BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg477585
Length=3552
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G03380.1 | Symbols: DegP7 | DegP protease 7 | chr3:799615-80... 5973 0.0
AT3G03370.2 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unkn... 219 2e-55
> AT3G03380.1 | Symbols: DegP7 | DegP protease 7 | chr3:799615-808522
FORWARD LENGTH=3602
Length=3602
Score = 5973 bits (3234), Expect = 0.0
Identities = 3431/3528 (97%), Gaps = 5/3528 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 26 AAAACCCTAAACCCCATTTCCCGCGGATTTTCTCCCAAGCTGATACGGAGACCAAATGGG 85
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 51 AAAACCCTAAACCCCATTTCCCGCGGATTTTCTCCCAAGCTGATACGGAGATCAAATGGG 110
Query 86 AGATCCGTTGGAGAGGTTGGGTTCACAGGCCTCAATGGCTACTGAGTCTGGCATGAAGGA 145
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 111 AGATCCGTTGGAGAGGTTGGGTTCTCAGGCATCAATGGCTACTGAGTCTGTCATGAAGGA 170
Query 146 GGACTTGTGTTTAGAGATCGATCCTCCGTTAACTGAATCCGTTGCCACCGCTGAAGATTG 205
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 GGACTTGTGTTTAGAGATCGATCCTCCCTTAACTGAATCCGTTGCCACCGCTGAAGATTG 230
Query 206 GCGTCGTGCTCTCGGTAAGGTTGTTCCCGCCGTCGTTGTACTCCGCACAACTGCTTGTCG 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 231 GCGTCGTGCTCTCGGTAAGGTTGTTCCCGCCGTCGTTGTACTCCGCACAACGGCTTGTCG 290
Query 266 CGCCTTCGACACTGAGTCCGCCGGTGCTAGCTATGCTACTGGGTTTATCGTTGATAAGCG 325
|||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 291 CGCCTTTGATACCGAGTCCGCCGGTGCTAGCTATGCTACTGGTTTTATCGTTGATAAGCG 350
Query 326 ACGTGGGATCATCCTCACCAATCGCCATGTGGTTAAGCCAGGCCCAGTTGTTGCTGAGGC 385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 351 ACGTGGGATCATCCTCACCAATCGCCATGTGGTTAAGCCAGGCCCAGTAGTTGCTGAGGC 410
Query 386 AATGTTTGTCAACCGCGAGGAAATCCCAATCTATCCTGTATACAGGGATCCGGTCCATGA 445
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 AATGTTTGTGAACCGAGAGGAAATCCCAATCTATCCTGTATACAGGGATCCGGTCCATGA 470
Query 446 CTTTGGCTTCTTTTCTTATGATCCCAGTGCGGTACAGTTTTTGACTTATGAAGAAATTCC 505
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 471 CTTTGGCTTCTTTTGTTATGATCCCAGTGCTGTACAGTTTTTGACTTACCAAGAAATTCC 530
Query 506 TCTTGCCCCAGAGGCGGCTTCTGTTGGACTCGAAATTAGGGTTGTTGGAAATGATAGCGG 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 TCTTGCCCCAGAGGCGGCTTCTGTTGGACTCGAAATTAGGGTTGTTGGAAATGATAGCGG 590
Query 566 AGAAAAGGTTTCCATACTTGCTGGTACTCTTGCGCGGTTGGATAGGGATGCTCCACATTA 625
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 591 AGAAAAGGTTTCCATACTGGCTGGTACTCTTGCGCGGTTGGATCGGGATGCTCCACATTA 650
Query 626 CAAAAAGGATGGTTATAACGACTTCAATACGTTTTATATGCAAGCAGCATCAGGTACTAA 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 CAAAAAGGATGGTTATAACGACTTCAATACGTTTTATATGCAAGCAGCATCAGGTACTAA 710
Query 686 AGGTGGTTCAAGTGGTTCTCCCGTCATTGATTGGCAAGGCAGGGCGGTAGCTTTGAATGC 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 711 AGGTGGTTCAAGTGGTTCTCCCGTCATTGATTGGCAAGGCAGGGCAGTAGCTTTGAATGC 770
Query 746 TGGCAGCAAGTCGTCAAGTGCATCAGCCTTCTTCCTACCACTTCAACGAGTTGTTAGGGC 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 TGGCAGCAAGTCGTCAAGTGCATCAGCCTTCTTCCTACCACTTCAACGAGTTGTTAGGGC 830
Query 806 GTTAAGTTTTCTCCAAAAAAGCATTGACTCGCGCACGGATAAGCCAAAAGCAGTTCATAT 865
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GTTAAGTTTTCTCCAAAAAAGCATTGACTCGCGGACGGATAAGCCAAAAGCAGTTCATAT 890
Query 866 TCCTCGTGGTACGCTTCAGATGACATTTCTTCATAAAGGATTCGATGAGATACGGCGACT 925
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TCCTCGTGGTACACTTCAGATGACATTTCTTCATAAAGGATTCGATGAGATACGGCGACT 950
Query 926 TGGTCTCAGGAGCGAAACTGAACAGGTGGTTCGACATGCATCTCCAACTGGGGAAACGGG 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 951 TGGTCTCAGGAGCGAAACTGAACAGGTGGTTCGACATGCATCTCCAACTGGGGAAACAGG 1010
Query 986 AATGCTTGTTGTCGACTCTGTGGTGCCAAGTGGCCCTGCTGATAAACATTTGGAGCCGGG 1045
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 AATGCTTGTTGTCGATTCTGTGGTGCCAAGTGGCCCTGCTGATAAACATTTGGAGCCGGG 1070
Query 1046 AGATGTTCTTGTTCGGGTGAATGGGACAGTGCTCACACAATTTTTGAACTTGGAGAATCT 1105
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 AGATGTTCTTGTTCGGGTGAATGGAACAGTGCTCACACAATTTTTGAACTTGGAGAATCT 1130
Query 1106 GCTTGATGACGGTGTTGGCCAGATACTTGAACTGGAGATTGAAAGGGGTGGACAACCACT 1165
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 GCTTGATGACGGTGTTGGCCAGATACTTGAATTGGAGATTGAAAGGGGTGGACAACCACT 1190
Query 1166 ATCTGTTAGTGTATCAGTACAAGATTTACACTCAATCACTCCAGACCACTTCCTGGAAGT 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1191 ATCTGTTAGTGTATCAGTACAAGATTTACACTCAATCACTCCAGATCACTTCCTGGAAGT 1250
Query 1226 AAGCGGTGCTGTAATTCATCCGTTGTCTTATCAGCAGGCTCGCAATTTTCGTTTTCCTTG 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 AAGCGGTGCTGTAATTCATCCGTTGTCTTATCAGCAGGCTCGCAATTTTCGTTTTCCTTG 1310
Query 1286 TGGCCTGGCATATGTTGCGGACCCTGGATACATGCTATTTAGAGCTGGGGTCCCTCGACA 1345
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 TGGCCTGGCTTATGTTGCGGACCCTGGATACATGCTATTTAGAGCTGGGGTCCCTCGACA 1370
Query 1346 TGCTATCATAAAGAAGGTTGCTAATGAGGACATTTCCGGTCTTGGAGATTTAGTATCTGT 1405
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 1371 TGCTATCATAAAGAAGGTTGCTAATGAGGATATTTCCAGTCTTGGAGACTTAGTATCTGT 1430
Query 1406 TCTTTCAAAGCTTTCTAGGGGTGCTCGTGTTCCCTTGGAATATATGTCTCACACTGATCG 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 TCTTTCAAAGCTTTCTAGGGGTGCTCGTGTTCCATTGGAATATATGTCTCACACTGATCG 1490
Query 1466 TCATCGCAAGAAGTCTGTGTTAGTCACGATTGATCGTCATGAATGGTACGCTCCTCCTCA 1525
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 TCATCGCAAGAAGTCTGTGTTAGTCACGATTGATCATCATGAATGGTACGCTCCTCCTCA 1550
Query 1526 GTTGTATACCCGTAATGACAGCTCTGGTTTATGGGATGCGAAACCTGCAATTGAACCTGC 1585
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 GTTGTATACCCGTAATGACAGTTCCGGTTTATGGGATGCGAAACCTGCAATTGAACCTGC 1610
Query 1586 TTCTGTTTCACCGTCTATTGGTAATAATGGCTTGCCTATAAGCCAAGATATTTCTCTATG 1645
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 TTCTGTTTCACCATCTATTGGTAATAATGGCTTTCCTATAAGCCAAGATATTTCTCTATG 1670
Query 1646 CCATCACGATACAGAACCCATGCATGAAGTGAATGTTCGTGGGGTTACTGATATTGCAGC 1705
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 CCATCACGATACGGAACCCATGCATGAAGTGAATGTTCGTGGGGTTACTGATATTGCAGC 1730
Query 1706 TATTATGGAAGCCTCTAGTGGGGATGGTTCTCAGAATGATTTTGGCTCAGAAGCAAAGAA 1765
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 GATTATGGAAACTTCTAGTGGGGATGGTTCTCAGAATGATTTTGGCTCAGAAGCAAAGAA 1790
Query 1766 ACAAAGAGTTGACGATGATTCTTTAGATGGGATTGCTTCAAACGGTTCCTTATATGGCAG 1825
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 ACAAAGAGTTGACGAGGATTCTTCAGATGGGATTGCTGCAAACGGTTCCTTATATGGCAG 1850
Query 1826 TGAATTTAAATCTGATGATGCAATGGCAACAGATAATACAGTTTTAAGAGACTTCGAAGG 1885
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGAATTTAAATCTGATGATGCAATGGAAACAGATACTACAGTTTTAAGAGACTTCGAAGG 1910
Query 1886 TGCAACAGCACTGCT-TGCTAATGCTTCATTGGCTGAGCGTGCTATTGAGCCTGCTCTTG 1944
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1911 TGCAACAGCACTG-TCTGCTAATGCTTCATTGGCTGAGCGTGCTATTGAGCCTGCACTTG 1969
Query 1945 TCATGTTTGAGGTTCATGTACCACCATCATGCAGTCTTGATGGTGTACACTCCCAACATT 2004
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1970 TCATGTTTGAGGTTCATGTGCCACCATCGTGCAGTCTTGATGGTGTACACTCACAACATT 2029
Query 2005 TCTTTGGGACTGGCATCATTATATATCATTCTTCTAGCATGGGACTTGCTGTGGTGGACA 2064
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2030 TCTTTGGGACTGGCATCATTATATATCATTCTTCTAACATGGGGCTTGCTGTGGTGGACA 2089
Query 2065 AAAACACTGTTGCGATTTCTGCATCTGATGTTATGTTGTCCTTTGCTGCTTTTCCAGTCG 2124
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 AAAACACAGTTGCGATTTCTGCATCTGATGTTATGTTGTCCTTTGCTGCTTTTCCAGTCG 2149
Query 2125 AGATTCCTGGAGAGGTAGTATTTCTTCATCCTGTTCACAACTATGCTCTTATTGCGTATA 2184
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2150 AGATTCCTGGAGAGGTAGTATTTCTTCATCCCGTTCACAACTATGCTCTGATTGCGTATA 2209
Query 2185 ATCCGTCAGCAATGGATCCTGCCAGTGCTTCAGTCATTCGTGCAGCTGAGCTACTACCTG 2244
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 ATCCATCAGCAATGGATCCTGCCAGTGCTTCAGTCATTCGTGCAGCTGAGCTACTACCTG 2269
Query 2245 AACCTGCACTCCAACGTGGAGATTCAGTCTATCTTGTCGGATTGAGTAGGAACCTTCAAG 2304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 AACCTGCACTCCAACGTGGAGATTCAGTCTATCTTGTCGGATTGAGTAGGAACCTTCAAG 2329
Query 2305 CCACATCAAGAAAATCTATTGTAACCAATCCATGTGCAGCGTTAAACATTGGGTCTGCTG 2364
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2330 CTACATCAAGAAAATCTATTGTAACCAATCCATGTGCAGCGTTAAACATTGGTTCTGCTG 2389
Query 2365 ATTCTCCCCGCTACAGAGCTACTAATATGGAAGTAATTGAGCTTGATACAGATTTTGGTA 2424
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 ATTCTCCCCGTTACAGAGCTACTAATATGGAAGTAATTGAGCTTGATACAGATTTTGGTA 2449
Query 2425 GCTCATTTTCAGGGGCGCTGACTGATGAGCAGGGAAGAATCCGGGCTATTTGGGGAAGCT 2484
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2450 GCTCATTTTCAGGGGCGCTGACTGATGAGCAGGGAAGAATTCGGGCTATTTGGGGAAGTT 2509
Query 2485 TTTCGACTCAGGTTAAATATAGTTCCACTTCGTCTGAAGACCATCAGTTTGTCAGAGGTA 2544
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2510 TTTCGACTCAGGTTAAATATAGTTCCACTTCTTCAGAAGACCACCAGTTTGTCAGAGGTA 2569
Query 2545 TCCCGGTATATGCAATCAGCCAAGTCCTTGAAAAAATCATAACCGGTGGAAATGGACCAG 2604
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 TCCCAGTATATGCAATCAGCCAAGTCCTTGAAAAAATCATAACCGGTGGAAATGGACCAG 2629
Query 2605 CTCTTCTCATAAATGGTGTCAAAAGGCCAATGCCACTTGTTCGGATTTTGGAAGTTGAAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 CTCTTCTCATAAATGGTGTCAAAAGGCCAATGCCACTTGTTCGGATTTTGGAAGTTGAAT 2689
Query 2665 TGTATCCTACTTTGCTTTCAAAAGCACGGAGTTTTGGTCTGAGTGATGCATGGATCCAAG 2724
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2690 TGTATCCTACTTTGCTTTCAAAAGCCCGGAGTTTTGGTCTGAGTGATGAATGGATCCAAG 2749
Query 2725 TCCTAGTCAAGAAGGATCCTGTTAGACGTCAAGTTCTGCGAGTTAAAGGTTGCCTGGCAG 2784
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2750 TCCTAGTCAAGAAGGATCCTGTTAGACGTCAAGTTCTGCGTGTTAAAGGTTGCCTGGCAG 2809
Query 2785 GATCAAAAGCTGAAAACCTTCTTGAACAAGGCGATATGGTTCTGGCAGTCAATAAGATGC 2844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 GATCAAAAGCTGAAAACCTTCTTGAACAAGGCGATATGGTTCTGGCAGTCAATAAGATGC 2869
Query 2845 CAGTTACATGCTTCAATGACATAGAAGCCGCTTGCCAAACATTGGATAAGGGTAGCCACA 2904
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2870 CAGTTACATGCTTCAATGACATAGAAGCTGCTTGCCAAACATTGGATAAGGGTAGTTACA 2929
Query 2905 GCGATGAAAATCTCAATCTAACAATCCTTCGACAGGGCCAAGAACTGGAGCTCGTAGTTG 2964
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 GCGATGAAAATCTCAATCTAACAATCCTTAGACAGGGCCAAGAACTGGAGCTCGTAGTTG 2989
Query 2965 GAACTGATAAAAGAGATGGGAATGGAACGACAAGAGCGATAAACTGGTGCGGATGCGTTG 3024
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2990 GAACTGATAAGAGAGATGGGAATGGAACGACAAGAGTGATAAATTGGTGCGGATGCGTTG 3049
Query 3025 TTCAGGATCCTCATCCTGCGGTTCGTGCTCTTGGATTTCTTCCTGAGGAAGGTCATGGTG 3084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 TTCAGGATCCTCATCCTGCGGTTCGTGCTCTTGGATTTCTTCCTGAGGAAGGTCATGGTG 3109
Query 3085 TCTATGTCACAAGATGGTGTCACGGGAGTCCCGCTCACCGATATGGCCTCTACGCACTTC 3144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3110 TCTATGTCACAAGATGGTGTCACGGGAGTCCCGCTCACCGATATGGCCTCTACGCGCTTC 3169
Query 3145 AATGGATTGTGGAAGTTAATGGGAAGAAGACTCCTGACCTAAACGCATTCGCAGATGCTA 3204
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 AATGGATCGTGGAAGTTAATGGGAAGAAGACTCCTGACCTAAACGCATTCGCAGATGCTA 3229
Query 3205 CCAAGGAGCTAGAACACGGGCAGTTTGTGCGTATTAGGACTGTTCATCTTAACGGCAAGC 3264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3230 CCAAGGAGCTAGAACACGGGCAGTTTGTGCGTATTAGGACTGTTCATCTAAACGGCAAGC 3289
Query 3265 CACGAGTCTTGACTCTGAAGCAAGATCTCCATTACTGGCCGACTTGGGAGTTGAGGTTCG 3324
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3290 CACGAGTATTGACTCTGAAACAAGATCTCCATTACTGGCCGACTTGGGAATTGAGGTTCG 3349
Query 3325 ACCCAGAGACTGCTCTTTGGCGGAGAAATATATTGAAAGCTTTGCAGTAAAAGCCTTTTG 3384
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3350 ACCCAGAGACTGCTCTTTGGCGGAGAAATATATTGAAAGCCTTGCAGTAAAAGCCATTTG 3409
Query 3385 GTATTTCTCTGAAAAGCTCTTATTATGTCTCTCATTGCTCCAACTTTGTTGTATTTCTAT 3444
|| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3410 GTGTTTCTCTGAAA-G-TCTC-TTATGTCTCTCATTGCTCCAACTTTGTTGTATTTCTAT 3466
Query 3445 CATTTTTCTACTCAAATTCTTCATTAATTCATCATACTAAAAGAACTATCACTACAATTT 3504
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||
Sbjct 3467 CATTCTTCTACTCAAATTCTTCATTAATTCATCATACTAAAAGACCTGTCACTACAGTTT 3526
Query 3505 ACAGAAAAACTGAAGGAATTTACATCCAGTAAAAATGATCATATCAAA 3552
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 3527 ACAGAAAAACTGAAGGATTTTACATCCAGTAAAAATGTTCAAATCAAA 3574
> AT3G03370.2 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unknown;
INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN:
cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 13 plant structures;
EXPRESSED DURING: 7 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: DegP protease 7 (TAIR:AT3G03380.1). |
chr3:797254-799148 REVERSE LENGTH=1171
Length=1171
Score = 219 bits (118), Expect = 2e-55
Identities = 120/121 (99%), Gaps = 0/121 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1358 GAAGGTTGCTAATGAGGACATTTCCGGTCTTGGAGATTTAGTATCTGTTCTTTCAAAGCT 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 GAAGGTTGCTAATGAGGACATTTCCGGTCTTGGAGATTTAGTATCTGTTCTTTCAAAGCT 452
Query 1418 TTCTAGGGGTGCTCGTGTTCCCTTGGAATATATGTCTCACACTGATCGTCATCGCAAGAA 1477
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 TTCTAGGGGTGCTCGTGTTCCATTGGAATATATGTCTCACACTGATCGTCATCGCAAGAA 512
Query 1478 G 1478
|
Sbjct 513 G 513
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 176838474075
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5