BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg478317
Length=2793
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G09920.1 | Symbols: PIP5K9 | phosphatidyl inositol monophosp... 4446 0.0
> AT3G09920.1 | Symbols: PIP5K9 | phosphatidyl inositol monophosphate
5 kinase | chr3:3040303-3043912 REVERSE LENGTH=2807
Length=2807
Score = 4446 bits (2407), Expect = 0.0
Identities = 2691/2822 (95%), Gaps = 44/2822 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAGTTAGTTACTC--TTCT-TT-TTTCTGATTCTGATGCTAGATTCATACATCGTGAC 56
||||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AAAAGTTAGTTACTCTTTTTTATTCTTTCTGATTCTGATTCTAGATTCATACATCGTGAC 60
Query 57 TTGGAGCCTGATTCTTGCATCTGCTTTCTTCGTTGACAGTAGCTGGGCACATTCTATTTC 116
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||
Sbjct 61 TTGGAACCTGATTCTTGCATCTGCTTTCTTCGTTGA-A-TAGCTGAGCACATTCTGTTT- 117
Query 117 ACCAGTTTGCCAGTTTACTGGAGGTAGCTTCATGTTTTGTTGAAAGAGTGTTCTCCTTGA 176
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 118 --CA-----CCAGTTTACTGGAGGTAGCTTCATGTTTTGTTGAAAGAATGTTCTCCTTAA 170
Query 177 GGCTGTGACGCGCCTTTTTCTCTGCGGTTTGTCTGAGCGTTTGTGCTTTGGCTTCTTTGG 236
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 171 GGCTGTGA--AGCCTTTTGCTCTGCGGTTTGTCTGAGCGTTTCTGCTTTAGCTTCTTTGG 228
Query 237 AGATTTACATGTCTGGCCTTGACCTTCGAGAACCAGTTTCTTTTGCTGAAAGAACTAAAT 296
||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 AGATTTACATGTCTGGCCTTGACGTACGAGGAGCAGTTTCTTTTGCTGAAAGAACTAAAT 288
Query 297 CTGTTGATGCACTTACTAAGAAAGAGATCCTATTAGCGCTAAACAGTGGAGAAGTTTCCG 356
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CTGTTGATGCACTTACTAAGAAAGAGATCCTATCGGCGCTAAACAGTGGAGAAGTTTCCG 348
Query 357 AAACTTCTGAGGATGCTAGGTTCAGAGTTAGAGAGCT-GTTGCTCCCTGATGGCGAATCC 415
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 349 AAACTTCTGAGGATGCTAGGTTCAGAGTTAGGGAGCTGGTT-CTCCCCGATGGCGAATCC 407
Query 416 TACAGTGGTTCTTTGCTTGGAAATGTACCCGAGGGACCAGGGAAGTACATATGGTCAGAT 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 TACAGTGGTTCTTTGCTTGGAAATGTACCCGAGGGACCAGGGAAGTACATATGGTCAGAT 467
Query 476 GGGTGTGTTTACGATGGAGAATGGAGGCGTGGGATGAGACATGGAATTGGAAAGATGAGA 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 468 GGGTGTGTTTACGATGGAGAATGGAGGCGTGGGATGAGACATGGAATTGGAAATATGAGA 527
Query 536 TGGGCTTCCGGGGCATCGTATGAAGGTGAATTTTCAGGCGGTTATATGCACGGTTCAGGG 595
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 TGGGCTTCCGGGGCATCTTATGATGGTGAATTTTCAGGCGGTTATATGCACGGTTCAGGG 587
Query 596 ACCTATGTGGATGCTAACAAGTTAACGTATAAAGGAAGATGGCGGCTTAATCTGAAACAT 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 588 ACCTATGTGGATGCTAACAAGTTAACGTATAAAGGAAGATGGCGGCTTAATTTGAAACAT 647
Query 656 GGGCTCGGATATCAGGTTTACCCTAATGGAGATGTCTTTGAAGGTTCTTGGATTCAGGGG 715
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 GGGCTCGGATATCAGGTTTACCCTAATGGAGATGTCTTTGAAGGTTCTTGGATTCAGGGA 707
Query 716 TTGGGAGAAGGGCCAGGGAAGTATACTTGGGCTAATAAAAATGTCTATCTCGGGGATATG 775
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 TTGGGAGAAGGACCAGGGAAGTATACTTGGGCTAATAAAAATGTCTATCTCGGGGATATG 767
Query 776 AAAGGCGGGAAAATGTCAGGAAAGGGTACACTGACTTGGGTTACCGGGGACTCCTATGAA 835
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 768 AAAGGCGGGAAAATGTCAGGAAAGGGTACACTTACTTGGGTTACCGGAGATTCCTATGAA 827
Query 836 GGAAGTTGGTTGAATGGAATGATGCATGGTGTTGGTGTATATACATGGAGCGATGGCGGT 895
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 828 GGAAGTTGGTTGAATGGAATGATGCATGGTGTTGGTGTATATACGTGGAGCGATGGAGGT 887
Query 896 TGCTATGTTGGGACATGGACACGGGGTTTGAAAGACGGTAAAGGCTCGTTTTATTCAGCG 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 TGCTATGTTGGGACATGGACACGGGGTTTGAAAGACGGTAAAGGCTCGTTTTATTCAGCG 947
Query 956 GGAACCAGAGTTCCGGCAGTGCAAGAGTTTTATTTAAATGCTCTTAGAAAAAGAGGTGTT 1015
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 948 GGAACCAGAGTTCCGGTAGTGCAAGAGTTTTATTTAAATGCTCTTAGAAAGAGAGGTGTT 1007
Query 1016 TTGCCAGACT-TGAGAAGACAGAACCAAGTTGCTTCTTCGGTTAATATGGAAAACCTTAG 1074
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 TTGCCAGA-TATGAGAAGACAGAACCAAGTTGCTTCCTCGGTTAATATGGAAAACCTTAG 1066
Query 1075 AGTTGGTGTGAACCGTAATAAGCTCTCAAAAGGGAGCTTAATAAACTTAGAACAGTCCCG 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067 AGTTGGTGTGAACCGTAATAAGCTCTCAAAAGGGAGCTTAATAAACTTAGAACAGTCCCG 1126
Query 1135 CAATGGAAGGGTTTCTTTAGAAAGACGTTGGAGTCTTGAAGTATCTATTGAGAAAGTGAT 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 CAATGGAAGGGTTTCTTTAGAAAGACGTTGGAGTCTTGAAGTATCTATTGAGAAAGTGAT 1186
Query 1195 TGGACATGGTTACTCGGATTTATCTACAGCAGTTTTAGATAGCGGAAGTAGTGTGCAGTA 1254
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 TGGACATGGTTACTCGGATTTATCTACGGCAGTTTTAGATAGCGGAAGTAGTGTGCAGTA 1246
Query 1255 TAAAGCAAACGTACCGATCTTGGAGCGGGAATATATGCAAGGTGTTCTGATCAGTGAGCT 1314
|||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 TAAAGCTAACATACCAATCTTGGAGAGGGAATATATGCAAGGTGTTCTGATCAGTGAGCT 1306
Query 1315 TGTGGTAAACAACGGTTTTTCGCGCACATCCAGAAGAGCAAAAAGGAAACACAAAAGACT 1374
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 TGTGGTAAACAACGGGTTTTCGCGCACATCCAGAAGAGCAAAAAGGAAACACAAAAGACT 1366
Query 1375 TGTTAAAGAAGCTAAGAAGCCCGGAGAAGTTGTTATTAAAGGTCACCGGAGTTATGATCT 1434
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1367 TGTTAAAGAAGCTAAGAAGCCTGGAGAAGTTGTTATTAAAGGTCACCGGAGTTATGATCT 1426
Query 1435 GATGCTCAGTTTGCAGCTTGGAATCAGATACACAGTGGGGAAAATTACGCCAATACAAAG 1494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1427 GATGCTCAGTTTGCAGCTTGGAATCAGATACACAGTGGGGAAAATTACGCCAATACAAAG 1486
Query 1495 ACGACAAGTACGGACAGCAGACTTTGGACCTCGGGCTAGTTTTTGGATGAATTTTCCTCG 1554
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1487 ACGACAAGTTCGGACAGCAGACTTTGGACCTCGGGCTAGTTTTTGGATGACTTTTCCTCG 1546
Query 1555 AGCTGGCTCCACGATGACTCCTCCACACCACTCGGAAGATTTTAAATGGAAGGACTATTG 1614
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 AGCTGGCTCCACGATGACTCCTCCGCACCACTCGGAGGATTTTAAATGGAAGGACTATTG 1606
Query 1615 CCCAATGGTATTCAGGAACCTAAGGGAGATGTTTAAGATCGATGCAGCTGATTATATGAT 1674
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607 CCCAATGGTATTCAGAAACCTGAGGGAGATGTTCAAGATCGATGCAGCTGATTATATGAT 1666
Query 1675 GTCCATTTGTGGAAATGATACTTTAAGAGAACTTTCTTCTCCAGGGAAGAGCGGCAGCGT 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 GTCCATTTGTGGAAATGATACTTTAAGAGAACTTTCTTCTCCAGGGAAGAGCGGCAGCGT 1726
Query 1735 CTTCTTCCTGTCTCAGGATGATCGGTTCATGATCAAAACACTCAGGAAATCTGAAGTCAA 1794
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1727 CTTCTTCCTGTCGCAGGATGATCGGTTCATGATCAAAACACTCAGGAAATCTGAAGTCAA 1786
Query 1795 GGTTCTTCTGAGGATGCTTCCAGATTACCATCATCATGTCAAGACGTATGAGAACACCCT 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1787 GGTTCTTCTGAGGATGCTTCCAGATTACCATCATCATGTGAAGACATATGAGAACACCCT 1846
Query 1855 CATTACTAAATTCTTTGGCCTTCACAGAATCAAACCATCAAGTGGTCAAAAGTTCCGCTT 1914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1847 CATTACTAAATTCTTTGGCCTTCACAGAATCAAACCATCAAGTGGTCAAAAGTTCCGTTT 1906
Query 1915 TGTGGTGATGGGTAACATGTTCTTTACAGATCTAAGAATTCATCGGAGATTTGACCTTAA 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 TGTGGTGATGGGTAACATGTTCTTTACAGATCTAAGAATCCATCGGAGATTTGACCTTAA 1966
Query 1975 AGGTTCATCCTTGGGACGCTCTGCAGACAAAGTCGAGATAGATGAGAACACGATACTTAA 2034
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1967 AGGTTCGTCCTTGGGACGCTCTGCAGACAAAGTCGAGATAGACGAGAACACGATACTTAA 2026
Query 2035 AGATTTAGATCTGAACTACAACTTCTTCTTGGAGCCTTCTTGGCGGGAAGATTTACTGAG 2094
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2027 AGATTTAGATCTGAACTACAGCTTCTTCTTGGAGACTTCTTGGCGGGAAGGTTTACTGAG 2086
Query 2095 ACAACTAGAGATCGATAGTAAGTTCTTGGAAGCACAGAACATAATGGATTACAGTCTTTT 2154
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 GCAACTAGAGATCGATAGCAAGTTCTTGGAAGCACAGAACATAATGGATTACAGTCTTTT 2146
Query 2155 ACTCGGTGTGCATCATCGAGCTCCACAACACTTAAGGTCCCAATTGGTCCGTTCTCAAAG 2214
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTCGGTGTGCATCATCGAGCTCCACAGCACTTAAGATCCCAATTGGTCCGTTCTCAAAG 2206
Query 2215 TATAACAACTGATG-TGTTGGAAAGTGTAGCTGAAGACGATACAATCGAAGACGACATGT 2273
|||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2207 TATAACAACTGATGCTCT-GGAAAGTGTAGCTGAAGATGATACAATCGAGGACGACATGC 2265
Query 2274 TGTCTTACCACGAAGGATTGGTTCTTGTCCCTCGGGGAAGTGAAAATATTGTAACTGGCC 2333
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2266 TGTCTTACCACGAAGGATTGGTTCTCGTTCCTCGGGGAAGTGAAAATACTGTAACTGGCC 2325
Query 2334 CTCACATCAGAGGCAGCAGATTACGAGCATCCGCTGCTGGTGATGAAGAAGTCGATCTCC 2393
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2326 CTCACATCAGAGGCAGCAGATTACGAGCATCCGCTGTTGGTGATGAAGAAGTAGATCTCC 2385
Query 2394 TTCTTCCTGGAACAGCCAGGCTGCAGATACAGCAAGGAGTGAACATGCCGGCGAGAGCAG 2453
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2386 TTCTTCCTGGAACAGCCAGGCTGCAGATACAGCAAGGAGTGAACATGCCGGCAAGAGCAG 2445
Query 2454 AACTGATACCGGGAAGAGAAGATAAAGAGAAGCAGATTTTACATGATTGCTGCGACGTCG 2513
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2446 AGCTGATACCGGGAAGAGAAGATAAAGAGAAGCAGATTTTACATGACTGCTGCGACGTCG 2505
Query 2514 TGCTCTACCTTGGGATTATAGACATCTTACAAGAGTACAACATGACCAAGAAGATTGAGC 2573
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2506 TACTCTACCTTGGCATTATAGACATCTTACAAGAGTACAACATGACCAAGAAGATTGAAC 2565
Query 2574 ATGCTTATAAATCTCTTCACTTTGATTCTCTTTCGATCTCAGCCGTTGATCCTACATTTT 2633
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2566 ATGCTTATAAATCTCTTCACTTTGATTCTCTTTCGATCTCAGCCGTTGATCCAACATTCT 2625
Query 2634 ACTCCCAACGTTTTCTTGAGTTCATCAAGAAAGTATTTCCACAGAACAACAACTCATAGA 2693
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2626 ACTCCCAACGTTTTCTTGAGTTCATCAAGAAAGTATTTCCACAGAACAACAAATCATAGA 2685
Query 2694 GAAAGAATTGAGTACAGAGTT--A-------------A-A-A-AA----GAATTCTATGT 2731
| |||||||||||||||||| | | | | || |||||||||||
Sbjct 2686 CAGAGAATTGAGTACAGAGTTTTATGTTTTTTTTTGTAGAGATAAAAAAGAATTCTATGT 2745
Query 2732 TGTAAGTATCTTCTATACAGATCTTGAGAGCTTCAATAAATAAATAAAAAACTATTTTTC 2791
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||
Sbjct 2746 TGTAAGTATGTTGTATACAGATCTTGAGAGCTTCAATAAATAAGTAAAAAACTAATTCTC 2805
Query 2792 CT 2793
||
Sbjct 2806 CT 2807
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 138761764338
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5