BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479127
Length=3377
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G16620.1 | Symbols: ATTOC120, TOC120 | translocon outer comp... 4156 0.0
AT2G16640.1 | Symbols: ATTOC132, TOC132 | multimeric translocon... 3234 0.0
> AT3G16620.1 | Symbols: ATTOC120, TOC120 | translocon outer complex
protein 120 | chr3:5658317-5661963 REVERSE LENGTH=3473
Length=3473
Score = 4156 bits (2250), Expect = 0.0
Identities = 2481/2593 (96%), Gaps = 14/2593 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 786 TCAATCTAATAAGGAAATTGAAAAGCAGCAAGACAGCAGCGTTAATATAGGTCCAGAGAT 845
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 894 TCAATCTAATAAGGAAATTGTAAAGCAGCAAGATAGCAGTGTAAATATAGGTCCAGAGAT 953
Query 846 TAAGGAAAGCCTACATGTGGAAAGAGAATCTGAGGTATTAAGTTCTGTCTCACCAACAGA 905
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 954 TAAGGAAAGCCAACATATGGAAAGAGAATCTGAGGTATTAAGTTCTGTTTCACCAACAGA 1013
Query 906 GTCTAGAATTAATACTGCAGCATTACCACCTGCTCGCCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTGC 965
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 GTCTAGAAGTGATACTGCAGCATTACCACCTGCTCGCCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTGC 1073
Query 966 TCCACTTTTGGAACCGGCACCACGCGTTCCACAACAGCCTCGTGTCAATGGCAATGTGTC 1025
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1074 TCCACTTTTGGAACCTGCACCACGCGTTACACAACAGCCTCGTGTCAATGGAAATGTGTC 1133
Query 1026 TCACAATCAGCCTCAGCAAGCTGAAGACTCTACCACTGGAGAGACTGATGAGCATGATGA 1085
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1134 TCACAATCAGCCTCAGCAAGCTGAAGACTCTACCACTGCAGAGACAGATGAGCATGATGA 1193
Query 1086 GACCCGTGAGAAGCTCCAGTTCATAAGGGTCAAATTTTTGAGGCTTTCACATAGATTAGG 1145
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 GACCCGTGAGAAGCTCCAGTTTATCAGGGTCAAATTTTTGAGGCTTTCACATAGATTAGG 1253
Query 1146 GCAAACTCCACATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTGTACAGGCTTGGATTGGCTGAACA 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 GCAAACTCCACATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTGTACAGGCTTGGATTGGCTGAACA 1313
Query 1206 GTTGAGGGGTAGAAACGGAAGCCGTGTTGGTGCCTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGCCAT 1265
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 GTTGAGGGGCAGAAACGGAAGCCGTGTTGGTGCCTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGCCAT 1373
Query 1266 GGCAGAACAGCTTGAGGCAGCTGGACAGGATCCCCTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGT 1325
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 GGCAGAACAGCTTGAGGCAGCTGCACAAGATCCCCTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGT 1433
Query 1326 GCTCGGCAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACTATCAATTCTATTTTCGATGAACTGAA 1385
||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1434 GCTTGGTAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACCATCAATTCTATTTTTGATGAACTGAA 1493
Query 1386 AATTAGGACTGATGCATTCCAGATGGGGACAAAGAGGGTTCAGGATATTGAGGGTTTTGT 1445
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 AATTAGTACTGATGCATTCCAGGTGGGGACAAAGAAGGTTCAGGATATTGAGGGTTTTGT 1553
Query 1446 TCAGGGAATCAAGGTACGGGTAATTGACACTCCCGGTCTCTTACCATCCTGGTCAGATCA 1505
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TCAGGGAATTAAGGTACGGGTAATTGACACTCCCGGTCTCTTACCATCCTGGTCAGATCA 1613
Query 1506 ACACAAGAATGAGAAGATCCTGAAGTCTGTTAGGGCATTCATCAAGAAAAATCCGCCTGA 1565
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1614 ACACAAGAATGAGAAGATCCTGAAGTCTGTTAGGGCATTCATCAAGAAAAGTCCGCCTGA 1673
Query 1566 CATTGTATTATATCTTGATAGGTTAGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCT 1625
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 CATTGTGTTATATCTTGATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCT 1733
Query 1626 CTTGCGCACCATTACTGATGTTTTTGGACCATCGATTTGGTTTAATGCCATTGTGGGTTT 1685
||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 CTTACGCACCATCACTGATGTTTTTGGACCATCAATATGGTTTAATGCCATTGTGGGTTT 1793
Query 1686 GACTCATGCCGCTTCGGCTCCACCAGATGGCCCAAATGGGACTGCTTCTAGCTATGACAT 1745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 GACTCATGCCGCTTCGGCTCCACCAGATGGCCCAAATGGTACTGCTTCTAGCTATGACAT 1853
Query 1746 GTTTGTAACACAACGTTCTCATGTCATCCAGCAAGCCATTCGCCAAGCAGCGGGAGATAT 1805
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 GTTTGTGACACAACGTTCTCATGTCATCCAGCAGGCCATTCGCCAAGCAGCGGGAGATAT 1913
Query 1806 GAGGCTCATGAACCCAGTTTCTTTAGTTGAGAACCACTCTGCTTGCAGGACAAATCGGGC 1865
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 GAGGCTCATGAACCCTGTTTCTTTAGTTGAGAACCACTCTGCTTGCAGGACAAATCGGGC 1973
Query 1866 AGGACAGAGAGTATTACCTAATGGCCAAGTGTGGAAGCCTCATTTGCTATTACTCTCATT 1925
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1974 AGGCCAGAGAGTATTACCTAATGGCCAAGTGTGGAAGCCTCATTTGTTATTACTCTCATT 2033
Query 1926 TGCATCCAAGATTCTAGCCGAAGCAAATGCTCTTCTGAAATTACAAGATAATATTCCAGG 1985
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 TGCATCCAAGATTCTTGCCGAAGCAAATGCTCTTCTGAAATTACAAGATAATATTCCAGG 2093
Query 1986 GGAACAATTTGCAGCTCGGTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTGCTCCTCTCATCGCTTCT 2045
|| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 GGGACAATTTGCAACTCGGTCCAAGGCTCCGCCACTACCATTGCTCCTCTCATCGCTTCT 2153
Query 2046 GCAATCAAGACCACAAGCTAAGCTTCCTGAGCAGCAGTACGATGATGAAGAAGATGAAGA 2105
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2154 GCAATCAAGACCACAAGCTAAGCTTCCTGAGCAACAGTACGATGATGAAGACGATGAAGA 2213
Query 2106 TGATTTGGACGAATCATCAGATTTTGACGAAGAATCAGAGTATGATGAGCTTCCTCCCTT 2165
|||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 TGATTTAGACGAATCATCAGATTCTGAGGAAGAATCAGAGTATGATGAGCTTCCTCCCTT 2273
Query 2166 TAAGCGGTTGACTAAAGCCGAGATGGCTAAGCTTAGTAAATCTCAGAAGAAGGAATATCT 2225
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 TAAGCGGTTGACTAAAGCAGAGATGACTAAGCTTAGCAAATCTCAGAAGAAGGAATATCT 2333
Query 2226 CGATGAGATGGAGTATCGGGAGAAACTATTTATGAAGAGGCAGATGAAAGAGGAAAGAAA 2285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2334 CGATGAGATGGAGTATCGGGAGAAACTATTTATGAAGAGACAGATGAAAGAGGAAAGAAA 2393
Query 2286 GAGACGTAAGTTGTTGAAGAAATTTGCTGCTGAGATTAAAGATATGCCTAACGGGTATAG 2345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 GAGACGTAAGTTGTTGAAGAAATTTGCTGCTGAGATTAAAGATATGCCTAACGGGTATAG 2453
Query 2346 TGAAAATGTGGAAGAGGAGAGAAGTGAACCTGCAGCTGTTCCAGTTCCCATGCCAGATTT 2405
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2454 TGAAAATGTGGAAGAGGAGAGAAGTGAACCTGCATCTGTTCCAGTTCCAATGCCAGATTT 2513
Query 2406 ATCTCTACCTGCATCTTTTGACTCTGACAACCCTACTCACCGGTTCCGGTACCTTGATTC 2465
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |
Sbjct 2514 ATCTCTACCTGCATCTTTTGACTCTGACAATCCTACTCATCGGTACCGGTACCTTGATAC 2573
Query 2466 CTCCAATCAATGGCTTGTTAGGCCAGTGCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGG 2525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2574 CTCCAATCAATGGCTTGTTAGGCCAGTGCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGG 2633
Query 2526 TTATGAAGGTGTGAATGCGGAACGACTGTTTGTTGTTAAAGACAAGATACCGGTATCTTT 2585
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2634 TTATGAAGGTGTGAATGCGGAACGACTATTTGTTGTTAAAGACAAAATACCAGTATCTTT 2693
Query 2586 CTCTGGCCAAGTGACAAAAGACAAAAAGGATGCAAATGTACAGCTGGAATTGGCCAGCTC 2645
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2694 CTCTGGCCAAGTGACAAAGGACAAGAAGGATGCACATGTGCAGCTAGAATTGGCCAGCTC 2753
Query 2646 GGTTAAACATGGAGATGGTAGATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAAATGCTGGGAA 2705
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2754 GGTTAAACATGGAGAAGGTAGATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAAATGCTGGGAA 2813
Query 2706 GGAGTTGGCGTACACTGTTCGAAGTGAAACAAGATTTAACAATTTTAGGAAAAACAAAGC 2765
||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2814 GGAATTAGCGTACACTATTCGAAGTGAAACAAGATTTAACAAGTTTAGGAAAAACAAAGC 2873
Query 2766 AGCAGCTGGTCTCTCTGTAACACTCTTGGGTGATTCAGTGTCTGCGGGACTGAAAGTGGA 2825
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||
Sbjct 2874 AGCAGCTGGTCTCTCTGTTACGCTCTTAGGTGATTCAGTTTCCGCGGGACTAAAAGTCGA 2933
Query 2826 AGATAAGTTGATTGCTAATAAACGGTTCAGAATGGTTATGTCAGGTGGAGCAATGACTAG 2885
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2934 AGATAAGTTGATTGCTAATAAACGGTTCAGGATGGTTATGTCAGGTGGAGCAATGACTAG 2993
Query 2886 TCGAGGAGATGTTGCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTTCGAGATAAAGATTATCC 2945
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 TCGTGGAGATGTTGCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTTCGAGATAAAGATTATCC 3053
Query 2946 GCTAGGTCGGTTTTTGTCAACTCTTGGACTTTCTGTGATGGATTGGCATGGCGATCTTGC 3005
||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3054 GCTTGGTCGGTTTTTATCAACTCTTGGACTCTCTGTGATGGATTGGCATGGCGATCTTGC 3113
Query 3006 TATCGGAGGGAATATACAGTCTCAAGTACCCATTGGACGTTCCTCTAATCTAATTGCTCG 3065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3114 TATCGGAGGGAATATACAGTCTCAAGTACCCATTGGACGTTCCTCTAATCTCATTGCTCG 3173
Query 3066 TGCTAATCTGAATAACAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGCATCCGCGTAAACAGCTCTGAGCA 3125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3174 TGCTAATCTGAATAACAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGCATCCGCGTAAACAGCTCTGAGCA 3233
Query 3126 GCTCCAACTTGCTGTTGTTGCACTTGTTCCTCTGTTCAAGAAGCTTCTTAGTTATTATTA 3185
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3234 GCTTCAACTTGCTGTGGTTGCACTTGTTCCTCTGTTCAAGAAGCTTCTTACTTATTATT- 3292
Query 3186 TTCCCCAGAGCAAATGCAATATGGACACTGATGAATAAACATTCAATTAtttttattttt 3245
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || | |||| ||||||
Sbjct 3293 --CCCCTGAGCAAATGCAATATGGACACTGATGAGTAA-CATTTAACTGTTTTGATTTTT 3349
Query 3246 tCTTGAAACATGttttt-tttttATTATTGTTGCTGTCGGAATTCACTTTTGTTTTAAGA 3304
||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3350 TCTTGAAACATGTTTTTCTTTTT-TTA--GTTG-T--CGGAATTCACTTTTGTTTTAAG- 3402
Query 3305 GTCTTTGATGTTTGGTTGTAACATATGACTGAAACTTAAAAGTCCATTATCTCAATGTTT 3364
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 3403 -TCTTTGATGTTTGGTTGTAACATATGTCTGAAACTTAAAA-TCCATTATCCCAATGTTT 3460
Query 3365 CTGAGACTTCTTG 3377
|| || |||||||
Sbjct 3461 CTAAGTCTTCTTG 3473
Score = 508 bits (275), Expect = 1e-142
Identities = 576/710 (81%), Gaps = 65/710 (9%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGACATGGGGCTGAGATTGTGGA-CATGTTAGATGGGGAAGAGAAGAAGCTTG--TA 57
|||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 52 ATGGGAGATGGGGCTGAGATTGT-AACCAGGTTATATGGGGATGAGAAGAAGCTTGCAGA 110
Query 58 -GATGATAGAATTAGTGATGGGGAAGTAGAGA-AAAATG-AGTTGGTGGGATCTGATGAA 114
|||| |||||||||||| | | || | || ||| || | | ||| | |||||
Sbjct 111 GGATGGTAGAATTAGTGA-GTTG--GT-GGGATCTGATGAAG-T-GAAGGA--TAATGAA 162
Query 115 GAAGAGGTCTTTGAGGAAGCAATTGATTCGCAGGAGGGTGC-AAAACCTGAATCTTTTGA 173
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | |
Sbjct 163 GAAGAGGTCTTTGAGGAAGCAATTGGTTCGCAGGAGGGT-CTAAAACCTGAATCTCTCAA 221
Query 174 AGCCGATGAGTGGCTCGAGGATAAAATCTTAGAGGAAACTCCTGAGAATTCCAAGGATGA 233
| |||||| || || |||||| | || | | | || |||| |
Sbjct 222 AACCGATGTGTTGCAAGAGGAT----T-TT--------C-CTTTAG-CTTCC-------A 259
Query 234 GGATGATGAAGTGGGTGATTTGGAAGAAACAAGTAGCAACGAGAGGGGAGTAGAAACTTT 293
||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||
Sbjct 260 --ATGATGAAGTGTGTGATTTGGAAGAAACAAGTAGAAATGAGAGAGGAGTAGAAAATTT 317
Query 294 AAAAGTTAATTATTCGGTGGTGGGAGAGAGCCATGGTGAGGTTAAATTGCAACATACAAC 353
||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||
Sbjct 318 AAAGGTTAATTATTCGGAGATTGGAGAGAGCCATGGTGAGGTTAACGAGCAATGTATAAC 377
Query 354 TACTAAGGAGGCTGAATCTGATTTGGTGACTCCCAAAATGAATG---ATGATCAGGGGGA 410
||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 378 TACGAAAGAGGCTGATTCTGATTTGGTGACTCTCAAAATGAATGATTATGATCACGGGGA 437
Query 411 AGTAGCAGATGCTGTA-ATTTC---T-G----A----ATCAAGCTTGGATGTGGTTGAGA 457
|||||||||||| | | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 AGTAGCAGATGCAG-ATATTTCTTATGGTAAAATGGCATCAAGCTTGGATGTGGTTGAGA 496
Query 458 ACAGTGAGGAAGCTACTTCCAATTTTGCGGCTGAGGATGTGAGTTTGGTAAACGGAAATA 517
|||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 497 ACAGTGAGAAAGCTACTTCCAATTTAGCTACTGAGGATGTGAATTTGGAAAACGGAAATA 556
Query 518 CACATTCTTCTTCAGGAAATGG-GATAGTCTCTCCTGA-GA-A-TAAAGAACTGGTGGCA 573
||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||
Sbjct 557 CACATTCTTCTTCAGAAAATGGAG-TAGTCTCTCCTGATGAGAATAAAGAACTGGTGGCG 615
Query 574 GAAGTTGTCTCAGTAAGTGCCTGGTCCGAGGAAACAGGGAATGATGGTATTGAAAACGAA 633
|||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||
Sbjct 616 GAAGTTATCTCAGTAAGTGCCTGTTCCGTGGAAACAGGGAGTAATGGTATTGACGACGAA 675
Query 634 ATATTGGAGGAA-AAAGTTGATGTATCCGCTGGCATGGGAACAGaaaaaa 682
| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||
Sbjct 676 AAATGGGAGGAAGAAA-TTGATGTATCAGCTGGCATGGTAACAGAACAAA 724
> AT2G16640.1 | Symbols: ATTOC132, TOC132 | multimeric translocon
complex in the outer envelope membrane 132 | chr2:7211112-7215553
REVERSE LENGTH=3975
Length=3975
Score = 3234 bits (1751), Expect = 0.0
Identities = 2290/2551 (90%), Gaps = 33/2551 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 690 TGAAGGTCACAGCAGTAGTGGCAT-CCCTGGGGTAACTTTTAGAGAACAGGACA-CTGTT 747
||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | | | |||
Sbjct 1195 TGAAGTTCACAGCAATAGTGGC-TCCCCTGGGGTAACTAGTAGAGAACA-CAAACCAGTT 1252
Query 748 CAAAATAG-TAATGGAGGACATGATATTCAACAGAGTCCTCAATCTAATAAGGAAATTGA 806
|||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||
Sbjct 1253 CAAAGT-GCTAATGGAGGACATGATGTT---CAGAGTCCTCAACCAAATAAGGAGCTTGA 1308
Query 807 AAAGCAGC-AAGACAGCAGCGTTA-ATATAGGTCCAGAGATTA-AGGAAAGCCTACATGT 863
||||||| ||| |||||| | || || ||| ||||||||||| || ||| | ||||||
Sbjct 1309 GAAGCAGCAAAG-CAGCAGAG-TACATGTAGATCCAGAGATTACAGAAAATTC-ACATGT 1365
Query 864 GGAAAGAGAATCTGAGGTATTAAGTTCTGTCTCACCAACAGAGTCTAGAATTAATACTGC 923
||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 1366 GGAAACAGAACCTGAGGTAGTAAGTTCTGTTTCACCAACAGAGTCTAGAAGTAATCCTGC 1425
Query 924 AGCATTACCACCTGCTCGCCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTGCTCCACTTTTGGAACCGGC 983
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||
Sbjct 1426 GGCATTACCACCTGCTCGTCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTTCTCCTCTTTTGGAACCTGC 1485
Query 984 ACCACGCGTTCCACAACAGCCTCGTGTCAATGGCAATGTGTCTCACAATCAGCCTCAGCA 1043
| |||| | ||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 1486 ATCACGTGCTCCTCAACAGTCTCGCGTCAATGGGAATGGGTCTCACAATCAGTTTCAGCA 1545
Query 1044 AGCTGAAGACTCTACCACTGGAGAGACTGATGAGCATGATGAGACCCGTGAGAAGCTCCA 1103
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1546 AGCTGAAGACTCTACCACTACAGAGGCTGATGAGCATGATGAGACCCGCGAGAAGCTCCA 1605
Query 1104 GTTCATAAGGGTCAAATTTTTGAGGCTTTCACATAGATTAGGGCAAACTCCACATAATGT 1163
||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||
Sbjct 1606 GTTGATCAGGGTAAAATTTTTGAGGCTTGCACATAGACTAGGGCAAACCCCGCATAATGT 1665
Query 1164 TGTTGTTGCTCAGGTTTTGTACAGGCTTGGATTGGCTGAACAGTTGAGGGGTAGAAACGG 1223
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1666 TGTTGTTGCTCAGGTTTTATACAGGCTTGGATTGGCTGAGCAGTTGAGGGGCAGAAATGG 1725
Query 1224 AAGCCGTGTTGGTGCCTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGCCATGGCAGAACAGCTTGAGGC 1283
||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1726 AAGCCGTGTTGGTGCTTTTAGTTTTGATCGCGCTAGTGCCATGGCAGAACAGCTTGAGGC 1785
Query 1284 AGCTGGACAGGATCCCCTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTGCTCGGCAAAAGTGGGGT 1343
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1786 TGCTGGACAGGATCCACTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTTCTCGGAAAAAGTGGGGT 1845
Query 1344 TGGTAAAAGTGCAACTATCAATTCTAT-TTTCGATGAACTGAAAATTAGGACTGATGCAT 1402
||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| || | ||||||||||
Sbjct 1846 TGGTAAAAGTGCAACGATCAATTCTATATTT-GATGAAGTGAAATTTTGTACTGATGCAT 1904
Query 1403 TCCAGATGGGGACAAAGAGGGTTCAGGATATTGAGGGTTTTGTTCAGGGAATCAAGGTAC 1462
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1905 TCCAGATGGGGACAAAGAGGGTTCAAGATGTTGAGGGTTTGGTTCAGGGAATTAAGGTAC 1964
Query 1463 GGGTAATTGACACTCCCGGTCTCTTACCATCCTGGTCAGATCAA-CACAAGAATGAGAAG 1521
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||
Sbjct 1965 GGGTGATTGACACTCCCGGTCTCTTACCTTCCTGGTCTGATCAAGC-CAAGAATGAGAAG 2023
Query 1522 ATCCTGAAGTCTGTTAGGGCATTCATCAAGAAAAATCCGCCTGACATTGTATTATATCTT 1581
|||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 2024 ATCCTGAATTCTGTTAAGGCTTTCATCAAGAAGAATCCACCTGACATTGTACTATATCTT 2083
Query 1582 GATAGGTTAGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCTTGCGCACCATTACT 1641
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
Sbjct 2084 GATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCCTGCGCACCATAAGT 2143
Query 1642 GATGTTTTTGGACCATCGATTTGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTCATGCCGCTTCG 1701
||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 GATGTTTTTGGTCCTTCGATATGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTCATGCCGCTTCT 2203
Query 1702 GCTCCACCAGATGGCCCAAATGGGACTGCTTCTAGCTATGACATGTTTGTAACACAACGT 1761
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2204 GTTCCACCAGATGGCCCAAATGGCACTGCTTCTAGCTATGATATGTTTGTTACACAACGT 2263
Query 1762 TCTCATGTCATCCAGCAAGCCATTCGCCAAGCAGCGGGAGATATGAGGCTCATGAACCCA 1821
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 TCTCATGTCATCCAGCAGGCCATTCGCCAAGCAGCTGGAGATATGAGGCTCATGAACCCT 2323
Query 1822 GTTTCTTTAGTTGAGAACCACTCTGCTTGCAGGACAAATCGGGCAGGACAGAGAGTATTA 1881
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2324 GTTTCTTTAGTTGAGAATCACTCAGCTTGCAGGACTAATCGGGCAGGCCAGAGAGTATTA 2383
Query 1882 CCTAATGGCCAAGTGTGGAAGCCTCATTTGCTATTACTCTCATTTGCATCCAAGATTCTA 1941
|| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2384 CCGAATGGCCAAGTGTGGAAGCCACATTTGTTGCTACTCTCATTTGCATCTAAGATTCTA 2443
Query 1942 GCCGAAGCAAATGCTCTTCTGAAATTACAAGATAATATTCCAGGGGA-ACAATTTGCAGC 2000
|| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||||
Sbjct 2444 GCAGAAGCAAATGCTCTTTTGAAGTTGCAAGATAATATTCCA-GGGAGACCATTTGCAGC 2502
Query 2001 TCGGTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTGCTCCTCTCATCGCTTCTGCAATCAAGACCACA 2060
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 TCGGTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTTCTCCTTTCATCGCTTCTGCAATCAAGACCACA 2562
Query 2061 AGCTAAGCTTCCTGAGCAGCAGTACGATGATGAAGAAGATGAAGATGATTTGGACGAATC 2120
| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2563 ACCTAAGCTTCCTGAACAGCAGTATGGTGATGAAGAAGATGAAGATGATTTAGAAGAATC 2622
Query 2121 ATCAGATTTTGACGAAGAATCAGAGTATGATGAGCTTCCTCCCTTTAAGCGGTTGACTAA 2180
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 2623 ATCAGATTCAGACGAAGAATCAGAGTATGATCAGCTTCCTCCGTTTAAGAGTTTGACTAA 2682
Query 2181 AGC-CGAGATGGCTAAGCTTAGTAAATCTCAGAAGAAGGAATATCTCGATGAGATGGAGT 2239
||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct 2683 AGCTC-AGATGGCTACGCTTAGTAAATCTCAGAAGAAGCAGTATCTCGATGAAATGGAGT 2741
Query 2240 ATCGGGAGAAACTATTT-ATGAAGAGGCAGATGAAAGAGGAAAGAAAGAGACGTAAGTTG 2298
| || |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2742 ACCGAGAGAAACT-TTTAATGAAGAAGCAAATGAAAGAGGAAAGAAAGAGACGTAAGATG 2800
Query 2299 TTGAAGAAATTTGCTGCTGAGATTAAAGATATGCCTAACGGGTATAGTGAAAATGTGGAA 2358
|| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 2801 TTTAAGAAATTTGCTGCAGAGATTAAAGATTTGCCTGATGGGTATAGTGAAAATGTGGAA 2860
Query 2359 GAGGAGAGAAGTGAACCTGCAGCTGTTCCAGTTCCCATGCCAGATTTATCTCTACCTGCA 2418
|||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2861 GAGGAGAGTGGTGGACCTGCATCAGTTCCAGTTCCTATGCCAGATTTATCTCTACCTGCG 2920
Query 2419 TCTTTTGACTCTGACAACCCTACTCACCGGTTCCGGTACCTTGATTCCTCCAATCAATGG 2478
|||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2921 TCTTTTGACTCTGATAACCCTACTCACCGCTACCGGTACCTTGATTCCTCCAATCAGTGG 2980
Query 2479 CTTGTTAGGCCAGTGCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATGAAGGTGTG 2538
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2981 CTTGTTAGGCCAGTCCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATGAAGGTGTG 3040
Query 2539 AATGCGGAACGACTGTTTGTTGTTAAAGACAAGATACCGGTATCTTTCTCTGGCCAAGTG 2598
||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| || ||||||
Sbjct 3041 AATGCAGAACGGCTCTTTGTTGTAAAAGAAAAAATACCAATATCTGTCTCAGGTCAAGTG 3100
Query 2599 ACAAAAGACAAAAAGGATGCAAATGTACAGCTGGAATTGGCCAGCTCGGTTAAACATGGA 2658
||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3101 ACAAAAGACAAGAAGGATGCAAATGTGCAGCTAGAAATGGCCAGCTCGGTTAAACATGGA 3160
Query 2659 GATGGTAGATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAAATGCTGGGAAGGAGTTGGCGTAC 2718
|| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||| ||
Sbjct 3161 GAGGGTAAATCAACTTCCCTAGGTTTCGACATGCAAACTGTTGGAAAGGAATTGGCTTAT 3220
Query 2719 ACTGTTCGAAGTGAAACAAGATTTAACAATTTTAGGAAAAACAAAGCAGCAGCTGGTCTC 2778
||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||
Sbjct 3221 ACTCTTCGAAGCGAAACGAGATTTAACAATTTCAGGAGAAACAAGGCTGCAGCTGGTCTT 3280
Query 2779 TCTGTAACACTCTTGGGTGATTCAGTGTCTGCGGGACTGAAAGTGGAAGATAAGTTGATT 2838
|||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3281 TCTGTAACACACTTGGGTGATTCGGTTTCTGCGGGGTTGAAAGTCGAAGATAAGTTTATT 3340
Query 2839 GCTAATAAACGGTTCAGAATGGTTATGTCAGGTGGAGCAATGACTAGTCGAGGAGATGTT 2898
|||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||
Sbjct 3341 GCTAGTAAATGGTTCAGAATCGTAATGTCTGGTGGAGCTATGACTAGTCGGGGAGATTTT 3400
Query 2899 GCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTTCGAGATAAAGATTATCCGCTAGGTCGGTTT 2958
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3401 GCTTATGGTGGTACTTTGGAAGCTCAGTTGAGAGATAAAGATTATCCGCTTGGTCGGTTT 3460
Query 2959 TTGTCAACTCTTGGACTTTCTGTGATGGATTGGCATGGCGATCTTGCTATCGGAGGGAAT 3018
||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3461 TTGACTACTCTTGGACTTTCTGTAATGGATTGGCACGGTGATCTTGCTATTGGAGGGAAC 3520
Query 3019 ATACAGTCTCAAGTACCCATTGGACGTTCCTCTAATCTAATTGCTCGTGCTAATCTGAAT 3078
||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3521 ATACAGTCTCAGGTTCCCATTGGACGTTCCTCTAATTTAATTGCTCGTGCTAATCTGAAC 3580
Query 3079 AACAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGCATCCGCGTAAACAGCTCTGAGCAGCTCCAACTTGCT 3138
|| |||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3581 AATAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGTGTTCGTGTTAACAGCTCCGAGCAGCTCCAACTTGCT 3640
Query 3139 GTTGTTGC-ACTTGTTCCTCTGTTCAAGAAGCTTCTTAGTTATTATTATTCCCCAGAGCA 3197
| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 3641 ATGGTTGCGA-TTGTTCCTCTCTTCAAGAAGCTACTTAGTTATTATTA--CCC--G--CA 3693
Query 3198 AATGCAATATGGACACTGATGAATAAACATT 3228
|| |||||||||||| |||| || |||||||
Sbjct 3694 AACGCAATATGGACAATGATTAAGAAACATT 3724
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 168059259050
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5