BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg478201
Length=1870
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G08943.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3... 3066 0.0
AT3G08947.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3... 3033 0.0
> AT3G08943.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3:2718880-2722624
REVERSE LENGTH=3167
Length=3167
Score = 3066 bits (1660), Expect = 0.0
Identities = 1802/1872 (96%), Gaps = 4/1872 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 ATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAG 941
Query 61 ATCAGACAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCTATTGCGTCCACATACTACGAGGTGCTG 120
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 942 ATCAGGCAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCCATTGCATCCACATACTATGAGGTGCTG 1001
Query 121 GAGCAATACATGCCAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAG 180
||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 GAGCACTACATACAAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAG 1061
Query 181 AGTGTTGCCCTCCAAGCAATTGAGTTTTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATTGACCGT 240
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1062 AGCGTTGCCCTCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGACCGT 1121
Query 241 CAAGAGTATGACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 CAAGAGTATGACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAG 1181
Query 301 AAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 AAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGAT 1241
Query 361 CAGGACCATGACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 CAGGACCATGACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTG 1301
Query 421 GTTGCCAGAACGGTTGGAGATGGTATAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGaaaaaaaC 480
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 GTTGCTAGAACGGTTGGAGATGGTGTAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGAAAAAAAC 1361
Query 481 ATAAGTTCGCCAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 ATAAGTTCGCCAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTG 1421
Query 541 GAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTCCTCCTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1422 GAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTAGCTGCTGGCTTGGAATTTCTCCTT 1481
Query 601 AATGCAACCAAGGATGGGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGT 660
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 AATGCAACCAAGGATCAGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGT 1541
Query 661 ATCTTTGAATTTTTGC-ACTCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCT 719
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542 ATCTTTGAATTTTTGCCA-TCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCT 1600
Query 720 CCCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 CCCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAA 1660
Query 780 GGTCTGCGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAACTCCTC 839
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1661 GGTCTGTGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAGTTCCTC 1720
Query 840 TCTTCTCTCTCCTTATCTCACAGAAATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCGTAC 899
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1721 TCTTCTCTCTCCTTATCTTACAGAGATCATCACACATCTCCTTGCAGCTGCTGAGCGTAC 1780
Query 900 AGATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAATGAGGTTGTCCG 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1781 AGATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAACGAGGTTGTCCG 1840
Query 960 GTGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCGAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAA 1019
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 GTGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCAAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAA 1900
Query 1020 AAAATTAGCTGAAACTATGGACCTCCCGATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAACAGGC 1079
|||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1901 AAAATTAGCTGAGACAATGGACCTCCCTATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAGCAAGC 1960
Query 1080 AGAACTCCAGGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGTGGCAG 1139
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1961 GGAACTCCAGGCGTCTCTGTGCGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGCAGCAG 2020
Query 1140 GGAGGATACAAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATGACATCATGAGGCTGTTCTTAAG 1199
||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||
Sbjct 2021 GGACGATATGAAACCTATCATAGTGCAAAACGCAGATGACATCATGAGGTTATTCCTAAG 2080
Query 1200 AGTGTTTGGATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCT 1259
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 AGTGTTTGGTTGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCT 2140
Query 1260 TGCCTATGCAACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCTCCA 1319
||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2141 TGCCTATGCGACTGGAACTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTTAAATATCTCCA 2200
Query 1320 GATGGGGCTGCAGAACTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGG 1379
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2201 GATGGGGCTGCAGAATTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGG 2260
Query 1380 TGACATATGCCGTGC-CTTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGGTC 1438
||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2261 TGACATATGCCGTGCGCT-GGATGAAAAAATCCTACCCTTTTGCGATCAGATAATGGGTC 2319
Query 1439 TCCTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATGTTCT 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2320 TCCTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATCTTCT 2379
Query 1499 CATGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTCGAAAGGTATGTTGCTCCAG 1558
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2380 CATGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTTGAAAGGTATGTAGCTCCAG 2439
Query 1559 CCGTTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGG 1618
| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 CTGTTCAGATAATGCAAGGTGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGG 2499
Query 1619 AGCTTATGGATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGAATAC 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2500 AGCTTATGGATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGGATAC 2559
Query 1679 TACAGGGGTTCAAGGATACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTCTTGC 1738
| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2560 TGCAAGGGTTCAAGGATGCAAAGGCTGAGCTCATGATGCCCTATGCTCAACATCTGTTGC 2619
Query 1739 AGTTTGTTGAACTAGTATCCAAAGATTCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCACGG 1798
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2620 AGTTTGTTGAACTAGTATCCAAAGATTCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCGCGG 2679
Query 1799 TTGCAGCAATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGGGAGAACACGAAGCAGCTGTTCAAAA 1858
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2680 TTGCAGCAATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGGGAGAACACGAAGCAGTTGTTCCAAA 2739
Query 1859 ACTTCACCTTCT 1870
||||||||||||
Sbjct 2740 ACTTCACCTTCT 2751
> AT3G08947.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3:2723289-2726942
FORWARD LENGTH=3026
Length=3026
Score = 3033 bits (1642), Expect = 0.0
Identities = 1794/1870 (96%), Gaps = 0/1870 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 ATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAG 892
Query 61 ATCAGACAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCTATTGCGTCCACATACTACGAGGTGCTG 120
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 893 ATCAGGCAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCCATTGCATCCACATACTATGAGGTGCTG 952
Query 121 GAGCAATACATGCCAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAG 180
||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 GAGCACTACATACAAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAG 1012
Query 181 AGTGTTGCCCTCCAAGCAATTGAGTTTTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATTGACCGT 240
|| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1013 AGCGTTTCCCTCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGACCGT 1072
Query 241 CAAGAGTATGACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAG 300
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1073 CAAGAGTATGACAGTCCTGCTAGTGGTGACTCATCTCCTCCCCACTCCTCTTTCATAGAG 1132
Query 301 AAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 AAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGAT 1192
Query 361 CAGGACCATGACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTG 420
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 CAGGACCATGATGACGACGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTG 1252
Query 421 GTTGCCAGAACGGTTGGAGATGGTATAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGaaaaaaaC 480
||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GTTGCCAGAACAGTTGGAGATCATGTAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGAAAAAAAC 1312
Query 481 ATAAGTTCGCCAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTG 540
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 ATAAGTTCGCCAGATTGGCGCTGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTG 1372
Query 541 GAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTCCTCCTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1373 GAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTTCTCCTT 1432
Query 601 AATGCAACCAAGGATGGGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGT 660
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 AATGCAACCAAGGATCAGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGT 1492
Query 661 ATCTTTGAATTTTTGCACTCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCTC 720
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 ATCTTTGAATTTTTGCACTCCCCAGACAGTGGTTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCTC 1552
Query 721 CCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAAG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAAG 1612
Query 781 GTCTGCGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAACTCCTCT 840
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1613 GTCTGTGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAGTTCATCT 1672
Query 841 CTTCTCTCTCCTTATCTCACAGAAATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCGTACA 900
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 CTTCTCTCTCCTTATCTTACAGAGATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCGTACA 1732
Query 901 GATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAATGAGGTTGTCCGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1733 GATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAACGAGGTTGTCCGG 1792
Query 961 TGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCGAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAAA 1020
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 TGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCAAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAAA 1852
Query 1021 AAATTAGCTGAAACTATGGACCTCCCGATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAACAGGCA 1080
||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1853 AAATTAGCTGAGACAATGGACCTCCCTATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAGCAAGCG 1912
Query 1081 GAACTCCAGGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGTGGCAGG 1140
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1913 GAAGTCCAGGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTTATAATCCAGAAGCTGAGCGGCAGG 1972
Query 1141 GAGGATACAAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATGACATCATGAGGCTGTTCTTAAGA 1200
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 1973 GAGGATACGAAACCCATCATAATGCAGAGCGCAGATGACATTATGAGGCTGTTCCTAAGA 2032
Query 1201 GTGTTTGGATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCTT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 GTGTTTGGATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCTT 2092
Query 1261 GCCTATGCAACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCTCCAG 1320
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 GCATATGCTACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCTCCAG 2152
Query 1321 ATGGGGCTGCAGAACTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGGT 1380
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 2153 ATGGGGCTGCAGAATTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACAGTAGGAGTGCTTGGT 2212
Query 1381 GACATATGCCGTGCCTTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGGTCTC 1440
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 GACATTTGCCGTGCCCTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGGTCTC 2272
Query 1441 CTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATGTTCTCA 1500
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 2273 CTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGGGCACTCCACAGATCAGTGAAGCCTCCAATATTCTCA 2332
Query 1501 TGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTCGAAAGGTATGTTGCTCCAGCC 1560
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct 2333 TGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCAATTGGTGCTCATTTTGAAAGGTATGTAGCACCAGCC 2392
Query 1561 GTTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGGAG 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2393 GTTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCTCAGATGGATACCCTTGACGAGGAG 2452
Query 1621 CTTATGGATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGAATACTA 1680
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2453 CTTATGGATTATGCAAACCAACTGCGGAGAAGCATCTTTGAGGCATACTCCGGGATACTA 2512
Query 1681 CAGGGGTTCAAGGATACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTCTTGCAG 1740
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2513 CAAGGGTTCAAGGACACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTCCTGCAG 2572
Query 1741 TTTGTTGAACTAGTATCCAAAGATTCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCACGGTT 1800
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2573 TTTGTTGAACTAGTATCCAAAGATCCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCGCGGTT 2632
Query 1801 GCAGCAATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGGGAGAACACGAAGCAGCTGTTCAAAAAC 1860
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||
Sbjct 2633 GCAGCGATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGAGAGAACACAAAGCAGTTGTTCCAAAAC 2692
Query 1861 TTCACCTTCT 1870
||||||||||
Sbjct 2693 TTCACCTTCT 2702
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 92569804980
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5