BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg477337
Length=3756
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G01780.1 | Symbols: TPLATE | ARM repeat superfamily protein ... 6231 0.0
> AT3G01780.1 | Symbols: TPLATE | ARM repeat superfamily protein
| chr3:279060-283580 FORWARD LENGTH=3823
Length=3823
Score = 6231 bits (3374), Expect = 0.0
Identities = 3639/3767 (97%), Gaps = 17/3767 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCAGTTCCATGTCGCATCCGTACACAGATTGACAGCAAAGCTAGGTAGCTCAGA-TTC 59
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||
Sbjct 20 TTCCAGTTCCATGTCGCATACGTACACAGATTGACAGCGAAGCTAGTTAGCTCAGATTTT 79
Query 60 CGAGCCTTGGATCTC-G--AATT---T-CAGTTATGGACATTCTTTTCGCTCAGATCCAG 112
|| || | || || | |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 80 GGA-TCTCGAATTTCAGTTAATTCGATCCGGTTATGGACATTCTTTTTGCTCAGATCCAG 138
Query 113 GCGGACCTCCGTTCTAATGACGCGCTTCGCCAGTCATCCGCGCTTCTTCAGGCGCTGCAG 172
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 139 GCGGACCTCCGTTCAAATGACGCGCTTCGCCAGTCATCGGCGCTTCTTCAGGCGCTGCAG 198
Query 173 CAATCCGCCGCCGGAAGAGATATCTCTGTGATCGCCAAGTCTGCTGTGGAGGAGATTGTT 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 CAATCCGCCGCCGGAAGAGATATCTCTGTGATCGCTAAGTCTGCTGTGGAGGAGATTGTT 258
Query 233 GCTTCTCCGGCGTCAGCTGTTTGTAAGAAGCTCGCATTCGATCTCATCCGATCTACCCGC 292
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 GCTTCTCCGGCTTCAGCTGTTTGTAAGAAGCTGGCATTCGATCTCATCCGATCTACCCGC 318
Query 293 CTGACTCCGGATCTTTGGGACACCGTTTGCTCAGGTGTCAAAACGGATCTTCATTTCCCG 352
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 319 CTCACTCCGGATCTTTGGGACACCGTTTGCTCAGGTGTCAAAACGGATCTTCATTTTCCG 378
Query 353 GACCCGGATGTCACCGCCGCTGCCGTCTCCATCCTTGCTGCTCTCCCTTCCTTCTCGCTT 412
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 379 GACCCGGATGTTACCGCCGCTGCCGTCTCCATCCTTGCGGCTCTCCCTGCCTTCTCGCTT 438
Query 413 CCTAAACTCATCTCTGATTGCAGCTCTGAGATTGCTTCCTGCTTCGATTCTCCATCTGAC 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 CCTAAACTCATCTCTGATTGCAGCTCTGAGATTGCTTCCTGCTTCGATTCTCCATCTGAC 498
Query 473 AACCTTCGTTTTTCCATTACCGAGACACTTGGCTGCATCCTCGCGCGTGATGATCTCGTT 532
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 AACCTTCGTTTTTCCATCACCGAGACACTTGGCTGCATCCTCGCGCGTGATGATCTCGTT 558
Query 533 ACATTGTGCGAGAACAATGTGGGTCTCCTCGACAAGGTCTCCAACTGGTGGGCTCGGATC 592
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 ACTTTGTGCGAGAACAATGTGGGTCTCCTCGACAAGGTCTCCAACTGGTGGGCTCGGATC 618
Query 593 GGCCAGAACATGCTCGACAAATCCGACGCTGTCTCCAAGGTTGCCTTCGAATCAGTCGGC 652
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||
Sbjct 619 GGCCAGAACATGCTCGACAAATCCGACGCCGTCTCCAAGGTTGCCTTTGAGTCCGTCGGC 678
Query 653 AGACTCTTCCAGGAGTTCGACTCCAAGCGGATGAGCCGTCTTGCTGGCGACAAGCTCGTT 712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 679 AGACTCTTCCAGGAGTTCGACTCCAAGCGGATGAGCCGTCTTGCTGGCGATAAGCTCGTT 738
Query 713 GACAGCGAGAATTCCCTCGCCATCAGGTCCAAGTGGGTCTCTTCCATGGTTGACATTGTA 772
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GACAGCGAGAACTCCCTCGCCATCAGGTCCAAGTGGGTCTCTTCCATGGTTGACATTGTA 798
Query 773 TGGAAAAAGAGGAGCGCTTTGATGGCTAGGTCTTTTGTTCTTCCTGTTGAAACCTTCAGA 832
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 799 TGGAGAAAGAGGAGCGCTTTGATGGCTAGGTCTTTAGTCCTTCCTGTCGAAACCTTCAGA 858
Query 833 GCCACTGTTTTCCCTCTTGTCTTTGCTGTCAAAGCTGTTGCTTCCGGTAGTGTCGAAGTG 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 859 GCCACTGTTTTCCCTCTTGTCTTTGCTGTCAAAGCTGTTGCTTCCGGTAGTGTCGAAGTG 918
Query 893 ATAAGACAGCTTTCCAAGGCTTCCTCCGCTGCTGCTGCAGCTAATGCCACCGTTGTGGAC 952
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 919 ATTAGACAGCTTTCCAAGGCTTCCTCTGCTGCTGCTGCAGCTAATGCCACCGTTGTGGAC 978
Query 953 TCCAACGCTGAGAAGCTGGTTGGCGTCTCAGATTTGGTTACCCATTTGGCGCCATTCTTG 1012
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 TCCAACGCCGAGAAGCTGGTTGGCGTCTCAGATTTGGTTACCCATTTGGCGCCATTCTTG 1038
Query 1013 GCTTCCTCTTTGGATCCAGCTTTGATTTTTGAAGTGGGAATTAACATGCTCTACCTGGCT 1072
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 GCTTCCTCTTTGGATCCAGCTTTGATTTTTGAAGTGGGAATTAACATGCTCTACCTGGCA 1098
Query 1073 GATGTTGCCGGAGGGAAGCCAGAGTGGGCTTCACAGTCCATTATTGCAATTTTAACACTT 1132
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 GATGTTGCCGGAGGCAAGCCAGAGTGGGCTTCACAGTCCATTATTGCAATTTTAACACTC 1158
Query 1133 TGGGACCGCCAAGAATTTTCCTCTGCTAGAGAGAGTATAGTCAGGGCCGTTGTCACGAAC 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1159 TGGGACCGCCAAGAATTTTCCTCTGCTAGAGAGAGTATAGTCAGGGCCGTTGTTACGAAC 1218
Query 1193 CTGCACTTGCTTGATCTGCATATGCAGGTTTCTTTGTTTAGAAGACTCCTGCTTATGGTG 1252
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1219 CTGCACTTGCTTGATCTGCATATGCAGGTTTCGTTGTTTAGAAGACTGCTGCTTATGGTG 1278
Query 1253 AGGAACTTGAGAGCAGAATCGGACAGGATGCACGCATTAGCATGTATCTGCCGGACAGCT 1312
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1279 AGAAACTTGAGAGCAGAATCGGACAGGATGCACGCATTAGCCTGTATCTGTCGGACAGCT 1338
Query 1313 CTATGTGTTCACCTTTTTGCCAGAGAAAGTGCCCGAAGAGGTCAGAAGCCTCTGCCTGGG 1372
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 CTCTGTGTTCACCTTTTTGCCAGAGAAAGTGCCCGAAGAGGTCAGAAGCCTCTGCCTGGG 1398
Query 1373 ACAGATATTATTTCTCTCTTTGAAGATGCAAGGATTAAAGATGATCTCAATAGTGTTACC 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 ACAGATATTATTTCTCTCTTTGAAGATGCAAGGATTAAAGATGATCTCAATAGTGTTACC 1458
Query 1433 AGTAAAAGCTTATTTCGGGAAGAGCTGGTGGCAATGCTTGTGGAAAGCTGCTTCCAGTTG 1492
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459 AGTAAGAGCTTATTTCGGGAAGAGCTGGTGGCAATGCTTGTGGAAAGCTGCTTCCAGTTG 1518
Query 1493 TCTCTACCTTTGCCTGAACaaaaaaaCTCTGGTATGGAGAGCAGAGTGATTGGTGCACTA 1552
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1519 TCTCTACCTTTGCCTGAACAAAAAAACTCGGGTATGGAGAGCAGAGTGATTGGTGCGTTA 1578
Query 1553 GCATATGGCACTGGTTATGGTGCTCTGAACTGGACAGAACCAGCCCTTGAGGTTGTGGAA 1612
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1579 GCATATGGTACTGGTTATGGTGCTCTGAACTGGACAGAACCAGCCCTTGAGGTTGTGGAA 1638
Query 1613 GTTTGTAGGCCTTGTGTCAAATGGGATTGTGATGGCAGGACGTACGCTATAGATTGCTAT 1672
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1639 GTTTGTAGGCCTTGTGTCAAATGGGATTGTGATGGCAGGACGTACGCTGTAGATTGCTAT 1698
Query 1673 TTGAAATTGCTTGTTAGGCTATGCCATATCTATGATACCCGTGGAGGTGTGAAGAGGCTT 1732
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1699 TTGAAATTGCTTGTTAGGCTGTGCCATATCTATGATACCCGTGGAGGAGTGAAGAGGCTG 1758
Query 1733 AAAGACGGTGCTTCCCAGGATCAAATATTAAATGAGACCCGATTGCAGAACTTGCAACGT 1792
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1759 AAAGATGGTGCTTCCCAGGATCAAATATTAAATGAGACACGATTGCAGAACTTGCAACGT 1818
Query 1793 GAACTCGTTAAGGATCTCCAAGAGGTAAATACCCCAAGAATCCTTGGGCGTCTTATATGG 1852
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1819 GAGCTTGTTAAGGATCTCCAAGAGGTAAATACCCCAAGAATCCTCGGGCGTCTTATATGG 1878
Query 1853 ACAATCGCAGAACATATTGATCTAGAAGGTCTAGATCCACTTTTAGCTGATGACCCCGAT 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1879 ACAATCGCAGAACATATTGATCTAGAAGGTCTAGATCCACTTTTAGCTGATGACCCCGAT 1938
Query 1913 GATCCGTTGAATATTATCATAGCAAACATACATAAGGTTCTCTTCAACTTGGATGCCGCT 1972
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1939 GATCCATTGAATATTATCATAGCAAACATACATAAGGTTCTCTTCAACTTGGATGCCGCT 1998
Query 1973 GCTACTACATCGAACAGGCTACAAGATGTTCAGGCAGTCTTATTATGTGCCCAGAGGATG 2032
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1999 GCTACTACATCGAATAGGCTACAAGATGTTCAGGCAGTCTTATTATGCGCCCAGAGGATG 2058
Query 2033 GGATCACGTCATGCAAGAGCTGGCCAATTATTAACCAAAGAGCTTGAGGAGTATAGGAAC 2092
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2059 GGATCGCGTCATGCAAGAGCTGGCCAGTTATTAACCAAAGAGCTTGAAGAGTATAGGAAC 2118
Query 2093 CATGCTGCTGCAGATACAGTTAGCAAACATCAAACCCGTTTAATATTGCAGAGGATCAAA 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2119 CATGCTGCTGCAGATACAGTTAGCAAACATCAAACCCGTTTAATATTGCAGAGGATCAAA 2178
Query 2153 TATGTTTCAAATCTTCCTGAAAGAAAGTGGGCTGGAGTCAGTGAGACAAGAGGAGATTAC 2212
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2179 TATGTTTCAAATCTTCCTGAAAGAAAGTGGGCTGGAGTTAGTGAGACAAGAGGAGATTAC 2238
Query 2213 CCGTTTAGCCACCATAAGCTTACTGTTCAGTTTTACGAACCATCAGCTGCTCAAGACAGA 2272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2239 CCGTTTAGCCACCATAAGCTTACTGTTCAGTTTTACGAACCATCAGCTGCTCAAGACAGG 2298
Query 2273 AAATTAGAAGGTCTAATTCACAAGGCCATTCTAGAGCTTTGGAGGCCGAAGCCCACTGAA 2332
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2299 AAATTAGAAGGTCTAATTCACAAGGCCATTCTCGAGCTTTGGAGGCCAAAGCCCACTGAA 2358
Query 2333 TTGACTCTCTTCCTTACAAAAGGGGTCGACTCGACTTCGATCAAGGTTCCTCCCACAGCA 2392
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 TTAACTCTCTTCCTTACAAAAGGGGTCGACTCAACTTCTATCAAGGTTCCTCCCACAGCA 2418
Query 2393 TATCCTTTGACCGGAAGCAGTGATCCTTGCTATATAGAAGCTTACCATTTAGCAGATACA 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2419 TATCCTTTGACCGGAAGCAGTGATCCTTGCTATATAGAAGCTTACCATTTAGCAGATACA 2478
Query 2453 AATGATGGAAGGGTCACTCTGCACTTGAAGATTATTAATTTGACAGAACTTGAACTGAAT 2512
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2479 AATGATGGAAGGGTCACTTTGCACTTGAAGATTATTAATTTGACAGAACTTGAACTGAAT 2538
Query 2513 CGTGTGGATATACGGGTTGGATTATCTGGTGCCCTATACTTCATGGATGGCTCTCCTCAA 2572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2539 CGTGTGGATATACGGGTTGGATTATCTGGTGCCCTATACTTCATGGATGGCTCTCCTCAA 2598
Query 2573 GCAGTGCGGCAGTTGCGCAATCTTGTCTCACAGGATCCTGTACAATGCAGTGTCACCGTT 2632
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2599 GCAGTGCGGCAGTTGCGTAATCTTGTCTCACAGGATCCTGTACAATGCAGTGTCACCGTT 2658
Query 2633 GGTGTGTCCCAATTTGAAAGATGTGGTTTCTGGGTTCAAGTCCTCTACTATCCATTCCGT 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2659 GGTGTGTCCCAATTTGAAAGATGTGGTTTCTGGGTTCAAGTCCTCTACTATCCATTCCGT 2718
Query 2693 GGTGCTAGGGGAGAATATGACGGTGACTACATAGAAGAGGATCCACAGATCATGAAGCAG 2752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2719 GGTGCTAGGGGAGAATATGACGGTGACTACATAGAAGAGGATCCACAGATCATGAAGCAG 2778
Query 2753 AAGAGAGGTTCAAAAGCAGAACTCGGAGAGCCTGTGATCTTAAGATGTCAGCCTTACAAG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2779 AAGAGAGGTTCAAAAGCAGAACTCGGAGAGCCTGTGATCTTAAGATGTCAGCCTTACAAG 2838
Query 2813 ATCCCACTGACTGAGCTTCTTCTCCCGCACAAAATTTCACCAGTCGAGTTCTTTCGTTTG 2872
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2839 ATCCCACTGACTGAGCTTCTTCTACCGCACAAAATCTCACCAGTCGAGTTCTTTCGTTTG 2898
Query 2873 TGGCCTAGCTTGCCAGCTGTTGCAGAGTACACTGGCACATATATGTATGAAGGAAGTGGC 2932
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2899 TGGCCTAGCTTGCCAGCTGTTGCAGAGTACACTGGCACATATATGTATGAAGGAAGCGGC 2958
Query 2933 TTCATGGCGACTGCCGCACAACAGTATGGTGCTTCACCATTTCTAAGCGGACTCAAATCA 2992
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2959 TTCATGGCGACCGCCGCACAACAGTATGGGGCTTCACCATTTTTAAGCGGACTCAAATCA 3018
Query 2993 ATATCCTCCAAGCCATTCCACAGAGTCTGTTCCCACATTATACGCACAGTTGCTGGCTTT 3052
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3019 TTATCCTCGAAGCCATTCCACAGAGTCTGTTCCCACATTATACGCACAGTTGCTGGCTTT 3078
Query 3053 CAGCTGTGTTACGCTGCAAAAACATGGCATGGAGGTTTTGTGGGCATGATGATCTTTGGA 3112
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3079 CAGCTTTGTTACGCTGCAAAAACGTGGCATGGAGGTTTTGTGGGTATGATGATCTTTGGC 3138
Query 3113 GCTAGTGAAGTGAGCAGGAACATGGATCTGGGTGACGAGACAACCACCATGATGTGCAAG 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3139 GCTAGTGAAGTGAGCAGGAACATGGATCTGGGTGACGAGACTACCACCATGATGTGCAAG 3198
Query 3173 TTCGTGGTTAGAGCATCAGAAGCATCAATCACAAAGCAAATAGAGTCGGATCTACAGGGA 3232
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 3199 TTTGTGGTTAGAGCATCAGAAGCATCAATCACAAAGCAAATAGAGTCGGATATTCAGGGA 3258
Query 3233 TGGTGCGATGATCTAACTGATGGGGGAGTTGAGTACATGCCAGAGGACGAAGTGAAGGCA 3292
||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3259 TGGTGTGATGATCTAACTGACGGGGGCGTTGAGTACATGCCAGAGGACGAAGTGAAGGCA 3318
Query 3293 ACCGCAGCCGAGAAGCTGAAGATCTCGATGGAGAGGATAGCTTTGTTGAAGGCAGCTCAG 3352
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3319 ACCGCGGCCGAGAAGCTGAAGATCTCTATGGAGAGGATAGCTTTGTTGAAGGCAGCTCAG 3378
Query 3353 CCGAAGAAGACTCCAAAGATAGAGGAGGAATCAGAAAACGAGgaagaagatgaag-a-a- 3409
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |
Sbjct 3379 CCGAAGAAGACTTCAAAGATAGAGGAGGAATCAGAAAACGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAA 3438
Query 3410 gatgatgatgatgatgaagatgtaaaagagaaaaaggagaaagaagagggaaaggacaag 3469
|| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3439 GAAGAAGATGATGATGAAGAAGTAAAAGAGAAAAAGGAGAAAGAAGAGGGAAAGGACAAG 3498
Query 3470 gaagagaagaagaagaaaaaagagaaggaaaaaggaaCACTGTCTAAGCTGACAGCAGAA 3529
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 3499 GAAGAGAAGAAGAA-AAAA--GAGAAGGAAAAAGGAACATTTTCTAAGCTGACAGCAGAA 3555
Query 3530 GAAACAGAGCACATGGCGCTTCAGGCAGCAGTGCTCCAAGAATGGCACATCTTGTGTAAA 3589
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3556 GAAACAGAGCACATGGCGCTTCAGGCAGCAGTGCTCCAAGAATGGCACATCTTGTGCAAA 3615
Query 3590 GATAGAAAATATACCAAAGTTAACTAAGAGCGAGAGTACTTTTTCTCCCAGATGAAGGTA 3649
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||
Sbjct 3616 GATAGAAAATATACCAAAGTTAACTAAGAGCGAGAGTACTTTTT-TCTCAGATGAAGCTA 3674
Query 3650 CGACAATCTTTTGTATTCTTTTGTTGTGTGTGGTTTCTTCGTAGGTTTAGATGTTTTGTA 3709
| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3675 CAACAATCTTT-GTTTTCTTTTGTTGTGTGTGGTTTCTTCGTAGGTTTAGATGTTTTGTA 3733
Query 3710 TTGTTGTTGGTGAAGAAAAGAAACGAAGCAAGGATGTTACTATTGCC 3756
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 3734 TTGTTGTTGGTGAAGAAAAGAAACAAACCAAGGATGTTACTATTGCC 3780
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187072530447
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5