BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479043
Length=3885
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G15880.2 | Symbols: WSIP2, TPR4 | WUS-interacting protein 2 ... 6122 0.0
AT3G15870.1 | Symbols: | Fatty acid desaturase family protein ... 302 2e-80
> AT3G15880.2 | Symbols: WSIP2, TPR4 | WUS-interacting protein
2 | chr3:5364081-5372289 REVERSE LENGTH=3975
Length=3975
Score = 6122 bits (3315), Expect = 0.0
Identities = 3678/3850 (96%), Gaps = 37/3850 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCATAAATAGCCCCCACG--tctctctctctcttctccaaag---tcttcttcttcttct 55
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4 CCATAAATAGCCCCCACGTCTCTCTCTCTCTCTTCTCCAAAGTCTTCTTCTTCTTCTTCT 63
Query 56 tc--ctt-ctc-tc-tgct-tc-g--tcgtctctctccttcttcAAAGTCAAAATTCAAC 106
|| ||| ||| || | || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TCTTCTTCCTCTTCTTCCTCTCTGCTTTGTCTCTCTCCTTCTTCAAAGTCAAAATTCAAC 123
Query 107 AGCGGTTCATGAGTGGTATTGTGATCGATTTGGAGAGC-AGCAATA-AG-AAG-AACAAG 162
|| |||||||||||||||||||||||||| | | | | | | || || || |||
Sbjct 124 AGTGGTTCATGAGTGGTATTGTGATCGATCT-GTTA-CTTTC-GGAGAGCGAGCAATAAG 180
Query 163 -AGAGGATATGTCGTCACTCAGCAGAGAACTCGTGTTTTTGATACTTCAGTTTCTCGATG 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 181 AAGAGGATATGTCGTCACTCAGCAGAGAACTCGTGTTTTTAATACTTCAGTTTCTCGATG 240
Query 222 AAGAGAAATTCAAAGAGACTGTTCACAGGTTGGAGAAGGAGTCTGGTTTTTTCTTCAACA 281
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAGAGAAATTCAAAGATACTGTTCACAGGTTGGAGAAAGAGTCTGGTTTTTTCTTCAACA 300
Query 282 TGAGGTACTTTGAAGATAGTGTAACAGCTGGTGAATGGGATGATGTAGAGAAGTACCTTT 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 301 TGAGGTACTTTGAAGATAGTGTAACAGCTGGTGAATGGGATGATGTAGAGAAGTATCTTT 360
Query 342 CTGGATTCACTAAAGTTGATGATAATAGATACTCCATGAAGATATTTTTCGAGATTCGGA 401
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTGGATTCACTAAAGTTGATGATAATAGATACTCTATGAAAATATTTTTCGAGATTCGGA 420
Query 402 AGCAGAAATACCTTGAAGCACTTGACAAGAAAGATCATGCCAAGGCGGTTGAAATTCTTG 461
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 421 AGCAGAAGTACCTTGAAGCACTTGACAAGAAAGATCATGCCAAGGCGGTTGATATTCTTG 480
Query 462 TTAAGGAGTTAAAAGTGTTCTCCACATTCAACGAAGAGCTTTTTAAGGAGATTACCATGC 521
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTAAGGAGTTGAAAGTGTTCTCGACATTCAACGAAGAGCTTTTTAAGGAGATTACCATGC 540
Query 522 TTTTAACTTTAACAAACTTCAGGGAAAATGAGCAGCTTTCCAAGTATGGAGATACTAAGT 581
||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTTTAACCTTGACTAACTTCAGGGAAAATGAGCAGCTTTCCAAGTATGGAGATACTAAGT 600
Query 582 CCGCAAGAGGTATCATGCTGGGGGAACTTAAAAAACTGATTGAGGCAAATCCTCTCTTCC 641
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 601 CCGCAAGAGGTATCATGCTTGGGGAACTTAAAAAACTGATTGAAGCAAATCCTCTCTTCC 660
Query 642 GAGACAAACTTCAGTTTCCCAGTTTGAAGAATTCAAGATTGAGAACCTTAATTAATCAAA 701
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 661 GAGACAAACTTCAATTTCCCAGTTTGAAGAATTCTAGATTGAGAACCTTAATAAATCAAA 720
Query 702 GTTTGAACTGGCAGCATCAGCTTTGCAAGAACCCAAGGCCTAACCCGGATATAAAAACAC 761
||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTTTGAACTGGCAACATCAGCTTTGCAAGAATCCTAGGCCTAACCCGGATATAAAAACAC 780
Query 762 TCTTTGTTGACCATACGTGTGGGCATCCAAATGGTGCACACACT-C--CCCCTACAACTA 818
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 781 TATTTGTTGACCATACGTGTGGGCATCCCAATGGTGCACACACTCCTTCCCCTACAACTA 840
Query 819 ATCATTTAATGGGTTCAGTCCCTAAAGTTGGAGGCTTCCCACCATTAGGTGCTCACGGCC 878
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 841 ATCATTTAATGGGTTCAGTCCCTAAAGTTGGAGGCTTCCCACCATTAGGTGCTCACGGTC 900
Query 879 CATTTCAGCCAACACCAGCTCCTCTTACAACATCTCTTGCAGGATGGATGCCTAATCCAT 938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CATTTCAGCCAACACCAGCTCCTCTTACAACATCTCTTGCAGGATGGATGCCTAATCCAT 960
Query 939 CGGTACCACACCCTACTGTTTCCGCTGGGCCTATCGGCTTAGGTGCCCCCAACAGTGCTG 998
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CGGTACAACACCCTACTGTTTCCGCTGGGCCTATCGGCTTAGGTGCCCCCAACAGTGCTG 1020
Query 999 TGTCTATGTTAAAGCGTGAGCGTCCCAGGAGTCCTCCAACTAATAGCCTATCAATGGATT 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGTCTATGTTAAAGCGTGAGCGTCCCAGGAGTCCTCCAACTAATAGCCTATCAATGGATT 1080
Query 1059 ATCAGACGGCAGATTCTGAAAGTGTGTTGAAGAGACCCAGACCTTTTGGTATATCAGATG 1118
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1081 ATCAGACGGCAGATTCTGAAAGTGTGTTGAAGAGACCCAGACCTTTTGGTATTTCAGATG 1140
Query 1119 GGGTTAATAATCTTCCAGTCAATGTCTTGCCAGTCACATATCCAGGGCAAAGCCATGCTC 1178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGGTTAATAATCTTCCAGTCAATGTCTTGCCAGTCACATATCCAGGGCAAAGCCATGCTC 1200
Query 1179 ATGCAACTTATTCTACTGATGACTTGCCCAAAAATGTTAGCAGGATTTTGAGTCAGGGTT 1238
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 ATGCAACTTATTCTACTGATGACTTGCCCAAAAACGTTAGCAGGATTTTGAGTCAGGGTT 1260
Query 1239 CTGCCATTAAGAGCATGGATTTTCATCCAGTACAGCAAACTATGCTCCTTGTTGGCACCA 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CTGCCATTAAGAGCATGGATTTTCATCCAGTACAGCAAACTATGCTCCTTGTTGGCACCA 1320
Query 1299 ATCTTGGTGATATCGCAATATGGGAGGTGAGTAGCAGGGAGAAGCTCGTTTCTAGAAGCT 1358
||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 ATCTTGGTGATATTGCAATATGGGAGGTGGGTAGCAGGGAGAAGCTCGTTTCTAGAAGCT 1380
Query 1359 TTAAAGTTTGGGATCTTGCTACTTGCACTGTGAATCTTCAGGCTTCACTTGCTAGCGAGT 1418
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TTAAAGTTTGGGATCTTGCTACTTGCACTGTGAACCTTCAGGCTTCACTTGCTAGCGAGT 1440
Query 1419 ATACTGCAGCAGTAAACCGAGTTGTTTGGAGTCCTGATGGAGGGCTACTGGGTGTCGCAT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1441 ATACTGCAGCAGTAAACCGAGTTGTTTGGAGTCCTGATGGAGGTCTACTGGGTGTCGCAT 1500
Query 1479 ATTCCAAGCATATTGTGCATATATATTCATATCATGGTGGCGAAGATCTGCGGAATCATC 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||
Sbjct 1501 ATTCCAAGCATATTGTGCATATATATTCATATCATGGTGGCGAGGATTTACGGAATCATC 1560
Query 1539 TAGAGATTGATGCTCATGCTGGTAATGTCAATGATCTTGCTTTCTCCCAACCAAACCAGC 1598
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TAGAGATTGATGCCCATGCTGGTAATGTCAACGATCTTGCTTTCTCCCAACCAAACCAGC 1620
Query 1599 AATTATGTGTTGTGACTTGTGGAGAAGACAAGACAATCAAGGTTTGGGATGCTGTTACCG 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1621 AATTATGTGTTGTGACTTGTGGAGAAGACAAGACAATCAAGGTCTGGGATGCTGTTACCG 1680
Query 1659 GAAATAAACTGCACACTTTTGAAGGTCATGAGGCACCTGTTTATTCTGTGTGCCCACACC 1718
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1681 GAAATAAATTGCACACTTTTGAAGGTCATGAGGCACCTGTTTATTCCGTGTGCCCACACC 1740
Query 1719 AGAAAGAGAATATTCAGTTCATATTCTCAACTGCTGTTGATGGGAAAATAAAGGCTTGGT 1778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AGAAAGAGAATATTCAGTTCATATTCTCAACTGCTGTTGATGGGAAAATAAAGGCTTGGT 1800
Query 1779 TATATGACAACATGGGTTCTAGAGTAGATTATGATGCCCCCGGTCGATCTTGCACGGCAA 1838
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1801 TATATGACAACATGGGTTCTAGAGTGGATTATGATGCCCCCGGTCGATCTTGCACGTCGA 1860
Query 1839 TGGCATATTGTGCTGACGGGACTAGATTATTCTCTTGTGGTACTAGTAAGGAGGGGGAAT 1898
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1861 TGGCATATTGTGCTGATGGGACTAGATTATTTTCTTGTGGTACTAGTAAGGAGGGGGAGT 1920
Query 1899 CATTCATTGTTGAATGGAATGAAAGTGAAGGAGCTGTGAAGCGGACTTATCTTGGACTTG 1958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1921 CATTCATTGTTGAATGGAATGAAAGTGAAGGAGCTGTGAAGCGGACTTATCTTGGACTGG 1980
Query 1959 GGAAACGTTCTGCGGGGGTTGTCCAGTTCGATACCATGAAGAATAAATTTTTGGTAGCTG 2018
||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GGAAACGGTCTGTGGGGGTTGTCCAGTTCGACACCATGAAGAATAAATTTTTGGTAGCTG 2040
Query 2019 GTGATGAGTTCCAAGTCAAATTTTGGGATATGGATAGTGTTGATCTCTTGAGTTCAACGG 2078
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GTGATGAATTCCAAGTCAAATTTTGGGATATGGATAGTGTTGATCTCTTGAGTTCAACGG 2100
Query 2079 CTGCAGAAGGGGGTTTGCCGTCTTCCCCTTGCTTAAGGATCAATAAAGAAGGAACTCTGC 2138
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 CTGCAGAAGGGGGTTTACCGTCTTCCCCTTGCTTAAGGATCAATAAAGAAGGAACTCTGC 2160
Query 2139 TGGCTGTCTCAACTACTGATAATGGAATTAAGATACTAGCGAATGCTGAAGGTTCCAGAC 2198
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 TGGCCGTCTCAACTACTGATAACGGAATTAAGATTCTAGCGAATGCTGAAGGTTCCAGAA 2220
Query 2199 TTTTGCACTCCATGGCAAACCGTGGACTTGACAGCTCTAGAGCTCCTCCTGGGTCAGTTG 2258
||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTTTGCATTCCATGGCAAACCGTGGCCTTGATAGCTCTAGAGCTCCTCCTGGGTCAGTTG 2280
Query 2259 CTAAGGGTCCTATTGTTGGCACATTTGGCACTTCAAGTTCAAGCACTGGAATGAGTCTAT 2318
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 CTAAGGGTCCTATTGTTGGCACATTTGGCACTCCAAATTCAAGCACTGGAATGAGTCTAT 2340
Query 2319 CAATGGCTGAAAGAAGTGGACCAGTGGCATCTGTTACTGGATTGAATGGAGATAATCGCA 2378
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 CAATGGGTGAAAGAAGTGGACCAGTGGCATCTGTTACTGGATTGAATGGAGATAATCGCA 2400
Query 2379 GTCTGCCAGATGTCAAACCACGAATCGCTGATGAGGCAGAGAAATCAAAGACTTGGAAGC 2438
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 GTCTGCCAGATGTCAAACCACGAATCGCTGATGATGCAGAGAAATCAAAGACTTGGAAGC 2460
Query 2439 TGACAGAGATCAGCGAACGTTCCCAGCTTCGTACTCTGCGGCTTCCTGACACCCTGCTAC 2498
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 TGACTGAGATCAGTGAACGTTCCCAGCTTCGTACTCTGCGGCTTCCTGACACCCTGCTAC 2520
Query 2499 CAGCAAGAGTTGTTAAGTTGATATATACAAATTCTGGAGGTGCTGTATTAGCATTAGCAG 2558
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 2521 CAGCAAGAGTTGTTAAGTTGATATATACAAATTCTGGAGGTGCTATATTGGCATTAGCAG 2580
Query 2559 AAAATGCTGCACATAAACTATGGAAATGGCAAAAGAGTGAGCGGAATCTTTTGGGAAAGG 2618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 AAAATGCTGCACATAAACTATGGAAATGGCAAAAGAGTGAGCGGAATCTTTTGGGAAAGG 2640
Query 2619 CAAATAGCAATGTCCCACCACAGCTTTGGCAGCCATCTAGTGGAGTATTAATGACAAATG 2678
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 CAAACAGCAATGTCCCACCACAGCTTTGGCAGCCATCTAGTGGAGTATTAATGACAAATG 2700
Query 2679 ACACACGCGAGGGAAACAAAGAGGATGTAGTTCCATGTTTTGCACTCTCAAAAAATGATT 2738
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 ATACACGTGAGGGAAACAAAGAGGATGTAGTTCCATGCTTTGCACTCTCAAAAAATGATT 2760
Query 2739 CTTATGTCATGTCAGCCTCAGGAGGAAAAATTTCCTTGTTCAACATGATGACTTTTAAGA 2798
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 CTTATGTCATGTCAGCCTCTGGAGGAAAAATTTCCTTATTCAACATGATGACTTTTAAGA 2820
Query 2799 CGATGACGACATTCATGGCGCCTCCTCCAGCAGCGACTTCCCTTGCCTTCCATCCTCAAG 2858
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 CGATGACGACATTCATGGCTCCTCCTCCAGCAGCGACTTCCCTTGCCTTCCATCCTCAAG 2880
Query 2859 ACAATAATATTATTGCTATCGGAATGGATGACTCGTCTATTCAAATCTACAATGTCAGAG 2918
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 ACAATAATATAATTGCTATCGGAATGGATGACTCTTCTATTCAAATCTACAATGTCAGAG 2940
Query 2919 TCGATGAGGTTAAAAGTAAATTGAAAGGTCATCAGAAGAGAGTGACTGGATTAGCATTCT 2978
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2941 TTGATGAGGTTAAAAGTAAATTGAAAGGTCATCAGAAGAGAGTGACTGGTTTAGCATTCT 3000
Query 2979 CAAACGTTCTAAATGTTCTTGTTTCCTCTGGTGCTGATTCTCAGCTTTGTGTATGGAGCA 3038
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 CAAACGTGCTAAATGTTCTTGTTTCCTCTGGTGCTGATTCTCAGCTTTGTGTATGGAGCA 3060
Query 3039 TGGATGGATGGGAAAAGCAAGCTAGCAAACAGATACAAATCCCAAGCGGGCATTCGCCAA 3098
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3061 TGGATGGATGGGAAAAACAAGCTAGCAAACAGATACAAATTCCAAGCGGGCATTCACCAA 3120
Query 3099 ACCCACTTGCTCATACACGCGTTCAGTTCCATCAGGACCAGACACATGTGCTTGTTGTCC 3158
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 3121 ATCCACTTGCTCATACACGCGTTCAGTTCCATCAAGACCAGATACATGTACTTGTTGTCC 3180
Query 3159 ATGCCAGCCAGTTAGCCATATACGAGGCTCCTAAATTAGAGAGCATGAAGCAGTGGATAC 3218
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3181 ATGCCAGCCAGTTAGCCATATATGAGGCTCCTAAATTAGAGAACATGAAGCAGTGGATAC 3240
Query 3219 CGAAGGAGTCAAGTGGTTCAGTCACAGATGCTGTATATTCATGTGATAGCCAGTCAATAT 3278
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3241 CGAAAGAGTCAAGTGGTTCAGTCACAGATGCAGTATATTCATGTGATAGCCAGTCAATCT 3300
Query 3279 ATGCAGCCTTTGATGATGGAAGTGTGAGTATCTTGACGGCAACAACATTGCAACTGAAGT 3338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301 ATGCAGCCTTTGATGATGGAAGTGTGAGTATCTTGACGGCAACAACATTGCAACTGAAGT 3360
Query 3339 GCCGCATTGGTCCCAATTCATATTTGCCTTCAAACCCGAGCTCGAGAGTATATCCAGCCA 3398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 GCCGCATTGGTCCCAATTCATATTTGCCTTCAAACCCGAGCTCGAGAGTATATCCAGCCA 3420
Query 3399 CAATCGCAGCACATCCATCTGAACCAAACCAATTTGCAGTTGGGCTAACCGATGGTGGGG 3458
|| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3421 CAGTTGCAGCACATCCGTCTGAACCAAACCAGTTTGCAGTTGGACTAACCGATGGTGGGG 3480
Query 3459 TCCACGTGATCGAACCGCCAGGTCCAGAGGGGAAGTGGGGAATGTCCCCACCACCAGAAA 3518
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 3481 TCCACGTGATCGAACCACCAGGTCCAGAAGGGAAGTGGGGAATATCCGCACCACCAGAAA 3540
Query 3519 ACGGCGCAGGGCCAAGCGTCTCCTCAGCACCCGGGTCAGATCAACAACAGAGAAAGAAAT 3578
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |
Sbjct 3541 ACGGAGCAGGGCCAAGCGTCTCCTCAGCTCCCGGGTCAGATCAACAACCGAGTGATTCGT 3600
Query 3579 AG--GGATG-TGGAGATGCAGGAGGAGCAGAGATCAGACCAAAGCCATTCTCTTT-TTCT 3634
|| ||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |
Sbjct 3601 AGTTGGA-GATGGA-A-GCAGGAGGAGCAGAGATCAAACCAAAGCCTTTCCCTTCATT-T 3656
Query 3635 GAGATTCAGTAGGTAACTTTACGTTGGTGGCCAAACCAATAGCTTCAAGAAACCTAATGA 3694
||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3657 GAGTTTCAGTAGGTAACTTAACGTTAGTGGCCAAACCAATAGCTTCAAGAAATCTAATGA 3716
Query 3695 GATACCAAGTAACGTCGAGCTGCCACCACTCGAGTCCATGCCTGGCCGAGAACTCGAACG 3754
|| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3717 GACACCAAGTAATGTCGAGCTGCCACCATTCGAGTCCATGCCTGGCCGAGAACTCGAACG 3776
Query 3755 CATGATGATTGTTATGCCATCCCTCGCCATGTGTTATCATGGCTACCCACCT-A-AT-T- 3810
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | || |
Sbjct 3777 CATGATGATTGTTATGCCATCCCTCGCCAAGTGTTAAAATTGCTACCCACCTGATATATT 3836
Query 3811 CATCACCAAT 3820
||||||||||
Sbjct 3837 CATCACCAAT 3846
> AT3G15870.1 | Symbols: | Fatty acid desaturase family protein
| chr3:5362888-5364544 FORWARD LENGTH=1228
Length=1228
Score = 302 bits (163), Expect = 2e-80
Identities = 201/219 (92%), Gaps = 3/219 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 3593 GCAGGAGGAGCAGAGATCAGACCAAAGCCATTCTCTT-TTTCTGAGATTCAGTAGGTAAC 3651
||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||
Sbjct 1125 GCAGGAGGAGCAGAGATCAAACCAAAGCCTTTCCCTTCATT-TGAGTTTCAGTAGGTAAC 1067
Query 3652 TTTACGTTGGTGGCCAAACCAATAGCTTCAAGAAACCTAATGAGATACCAAGTAACGTCG 3711
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1066 TTAACGTTAGTGGCCAAACCAATAGCTTCAAGAAATCTAATGAGACACCAAGTAATGTCG 1007
Query 3712 AGCTGCCACCACTCGAGTCCATGCCTGGCCGAGAACTCGAACGCATGATGATTGTTATGC 3771
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 AGCTGCCACCATTCGAGTCCATGCCTGGCCGAGAACTCGAACGCATGATGATTGTTATGC 947
Query 3772 CATCCCTCGCCATGTGTTATCATGGCTACCCACCTAATT 3810
|||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||
Sbjct 946 CATCCCTCGCCAAGTGTTAAAATTGCTACCCACC-AATT 909
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 193544066094
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5