BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg477953
Length=3627
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G06480.1 | Symbols: | DEAD box RNA helicase family protein ... 4072 0.0
> AT3G06480.1 | Symbols: | DEAD box RNA helicase family protein
| chr3:1985455-1990153 REVERSE LENGTH=3605
Length=3605
Score = 4072 bits (2205), Expect = 0.0
Identities = 2604/2787 (93%), Gaps = 65/2787 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTTCTTGATCCTCTCTGGCTCGCACCGGTGTCTTTATTCAACTCTGGTTCGCATAGGTG 60
||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 CGTTCTTGATCCTCTCTGGTTCGCACCCGTGTTTTTAATCAATTCTGGTTCGCATAGGTG 60
Query 61 ACTCCGGTACTATTTCTTCGCCGATGTAAGTCTTTGCCTATGGCCACAACAGAAGCTACT 120
||||||||||| |||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 ACTCCGGTACTGTTTCTTCGTCGA--T-AGCCTTTTCCTATGGCCACAACAGAAGATACT 117
Query 121 CCAGCTTCTGCTGGTCCAAGATATGCTCCAGAGGACCCAACTCTTCCCCAACCATGGAAG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CCAGCTTCTGCTGGTCCAAGATATGCTCCAGAGGACCCAACTCTTCCCCAACCATGGAAG 177
Query 181 GGACTTATTGATGGAAGCACAGGAATTCTGTATTACTGGAATCCTGAAACCAATGTCACT 240
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 GGACTTATTGATGGAAGCACAGGAATTCTCTATTACTGGAATCCTGAAACCAATGTCACT 237
Query 241 CAGTATGAAAGACCTTCTGCGCCTCCTCCACCA-T-TGCCAGCTGGTGCTCCAAAGCTCG 298
||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | || ||||| |
Sbjct 238 CAGTATGAAAGACCTTCTGCGCCTCCTCC-CCACTCTGCCA-C---AACACCGAAGCTAG 292
Query 299 CTCAGATTCCTGTACCCTCTTCAGGACAAGGTCACCAAGCTCAGCACGAACAAGCAAAAC 358
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 293 CTCAGATTCCTGTACCCTCTTCAGGACAAGGTCACCAAGCTCAGCATGAACAAGCAAAAC 352
Query 359 CAGTTGGTCACGTGTCTCAGCAGCATGGTTTACAACAACAGCCACAGCAATATCCATCCC 418
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 353 CAGTTGGTCATGTGTCTCAGCAGCATGGTTTCCAACAACAGCCACAGCAATTTCCATCCC 412
Query 419 AACATGTCAGACCCCAAATGATGCAGCAGCAGCACCAGCATCCGGGCCAGCAAATGCCTC 478
||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 413 AACATGTAAGACCCCAAATGAT------GCAG---CAGCATCCGGCCCAGCAAATGCCTC 463
Query 479 AACAATCAGGTCAACAGTTTCCCCAACAACAGAGCCAATCGATGGTGTCGCAGCCGCATG 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct 464 AACAATCAGGTCAACAGTTTCCCCAACAACAGAGCCAATCGATGGTGCCGCACCCACATG 523
Query 539 GGCATCCTTCTGTACAGACTTATCAG-C--C-A---A-C-G-A-C-GC-----A-GCAG- 579
|||||||||||||||||||||||||| | | | | | | | | || | ||||
Sbjct 524 GGCATCCTTCTGTACAGACTTATCAGCCAACGACGCAGCAGCAGCAGCAAGGGATGCAGA 583
Query 580 --CAGCATTCACAAATGCCTCAGCAGCAGAGCCATCAGTATGCACATTCACAACAACAGT 637
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 584 ATCAGCATTCACAAATGCCTCAGCAGCTGAGCCATCAGTATGCTCATTCACAACAACATT 643
Query 638 ACATGGGTTATCGGCCTCACATGC-AAC-CACAGGGGTTACAAAATTCACATCAGACACC 695
||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 644 ACATGGGTTTTCGGCCTCACATGCAAACGCA-AGGACTT-CAAAATTCACATCAGACACC 701
Query 696 TCAGGGTGGTCCCCAAGGTCAGCAGTTTCCGAGCCAGCAAGAGTACAACTCATTGGTTCC 755
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 702 TCAGGGTGGTCCCCATGGTCAGCAGTTTCCGAGCCAGCAAGAGTACAACTCATTGGCTCC 761
Query 756 AAAGAGGGAGGGGGATGAGTTCCATGGGGGTAAGAAAACTGGGTTTCCTCAACCCCATTT 815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 762 GAAGAGGGAGGGGGATGAGTTCCATGGGGGTAAGAAAACTGGGTTTTCTCAACCCCATTT 821
Query 816 ACCAAATTCTGAAAATTCGCCATCTCAAAATACCCCCTTTGAAGCCAATGCAGCATCAC- 874
||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 ACCAAATTCTGAACGTTCACCATCTCAAAATACCCACTTTGAAGCCAATGCAGCATCACA 881
Query 875 AAAGAACGAATGCAAACTTGGCTATGGCTCAGAAATACAATGGACCTCAAGCAAACATGC 934
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||
Sbjct 882 AAAG-ACGAATGCAAACTTGGCTATGGCTCAGAAATGCAATGGACCTCAAGC-AA-ATG- 937
Query 935 AACATCATGTTGCAGTCACACAGTTTCAACAGCCAGGGTCTAACCTGATTCACCAGCAGC 994
| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |
Sbjct 938 -----C----TGCAGTCACACAGTTTCAACAGCCAGGGGCGAACCTAATTCACCAGCAAC 988
Query 995 TTGGACCTAGGGCTCCAAATCAAATGGACCCGACAATGTTGCACCAGAAGTCTCATGCTT 1054
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 989 TTGGACCTAGGGCGCCAAATCAAATGGACCAGACAATGTTGCACCAGAAGTCTCACGTTT 1048
Query 1055 CCTCTTTCCAGTCAAATAATACTTATGAGAATAATCTACAATCTAGACCTGGGAATGACT 1114
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1049 CCCCTTTCCAATCAAATAATACTTATGAGAATAATCTACAATCTAGGCCTGGTAATGACT 1108
Query 1115 CATACGTTAACGCGAGAATGGAAGGGCCGGTTAGGGGTGCCCAACCACTTCATCCTGCAT 1174
| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 CGTACGTTAACATGAGAATGGAAGTGCCGGTTAGGGGTGCCCAACCACTTCATCCTGCAG 1168
Query 1175 CAATGCCTAAGGATATAAGGATAGGTGGTGGTCCACCTATAAATGCTGATCCCGCCATGG 1234
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 CAATGCCTAAGGATATAAGGATAAGTGGTGGTCCACCAACAAATGCTGATCCCGCCATGG 1228
Query 1235 GGCAAACAGGACATGGAACATATGGACACGCTGGTCCAGCTTTTCCAAATAAATCCTTGG 1294
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 GGCAAACAGGGCATGGAACATATGGACACGCTGGTCCAGCTTTTCCAAATAAATCCTTGG 1288
Query 1295 TGAGGCCTCATTTTGCCACATCTCCTGATGTTCCCCATCTCTCGCCCGTTGAAATATACC 1354
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1289 TGCGGCCTCATTTTGTCACATCTCCTGATGTTCCCCATCTCTCTCCCGTTGAAATATACC 1348
Query 1355 GAAAGCAACATGAAGTCACAACAACTGGCGAGAACATTCCAGCACCATACATCACATTTG 1414
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 GAAAACAACATGAAGTCACAACAACTGGCGAGAACATTCCAGCACCATACATCACATTTG 1408
Query 1415 AATCTAGTGGTCTCCCACCTGAAATACTTAGAGAGTTGCTTTCTGCTGGATTTCCATCGC 1474
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409 AATCTAGTGGTCTCCCACCTGAAATCCTTAGAGAGTTGCTTTCTGCTGGATTTCCATCGC 1468
Query 1475 CAACACCGATCCAGGCTCAAACATGGCCAATTGCTCTGCAGAGCAGGGATATAGTTGCAA 1534
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1469 CAACACCGATCCAGGCCCAAACATGGCCAATTGCTCTGCAAAGCAGGGATATAGTTGCAA 1528
Query 1535 TTGCAAAAACTGGTTCCGGTAAAACATTGGGATACTTGATCCCTGCCTTCATTCTTCTAA 1594
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 TTGCAAAAACTGGTTCTGGTAAAACATTGGGATACTTGATCCCTGCCTTCATTCTTCTAA 1588
Query 1595 GGCACTGTCGTAACGACTCCCGCAATGGGCCCACAGTTTTGATCCTAGCTCCTACTCGGG 1654
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1589 GGCACTGTCGTAACGACTCCCGCAATGGCCCCACAGTTTTGATCCTAGCTCCTACTCGGG 1648
Query 1655 AGCTAGCCACACAAATACAAGATGAAGCCCTTAGGTTTGGCCGGTCTTCCAGGATATCAT 1714
|||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1649 AGCTAGCCACACAAATACAAGACGAAGCACTAAGGTTTGGACGGTCTTCCAGGATATCAT 1708
Query 1715 GCACTTGTTTGTATGGTGGAGCTCCAAAGGGTCCTCAGTTGAAAGAGTTGGAACGAGGAG 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 GCACTTGTTTGTATGGTGGAGCTCCAAAGGGTCCTCAATTGAAAGAGTTGGAACGAGGAG 1768
Query 1775 CTGATATTGTGGTGGCAACTCCTGGGCGTCTAAATGATATACTGGAGATGAAGAAGATTG 1834
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1769 CTGATATTGTGGTGGCAACTCCTGGGCGTCTAAATGATATACTGGAGATGAAGATGATTG 1828
Query 1835 ATTTCCAGCAGGTTTCCCTTCTTGTGCTTGATGAGGCAGACAGAATGCTTGACATGGGTT 1894
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1829 ATTTCCAGCAGGTTTCCCTTCTTGTGCTTGACGAGGCAGACCGAATGCTTGACATGGGTT 1888
Query 1895 TTGAACCCCAAATCTGTAAGATTGTGAATGAAATACCTCCTAGGAGACAGACTCTTATGT 1954
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1889 TTGAACCCCAAATCCGTAAGATTGTGAATGAAATACCTCCTCGGAGACAGACTCTTATGT 1948
Query 1955 ACACAGCAACTTGGCCAAAAGAAGTAAGAAAAATTGCAAGCGATCTTCTTGTGAACCCTG 2014
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 ACACAGCCACTTGGCCAAAAGAAGTAAGAAAAATTGCAAGCGATCTTCTTGTGAACCCTG 2008
Query 2015 TCCAAGTTAACATAGGTAGGGTAGATGAGTTGGCTGCTAACAAAGCAATAACGCAGTATG 2074
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 TCCAAGTTAACATAGGCAGGGTAGATGAGTTGGCTGCTAACAAAGCAATAACGCAGTATG 2068
Query 2075 TTGAAGTAGTCCCACAAACGGAGAAAGAGAGACGTTTGGAGCAAATCCTTAGGTCGCAAG 2134
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2069 TTGAAGTAGTCCCACAAATGGAGAAAGAGAGACGTTTGGAGCAAATCCTTAGGTCACAAG 2128
Query 2135 AACGAGGTTCAAAAGTTATAATATTTTGCTCCACGAAGAGGCTTTGTGACCATCTTGCAC 2194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129 AACGAGGTTCAAAAGTTATAATATTTTGCTCCACGAAGAGGCTTTGTGACCATCTTGCAC 2188
Query 2195 GTAGTGTCGGACGTCATTTTGGCGCTGTTGTGATCCATGGAGACAAGACTCAAGGTGAGA 2254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2189 GTAGTGTCGGACGTCATTTTGGCGCTGTTGTGATCCATGGAGACAAGACTCAAGGTGAGA 2248
Query 2255 GAGATTGGGTACTTAGCCAGTTCCGAAGCGGGAAGTCTTGTATATTGATAGCTACTGATG 2314
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
Sbjct 2249 GAGATTGGGTGCTTAACCAGTTCCGAAGCGGGAAGTCTTGTGTACTGATAGCTACTGACG 2308
Query 2315 TTGCTGCCCGAGGACTCGATATAAAAGACATAAGAGTTGTGATCAACTATGATTTTCCAA 2374
|||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2309 TTGCTGCCCGGGGACTCGACATAAAAGACATACGAGTTGTGATCAACTACGATTTTCCAA 2368
Query 2375 CTGGAGTTGAAGACTATGTCCACCGTATTGGGAGAACCCGGTCGAGCTGGTGCAACTGGA 2434
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CTGGAGTTGAAGACTATGTCCACCGTATTGGGAGAACC-GGTCGAGCTGGTGCAACTGGA 2427
Query 2435 GTTGCATTCACTTTCTTTACAGAGCAAGATTGGAAGTACGCACC-GAAATGATCAAAGTC 2493
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 2428 GTTGCATTCACTTTCTTTACAGAGCAAGATTGGAAATACGCACCTGATTTGATCAAAGTC 2487
Query 2494 CTGGAAGGAGCGAACCAGCAAGTACCGCCTCAAGTAAGGGACATTGCAATGCgtggtggt 2553
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2488 CTGGAAGGAGCGAACCAGCAAGTACCGCCTCAAGTAAGAGATATTGCAATGCGTGGTGGT 2547
Query 2554 ggtggtggt---CCTGGTTATAGCCAGGATCGAAGAGGTATGGTAAACCGGTTTGACTCT 2610
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2548 GGTGGTGGTGGTCCCGGTTATAGCCAGGATCGAAGAGGTATGGTTAACCGGTTTGACTCT 2607
Query 2611 GGCGGTAATGGTAGCCGTTGGGATTCTGCTGAtgggtttggtgggcgcggtggtgggttt 2670
|||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2608 GGCGGTGGTGGTACCCGTTGGGATTCTGGTGGTGGGTTTGGTGGGCGTGGTGGTGGGTTT 2667
Query 2671 ggtgggcgtgagggtggatttggtgggcgtgagggtgggtttggtgggc-gtgagggtgg 2729
|||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||
Sbjct 2668 AGTGGCCGTGAGGGTGGGTTTGGAGGCCGTGAGGGTGGATTTGG-GGGCCGTGAGGGTGG 2726
Query 2730 gtttggtgggcgtgagggtggatttgg 2756
||||| || |||| ||| |||||||
Sbjct 2727 ATTTGGAGGCCGTGGGGGAAGATTTGG 2753
Score = 1205 bits (652), Expect = 0.0
Identities = 874/972 (90%), Gaps = 51/972 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 2683 ggtggatttggtgggcgtgag-ggtgggtttggtgggcgtgagggtgggtttggtgggcg 2741
||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2638 GGTGGGTTTGGTGGGCGTG-GTGGTGGGTTTAGTGGCCGTGAGGGTGGGTTTGGAGGCCG 2696
Query 2742 tgagggtggatttggtggg-cgtgagggtgggtttggtggccgtagtggcGGATTTGGAA 2800
||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||
Sbjct 2697 TGAGGGTGGATTTGG-GGGCCGTGAGGGTGGATTTGGAGGCCGTGGGGGAAGATTTGGAA 2755
Query 2801 TGAGAGATGACTCATTTGGACGTGGCGGGAATCGTGGTCGGGGTTTTAGTGGTCCTGATG 2860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2756 TGAGAGATGACTCATTTGGACGTGGCGGGAATCGTGGTCGGGGTTTTACTGGTCCTGATG 2815
Query 2861 CTGGTCATATGAATGTGGGTGGTAGAGGCGGATTTGGTCGGTTTGGCAATAATAATA-T- 2918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2816 CTGGTCATATGAATGTGGGTGGTAGAGGCGGATTTGGTCGGTTTGGCAATAATAATAATA 2875
Query 2919 -GGATG-GCCGTGGCTTTGGTCGTGGT-G-G-TAGAGGCTTTGGTCGTGGTGTTGGACGG 2973
||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876 TGGA-GAGCCGAGGCTTTGGTCGTGGTAGTGGTAGAGGCTTTGGTCGTGGTGTTGGACGG 2934
Query 2974 TTTGACAACAGAAGAGGTAGAAGTCGTAGCAGAAGTCCTGATTTGGTTCGGCCACGGCGG 3033
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 TTTGACAACAGAAGAGGTAGAAGTCGCAGCAGAAGTCCTGATTTGGTTCGGCCACGGCGC 2994
Query 3034 CGTAGCCCGAGCTATAGCCGGAGTCGAAGCCGGAGC------TATAGTCGTAGCCGTAGC 3087
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2995 CGTAGCTCGAGCTATAGCCGGAGTCGAAGCCGGAGCGGGAGCTATAGTCGTAGCCGTAGC 3054
Query 3088 ---AG--G-AGCTGGTCACGTTCAAGGAGTCGTAGCCCTAGACATAGCCGTGACCGTGGT 3141
|| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3055 CGTAGCAGGAGCTGGTCACGTTCAAGGAGTCGCAGCCCTAGACATAGCCGTGACCGAGGT 3114
Query 3142 GGTCATAACCGGAGCAGAAGCTATAGCCGTAGTCCTAGTCCGGTTTATGAAAGACGAGAT 3201
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 GGTCATAACAGGAGCAGAAGCTATAGCCGTAGTCCTAGTCCGGTTTATGAAAGACGAGAT 3174
Query 3202 AGACCGCCACGTGTTTCAGGGTTTGATATTAAACCACCAGTTGAGTCTGTAGTGAACCTG 3261
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3175 AGAGCGCCACGTGTTTCTGGGTTTGATATTAAACCACCAGTTGAATCTGTAGTGAACCTG 3234
Query 3262 GACATGAATGCCGCGGCAGCGTTTGAAA-CTGCGGTTCCTACGTCCTTGTCTGAGAGACA 3320
||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3235 GACATGAATGCCGCGGCAGCGATTGAAAAC-GTGGTTCCTACATCCTTGTCTGAGAGACA 3293
Query 3321 AGGGAATGGGGTTGTTGAATCGGAGGTAGAAGCTGCTTCAGCTTCAGTACGACCAGTAGT 3380
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||
Sbjct 3294 AGGGAATGGGGTTGTTGAATCGGAGGTAGAAGCGGCTT----T--AGTACGACCAGTGGT 3347
Query 3381 TGATGAACA-C--TAAAAGCCAAAACATAGAATGATATAAAACCTCACTAGTCACTAGGG 3437
||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||
Sbjct 3348 TGATGAAGAACCCTAAAA-CCAAATCATAGAATGATATAAATCCTCACTA--C----GG- 3399
Query 3438 AGATATCACCCA-CTCATCCCAAAAATTTTGGTTATTAAATGGATCCAGCAAATCAGACA 3496
||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||
Sbjct 3400 AGATATCACA-AGCTCACCCCAAATTTTTTGGGTATTGAATGGATTCACCAAATCAGACA 3458
Query 3497 GCTGATGCGTCTTCTCAGATTTGTTGGCTGGAG-tttctttgtttttcattttttaattt 3555
||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||
Sbjct 3459 GCTGACACGTCTTCTCAGATTTGTTGGCTG-AGGTTTCTTTATTTT-CATTTTTTTATTT 3516
Query 3556 tttttttCTCATTTTCTTGTTGTATCATGGAGGTTTAGTTTGTAATGTATTTGACAATTC 3615
|||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3517 TTTT---CTCATGTTCTTGTTGTATCATGGAGAATTAGTTTGTAATGTATTTGAGAATTT 3573
Query 3616 TTATCGTTTATG 3627
||||||||||||
Sbjct 3574 TTATCGTTTATG 3585
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 180600994800
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5