATATGTGAGGTTTCTTCTGCTGGAATTTCCAATGACCACATTGGCATGAAAA 815
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 763 CAGAAGCTATATATGAGGTTTCTTCTGCTGGTATTTCCAATGACCACATTGGAATGAAAA 822
Query 816 TATTTATCACAGAAGGTGTTGTGCCAACATTGTGGGATCAACTTAGCCTGAAAGGAAATC 875
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 TATTTATCACAGAAGGTGTTGTTCCAACTTTGTGGGATCAACTTAGCCTGAAAGGAAATC 882
Query 876 AGGAGAAAGTGGTTGAAGGGTATGTTACTGGAGCTTTGAGGAATCTTTGTGGCGTTGATG 935
|||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 AGGATAAAGTTGTTGAAGGGTATGTTACTGGCGCTTTGAGGAATCTTTGTGGCGTTGATG 942
Query 936 ATAGTTATTGGAGACTGACACTAGAGGGTAGTGGTGTAGACATAGTCGTGTCTCTTTTGT 995
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 943 ATGGTTATTGGAGACTGACACTAGAGGGTAGTGGTGTAGACATAGTTGTGTCTCTTTTGT 1002
Query 996 CATCTGATAACCCTCATTCTCAAGCAAATGCTGCTTCTCTGCTGGCTCGTCTAGTTCTGT 1055
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 CATCTGATAACCCTAATTCTCAAGCAAATGCTGCTTCTCTGCTGGCTCGTCTAGTTCTGT 1062
Query 1056 CCTTTTGTGATAGCATCCAGAAAATATTAAATTCTGGAGTTGTCAAGTCTCTGATACAGC 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 CCTTTTGTGATAGCATCCAGAAAATATTAAATTCTGGAGTTGTCAAGTCTCTGATACAGC 1122
Query 1116 TTTTGGAACAGAAAAATGATATCAATGTTCGTGCTAGTGCAGCAGATGCTTTGGAAGCTC 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 TTTTGGAACAGAAAAATGATATCAATGTTCGTGCTAGTGCAGCAGATGCTTTGGAAGCTC 1182
Query 1176 TTTCATCAAAATCCGATGAGGCTAAGAAATGTGTCAAAGAGGCAGGAGGTGTTCATGCTC 1235
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TTTCAGCAAATTCCGATGAGGCTAAGAAATGTGTCAAAGATGCAGGAGGTGTTCATGCTC 1242
Query 1236 TCATTGAAGCCATTGTTGCTCCATCGAAAGAGTGTATGCAGGGAAAACATGGACAATCTC 1295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 TCATTGAAGCCATTGTTGCTCCATCGAAAGAGTGTATGCAGGGAAAACATGGACAATCTC 1302
Query 1296 TACAAGAACATGCAACTGGAGCTTTAGCAAATGTGTTTGGTGGGATGCTCCATTTGATTA 1355
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1303 TACAAGAACATGCAACTGGAGCTTTAGCAAATGTGTTTGGTGGGATGCGCCATTTGATTA 1362
Query 1356 TATATCTTGGAGAAGTATCACAATCCCCACGTCTAACGGAACCAATTGGTGATGTAATTG 1415
||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 TATATCTTGGACAAGTCTCACAATCCCCTCGTCTAACGGAACCAATTGGTGATGTAATTG 1422
Query 1416 GAGCCCTTGCCTATGCTCTAATGATTTTCAAACAACCAGAGAGTTCGGAGAAGATATTTG 1475
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1423 GAGCCCTTGCCTATGCTCTAATGATTTTCAAACAACCAGAGAGTTCCGAGAATATATTTG 1482
Query 1476 ATCCAAGCGTGACAGAGAGCATTTTGGTAAAGTTACTAAAGCCTCGTGACACAAAGTTAA 1535
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 ATCCAAGCGTGATAGAGAGCATTTTGGTAAAGTTACTAAAGCCTCGTGACACAAAGTTAA 1542
Query 1536 TCCAAGAACGGATCTTAGAGGCTATGGCGAGCTTGTACGGAAACAGTAGTCTATCGTGTT 1595
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1543 TCCAAGAACGGATCTTAGAGGCTATGGCGAGCTTGTACGGAAACAGTAGTCTGTCGTGTT 1602
Query 1596 ACCTAGATGATGCAGAAGCTAAGAGAGTTCTTATCGCTCTCATAACCATGGCTTCTGCTG 1655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 ACCTAGATGATGCAGAAGCTAAGAGAGTTCTTATCGCTCTCATAACCATGGCTTCTGCTG 1662
Query 1656 ATGTACGAGAGCGTCTGATAATTTGCTTGTCTGGCTTATGCCATGACAAAGTTGGAATTT 1715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1663 ATGTACGAGAGCGTCTGATAATTTGCTTGTCTGGCTTATGCCATGACAAGGTTGGAATTT 1722
Query 1716 GGGAGGCGATTGGAAAGAGAGAAGGAATCCAGTTATTTATATCATTTCTAGGTTTGTCTA 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1723 GGGAGGCGATTGGAAAGAGAGAAGGAATCCAGTTATTTATATCATTTCTAGGTTTGTCTA 1782
Query 1776 GTGAGCAACACCAAGAGTATGCTGTTGAAATGTTGAAAATTTTGACGGCTCAGGTGGATG 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 GTGAGCAACACCAAGAGTATGCTGTTGAAATGTTGAAAATTTTGACGGCTCAGGTGGATG 1842
Query 1836 ATAGTAAATGGGCTGTAACAGCAGCCGGGGGGATTCCTCCACTTGTCCAGTTGCTCGAGA 1895
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 ATAGTAAATGGGCTGTAACAGCAGCCGGGGGGATACCTCCACTTGTCCAGTTGCTCGAGA 1902
Query 1896 CTGGATCTCAGAAGGCCAAGGAAGATGCTGCCTGCATTCTCTGGAATTTGTGTTGTCACA 1955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 CTGGATCTCAGAAGGCCAAGGAAGATGCTGCCTGCATTCTCTGGAATTTGTGTTGTCACA 1962
Query 1956 GTGAGGAAATCCGTGATTGTGTTGAAAGAGCTGGTGGTATTCCAGCATTCTTGTGGCTTC 2015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 GTGAGGAAATCCGTGATTGTGTTGAAAGAGCTGGTGGTATTCCAGCATTCTTGTGGCTTC 2022
Query 2016 TGAAGACTGGTGGACCAAATTCCCAGGACACATCTGCAAAGACACTTGTGAAGCTTGTCC 2075
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 TGAAGACTGGTGGACCAAATTCCCAGGAAACATCTGCAAAGACACTTGTGAAGCTTGTCC 2082
Query 2076 ATACAGCTGATCCTGCCACAGTTAATCAGTTGTTGGCTTTACTTCTGGGAGATGATCCAA 2135
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2083 ATACAGCTGATCCTGCCACAATAAATCAGTTGTTGGCTTTACTTCTGGGAGATGATCCGA 2142
Query 2136 CTTCAAAGATTCATGTAATAAAAGTATTGGGTCATGTGCTCTCAAAAGCTTCACAAGAGG 2195
||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 CTTCAAAGATTCAGGTAATAGAAGTGTTGGGTCATGTGCTCTCAAAAGCTTCACAAGAGG 2202
Query 2196 ATCTTGTTCATAGAGGATGTGCCGCTAACAAAGGACTGAGGTCCCTTGTCGAGTCCCTAA 2255
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2203 ATCTTGTTCATAGAGGATGTGCCGCTAACAAAGGACTGAGGTCCCTAGTCGAGTCCCTAA 2262
Query 2256 CATCTTCCAGGGAAGAAACAAAGGAGCATACAGCTTCAGTTTTAGCTGATCTGTTCAGCT 2315
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 CATCTTCCAGAGAAGAAACAAAGGAGCATACAGCTTCAGTTTTAGCTGATCTGTTCAGCT 2322
Query 2316 CAAGACAAGATATCTGTGGTCATCTTGCGACTGATGACATTATTAATCCCTGGATCAAGC 2375
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2323 CAAGACAAGATATTTGTGGTCATCTTGCGACGGATGACATTATTAATCCCTGGATCAAGC 2382
Query 2376 TGCTTACAAACAACACCCAGAATGTGGCCAAACAGGTGGCTAGGGCTTTAGACGCACTGT 2435
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2383 TGCTTACAAACAACACTCAGAATGTGGCAAAACAGGTGGCTAGGGCTTTGGACGCACTGT 2442
Query 2436 CCCGCCCGGTTAAGAAAAATAATAATAAAAAGAAGTCTTACATTGCAGAAGGAGATATTA 2495
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2443 CCCGCCCAGTTAAGAACAATAATAATAAAAAGAAGTCTTACATTGCCGAAGGAGATATTA 2502
Query 2496 AGTCACTCATAAAATTGGCTAAGAACTCTTCCATTGAGTCTGCAGAAAATGCGGTTTCTG 2555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2503 AGTCACTCATAAAATTGGCTAAGAACTCTTCCATTGAGTCTGCAGAAAATGCGGTATCTG 2562
Query 2556 CCCTCGCAAATCTTCTGTCTGATCCGGATATCGCTGCAGAAGCACTAGCTGAAGATGTTG 2615
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563 CCCTCGCAAATCTTCTGTCTGATCCGGATATAGCTGCAGAAGCACTAGCTGAAGATGTTG 2622
Query 2616 TTTCAGCTTTCACAAGAATTTTGGCTGATGGATCTCCAGAGGGTAAGAGAAATGCGTCAC 2675
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 TTTCCGCTTTCACAAGAATTTTGGCTGATGGATCTCCAGAGGGTAAGAGAAATGCGTCAC 2682
Query 2676 GGGCACTTCATCAGTTACTTAAGAACTTTCCAGTTTGTGATGTGCTAAAGGGAAGTGCTC 2735
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2683 GCGCACTTCATCAGTTACTTAAGAACTTTCCAGTTTGTGATGTGCTAAAGGGAAGTGCTC 2742
Query 2736 AGTGCCGTTTTGCTATACTTTCGCTCGTTGATTCTCTAAAATCAATTGATGTGGATAGCC 2795
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2743 AGTGCCGTTTTGCTATACTTTCACTCGTTGATTCTCTAAAATCAATTGATGTGGATAGCG 2802
Query 2796 CAGATGCTTTCAACATATTAGAAGTAGTTGCGCTCTTGGCAAAGACTAAGAGTGGGGTGA 2855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803 CAGATGCTTTCAACATATTAGAAGTAGTTGCGCTCTTGGCAAAGACTAAGAGTGGGGTGA 2862
Query 2856 ATTTCTCTTATCCTCCATGGATTGCCCTTGCCGAAGTGCCTTCAAGCCTGGAGACCCTTG 2915
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2863 ATTTCTCTTACCCTCCATGGATTGCCCTTGCCGAAGTGCCATCAAGCCTGGAGACTCTTG 2922
Query 2916 TGCAATGCCTTACTGAAGGCCATACTCTTGTGCAAGATAAGGCAATAGAAGTTTTGTCCA 2975
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2923 TGCAATGCCTTGCCGAAGGCCATACTCTTGTGCAAGATAAGGCAATAGAAGTTTTGTCCA 2982
Query 2976 GGCTTTGCTCTGATCAACAGTTTCTGCTCAGTGAACTTATAGTTTCAAGACCCAAGTCAA 3035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2983 GGCTTTGCTCTGATCAACAGTTTCTGCTCAGTGAACTTATAGTTTCAAGACCCAAGTCAA 3042
Query 3036 TGGGGGTTCTGGCTGATAGAATAGTGAATGCATCCAGCTTAGAAGTGAGAGTTGGGGGGA 3095
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3043 TGTTGGTTCTGGCTGATAGAATAGTGAATGCATCCAGCTTAGAAGTGAGAGTTGGGAGCA 3102
Query 3096 CGGCGCTGCTCTTATGTGCTGCAAAGGAAAAGAAGCAGCTGATCACAGAGACACTTGATC 3155
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3103 CAGCGCTGCTCTTATGTGCTGCAAAGGAAAAGAAGCAGCTGATCACGGAGACACTTGATC 3162
Query 3156 AGTCTGGTTTTTCAAAACTCTTGTTACATGCCCTCGTTGATATGATAAAGCACAATTCTA 3215
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3163 AGTCTGGTTTTTTAAAGCTCTTGTTACATGCCCTCGTTGATATGATAAAGCACAATTCTA 3222
Query 3216 CATGCTTTTCTCTAGAGACTGAAGTCCAGACACCTAAAGGTTTTTTGGaaaaaaaaGTTT 3275
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3223 CAAGCTTTTCTCTAGAGACTGAAGTCCAGACACCTAAAGGTTTTTTGGAAAAAAATGTTT 3282
Query 3276 TCCAGGATACAGGTAGCTTTTATTTTCCTGATCCAGCTAAAATCTTGGGTGGTACAGTCG 3335
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3283 TCCAGGATACAGGTAGTTTTTATTTTCCTGATCCAGCTAAAATCTTGGGTGGTACAGTCG 3342
Query 3336 CATTGTGGCTGCTATGCATACTCACTTCCGTTGATGCTAAGTCAAAGGTCATTGTTATGG 3395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3343 CATTGTGGCTGCTATGCATACTCACTTCCGTTGATGCTAAGTCAAAGGTCATTGTTATGG 3402
Query 3396 AAGCTGGCGGACTTGAGGTGCTCTTGGGGAAGCTTGCTAGGTATACTTCCAGTCCTCAGG 3455
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3403 AAGCTGGCGGACTTGAGGTGCTCGTGGGGAAGCTTGCTAGGTATACTTCCAGTGCTCAGG 3462
Query 3456 CTGAATTTGAGGATACAGAAGGCATTTGGATTAGTGCTCTCCTCCTGGCTATTATGTTCC 3515
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3463 CTGAATTTGAGGATACAGAAGGCATTTGGATTAGTGCTCTCCTCCTGGCTATCATGTTCC 3522
Query 3516 AGGATGACAATGTGTCCTTTTCTTCAACGACAATGCGGATCATTCCAACACTTGCAGTTT 3575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3523 AGGATGACAATGTGTCCTTTTCTTCAACGACAATGCGGATCATTCCAACACTTGCAGTTT 3582
Query 3576 TGCTAGGATCTGATGAACTGGTAGATCGGTATTTCGCTGCCCACGCAATGGCTAGTCTTG 3635
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3583 TGCTAGGATCTGATGAACTGATAGATCGGTATTTCGCTGCCCACGCAATGGCTAGTCTTG 3642
Query 3636 TTTGTACTAGGAACAGAGGAATAAATCTGACAATTGCAAACTCAGGTGCTGTTTCTGGGA 3695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3643 TTTGTACTAGGAACAGAGGAATAAATCTGACAATTGCAAACTCTGGTGCTGTTTCTGGGA 3702
Query 3696 TAATAAACCTTCTTGGCTATGTGGAATCGGACATACTGAACTTGGTTGCTTTGGCAAATG 3755
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3703 TAATAAACCTTCTTGGCTATGTGGAATCGGAGATACTGAACTTGGTTGCTTTGGCAAATG 3762
Query 3756 AATTTTCTCTGGTGAAAGAGCCTGATCAAGTTATTCTTCAACACCTTTTTGAAATTGACG 3815
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3763 AATTTTCTCTCGTGAAAGAGCCTGATCAAGTTATTCTTCAACACCTTTTTGAAATTGAAG 3822
Query 3816 ATGTGAGGCTTGGCTCCACTGCACGCAAATCTATCCCACTACTTGTCGATCTCTTAAGGC 3875
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 3823 ATGTGAGGCTTGGCTCCACTGCACGTAAATCTATCCCGCTGCTTGTAGATCTCTTAAGGC 3882
Query 3876 CAATTCCAGATAGGCCTGGAGCCCCTCAGTTTGCTGTCCAAATCCTGATTCGCATTGCTG 3935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3883 CAATTCCAGATAGGCCTGGAGCCCCTCAGTTTGCTGTCCAAATCCTGATTCGCATTGCTG 3942
Query 3936 ATGGAAGTGACACAAATAAATTACTAATGGCTGAAGCTGGAGCCGTTGAAGCTTTAACAA 3995
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3943 ATGGAAGTGACACAAATAAATTACTTATGGCTGAAGCTGGAGCTGTTGAAGCTTTAACAA 4002
Query 3996 AGTACCTTTCGCTTAGTCCTCAAGATTCAACTGAGTACGCCATATCTGAATTGCTTAGGG 4055
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4003 AGTACCTTTCTCTAAGTCCTCAAGATTCAACTGAGTACGCCATATCTGAATTGCTTAGGG 4062
Query 4056 TATTATTTAGCAACCACGAGCTTAGACAAAACGAAATGGCACTAAGTTCCTTGAATCAGC 4115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4063 TATTATTTAGCAACCACGAGCTTAGACAAAACGAAATGGCACTAAGTTCCTTGAATCAGC 4122
Query 4116 TTATCGCAGTACTGCGGCTAGGTTCAAGAAGTGCAAGATACAGCGCAGCTGGGGCTCTGA 4175
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4123 TTATCGCAGTACTGCGGCTAGGTTCACGAAGTGCAAGATACAGCGCAGCTGGGGCTCTGA 4182
Query 4176 ATGAACTATTTGAAGCTGAAAACATAAGAAATTCTGAAATCGCCTGCCAGGCTGTTCAAC 4235
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4183 ATGAACTATTTGATGCTGAAAACATCAGAAATTCTGAAATCGCCTGCCAGGCTGTTCAAC 4242
Query 4236 CACTAATGGACATATTCGGTACTGTATCAGAAAGTGAGCAAGAGGTAGCTCTCTCTGCAT 4295
|||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4243 CACTTATGGACATACTCGGTTCTGTATCAGAAAGTGAGCAAGAGGTAGCTCTCTCTGCAT 4302
Query 4296 TGATCAAACTAAGCTCAGGAAATACTTCGAATACAGCTCTTCTGATTGATGTGGAAGGAA 4355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4303 TGATCAAACTAAGCTCAGGAAATACTTCGAATACAGCTCTTCTGATTGATGTGGAAGGAA 4362
Query 4356 GTCTGCTGGAAAACGTGATCAAAATCTTATCATCTGCTTCTGCTTCAGAGGAGTTAAAGA 4415
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4363 GTCTGCTGGAAAACGTGATCAAAATCTTATCATCTGCTACTGCTTCAGAGGAGTTAAAGA 4422
Query 4416 TAAATGCTGCCAGACTTTGTTCTGTTGTTTTCTTGAATAAAAACATCAGAACAAGTCCAT 4475
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4423 TAAATGCTGCCAGACTTTGTTCTGTTGTTTTCTCGAATAAAAACATCAGAACAAGTGCAT 4482
Query 4476 CCGCATCCGGATGCATGAAGCCTTTGATAACACTTATGCAGTCTGAAAGAAGTGCAGCAG 4535
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4483 CCGCCTCCGGATGCATGAAGCCGTTAATAACACTTATGCAGTCTGAAAGAAGTGCAGCAG 4542
Query 4536 TTGAAGCAGCAATTTGTGCTATTAAGATATTATTGGATGACGAGCAACATTTAGAACTAG 4595
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4543 TTGAAGCAGCAGTTTTTGCTATTAAGATATTATTGGATGACGAGCAACATTTAGAACTAG 4602
Query 4596 CAGCCGCACATAACATTCAAGAGCTTCTTGTTGGCTTGGTTTCCGG-AAGAAATTACGTT 4654
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4603 CAGCCGCACATAACATTCAGGAGCTTCTTGTTGGCTTGGTTTCCGGGAA-AAATTACGTT 4661
Query 4655 ATTATTGAGGCTAGCTTATCAGCTCTCATTAAGTTGGGGAAAGACAGAGTACCACGCAAG 4714
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4662 ATTATTGAGGCTAGCTTATCAGCTCTCATTAAGTTGGGAAAAGACAGAGTACCACGCAAG 4721
Query 4715 TTGGACATGGTGGAAGCTGGAATAATTGAGCGATGTCTTGAGCTACTACCTGGAGCCTCG 4774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4722 TTGGACATGGTGGAAGCTGGAATAATTGAGCGATGTCTTGAGCTACTACCTGGAGCCTCG 4781
Query 4775 AGTTCGTTATGTTCTGCTGTTGCAGAGCTGTTTCGAATTTTAACAAATAGTGGAGTAATT 4834
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4782 AGTTCGTTATGTTCCGCTGTTGTAGAGCTGTTTCGTATTTTAACAAATAGTGGAGTAATC 4841
Query 4835 GCGAGAAGACCAGATGTTGCAAAAACTGTTGAGCCTCTATTCGCAGTCTTGCTCCGGTCA 4894
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 4842 GCGAGAAGACCAGATGTTGCAAAAACTGTAGAGCCTCTCTTCGCGGTCTTGCTGCGGTCA 4901
Query 4895 GACTTGACCTTATGGGGGCAACATAGTGCCCTGCAAGCACTTGTAAATATATTGGAAAAA 4954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 4902 GACTTGACCTTATGGGGGCAACATAGTGCCCTGCAAGCACTCGTAAACATATTGGAAAAA 4961
Query 4955 CAGCAAAGCCTTGAAGCTTTTAGTTTTACACCCAGTGAAGCCATCGTGCCGCTGATTTCC 5014
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4962 CAGCAAACCCTTGAAGCTTTTAGTTTTACACCCAGTGAAGCCATTGTGCCGCTGATTTCT 5021
Query 5015 TTTTTAGAATCTTCACCCCAAGCTATCCAGCAGCTTGGAGCAGAACTGCTGAGCCATTTT 5074
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5022 TTTTTAGAATCTTCATCCCAAGCTATCCAGCAGCTTGGAGCAGAACTGCTGAGCCATTTT 5081
Query 5075 CTTACAATGGAAGATTTCCAGCAAGACATCACAACACAGAGTGCTGTTGTCCCTCTGGTC 5134
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5082 CTTACAATGGAAGATTTCCAGCAAGACATCACAACACAGAGTGCTGTTGTTCCTCTGGTC 5141
Query 5135 CGGCTTGCAGGAATTGGAATACTGAGCCTGCAGGAAACTGCGATAAAGGCATTGGAGAAG 5194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5142 CGGCTTGCAGGAATTGGAATACTGAGCCTGCAGGAAACTGCGATAAAGGCATTGGAGAAG 5201
Query 5195 ATATCTGCTAGCTGGCCTAAGGCTGTTCTTGATGCTGGAGGTATTTTTGAGCTATCCAAG 5254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5202 ATATCTGCTAGCTGGCCTAAGGCTGTTCTTGATGCTGAAGGTATTTTTGAGCTATCCAAG 5261
Query 5255 GTTATTCTTCAGGAAGATCCTCAGCCCCCTCTTGATCTATGGGAGTCAGCTGCTTTTGTT 5314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5262 GTTATTCTTCAGGAAGATCCTCAGCCCCCTCTTGATCTATGGGAGTCAGCTGCCTTTGTT 5321
Query 5315 CTTTCCAACATTCTGCAGTATGATGCAGAATGCTTTTTCAGAGTTGAACTGCCAGTTTTG 5374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5322 CTTTCCAACATTCTGCAGTATGATGCAGAATGCTTTTTCAGAGTTGAACTGCCAGTGTTG 5381
Query 5375 GTAAAATTATTGTTCTCGACAATTGAAGGCACAGTATTACTGGCTCTTAAAGCATTGATG 5434
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5382 GTAAAATTGTTGTTCTCGACAATTGAAAGCACAGTGTTACTGGCTCTTAAAGCTTTGATG 5441
Query 5435 CTTCATGAGAAGAACGATGCTTCAAGCACAGTACAAATGGCTGAGCTTGGCGCAATCGAT 5494
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5442 CTTCATGAGAAGAACGACGCTTCAAGTACAGTACAAATGGCTGAGCTTGGTGCAATCGAT 5501
Query 5495 GCATTGCTGGACCTCCTGAGATCTCATCAATGCGAGGAAGAGTCGGGAAGCTTACTTGAA 5554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 5502 GCATTGCTGGACCTCCTGAGATCTCATCAATGCGAGGAAGAATCTGGAAGCTTACTTGAA 5561
Query 5555 GTAATATTCAACAATCCGAGAGTAAGAGAGTTGAAGTTATGCAAATATGCAATAGCACCA 5614
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5562 GTAATATTTAACAATCCAAGAGTAAGAGAGTTGAAGTTATGCAAATATGCAATAGCACCA 5621
Query 5615 CTATCTCAATATCTGTTGGACCCTCAGACAAGATCAGAACCTGGTAGGCTTCTTGCTGCT 5674
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5622 CTATCTCAATATCTGTTGGACCCTCATACAAGATCAGAACCTGGTAGGCTTCTTGCTGCT 5681
Query 5675 CTGGCACTTGGGGATCTTTCTCAGCATGAAGGGCTTTCTAGATCCAGTGGTTCTGTTTCC 5734
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5682 CTGGCACTGGGGGATCTATCTCAGCATGAAGGGCTTTCTAGATCCAGTGGTTCTGTTTCC 5741
Query 5735 GCTTGTCGGGCACTCATTAGCGTGCTAGAAGAACAACCAACAGAAGAAATGAAAGTGGTG 5794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5742 GCTTGTCGGGCACTCATTAGCGTGCTAGAAGAACAACCAACAGAAGAAATGAAAGTGGTG 5801
Query 5795 GCCATCTGTGCGTTGCAGAATTTTGTGATGAATAGTAGAACGAATAGACGAGCTGTCGCA 5854
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5802 GCCATCTGTGCGTTGCAGAATTTTGTGATGAATAGTAGAACGAATAGACGAGCTGTTGCA 5861
Query 5855 GAGGCTGGTGGCGTATTATTAATTCAGGAGCTACTGCTCTCTTGCAATGCAGAAGTTTCT 5914
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 5862 GAGGCTGGTGGCGTATTGTTAATTCAAGAGCTACTGCTTTCTTGCAACCCAGAAGTTTCT 5921
Query 5915 GGGCAGGCTGCACTAATGGTCAAATTTTTGTTTTCCAACCACACACTCCAAGAATATGTC 5974
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5922 GGGCAGGCTGCACTGATGGTCAAATTTTTGTTTTCCAACCACACACTCCAAGAATATGTC 5981
Query 5975 TCGAATGAGCTTATAAGATCACTAACAGCTGCACTTGAGAGAGGCTTGTGGTCTACAGCA 6034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5982 TCGAATGAGCTTATAAGATCACTAACAGCTGCACTTGAGAGAGGCTTGTGGTCTACAGCA 6041
Query 6035 ACTATAAATATCGAAGTTTTGAGAACCTTAAATGTGATTTTCTCCAATTTTCCTAAGCTC 6094
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6042 ACTATAAATATTGAAGTTTTGAGAACCTTAAATGTGATTTTCTCCAATTTTCCTAAGCTC 6101
Query 6095 CGTGCCTCAGAAGCTGCTACTTTCTGCATCCCTCATTTGGTAGGGGCCCTCAAATCTGGT 6154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6102 CGTGCCTCAGAAGCTGCTACTTTCTGCATCCCTCATTTGGTAGGGGCGCTCAAATCTGGT 6161
Query 6155 GTTGAAGACGTCCAGGGATTAGTATTGGATATTCTTTACTTGCTAAGGCACTCCTGGACG 6214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6162 GTTGAAGACGTCCAGGGATTAGTATTGGATATTCTTTACTTGCTAAGACACTCCTGGACG 6221
Query 6215 AATATGTCTATAGATGTTGCAAAGTCCCAAGCCATGATTGCAGCTGAAGCAATTCCCGTC 6274
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6222 AATATGTCTATAGATGTTGCAAAGTCTCAAGCCATGATTGCAGCTGAAGCAATTCCCGTC 6281
Query 6275 CTGCAAATGCTGATGAAAACATGCCCTCCTAGGTTCCACGACAAGGCAGACAGCTTATTG 6334
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6282 CTGCAAATGCTGATGAAAACATGCCCTCCTAGGTTTCACGACAAGGCAGATAGCTTATTG 6341
Query 6335 CACTGCTTACCAGGTTGCTTAACAGTGAACGTCATGCGTGCCAATAACTTAAAGCAGTCC 6394
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6342 CACTGCTTACCAGGTTGCTTAACAGTGAACGTCATGCGTGCCAATAACTTAAAGCAGTCT 6401
Query 6395 ATGGCAACCACAAACGCCTTTTGTCAATTAACAATAGGAAACTGCCCTCCACGGCAAACT 6454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6402 ATGGCAACCACAAACGCCTTTTGTCAATTAACAATAGGAAACTGCCCTCCACGGCAAACT 6461
Query 6455 AAGGTCGTTAGCAATAGCACAACTCCTGAATGGAAAGAAGGCTTTACTTGGGCATTTGAT 6514
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6462 AAGGTCGTGAGCAATAGCACTACTCCTGAATGGAAAGAAGGCTTTACTTGGGCATTTGAT 6521
Query 6515 GTTCCCCCCAAAGGACAAAAGCTTCACATCATATGCAAGAGCAAAAGCACATTTGGAAAG 6574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6522 GTTCCCCCCAAAGGACAAAAGCTTCACATCATATGCAAGAGCAAAAGCACATTTGGAAAG 6581
Query 6575 ACAACTCTAGGCCGTGTTACTATCCAAATCGACAAAGTTGTGACAGAAGGAGAGTACAGT 6634
|| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6582 ACGACTCTAGGGCGAGTTACTATCCAAATCGACAAAGTCGTGACAGAAGGAGAGTACAGT 6641
Query 6635 GGATCTCTAAGCCTGAATCATGAAAACAGCAAAGATACTTCTTCCAGATCACTTGACATT 6694
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 6642 GGATCTCTAAGCCTGAATCATGAAAATAGCAAAGATGCTTCTTCCAGATCACTCGACATT 6701
Query 6695 GAGATTGCATGGTCCAATAGGACAACGGATGAGACTCATTGATCTTCACAAGCACAATGC 6754
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6702 GAGATAGCATGGTCCAATAGGACAACGGATGAGACTCATTGATCTTCACAAGCACAATGC 6761
Query 6755 ACTTGGTCAAGGGAAGACTTAA-TCTGTCTAATG--------G-CTGCATTTTGGTAGTA 6804
||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 6762 ACTTGGTCATTGGAAGACTGAAATCTGTCTAATGCTCCTAATGACTGCATTTTGGTAGTA 6821
Query 6805 GAAGAAGGAAAGCAAACTCTGCAGCAGATGTATAGCAATACGTGTATATGAGTA-ATGAG 6863
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||
Sbjct 6822 GAAGAAGGAAAGCAAAGTCTGCAGCAGATGTATAGCAATACGTATATATGGGTAGA-GAA 6880
Query 6864 TATGGTGTGTGAAAAGGAACGTAGAAGCAAAGAGTTCCTGCCTAGCAAGAAAGAAAG-TC 6922
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||
Sbjct 6881 TATGGTGTGTGAAAAGGAACATAGAAGCAAAGAGTTCCTGCCTAGCAAGAGAGAAGGGTC 6940
Query 6923 TTATTGTATAGGTTGTTTCTCTTCttttttt-GGTCTGCGATCTTCGGTATTTGTCAGTT 6981
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 6941 TTATTGTATAGGTTGAATCTCTTCTTTTTTTTGGTCTGCGATGTTCGGTATTTGACAGTT 7000
Query 6982 TGTTCACAAAAATTCTTTCGCTCGGGGATCAACTAAGCAGCACGAAGTGCTCTGATTCCT 7041
|||| || || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 7001 TGTTTACGAACCTT-TT-CGCTCGGGGATCAACTAAGCAGCACAAAGTGCTCTGATTTCT 7058
Query 7042 GTAGCGATGTTTAAGTTATTTTACC 7066
||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 7059 GTAGCGATGTTCAAGTTATTTTACC 7083
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 352838453958
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5