BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg477786
Length=3918
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G05040.1 | Symbols: HST, HST1 | ARM repeat superfamily prote... 6453 0.0
> AT3G05040.1 | Symbols: HST, HST1 | ARM repeat superfamily protein
| chr3:1401271-1408197 REVERSE LENGTH=3919
Length=3919
Score = 6453 bits (3494), Expect = 0.0
Identities = 3788/3928 (96%), Gaps = 27/3928 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TAAACCCCAAAACCCAAAGCCAAGCCAGAGAGATTCTGCAAGACGA---G--GAAGAAAG 56
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 5 TAAACCCCAAAACCCAAAGCCAAATC--AGAGATTCTGCAAGACGAGTTGCAGAAGAAAG 62
Query 57 TGTGGGAATCTCTACTTTTGGTAAAGT-TTCATCGCAAGTAATGGAAGATAGCAGCTCCA 115
|||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 63 TGTGGGAATCTCTACTTTTGGT-AATTATTCGTCGCAAGTAATGGAAGATAGCAACTCCA 121
Query 116 CGGCGAGTAATGTGGCCCGAGCTATTCTCGCCGTCGTCGATTAT-AGCTCCACGTCCGAC 174
|||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 122 CGGCAAGTAATGTGGCTCGAGCGATTCTCGCCGTCGTCGATT-TCAGCTCCACGTCCGAC 180
Query 175 ACTCGCAAATCGGCGGTCGAATTCCTGGATTCTATCAAATCTGGAGATGTCAGAGTTTTG 234
|||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 ACTCGCAAATCGGCGGTCCAATTCCTGGATTCTGTAAAATCTGGAGATGTCAGGGTTTTG 240
Query 235 GCAAATACTTCTTTTCATCTTGTGAAAAAAGAGTGGTCTTCAGAAATTCGTCTCCATGCT 294
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCAAAGACTTCTTTTCATCTTGTGAAAAAAGAGTGGTCTTCAGAAATTCGTCTCCATGCT 300
Query 295 TTTAAGATGCTACAGCATTTGGTTAGACTACGATGGGACGAATTAAGTCCTCCGGAGTGC 354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTTAAGATGCTACAGCATTTGGTTAGACTACGATGGGACGAATTAAGTCCTCCGGAGTGC 360
Query 355 AGGGATCTTGTTAATGTTTCTGTTGAACTAATGTCAGAGATTGCTAATGCATGCGAGAAT 414
|||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 361 AGGGGTCTTGTTAATCTTTCTATCGAACTAATGTCAGAGGTTGCTAATGCAAGCGAGAAT 420
Query 415 TGGCCTCTTAAGAGTCAGTCTGCTGCCCTTGTAGCTGAGATAGTTAGAAGAGAAGGCCCT 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 421 TGGCCTCTTAAGAGTCAGTCTGCTGCCCTTGTAGCTGAGATTGTTAGAAGAGAAGGCCCT 480
Query 475 GAT-GTTTGGCAAAAGATATTTACTTTATTAACTTCATTGTCTACTCAGGGTCCCTTACA 533
||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 481 GATCG-TTGGCAAGAGATATTTACTTTATTAACTTCATTGTCTGCTCAGGGCCCCTTACA 539
Query 534 AGCTGAATTGGTCTTGATGACGCTTAGATGGCTTCCTGAAGATATTACAATTTACAATGA 593
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AGCTGAATTGGTATTGATGACTCTTAGATGGCTTCCTGAAGATATTACAATTTACAATGA 599
Query 594 TGACTTGGAAGGTGACAGGCGTAGGCTATTGTTGCGGGGACTTACTCAATC-TCTGCCTG 652
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 600 CGACTTGGAAGGTGACAGGCGTAGGCTATTGTTGCGGGGACTTACTCAATCGT-TGCCTG 658
Query 653 AGATTTTACCTTTATTGTATAATCTTCTTGAGAGACACTTTGGAGCTGCAATGAGTGAAG 712
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AGATTTTGCCTTTATTGTATAATCTTCTTGAGAGACACTTTGGAGCTGCAATGAGTGAAG 718
Query 713 CTGGTAGGCAGCAGTATGACTTGGCAAAACAGCATGCAGATGTGGTTATAGCTTGCTTGA 772
|||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 719 CTGGTATGCAGCACTTTGACTTGGCAAAACAGCATGCAGATGTAGTTATAGCTTGCTTGA 778
Query 773 ATGCCATCATTGCATACACTGAGTGGGCTCCTGTTCCAGATCTTGCCAGATATGGAATTC 832
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 ATGCCATCGTTGCATACACTGAGTGGGCTCCTGTTCCAGATCTTGCCAGATATGGAATTC 838
Query 833 TTAGTGGTTGCAGCTTCTTACTTTCTTCTCCTGACTTCCGTCTTCATGCTTGTGAGGTTT 892
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TTAGTGGGTGCAGCTTCTTACTTTCTTCTTCTGACTTCCGTCTTCATGCTTGTGAGGTTT 898
Query 893 TCAAACTCGTCTGCTCAAGAAAAAGACCCAGTGATGCTTCTAATGCAGAGTTCGATTCTG 952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 899 TCAAACTCGTCTGCTCAAGAAAAAGACCCAGTGATGCTTCTACTGCAGAGTTCGATTCTG 958
Query 953 CAATTAGCAATTTGTTTCAGATCCTGACGAATGCCTCGAGAGAATTATTATGTAGATCCT 1012
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 959 CAATTAGCAATTTGTTTCAGATTCTGACGAATGCCTCCAGAGAATTCTTATGTAGATCCT 1018
Query 1013 CCTCAAGTTCTAGCGTTATAGATGAAAATGATTATGATTTTGCTGTATGCTTGTGTGAGA 1072
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1019 CCTCAAGTTCTAGCGTTATAGATGACAATGATTATGATTTTGCTGTATGCATGTGTGAGA 1078
Query 1073 GTATGGCCTCTTTAGGCTCAACTAACTTGCAATGCATCTCTTCTGATGGTGGTGTTATGG 1132
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 GTATGGCCTCTTTAGGCTCAACTAACTTGCAAAGCATCTCTTCTGATGGTGGTGTTATGG 1138
Query 1133 CTGTTTATCTTCAGCAGATGCTTGGCTTTTTCCAACACTTCAAGTTGGGCCTTCACTTCG 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 CTGTTTATCTTCAGCAGATGCTTGGCTTTTTCCAACACTTCAAGTTGGGCCTTCACTTCG 1198
Query 1193 AGGCACTTCTCTTTTGGCTGTCATTGATGCGGGATTTACTTCCAAAGCCTAAGGCTGCGG 1252
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1199 AGGCACTTCTCTTTTGGCTGTCACTGATGCGGGATTTACTTCCAAAACCCAAGGCTGCGA 1258
Query 1253 CTTATCCAAGTGGTGGGGGATCATCAACTGGCGGTG-TGGATAGTTCAAGCCAGGTTGAT 1311
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTTATCCAAGTGGTGGGGGATCATCAACTGGCGGTGAT-GATAGTTCAAGCCAGGTTGAT 1317
Query 1312 AGTGAAAAGAAAAAGACTTTAAGTCTTATTAATGATGACATCTCTAGCGTTATACTGGAT 1371
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1318 AGTGAAAAGAAAAAGACTTTAAGTCTTATTAATGATGACATCTCGAGCGCTATACTGGAC 1377
Query 1372 GTATCTTTCCAGCGGATGCTCAAGAAAGAAAAAGTTCCTATTGGAATTGCTCTTTCGCTT 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1378 GTATCTTTCCAGCGGATGCTCAAGAAAGAAAAAGTTCCTACTGGAATTGCTCTTTCGCTT 1437
Query 1432 GGGCCCCTAGAACTCTGGAGTGATGAATTTGAAGGGAAGGGGGACTTTGGCCCGTACCGA 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GGGCCCCTAGAACTCTGGAGTGATGAATTTGAAGGGAAGGGAGACTTTGGCCCGTACCGA 1497
Query 1492 TCAAAGCTTCTAGAGTTGATCAAGCTTACTGCTTCTCACAAGCCTCTCATCTCCAGTACC 1551
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TCAAAGCTTCTAGAATTGATCAAGCTTACTGCTTCTCACAAGCCTCTCATCTCCAGTACC 1557
Query 1552 AAAATATCTGAAAGGGTGATTACACTCATTAAGCACCTATTGGCTTCTCCAGCACCTCTT 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1558 AAAATATCTGAAAGGGTGATTACACTCATTAAGCACCTATTGGCTTCTCCAGCTCCTCTT 1617
Query 1612 CAGGATGTAGCAGTGATGGACAGCCAGCAGTTAGCACTTGACTGTATTGTGGCAACGCTT 1671
||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 CAGCATGTAGCAGTGATGGACAGCCAGCAATTAGCACTTGACTGTATTGTGGCAACGCTT 1677
Query 1672 TTTGATGGATCAAATGAGTTTGCTGGTGGAAGTTCTGAAGTTCATTATGCATTACGTGGA 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 TTTGATGGATCAAATGAGTTTGCTGGTGGAAGTTCTGAAGTTCATTATGCATTACGTGGA 1737
Query 1732 ATATTTGAGGGATTGCTTCAGCAGCTTCTCTCTTTGAAATGGAATGAACCAGAACTTATG 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 ATATTTGAGGGATTGCTTCAGCAGCTTCTCTCTTTGAAATGGAATGAACCAGAACTTATG 1797
Query 1792 AAAGTGCATGTGCACTATCTGGATGCAATGGGTCCCTTTTTCAAGTATTTTCCAGATGCA 1851
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 AAAGTGCATGTCCACTATCTGGATGCAATGGGTCCCTTTCTCAAGTATTTTCCAGATGCA 1857
Query 1852 GTTGGAAGTGTCATCAATAAATTATTTGAGCTTCTCACCTCTCTTCCACACGTTGTGAAG 1911
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 GTTGGAAGTCTCATCAATAAATTATTTGAGCTTCTCACCTCTCTTCCACACGTTGTGAAG 1917
Query 1912 GATCCAGCTACTAGTACATCTAGAGCTGCAAGATTGCAGATTTGCACATCTTTCATAAGA 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 GATCCAGCTACTAGTACATCTAGAGCTGCAAGATTGCAGATTTGCACATCTTTCATAAGA 1977
Query 1972 ATAGCCAAAGCTGCAGAGAAAAGTGTTTTGCCTCACATGAAGGGTATTGCTGATACAATG 2031
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 ATAGCCAAAGCTGCAGAAAAAAGTGTTCTGCCTCACATGAAGGGTATTGCTGATACAATG 2037
Query 2032 GGGTATTTGACaaaaaaaGGAACTTTACTCCGTGGGGAGCATAACATTCTGGGTGAAGCA 2091
||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 GGGTACTTGGCAAAAGAAGGAACTTTACTCCGTGGGGAGCATAACATTCTGGGTGAAGCA 2097
Query 2092 TTTCTTGTTATGGCTTCCTCAGCAGGAGCTCAACAGCAGCAAGAAGTTCTAGCTTGGTTA 2151
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2098 TTTCTTGTTATGGCTTCCTCAGCAGGAGCTCAACAGCAGCAAGAAGTTCTGGCTTGGTTA 2157
Query 2152 TTGGAACCATTGAGTCAACAGTGGATCCAGCCAGAGTGGCAGAACAATTATCTATCAGAC 2211
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 TTGGAACCATTGAGTCAACAGTGGATCCAACCAGAGTGGCAGAACAATTATCTATCAGAC 2217
Query 2212 CCGATGGGTCTTGTTCGTTTATGCTCCAACACATCCTTCATGTGGTCCATATTCCACACT 2271
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2218 CCGATGGGTCTTGTTCGTTTATGCTCCAACACATCCTTCATGTGGTCCATATACCACACT 2277
Query 2272 GTTACATTCTTTGAGAAAGCACTCAAGCGAAGTGGATACAGAAAAAGCAATTTGAACACG 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 GTTACATTCTTTGAGAAAGCACTCAAGCGAAGTGGATACAGAAAAAGCAATTTGAACACG 2337
Query 2332 ACCTCTGCGACAACTCCAGCTTCACATCCTATGGCTCATCATCTTTCTTGGATGTTGCCA 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 ACCTCTGCGACAACTCCAGCTTCACATCCTATGGCTCATCATCTTTCTTGGATGTTGCCA 2397
Query 2392 CCCCTCTTAAAACTACTCCGTGTTCTTCATTCCCTTTGGTCTCCCTCTGTATTTCAAACA 2451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 CCCCTCTTAAAACTACTCCGTGTTCTTCATTCCCTTTGGTCTCCCTCTGTATTTCAAACA 2457
Query 2452 TTACCCCCAGAACTGAGGGCAGCAATGACAATGACTGATGCTGAGCGATGCAGTCTCCTT 2511
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2458 TTACCCCCAGAAATGAGGGCGGCAATGACAATGACTGATGCTGAGCGATACAGTCTCCTT 2517
Query 2512 GGTGAAGCAAATCCTAAATTGTCAAAAGGTACATCGGTTTATGCTGATGGGTCATTCGAT 2571
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 GGTGAAGCAAATCCTAAATTGTCAAAAGGCGTATCGGTTTATGCTGATGGGTCATTCGAA 2577
Query 2572 GGAAATAAGGAAGGACAGGTCGAGGCAAGTGAATCTGATATACGAAATTGGTTGAAAGGT 2631
|||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 GGAACTAAGGAAGGACAAGCCGAGGCAAGTGAATCTGATATACGAAATTGGTTGAAAGGT 2637
Query 2632 ATCCGAGATTGTGGATACAACGTGTTGGGCCTATCAACAACCATCGGAGAGACATTCTTT 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 ATCCGAGATTGTGGATACAACGTGTTGGGCCTATCAACAACCATCGGAGAGACATTCTTT 2697
Query 2692 AAATGCTTAGATCCTAACTATGTTGCGATGGCACTCATGGAAAATTTGCAGTCGATGGAA 2751
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 AAATGCTTAGATGCTAACTATGTTGCAATGGCACTCATGGAAAATTTGCAGTCGATGGAA 2757
Query 2752 TTCAGGCACATTCGGCTGTTCATTCATACCTTTATAACTTATATAGTCAAATTTTGTCCG 2811
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2758 TTCAGGCACATTCGGCTGTTTATTCATACCTTTATAACTTATATAGTCAAATCTTGTCCG 2817
Query 2812 GCGGATATGTGGGAGTCATGGCTCGGAGTGCTTCTGCACCCATTGTTTATTCACTGTCAG 2871
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2818 GCGGATATGTGGGAGTCATGGCTGGGAGTGCTTCTGCACCCATTGTTTATACACTGTCAG 2877
Query 2872 CAAGCTCTCAGCTCCGCCTGGCCTGGTCTTCTACAAGAGGGCAGAGCAAAGGTTCCGGAC 2931
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 CAAGCTCTCAGCTCCGCCTGGCCAGGTCTTCTACAAGAGGGCAGAGCAAAGGTTCCGGAC 2937
Query 2932 TTGTTTGGCATACAAAGTGGATCAGACATGAAACTTGAAGTGATGGAGGAAAAACTGTTA 2991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 TTGTTTGGCATACAAAGTGGATCAGACATGAAACTTGAAGTGATGGAGGAAAAACTGTTA 2997
Query 2992 AGAGATTTAACTCGGGAGATTGCGACTCTCTTTTCAACAATGGCTTCTCCTGGACTAAAC 3051
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2998 AGAGATCTAACTCGGGAGATTGCGACTCTCTTTTCAACAATGGCTTCTCCTGGACTAAAC 3057
Query 3052 ACAGGAGTTCCAGTTTTGGAACATTCAGGACATGTTGGTCGTGTGGACATGTCTACTCTC 3111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3058 ACAGGAGTTCCAGTTTTGGAACATTCAGGACATGTTGGTCGTGTGGACATGTCCACTCTC 3117
Query 3112 ACGGATTTGCATGCGTTCAGATCCAACTCTATGGTGGGTTTCCTCCTGAATCACAAAAGC 3171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3118 ACGGATTTGCATGCGTTCAGATCCAACTCTATGGTGGGTTTCCTCTTGAATCACAAAAGC 3177
Query 3172 GTAGCTCTACCAGCACTGCAGATATGTTTAGAAGTCTTT-AGCTGGACAGATGGAGAAGC 3230
||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 3178 GTAGCTCTACCAGCACTGCAGATCTGTTTAGAAA-CTTTTACCTGGACAGATGGAGAAGC 3236
Query 3231 GACCACCAAAGTCTGTTACTTTTGTGGTGTTGTTGTTCTTCTAGCTAAACTAACAAATAA 3290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3237 GACCACCAAAGTCTGTTACTTTTGTGGTGTTGTTGTTCTTCTAGCTAAACTAACAAATAA 3296
Query 3291 CGTGGAGCTCCGAGAATTTGTTTCAAAAGATATGTTCTCTGCAGTCATCCGCGGCTTAGG 3350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||
Sbjct 3297 CGTGGAGCTCCGAGAATTTGTTTCAAAAGATATGTTCTCGGCAGTCATTCGTGGCTTGGG 3356
Query 3351 CATGGAGTCCAATGCCATTAACAGCCCTGATTTAGTTAATATATGCCGTGAAATATTTAT 3410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 CATGGAGTCCAATGCCATTAACAGCCCTGATTTAGTTAATATATGCCGTGAAATATTTAT 3416
Query 3411 CTATCTCTCTGACAGAGACCCAGCTCCTCGCCAGGTTTTGCTTTCGCTCCCGTGTCTCAC 3470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3417 CTATCTCTCTGACAGAGACCCAGCTCCTCGCCAGGTTTTGCTTTCGCTCCCGTGTCTCAC 3476
Query 3471 TCCCAACGACTTGCATGCTTTTGAAGAAGCTGCAGCCAAAACTACCAGCCCCAAAGAACA 3530
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3477 TCCCAACGACTTGCATGCTTTTGAAGAAGCTACAGCCAAAACTAGCAGCCCCAAAGAACA 3536
Query 3531 AAAGCAGCTTATGAGGAGCTTGTTGTTGTTAGGTACTGGGAACAACTTAAAAGCACTTGC 3590
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3537 AAAGCAGCTTATGAGGAGCTTGTTGTTGCTAGGTACTGGGAACAACTTAAAAGCACTTGC 3596
Query 3591 TGCTCaaaaaaaTCTGAATGTTATCACCAATGTCACAGCAAGATCGCGGCTACCCGCAAG 3650
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3597 TGCTCAAAAAAGTCAGAATGTTATCACCAATGTCACAGCAAGAACGCGGCTACCCGCAAG 3656
Query 3651 CGCTTCAGAAACAATTGGAGCGGGTGTTTTGTGGGAGGAAGAGCTCTTACAATGATTAAA 3710
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||
Sbjct 3657 CGCTCCAGAAACAATTGGAGCGGGTGTTTTGTGGGATGAAGAGTTCGTACAATGATTAAA 3716
Query 3711 GAGTTGTACAGAGTATAAATAGAGTTTATTTGAGATGCCATGTAATAGTAGAGAAGCAGG 3770
|| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3717 GAATCGTACATAGTATAAACAGAATTTATTTGAGATGCCATGTAATAGTAGAGAAGCAGA 3776
Query 3771 TTTCTGTTTATGTCCTTACCTTAATACCTTTACTTGTTAAATTCATAGGTAGAAAGAAGG 3830
|||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3777 TTTCTGTTTATGTCCTTACCTT--TAC-TT-----GTTAAATTCATAGGTAGAAAGAAAG 3828
Query 3831 AACCTCTTACCAAAGCTTCCATGTGATAAGCAAAGTTTTTGTAATTTTCGATTTTGTTCT 3890
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3829 AACCTCTAACCAAAGCTTCCATGTCATAAGCAAAGTTTTTGTGATTTTCGATTTTGTTCT 3888
Query 3891 TTATCAGTATTTAAACAATCGGTGAATT 3918
||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3889 TTATCAGTATTTAAACAATCGGTCAATT 3916
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 195199575213
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5