BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg477271
Length=2694
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G79920.1 | Symbols: | Heat shock protein 70 (Hsp 70) family... 3096 0.0
AT1G79930.1 | Symbols: HSP91 | heat shock protein 91 | chr1:300... 3009 0.0
> AT1G79920.1 | Symbols: | Heat shock protein 70 (Hsp 70) family
protein | chr1:30058632-30062744 REVERSE LENGTH=2964
Length=2964
Score = 3096 bits (1676), Expect = 0.0
Identities = 1851/1937 (96%), Gaps = 6/1937 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 TGAAGAACACAAAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC 75
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 TGAAGAACACAAAGCCTAACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC 204
Query 76 CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGT 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 205 CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCAAATCGC 264
Query 136 GAGACTCCCGCTATTGTATGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT 195
|||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 GAGACTCCGGCTATCGTTTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT 324
Query 196 GCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC 255
||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 325 GCTTCTACCATGATGAACCCCAAAAACTCCATCTCACAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC 384
Query 256 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAA 315
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 385 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACTGAA 444
Query 316 GGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAGTTATTTGGGAGAGACTAGAGCCTTTACT 375
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 445 GGCCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGATTAGAGCCTTTAC- 503
Query 376 CCC-ACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTT 434
||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 504 CCCGACTCAGGTCATGGGTATGATGTTGTCCAACTTGAAAGGTATTGCTGAGAAGAATTT 563
Query 435 GAATGCTGCAGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACAGACCTCCAGCG 494
|||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 564 GAATACAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCG 623
Query 495 AAGGGCTGTTCTCGACGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCACGA 554
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 624 TAGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCATGA 683
Query 555 GACTACAGCAACGGCTTTGGCTTATGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCA 614
||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 GACTACAGCTACGGCTTTGGCATACGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCA 743
Query 615 GCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 GCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTT 803
Query 675 CAAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGGTTTCGATCCCTCCCTTGGAGGAAGGGA 734
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 804 CAAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGA 863
Query 735 CTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGA 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 864 TTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGA 923
Query 795 CGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAA 854
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||
Sbjct 924 CGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGCGCTACATGCGAGAAACTGAAAAA 983
Query 855 GGTTCTAAGCGCAAATCCTGTCGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAAGA 914
|||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 984 GGTTCTAAGCGCTAATCCTATGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGCTGAGAAAGA 1043
Query 915 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCTATTCTGGAGCG 974
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 1044 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCG 1103
Query 975 TGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACA 1034
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1104 TGTTAAGAGGCCTTTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACTGTTGAAGATGTACA 1163
Query 1035 TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACTGA 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACTGA 1223
Query 1095 GTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATG 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 GTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATG 1283
Query 1155 TGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGA 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 TGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGA 1343
Query 1215 GAGCTTCCCTTTCTCAATTTCGCTGGCGTGGACAGGAGCAGCTTCCGATGCTCAAAATGG 1274
|||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1344 GAGCTTCCCTTTCTCAATATCGCTTGCTTGGAAAGGAGCAGCGACTGATGCTCAAAATGG 1403
Query 1275 AGG-AGCTGAGAATCAGCAGAGCACTGTTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTG 1333
||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1404 AGGCA-CTGAGAACCAGCAGAGCACTATTGTTTTTCCGAAAGGAAATCCTATTCCTAGTG 1462
Query 1334 TCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGATG 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 TCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGATG 1522
Query 1394 TGAATGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCAT 1453
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523 TGAACGATTTGCAAGCACCTCCTAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCAT 1582
Query 1454 CAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCT 1513
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583 CAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTGAAAGTGAAAGTTAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCT 1642
Query 1514 CAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGT-TCCGGTCACAAAAGAT 1572
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1643 CTGTTGAATCAGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTATC-GGTCACAAAAGAT 1701
Query 1573 CAATCAGAGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT 1632
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 CAATCAGAGGAAACTGCTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT 1761
Query 1633 TTTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCT 1692
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1762 TCTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAAGATACCAGTGATGCAACTGGTACT 1821
Query 1693 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCT 1752
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1822 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCA 1881
Query 1753 GAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT 1812
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1882 GAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT 1941
Query 1813 GCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 1872
||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1942 GCCTTGAAAACTGTGGAAGTTGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTCTGCAA 2001
Query 1873 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 1932
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2002 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 2061
Query 1933 ATGCGAAACAAACTGAG 1949
|||||||||||||||||
Sbjct 2062 ATGCGAAACAAACTGAG 2078
Score = 1005 bits (544), Expect = 0.0
Identities = 638/680 (94%), Gaps = 19/680 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2030 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2219
Query 2090 GGTGGGAGACCCTGTGGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2149
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2279
Query 2150 TCAGCTTGGTTACTGTATTAAGAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTT 2209
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TCAGCTTGGCTACTGTATTAACAGCTACAGAGAGGCAGCTGTGTCTAATGATCCCAAGTT 2339
Query 2210 TGACCACATTGAATTGGCAGATAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2269
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TGATCACATTGAATTGGCAGAGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2399
Query 2270 ATGGCTACGGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACTCCGGCTCT 2329
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2400 ATGGCTGCGGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCT 2459
Query 2330 CTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAAT 2389
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 CTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAAT 2519
Query 2390 GACCAAACCAAAACCGGC---TAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCCGGC 2446
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2520 GACCAAACCAAAGCCGGCGGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGC 2579
Query 2447 GGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAA 2506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2580 GGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAAGCAATGGAGACTGAGAA 2639
Query 2507 TCCCGCTGAAGGGAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGT---ATCGATT 2563
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2640 TCCCGCGGAAGGTAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGTTGTATCGATT 2699
Query 2564 TTGTTTTAATTTACGTAGTGGAACCTCTTATTCTAGTTTCGCTATTATCCCCCGAAA-GA 2622
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2700 TTGTTTTAATTTACCTAGTGGAACCACTTTTTGTAGTTTCGCTATTATCCCCC-AAACGA 2758
Query 2623 TTCTATCTTTAGTTCTTCCTTTCGACAACAGTTTTTAGGAGGTATATT----ATTGT-T- 2676
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2759 TTCTATATTTAGTTCTTCCTTTCGACAT---TTTTTAGGAGGTATATTTTTTATTGTCTG 2815
Query 2677 --CCTTGTGGTTTCATATTA 2694
|||||||||||||| |||
Sbjct 2816 TTCCTTGTGGTTTCATTTTA 2835
> AT1G79930.1 | Symbols: HSP91 | heat shock protein 91 | chr1:30063478-30067547
REVERSE LENGTH=2997
Length=2997
Score = 3009 bits (1629), Expect = 0.0
Identities = 1835/1937 (95%), Gaps = 4/1937 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 14 ATTGAAGAACACAAAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATT 73
|||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 ATTGAATAACAC--AGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATT 235
Query 74 GCCTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC 133
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 GCCTTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC 295
Query 134 GTGAGACTCCCGCTATTGTATGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAG 193
|||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 296 GTGAGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAG 355
Query 194 CTGCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAGCGCTTAATTGGTC 253
||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 356 CTGCTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTC 415
Query 254 GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCC 313
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 416 GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCG 475
Query 314 AAGGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAGTTATTTGGGAGAGACTAGAGCCTTTA 373
|||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 476 AAGGCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTA 535
Query 374 CTCCC-ACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT 432
| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 C-CCCGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT 594
Query 433 TTGAATGCTGCAGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACAGACCTCCAG 492
|||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 595 TTGAATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAG 654
Query 493 CGAAGGGCTGTTCTCGACGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCAC 552
|| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 655 CGTAGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCAC 714
Query 553 GAGACTACAGCAACGGCTTTGGCTTATGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGAC 612
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 715 GAGACTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGAC 774
Query 613 CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC 834
Query 673 TTCAAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGGTTTCGATCCCTCCCTTGGAGGAAGG 732
|| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 835 TTTAAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGG 894
Query 733 GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATT 792
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 895 GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATT 954
Query 793 GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAA 852
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||
Sbjct 955 GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAA 1014
Query 853 AAGGTTCTAAGCGCAAATCCTGTCGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA 912
|||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 AAGGTTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA 1074
Query 913 GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCTATTCTGGAG 972
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1075 GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAG 1134
Query 973 CGTGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTA 1032
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1135 CGTGTAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTA 1194
Query 1033 CATATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT 1092
|||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 CATATGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT 1254
Query 1093 GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGA 1152
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1255 GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGA 1314
Query 1153 TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT 1374
Query 1213 GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCGCTGGCGTGGACAGGAGCAGCTTCCGATGCTCAAAAT 1272
||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1375 GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAAT 1434
Query 1273 GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACTGTTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1332
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1494
Query 1333 GTCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGAT 1392
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GTCAAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGAT 1554
Query 1393 GTGAATGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCA 1452
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1555 GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCGTTCCAGTCA 1614
Query 1453 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC 1512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1615 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTC 1674
Query 1513 TCAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAT 1572
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 TCAGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAA 1734
Query 1573 CAATCAGAGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT 1632
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1735 CATTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCT 1794
Query 1633 TTTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCT 1692
| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1795 TCTGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACT 1854
Query 1693 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCT 1752
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1855 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCT 1914
Query 1753 GAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT 1812
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1915 GAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGT 1974
Query 1813 GCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 1872
||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 GCCTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 2034
Query 1873 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 1932
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 2094
Query 1933 ATGCGAAACAAACTGAG 1949
||||| |||||||||||
Sbjct 2095 ATGCGGAACAAACTGAG 2111
Score = 924 bits (500), Expect = 0.0
Identities = 604/651 (93%), Gaps = 19/651 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2030 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2252
Query 2090 GGTGGGAGACCCTGTGGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2149
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 GGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGCGTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2312
Query 2150 TCAGCTTGGTTACTGTATTAAGAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTT 2209
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2313 TCAGCTTGGTTACTGTATTAACAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTT 2372
Query 2210 TGACCACATTGAATTGGCAGATAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2269
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2373 TGATCACATTGAATTGGCAGAGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2432
Query 2270 ATGGCTAC-GGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACTCCGGCTC 2328
|||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2433 ATGGCTGCGGGGA-AAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTC 2491
Query 2329 TCTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA 2388
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492 TCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA 2551
Query 2389 TGACCAAACCAAAACC---GGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCCGG 2445
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2552 TGACCAAACCAAAGCCGGTGGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGG 2611
Query 2446 CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2612 CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA 2671
Query 2506 ATCCCGCTGAAGGGAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGTATCGATTTT 2565
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2672 ATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAAATGAATGACGAGAGAGAGATGGTGTTGTATCGATTTT 2731
Query 2566 GTT-TTAA-T-TT----A----CGTAGTGGAACCTCTTATTCTAGTTTCGCTATTATCCC 2614
||| |||| | || | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2732 GTTCTTAACTCTTTTTGATTTACCTAGTGGAACCTCTTTTTCTGGTTTCGCTATTATTCC 2791
Query 2615 CCGAAAGATTCTATCTT-T-AGTTCTTCCTTT-CGACAACAGTTTTTAGGA 2662
| |||| | ||||| || | | |||||||||| ||| |||| |||||||||
Sbjct 2792 CGGAAAAAATCTATATTGTTAATTCTTCCTTTTCGAAAACAATTTTTAGGA 2842
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 133795236981
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5