BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479052
Length=3211
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G15980.5 | Symbols: | Coatomer, beta' subunit | chr3:541129... 5297 0.0
AT1G52360.2 | Symbols: | Coatomer, beta' subunit | chr1:194993... 3517 0.0
> AT3G15980.5 | Symbols: | Coatomer, beta' subunit | chr3:5411292-5418493
REVERSE LENGTH=3356
Length=3356
Score = 5297 bits (2868), Expect = 0.0
Identities = 3131/3251 (96%), Gaps = 46/3251 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCTCCGCCGTATTAATACAAGCTCTCTGAACGCACTCTACGACGAGCCTAACGTCTTTC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 ATCTCCGCCGTATTAATACAAGCTCTCTGAACGCACTCTACGACGAGCCTAACGTCTTTC 108
Query 61 TCCGATCGCCGGTTAGCAGATTTAAGCGAAATACGAGATCCGACGAGCAGATCTTCTGCT 120
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 TCCGATCGCCGGTTAGCAGATTCAAGCGAGATACGAGATCCGACGAGCAGATCTTCTGCT 168
Query 121 TGATCTGTAAACATGCCTCTCAGACTCGATATCAAGAGAAAATTTGCTCAACGATCAGAG 180
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 169 TAATCTGTAAACATGCCTCTCAGACTAGATATCAAGAGAAAGTTTGCTCAACGATCAGAG 228
Query 181 AGAGTCAAATCTGTTGATCTGCATCCTACTGAACCATGGATTCTAGCAAGTTTGTATGCT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 229 AGAGTCAAATCTGTTGATCTGCATCCTACTGAACCATGGATTCTAGCAAGTTTGTATTCT 288
Query 241 GGAACCGTGTGTATTTGGAACTACCAGACACAGACGATTACAAAATCCTTCGAGGTGACC 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 GGAACCGTGTGTATTTGGAACTACCAGACACAGACGATTACAAAATCCTTCGAGGTGACG 348
Query 301 GACTTGCCAGTTAGGTCAGCCAAGTTTATTCCGCGCAAGCAATGGGTTGTTGCTGGAGCG 360
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 349 GAATTGCCAGTTAGGTCGGCCAAGTTTATTCCGCGCAAGCAATGGGTTGTGGCTGGAGCG 408
Query 361 GATGACATGCACATCCGTGTATACAATTACAATACGATGGACAAGGTCAGAGTATTTGAG 420
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 409 GATGATATGTACATCCGTGTATACAATTACAATACAATGGACAAGGTCAAAGTATTTGAG 468
Query 421 GCTCATTCGGATTACATTAGGTGTGTAGCTGTCCATCCGACCCTTCCATATGTGCTGTCA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 GCTCATTCGGATTACATTAGGTGTGTAGCTGTCCATCCGACCCTTCCATATGTGCTGTCA 528
Query 481 TCTTCTGATGATATGCTCATAAAGCTTTGGGACTGGGAAAACGGTTGGGCTTGTACTCAG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 TCTTCTGATGATATGCTCATAAAGCTTTGGGACTGGGAAAACGGTTGGGCTTGTACTCAG 588
Query 541 ATATTTGAGGGGCATTCGCACTATGTGATGCAAGTGGTATTTAATCCAAAAGATACCAAC 600
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 ATATTTGAGGGACATTCGCACTATGTGATGCAAGTGGTATTTAATCCAAAAGATACCAAC 648
Query 601 ACTTTTGCCAGTGCATCGCTTGATCGTACCATAAAGATATGGAATCTTGGTTCCCCAGAC 660
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 ACTTTTGCCAGTGCTTCGCTTGATCGTACCATAAAGATATGGAATCTTGGTTCCCCAGAC 708
Query 661 CCAAATTTTACACTGGATGCTCATCAGAAAGGAGTCAACTGTGTAGATTATTTCACAGGG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 CCAAATTTTACACTGGATGCTCATCAGAAAGGAGTCAACTGTGTAGATTATTTCACAGGG 768
Query 721 GGTGATAAACCCTACCTAATTACCGGCTCTGATGATCATACTGCTAAGGTATGGGACTAT 780
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 GGTGATAAACCCTATCTAATTACCGGCTCTGATGATCATACTGCTAAGGTATGGGACTAT 828
Query 781 CAAACCAAAAGTTGTGTCCAGACGCTAGATGGGCACACACACAATGTTTCTGCCGTATGT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 CAAACCAAAAGTTGTGTCCAGACGCTAGATGGGCACACACACAATGTTTCTGCCGTATGT 888
Query 841 TTCCACCCAGAACTTCCAATAATAATCACAGGTTCTGAGGATGGCACTGTTCGCATTTGG 900
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCCATCCAGAGCTTCCAATAATAATCACAGGTTCTGAGGATGGCACTGTTCGCATTTGG 948
Query 901 CACGCCACGACTTACAGGCTAGAAAACACATTGAATTATGGTCTCGAGAGAGTTTGGGCC 960
|||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 CACGCCACTACCTACAGGCTAGAAAACACATTAAATTATGGTCTCGAGAGAGTTTGGGCC 1008
Query 961 ATTGGTTACATCAAAAGTTCGCGGCGGGTTGTGATTGGATATGATGAAGGAACCATCATG 1020
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 ATTGGTTACATCAAAAGTTCTCGGCGGGTTGTGATTGGATATGATGAAGGAACCATCATG 1068
Query 1021 GTTAAGCTTGGACGAGAAATTCCTGTCGCTAGCATGGACAGTAGCGGAAAAATCATATGG 1080
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GTTAAACTTGGACGAGAAATTCCTGTCGCTAGCATGGACAGTAGCGGAAAAATCATATGG 1128
Query 1081 GCTAAGCATAATGAAATTCAAACTGCAAACATCAAAAGTATTGGTGC--G----G-G--- 1130
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |
Sbjct 1129 GCTAAGCATAATGAAATTCAAACCGCAAACATCAAAAGTATTGGTGCAGGTTACGAGCTT 1188
Query 1131 -------T-TA-C-GAGGTTACTGATGGAGAAAGACTTCCCTTGTCTGTTAAAGAGTTGG 1180
| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 TCATCTCTCTACCTTAGGCTACTGATGGAGAAAGACTTCCCTTGTCTGTTAAAGAGTTGG 1248
Query 1181 GGACCTGTGATCTTTAT---C--C-A--C--A-----A-AGCTTGAAGCACAACCCTAAT 1224
||||||||||||||||| | | | | | | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 GGACCTGTGATCTTTATCCACAACTATTCTAACTCTCAGAGCTTGAAGCACAACCCTAAT 1308
Query 1225 GGGAGGTTTGTCGTAGTCTGCGGTGATGGAGAGTACATAATCTACACAGCTTTGGCTTGG 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1309 GGGAGGTTTGTCGTAGTCTGCGGTGATGGAGAGTACATAATCTACACTGCTTTGGCGTGG 1368
Query 1285 AGAAATAGATCTTTTGGGTCTGGCCTGGAATTTGTTTGGTCATCCGAGGGGGAATGTGCG 1344
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1369 AGAAATAGATCTTTTGGGTCTGGCCTGGAATTTGTTTGGTCATCTGAGGGGGAATGTGCG 1428
Query 1345 GTTAGAGAAAGCTCATCAAAGATAAAGATATTCAGTAAAAATTTCCAGGAAAGGAAGAGT 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 GTTAGAGAAAGCTCATCAAAGATAAAGATATTCAGTAAAAATTTCCAGGAAAGGAAGAGT 1488
Query 1405 ATCCGGCCTACTTTCTCAGCTGAGAAGATTTTTGGAGGAACCTTGTTAGCAATGTGTTCG 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 ATCCGGCCTACTTTCTCAGCTGAGAAGATTTTTGGAGGAACCTTGTTAGCAATGTGTTCG 1548
Query 1465 AATGATTTCATCTGCTTCTATGATTGGGCTGAATGCAGGCTGATTCAACAAATTGATGTC 1524
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 AATGATTTCATCTGCTTCTATGATTGGGCCGAATGCAGGCTGATTCAACAAATTGATGTC 1608
Query 1525 ACCGTAAAGAATCTTTATTGGGCTGAAAGTGGTGATTTAGTAGCCATTGCTAGTGATTCG 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1609 ACCGTAAAGAATCTTTATTGGGCTGAAAGTGGTGATTTAGTAGCCATTGCTAGTGATACG 1668
Query 1585 TCATTCTACATCTTGAAGTACAATCGCGACTTGGTTTCCTCACATTTTGATAGTGGAAGA 1644
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1669 TCATTCTACATCTTGAAGTACAATCGAGAGTTGGTTTCCTCGCATTTTGATAGTGGAAGA 1728
Query 1645 CCAACTGATGAAGAGGGTGTTGAGGATGCTTTTGAGGTTCTCCACGAGAATGATGAACGT 1704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 CCAACTGATGAAGAGGGTGTTGAGGATGCTTTTGAGGTTCTCCACGAGAATGATGAACGT 1788
Query 1705 GTTAGGACAGGTATATGGGTTGGGGACTGCTTCATTTACAACAACTCTTCTTGGAAGCTT 1764
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 GTTAGGACCGGTATATGGGTTGGGGACTGCTTCATTTACAACAACTCTTCTTGGAAGCTT 1848
Query 1765 AACTATTGTGTTGGAGGCGAGGTAACCACAATGTATCATTTAGACCGCCCAATGTATTTG 1824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1849 AACTATTGTGTTGGAGGCGAGGTAACCACAATGTATCATTTGGACCGCCCAATGTATTTG 1908
Query 1825 TTAGGCTATATTGCCAACCAAAGCCGGGTGTT-CTTGGTAGACAAAGAATTCAATGTCAT 1883
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 TTAGGCTATATTGCCAACCAAAGCCGGGT-TTACTTGGTAGACAAAGAATTCAATGTCAT 1967
Query 1884 AGGATATACCCTGCTGCTTAGCCTGATTGAATACAAGACTCTTGTGATGCGAGGGGATTT 1943
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1968 AGGATATACCCTGCTGCTTAGCCTGATTGAATACAAGACTCTTGTGATGCGAGGCGATTT 2027
Query 1944 GGATAGAGCCAATCAAATTTTACCTACAATTCCTAAAGAGCAGCATAACAATGTTGCTCA 2003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 GGATAGAGCCAATCAAATTTTACCTACAATTCCTAAAGAGCAGCATAACAATGTTGCTCA 2087
Query 2004 TTTCTTGGAATCTCGGGGAATGATTGAAGATGCTTTAGAAATTGTGACAGATCTAGACTA 2063
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2088 TTTCTTGGAATCTCGGGGAATGATTGAAGATGCTTTAGAAATTGCGACAGATCCAGACTA 2147
Query 2064 CAAATTTGATCTGGCCATACAACTGGGTAGACTTGAAATTGCAAAGGAAATTGCTGAAGA 2123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 CAAATTTGATCTGGCCATACAACTGGGTAGACTTGAAATTGCAAAGGAAATTGCTGAAGA 2207
Query 2124 AGTACAGAGCGAGTCTAAATGGAAGCAGTTAGGAGAGTTAGCCATGTCCTCTGGGAAGCT 2183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2208 AGTACAGAGCGAGTCTAAATGGAAGCAGTTAGGAGAGTTAGCCATGTCCTCGGGGAAGCT 2267
Query 2184 GCAATTGGCCGAGGATTGCATGAAGTACGCTATGGATTTGAGTGGTTTGTTACTACTATA 2243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 GCAATTGGCCGAGGATTGCATGAAGTACGCTATGGATTTGAGTGGTTTGTTACTACTATA 2327
Query 2244 TTCTTCTTTAGGAGATGCTGAAGGGGTGTCAAAACTTGCATGCCTTGCTAAGGAACAGGG 2303
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328 TTCTTCTTTGGGAGATGCTGAAGGGGTGTCAAAACTTGCATGCCTTGCTAAGGAACAGGG 2387
Query 2304 GAAGAACAATGTTGCCTTTCTTTGCTTATTTACGCTGGGTAGATTGGAAGATTGTCTGCA 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 GAAGAACAATGTTGCCTTTCTTTGCTTATTTACGCTGGGTAGATTGGAAGATTGTCTGCA 2447
Query 2364 GTTATTGGTGGAGAGTAACCGGATACCTGAAGCTGCTCTGATGGCACGTTCTTATCTTCC 2423
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 GTTATTGGTGGAGAGTAACCGGATACCAGAAGCTGCTCTGATGGCACGTTCTTATCTTCC 2507
Query 2424 GAGCAAAGTTTCGGAGATAGTAGCTCTTTGGAGGGAAGATCTCAGCAAGGTTAATTCAAA 2483
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2508 AAGCAAAGTTTCGGAGATAGTAGCTCTATGGAGGGAAGATCTCAGCAAGGTTAATCCAAA 2567
Query 2484 AGCAGCAGAATCTTTAGCTGATCCTGAAGAGTACCCAAATCTTTTTGAGGATTGGCAAGT 2543
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2568 AGCAGCTGAATCTTTAGCTGATCCTGAAGAGTACTCAAATCTTTTTGAGGATTGGCAAGT 2627
Query 2544 TGCTCTTTCTGTTGAAGCGAACACTGCAGAGACAAGGGGAGTTTATACTGCTGCAGAAAA 2603
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2628 TGCTCTTTCTGTTGAAGCGAACACTGCAGAGACAAGGGGAGTTTATACCGCTGCAGAAAA 2687
Query 2604 TTATCCATCCCATGCCGATAAATCTTCCATTACCCTCGTGGAAGCCTTTAGAAACCTGCA 2663
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 TTATCCATCCCATGCCGATAAACCTTCCATTACCCTTGTGGAAGCCTTTAGAAACCTGCA 2747
Query 2664 AGTTGAAGCAGAGGAATCACTTGAAAATGGAGTCATCGATCACGAGGTAGCAGAAGAAAA 2723
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 AGTTGAAGCAGAGGAATCACTTGAAAATGGAAACATCGATCACGAGGTAGCAGAAGAAAA 2807
Query 2724 CGGTCATGTagaggacgaaggagatgaagaggaacaacaggaagaagaagtgaatgaaga 2783
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 CGGTCATGTAGAGAATGAAGGAGATGAAGAGGAACAACAGGAAGAAGAAGTGAATGAAGA 2867
Query 2784 agagggagTTGTGGATGCAGACTCTACGGACGGTGCTGTACTTGTTAATGGAAGTGAGGG 2843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 AGAGGGAGTTGTGGATGCAGACTCTACGGACGGTGCTGTACTTGTTAATGGAAGTGAGGG 2927
Query 2844 TGAGGAAGAGTGGGGTACGAATAACAAAGGAAACCCATCAGCCTAATAAGCAAGTCAGTC 2903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928 TGAGGAAGAGTGGGGTACGAATAACAAAGGAAACCCATCAGCCTAATAAGCAAGTCAGTC 2987
Query 2904 CAGGATCAATGTTGAAAAGTCGAAATTTTGTCTCTGTGCTTACGCCGCATCC-TAGCTAG 2962
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2988 CAGGATCAATGTTGAATAGTCGAAATTTTGTCTCTGTGCTTACGCCACATCCCTAGCTAG 3047
Query 2963 ATCCAGTAGCCGGCACTGATACTTGAAGCAGGAATCGATTCTTGGTGGAGGGAGAATATA 3022
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3048 ATCCAGTAGCCGGCACCGATACTCCAAGCAGGAATCGATTCTTGGTGGATGGAGAGTATA 3107
Query 3023 AAGAAGAAGATGGGATTGGTGGATTAAGGAATTTGGTGTTGTGGTTTT--CATCTAATGA 3080
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 3108 AAGACGAAGATGGGATTGGTGGATTAAGGAATTTGGTGTTGTGGTTTTTTCAACTAATGA 3167
Query 3081 TTGTGGTTTTCATCTTAAAGAGAGTATATTATAAAAACAAAGTAGATTGTTTTACAAATT 3140
||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||| ||| ||||||||
Sbjct 3168 TTGTGGTTTTCATCTGAAAGAG--TATATTATAACA-CA--GTAGAGAGTTATACAAATT 3222
Query 3141 TTCTGCTGTAGATTTCAGCTCATGTTTACAAAATTCTGGTGCATATATAATTCTTTGGAA 3200
||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3223 TTCTGCTTTAGATTTCAGCTCAAAATTACAAATTTCTGGTGCATATATAATTCTTTGGAA 3282
Query 3201 GCCTTTATCAC 3211
|||||||||||
Sbjct 3283 GCCTTTATCAC 3293
> AT1G52360.2 | Symbols: | Coatomer, beta' subunit | chr1:19499343-19505757
FORWARD LENGTH=3099
Length=3099
Score = 3517 bits (1904), Expect = 0.0
Identities = 2545/2852 (89%), Gaps = 54/2852 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 139 CTCAGACTCGATATCAAGAGAAAATTTGCTCAACGATCAGAGAGAGTCAAATCTGTTGAT 198
||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| |||||||| |||
Sbjct 216 CTCAGACTCGAGATCAAGAGAAAATTAGCGCAAAGGTCTGAGAGAGTTAAATCTGTGGAT 275
Query 199 CTGCATCCTACTGAACCATGGATTCTAGCAAGTTTGTATGCTGGAACCGTGTGTATTTGG 258
|| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 276 CTTCATCCTACAGAACCATGGATTCTTGCAAGTTTGTATTCTGGAACCTTGTGTATTTGG 335
Query 259 AACTACCAGACACAGACGATTACAAAATCCTTCGAGGTGACCGACTTGCCAGTTAGGTCA 318
||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| || || |||||| |||||
Sbjct 336 AACTACCAGACGCAGGTGATGGCAAAATCCTTTGAGGTGACTGAATTACCAGTTCGGTCA 395
Query 319 GCCAAGTTTATTCCGCGCAAGCAATGGGTTGTTGCTGGAGCGGATGACATGCACATCCGT 378
||||||||| | | || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||||
Sbjct 396 GCCAAGTTTGTAGCACGAAAGCAATGGGTTGTCGCAGGAGCTGATGATATGTATATCCGT 455
Query 379 GTATACAATTACAATACGATGGACAAGGTCAGAGTATTTGAGGCTCATTCGGATTACATT 438
|||||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 456 GTATACAATTACAACACCATGGACAAGGTTAAAGTGTTTGAGGCTCATTCAGACTACATT 515
Query 439 AGGTGTGTAGCTGTCCATCCGACCCTTCCATATGTGCTGTCATCTTCTGATGATATGCTC 498
|||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 AGGTGTGTGGCTGTTCATCCAACCCTTCCATATGTGCTGTCATCTTCTGATGATATGCTC 575
Query 499 ATAAAGCTTTGGGACTGGGAAAACGGTTGGGCTTGTACTCAGATATTTGAGGGGCATTCG 558
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 576 ATAAAGCTTTGGGACTGGGAAAAGGGTTGGGCTTGCACTCAGATATTCGAGGGACACTCA 635
Query 559 CACTATGTGATGCAAGTGGTATTTAATCCAAAAGATACCAACACTTTTGCCAGTGCATCG 618
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 CACTATGTGATGCAAGTCACATTTAATCCAAAAGACACCAACACTTTTGCCAGTGCATCC 695
Query 619 CTTGATCGTACCATAAAGATATGGAATCTTGGTTCCCCAGACCCAAATTTTACACTGGAT 678
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 696 CTTGATCGTACCATAAAGATTTGGAATCTTGGTTCCCCAGACCCAAATTTTACATTGGAT 755
Query 679 GCTCATCAGAAAGGAGTCAACTGTGTAGATTATTTCACAGGGGGTGATAAACCCTACCTA 738
|| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||
Sbjct 756 GCCCATCAGAAAGGAGTAAATTGTGTAGATTATTTCACCGGTGGTGATAAGCCCTATTTA 815
Query 739 ATTACCGGCTCTGATGATCATACTGCTAAGGTATGGGACTATCAAACCAAAAGTTGTGTC 798
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 816 ATTACCGGCTCTGATGATCACACTGCTAAGGTCTGGGACTACCAAACAAAAAGTTGTGTA 875
Query 799 CAGACGCTAGATGGGCACACACACAATGTTTCTGCCGTATGTTTCCACCCAGAACTTCCA 858
||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 876 CAGACCCTGGAGGGGCACACACACAATGTATCTGCAGTATGTTTCCATCCAGAGCTTCCA 935
Query 859 ATAATAATCACAGGTTCTGAGGATGGCACTGTTCGCATTTGGCACGCCACGACTTACAGG 918
|| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||
Sbjct 936 ATTATAATCACAGGTTCTGAAGATGGCACCGTTCGCATTTGGCATGCAACCACATACAGG 995
Query 919 CTAGAAAACACATTGAATTATGGTCTCGAGAGAGTTTGGGCCATTGGTTACATCAAAAGT 978
||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 996 CTAGAGAACACATTGAATTATGGCCTTGAGAGAGTCTGGGCAATTGGTTACATTAAAAGT 1055
Query 979 TCGCGGCGGGTTGTGATTGGATATGATGAAGGAACCATCATGGTTAAGCTTGGACGAGAA 1038
|| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1056 TCACGCCGGGTTGTGATCGGATATGATGAAGGAACCATCATGGTTAAACTTGGACGAGAA 1115
Query 1039 ATTCCTGTCGCTAGCATGGACAGTAGCGGAAAAATCATATGGGCTAAGCATAATGAAATT 1098
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 ATTCCTGTCGCTAGCATGGACAATACCGGAAAAATCATATGGGCTAAGCATAATGAAATT 1175
Query 1099 CAAACTGCAAACATCAAAAGTATTGGTGCGGGTTACGAGGTTACTGATGGAGAAAGACTT 1158
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1176 CAAACTGCAAACATCAAAAGTATTGGTGCAGATTACGAGGTTACTGATGGAGAAAG-GTT 1234
Query 1159 -CCCTTGTCTGTTAAAGAGTTGGGGACCTGTGATCTTTATCCACAAAGCTTGAAGCACAA 1217
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235 GCCCTTGAGTGTTAAAGAGTTGGGGACCTGTGATCTTTATCCACAAAGCTTGAAGCACAA 1294
Query 1218 CCCTAATGGGAGGTTTGTCGTAGTCTGCGGTGATGGAGAGTACATAATCTACACAGCTTT 1277
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||
Sbjct 1295 CCCTAATGGGAGGTTTGTCGTAGTCTGTGGTGACGGAGAATATATAATCTACACGGCTTT 1354
Query 1278 GGCTTGGAGAAATAGATCTTTTGGGTCTGGCCTGGAATTTGTTTGGTCATCCGAGGGGGA 1337
||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 GGCTTGGAGAAATAGGTCATTTGGTTCTGGACTGGAATTTGTTTGGTCATCCGAGGGGGA 1414
Query 1338 ATGTGCGGTTAGAGAAAGCTCATCAAAGAT-AAAGATATTCAGTAAAAATTTCCAGGAAA 1396
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1415 GTGTGCGGTTAGAGAAAGCTCATCAAAGATTAAA-ATATTTAGCAAAAATTTCCAGGAAA 1473
Query 1397 GGAAGAGTATCCGGCCTACTTTCTCAGCTGAGAAGATTTTTGGAGGAACCTTGTTAGCAA 1456
|| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1474 AGAGGAGTATCCGCCCTACTTTTTCAGCTGAGAAGATCTTTGGAGGAACCTTGTTAGCTA 1533
Query 1457 TGTGTTCGAA-TGATTTCATCTGCTTCTATGATTGGGCTGAATGCAGGCTGATTCAACAA 1515
||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1534 TGTGTTC-AAGTGATTTCATCTGCTTTTATGATTGGGCTGAATGTAGGCTGATTCAACGT 1592
Query 1516 ATTGATGTCACCGTAAAGAATCTTTATTGGGCTGAAAGTGGTGATTTAGTAGCCATTGCT 1575
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 ATTGACGTCACTGTAAAGAATCTATATTGGGCTGACAGTGGTGATTTAGTAGCCATTGCT 1652
Query 1576 AGTGATTCGTCATTCTACATCTTGAAGTACAATCGCGACTTGGTTTCCTCACATTTTGAT 1635
||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 1653 AGTGACACATCATTCTACATCTTGAAATTCAACCGCGACTTAGTTACCTCACATTTTGAT 1712
Query 1636 AGTGGAAGACCAACTGATGAAGAGGGTGTTGAGGATGCTTTTGAGGTTCTCCACGAGAAT 1695
|| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1713 AGCGGAAGACCTACTGAGGAAGAAGGTGTTGAGGATGCTTTTGAGGTTCTCCATGAAAAT 1772
Query 1696 GATGAACGTGTTAGGACAGGTATATGGGTTGGGGACTGCTTCATTTACAACAACTCTTCT 1755
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 GATGAACGTGTTAGGACAGGTATATGGGTTGGTGACTGTTTCATTTACAACAACTCTTCC 1832
Query 1756 TGGAAGCTTAACTATTGTGTTGGAGGCGAGGTAACCACAATGTATCATTTAGACCGCCCA 1815
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1833 TGGAAGCTTAACTACTGTGTTGGAGGCGAGGTAACCACAATGTATCATTTGGACCGCCCA 1892
Query 1816 ATGTATTTGTTAGGCTATATTGCCAAC-CAAAGCCGGGTGTTCTTGGTAGACAAAGAATT 1874
||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 ATGTATTTGTTGGGATATCTTGC-AAGTCAAAGTCGGGTTTTCTTGGTAGACAAAGAATT 1951
Query 1875 CAATGTCATAGGATATACCCTGCTGCTTAGCCTGATTGAATACAAGACTCTTGTGATGCG 1934
|||||| ||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1952 CAATGTTATAGGGTACACCTTGTTGCTAAGCCTGATTGAGTACAAGACTCTTGTGATGCG 2011
Query 1935 AGGG-GATTTGGATAGAGCCAATCAAATTTTACCTACAATTCCTAAAGAGCAGCATAACA 1993
||| ||||| || | ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2012 -GGGTGATTTAGACAAAGCCAGTGAAATCTTACCTACAATTCCTAAAGATCAGCATAACA 2070
Query 1994 ATGTTGCTCATTTCTTGGAATCTCGGGGAATGATTGAAGATGCTTTAGAAATTGTGACAG 2053
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||
Sbjct 2071 GTGTTGCTCATTTCTTGGAGTCACGGGGAATGATTGAAGATGCTCTGGAAATTGCAACAG 2130
Query 2054 ATC-TAGACTACAAATTTGA-TCTGGCCATACAACTGGGTAGACTTGAAATTGCAAAGGA 2111
||| | ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2131 ATCCT-GACTACAGATTTGAGT-TGGCCATACAACTGGGTAGACTTGAAATTGCACAGGA 2188
Query 2112 AATTGCTGAAGAAGTACAGAGCGAGTCTAAATGGAAGCAGTTAGGAGAGTTAGCCATGTC 2171
||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 2189 AATCGCTGTGGAAGTACAGAGCGAATCTAAGTGGAAACAATTAGGAGAGTTAGCTATGTC 2248
Query 2172 CTCTGGGAAGCTGCAATTGGCCGAGGATTGCATGAAGTACGCTATGGATTTGAGTGGTTT 2231
||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2249 CTCCGGAAAGCTGCAAATGGCTGAGGAATGCATGAAGTATGCGATGGATTTGAGTGGTTT 2308
Query 2232 GTTACTACTATATTCTTCTTTAGGAGATGCTGAAGGGGTGTCAAAACTTGCATGC-CTTG 2290
|||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||
Sbjct 2309 GTTACTTCTTTATTCTTCTCTGGGAGATGCTGAAGGTGTAACAAAACTTGCAA-CACTTG 2367
Query 2291 CTAAGGAACAGGGGAAGAACAATGTTGCCTTTCTTTGCTTATTTACGCTGGGTAGATTGG 2350
|||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| | |||
Sbjct 2368 CTAAAGAACAAGGGAAGAACAATGTCGCCTTTCTTTGCCTATTCATGCTGGGTAAACTGG 2427
Query 2351 AAGATTGTCTGCAGTTATTGGTGGAGAGTAACCGGATACCTGAAGCTGCTCTGATGGCAC 2410
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2428 AAGATTGTTTGCAGTTATTGGTGGAGAGTAACCGGATACCAGAAGCTGCTCTGATGGCAC 2487
Query 2411 GTTCTTATCTTCCGAGCAAAGTTTCGGAGATAGTAGCTCTTTGGAGGGAAGATCTCAGCA 2470
| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2488 GATCATATCTTCCGAGCAAAGTTTCTGAGATAGTAGCTCTTTGGAGGAAAGATCTCAGCA 2547
Query 2471 AGGTTAATTCAAAAGCAGCAGAATCTTTAGCTGATCCTGAAGAGTACCCAAATCTTTTTG 2530
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 2548 AGGTTAATTCAAAAGCAGCAGAATCTTTGGCTGATCCTGAGGAGTACTCAAATCTTTTTG 2607
Query 2531 AGGATTGGCAAGTTGCTCTTTCTGTTGAAGCGAACA-CTGCAGAGACAAGGGGAGTTTAT 2589
| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2608 AAGATTGGCAAGTTGCTCTTTCTGTGGAAGCTAA-AGCTGTAGAGACAAGGGGAGTTTAC 2666
Query 2590 ACTGCTGCAGAAA-ATTATCC-ATCCCATGCCGATAAATCTTCCATTACCCTCGTGGAAG 2647
|| | |||| ||| ||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2667 ACAGGTGCA-AAAGATTATCCTAGCC-ATGCTGATAAATCTTCCATGACCCTCGTGGAAG 2724
Query 2648 CCTTTAGAAACCTGCAAGTTGAAGCAGAGGAATCACTTGAAAATGGAG-TCATCGATCAC 2706
|||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||
Sbjct 2725 CCTTCCGAAACTTGCAAGTTGAGGAAGAGGAATCACTTGAAAATGGAGAT-ATGGATCAC 2783
Query 2707 GAGG---TAG---CAGAAGAAAACGG---T---CAT-GTa--gaggacga---ag-g-ag 2746
|||| ||| |||||||||| || | || | | ||||| || || | ||
Sbjct 2784 GAGGAGGTAGTAGCAGAAGAAAATGGAAATGAACAAAGGAATGAGGATGATGTAGCGGAG 2843
Query 2747 -atgaagaggaacaacaggaaga-a--gaagt-gaatgaagaagagggagTTGTGGATGC 2801
||| |||||| || || ||||| | |||| ||| |||||||||||| |||| ||||
Sbjct 2844 CATGTAGAGGAGCATCATGAAGAGAAAGAAGCAGAA-GAAGAAGAGGGAATTGTTGATGG 2902
Query 2802 AGACTCTACGGACGGTGCTGTACTTGTTAATGGAAGTGAGGGTGAGGAAGAGTGGGGTAC 2861
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2903 AGACTCTACGGATGGAGCTGTACTTGTTAATGGAAGTGAGGCTGACGAAGAGTGGGGTAC 2962
Query 2862 GAATAACAAAGGAAACCCATCAGCCTAATAAGCAAGTCAGTCCAGGATCAATGTTGAAAA 2921
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2963 GAATAATGAAGGAAACCCATCAGCCTAATA-GCAAGTCGGTCAAGGC-CAATGTTGAAAA 3020
Query 2922 GTC-GAAA-TTTTGTCTCTGTGCTTACGCCGC 2951
||| |||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3021 GTCTGAAAATTTTGTCTCTGTGCTTACACCGC 3052
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 159731546512
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5