BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg477100
Length=4281
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G79350.1 | Symbols: EMB1135 | RING/FYVE/PHD zinc finger supe... 6831 0.0
> AT1G79350.1 | Symbols: EMB1135 | RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily
protein | chr1:29844633-29853414 REVERSE LENGTH=4283
Length=4283
Score = 6831 bits (3699), Expect = 0.0
Identities = 4133/4326 (96%), Gaps = 96/4326 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAAGGGAAGAAAATCTGAAACCaaaaaaaaCGAGAAGGGAGTC---GAAGAACCTTTC 57
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 9 AAAAAGGGAAGAAAATCTGAAACCAAAAAAAACGAGAAGGGAGTCGAAGAAGAACCTTTC 68
Query 58 GCGCTCTGGCGAAATTCATTACTTACACT-GATTTATAC---TTTTGTCTTCCTCTCTCT 113
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||
Sbjct 69 GCGCTCTGACGAAATTCATTACTTACACTGGATTTATACTTTTTTTGTCTT-C-CTCTCT 126
Query 114 CAATTATCTCC-TCAAACGCCACAAGATCCTTAAGGCCTCGCACGGATCTCTC-TACGAT 171
||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||
Sbjct 127 CAATTATCTCCTTC-AACGCCACAAGATCC-TAAGGCCTCTCACGGATCTCTCTTAAGAT 184
Query 172 CAATCGCCGCGGCTCATGACGCAGTCGCCTGTTCAACCGCCTCCGCCGCTCCCCGCTCCG 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 185 CAATCGCCGCGGCTCATGACGCAGTCGCCTGTTCAACCGCCTCCGCCGCTCCCAGCTCAG 244
Query 232 CCGCATTCCGCCGGCGGTGGTGTAATAAGA-GCAGATGTACAGGTTAGGTGCGCAGGCTG 290
||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 CCGCATTCCGCCGCCGGAGGTGTAATAAGAGGC-GATGTACAGGTTAGGTGCGCAGGCTG 303
Query 291 TCGCGTGATTCTGAGGGTGAAGACCGGCGTTGTGGAGTTCTCGTGTCCGACTTGTCAACT 350
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 TCGCGTGATTCTGAGGGTGAAAACCGGCGTTGTGGAGTTCTCGTGTCCGACTTGTCAACT 363
Query 351 TCCCCAAATGTTGCCGCCGGAGCTTCTTTCTAGGGCACGGCCGCAGTTTCCGCAGTCTCA 410
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 TCCCCAAATGTTGCCGCCGGAGCTTCTTTCTAGGGCACGGCCGCAGTTTCCGCAGTCTC- 422
Query 411 ACAACAACCACCACCGCCTCAACCGCAGCCGATTCAGACGCTTCCGCCACCGATTCAACA 470
| |||| || | | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 -C-ACAA-CA--A----C-C-ACCACAGCCAATTCAGACGCTTCCGCCACCGATTCAACA 471
Query 471 GCAGCTTAAGCCTCTTAATTTACCTAGGCCTCCGGTTCCGGCACATGGAATCGATCCGAC 530
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 GCAGCTTAAGCCTCTTAATCTACCTAGGCCTCCGGTTCCGGCACATGGAATCGATCCGAC 531
Query 531 GAAGATGCAATTGCCTTGCGCTAACTGTCAAGCTATCCTTAATGTGCCTCATGGACTCAC 590
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 532 GAAGATGCAATTGCCTTGCGCTAACTGTCAGGCTATCCTCAATGTGCCTCATGGACTCAC 591
Query 591 TCGGTTCTCGTGTCCTCAGTGCCATGTCGAGCTCGCTGTTGATGTCTCCAAGCTTAATCG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TCGGTTCTCGTGTCCTCAGTGCCATGTCGAGCTCGCTGTTGATGTCTCCAAGCTTAATCG 651
Query 651 GTCTTTAACTGctcctcaatctcatcctaatcctcctact-c--ctactcctgc--t-cc 704
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||| | | ||
Sbjct 652 GTCTTTAACTGCTTCTCAATCTCATTCTAATCCTCCTACTCCTGCTGCTCCCACAGTCCC 711
Query 705 gcctccgcctcctccCGAAGAAGTCAATGAGGAAGCTATTGAAGTGGAGAGAGAAGAAGA 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 GCCTCCGCCTCCTCCCGAAGAAGTCAATGAGGAAGCTATTGAAGTGGAGAGAGAAGAAGA 771
Query 765 TGAAGGTGGAACCGCAGGAGAAACTTTTATGGATTATCGTCCCCCAAAACTTTCAATTGG 824
|||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 772 TGAAGGTGGAACGGCTGGAGAAACGTTTATGGATTATCGTCCCCCAAAACTTTCGATCGG 831
Query 825 ACCTCCTCATCCTGATCCAATTGTGGAAACATCATCTCTATCTGCAGTGCAACCCCCAGA 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 ACCTCCTCATCCTGATCCAATTGTGGAAACATCATCTCTATCTGCAGTGCAACCCCCAGA 891
Query 885 GCCCACTTATGATCTCAAAATCAAGGAAGAGCTCGAAAGGTCAAAGGCTTTATCGTGTTT 944
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 GCCTACTTATGATCTCAAAATCAAGGAAGAGCTTGAAAGGTCAAAGGCTTTATCGTGTTT 951
Query 945 GCAGATTGAGACATTAGTTTACGCTTGTCAGAGGCATCTCCAGCACCTTGCTGATGGTAC 1004
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 952 GCAGATTGAGACATTAGTTTACGCTTGCCAGAGGCATCTCCAGCACCTTGCTGATGGTAC 1011
Query 1005 CAGAGCAGGCTTTTTTGTTGGAGATGGTGCTGGTGTGGGGAAAGGGCGAACAATTGCCGG 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 CAGAGCAGGCTTTTTTGTTGGAGATGGTGCTGGTGTGGGCAAAGGGCGAACAATTGCCGG 1071
Query 1065 GTTGATTTGGGAAAATTGGAAACATGGAAGGAGGAAAGCTTTGTGGATATCTATTGGCTC 1124
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1072 GTTGATTTGGGAAAATTGGAAACATGGAAGGAGGAAAGCTTTGTGGATTTCTATTGGCTC 1131
Query 1125 AGACTTGAAGTATGATGCAAGAAGGGACTTGGATGATGTGGGTGCCACATGCGTTGGAGT 1184
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1132 AGACTTGAAATATGATGCAAGAAGGGACTTGGATGATGTGGGTGCTACATGCGTTGGAGT 1191
Query 1185 GAATCCTTTGAACAAGCTACCCTATTCTAAGCTTGACTCAAAAAATGTGGGTATTAAAGA 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1192 GAATCCTTTGAACAAGCTACCCTATTCTAAGCTTGACTCGAAAAATGTTGGTATTAAAGA 1251
Query 1245 AGGAGTGGTATTCTTGACATACAATAGCCTCATTGCTTCCTCTGAGAAGGGCCGTTCTCG 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 AGGAGTGGTATTCTTGACATACAATAGCCTCATTGCTTCCTCTGAGAAGGGCCGTTCTCG 1311
Query 1305 TTTACAGCAGCTTGTTCAATGGTGTGGACCAGAATTTGATGGTCTCTTGATCTTTGATGA 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 TTTACAGCAGCTTGTTCAATGGTGTGGACCAGAATTTGATGGTCTCTTGATCTTTGATGA 1371
Query 1365 GTGCCATAAAGCGAAAAATTTGGTACCTGAAGCTGGGAGTCAGCCGACACGCATCGGGCA 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1372 GTGCCATAAAGCGAAAAATTTGGTACCTGAAGCTGGGAGTCAGCCGACACGCATCGGACA 1431
Query 1425 GGCAGTTGTGGATATTCAGGATAAGATCCCCCAAGCACGTGTTCTTTATTGCTCGGCTAC 1484
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1432 GGCAGTTGTTGACATTCAGGATAAGATCCCCCAAGCACGTGTTATTTATTGCTCGGCTAC 1491
Query 1485 TGGTGCATCAGAACCACGAAACATGGGTTATATGGTCAGGCTTGGTCTTTGGGGAGCTGG 1544
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 TGGGGCATCAGAACCACGAAACATGGGTTATATGGTCAGGCTTGGTCTTTGGGGAGCTGG 1551
Query 1545 AACAAGTTTCAATGATTTTAACAAATTTCTAGGTGCCCTTGATAAAGGTGGGACAGGAGC 1604
||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 AACAAGTTTTAGTGATTTTAACAAATTCCTAGGTGCCCTTGATAAAGGTGGGACAGGAGC 1611
Query 1605 GTTGGAATTGGTTGCCATGGACATGAAAGCGAGGGGGATGTATGTATGCCGAACCCTGAG 1664
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 GTTGGAATTGGTTGCCATGGATATGAAAGCGAGGGGGATGTATGTATGCCGAACCCTGAG 1671
Query 1665 TTACAAAGGGGCTGAGTTTGAGATTGTTGAAGCTCGTTTAGAAGCAGGAATGGAGGCAAT 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 TTACAAAGGGGCTGAGTTTGAGATTGTTGAAGCTCGTTTAGAAGCAGGAATGGAGGCAAT 1731
Query 1725 GTACAATAAGTCTGCAGAATTTTGGGCAGAGCTACGGATAGAGTTGTTGTCAGCAAGTGC 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732 GTACAATAAGTCTGCAGAATTTTGGGCAGAGCTACGGATAGAGTTGTTGTCAGCAAGTGC 1791
Query 1785 TTTTCTCCCTAACGAGAAACCAAATTCTAGTCAGTTGTGGAGATTATACTGGTCAAGCCA 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 TTTTCTCCCTAACGAGAAACCAAATTCTAGTCAGTTGTGGAGATTATACTGGTCAAGCCA 1851
Query 1845 CCAGCGTTTCTTTAGACACCTGTGTATGTCAGCTAAAGTCCCTGTAACTGTGAGGTTAGC 1904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 CCAGCGTTTCTTTAGACACCTGTGTATGTCAGCTAAAGTCCCTGTAACTGTGAGGTTAGC 1911
Query 1905 GAAGAAAGCCTTGTCAACAAACAAGTGTGTGGTTATTGGCCTTCAGAGTACTGGAGAGGC 1964
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 TAAGAAAGCCTTGTCAACAAACAAGTGTGTAGTTATTGGCCTTCAGAGTACTGGAGAGGC 1971
Query 1965 TCGAACCGAAGAGGCTGTAAATAAATATGGTCTTGAGCTTGATGATTTTGTCTCGGGACC 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 TCGAACCGAAGAGGCTGTAAATAAATATGGTCTTGAGCTTGATGATTTTGTCTCGGGACC 2031
Query 2025 TCGAGAGCTCTTGTTGAAATTTGTGGAAGAGAATTATCCCTTACCCGAGCAGCCTGAACC 2084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 TCGAGAGCTCTTGTTGAAATTTGTGGAAGAGAATTATCCCTTACCCGAGCAGCCTGAACC 2091
Query 2085 TCTGTCAGAGGATGATAGTGTTAAAGAACTTCAGAGGAAGAGGCATTCAGCTTCACCTGG 2144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2092 TCTGTCAGAGGATGATAGTGTTAAAGAACTTCAGAGGAAGAGGCATTCAGCTTCACCTGG 2151
Query 2145 TGTTTCAATTAGAGGGAGGGTAAGAAAGATGGCAAAGTGGAAACCAGATAGTGATAATGA 2204
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 TGTTTCAATTAGAGGGAGAGTAAGAAAGATGGCAAAGTGGAAACCAGATAGTGATAATGA 2211
Query 2205 AAGTGATTTGGAGTCTGAAGGTTGGTTTCCTAGTGAAAACATGTCTTCTG-CTGACTCTG 2263
|||||||||||||||||||| | | | | | | || ||| | || | |
Sbjct 2212 AAGTGATTTGGAGTCTGAAG--------C-T-G--A---C-T--CTGCTGAC-GA-T-T- 2249
Query 2264 CTGACGATTCTAATGATTCTGATGATGAGTTCCAGATATGTCAGATATGCAGTGGGGAAG 2323
|| | |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 CTAATGATTCT---GAT---GATGA-G--TTCCAGATATGTCAGATATGCAGTGGGGAAG 2300
Query 2324 ATGAAAGGAAGAAGTTGCTCCATTGTTCTGAATGTGACAAGCTTTTTCATCCGGACTGTG 2383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 ATGAAAGGAAGAAGTTGCTCCATTGTTCTGAATGTGACAAGCTTTTTCATCCGGACTGTG 2360
Query 2384 TGGTTCCTCCAGTAATAGACTTACCATCGGAAGCGTGGATTTGCTATTCTTGCAAGGAAA 2443
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 2361 TGGTTCCTCCAGTTATAGACTTACCATCTGAAGCGTGGATTTGCTTTTCTTGTAAGGAAA 2420
Query 2444 AGACAGAGGAATACATTCAAGCAAGACGTCTTTACATTGCAGAATTGCAGAAAAGGTATG 2503
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2421 AGACAGAGGAGTACATTCAAGCAAGACGTCTTTACATTGCCGAATTGCAGAAAAGGTATG 2480
Query 2504 AAGCAGCG-TTGGAACGAAAATCAAAGATCATAGAGATCATCCGTTCTCTGAATCTTCCA 2562
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2481 AAGCAGCGCTTG-AACGAAAATCAAAGATCATAGAGATCATCCGTTCTCTGAATCTTCCA 2539
Query 2563 AACAATCCTTTGGATGACATTGTCGATCAGCTTGGAGGCCCTGACAAAGTTGCAGAAATA 2622
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2540 AACAATCCTTTGGATGACATCGTCGATCAGCTTGGAGGCCCTGAAAAAGTTGCAGAAATG 2599
Query 2623 ACAGGCAGGCGAGGTATGCTTGTAAGAGCATCTAATGGGAAAGGTGTTACATATCAAGCA 2682
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2600 ACGGGCAGGCGAGGTATGCTTGTAAGAGCATCGAATGGGAAAGGTGTTACATATCAAGCA 2659
Query 2683 AGAAACACAAAGGATATTACAATGGAAATGGTCAACATGCACGAGAAGCAACTATTTATG 2742
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2660 AGAAACACAAAGGATATTACCATGGAAATGGTCAACATGCACGAGAAGCAACTATTTATG 2719
Query 2743 GATGGTAAAAAGTTGGTTGCCATTATTTCTGAGGCTGGGTCAGCTGGTGTTTCGTTGCAA 2802
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2720 GATGGTAAAAAGTTGGTTGCCATTATTTCTGAAGCTGGGTCAGCTGGTGTTTCGTTGCAA 2779
Query 2803 GCAGATAGAAGGGCAGTAAATCAGAAAAGAAGGGTTCACTTGACTTTAGAGCTTCCCTGG 2862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2780 GCAGATAGAAGGGCAGTAAATCAGAAAAGAAGGGTTCACTTGACTTTAGAGCTTCCCTGG 2839
Query 2863 AGTGCTGATCGTGCAATTCAGCAATTTGGAAGAACTCACCGGTCGAACCAGACATCTGCA 2922
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2840 AGTGCTGATCGTGCAATTCAGCAATTTGGAAGAACTCACCGGTCAAATCAGACATCTGCA 2899
Query 2923 CCTGAATATAGACTACTCTTCACAAATCTCGGTGGGGAACGCCGCTTTGCCTCTATTGTT 2982
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2900 CCTGAATATAGACTACTCTTCACTAATCTCGGTGGGGAACGCCGCTTTGCCTCTATTGTT 2959
Query 2983 GCAAAGAGACTAGAAACACTTGGTGCTTTAACACAGGGAGACCGCAGGAAAGT-CA-TGC 3040
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |
Sbjct 2960 GCAAAGAGACTAGAAACACTTGGTGCTTTAACACAGGGAGACCGCAGGGCTGGGCCCTCC 3019
Query 3041 A--CCTT-TCT---T----ATAACTT-TG---GTAA-------AAAA--TCCTTGATGGT 3077
|||| | | | |||| || || |||| |||| |||||||||||
Sbjct 3020 GGGCCTTCTTTGAGTGCGTATAA-TTATGATAGTAACTTTGGTAAAAAATCCTTGATGGT 3078
Query 3078 GATGTATCGAGGCATAATGGAGCAGGAGAAACTACCTGTTGTTCCTCCTGGATGCTCGAT 3137
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3079 GATGTATCGAGGCATAATGGAGCAGGAGAAACTACCTGTTCTTCCTCCTGGATGCTCGAT 3138
Query 3138 TGATGAACCCGAAACAGTTAAAGAGTTTTTGACCAAGGCAAGGGCTGCTCTTGTTGCGGT 3197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3139 TGATGAACCCGAAACAGTTAAAGAGTTTTTGACCAAGGCAAGGGCTGCTCTTGTTGCGGT 3198
Query 3198 TGGAATTGTTAGGGACAGTGTTCTGGCCAATGGGAAAGATGCTGGAAAGTTTTCAGGACG 3257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 3199 TGGAATTGTTAGGGACAGTGTTCTGGCCAATGGGAAAGATGTTGGAAGGTTTTCAGGACG 3258
Query 3258 TATTATTGATTCTGACATGCATGATGTTGGACGATTTTTGAATCGGCTCTTGGGATTGCC 3317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3259 TATTATTGATTCTGACATGCATGATGTTGGACGATTTTTGAATCGCCTCTTAGGATTGCC 3318
Query 3318 ACCTGATATCCAGAATAGGCTGTTTGAATTGTTTACTAGTATATTAGACGTTCTTGTACA 3377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3319 ACCTGATATCCAGAATAGGCTGTTTGAATTGTTTACTAGTATATTAGACGTTCTTGTACA 3378
Query 3378 TAATGCTCGGATCGAAGGAAGTTTTGACTCAGGAATTGTGGATATGAAAGCTAATAGTGT 3437
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3379 TAATGCTCGGATAGAAGGAAGTTTTGACTCAGGAATTGTGGATATGAAAGCTAATAGTGT 3438
Query 3438 TGAGCTGCTGAGCACTCCAAAGACCGTCCATGTTGATCAAATGTCTGGTGCCTCAACTAT 3497
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3439 TGAGCTACTGAGCACTCCAAAGACCGTCCATGTTGATCAAATGTCTGGTGCCTCAACTAT 3498
Query 3498 GCTCTTTACTTTTACTTTGGATCGTGGTGTAACATGGGAGTCTGCGAGTTCAATGCTAGA 3557
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3499 GCTCTTTACTTTTACTCTAGATCGTGGTGTAACATGGGAGTCTGCGAGTTCAATGCTAGA 3558
Query 3558 GGGAAAGAGAAGGGACAGCCTTGGTTCAGCTAATGATGGCTTTTTTGAATCTAAAAGGGA 3617
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3559 GGGAAAGAGAAGGGACGGGCTTGGTTCAGCTAATGATGGCTTTTTTGAATCTAAAAGGGA 3618
Query 3618 ATGGTTAGGAAGACGGCACTTCATATTAGCATTTGAGAGTGCGGCTTCTGGGTTGTTTAA 3677
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3619 ATGGTTAGGAAGACGGCACTTCATATTAGCATTTGAGAGTGCCGCTTCTGGGTTGTTTAA 3678
Query 3678 GATTGTCCGTCCTGCTGTAGGAGAGTCGATCAGGGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAAC 3737
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3679 GATTGTACGTCCTGCTGTAGGAGAGTCGATCAGGGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAAC 3738
Query 3738 TAAATACCGAAAACTCTCTTCTCTGGAGAAGGCTCGTACTGGTTGGGAGGACGAGTACGA 3797
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3739 TAAATACCGAAAACTATCTTCTCTGGAGAAGGCTCGTACTGGTTGGGAGGACGAGTACGA 3798
Query 3798 AGTTTCATCAAAACAGTGTATGCATGGACCCAAGTGTAAGCTAGGCGAGTATTGCACGGT 3857
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 3799 AGTTTCATCAAAACAGTGTATGCATGGACCCAAGTGTAAGCTTGGGGAGTATTGCACGGT 3858
Query 3858 TGGACGTAGAATACAGGAAGTAAACGTTGTGGGTGGCCTCATTCTTCCCATTTGGGGAAC 3917
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3859 TGGACGTAGGATACAGGAAGTAAACGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGAAC 3918
Query 3918 CATTGAGAAAGCTCTCTCCAAACAAGCCCGTCACAGCCACAAGAGAATTCGAGTTATACG 3977
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3919 CATCGAGAAAGCTCTCTCCAAACAAGCCCGTCACAGCCACAAGAGAATTCGAGTTATACG 3978
Query 3978 CATAGAGACTACGACGGATAATCAGCGGATAGTGGGCCTCTCCATCCCAAATGCAGCTGT 4037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3979 CATAGAGACTACGACGGATAATCAGCGGATAGTGGGCCTCTCCATCCCAAATGCAGCTGT 4038
Query 4038 AGAAACTGTTTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATCGATGATTAAGACAACGATTA 4097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 4039 AGAAACTGTTTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATTGATGATTAAGACAACGAGTA 4098
Query 4098 TTTATAAGAAGCATACACCCTCAAAGCTCCAGAACCAAGTTCCCATGCCTATTT-GTATT 4156
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4099 TTTATAAGAAGCATACACCCTCAAAGCTCCACAATCAAGTTCCCATGCCTATTTTGTATT 4158
Query 4157 TTTCTTTATTTaa-aaaaaGAGGAAAAAGACACTTGACTTTCATTTTTGTGTATATCACA 4215
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4159 TT-CTTTATTTAAGAAAAAGAGGAAAAAGACACTTGACTTTCATTTTTGTGTATATCACA 4217
Query 4216 TGACAAATTGGCAAGAAGATACATAGATGTAATATTATTTATCTAACAAGATTCATTCTT 4275
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4218 TGACAAATTGGCAAGATGATACATAGATGTAATATTATTTATCTAACAAGATTCATTCTT 4277
Query 4276 ACGTTC 4281
| ||||
Sbjct 4278 ATGTTC 4283
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 213410175522
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5