BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg478202
Length=2976
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G08947.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3... 4473 0.0
AT3G08943.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3... 4239 0.0
> AT3G08947.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3:2723289-2726942
FORWARD LENGTH=3026
Length=3026
Score = 4473 bits (2422), Expect = 0.0
Identities = 2805/2985 (94%), Gaps = 46/2985 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTCTCTCTCCTTCGACAGTTTCAAGT--AGtctctctctctctctctGCAAACTCTAGG 58
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTCTCTCTCCTTCGACAGTTTCAAGTACAGACTCTCTCTCTGTCTCTGCAAACTCTAGG 60
Query 59 GTTTTTCTCCTGAGGTTTTTGCTCTTCTTCAAGAAGCTTTTTGTGGATAGAATCTTCAGT 118
| | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 G----T-T--T--GGTTTTTGCTCTTCTTCGAGAAGCTTTTTGTGGATAGAATCTGCAGT 111
Query 119 GAGAGGGACGTGGTGTTTAAATTGAAGCGAAAAACCCTAGCGTTTACTCAAGCATTGATT 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||
Sbjct 112 GAGAGGGACGTGGTGTTTAAATTGAAGCGAAAAACCCTAGCGTTTACGCAAACCTTAATT 171
Query 179 TCCATAGAGAAGAATGGCTATGGAGATCACACAGTTCCTACTGGCTGCTCAGTCAGCTGA 238
|||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||
Sbjct 172 TCCAGAGACCAGAATGGCGATGGAGATCACACAGTTTCTGTTGGCTGCCCAGTCAGCCGA 231
Query 239 TGCAAGAGTCCGTACTGAAGCAGAGGCTAGTCTCAGGCAGTTCCAAGAACAAAACTTGCC 298
|||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 232 TGCAAGAGTCCGGACTGAAGCAGAGGGTAATCTCAGGCAATTCCAAGAACAGAACTTGCC 291
Query 299 ACTGTTCTTATTATCCTTGTCTTTTGAGCTTGAGAACAATGATAAACCTGCTGAATCCCG 358
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GCTGTTCTTAGTATCCTTGTCTTTTGAGCTTGCCAACAATGATAAACCTGCTGAATCCCG 351
Query 359 TCGACTTGCTGGTATTCTGCTAAAGAATTCTCTTGACGCCAAAGATTCTGCCAGAAAAGA 418
|||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 352 TCGACTAGCCGGTATTCTGCTAAAGAATTCTCTGGACGCCAAAGATTCTGCCACAAAAGA 411
Query 419 TCATCTGGTGAAACAATGGTTTGCAATTGATGTTGCTCTTAAATCCCAGATCAAGGAACT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 412 TCATCTGGTGAAACAATGGTTTGCAATTGATGTTGCTCTTAAATCCCAGATCAAGGATC- 470
Query 479 G-TTAATGAGAACTCTTGGTTCTTCTGCCCTAGAGGCGAGGCATACTTCAGCTCAGGTTA 537
| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 GCTTACTAAGAACTCTTGGTTCATCTGCCCTAGAGGCAAGGCATACTTCAGCTCAGGTTA 530
Query 538 TTGCAAAGGTAGCCTCCATTGAAATTCCTCAGAAGCAGTGGCCTGAACTTGTTGGATCGT 597
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 TTGCTAAGGTAGCCTCCATTGAAATTCCTCAGAAGCAGTGGCCTGAACTTGTTGGATCGC 590
Query 598 TGCTTAACAATATGACCCAGCAAGGCAGTCCCGCACACTTGAAGCAATCAACGTTAGAAA 657
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 591 TGCTTAACAATATGACTCAGCAAGGCAGTCCCGCACACTTGAAGCAATCAACCTTGGAAA 650
Query 658 CTCTAGGCTATGTCTGTGAAGAGATATCACACCATGATCTTGTGCAAAATGAAGTGAATT 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 651 CTCTAGGCTATGTCTGTGAAGAGATATCACACCATGATCTTGTGCAAGATGAAGTGAATT 710
Query 718 CCGTCCTCACAGCAGTTGTGCAGGGCATGAACCAGTCTGAAAATACTGCAGAAGTTCGTC 777
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 711 CTGTCCTCACAGCAGTTGTGCAGGGCATGAACCAGTCTGAAAATACTGCTGAAGTTCGTC 770
Query 778 TTGCAGCAACAAAGGCACTGTTG-AATGCCCTGGATTTCTCTCAGACAAACTTTGAGAAT 836
| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 771 TCGCAGCAACAAAGGCACTG-TGTAATGCCTTGGATTTCTCTCAGACAAATTTTGAGAAT 829
Query 837 GAAATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCA 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 GAAATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCA 889
Query 897 GAGATCAGACAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCTATTGCGTCCACATACTACGAGGTG 956
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 890 GAGATCAGGCAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCCATTGCATCCACATACTATGAGGTG 949
Query 957 CTGGAGCAATACATGCCAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAA 1016
|||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 CTGGAGCACTACATACAAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAA 1009
Query 1017 GAGAGTGTTGCCCTCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGAC 1076
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 GAGAGCGTTTCCCTCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGAC 1069
Query 1077 CGTCAAGAGTATGACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATA 1136
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1070 CGTCAAGAGTATGACAGTCCTGCTAGTGGTGACTCATCTCCTCCCCACTCCTCTTTCATA 1129
Query 1137 GAGAAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAG 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 GAGAAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAG 1189
Query 1197 GATCAGGACCATGACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGC 1256
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 GATCAGGACCATGATGACGACGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGC 1249
Query 1257 CTGGTTGCCAGAACGGTTGGAGATGGTATAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGaaaaa 1316
|||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CTGGTTGCCAGAACAGTTGGAGATCATGTAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGAAAAA 1309
Query 1317 aaCATAAGTTCGCCAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATT 1376
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 AACATAAGTTCGCCAGATTGGCGCTGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATT 1369
Query 1377 TTGGAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTCCTC 1436
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1370 TTGGAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTTCTC 1429
Query 1437 CTTAATGCAACCAAGGATGGGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGC 1496
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1430 CTTAATGCAACCAAGGATCAGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGC 1489
Query 1497 CGTATCTTTGAATTTTTGCACTCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAAC 1556
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 CGTATCTTTGAATTTTTGCACTCCCCAGACAGTGGTTTCTCTGTTATATCACCCGAAAAC 1549
Query 1557 CTCCCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAG 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 CTCCCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAG 1609
Query 1617 AAGGTCTGCGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAAGTCC 1676
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1610 AAGGTCTGTGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAA-GTTC 1668
Query 1677 -TCTCTTCTCTCTCCTTATCTCACAGAAATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCG 1735
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 ATCTCTTCTCTCTCCTTATCTTACAGAGATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCG 1728
Query 1736 TACAGATGGGGCAGAGTCTAAACTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAATGAGGTTGT 1795
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1729 TACAGATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAACGAGGTTGT 1788
Query 1796 CCGGTGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCGAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCAT 1855
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 CCGGTGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCAAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCAT 1848
Query 1856 GAAAAAATTAGCTGAAACTATGGACCTCCCGATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAACA 1915
||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1849 GAAAAAATTAGCTGAGACAATGGACCTCCCTATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAGCA 1908
Query 1916 GGCAGAACTCCAGGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGTGG 1975
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1909 AGCGGAAGTCCAGGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTTATAATCCAGAAGCTGAGCGG 1968
Query 1976 CAGGGAGGATACGAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATGACATCATGAGGCTGTTCTT 2035
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1969 CAGGGAGGATACGAAACCCATCATAATGCAGAGCGCAGATGACATTATGAGGCTGTTCCT 2028
Query 2036 AAGAGTGTTTGGATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGC 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 AAGAGTGTTTGGATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGC 2088
Query 2096 TCTTGCCTATGCAACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCT 2155
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 TCTTGCATATGCTACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCT 2148
Query 2156 CCAGATGGGGCTGCAGAATTTTGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGAT 2215
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 2149 CCAGATGGGGCTGCAGAATTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACAGTAGGAGTGCT 2208
Query 2216 TGGTGACATATGCCGTGCCTTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGG 2275
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 TGGTGACATTTGCCGTGCCCTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGG 2268
Query 2276 TCTCCTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATGTT 2335
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2269 TCTCCTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGGGCACTCCACAGATCAGTGAAGCCTCCAATATT 2328
Query 2336 CTCATGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTCGAAAGGTATGTTGCTCC 2395
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 2329 CTCATGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCAATTGGTGCTCATTTTGAAAGGTATGTAGCACC 2388
Query 2396 AGCCGTTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGA 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2389 AGCCGTTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCTCAGATGGATACCCTTGACGA 2448
Query 2456 GGAGCTTATGGATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGAAT 2515
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2449 GGAGCTTATGGATTATGCAAACCAACTGCGGAGAAGCATCTTTGAGGCATACTCCGGGAT 2508
Query 2516 ACTACAGGGGTTCAAGGACACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTACT 2575
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2509 ACTACAAGGGTTCAAGGACACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTCCT 2568
Query 2576 GCAGTTTGTTGAGCTAGTATCCAAAGATCCCCTCAGGGATGAGAGTGTGACAAAAGCTGC 2635
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2569 GCAGTTTGTTGAACTAGTATCCAAAGATCCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCGC 2628
Query 2636 GGTTGCAGCAATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGAGAGAACACAAAGCAGGTGTTC-A 2694
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2629 GGTTGCAGCGATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGAGAGAACACAAAGCAGTTGTTCCA 2688
Query 2695 ACAACTTCACCTTCTTCGGTGAGTTCCTCAATGAGTGTCTCGAATCAGAGGATGAAGATC 2754
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2689 A-AACTTCACCTTCTTCGGTGAGTTCCTTAATGAGTGTCTCGAATCAGAGGATGAAGATC 2747
Query 2755 TCAAGGTTACTGCACGCTGGACTCAAGGAATGATCGCAAGGCTCATGCACTCATCATAAA 2814
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2748 TCAAGGTCACTGCACGCTGGACTCAAGGAATGATTGCAAGGCTCATGCACCCATCATAAA 2807
Query 2815 TTTTAGCCTCT-TTTTTCT--C-T--C-TCTT---GC--------AT-G-AT---GTGAA 2851
||| | ||||| ||||| | | | | |||| || || | || |||||
Sbjct 2808 TTTAACCCTCTATTTTTTTTGCATGTCGTCTTTCCGCTTCTCTCTATCGTATCATGTGAA 2867
Query 2852 TAGTGCTGACGGGGTTTTT-GGGTAAAAGTAGTTTCATTCCCCTCAGGCCATATCTGTTT 2910
||||| | | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 TAGTGGTTA-GTTTTTTTTTGGGTAAAAGTAGTTTAATTCCCCTCAGGCCATATCTGTTT 2926
Query 2911 TGAGGTTTCGGTCTTATTTTATTCTCTTTTGGAAGTTAATGCAAA 2955
|||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2927 -GAGGTTG-GGTCTTATTTTGTTCTCTTGGGGTAGTTAATGCAAA 2969
> AT3G08943.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3:2718880-2722624
REVERSE LENGTH=3167
Length=3167
Score = 4239 bits (2295), Expect = 0.0
Identities = 2606/2753 (95%), Gaps = 33/2753 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 90 AGAAGCTTTTTGTGGATAGAATCTT-CAGTGAGAGGGAC-GTGGTGTTTAAATTGAAGCG 147
||||||||||| | ||||| | || |||||| |||||| || |||| |||||||||
Sbjct 115 AGAAGCTTTTTCTCGATAGGCT-TTGCAGTGACAGGGACACAGG-GTTTGGATTGAAGCG 172
Query 148 AAAAACCCTAGCGTTTA--------CTCAAGC------A---TTGATTTCCATAGAGAAG 190
||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||
Sbjct 173 AAAAACCCTAGCGTTTACGCGTCTTCTCAAGCGAAAAAATCCTTAATTTCCACAGAGAAG 232
Query 191 AATGGCTATGGAGATCACACAGTTCCTACTGGCTGCTCAGTCAGCTGATGCAAGAGTCCG 250
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 233 AATGGCTATGGAGATCACACAGTTCCTTCTGGCTGCCCAGTCAGCCGATGCAAGAGTCCG 292
Query 251 TACTGAAGCAGAGGCTAGTCTCAGGCAGTTCCAAGAACAAAACTTGCCACTGTTCTTATT 310
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 293 TACTGAAGCAGAGGCTAGTCTCAGACAGTTCCAAGAACAAAACTTGCCGCTGTTCTTGTT 352
Query 311 ATCCTTGTCTTTTGAGCTTGAGAACAATGATAAACCTGCTGAATCCCGTCGACTTGCTGG 370
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 353 ATCCTTGTCTTTTGAGCTTGAAAACAATGATAAACCTGCTGAATCCCGTCGACTAGCCGG 412
Query 371 TATTCTGCTAAAGAATTCTCTTGACGCCAAAGATTCTGCCAGAAAAGATCATCTGGTGAA 430
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 413 TATTCTGCTAAAGAATTCTCTGGACGCCAAAGATTCTGCCACAAAAGATCATCTGGTGAA 472
Query 431 ACAATGGTTTGCAATTGATGTTGCTCTTAAATCCCAGATCAAGGAACTG-TTAATGAGAA 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||
Sbjct 473 ACAATGGTTTGCAATTGATGTTGCTCTTAAATCCCAGATCAAGGATC-GCTTACTAAGAA 531
Query 490 CTCTTGGTTCTTCTGCCCTAGAGGCGAGGCATACTTCAGCTCAGGTTATTGCAAAGGTAG 549
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 532 CTCTTGGTTCATCTGCCCTAGAGGCAAGGCATACTTCAGCTCAGGTTATTGCTAAGGTAG 591
Query 550 CCTCCATTGAAATTCCTCAGAAGCAGTGGCCTGAACTTGTTGGATCGTTGCTTAACAATA 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 592 CCTCCATTGAAATTCCTCAGAAGCAGTGGCCTGAACTTGTTGGATCGCTGCTTAACAATA 651
Query 610 TGACCCAGCAAGGCAGTCCCGCACACTTGAAGCAATCAACGTTAGAAACTCTAGGCTATG 669
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 652 TGACTCAGCAAGGCAGTCCCGCACACTTGAAGCAATCAACCTTGGAAACTCTAGGCTATG 711
Query 670 TCTGTGAAGAGATATCACACCATGATCTTGTGCAAAATGAAGTGAATTCCGTCCTCACAG 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 712 TCTGTGAAGAGATATCACACCATGATCTTGTGCAAGATGAAGTGAATTCTGTCCTCACAG 771
Query 730 CAGTTGTGCAGGGCATGAACCAGTCTGAAAATACTGCAGAAGTTCGTCTTGCAGCAACAA 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 772 CAGTTGTGCAGGGCATGAACCAGTCTGAAAATACTGCTGAAGTTCGTCTCGCAGCAACAA 831
Query 790 AGGCACTGTTGAATGCCCTGGATTTCTCTCAGACAAACTTTGAGAATGAAATGGAGAGGA 849
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 AGGCACTGTTAAATGCCTTGGATTTCTCTCAGACAAATTTTGAGAATGAAATGGAGAGGA 891
Query 850 ATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAGATCAGACAAG 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 892 ATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAGATCAGGCAAG 951
Query 910 CTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCTATTGCGTCCACATACTACGAGGTGCTGGAGCAATACA 969
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 952 CTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCCATTGCATCCACATACTATGAGGTGCTGGAGCACTACA 1011
Query 970 TGCCAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAGAGTGTTGCCC 1029
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1012 TACAAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAGAGCGTTGCCC 1071
Query 1030 TCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGACCGTCAAGAGTATG 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 TCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGACCGTCAAGAGTATG 1131
Query 1090 ACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAGAAGGCTCTTC 1149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 ACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAGAAGGCTCTTC 1191
Query 1150 CCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGATCAGGACCATG 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 CCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGATCAGGACCATG 1251
Query 1210 ACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTGGTTGCCAGAA 1269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1252 ACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTGGTTGCTAGAA 1311
Query 1270 CGGTTGGAGATGGTATAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGaaaaaaaCATAAGTTCGC 1329
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 CGGTTGGAGATGGTGTAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGAAAAAAACATAAGTTCGC 1371
Query 1330 CAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTGGAGGGCCCAA 1389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 CAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTGGAGGGCCCAA 1431
Query 1390 CAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTCCTCCTTAATGCAACCA 1449
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1432 CAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTAGCTGCTGGCTTGGAATTTCTCCTTAATGCAACCA 1491
Query 1450 AGGATGGGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGTATCTTTGAAT 1509
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 AGGATCAGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGTATCTTTGAAT 1551
Query 1510 TTTTGC-ACTCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCTCCCTAGAATT 1568
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 TTTTGCCA-TCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCTCCCTAGAATT 1610
Query 1569 GTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAAGGTCTGCGGA 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1611 GTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAAGGTCTGTGGA 1670
Query 1629 GCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAAGT-CCTCTCTTCTCTC 1687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1671 GCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAA-GTTCCTCTCTTCTCTC 1729
Query 1688 TCCTTATCTCACAGAAATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCGTACAGATGGGGC 1747
||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 TCCTTATCTTACAGAGATCATCACACATCTCCTTGCAGCTGCTGAGCGTACAGATGGGGC 1789
Query 1748 AGAGTCTAAACTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAATGAGGTTGTCCGGTGTTCAAA 1807
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 AGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAACGAGGTTGTCCGGTGTTCAAA 1849
Query 1808 CCTTTCAGAGGCCTCGAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAAAAAATTAGC 1867
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 CCTTTCAGAGGCCTCAAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAAAAAATTAGC 1909
Query 1868 TGAAACTATGGACCTCCCGATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAACAGGCAGAACTCCA 1927
||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||
Sbjct 1910 TGAGACAATGGACCTCCCTATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAGCAAGCGGAACTCCA 1969
Query 1928 GGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGTGGCAGGGAGGATAC 1987
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 1970 GGCGTCTCTGTGCGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGCAGCAGGGACGATAT 2029
Query 1988 GAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATGACATCATGAGGCTGTTCTTAAGAGTGTTTGG 2047
|||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||
Sbjct 2030 GAAACCTATCATAGTGCAAAACGCAGATGACATCATGAGGTTATTCCTAAGAGTGTTTGG 2089
Query 2048 ATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCTTGCCTATGC 2107
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 TTGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCTTGCCTATGC 2149
Query 2108 AACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCTCCAGATGGGGCT 2167
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 GACTGGAACTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTTAAATATCTCCAGATGGGGCT 2209
Query 2168 GCAGAATTTTGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGGTGACATATG 2227
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 GCAGAATTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGGTGACATATG 2269
Query 2228 CCGTGC-CTTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGGTCTCCTTATCC 2286
|||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 CCGTGCGCT-GGATGAAAAAATCCTACCCTTTTGCGATCAGATAATGGGTCTCCTTATCC 2328
Query 2287 AAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATGTTCTCATGCTTTG 2346
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2329 AAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATCTTCTCATGCTTTG 2388
Query 2347 GAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTCGAAAGGTATGTTGCTCCAGCCGTTCAGA 2406
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2389 GAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTTGAAAGGTATGTAGCTCCAGCTGTTCAGA 2448
Query 2407 TCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGGAGCTTATGG 2466
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 TAATGCAAGGTGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGGAGCTTATGG 2508
Query 2467 ATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGAATACTACAGGGGT 2526
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 2509 ATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGGATACTGCAAGGGT 2568
Query 2527 TCAAGGACACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTACTGCAGTTTGTTG 2586
||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2569 TCAAGGATGCAAAGGCTGAGCTCATGATGCCCTATGCTCAACATCTGTTGCAGTTTGTTG 2628
Query 2587 AGCTAGTATCCAAAGATCCCCTCAGGGATGAGAGTGTGACAAAAGCTGCGGTTGCAGCAA 2646
| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2629 AACTAGTATCCAAAGATTCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCGCGGTTGCAGCAA 2688
Query 2647 TGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGAGAGAACACAAAGCAGGTGTTC-AACAACTTCACC 2705
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||
Sbjct 2689 TGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGGGAGAACACGAAGCAGTTGTTCCAA-AACTTCACC 2747
Query 2706 TTCT-TCGGTGAGTTCCTCAATGAGTGTCTCGAATCAGAGGATGAAGATCTCAAGGTTAC 2764
|||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2748 TTCTGT-GATGAGTTCCTCAATGAGTGTCTCGAATCAGAGGATGAAGATCTCAAGGTCAC 2806
Query 2765 TGCACGCTGGACTCAAGGAATGATCGCAAGGCTCATGCACTCATCATAAATTT 2817
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||
Sbjct 2807 TGCACGCTGGACTCAAGGAATGATCGCAAGACTCGTGCTCTAATCATAAATTT 2859
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 147942314907
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5