BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479191
Length=3655
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G17205.1 | Symbols: UPL6 | ubiquitin protein ligase 6 | chr3... 5686 0.0
> AT3G17205.1 | Symbols: UPL6 | ubiquitin protein ligase 6 | chr3:5873294-5881525
FORWARD LENGTH=3717
Length=3717
Score = 5686 bits (3079), Expect = 0.0
Identities = 3506/3701 (95%), Gaps = 73/3701 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CAGAAATTTTAGCTTCTGTTTGAttttgtttttgttttttCCTTTGCACGCAAATCATCC 62
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||
Sbjct 7 CAGAAATTTTTGCTTCTGTTTGATTTTGTTTTTG----CCCCTTTGCACACATATCATCC 62
Query 63 AAATTC--T-TGATTTTT---CTTT------ATC-A-C-CTTTGAAGAATCTATCTCCAG 107
|||||| | | |||||| |||| ||| | | | ||| | |||||||||
Sbjct 63 AAATTCGTTATCATTTTTCACCTTTGAAAGAATCTATCTCCTTGCTCTGT-TATCTCCAG 121
Query 108 TTCTAGGGCATAACGCCGATCACATCCCTAGCTTCTTTTGGCTCCAATCGCAGCGGATAC 167
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||
Sbjct 122 TTCTAGGGCAT-ACGCCGATCACATCCCTAGCTCCTTTTGGCTCTAAT---A----ATAC 173
Query 168 AGTAATCTTAGGTTTTCGGGCAGAGAATCGTGTATTGGTATTCTAGGTTTAGCTCAACAA 227
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 174 AGTAATCTTAGGTTTTCGGGGAGTGAATCGTGTATTGGTATTCTAGTTTTAGCTCAAGAA 233
Query 228 CATGTTTTTCTCCGGCGATCCGTCGACTCGGAAGCGAGTTGATTTAGGTGGCCGGAGCAC 287
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 234 CATGTTTTTCTCCGGCGATCCTTCGACTCGGAAGCGAGTTGATTTAGGTGGCCGGAGCAC 293
Query 288 CAAGGAAAGAGATGCTCGGAAGCTTCTGGAGCAGACTAGAATGGAGCGTAATCGTCGCTT 347
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 294 CAAGGAGAGAGATGCTCGGAAGCTTCTCGAGCAGACTAGAATGGAGCGTAATCGTCGGTT 353
Query 348 GCTACAGAAGCAGCAGAACTCTGCTGCTCTCAAAATTCAGAAATTCTTTAGAGGTCGAAG 407
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 ACTACAGAAGCAGCAGAACTCTGCTGCTCTCAAAATTCAGAAATTCTTTAGAGGTCGAAG 413
Query 408 ATCAATGGCCAGTGAGCGCTCGAAGGTGCGGCATGATTTCTGTGAAACCTATGGGAATAA 467
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 ATCAATGGCCATTGAGCGCTCGAAGGTGCGGCATGATTTCTGTGAAACCTATGGGAATAA 473
Query 468 TTGCCAGAATGTCGATAGACATTGCTTTGAGCCAGGCTCAAGTTTCCTCCGGCAGTTTCT 527
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 TTGCCAGAATGTTGATAGACATTGCTTTGAGCCAGGTTCAAGTTTCCTCCGGCAGTTTCT 533
Query 528 GttttttttCAAGGCACAAAACTCGGGAGATTTTGTGATACTTGTGGAGACTTGTCGTCT 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 GTTTTTTTTCAAGGCACAAAACTCGGGAGATTTTGTGATACTTGTGGAGACTTGTCGTCT 593
Query 588 ACTGCAGAGTTTCGTTGACAGCAGTGGTGACATTGTCAGCCTTTTTTCTGGCTTGGACTA 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 ACTGCAGAGTTTCGTTGACAGCAGTGGTGACATTGTCAGCCTTTTTTCTGGCTTGGACTA 653
Query 648 TTCCTCTGAGCATAATTTGGTGGATTTTAGAGTAAAGAAACTTGCATTTACCTGTATTGA 707
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 654 TTCTTCTGAGCATAATTTGGTGGATTTTAGAGTAAAGAAACTTGCATTTACCTGTATCGA 713
Query 708 AGCTATACACCAGAATAGGAACCGTTTAAGGGATCAGCTCTTAGTTACTCCTGAAGAAGC 767
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 GGCGATACACCAGAATAGGAACCGTTTAAGGGATCAGCTCTTAGTTACTCCTGAAGAAGC 773
Query 768 TAGCATTTCAACAGCTATCTTGATGGAGGCAGTGTCGTTGTTGCTAGATCCTAAGCTGCC 827
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 TAGCATTTCAACAGCTATCTTGATGGAGGCAGTTTCGTTGTTGCTAGATCCTAAGCTGCC 833
Query 828 TTGGGTCTGCAAAATAGTTAGTTATCTAC-ATAAAGAGAACGTATTCAAACTGGTCCGAG 886
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 834 TTGGGTCTGCAAAATAGTTAGTTATCTACAAAAAAGA-AAAGTATTCAAACTGGTCCGAG 892
Query 887 AAATGGTCACTACGGCTAAGGAAAGCCCAAGAGGTCAGACAATGACCGGCAGCATCCTTT 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 893 AAATGGTCACTACGGCTAAGGAAAGCCCAAGAGGTAAGACTATGACCGGCAACATCCTTT 952
Query 947 CACTAGAAAGAGTCTTGACACTGATAGTACCACATATTGGCCGTGAGCCATGTTGCTGCC 1006
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 CACTAGAAAGAGTATTGATACTGATAGTACCACATATTGGCCGTGAGCCATGTTGCTGCA 1012
Query 1007 CTGTTGTTGATCCACGTTGTAGTTTCTCATCTATGATTCTTACAATACCTTTGATATGGA 1066
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 CTGTTGTTGATCCACGTTGGAGTTTCTCATCTATGATTCTTACAATACCTTTGATATGGA 1072
Query 1067 AGCTCTTCCCAAATTTGAAAGTGGTCTTTGCCAACCCAAGTCTAAGTCAACACTACATTC 1126
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 AGCTCTTCCCAAACTTGAAAGTGGTATTTGCCAACCCGAGTCTAAGTCAACACTACATTC 1132
Query 1127 ACCAGATGGCTTCCTGTATTCAAAAGGATACCTGTGTTCTCCCAATGGAAACAAGCCCAG 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 ACCAGATGGCTTCCTGTATTCAAAAGGATACCTGTGTTCTCCCAATGGAAACAAGCCCAG 1192
Query 1187 AATTCCCTGGTTATGCTTGCCTGCTTGGTAATACGTTGGACACTGCAAATGTGGTGTTGT 1246
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1193 AATTCCCTGGTTATGCTTGCCTACTTGGTAACACGTTGGACACTGCAAACGTGGTGTTGT 1252
Query 1247 CACAGCCTGAATGTTCATTGGACATGGCAATTGACATTGCATTAGTTGCAACTTTCTTAT 1306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1253 CACAGCCTGAATGTTCATTGGACATGGCAATTGACATTGCATTAGTTGCAACTTTCTTTT 1312
Query 1307 TGGAGACACTTCCTCCTGTGAAATCATCAGAAAGAGAAAGCAGAC-AGAGCTCTTCTGAT 1365
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||
Sbjct 1313 TGGAGACACTTCCTCCTGTGAAATCATCAGAAGGAGAAAGTAGACAAG-GCTCTTCTGAT 1371
Query 1366 GAGGATGATATGCTAATTGACGATGTACCAGAATTAGTCTTGAATAGGGCACTTGAGCAG 1425
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||
Sbjct 1372 GAGGATGATATGTTGATTGACGATGTACCAGGATTAGTCTTGAATAAGGCTCTGGAGCAG 1431
Query 1426 CAGATAACCAATGCTATAGACTCACGTTTTCTTCTGCAGTTAACAAATGTTTTGTTCCAT 1485
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1432 CAGATAACCAATGCTATAGACTCACGCTTTCTTCTGCAGTTAACAAATGTTTTGTTCCGT 1491
Query 1486 CAAGTTTCGCTTGGTACGCAGTCATATGACGAAGATAAAGAAGCATTAGCTATTGGCACA 1545
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 CAAGTTTCGCTTGGTATGCAGTCATATGACGAAGATAAAGAAGCATTAGCTATTGGCACA 1551
Query 1546 GCCAGTTCTTTTCTGTATGCAGCATTCAACACTCTCCCTCTTGAGCGGATCATGACAATT 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GCCAGTTCTTTTCTGTATGCAGCATTCAACACTCTCCCTCTTGAGCGGATCATGACAATT 1611
Query 1606 TTGGCTTATAGGACCGAGCTTGTAGCTGTGTTGTGGAATTATATGAAACGATGCCATGAG 1665
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 TTGGCTTATAGAACAGAGCTTGTAGCTGTGTTGTGGAATTATATGAAACGATGCCATGAG 1671
Query 1666 AACCAGAAGTGGTCATCCATGCCTAAACTCCTAGCTTACCTTCCAGGGGATGCTCCGGGT 1725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1672 AACCAGAAGTGGTCATCCATGCCTAAACTCCTAGCTTACCTTCCAGGGGATGCTCCCGGT 1731
Query 1726 TGGCTATTACCTCTGGTTGTTTTTTGTCCTGTTTATAAGCATATGCTTATGATAGTCGAC 1785
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732 TGGCTGTTACCTCTGGTTGTTTTTTGTCCTGTTTATAAGCATATGCTTATGATAGTCGAC 1791
Query 1786 AATGAGGAGTTTTATGAACGAGAGAAGCCATTATCGCTACAAGATATCAGGTTGCTCATC 1845
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 AATGAGGAGTTTTATGAAAGAGAGAAGCCATTATCGCTACAAGATATCAGGTTGCTCATC 1851
Query 1846 ATTATTCTTAAGCAAGCTTTATGGCAGTTACTATGGGTAAATCCACTTACGCAACCTAAC 1905
||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 ATTATCCTTAAGCAGGCTTTATGGCAGTTACTGTGGGTGAATCCACTTACGCAACCTAAC 1911
Query 1906 ACTGGGAAATCTGTCTCCAATGACCTCTCGAAGAAGAACCCTGTTGAATTGATTCAGAAC 1965
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1912 ACTGGGAAATCTGTCTCCAATGACCTCTCGAAGAAGAACCCTATTGAACTGATTCAGAAC 1971
Query 1966 AGGGTTGGGG-TTGTAGTCTCTGAGTTACTTTCACAGCTGCAAGATTGGAACAACCGGCA 2024
| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1972 A-GGATGGGGATTGTAGTCTCTGAGTTACTTTCACAGTTGCAAGATTGGAACAACCGGAA 2030
Query 2025 ACAATTCACTTCCTCGAGTGACTTCCAAGCTGATACAGTCAATGAATATTTCATCTCTCA 2084
||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 ACAATTCACTTCCTCAAGTGACTTCCAAGCAGATTCAGTCAATGAATATTTCATCTCTCA 2090
Query 2085 GGCCATAGTGGAAGGAACGAGAGCCAACTACATACTGATGCAAGCTCCGTTCTTGATTCC 2144
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 GGCCATAATGGAAGGAACGAGAGCCAACTACATACTGATGCAAGCTCCGTTCTTGATTCC 2150
Query 2145 GTTTACAAGCAGAGTCAAAATATTCACAACACAATTAGCAACGGCAAGGCAGAGTCATGG 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151 GTTTACAAGCAGAGTCAAAATATTCACAACACAATTAGCAACGGCAAGGCAGAGTCATGG 2210
Query 2205 ATCGCAAGGAATTTTTGCTCGAAATCGGTTCAGAATACGAAGAGATCATATCTTGGAAGA 2264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 ATCGCAAGGAATTTTTGCTCGAAATCGGTTCAGAATACGAAGAGATCATATCTTGGAAGA 2270
Query 2265 TGCTTACAATCAAATGAGTGCGTTGTCAGAGGATGATCTCCGGGGGTCGATTCGCGTGAC 2324
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||
Sbjct 2271 TGCTTACAATCAAATGAGTGCGTTATCAGAGGATGATCTACGGAGCTCGATTCGTGTGAC 2330
Query 2325 ATTTGTCAATGAACTCGGAGTTGAGGAAGCTGGTATTGATGGTGGTGGCATTTTCAAAGA 2384
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331 ATTTGTGAATGAACTCGGAGTTGAGGAAGCTGGTATTGATGGTGGTGGCATTTTCAAAGA 2390
Query 2385 CTTCATGGAGAAAATTACCCGAGCAGCCTTTGATGTGCAATACGGGTTGTTTAAGGAGAC 2444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 CTTCATGGAGAAAATTACCCGAGCAGCCTTTGATGTGCAATACGGGTTGTTTAAGGAGAC 2450
Query 2445 GGCTGATCACATGCTTTATCCTAATCCTGGGTCAGGAATGATACATGACCAGCATCTCCA 2504
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2451 CGCTGATCACATGCTTTATCCTAATCCTGGATCAGGAATGATACATGAACAGCATCTCCA 2510
Query 2505 GTTCTTTCATTTTCTCGGCAGTCTTCTTGCAAAAGCAATGTTTGAAGGGATTCTAGTTGA 2564
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2511 GTTCTTTCATTTTCTCGGCAGTCTCCTCGCAAAAGCTATGTTTGAAGGGATTCTTGTTGA 2570
Query 2565 TATACCATTTGCAACGTTTTTCCTCAGCAAACTGAAACAAAAGTACAACTATTTGAACGA 2624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 TATACCATTTGCAACGTTTTTCCTCAGCAAACTGAAACAAAAGTACAACTATTTGAACGA 2630
Query 2625 TTTGCCTTCTCTGGATCCTGAGTTGTATAGGCACCTTATATTTCTGAAGCGTTATAAGGG 2684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2631 TTTGCCTTCTCTGGATCCTGAGTTGTATAGGCACCTTATATTTCTGAAGCGTTATAAGGG 2690
Query 2685 TGATATCTCAGATTTGGAGCTTTACTTTGTTATTTTGAATAATGAATATGGAGAGAGGAC 2744
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2691 TGATATCTCAGACTTGGAGCTTTACTTTGTTATTTTGAATAATGAATATGGAGAGAGGAC 2750
Query 2745 AGAGGAAGAGCTACTTCCAGGGGGACAAGACATGCGAGTTACAAATGAGAATGTTATAAC 2804
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2751 AGAGGAAGAGCTACTTCCAGGGGGCCAAGACATGCGAGTTACAAATGAGAATGTTATAAC 2810
Query 2805 TTTCATTCATCTGGTTTCCAATCATCGGTTAAATTTTCAGATACGCCAGCAGAGTTCTCA 2864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 TTTCATTCATCTGGTTTCCAATCATCGGTTAAATTTTCAGATACGCCAGCAGAGTTCTCA 2870
Query 2865 TTTCTTGAGGGGGTTTCAGCAACTCATTCC-AAAGGAATGGATCGACATGTTCAATGAGC 2923
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2871 TTTCTTGAGGGGGTTTCAGCAACTCATTCCGAAAG-AATGGATCGACATGTTCAATGAAC 2929
Query 2924 ATGAGCTTCAGGTTCTCATATCTGGTTCAGTTGACAGTTTGGATATTGACGACTTGCGAA 2983
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2930 ATGAGCTTCAGGTTCTCATATCTGGTTCAGTTGATAGTTTGGATATAGACGACTTGCGAA 2989
Query 2984 ACAACACTAATTATGCTGGAGGCTACCACGCGGGACATTATGTGATCGATATGTTCTGGG 3043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 ACAACACTAATTATGCTGGAGGCTACCACGCGGGACATTATGTGATCGATATGTTCTGGG 3049
Query 3044 AAGTTATGAAAAGCTTCTCAACTGAAAACCAGAAGAAGTTCTTAAAGTTTGTGACGGGCT 3103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3050 AAGTTATGAAAAGCTTCTCAACTGAAAACCAGAAGAAGTTCTTAAAGTTTGTGACAGGCT 3109
Query 3104 GTTCTCGAGGACCACTGCTCGGTTTCAAATACTTGGAACCTGCATTCTGCATACAGAGGG 3163
| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 GCTCACGAGGACCACTGCTGGGTTTCAAATACTTGGAACCTGCATTCTGCATACAGAGGG 3169
Query 3164 CTGCCGGTAGTGCGAGTAATGAATCAGTTGATAGACTACCGACATCAGCCACTTGTATGA 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 CTGCCGGTAGTGCGAGTAATGAATCAGTTGATAGACTACCGACATCAGCCACTTGTATGA 3229
Query 3224 ATCTTCTTAAGCTTCCGCCTTATCAAAGCAAAGAGCTACTTGAGACGAAATTGATGTACG 3283
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3230 ATCTTCTTAAGCTTCCGCCCTATCAAAGCAAAGAGCTACTTGAGACCAAATTGATGTACG 3289
Query 3284 CCATAAGCGCAGAAGCGGGTTTTGATCTGAGCTGA-G------C--C-T---TAAAAGAC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | | ||| ||
Sbjct 3290 CCATAAGCGCAGAAGCGGGTTTTGATCTGAGCTGATGGAATAGCTTCCTGCCTTAAACAC 3349
Query 3331 AGACTTGCA-TGGCCCCAAATTGACACCCTTTTATCTAGCGTTCCTTGGTTATGGTATAA 3389
|||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||
Sbjct 3350 AGACTT-CAATGGCCCCAAATTGACACCCTTTTTTCTAGCATTCCTCG-TTATGGTATAA 3407
Query 3390 ACCGGTTA-CCTGTAGACTGAGGCAGGCTTGTTGGCTCTAAGCATCTAAGAGACGGATCT 3448
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 ACCGGGTAACCTGTAGACTGAGGCAGGCTTGTTGGCTCTAAGCATCTAAGAGACGGATCT 3467
Query 3449 AGAAGGGGAACATGTACTAGAGATTACTTAACTAATGGGTTTCATTTGCAGC-CTACGGG 3507
|||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3468 AGAAGGAGAACATGTAGTAGAGATTACTTGACTAATGGGTTTCATTTGCAGCTCT-CGGG 3526
Query 3508 TATTCGCTTTaaaaaa-tgtgtccaaaacaaagaaaaa---a--a-aGGGT-GA-TT-AC 3557
|||||||||| ||||| |||| | |||| ||| ||||| | | |||| | || |
Sbjct 3527 TATTCGCTTTCAAAAAGTGTGAC-AAAA-AAA-AAAAAGTGATTACAGGGAAGTCTTTAT 3583
Query 3558 GGGGAAG-TCTT-AGAGTTAGTATTGGGTTAAAAATTCAATAAAATAAATGGTAAATAAG 3615
||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3584 TTGGAAGCTCCTGAGAGTTAGTCTTGGGTTAAAAATTCAATAAAAGAAATGGTAAATAAG 3643
Query 3616 ACAGGTCTCAAGTTTGGAACTCAAATGCTGTAAATT-TTTT 3655
|| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3644 ACTGGTCTCAAGA--GGAACTTAAATGCTGTAAATTATTTT 3682
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182005669204
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5