BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg478870

Length=4290
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT3G14460.1 | Symbols:  | LRR and NB-ARC domains-containing dis...  6789    0.0  


> AT3G14460.1 | Symbols:  | LRR and NB-ARC domains-containing disease 
resistance protein | chr3:4851990-4856264 REVERSE LENGTH=4275
Length=4275

 Score = 6789 bits (3676),  Expect = 0.0
 Identities = 4100/4302 (95%), Gaps = 39/4302 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGCGAACTCCTATTTATCAAATTGTGCGAACGTGATGGTTGAACGGATTAATACTTCT  60
             |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGGCGAACTCCTATTTATCAAGTTGTGCAAACGTGATGGTTGAACGGATTAATACTTCT  60

Query  61    CAAGAATTGGTCGAACTATGTAAAGGAAAGTCCTCCAGTGCATTGCTGAAGAGATTGAAG  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CAAGAATTGGTCGAACTATGTAAAGGAAAGTCCTCCAGTGCATTGCTGAAGAGATTGAAG  120

Query  121   GTTGCTTTGGTGACTGCGAACCCGGTGCTTGCGGATGCTGAGCAGAGAGCAGAACATGTT  180
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  121   GTTGCTTTGGTGACTGCAAACCCGGTGCTTGCGGATGCTGATCAGAGAGCAGAACATGTT  180

Query  181   CGGGAAATAAAACATTGGCTTACAGGAATCAAAGATGCTTTCTTCCAGGCAGAGGATGTC  240
             |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  181   CGGGAAGTTAAACATTGGCTTACAGGAATCAAAGATGCTTTCTTCCAGGCAGAGGATATC  240

Query  241   CTTGATGAGTTGCTAACCGAAGCTTTGCGGAGAAGAGTAGTAGCTGAAGCAGGAGGCTTT  300
             ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  241   CTTGATGAGTTGCAAACAGAAGCTTTGAGAAGAAGAGTAGTAGCTGAAGCAGGAGGCTTA  300

Query  301   GGAGGACTATTCCAGAATCTCAGGGCTGGTCGAGAAGCCATCCAGAAAAAGATAGAACCA  360
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  301   GGAGGACTATTCCAGAATCTCATGGCTGGTCGAGAAGCCATTCAGAAAAAGATAGAACCA  360

Query  361   AAGATGGAAAAAGTAGTTAGACTGCTGGAACATCATGTGAAACACATTGAAGTTATTGGA  420
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   AAGATGGAAAAAGTAGTTAGACTACTGGAACATCATGTGAAACACATTGAAGTTATTGGA  420

Query  421   TTGAAAGAATATAGTGAGACTCGAGAACCACAATGGAGACAAGCATCACGGTCAAGACCT  480
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  421   TTGAAAGAATATAGCGAGACTCGAGAACCACAATGGAGGCAAGCATCACGGTCAAGACCT  480

Query  481   GATGATCTTCCACAAGGTAGAGTGGTCGGGCGAGTGGAAGATAAGCTAGCGTTAGTCAAT  540
             ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GATGATCTTCCACAAGGCAGATTGGTCGGGCGAGTGGAAGATAAGCTAGCGTTAGTCAAT  540

Query  541   TTGCTGCTTTCTGATGATGAAATAAGCACTGGGAAACCAACTGTGATCTCCGTAGTTGGT  600
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct  541   TTGCTGCTTTCTGATGATGAAATAAGCATTGGGAAACCAGCTGTTATCTCCGTAGTTGGT  600

Query  601   ATGCCAGGGGTTGGAAAGACTACCTTGACAGAGATAGTTTTTAATGACAACAGGGTGACC  660
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  601   ATGCCAGGGGTTGGAAAGACTACCTTGACAGAGATAGTTTTTAATGACTACAGGGTGACC  660

Query  661   GAACATTTTGATGTTAAAATGTGGATCTCTGCCGGGATAAACTTTAACGTCTTCACGGTT  720
             ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct  661   GAACATTTTGAGGTTAAAATGTGGATCTCTGCTGGGATAAACTTTAATGTCTTTACGGTT  720

Query  721   ACAAAAGCCGTTCTGCAGGATATCACTTCAAGTGTAGTTAATACTGAGGATCTACCTTCA  780
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   ACAAAAGCAGTTCTGCAGGATATCACTTCAAGTGCAGTTAATACTGAGGATCTACCTTCA  780

Query  781   CTTCAAATTCAGCTGAAGAAAACACTCTCGGGGAAGAGATTTTTACTTGTTCTGGATGAT  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   CTTCAAATTCAGCTGAAGAAAACACTCTCGGGGAAGAGATTTTTACTTGTTCTGGATGAT  840

Query  841   TTTTGGTCTGAAAGTGATTCAGAATGGGAAAGTTTCCAGGTCGCCTTTACTGATGCAGAG  900
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   TTTTGGTCTGAAAGTGATTCAGAATGGGAGAGTTTCCAGGTCGCCTTTACTGATGCAGAG  900

Query  901   GAAGGAAGCAAGATTGTTCTAACCACACGAAGTGAAATTGTCTCCACAGTAGCAAAGGCT  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   GAAGGAAGCAAGATTGTTCTAACCACACGAAGTGAAATTGTCTCCACAGTAGCAAAGGCT  960

Query  961   GAAAAAATCTACCAAATGAAGTTGATGACTAATGAAGAATGTTGGGAGCTGATCTCTAGA  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   GAAAAAATCTACCAAATGAAGTTGATGACTAATGAAGAATGTTGGGAGCTGATCTCTAGA  1020

Query  1021  TTTGCATTTGGAAACATATCAGTCGGTTCTATCAACCAAGAACTAGAAGGAATTGGCAAA  1080
             || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  TTCGCTTTTGGAAATATATCAGTCGGTTCTATCAACCAAGAACTAGAAGGAATTGGCAAA  1080

Query  1081  AGGATTGCAGAACAGTGCAAGGGCTTGCCATTAGCTGCACGAGCCATTGCATCTCATCTC  1140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  AGGATTGCAGAACAGTGCAAGGGCTTGCCATTAGCTGCACGAGCCATTGCATCTCATCTC  1140

Query  1141  CGTTCAAAGCCAAATCCTGACGACTGGTATGCTGTATCAAAGAATTTCTCAAGCTACACC  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1141  CGTTCAAAGCCAAATCCTGACGACTGGTATGCTGTATCAAAGAATTTTTCAAGCTACACC  1200

Query  1201  AACAGTATCCTTCCAGTTCTTAAACTAAGCTATGACTCTCTTCCTGCTCAACTTAAGCGA  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1201  AACAGTATCCTTCCAGTTCTTAAACTAAGCTATGACTCTCTTCCTCCTCAACTTAAGCGA  1260

Query  1261  TGCTTTGCCCTCTGCTCAATATTCCCCAAGGGTCATATTTTCGATAGGGAGGAATTAGTA  1320
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1261  TGCTTTGCCCTCTGCTCGATATTCCCCAAGGGTCATGTTTTCGATAGGGAGGAATTAGTA  1320

Query  1321  CTCCTATGGATGGCAATAGACCTCTTATACCAACCAAGGAGCAGCAGAAGATTGGAAGAT  1380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1321  CTCCTATGGATGGCAATAGACCTCTTATACCAACCAAGGAGCAGCAGAAGATTGGAAGAT  1380

Query  1381  ATTGGAAATGATTACCTTGGTGATTTAGTTGCTCAATCtttttttCAGAGATTGGATATC  1440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1381  ATTGGAAATGATTACCTTGGTGATTTAGTTGCTCAATCTTTTTTTCAGAGATTGGATATC  1440

Query  1441  ACCATGACGAGCTTTGTGATGCATGATCTTATGAATGATTTGGCAAAAGCTGTTTCAGGA  1500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1441  ACCATGACGAGCTTTGTGATGCATGATCTTATGAATGATTTGGCAAAAGCTGTTTCAGGA  1500

Query  1501  GATTTTTGTTTCAGACTGGAAGATGACAACATTCCGGAGATACCAAGCACAACTCGACAT  1560
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1501  GATTTTTGTTTCAGACTGGAAGATGACAACATTCCGGAGATACCAAGCACAACTCGACAT  1560

Query  1561  TTTTCTTTTTCTAGAAGCCAATGTGATGCTTCCGTGGCTTTCAGGTCCATCTCTGGAGCT  1620
             ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct  1561  TTTTCATTTTCTAGAAGCCAATGTGATGCTTCTGTGGCTTTTAGGTCCATCTGTGGAGCT  1620

Query  1621  GAGTTTCTGAGAACCATTCTTCCGTTCAACTCGCCAACAAGTCTTGAATCTCTCCAACTA  1680
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1621  GAGTTTCTGAGAACCATTCTTCCTTTCAACTCGCCAACAAGTCTTGAATCTCTCCAACTA  1680

Query  1681  ACAGAAAAAGTTTTGAATCCTTTGCTCCATGCAGTGAGCGGCCTACGAATTCTTAGCTTG  1740
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1681  ACAGAAAAAGTTTTGAATCCTTTGCTCAATGCATTGAGTGGCCTACGAATTCTTAGCTTG  1740

Query  1741  TCTCATTATCAGATAACCAACTTGCCTAAATCATTAAAAGGTTTGAAGCTGTTACGGTAT  1800
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1741  TCTCATTATCAGATAACCAACTTGCCTAAATCGTTAAAAGGTTTGAAGCTTTTACGGTAT  1800

Query  1801  CTAGATTTGTCAAGCACCAAAATAAAAGATCTCCCAGAGTTTGTGTGTACTCTCTGTAAT  1860
             |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1801  CTAGATCTGTCAAGCACCAAAATAAAAGAGCTCCCAGAGTTTGTGTGTACTCTCTGTAAT  1860

Query  1861  CTGCAGACACTATTGTTGTCAAATTGTCGTGACCTCACAAGCCTGCCAAAAAGCATTGCC  1920
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1861  CTGCAGACACTATTGTTGTCAAATTGTCGTGACCTCACAAGCCTGCCAAAAAGCATTGCC  1920

Query  1921  GAACTCATCCATTTGCGCTTCCTTGATCTCGTTGGCACTCCTTTGGTAGAGATGCCACCA  1980
             ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| 
Sbjct  1921  GAACTTATCAATTTGCGCCTCCTTGACCTCGTTGGCACTCCTTTAGTAGAGATGCCACCC  1980

Query  1981  GGAATAAAAAAGCTGCGAAGCTTGCAGAAGTTATCAAATTTTGCTATAGGAAGGCTGAGT  2040
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1981  GGAATAAAAAAGCTGCGAAGCTTGCAGAAGTTATCAAATTTTGTTATAGGAAGGCTGAGT  2040

Query  2041  GGTGCTGGGCTGCATGAGCTCAAAGAACTTTTTCATCTCCGAGGGACACTTCGCATCTCT  2100
             ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2041  GGTGCCGGGCTGCATGAGCTCAAAGAACTTTCTCATCTCCGAGGGACACTTCGCATCTCT  2100

Query  2101  GAGCTACAAAATGTGGCTTTTGCCTCAGAAGCAAAAGACGCTGGTTTGAAAAGAAAGCCA  2160
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2101  GAGCTACAAAATGTGGCGTTTGCCTCAGAAGCAAAAGATGCTGGTTTGAAAAGAAAGCCA  2160

Query  2161  TTCCTTGACGAGTTAATCCTGAAGTGGACTGTCAAAGGTTCTGGCTTCGTCCCTGGTAGT  2220
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2161  TTCCTTGACGGGTTAATCCTGAAGTGGACTGTCAAAGGTTCTGGCTTCGTCCCTGGTAGT  2220

Query  2221  TTTAATGCATTGGCCTGTGACCAGAAAGAGGTCCTAAGGATACTAGAACCCCATCCACAC  2280
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2221  TTTAATGCATTGGCATGTGACCAGAAAGAGGTCCTAAGGATGCTAGAACCCCATCCACAC  2280

Query  2281  TTGAAAACGTTCTGCATTGAATCTTATCAGGGTGGAGCATTTCCGAAGTGGTTGGGTGAT  2340
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2281  TTGAAAACGTTCTGCATTGAATCTTATCAGGGTGGAGCATTTCCTAAGTGGTTGGGTGAT  2340

Query  2341  TCTTCATTCTTCGGTATTGCGTCCGTCACTCTCAGTAGCTGCAACCTCTGCATATCACTG  2400
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2341  TCTTCATTCTTCGGTATTACGTCCGTCACTCTCAGTAGCTGCAACCTCTGCATATCACTG  2400

Query  2401  CCTCCAGTGGGGCAGTTGCCTTCACTCAAGTATCTCAGCATTGAAAAATTTAACATTCTG  2460
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2401  CCTCCAGTGGGGCAGTTGCCTTCACTCAAGTATCTCAGCATTGAAAAATTTAATATTCTG  2460

Query  2461  CAGAAGGTTGGTATAGACTTCTTCTTCGGTGAGAACAAC-CTTAGCTGTGTACCGTTTCA  2519
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||
Sbjct  2461  CAGAAGGTTGGTCTAGACTTCTTCTTCGGTGAGAACAACTCT-AGAGGTGTACCGTTTCA  2519

Query  2520  ATCCTTGCAAACTCTAAAGTTCTATGGCATGCCAAGATGGGAAGAATGGATTTGTCCGGA  2579
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2520  ATCCTTGCAAATTCTAAAGTTCTATGGCATGCCAAGATGGGACGAATGGATTTGTCCGGA  2579

Query  2580  ACTAGAAGGTGGAATCTTTCCTTGCCTCCAAAAACTCATAATACAAAGATGCCCCAGCTT  2639
             |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2580  ACTAGAAGATGGGATCTTTCCTTGCCTCCAAAAACTCATAATACAAAGATGCCCCAGCTT  2639

Query  2640  AACaaaaaaaTTTCCAGAAGGACTCCCTTCTTCCACTGAAGTCACCATCTCTGATTGTCC  2699
             || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2640  AAGAAAAAAGTTTCCAGAAGGACTCCCTTCATCCACTGAAGTCACCATCTCTGATTGTCC  2699

Query  2700  CCTAAGAGCAGTTGCTGGAGGAGAACATTCCTCCAGAAGGAGTCTGACAAATATTCCAGA  2759
             ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2700  CCTAAGAGCAGTTTCTGGAGGAGAAAATTCCTTCAGAAGGAGTCTGACAAATATTCCAGA  2759

Query  2760  AAGTCCAACCAGCATTCCCTCTATGAGCAGAAGGGAACTGTCTTCCCCTACAGGGAATTC  2819
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2760  AAGTCCAGCCAGCATTCCCTCTATGAGCAGAAGGGAACTGTCTTCCCCTACAGGGAATCC  2819

Query  2820  AAAATCTGATGCAAGTACCAGTGCTCAGCCAGGTTTTGCTTCAAGTAGTCAAAGTAATGA  2879
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2820  AAAATCAGATGCAAGTACCAGTGCTCAGCCAGGTTTTGCTTCAAGTAGTCAAAGTAATGA  2879

Query  2880  TGACAATGAAGTAACTTCGACATCAAGCTTGTCATCTTTGCCAAAGGATCGTCCACTGTC  2939
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |    |||
Sbjct  2880  TGACAATGAAGTAACTTCAACATCAAGCTTGTCATCTTTACCAAAGGA-C--C----GTC  2932

Query  2940  ACAAACAGAAGATTTCGACCAATATGAAACTCAACTTGGAAGCTTACCTCAGCATTTTGA  2999
             | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct  2933  A-AA-CAGAAGATTTCGACCAATATGAAACTCAACTTGGAAGCTTACCACAACAATTTGA  2990

Query  3000  AGAACCTGCAGTGATCTCGGCAAGATACTCAGGATATATCTCGGATATACCTAGCTCGTT  3059
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2991  AGAACCTGCTGTGATCTCGGCAAGATACTCAGGATATATCTCGGATATACCTAGCACGTT  3050

Query  3060  AAGTCCGTATATATCAAGAACATCACTTCTTCCCGATCCCAAAAATGAAGGTTC-AGGTC  3118
             |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  ||
Sbjct  3051  AAGTCCGTATATGTCAAGAACATCACTTGTTCCAGATCCCAAAAATGAAGGTTCTAT-TC  3109

Query  3119  TTCCTGGAAGTAGTAGGCTTAGCTACCAGTACCAGCCATATGG-A--AAG-CTTTCTGTT  3174
             |||||||||||||||| || | |  | ||||||| | |||||| |  ||| | | |||||
Sbjct  3110  TTCCTGGAAGTAGTAG-CT-A-C--C-AGTACCATCAATATGGGATTAAGTCAT-CTGTT  3162

Query  3175  CGGAGTCCACCATCAAGTGATA-CAGATAACAAAAAGCTTTCACAATATGATGATGA--A  3231
             | ||||||||  |||||||| | || |||| |    ||  |||||||||||||||||  |
Sbjct  3163  CCGAGTCCACGGTCAAGTGA-AGCA-ATAA-A----GCCGTCACAATATGATGATGATGA  3215

Query  3232  A-CAGGCATGGACTATTTGAAAGTGACAGAGATCTCTCACCTCATGGAGCTTCCTCAAAA  3290
             | ||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  3216  AACAGACATGGAATATTTAAAAGTGACAGACATATCTCACCTCATGGAGCTTCCTCAGAA  3275

Query  3291  TCTACAGTCACTCCACATCGACAGCTGCGATGGACTCACTTCCTTACCAGAGAACTTAAC  3350
             ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3276  TCTGCAGTCACTCCACATCGACAGCTGCGACGGACTCACTTCCTTACCGGAGAACTTAAC  3335

Query  3351  AGAAAGCAATCCAAATCTCCATGAACTGA-TCATCATTGCTTGTCACTCTCAAAAATCTT  3409
             ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||
Sbjct  3336  AGAAAGCTATCCAAACCTCCATGAACT-ACTCATCATTGCTTGTCATTCTCTAGAATCTT  3394

Query  3410  TCCCTGGAAGCCACCCTCCAACCACATTGAAAACCTTATACATAAGAGACTGCAAGAAAC  3469
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3395  TCCCTGGAAGCCACCCTCCAACCACATTGAAAACCTTATACATAAGAGACTGCAAGAAAC  3454

Query  3470  TAGATTTCGCAGAGAGTTTGCAGCCAACACGAAGTTACTCACAGCTCGAATACCTGTTCA  3529
             || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct  3455  TAAATTTCACAGAGAGTTTGCAACCAACACGAAGTTACTCACAGCTCGAGTACCTTTTCA  3514

Query  3530  TCGGAAGTAGCTGCAGCAATCTCGTCAACTTCCCTCTATCCTTATTTCCGAAGCTCAAAA  3589
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||
Sbjct  3515  TCGGAAGTAGCTGCAGCAATCTCGTCAATTTCCCTCTATCATTGTTTCCGAAGCTGAGAA  3574

Query  3590  GCCTCTCGATTAGGGATTGTGAAAGCTTCAAAACTTTCTCAATTCACGCAGGACTTGGAG  3649
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct  3575  GCCTCTCAATTAGGGATTGTGAAAGCTTCAAAACTTTCTCGATTCACGCAGGACTCGGAG  3634

Query  3650  ACGATCGTATCGCTCTCGAGTCTCTTGAAATTAGGGATTGTCCAAATCTGGTAACTTTCC  3709
             ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct  3635  ACGATCGTATCGCACTCGAGTCTCTTGAGATTAGGGATTGCCCAAATCTGGAAACTTTCC  3694

Query  3710  CACAAGGAGGACTTCCAACACCGAAACTCTCTTCAATGTTACTCTCTAACTGCAAAAAGC  3769
             |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3695  CACAAGGAGGCCTTCCAACACCGAAACTTTCTTCAATGTTACTCTCAAACTGCAAAAAGC  3754

Query  3770  TCCGAGCTTTACCGGAGAAATTGTTCGGACTCACTTCTCTCTTGTCACTGTTTATAATCA  3829
             | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3755  TTCAAGCTTTACCTGAGAAATTGTTTGGACTCACTTCTCTCTTGTCACTGTTTATAATCA  3814

Query  3830  AATGCCCAGAAATCGAGACGATCCCAGGTGGAGGGTTTCCGAGTAATCTCCGAACACTTT  3889
             |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||
Sbjct  3815  AATGCCCAGAAATCGAGACGATTCCTGGTGGAGGGTTCCCAAGTAATCTTCGAACACTTT  3874

Query  3890  GCATCAGCCTTTGCGACAAGCTTACACCGAGAATCGAATGGGGATTGAGAGATTTGGAAA  3949
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  3875  GCATCAGCCTTTGCGACAAGCTTACACCGAGAATCGAATGGGGATTGAGAGATTTGGAGA  3934

Query  3950  ATCTTCGAAATCTTGAGATTGAAGGAGGTAACGAAGACATTGAATCGTTTCCAGATGAAG  4009
             ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct  3935  ATCTTCGAAATCTCGAGATTGATGGAGGAAACGAAGACATTGAATCGTTTCCTGAGGAAG  3994

Query  4010  GGTTATTGCCAAAAGG-GATTATTTCTCTGAGGATTAGTCGTTTCGAGAACCTCAAGACT  4068
             |||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3995  GGTTATTGCCAAAAAGTGTTT-TTTCTCTGCGGATTAGTCGTTTCGAGAACCTCAAGACT  4053

Query  4069  CTGAATCGAAAAGGGTTTCAAGATACAAAAGCTATTGAGACGATGGAGATCAACGGCTGT  4128
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  4054  CTGAATCGAAAAGGGTTTCATGATACAAAAGCTATTGAGACGATGGAGATCAGCGGCTGT  4113

Query  4129  GATAAGCTACAGATATCGATAGATGAAGATCTTCCTCCTTTGTCTTGTCTGAGAATAAGC  4188
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4114  GATAAGCTACAGATATCGATAGATGAAGATCTTCCTCCTTTGTCTTGTCTGAGAATAAGC  4173

Query  4189  TCATGTTCATTGTTGACTGAGAGTTTTGCTGAAGCAGAAACAGAGTTCTTCAAGGTTTTG  4248
             |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4174  TCATGTTCTTTGTTGACTGAGACTTTTGCTGAAGTGGAAACAGAGTTCTTCAAGGTTTTG  4233

Query  4249  AACATTCCACATGTGGAAATTGACGGCGAGATCTTCTCTTGA  4290
             ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct  4234  AACATTCCATACGTGGAAATCGATGGCGAGATCTTCTCTTGA  4275



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 213861678009


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5