BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg478029
Length=4018
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G07100.1 | Symbols: ERMO2, SEC24A | Sec23/Sec24 protein tran... 6340 0.0
> AT3G07100.1 | Symbols: ERMO2, SEC24A | Sec23/Sec24 protein transport
family protein | chr3:2245164-2250699 REVERSE LENGTH=4096
Length=4096
Score = 6340 bits (3433), Expect = 0.0
Identities = 3862/4061 (95%), Gaps = 62/4061 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATTCCGTATCGAAAATCTTCTTCAGGTCAGACGATCTGAAGCCGATCGCTGTAGAATCA 60
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AATTCCGTATCGAAAATCTTCTTCGGGTCAGACGATCTGAAGCCGATCGCTGTAGAATCA 60
Query 61 GTTTCGTGCTGCGCAGTTTCTCGAGTTTCCTCTCACTTAAG-TCTTTCAGAAGGA-AATT 118
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || || ||||
Sbjct 61 GTTTCGTGCTCCGCAGTTTCTCGAGTTTCCTCTCACTTCAGATC-TTCATAA-GAGAATT 118
Query 119 CACTTACGGAGAGGGACTTTTTCGTAGACGATTCTCACTGGATTATCTATCACCTGGTAA 178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 119 CACTTACGGAGAGGGACTTTTTCGTAGACGATTCTCACTGGA-TATCTATCACCCGGTAA 177
Query 179 GATCGTCTTGCTCG--AA-AA-T---AA----TT--G-AA---AAGAAGGAACTGTGAAT 221
|||||||||||||| || || | || || | || || ||||||||||||||
Sbjct 178 GATCGTCTTGCTCGAAAAGAATTGAAAAGTTTTTAAGTAATTGAATAAGGAACTGTGAAT 237
Query 222 CGGAGGGGCTTA-GTTTTTGAAGAGATCTAAACCATCGTACAAGATCGT-CTCAAATATC 279
||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 238 CGGAGAGGCTTACTTTTTTGAAAAGATCTAAACCATCGTAGAAGATCGTCCTCAAATATC 297
Query 280 TGTTGTTGACAGAAGTTACCAATTTTGATTAGATCACTTGAGAAAGCTACGGATTGACAG 339
| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||
Sbjct 298 ------TCACAGAAGTTACCAATTTTGA-AAGATCACTAGAGATAGCTACGGATTTTGAG 350
Query 340 AGGCGGATCTGTCCAGGTCGGCACTGTGAAAGAGAACTACACTAGtttttttCAAGAGGA 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||
Sbjct 351 AGGCGGATCTGTCCAGGTCGGCACTGTGAAAGAGAACTACACT-GGTTTTTTCCAGATGA 409
Query 400 TATGAAGCTTCCGTGAATGAATCTGATTCT-AGGTACTCATTGAAGAGAATCTGGGATTG 458
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 410 TATGAAGCTTCCGTGAACGAATCTGATTCTAAGGTACTCATCGAAGAGAATCTGGGATTG 469
Query 459 TATTGATCTGGTCCCTTTGCTTCCTGTTTGGCTATAACTTTGACAAGTGTTGTAGGTGAT 518
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||
Sbjct 470 TATTGATCTGGTCCCTTAGCTTCCAGTTTGGCTATAACTCTGACAACTGTTGTAAGTGAT 529
Query 519 AAGTTGTGATCAATAATGGGTACGGAGAATCAGGGCTATCCAAATTTTCCTGCTAGACCT 578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 530 AAGTTGTGATCAATAATGGGTACGGAGAATCAGGGCTATCCAAATTTTCCAGCTAGGCCT 589
Query 579 GCCTCCTCTCCATTCGCATCTGCTCCGCCACCAGGGATTCCTCCTCAATCCGGTGGACCA 638
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 590 GCTTCCTCTCCATTTGCATCTGCTCCGCCACCAGGGATTCCTCCTCAATCAGGTGGACCA 649
Query 639 CCCATTGGATCAGAGGCGGTTGGCTTTAGACCTTTTACACCATCTGCATCCCAACCTACA 698
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 CCCACTGGATCAGAGGCGGTTGGCTTTAGACCTTTTACACCATCTGCATCCCAACCTACA 709
Query 699 AGACCTTTCACAGCTTCTGGTCCTCCTCCGGCTCCACCAGTGGGTGCGATGAGGCCTGGC 758
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 710 AGACCTTTCACTGCCTCTGGTCCTCCTCCGGCTCCACCAGTGGGTACGATGAGGCCTGGC 769
Query 759 CAGCCTTCTCCTTTTGTTTCTCAGATTCCAGGGAGTAGACCTCCACCGCCATCATCGAAT 818
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 770 CAGCCGTCTCCTTTTGTTTCTCAGATTCCTGGGAGTAGACCTCCACCGCCATCATCAAAT 829
Query 819 TCATTTCCTTCTA-CAGCATATGGTCCTCCTGGTGGTGCCTCTTTTCAGCGTTATCCATC 877
|| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 830 TCGTTTCCTTC-ACCAGCATATGGTCCTCCTGGTGGTGCCCCTTTTCAGCGTTTTCCATC 888
Query 878 CCCGCAATTCCCGACTACACAAAACCCTCCTCAGGGTCCACCACCACCTCAAACTCTTGC 937
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCGCCATTCCCGACTACACAAAACCCTCCTCAGGGCCCACCACCACCTCAAACTCTTGC 948
Query 938 AGGTCACTTATCTCCTCC-ACCGTCTCTTCGCCCACAGCAACCGATGGCACCTGTAACAA 996
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 949 AGGTCACTTATCTCCTCCTA-TGTCTCTTCGCCCACAGCAACCGATGGCACCTGTAGCAA 1007
Query 997 TGGGACCTCCTCCACAAAGTATGACTTCTGGGCTACCTGGAGCAAATGCTTCTCCCCCTG 1056
|||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1008 TGGGGCCTCCGCCACAAAGTACGACTTCTGGGCTACCTGGAGCAAATGCTTATCCCCCTG 1067
Query 1057 CTACAGATTATCATATGCCTGCCAGGCCTGGTTTTCAACAGTCGATGGCTCCAGTTACTC 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1068 CTACAGATTATCATATGCCTGCCAGGCCTGGTTTTCAACAGTCAATGCCTCCAGTTACTC 1127
Query 1117 TGTCTTATCCTGGCGTGGGCGGTTTACAGCCATCTTTTCCTGGTTATCCCAGCAAGCA-G 1175
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1128 CGTCTTATCCTGGCGTGGGCGGTTCGCAGCCATCTTTTCCTGGTTATCCTAGCAAGCAGG 1187
Query 1176 -----CAGGCTCCAATGCCATTCCAGACATCTCAAGGTCCCCCGGGACCCCCTCCAATCT 1230
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1188 TCTTACAGGCTCCGACGCCATTCCAGACATCTCAAGGTCCCCCAGGACCCCCTCCAGTCT 1247
Query 1231 CATCATATCCTCCTCACACAGGAGGTTTTGCTCAGCGCCCAAATATGGTAGCACAGCAGA 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 1248 CATCATATCCTCCTCACACAGGAGGTTTTGCTCAGCGACCAAATATGGCAGCACAGCAGA 1307
Query 1291 ATCTACATCCAAGCTATGCACCTCCTCCCAGTAACGTACAAGGCTTGACTGAAGATTTTA 1350
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 ATCTGCATCCAAACTATGCACCTCCTCCCAGTAACGTTCAAGGCTTGACTGAAGATTTTA 1367
Query 1351 ACTCGCTATCTCTTTCATCTATTCCTGGATCGCTGGAACCAGGACTTGATCATAAATCAT 1410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 ACTCGCTATCTCTTTCATCTATTCCTGGATCGCTGGAACCAGGACTTGATCATAAATCAT 1427
Query 1411 TCCCAAGGCCATTGGATGGTGATGTGGAGCCAAGTTCATTTGCTGAAATGTACCCAATGA 1470
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 TCCCAAGGCCATTGGATGGTGACGTGGAGCCAAATTCATTTGCTGAAATGTACCCAATGA 1487
Query 1471 ATTGCCATTCTAGATATCTACGACTGACGACTAGTGCTATACCAAATTCCCAGTCTCTGG 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 ATTGCCATTCTAGATATCTACGACTGACGACTAGTGCTATACCAAATTCCCAGTCTCTGG 1547
Query 1531 CTTCGAGGTGGCATTTACCTCTAGGAGCTGTGGTTTGTCCACTTGCCGAGACTCCTGAAG 1590
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1548 CTTCAAGGTGGCATTTACCTCTAGGAGCTGTGGTTTGTCCACTTGCTGAGACTCCTGAAG 1607
Query 1591 GGGAGGAGGTACCACTTATTGATTTTGGCTCAACCGGCATCATCCGCTGCAGAAGATGCC 1650
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 GGGAGGAGGTACCACTTATTGATTTTGGCTCAACTGGCATCATCCGCTGCAGAAGATGCC 1667
Query 1651 GTACCTATGTGAATCCTTATGTGACTTTCACAGATTCTGGAAGAAAGTGGCGGTGTAATA 1710
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 GTACCTATGTGAATCCTTTTGTGACTTTTACAGATTCTGGAAGAAAGTGGCGGTGTAATA 1727
Query 1711 TATGTTCTATGCTTAATGATGTACCTGGTGAATACTTCTCACATTTGGATGCTACTGGCC 1770
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 TATGTTCGATGCTTAATGATGTGCCTGGTGAATACTTCTCACATTTGGATGCTACTGGCC 1787
Query 1771 GAAGAATGGATATGGATCAACGACCTGAGCTGACTAAGGGCAGTGTTGAAATCATTGCTC 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1788 GAAGAATGGATATGGATCAACGACCTGAGCTGACTAAAGGCAGTGTTGAAATCATAGCTC 1847
Query 1831 CAACTGAATACATGGTCCGGCCTCCGATGCCACCTATCTACTTCTTCCTCATTGATGTTT 1890
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CAACTGAATACATGGTTCGGCCTCCGATGCCACCTATCTACTTCTTCCTCATTGATGTTT 1907
Query 1891 CGATTTCAGCTACTAAAAGTGGGATGCTTGAGGTTGTTGCTCAAACGATTAAGTCGTGTT 1950
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1908 CGATTTCGGCTACTAAAAGTGGAATGCTTGAGGTTGTTGCTCAAACGATTAAGTCTTGTT 1967
Query 1951 TGGATAACCTGCCTGGTTATCCCAGAACTCAAATTGGATTTATTACTTATGACAGCACGT 2010
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 TGGATAACCTGCCTGGTTATCCAAGAACTCAAATTGGATTTATTACTTATGACAGCACGT 2027
Query 2011 TACATTTTTACAACATGAAGTCATCTTTGAGCCAGCCGCAGATGATGGTTGTATCGGATC 2070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2028 TACATTTTTACAACATGAAGTCATCTTTGAGCCAGCCGCAGATGATGGTTGTATCAGATC 2087
Query 2071 TAGATGATATATTTGTCCCATTGCCAGATGATCTCCTTGTCAATCTATCTGAATCTAGAA 2130
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2088 TAGATGATATCTTTGTCCCATTGCCAGACGATCTGCTTGTAAATCTATCTGAATCTAGAA 2147
Query 2131 CTGTGGTGGAAGCCTTTTTGGACAGTCTACCTTTGATGTTTCAAGATAATGTCAATGTGG 2190
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2148 CTGTGGTGGACGCCTTTTTGGACAGTCTACCTTTGATGTTTCAAGATAATTTCAATGTGG 2207
Query 2191 AATCGGCTTTTGGCCCAGCTCTCAGAGCGGCATTTATGGTTATGAACCAACTTGGGGGCA 2250
|||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 AATCAGCTTTTGGCCCAGCCCTCAGAGCGGCGTTTATGGTTATGAACCAACTTGGGGGCA 2267
Query 2251 AGTTGCTAATTTTCCAGAACTCGTTACCTTCTCTTGGTGCTGGGCGGTTAAAGTTGCGGG 2310
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2268 AGTTACTAATTTTCCAGAACTCATTACCTTCTCTTGGTGCTGGGAGGTTAAAGTTGCGGG 2327
Query 2311 GAGATGATCCTCGTGTCTATGGAACGGACAAAGAATATGCATTAAGGGTAGCTGAAGATC 2370
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328 GAGATGATCCTCGTGTCTATGGAACTGACAAAGAATATGCATTAAGGGTAGCTGAAGATC 2387
Query 2371 CCTTCTACAAGCAAATGGCTGCCGATTGTACCAAGTTCCAGATAGGAATTAATGTTTATG 2430
||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 CCTTCTATAAACAAATGGCTGCTGATTGTACCAAGTTCCAGATAGGAATTAATGTTTATG 2447
Query 2431 CATTCAGTGATAAGTACACTGATATTGCCTCCTTAGGGACTCTGGCAAAATACACTGGAG 2490
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 CATTCAGTGATAAGTACACTGATATTGCCTCATTAGGGACTCTGGCAAAATACACTGGAG 2507
Query 2491 GACAGGTGTACTATTATCCAGGTTTCCAATCATCTGTTCATGGAGATAAGTTAAGACACG 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 GACAGGTGTACTATTATCCAGGTTTCCAATCATCTGTTCATGGAGATAAGTTAAGACACG 2567
Query 2551 AGCTGGCTAGAGACCTTACAAGGGAAACTGCGTGGGAGGCGGTTATGCGAATAAGATGTG 2610
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2568 AGCTTGCTAGAGACCTTACAAGGGAAACTGCGTGGGAGGCGGTTATGCGAATAAGATGTG 2627
Query 2611 GAAAAGGAATTCGTTTCTCGTCCTACCATGGGAACTTCATGCTAAGGTCTACTGACCTGC 2670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 GAAAAGGAATTCGTTTCTCGTCCTACCATGGGAACTTCATGCTAAGGTCTACTGACCTGC 2687
Query 2671 TTGCTCTTCCTGCTGTTGACTGTGACAAAGCGTATGCAATGCAGCTATCTCTTGAGGAGA 2730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 TTGCTCTTCCTGCTGTTGACTGTGACAAAGCGTATGCAATGCAGCTATCTCTTGAGGAGA 2747
Query 2731 CATTGCTAACATCCCAGACTGTATATTTCCAAGTGGCTTTGCTATATACTGCCTCTTGCG 2790
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2748 CTTTGCTAACATCCCAGACTGTGTATTTCCAAGTGGCTTTGCTATATACCGCCTCTTGTG 2807
Query 2791 GAGAGAGACGTATAAGGGTACACACATCTGTTGCACCAGTGGTTACAGATCTTGGGGAGA 2850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 GAGAGAGACGTATAAGGGTACACACATCTGTTGCACCAGTGGTTACAGATCTTGGGGAGA 2867
Query 2851 TGTATAGACAAGCAGACACTGGTTCCATTGTGTCTTTATATGCTAGATTAGCAATTGAGA 2910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 TGTATAGACAAGCAGACACTGGTTCCATTGTGTCTTTATATGCTAGATTAGCAATTGAGA 2927
Query 2911 AATCTTTGTCCGCAAAATTGGATGATGCACGGAATGCAATACAGCAAAAGATTGTTAAAG 2970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928 AATCTTTGTCCGCAAAATTGGATGATGCACGGAATGCAATACAGCAAAAGATTGTTAAAG 2987
Query 2971 CCCTCAAAGAATATCGTAATCTTCACGCGGTGCAGCATCGCTTGGGGTCCAGATTAATAT 3030
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2988 CCCTCAAAGAATATCGTAATCTTCACGCGGTGCAGCATCGCTTGGGGTCCAGATTAGTAT 3047
Query 3031 ACCCAGAGTCTCTGAAGTTCTTGCCATTGTACGGATTGGCAATTACTAAGTCCACTCCTC 3090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3048 ACCCAGAGTCTCTGAAGTTCTTGCCATTGTACGGATTGGCAATTACTAAGTCCACTCCTC 3107
Query 3091 TTCTAGGTGGGCCTGCTGATACTTCTCTTGATGAGCGCTGTGCTGCAGGCTTCACCATGA 3150
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 TTCTAGGTGGACCTGCTGATACTTCTCTTGATGAGCGCTGTGCTGCAGGCTTCACCATGA 3167
Query 3151 TGGCTCTGCCTGTCAAAAAGCTATTGAAGCTTTTGTATCCCAATTTATTCCGTGTTGACG 3210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 TGGCTCTGCCTGTCAAAAAGCTATTGAAGCTTTTGTATCCCAATTTATTCCGTGTTGACG 3227
Query 3211 AATGGCTCTTAAAGCCATCAATAGACCACGATGACTTTAAGGACGTATTAAGGAGATTGC 3270
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3228 AATGGCTCTTAAAGCCATCAGCAGCCCACGATGACTTTAAAGACGTATTAAGGAGATTGC 3287
Query 3271 CTCTGGCTGCAGAGAGTTTGGATTCTAGAGGCCTTTACATATATGATGATGGTTTTCGAT 3330
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3288 CGCTGGCTGCAGAGAGTTTGGATTCTAGAGGCCTTTACATATATGATGATGGTTTTCGAT 3347
Query 3331 TAGTTTTGTGGTTTGGCCGGATGCTTTCACCTGACATTGCTAAAAATCTTCTTGGGGGTG 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3348 TAGTTTTGTGGTTTGGCCGGATGCTTTCACCTGACATTGCTAAAAATCTTCTTGGGGTTG 3407
Query 3391 ACTTTGCAGCAGAGCTCTCAAGGGTTACCTTTCAAGAGCAAGAGAATGGGATGTCGAAGA 3450
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3408 ACTTTGCAGCAGACCTCTCAAGGGTTACCTTTCAAGAGCAAGAGAATGGGATGTCAAAGA 3467
Query 3451 AGCTAATGAGGTTGGTAAAGAAACTGAGGGAGAGTGATCCTTCATATCACCCCATGTGTT 3510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3468 AGCTAATGAGGTTGGTAAAGAAACTGAGGGAGAGTGATCCTTCATATCACCCCATGTGTT 3527
Query 3511 TTCTAGTGAGACAAGGAGAACAACCCCGAGAAGGCTTCCTTCTCCTCAGAAATCTCATTG 3570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3528 TTCTAGTGAGACAAGGAGAACAACCCCGAGAAGGCTTCCTTCTCCTCAGAAATCTCATTG 3587
Query 3571 AGGACCAGATGGGCGGTTCGAGTGGTTATGTTGATTGGATTCTACAACTTCACCGCCAAG 3630
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3588 AGGACCAGATGGGCGGTTCGAGTGGTTATGTCGATTGGATTCTACAACTTCACCGCCAAG 3647
Query 3631 TTCAACAAAACTAAGATAGCTCACAATG-CAACTCTTGGATGCCAGGATGC-ACCTCTTT 3688
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||
Sbjct 3648 TTCAACAAAACTAAGATAGCTCACAATGACAACTCG-GG-TGCTAGGATGCCACCTCTTT 3705
Query 3689 GTAACCAT-GAAGAACTCTTGAGCTCAAAAATCTTCTACTTAAGCAGGATCATGGCGGCC 3747
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3706 GTAACCATTGAAGAACTCTTGAGCTCAAAAATCTTCTACTTAAGCAGGATCATGGCGGCC 3765
Query 3748 TGCTTCCTTGGGCGTTAATGTGTTGTTTTGaaaaaaaGAAGTGCTA-TTTT-GATTTTTC 3805
| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 3766 TTCTTCCTTGGGCCATAATGTGTTGTTTTGGATAAA-GAAGTGCTACTTTTTGATTTTTC 3824
Query 3806 TTCATTTATTTT-CTGTA--GACCTTTTC-CTCAAG-TCTAGGCTTTTATTTGCCTAACC 3860
||||||| |||| || || |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3825 TTCATTTGTTTTTCTATATAGACCTTTTTTCTCAAGAT-TAGGCTTTTATTTGCCTAACC 3883
Query 3861 AGAATGGTTTTGTCCCATAAGATTAGTCGttttttaa-tcttttattgcctttttttttg 3919
||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 3884 AGAATGGTTATCTCCG-TAAGATTAGTCGTTTTTTAAATCTTTTGTTGCCTTTTTTTTTT 3942
Query 3920 gttctctttcgaattttttGTTGTTGTGCGTCTGTACTAGATTTATTTTGGGAGTTACAG 3979
|| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3943 GTCCTCATTCGA-TTTTTTGTTGATGTGCGTCTGTTCTAGATTTATTTTGGGAGTTGCAG 4001
Query 3980 TTCATGAATCT--CGTAATTAGGGTTATTAACAAGAAAATG 4018
||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4002 TTCATGAATCTGTCCTAATTAGGGTTATTAACAAGAAGATG 4042
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 200216269513
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5