BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg477928
Length=5128
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G06290.1 | Symbols: | SAC3/GANP/Nin1/mts3/eIF-3 p25 family ... 8035 0.0
> AT3G06290.1 | Symbols: | SAC3/GANP/Nin1/mts3/eIF-3 p25 family
| chr3:1899042-1907297 REVERSE LENGTH=5175
Length=5175
Score = 8035 bits (4351), Expect = 0.0
Identities = 4888/5144 (95%), Gaps = 50/5144 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGTTTAGGCCTTTCGGGAAGGACGTAGGTCCGTCGATGAGTTCCAAGCCATCGCCG 60
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |||||| |||||
Sbjct 1 ATGGCGTTTAGGCCTTTCGGGAAGGACTTAGGT-C--CGATGAGCTCTAAGCCAGCGCCG 57
Query 61 TTTACACCGTTCGGTGCTTCTGCTCCCACTAGGTTTGTACTCTTTC-TTTTAATAC-TA- 117
||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||| |||| || | ||
Sbjct 58 TTTACACCGTTCGGTGCTTCTTCAACCACTA-GATTGTAC-CTTTCTTTTTTATTCTTAC 115
Query 118 ACACTGCGAGTTTTGGATTTTCCTTGTAGTGATTC-TCCAATTCAACCACCGTCTTCTCA 176
||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||
Sbjct 116 ACACTGCGAATGTTGGA-TTTGCTTGTAGTGATTCAT-CAATTCAACCACCGGCGTCTCA 173
Query 177 AAACCCTTCAGCCTTAGCAGGACAATCTTTTGGACCAGGTGGAATTCAAAGTGGTCCTCC 236
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
Sbjct 174 AAACCATTCAGCCTTTGCAGGACAATCTTTTGGACCTGGTGGAATTCGAAGTGGTCCTTC 233
Query 237 AGTTCAGCGAGCACCACCTCCT-TTGGCTTCTCAAAACCCTCCA-CCCTCTATAGGGAAA 294
| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| || | |||||||||||||
Sbjct 234 AATTCAGCGAGCACCACCT-CTGTCGGCTTCTCAAAACCCT-CAGCTCTCTATAGGGAAA 291
Query 295 CCTTACCGACCAGGTGGGGTTCAAAGTGTTCCTCCAATTAATCGAACACCATCTCCGTTG 354
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
Sbjct 292 CCTTACCGACCAGGTGGGGTTCAAAGTGTTCCTCCAATTAATAGAATACCATCTCCGTCG 351
Query 355 GCTTTTCAAAATCCCTCACCCTCCTCAGGACAACCTTACCAACCTGGTGGAATTCAAAGG 414
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 GCTTTTCAAAATCCATCACCCTCCTCAGGACAACCTTACCAACCTGGTGGAATTCAAAGG 411
Query 415 TTCCCAGAACCTTTCAATGGAATAGCATGGGGTTCAGAAGCTTTTCCACGTCCAAGCCCC 474
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 412 ATCCCAGAACCTTTCAATGGAATAGCATGGGGTCCAGAAGC--TT-CACGTACAAGCCCC 468
Query 475 TCTGTGAGACCTTACCAATTTCCTGGAGTTCAAAGGCCTGCTTTAAATCCTCAATTTGGG 534
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 469 TCTGTGAGACCTTACCAATTTCCTGGAGTTCAGAGGCCTAATTTAAATCCTCAATATGGG 528
Query 535 CACGATGGATCAAGGAATTTCTTGAAAGATCATGGTGAACATAGTCGAGCCACATCTCCA 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 529 CACGATGGATCAAGGAATTTCTTGAAAGATCATGGTGAACATAGTCGAGCCACGTCTCCA 588
Query 595 CCTGCTACATCTCACATTCTTTCCAGAATGGGAACTGATGCTGTTGAGATAGGTCGATCA 654
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 589 CCTGCTACATCTCACATTCTTTCCAGAATGGGAACTGATGCTGTTGAGATTGGTCGATCA 648
Query 655 CAAGATTCAAAAAGAAAAAGTCGGTCAGATATTCTTCCGGATCAGACTATGGGGTTTTCT 714
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||
Sbjct 649 CAAGATTCAAAAAGAAAAAGTCGGTCAGATATTCTTCCTGACCAGAATATGGGGTTTTCT 708
Query 715 AGAAGAAATCAATCGCCAGTATCAGGTTTTGAGAATGGGAACTTGGTAGATGGTTTTCAG 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 709 CGAAGAAATCAATCGCCAGTATCAGGTTTTGAGAATGGAAACTTGGTAGATGGTTTTCAG 768
Query 775 CCACCTTCTAGCCAAACTTGGATGCGCTCTCTGTCTTCTGCGGAGAATAATCCCGTGAGG 834
|||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 769 CCACTTTCTAGCCGAACTTGGATGCGCTCTCCGTCTTCTGCGGAGAATAATCCGGTGAGG 828
Query 835 TCGAGGAGCAATCCCAATCGGTTGATTCATCAAGAACAAACCCGAAACTCGCCATTCCCC 894
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 829 TCGAGGAGCAATCCCAATCAGTTGATTCATCAAGAACAAACCGGAAACTCGTCATTCCCC 888
Query 895 TATGCACATGAAGTAGCTGAAATTCAGGAAGCTACAAGAAGAAAGTCTTCGGCTATAGCA 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 889 TATGCACATGAAGTAGCTGAAATTCAGGAAGCTACTAGAAGAAAGTCTTCGGCTGTAGCA 948
Query 955 CCTTCTGATAAACCCCTCGGAGATGACCCCATATTGTCTCAACATGACTCTCAAAGGTTT 1014
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 CCTTCTGATAAACCCCTTGGAGATGACCCCATATTGTCTCAACATGACTCTCAAAGGTTT 1008
Query 1015 TCGACATCTCCTCCTACGTCAGGCACAAAGACATATACGCTTTCAAGAAGTTCAGATTCT 1074
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 TCGACATCTCCACCTACGTCAGGCACAAAGTCATATACACTTTCAAGAAGTTCAGATTCT 1068
Query 1075 CAATTTCCTGGGCAGCCCTCCTCTCTAAATAGTTTCAATAATGCGGGTAAGACAAGCAGT 1134
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1069 CAATTTCCTGGACAGCCCTCCTCTGTAAATAGTTTCAATAATGCGCGTAAGACAAACAGT 1128
Query 1135 TCACCTGCAACAAAAAGGACGAGATCTCCACCTGTATATCCAGTTGAAGAGGATATCCAG 1194
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1129 TCACCTGCAACAAAAAGGACGAGATCTCCACCTGTATATCCAATTGAAGAGGATATCCCG 1188
Query 1195 CGAAACTCTTTTCCTTCTCAAGATTGTACGGAAGGAGAAGAGCAAGCCAGGGCAAAGAGA 1254
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 CGAAACTCTTTCCCTTCTCAAGATTGTACAGAAGGAGAAGAGCAAGCCAGGGCAAAGAGA 1248
Query 1255 CTGGCCCGCTTCAAGGGTGAACTGGAGCCTATTGCAGACCGACCTGTTGATACTCAACTT 1314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1249 CTGGCCCGCTTCAAGGGTGAACTGGAGCCTATTGCAGACCGACCTGTTGATATTCAACTT 1308
Query 1315 ACTAAATCACCTGTAAATAAAACTATGAAGCCTCTGGACAACAAACAAACATTCAATTCA 1374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 ACTAAATCACCTGTAAATAAAACTATGAAGCCTCTGGACAACAAACAAACATTCAATTCG 1368
Query 1375 CTTGAATCAAGTAGGGATGCCCTGAAGGGAGATGCCTTGCCTGATTATGAAAGCTCGGAG 1434
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1369 CTTGAATCAAGTAGGGATGCCCTGAAGGGAGATGCCTTGCCTGATTATGAAAACTCGGAG 1428
Query 1435 CAGCCCTCTCTTATCATTGGATTATGCCCTGACATGTGTCCTGAGTCAGAACGGGGGGAG 1494
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 CAGCCCTCTCTTATCATTGGAGTATGCCCTGACATGTGTCCTGAGTCAGAACGGGGGGAG 1488
Query 1495 CGTGAGAGGAAGGGTGACTTGGACCATTATGAGCGTGTGGATGGAGATAGGAACCAGACA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 CGTGAGAGGAAGGGTGACTTGGACCATTATGAGCGTGTGGATGGAGATAGGAACCAGACA 1548
Query 1555 AGCAAATCCCTTGCTGTGAAGAAATATACTAGGACGGCGGAGCGAGAAGCAATTTTGATA 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 AGCAAATCCCTTGCTGTGAAGAAATATACTAGGACGGCGGAGCGAGAAGCAATTTTGATA 1608
Query 1615 CGACCAATGCCAATCCTGCAAAATACAATGGAATATTTGCTGAGTTTGCTAGACCGACCT 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 CGACCAATGCCAATCCTGCAAAATACAATGGAATATTTGCTGAGTTTGCTAGACCGACCT 1668
Query 1675 TACAATGAAAACTTTCTTGGCATGTACAATTTCTTATGGGATAGGATGAGAGCTATTCGT 1734
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1669 TACAATGAAAACTTTCTTGGCATGTACAATTTCTTATGGGATAGGATGAGAGCTATACGT 1728
Query 1735 ATGGATCTAAGAATGCAACATATTTTCAACCAAGAAGCTATTACTTTGCTGGAGCAAATG 1794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 ATGGATCTAAGAATGCAACATATTTTCAACCAAGAAGCTATTACTTTGCTGGAGCAAATG 1788
Query 1795 GTTAGACTTCACATCATTGCAATGCATGAACTATGTGAATATACGAAAGGAGAGGGCTTT 1854
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1789 ATTAGACTTCACATCATTGCAATGCATGAGCTATGTGAATATACTAAAGGAGAGGGCTTT 1848
Query 1855 TCGGAGGGGTTTGATGCACACCTGAATATTGAGCAGATGAACAAGACATCTGTTGAGTTG 1914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 TCGGAGGGGTTTGATGCACACCTGAATATTGAGCAGATGAACAAGACATCTGTTGAGTTG 1908
Query 1915 CTTCAAATGTATGATGATCACAGGAAGAAAGGAATAACTGTTCCTACAGAAAAAGAGTTT 1974
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 TTTCAAATGTATGATGATCACAGGAAGAAAGGAATAACTGTTCCTACAGAAAAAGAGTTT 1968
Query 1975 CGTGGCTATTATGCCCTTCTCAAACTCGACAAACATCCGGGCTATAAGGTTGAACCTTCA 2034
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 CGTGGCTATTATGCCCTTCTCAAACTCGACAAGCATCCTGGCTATAAGGTTGAACCTTCA 2028
Query 2035 GAACTTTCTCTTGATCTTGCCAATATGACTCCAGAAATAAGGCAAACTTCAGAAGTTCTC 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 GAACTTTCTCTTGATCTTGCCAATATGACTCCAGAAATAAGGCAAACTTCAGAAGTTCTC 2088
Query 2095 TTTGCCCGCAATGTAGCCAGAGCTTGCAGAACTGGCAACTTCATCGCCTTCTTTCGCCTT 2154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 TTTGCCCGCAATGTAGCCAGAGCTTGCAGAACTGGCAACTTCATCGCCTTCTTTCGCCTT 2148
Query 2155 GCACGGAAAGCAAGCTATCTTCAAGCATGTCTAATGCATGCTCATTTTTCGAAACTAAGA 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 GCACGGAAAGCAAGCTATCTTCAAGCATGTCTAATGCATGCTCATTTTTCGAAACTAAGA 2208
Query 2215 ACTCAGGCACTTGCCTCTCTGCACTCGGGTCTCCAAATTAATCAGGGTCTCCCAGTTTCA 2274
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 ACTCAGGCGCTTGCCTCTCTGCACTCGGGTCTCCAAATTAATCAGGGTCTCCCAGTTTCA 2268
Query 2275 GATACGTCAAAGTGGATAGGGATGGAGGAAGAGGACATAGAAGCCCTGTTGGAGTACCAT 2334
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 GATATGTCAAATTGGATAGGGATGGAGGAAGAGGACATAGAAGCCCTGTTGGAGTACCAT 2328
Query 2335 GGGTTTTCGATAAAGGTGTTTGAAGAGCCATACATGGTAAAAAATGACCTATTTCTCCAT 2394
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2329 GGGTTTTCGATAAAGGTTTTTGAAGAGCCATACATGGTAAAAAATGACCTATTTCTCCAT 2388
Query 2395 GCTGATAAGGATTACAAAACAAAATGCTCAAAACTTGTTCACATGAAGAAGTCAAGAACC 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2389 GCTGATAAGGATTACAAAACAAAATGCTCAAAACTTGTTCACATGAAAAAGTCAAGAACC 2448
Query 2455 ATAGTGGAAGATGTTTCTGCTCCCTCAGTAGAGGAAGATGTTTCTACTCCCTCTCCATTG 2514
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2449 ATAGTGGAAGATGTTTCTGCTCCCACAGTAGTGGAAGATGTTTCTACTCCCTTTCCATTG 2508
Query 2515 CCTTCCTTGATCACAGAAACAACTAACAGAAATCAACAGTGTATTACCGCCCATAAACAG 2574
|||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2509 CCTTCCTTGATCACAGAAGCAACTATCGGAAATCAACAGTGTATTACCGCCCATAAACAC 2568
Query 2575 GAAATGCCGCCTGCCAGAAGTCTTAAGAAACAAACATCAATGCGTCTATTTGATAAAGAA 2634
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 GAAATGCCGCCTGCGAGAAGTCTTAAGAAACAAACATCAATGCGTCTATTTGATAAAGAA 2628
Query 2635 ATGGCTGACTCCAAGACTTCCCTCTCACCAGAGGAGGACAAGCCAGTGAGGCCATTTATT 2694
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||| ||
Sbjct 2629 GTGGCTGACTCCAAGACTTCCCTCTTAGCAGAGGAGGACAAGCCAATGGGGACATTTGTT 2688
Query 2695 ATAAATCCAGCAGGGCCATCCTTTATAAATCCAGTTGTGCATCAACAGAAACAAAATCAC 2754
|| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2689 ATGAATCCACCAGGGCCATTCGTTATAAATCCAGTGGTGCATCAAGAGAAACAAAATGAC 2748
Query 2755 CTTACATCAGCTGGTGGATTTCATTCTCCCGTGAAGCTATATTCTCCTATTGTTTCCCCT 2814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 2749 CTTACATCAGCTGGTGGATTTCATTCTCCCGTGAAGCTATATTCTCCTTTTGGTTCCCCT 2808
Query 2815 AGATTTCCTCAAACTAAATCCTTGAATTTGGAGAAACAACCTAATGACGGTCGCATTGGT 2874
| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2809 AAATTTCCTCAAACTAAATCGTCGAATTTGGAGAAACAACCTAATGACGATCGCATCGGT 2868
Query 2875 ATGTCTCCTGGGGAAATTAAATTTCCATTTGCAGGGGATGTACATACGAATCATGTGCCT 2934
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2869 ATGTCTCCTGGGGAAATTAAATTTTCAATCATAGGGGATGTATATACGAATCATGTGCCT 2928
Query 2935 GGACCAGCTTTGCAACAAAGTCTGAAGTCTATGCCAATGGAGATTATGCCTGTAACTACC 2994
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 GGACCAGCTTTGCAACAAAGTCCGAAGTCTATGCCAATGGAGATTATGCCTGTAACTACC 2988
Query 2995 ATTGCAGAGTCTCCGAC---TGTAGAAAACAAATATGCTTTGGAAGAATCCGTACCTGAA 3051
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2989 ATTGCAGAGTGTCCGACAAGTGTAGAAAACAAATATGCTTTGGAAGAATCAGTACCGGAG 3048
Query 3052 GCTGCAATTATTTGTACCTTGGAAAAGGACTTCCATGACATTGACCAGGAAGATGAGGAT 3111
|||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 3049 GCTGCAATGATTTGTACCTTGGAAAAGGAGTTCAATGACATTGACGAGGAAGACGAGGAT 3108
Query 3112 GAGAATGGGGTCATCTTAAATCAGTATGATGAGGAAGTGGCGAAGGCAAAACTCAAGTTG 3171
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3109 GAGGATGGGGTCATCTTAAATCAGTATGATGAGGAAGTGGCGAAAGCAAAACTCAAGTTG 3168
Query 3172 ATAATAAGATTATGGAAGCGGTGGTCTTCACGTCAAAGTGAATTGCGGGAGCGTCGACAG 3231
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 ATCATAAGATTATGGAAGCGGTGGTCTTCACGTCAAAGTGAATTGCGGGAGCGTCGACAG 3228
Query 3232 TTAGCAGCAGCTGCTGCACTGAATTCACTATCCCTGGGTACTCCTATCCGATTTAGCAAA 3291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 TTAGCAGCAGCTGCTGCACTGAATTCACTATCCCTGGGTACTCCTATCCGATTTAGCAAA 3288
Query 3292 ACTGAGCAATCAAGGGCGTGTGGTGAGTTTAACATTGATCAAGCCATGAAGAGGAGATTT 3351
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3289 ACTGATCAATCGAGGGCGTGTGGTGAGTTTAACATTGATCAAGCCATGAGGAGGAGATTT 3348
Query 3352 GAAGAACACGAGAAATCATGGTCAAGGCTGAATATTTCAGATGTGATAGCTGATATACTA 3411
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 GAAGAACGTGAGAAATCATGGTCAAGGCTGAATATTTCTGATGTGATAGCTGATATACTA 3408
Query 3412 GTTGGAAGGAATCCAGAATCAAAATGCATATGCTGGAAGGTCATCTTATGTACTCAGACT 3471
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3409 GTTGGAAGGAATCCAGAATCAAAATGCATAAGCTGGAAGGTCGTCTTATGTACTCAGACT 3468
Query 3472 AAATCAGTAAACACAGCATCTTCTGCAAGTCAGGTTACACATTCAGCAGCCAGTCGATGG 3531
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3469 AAATCAGTAAACTCATCATCTTCTGCAAGTCAGGTTACGCATTCAGCAGCCAGTCGATGG 3528
Query 3532 TTATCATCAAAGCTTATGCCTCATGCAGAACATAGT---CTCAATGATGATAATCTGCTG 3588
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 3529 TTATCATCAAAGCTTATGCCTCATGCAGAACATAGTAGTCTCAACGATGATAATCTGCTG 3588
Query 3589 TTTTCAGCTCCCGGTGTGTCGGTATGGAACAAATGGGTTGCAAATGGGTCTGACATAGAT 3648
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3589 TTTTCAGCTCCCGGCGTGTCTGTATGGAACAAATGGGTTGCAAATGGGTCTGATATAGAT 3648
Query 3649 TTCACATGCTGTCTCTCAGTAGCTAGAGATGTGGAGGCTGAGAATGATATGTGTGAAACA 3708
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3649 TTCACATGCTGTCTCTCAGTAGCTAGGGATGTGGAGGCTGAGAATGATATGTGTGAAACA 3708
Query 3709 ACATGTGGTGCAAGTGCAGTCCTTTTCCTTGCATCTGGAGGCCTCCCTTTAAATCTTCAG 3768
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3709 ACATGTGGTGCAAGTGCAGTCCTTTTCCTTGCATCTGGAGGCCTCCCTTTGAATCTTCAG 3768
Query 3769 AGAGAACAGCTTAACCGCATTCTTGAATCAGTACCCAACGGTTCAGTTCTTCCCCTTCTC 3828
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3769 AGAGAACAGCTTAACCTCATTCTTGAATCAGTACCCAACGGTTCAGTTCTTCCCCTTCTC 3828
Query 3829 GTAGTAATCAGCTCATGCAATGGGGAACATACGGAGCCTGATACCGATC-TCGTCTCGGG 3887
|||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||
Sbjct 3829 GTAGTAATTAGCTCATGCAATGGGGAACACATGGAGCCTGATACCGA-CATTGTCTCGGG 3887
Query 3888 ACTAGGCCTCCATGATATTGACAAGTCAAAGATTGCAAGCTTTTCCATCGTTTCTATTGC 3947
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3888 ATTAGGCCTCCATGATATTGACAAGTCAAAGATAGCAAGCTTTTCCATCGTTTCTATTGC 3947
Query 3948 TAATAAGTCGCAAAAGGGGCAGGAAGTTCGTTTTTTCAACGATTCACGGCTAAGAGATGG 4007
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3948 TAATAAGTCCCAAAAGGGGCAGGAAGTTCATTTTTTCAATGATTCACGGCTAAGAGATGG 4007
Query 4008 GATTAAATGGCTGGCGAGCAATTCACCACTGCAACCAAATCTTCATCATGTTAAACCCCG 4067
| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4008 GTTTAAATGGCTAGCAAGCAATTCACCTCTGCAACCAAATCTTCATCATGTTAAACTCCG 4067
Query 4068 GGAACTGGTTCTGACTCATTTCAGTTTTTCCCTGGAGTTGCTTAAGCAGATGCCAGATCA 4127
||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4068 GGAACTGTTTCTGACCCATTTCAGTTTTTCCTTGGAGTTGCTTAAGCAGATGCCAGATCA 4127
Query 4128 GGAGGTTGGTCCTAACATCTGCATATCAGCCTTCAACGACGCATTGGAAACATCACGAAG 4187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4128 GGAGGTTGGTCCTAACATCTGCATATCAGCCTTCAACGACGCATTGGAAACATCACGAAG 4187
Query 4188 AAACATCACTTCTGCTGCTGAAGCAAATCCAATCGGTTGGCCTTGCCAC-GAGACGAA-G 4245
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |
Sbjct 4188 AAACATCACTTCTGCTGCTGAAGCAAATCCCATCGGTTGGCCTTGCC-CTGAGAC-AATG 4245
Query 4246 TTGCTCGAGGATAATAGAAAAGAACGTTTAATGGTGAAGCGGTATCTTCCCAACCTGGAC 4305
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4246 TTGCTCGAGGATAATAGAAAAGAATGTTTAATGGTCAAGCGGTATCTTCCCAACCTGGAC 4305
Query 4306 TGGAGCAGTGCAGAGAACGTCGAACCACTCAACTCCGTGCTAGAGAATTGTAAGCTCCCA 4365
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4306 TGGAGCAGTGCAGAGAACGTCGAACTACTCAGTTCCGTGCTAGAGAATTGTAAGCTCCCA 4365
Query 4366 TATTTTGAAGATGATTTGACATGGTTAACCGTAGGATGTGCTTCTGGTGCTGAGATAGAG 4425
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4366 GATTTTGAAGATGATTTGACATGGCTAACCGTAGGATGTGCTTCTGGTGCTGAGATAGAG 4425
Query 4426 AACCATACGCAACGGCTCGAGGGATGCTTAGTTGAGTACTTAACACAGAGAAGCAATCTT 4485
||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4426 AACCACACGCAAAGGCTTGAGGGATGCTTAATTGAGTACTTAACACAGAGAAGCAATCTT 4485
Query 4486 ATGGGAGTCTCATTAGCTACCAAAGAAACAGGAGTGATGCTAGAAAGAAACACTAGACTC 4545
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4486 ATGGGAGTCTCATTAGCTACTAAAGAAACAGGAGTGATGCTAGAAAGAAACACTAGACTC 4545
Query 4546 GAACTCCATAACTCAAGCCGCTACCATATCATCCCAAGATGGATTGGTATCTTCCAGAGG 4605
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4546 GAACTCCATAACTCAAGCCGCTACCATATCACCCCGAGATGGATTGGTATCTTCCAGAGG 4605
Query 4606 ATCTTCAACTGGCGGATAATGGGTTTGTTTGATGCATCGTCTTCCTCAGCTTACGTACTG 4665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4606 ATCTTCAACTGGCGGATAATGGGTTTGTTTGATGCATCATCTTCCTCAGCTTACGTACTG 4665
Query 4666 AAGTCTGATCTCACCATGTCAACTTCAAGCTATGCAGATAAATTCTTGGCTGAAGATGCA 4725
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4666 AAGTCTGATCTCAACATGTCAACTTCAAGCTATGCAGATAAATTCTTGGCTGAAGATGCA 4725
Query 4726 TCATACCCATCTTCTCGTCCAAATCTTCCATTGCTTCATGAAATGATACAAATCAGCTGC 4785
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4726 TCATACCCATCTTGTCCTCCAAATCTTCCATTGCTTCATGAAATGATAGAAATCAGCTGC 4785
Query 4786 AGCCCCTTCAAGTCGTCTCCTCGATATGATCACAAAGCCCAGAGAGTTGTCGAATCGGTT 4845
|||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4786 AGCCCCTTGAAGTCGCCTCCTCCATATGATGACAAAGCCCAGAGAGTTGT----T-G--- 4837
Query 4846 GAGACAGAAATGGTCATCGATGATCATAGAGATATAGACGAGTCTACT-TTGGAGAAGAG 4904
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||| ||||
Sbjct 4838 -AGACAGGAATGCTCATCGATGATCATAGAGATATAGAGGAATCGA-TGTTGGAAAAGAA 4895
Query 4905 CAGCGAAGCTTATAGAGGGACGGATCTGATGATAACTGAGGATGATGAGTTAGCCGATGG 4964
||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 4896 CAGAGAAGCTTGTCGAGGTATTGATCTGATGATAACTGAGGATGATGAGTTAGGCGA-G- 4953
Query 4965 AACCGATAGATCATGgagaagtaaaggtaaagaagcggcagagaagaagacgatagagaa 5024
| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4954 A---GAT----CATGGAGAAGTAAAGGTAGAGAAGCGGCAGAGAAGAAGACGATAGAGAA 5006
Query 5025 gcgagagagtgagagattagaTGAATTGTTGGAGAAATGTAACTTGGTACAGAGTAGCAT 5084
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 5007 GAGAGAGAGTGAGAGATTAGATGAATTGTTGGAAAAATGTAACATGGTACAGAATAGCAT 5066
Query 5085 AGCCGAGAAGCTCTGTATTTACTTCTGATTTTCTTCAACCCTTT 5128
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 5067 AGCCGAGAAGCTCTGTATTTACTTCTGATTTTCGTCAGCCCTTT 5110
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 255901576243
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5