BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg478454
Length=5388
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G11130.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:3482149-... 8813 0.0
AT3G08530.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:2586806-... 7313 0.0
> AT3G11130.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:3482149-3491908
REVERSE LENGTH=5785
Length=5785
Score = 8813 bits (4772), Expect = 0.0
Identities = 5025/5148 (98%), Gaps = 13/5148 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 147 TTCTCTCGCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCGGCTAACGCGCCCATCATCATGAAG 206
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 215 TTCTCTCGCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCTAACGCGCCCATCATTATGAAG 274
Query 207 GAGGTCCTAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAATGTT 266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 GAGGTCCTAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAATGTT 334
Query 267 ACTATGGAGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCACAAAACAGTGTTGTA 326
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 335 ACTATGGAGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCGCAGAACAGTGTTGTA 394
Query 327 ATTATCGATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATAACTGCTGATTCTGCT 386
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 395 ATTATCGATATGAATATGCCGATGCAGCCTTTAAGGAGGCCTATAACTGCTGATTCTGCT 454
Query 387 CTTATGAACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAG 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 CTTATGAACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAG 514
Query 447 GATCATCTACAGATATTTAACATCGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATGCCT 506
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 GATCATCTACAGATATTTAACATTGAAGCAAAGGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATGCCT 574
Query 507 GAGCAGGTTGCTTTTTGGAAGTGGATCACACCAAAGATGCTGGGGCTGGTCACGCAAACT 566
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 575 GAGCAGGTTGCTTTTTGGAAGTGGATCACACCTAAGATGCTGGGACTGGTCACACAAACT 634
Query 567 TCTGTGTATCATTGGTCGATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACG 626
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 TCTGTGTATCATTGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACG 694
Query 627 GCCAATTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTG 686
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 695 GCTAATTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTG 754
Query 687 GTCTTGATTGGAATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTAAAAGGAAATATG 746
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 755 GTCTTGATTGGAATTGCCCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTGAAAGGAAATATG 814
Query 747 CAGCTTTTCTCGGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCGCATGCTGCGTCATTT 806
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 815 CAGCTTTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCACATGCTGCATCTTTT 874
Query 807 GCTCAGTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCCTTTGCAAGCAAG 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 875 GCTCAGTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCGATTCTTATATCATTTGCAAGCAAG 934
Query 867 AGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCACGTTATTGAACTTGGTGCCCAACC- 925
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 AGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGCTGCATGTTATTGAACTTGGTGCCCAACCA 994
Query 926 GGGAAAACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTGCTGA 985
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 GGG-AAACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTGCTGA 1053
Query 986 TGATTTTCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCACCAA 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 TGATTTTCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCACCAA 1113
Query 1046 GCTTGGCCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGAT 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 GCTTGGCCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGAT 1173
Query 1106 AAGTCCGGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCAT 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 AAGTCCGGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCAT 1233
Query 1166 TAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACCGTAAATGAGGCCACCATAATACCTTTTAT 1225
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 TAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACAGTAAATGAGGCCACCATAATACCTTTTAT 1293
Query 1226 TAGTGGTCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCC 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 TAGTGGTCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCC 1353
Query 1286 TGGTGCAGAGAATCTGGTTGTCCAGAGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGTACAA 1345
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 TGGTGCAGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGTACAA 1413
Query 1346 GGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATACGGT 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1414 GGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATACGGT 1473
Query 1406 GGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTT 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 GGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTT 1533
Query 1466 TGGGACCCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATACATATGAGTCTTTGGAACTATCTCGGCT 1525
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 TGGGACCCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCTTTGGAACTATCTCGGCT 1593
Query 1526 TGTTGTGAATCAAAACAAGAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTAGCCGAGGATAAGTTAGA 1585
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1594 TGTTGTGAATCAAAACAAAAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGTTAGA 1653
Query 1586 ATGCAGTGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAAAAAT 1645
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654 ATGCAGTGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAAACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAAAAAT 1713
Query 1646 TTACATCAAAGCTAGAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGGAGTT 1705
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714 ATACATCAAAGCTAGAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGGAGTT 1773
Query 1706 TGACAAAATACTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTCTTCT 1765
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TGACAAAATATTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTCTTCT 1833
Query 1766 GCAAACGATACTTCGTACGGACCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGTCCCA 1825
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 GCAAACGATACTCCGTACGGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGTCCCA 1893
Query 1826 AATGGAAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGAGAAA 1885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894 AATGGAAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGAGAAA 1953
Query 1886 TCTGATCCGTGAAGCCACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAACTTACCCGAGCA 1945
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1954 TCTGATCCGTGAAGCGACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAATTTACCCGAGCA 2013
Query 1946 TGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGGCTGA 2005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2014 TGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGGCTGA 2073
Query 2006 TGCAATCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACAGGCCTCGTGTTGCTCAGCTTTG 2065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2074 TGCAATCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACCGGCCTCGTGTTGCTCAGCTTTG 2133
Query 2066 TGAAAAGGCTGGACTTTACATCCAATCCTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATCAA 2125
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134 TGAAAAGGCTGGACTTTACATCCAATCTTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATCAA 2193
Query 2126 ACGTGTAATTGTTAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTCGGTAC 2185
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2194 ACGTGTAATTGTGAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTTGGTAC 2253
Query 2186 TCTTTCTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGAGAGG 2245
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2254 TCTTTCTAGCGAGTGGGCAATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGAGAGG 2313
Query 2246 CAACCTTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTCGATGC 2305
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2314 CAACCTTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGC 2373
Query 2306 ATGCATTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCATACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAGGTTC 2365
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2374 ATGCATTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCGTACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAGGTTC 2433
Query 2366 ATACTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTGCCAA 2425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434 ATACTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTGCCAA 2493
Query 2426 GACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATGCTGA 2485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2494 GACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATGCGGA 2553
Query 2486 AAAGACGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATAAATGT 2545
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2554 AAAGACGAAGAACTTTTTAATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATTAATGT 2613
Query 2546 CTGCGATCGTTTTGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCT 2605
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2614 CTGTGATCGTTTTGGCTTTGTACCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCT 2673
Query 2606 GCGTTACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTAAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTGGG 2665
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2674 GCGTTACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTGAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTGGG 2733
Query 2666 GCAGTTGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTGTTCG 2725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734 GCAGTTGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTGTTCG 2793
Query 2726 TTCATTACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTG-ATGAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCCGTC 2784
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794 TTCATTACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTGCA-GAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCCGTC 2852
Query 2785 TCCTTACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATA 2844
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2853 TCCTCACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATA 2912
Query 2845 ATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCACCA 2904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2913 ATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCACCA 2972
Query 2905 ATCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTCTGG 2964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2973 ATCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTCTGG 3032
Query 2965 CCGTCGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACAAGA 3024
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3033 CTGTTGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACAAGA 3092
Query 3025 ACTCTTTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCTGGG 3084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3093 ACTCTTTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCTGGG 3152
Query 3085 AGAAGGTTCTTACGGAAGAAAATGAATATAGGAGGCAACTTATCGACCAAGTTGTGTCTA 3144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3153 AGAAGGTTCTTACGGAAGAAAATGAATATAGGAGGCAACTTATAGACCAAGTTGTGTCTA 3212
Query 3145 CTGCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGA 3204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3213 CTGCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGA 3272
Query 3205 CTGCTGATCTGCCGCATGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAAATTGTGCTTCAAAATTCTG 3264
|||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3273 CTGCTGATTTGCCACATGAGCTAATTGAGCTTCTGGAAAAAATTGTGCTTCAAAATTCTG 3332
Query 3265 CCTTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATACTGACAGCTATTAAGGCAGATC 3324
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3333 CCTTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTACTTATACTGACAGCTATTAAGGCAGATC 3392
Query 3325 CGTCTAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAATTTTGATGGTCCAGCGGTTGGAG 3384
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 3393 CGTCCAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAATTTCGATGGTCCAGCTGTTGGAG 3452
Query 3385 AAGTGGCGGTTGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGTTTAACT 3444
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3453 AAGTGGCAGTGGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGTTTAACT 3512
Query 3445 TAAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTGCTGTTG 3504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3513 TAAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAACGTGCTGTTG 3572
Query 3505 AGTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCTCAGCTCA 3564
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3573 AGTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCACAGCTCA 3632
Query 3565 GGGACGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGATGCCACTCAGT 3624
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3633 GGGAAGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGACACCACTCAGT 3692
Query 3625 TCCTGGAGGTCATCCGCGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCAGATACC 3684
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3693 TCTTGGAGGTCATCCGAGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCAGATACC 3752
Query 3685 TTTTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCTATGCTT 3744
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3753 TTCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCTATGCTT 3812
Query 3745 ATGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACGTTGCCA 3804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3813 ATGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACGTTGCCA 3872
Query 3805 ACCTTCAAAATGTTGGTGACCGTTTGTATGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAGATAA 3864
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3873 ACCTTCAACATGTTGGTGACCGTTTGTACGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAGATAA 3932
Query 3865 TATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGCAACAGT 3924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3933 TATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGCAACAGT 3992
Query 3925 TCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCT 3984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3993 TCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCT 4052
Query 3985 GCTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCCCAAATCTGTGGACTTAACATTA 4044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4053 GCTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCTCAAATCTGTGGACTTAACATTA 4112
Query 4045 TCATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGATGCTTCA 4104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4113 TCATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGATGCTTCA 4172
Query 4105 ATGAATTGATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGGGGATCT 4164
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4173 ATGAATTGATCTCCCTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGGGTATCT 4232
Query 4165 TCACCGAGTTGGGTGTACTGTACGCTAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAACACATCA 4224
|||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4233 TCACCGAGTTAGGAGTACTGTACGCCAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAACACATCA 4292
Query 4225 AGTTGTTCTCGACGCGGCTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAACAACAGC 4284
|||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4293 AGTTGTTCTCTACTCGACTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAACAACAGC 4352
Query 4285 ATTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCAACCA 4344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4353 ATTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCAACCA 4412
Query 4345 CTGTCATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAACACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCA 4404
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4413 CTGTTATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCA 4472
Query 4405 AGGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGCACCCTG 4464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4473 AGGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGCACCCTG 4532
Query 4465 ATATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGCTCTGCGGTTAGATCACACTCGTGTCGTTG 4524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4533 ATATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGCTCTGCGGTTAGATCACACGCGTGTCGTTG 4592
Query 4525 ATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATCAAGCCATACATGGTTGCAGTTCAGA 4584
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4593 ATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATTAAGCCATATATGGTTGCAGTTCAGA 4652
Query 4585 GCAATAATGTCTCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGTAGAAGAAGAAGACT 4644
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4653 GCAATAATGTATCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGCAGAAGAAGAAGACT 4712
Query 4645 ATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGTCTCGCCC 4704
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4713 ATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGTCTCGCTC 4772
Query 4705 AGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGGCGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGA 4764
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4773 AGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTATAAGA 4832
Query 4765 AAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTATCAAAGAAAGATAACATGTACAAGGACT 4824
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4833 AAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTGTCAAAGAAAGATAACATGTACAAGGACT 4892
Query 4825 GTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTCGTCTACT 4884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4893 GTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTCGTCTACT 4952
Query 4885 TCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAA 4944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4953 TCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAA 5012
Query 4945 TCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATAGACTTTGCCTTCC 5004
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5013 TCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATCGACTTTGCCTTCC 5072
Query 5005 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATCAAGGACA 5064
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5073 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCCGGCAAAGTGGATGAGCTAATCAAGGACA 5132
Query 5065 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCCC 5124
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5133 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCAC 5192
Query 5125 AACAGAACATGTACGCCCAATTATTGCCATTGGCTCTACCTGCCCCTCCGATGCCAGGAA 5184
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||
Sbjct 5193 AACAGAACATGTACGCCCAATTATTACCACTGGCTCTACCCGCACCACCGATGCCAGGAA 5252
Query 5185 TGGGAGGTGGTGGGTATGGTCCGCCACCACCAATGGGCGGAATGCCAGGAATG-C----- 5238
|||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 5253 TGGGAGGTGGCGGGTATGGTCCACCACCACAAATGGGTGGAATGCCAGGAATGTCAGGAA 5312
Query 5239 --C-TCCAATGCCACCGTATGGAATGCCTCCAATGGGCGGCTACTAAG 5283
| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 5313 TGCCTCCAATGCCTCCATATGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAAG 5360
Score = 241 bits (130), Expect = 7e-62
Identities = 150/159 (94%), Gaps = 4/159 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCCCTTATATTCGACGAGTGACTCCGATTGGATCGCTGTTTCGTCATTTCTCACTTTC 60
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTCCTTATATTCGACGAGTGACTCCGATTGGATCGCTATTTCGTCATTTCTCACTTTC 60
Query 61 TAAA--GAAAAA--CGAATCTCTCTCCACCATCATTACCTTTCTCCTTCACTTGCCTCAG 116
||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAAAAAGAAAAAAACGAATCTCTCTCCACCATCATCACCTTTCTCCTTCACTTGCCTCAG 120
Query 117 ATCTGGCTGCGATTTCAAATCTTCTTTAGTTTCTCTCGC 155
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 121 ATCTGGCTGCGATTTCAAATCTTCCTTAGTTTCTCTCGC 159
> AT3G08530.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:2586806-2595572
REVERSE LENGTH=5638
Length=5638
Score = 7313 bits (3960), Expect = 0.0
Identities = 4761/5156 (92%), Gaps = 21/5156 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 146 TTT-CTCTCGCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCGGCTAACGCGCCCATCATC-ATG 203
||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||
Sbjct 133 TTTACTCTTGCTGTGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCCAACGCCCCCATCA-CGATG 191
Query 204 AAGGAGGTCCTAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAAT 263
||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 192 AAGGAGGTCCTGACGCTTCCGAGCATCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAAT 251
Query 264 GTTACTATGGAGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCACAAAACAGTGTT 323
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 252 GTTACTATGGAGTCTGACAAGTATATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTT 311
Query 324 GTAATTATCGATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATAACTGCTGATTCT 383
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||
Sbjct 312 GTAATTATAGATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTTAGGAGGCCTATTACTGCAGACTCT 371
Query 384 GCTCTTATGAACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACT 443
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 GCTCTTATGAACCCAAACTCGAAGATCCTTGCCTTGAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACT 431
Query 444 CAGGATCATCTACAGATATTTAACATCGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATG 503
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 432 CAGGATCATCTACAGATATTTAACATTGAAGCCAAAGCAAAGTTGAAATCACATCAGATG 491
Query 504 CCTGAGCAGGTTGCT-TTTTGGAAGTGGATCACACCAAAGATGCTGGGGCTGGTCACGCA 562
||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 492 CCTGAGCAGGTTG-TCTTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACA 550
Query 563 -AACTTCTGTGTATCATTGGTCGATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATA 621
|| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 GAA-TTCCGTCTATCATTGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATA 609
Query 622 GAACGGCCAATTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGT 681
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 GAACAGCCAATTTGGCCAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGT 669
Query 682 GGTTGGTCTTGATTGGAATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTAAAAGGAA 741
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 670 GGTTGGTTTTAATTGGAATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACAACAATTGGTAAAAGGAA 729
Query 742 ATATGCAGCTTTTCTCGGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCGCATGCTGCGT 801
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |
Sbjct 730 ATATGCAGCTTTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCAT 789
Query 802 CATTTGCTCAGTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCCTTTGCAA 861
| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 790 CGTTTGCGCAGTTTAAGGTTCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAA 849
Query 862 GCAAGAGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCACGTTATTGAACTTGGTGCCC 921
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 850 GCAAGAGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCC 909
Query 922 AACCGGGAAAACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTG 981
|||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 910 AACCTGGAAAACCATCATTTACAAAAAAACAAGCAGATCTCTTTTTTCCCCCTGATTTTG 969
Query 982 CTGATGATTTTCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCA 1041
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 970 CTGATGATTTTCCTGTTGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCA 1029
Query 1042 CCAAGCTTGGCCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATC 1101
|||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 CCAAACTTGGCCTGTTGTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATC 1089
Query 1102 GGATAAGTCCGGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATG 1161
|||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 GGATTAGTCCAGACCCAATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATG 1149
Query 1162 CCATTAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACCGTAAATGAGGCCACCATAATACCTT 1221
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 1150 CCATTAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTT 1209
Query 1222 TTATTAGTGGTCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACC 1281
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 TTATTAGTGGCCAATTGAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACC 1269
Query 1282 TCCCTGGTGCAGAGAATCTGGTTGTCCAGAGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGT 1341
|||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1270 TCCCAGGTGCAGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGT 1329
Query 1342 ACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATA 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||
Sbjct 1330 ACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATA 1389
Query 1402 CGGTGGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGT 1461
| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 CAGTGGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCTGGACAAACTCCTCCATTGTTACAGT 1449
Query 1462 ATTTTGGGACCCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATACATATGAGTCTTTGGAACTATCTC 1521
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1450 ATTTTGGGACTCTTTTGACTAGAGGGAAACTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTC 1509
Query 1522 GGCTTGTTGTGAATCAAAACAAGAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTAGCCGAGGATAAGT 1581
|||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1510 GGCTGGTTGTGAACCAAAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAAC 1569
Query 1582 TAGAATGCAGTGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAA 1641
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 1570 TAGAATGCAGTGAAGAACTTGGAGACCTTGTGAAGACTGTGGATAATGATCTCGCTCTGA 1629
Query 1642 AAATTTACATCAAAGCTAGAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGG 1701
|||| |||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1630 AAATATACATCAAAGCTCGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGG 1689
Query 1702 AGTTTGACAAAATACTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTC 1761
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1690 AGTTTGACAAAATACTGATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTC 1749
Query 1762 TTCTGCAAACGATACTTCGTACGGACCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGT 1821
|||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1750 TTCTGCAAACCATACTCCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGT 1809
Query 1822 CCCAAATGGAAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGA 1881
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1810 CTCAAATGGAAGGAGGTTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGA 1869
Query 1882 GAAATCTGATCCGTGAAGCCACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAACTTACCCG 1941
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |
Sbjct 1870 GAAATCTGATCCGTGAAGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTG 1929
Query 1942 AGCATGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGG 2001
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1930 AGCATGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTCTGGAGATAAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGG 1989
Query 2002 CTGATGCAATCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACAGGCCTCGTGTTGCTCAGC 2061
||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| |
Sbjct 1990 CTGATGCGGTATTAGCAAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAAC 2049
Query 2062 TTTGTGAAAAGGCTGGACTTTACATCCAATCCTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATA 2121
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2050 TTTGTGAAAAGGCTGGACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATA 2109
Query 2122 TCAAACGTGTAATTGTTAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTCG 2181
| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2110 TAAAACGTGTAATTGTAAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTG 2169
Query 2182 GTACTCTTTCTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGA 2241
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 2170 GCACTCTTTCTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGA 2229
Query 2242 GAGGCAACCTTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTCG 2301
||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2230 GAGGCAATCTGCAGATAATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTG 2289
Query 2302 ATGCATGCATTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCATACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAG 2361
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2290 ATGCATGTATTAAGCTCTTTGAGCAGTTCAAGTCATATGAAGGGCTATACTTTTTCCTAG 2349
Query 2362 GTTCATACTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTG 2421
||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2350 GTTCATATTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATCCATTTCAAGTACATTGAAGCAGCTG 2409
Query 2422 CCAAGACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATG 2481
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2410 CCAAGACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATG 2469
Query 2482 CTGAAAAGACGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATAA 2541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2470 CTGAAAAGACGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAA 2529
Query 2542 ATGTCTGCGATCGTTTTGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACA 2601
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2530 ATGTCTGTGATCGTTTCAGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACA 2589
Query 2602 TGCTGCGTTACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTAAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTG 2661
|||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 TGCTTCGTTACATTGAAGGCTACGTGCAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTG 2649
Query 2662 TGGGGCAGTTGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTG 2721
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2650 TCGGGCAGTTGCTTGATGATGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTCTCTG 2709
Query 2722 TTCGTTCATTACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTGATGAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCC 2781
|||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2710 TTCGTTCATTGCTTCCTGTTGAACCACTTGTCGAGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCC 2769
Query 2782 GTCTCCTTACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCC 2841
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2770 GTCTCCTCACTCAGTTCTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCC 2829
Query 2842 ATAATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCA 2901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2830 ATAATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCA 2889
Query 2902 CCAATCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTC 2961
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2890 CCAACCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCC 2949
Query 2962 TGGCCGTCGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACA 3021
| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2950 TAGCAGTTGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACTAACA 3009
Query 3022 AGAACTCTTTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCT 3081
| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3010 AAAACTCTTTGTTTAAGTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGT 3069
Query 3082 GGGAGAAGGTTCTTACG--GAAGAA-AATGAATATAGGAGGCAACTTATCGACCAAGTTG 3138
|||| ||||||| | || ||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||
Sbjct 3070 GGGATAAGGTTC-T-CGATGAA-AACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTG 3126
Query 3139 TGTCTACTGCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCAT 3198
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3127 TGTCTACTGCTTTACCTGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCAT 3186
Query 3199 TCATGACTGCTGATCTGCCGCATGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAAATTGTGCTTCAAA 3258
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 3187 TCATGACTGCTGATTTGCCGCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTACAAA 3246
Query 3259 ATTCTGCCTTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATACTGACAGCTATTAAGG 3318
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3247 ATTCTGCCTTCAGTGGAAACTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGG 3306
Query 3319 CAGATCCGTCTAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAATTTTGATGGTCCAGCGG 3378
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |
Sbjct 3307 CAGATCCGTCTAGAGTTATGGATTACATCAACAGGCTGGACAACTTTGATGGACCTGCAG 3366
Query 3379 TTGGAGAAGTGGCGGTTGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGT 3438
|||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3367 TTGGAGAAGTCGCAGTTGAAGCCCAATTATATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGT 3426
Query 3439 TTAACTTAAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTG 3498
| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3427 TCAACTTAAATGTTCAGGCTGTCAATGTATTGCTGGATAATGTCAGGAGCATTGAGCGTG 3486
Query 3499 CTGTTGAGTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCTC 3558
| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3487 CAGTTGAGTTTGCATTCCGGGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTCGCTAAGGCGC 3546
Query 3559 AGCTCAGGGACGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGATGCCA 3618
| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3547 AACTCAGGGAAGGACTAGTCAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCA 3606
Query 3619 CTCAGTTCCTGGAGGTCATCCGCGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCA 3678
|||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3607 CTCATTTCTTGGAGGTCATACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCA 3666
Query 3679 GATACCTTTTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCT 3738
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3667 AATACCTTCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCT 3726
Query 3739 ATGCTTATGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACG 3798
|||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3727 ATGCATATGCAAAGATTGATCGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACG 3786
Query 3799 TTGCCAACCTTCAAAATGTTGGTGACCGTTTGTATGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAA 3858
|||| || || ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3787 TTGCTAATCTACAACATGTTGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTCTATGAGGCTGCAA 3846
Query 3859 AGATAATATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGC 3918
| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3847 AAATAATCTATGCGTTCATATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGC 3906
Query 3919 AACAGTTCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGG 3978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3907 AACAGTTCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGG 3966
Query 3979 AAGTCTGCTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCCCAAATCTGTGGACTTA 4038
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 3967 AAGTCTGCTTTGCTTGCGTTGATGCTGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTA 4026
Query 4039 ACATTATCATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGAT 4098
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4027 ACATTATCATTCAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGT 4086
Query 4099 GCTTCAATGAATTGATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGG 4158
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4087 GCTTCAATGAATTAATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGG 4146
Query 4159 GGATCTTCACCGAGTTGGGTGTACTGTACGCTAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAAC 4218
| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4147 GTATCTTCACCGAGTTGGGTGTACTCTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAAC 4206
Query 4219 ACATCAAGTTGTTCTCGACGCGGCTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAAC 4278
|||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4207 ACATCAAGTTATTTTCAACTCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAAC 4266
Query 4279 AACAGCATTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTG 4338
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4267 AACAGCACTGGCAGGAACTTACCTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTG 4326
Query 4339 CAACCACTGTCATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAACACATGCAATTCAAAGACATTG 4398
| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4327 CGACCACCGTCATGAACCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTG 4386
Query 4399 TTGCCAAGGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGC 4458
|||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 4387 TTGCCAAGGTAGCGAATGTTGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGC 4446
Query 4459 ACCCTGATATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGC-TCTGCGGTTAGATCACACTCGT 4517
| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || ||||||
Sbjct 4447 ATCCGGATATAATCAACGATCTTCTCAACGTACTTGCGT-TGCGGTTAGACCATACTCGT 4505
Query 4518 GTCGTTGATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATCAAGCCATACATGGTTGCA 4577
|| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4506 GTTGTTGATATAATGCGGAAGGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCA 4565
Query 4578 GTTCAGAGCAATAATGTCTCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGTAGAAGAA 4637
||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4566 GTTCAGAGCAACAATGTCTCTGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAA 4625
Query 4638 GAAGACTATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGT 4697
|||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 4626 GAAGACTACGATAGGTTGCGAGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGC 4685
Query 4698 CTCGCCCAGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGGCGTGTGGCTGCTTATATC 4757
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4686 CTCGCTCAGAAGATCGAGAAACACGAACTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATC 4745
Query 4758 TACAAGAAAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTATCAAAGAAAGATAACATGTAC 4817
||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4746 TACAAGAAAGCGGGCAGATGGAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTAC 4805
Query 4818 AAGGACTGTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTC 4877
||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 4806 AAGGACTGTATGGAAACGGCTTCACAATCAGGCGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTG 4865
Query 4878 GTCTACTTCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTAT 4937
|| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4866 GTGTATTTCATTGAACAGGGCAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTATGTTAT 4925
Query 4938 GACTTAATCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATAGACTTT 4997
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4926 GACTTAATCCGACCAGACGTGGCTCTAGAACTTGCCTGGATCAACAATATGATGGACTTT 4985
Query 4998 GCCTTCCCGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATC 5057
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4986 GCCTTCCCGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAGTACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATA 5045
Query 5058 AAGGACAAGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTC 5117
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5046 AAGGACAAGCTTGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTC 5105
Query 5118 ATGTCCCAACAGAACATGTACGCCCAATTATTGCCA-TTGGCTCTACCTGCCCCTCCGAT 5176
|| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| || ||||||| || |||||
Sbjct 5106 ATATCCCAACAGAACATGTATGCCCAAATGTTGCCACTTG-CTTTACCTGCACCACCGAT 5164
Query 5177 GCCAGGAATGGGAGGTGGTGG-G--TATGGTCCGCCACCACCAATGGGCGGAATGCCAGG 5233
||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 5165 GCCAGGAATGGGAGGTGGTGGTGGGTATGGTCCTCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGG 5224
Query 5234 AATGCCTCCAATGCCACCGTATGGAATGCCTCCAATGGGCGGCTACTAAGGTCAGA 5289
||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||
Sbjct 5225 AATGCCTCCCATGCCACCATATGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAAAG-CAGA 5279
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 268944981423
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5