BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479638
Length=3734
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G21180.1 | Symbols: ACA9, ATACA9 | autoinhibited Ca(2+)-ATPa... 6093 0.0
> AT3G21180.1 | Symbols: ACA9, ATACA9 | autoinhibited Ca(2+)-ATPase
9 | chr3:7425519-7432200 FORWARD LENGTH=3771
Length=3771
Score = 6093 bits (3299), Expect = 0.0
Identities = 3621/3770 (96%), Gaps = 47/3770 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTTCTCttttttttCTCTGTAATTGACAGAGAGGTAAGAGaaaaaaaaGAGAGAAAGT 60
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGTTTCTCTTTTTTTTCTCTGTGATTGACAGAGAGGTAAGAGAAAAAAAAGAGAGAAAGT 60
Query 61 GTTTTCGGTTTTTGTTGCCTTCTCTTGAGTTAGGCCTTCTCTCTTCCGTCCCACCATCAt 120
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 61 G-TTTCGGTTTTTGTTGCCTTCTCTCGAGTTAGGCCTTCTCTCTTCCGTCACACCATCA- 118
Query 121 tttttttttttCCATAACGACCAAATCATAAAACAGGTCGTTCCTA-TTTTTC-TT-TCT 177
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||
Sbjct 119 -TTTTTTTTCTCCATAACGACCAAATCATAAAACCGGTCGTTCCTATTTTTTCTTTCTCT 177
Query 178 -C------TG---CG------T---T----TTTTGAAAG-AAGAAGAAAGCTGGGTGAGA 213
| || || | | |||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 178 GCGTTTTTTGTTTCGAATTCTTCAATAGAATTTTAAAAGAAAGAAGAAAGCTGGGTGAGA 237
Query 214 CGAAGGAAGGAAGAATGAGCACTTCGTCGAGCAATGGATTGCTCCTGACGTCAATGTCAG 273
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 238 CGAAGGAAGGAAGAATGAGCACTTCGTCGAGCAACGGATTGCTTCTGACGTCAATGTCAG 297
Query 274 GTCGTCATGACGACATGGAAGCTGGTTCTGCTAAAACTGAAGAACATTCTGATCATGAAG 333
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 GACGTCATGACGACATGGAAGCTGGTTCTGCTAAAACTGAAGAACATTCTGATCATGAAG 357
Query 334 AGCTTCAACATGATCCTGATGATCCTTTTGACATTGATAACACCAAGAATGCTTCTGTTG 393
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 358 AGCTTCAACATGATCCTGATGATCCTTTTGATATTGATAACACCAAGAACGCTTCTGTTG 417
Query 394 AATCTCTTCGTCGTTGGAGGCAAGCGGCTCTTGTGTTGAACGCATCTCGTCGGTTTCGAT 453
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 418 AATCTCTTCGTCGTTGGAGACAAGCCGCTCTTGTGTTGAACGCATCGCGTCGGTTTCGAT 477
Query 454 ACACTTTGGATCTTAATAAAGAAGAACATTATGATAATCGAAGGAGGATGATCAGAGCTC 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 ACACTTTGGATCTTAATAAAGAAGAACATTATGATAATCGAAGGAGGATGATCAGAGCTC 537
Query 514 ATGCTCAAGTCATTAGGGCAGCATTGCTTTTTAAATTGGCTGGTGAACAACAACTTGCGT 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 538 ATGCTCAAGTCATTAGGGCAGCATTGCTTTTTAAACTGGCTGGTGAACAACAAATTGCGT 597
Query 574 TTGGATCATCATCAACACCAGCAGCTTCAACTGGTAACTTTGACATTGATCTTGAAAAGC 633
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 TTGG---ATCATCAACACCAGCAGCTTCTACTGGTAACTTTGACATTGATCTTGAAAAGC 654
Query 634 TTGTGTCAATGACAAGGAACCAGAAGATGTCCAATTTGCAGCAATATGGAGGGGTCAAAG 693
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TTGTGTCTATGACAAGGAACCAGAACATGTCCAATTTGCAGCAATATGGAGGGGTCAAAG 714
Query 694 GTGTTGCAGAGAAGCTGAAGTCAAATATGGAACAAGGAATCAATGAGGATGAGAAAGAGG 753
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GTGTTGCAGAGAAGTTGAAGTCAAATATGGAACAAGGAATCAATGAGGATGAGAAAGAGG 774
Query 754 TGATAGATGGGAAGAATGCTTTTGTATCTAACACATACCCAAAGAAGAAGGGGAAAAACG 813
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 775 TGATAGATAGGAAGAATGCTTTTGGATCTAACACTTACCCAAAAAAGAAGGGGAAAAACT 834
Query 814 TCTTTATGTTCCTCTGGGAAGCTTGGCAAGATTTAACTCTCATCATCTTGATCATAGCGG 873
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 TTTTTATGTTCCTCTGGGAAGCTTGGCAAGATTTAACTCTCATCATCTTGATCATAGCGG 894
Query 874 CTGTAACATCGA-TGGCATTGGGAATAAAAACAGAGGGTTTGAAAGAAGGTTGGCTTGAT 932
|||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 CTGTAACATC-ATTGGCATTGGGAATAAAGACAGAGGGTTTGAAAGAAGGTTGGCTTGAT 953
Query 933 GGTGGAAGCATTGCCTTTGCGGTTTTGCTTGTCATTATTGTTACAGCTGTTAGTGACTAT 992
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 GGTGGAAGCATTGCCTTTGCGGTTTTGCTTGTCATTGTTGTTACAGCTGTTAGTGACTAT 1013
Query 993 CGCCAATCTCTCCAGTTTCAAAACCTCAACGATGAAAAAAGAAATATACAACTGGAGGTC 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1014 CGCCAATCTCTCCAGTTTCAAAACCTCAACGATGAAAAAAGAAATATACAACTAGAGGTC 1073
Query 1053 ATGAGAGGAGGGAGAACAGTGAAGATTTCAATCTATGACGTTGTTGTCGGAGATGTTATA 1112
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 ATGAGAGGAGGGAGAACAGTGAAGATATCAATCTATGACGTTGTTGTCGGAGATGTTATA 1133
Query 1113 CCTCTTAGGATAGGTGACCAGGTCCCTGCGGATGGAGTGCTAATTAGTGGTCATTCTCTT 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 CCTCTTAGGATAGGTGACCAGGTCCCTGCGGATGGAGTGCTAATTAGTGGTCATTCTCTT 1193
Query 1173 GCTATTGATGAATCTAGCATGACCGGTGAAAGCAAGATTGTTCACAAGGATCAAAAATCA 1232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 GCTATTGATGAATCTAGCATGACCGGTGAAAGCAAGATTGTTCACAAGGATCAAAAATCC 1253
Query 1233 CCTTTTCTAATGTCTGGTTGTAAAGTAGCTGATGGAGTCGGTAACATGCTGGTTACTGGT 1292
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 CCTTTTCTAATGTCTGGCTGTAAAGTAGCTGACGGAGTCGGTAACATGCTGGTTACTGGT 1313
Query 1293 GTTGGAATTAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGGCAAGTATCTCAGAGGATACTGGTGAA 1352
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1314 GTTGGAATCAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGGCAAGTATCTCAGAAGATACTGGTGAA 1373
Query 1353 GAAACTCCCGTGCAGGTTCGGTTAAATGGTCTTGCAACCTTCATCGGTATAGTGGGGCTT 1412
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1374 GAAACTCCATTGCAGGTGAGGTTAAATGGTCTTGCAACCTTCATAGGGATAGTGGGGCTC 1433
Query 1413 TCAGTGGCTCTTGTTGTCCTGGTGGCTCTTCTTGTGAGATATTTTACCGGAACTACTCAA 1472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 TCAGTGGCTCTTGTTGTCCTGGTGGCTCTTCTTGTGAGATATTTTACCGGAACTACTCAA 1493
Query 1473 GATACTAATGGAGCGACTCAGTTTATCAAAGGGACGACTAGTATCAGTGACATTGTAGAT 1532
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 GATACTAATGGAGCGACCCAGTTTATCAAAGGGACGACTAGTATCAGTGACATTGTAGAT 1553
Query 1533 GATTGTGTAAAGATATTTACAATCGCCGTGACAATTGTTGTTGTGGCTGTGCCTGAGGGA 1592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 1554 GATTGTGTAAAGATATTTACAATCGCCGTGACAATTGTGGTTGTAGCAGTGCCTGAGGGA 1613
Query 1593 CTTCCCTTAGCAGTTACCCTCACTTTGGCTTACTCAATGAGAAAGATGATGGCAGACAAA 1652
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 CTTCCCCTAGCAGTTACCCTCACTTTGGCTTACTCAATGCGAAAGATGATGGCAGACAAA 1673
Query 1653 GCTTTGGTTAGAAGGCTTTCAGCTTGTGAAACCATGGGCTCAGCAACAACAATCTGCAGT 1712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 GCTTTGGTTAGAAGGCTTTCAGCTTGTGAAACCATGGGATCAGCAACAACAATCTGCAGT 1733
Query 1713 GACAAAACTGGAACTTTAACTTTGAATCAGATGACTGTGGTTGAAACTTATGCTGGAGGA 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 GACAAAACTGGAACTTTAACTTTGAATCAGATGACTGTGGTTGAAACTTATGCTGGAGGA 1793
Query 1773 TCAAAGATGGATGTAGCGGACAACCCTTCTGGTCTCCACCCTAAACTTGTTGCCTTAATA 1832
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 TCAAAGATGGATGTAGCAGACAACCCTTCCGGTCTCCACCCTAAACTTGTTGCCTTAATA 1853
Query 1833 AGTGAGGGTGTGGCACAAAACACAACAGGAAACGTTTTTCATCCCAAGGAAGGTGGAGAG 1892
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1854 AGTGAGGGTGTTGCACAAAACACAACAGGAAACATTTTTCATCCCAAGGATGGTGGAGAG 1913
Query 1893 GTGGAGATTTCTGGATCTCCAACAGAGAAGGCTAT-CTTGTCCTGGGCGTATATGTTGGG 1951
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||
Sbjct 1914 GTGGAGATTTCTGGATCTCCCACAGAGAAGGCTATTCT-GTCTTGGGCTTATAAGTTGGG 1972
Query 1952 GATGAAGTTTGATACCATCAGGTCGGAGTCTGCTATCATCCATGCTTTCCCTTTCAATTC 2011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1973 GATGAAGTTTGATACCATCAGGTCGGAGTCTGCTATCATCCATGCCTTCCCTTTCAATTC 2032
Query 2012 AGAGAAAAAGCGTGGTGGTGTTGCTTTGCTTCGAGGTGATTCTGAAGTTTCCATTCACTG 2071
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2033 AGAGAAAAAGCGTGGTGGTGTTGCTGTGCTTCGAGGTGATTCTGAAGTTTTCATTCACTG 2092
Query 2072 GAAGGGAGCAGCAGAGATAGTTTTGGCTTGCTGTACACAATACATGGACTCAAATGGTAC 2131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 GAAGGGAGCAGCAGAGATAGTTTTGGCTTGCTGTACACAATACATGGACTCAAATGGTAC 2152
Query 2132 TCTGCAGTCCATTGATAGCCAGAAGGAATTTTTCAGAGTTGCTATCGATAGCATGGCGAA 2191
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 TCTGCAGTCCATTGAGAGCCAAAAGGAATTTTTCAGAGTTGCTATCGATAGCATGGCGAA 2212
Query 2192 AAATAGCTTGCGATGTGTTGCTATTGCATGCAGAACACAAGAACTGAACCAAGTTCCCAA 2251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2213 AAATAGCTTGCGATGTGTTGCTATTGCATGCAGAACACAAGAGCTGAACCAAGTTCCCAA 2272
Query 2252 GGAACAAGAGGACTTGGATAAATGGGCTTTACCTGAAGATGAACTGATTTTGCTTGCTAT 2311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2273 GGAACAAGAGGACTTGGATAAATGGGCTTTACCTGAAGATGAACTCATTTTGCTTGCTAT 2332
Query 2312 CGTTGGGATAAAGGATCCTTGTCGTCCTGGTGTCAGAGAAGCAGTGAGAATCTGCACTAG 2371
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2333 CGTTGGCATAAAGGATCCTTGTCGTCCCGGTGTCAGAGAAGCAGTGAGAATCTGTACCAG 2392
Query 2372 TGCTGGTGTTAAGGTACGAATGGTGACTGGTGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATTGC 2431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 TGCTGGTGTTAAGGTACGAATGGTGACTGGTGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATTGC 2452
Query 2432 TTTGGAGTGTGGTATACTTTGTTCAGATACAGAAGCTGTTGAGCCTACTATCATCGAAGG 2491
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 TTTGGAGTGTGGTATACTTTCTTCAGATACAGAAGCTGTTGAGCCTACTATCATCGAAGG 2512
Query 2492 AAAAGTGTTCCGTGAGCTATCTGAAAAAGAGAGAGAACAAGTAGCCAAGAAAATAACGGT 2551
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 AAAAGTGTTCCGTGAGCTATCTGAGAAAGAGAGAGAACAAGTAGCCAAGAAAATAACGGT 2572
Query 2552 GATGGGTAGGTCATCTCCTAATGACAAGCTTTTACTTGTTCAAGCACTACGGAAAAATGG 2611
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 GATGGGTAGGTCATCTCCTAACGACAAGCTCTTACTTGTTCAAGCACTACGGAAAAATGG 2632
Query 2612 AGATGTTGTTGCTGTCACTGGTGATGGTACTAATGATGCTCCTGCACTTCATGAGGCAGA 2671
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2633 AGATGTTGTTGCAGTCACTGGTGATGGTACTAATGATGCTCCTGCCCTCCATGAGGCAGA 2692
Query 2672 CATAGGTCTCTCTATGGGTATATCAGGAACTGAAGTTGCGAAAGAGAGTTCCGACATCAT 2731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2693 TATAGGTCTCTCTATGGGTATATCAGGAACTGAAGTTGCAAAAGAGAGTTCTGACATCAT 2752
Query 2732 TATTTTGGATGACAATTTTGCTTCAGTAGTAAAGGTTGTTCGCTGGGGCCGTTCTGTGTA 2791
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2753 TATTTTGGATGACAATTTTGCTTCAGTAGTAAAGGTTGTTCGTTGGGGCCGTTCTGTGTA 2812
Query 2792 TGCAAATATTCAGAAATTCATACAATTCCAGCTTACTGTGAATGTTGCAGCACTTATAAT 2851
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2813 TGCTAACATTCAGAAATTCATACAATTCCAGCTTACTGTGAATGTTGCCGCACTTATAAT 2872
Query 2852 CAATGTTGTAGCAGCAATGTCTTCTGGTGACGTTCCTCTAAAGGCTGTCCAGCTGCTTTG 2911
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2873 CAATGTTGTAGCAGCAATGTCTTCTGGTGACGTCCCTCTAAAGGCTGTACAGCTGCTTTG 2932
Query 2912 GGTCAACCTTATCATGGATACTCTTGGAGCACTTGCACTCGCTACAGAGCCACCAACCGA 2971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 GGTCAACCTTATCATGGATACTCTTGGAGCACTTGCACTAGCTACAGAGCCACCAACCGA 2992
Query 2972 TCATCTTATGCATAGAACCCCTGTTGGAAGAAGGGAACCTCTTATAACAAACATCATGTG 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 TCATCTTATGCATAGAACCCCTGTTGGAAGAAGGGAACCTCTTATAACAAACATCATGTG 3052
Query 3032 GAGGAACTTGCTTGTTCAGTCATTCTATCAAGTGGCTGTTCTCCTGGTTCTCAACTTTGC 3091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3053 GAGGAACTTGCTTGTTCAGTCATTCTATCAAGTGGCTGTTCTCCTAGTTCTCAACTTTGC 3112
Query 3092 AGGATTAAGCATTCTTGGCTTGAACCATGAAAACCATGCACATGCTGTGGAAGTGAAGAA 3151
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 AGGCTTAAGCATTCTTGGCTTGAACCATGAAAACCATGCACATGCTGTGGAAGTGAAGAA 3172
Query 3152 CACTATGATATTCAATGCCTTTGTCATGTGTCAAATATTCAACGAGTTCAATGCAAGGAA 3211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3173 CACTATGATATTCAATGCCTTTGTCATGTGTCAAATATTCAACGAGTTCAACGCAAGAAA 3232
Query 3212 ACCTGATGAAATGAATGTTTTCCGGGGAGTATCTAAGAACCCTCTCTTCGTAGCAATTGT 3271
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 ACCTGATGAAATGAATGTATTCCGGGGAGTAAATAAGAACCCTCTCTTCGTAGCAATTGT 3292
Query 3272 TGGAGTCACTTTTATACTTCAGAT-ACTCATCGTTACTTTCCTCGGAAAGTTTGCCCACA 3330
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3293 TGGAGTCACTTTTATACTTCAGATCA-TCATCGTTACTTTCCTCGGAAAGTTTGCTCACA 3351
Query 3331 CCGTTAGACTGGGATGGCAGCTATGGCTTGCTTCTATTCTCATTGGATTGGTCAGCTGGC 3390
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3352 CCGTTAGACTGGGATGGCAGTTATGGCTTGCTTCTATAATCATTGGATTGGTCAGCTGGC 3411
Query 3391 CACTAGCAATTGTTGGGAAACTGATTCCTGTACCCAAGACTCCGATGAGCGTCTACTTCA 3450
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3412 CACTAGCAATTGTTGGGAAACTGATCCCTGTACCCAAGACACCGATGAGCGTCTACTTCA 3471
Query 3451 AGAAACCGTTCCGTAAATACAAAGCTTCAAGAAATGCATAAAACATA-AGTACTAGGTTC 3509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 3472 AGAAACCGTTCCGTAAATACAAAGCTTCAAGAAATGCATAAAACATACA--ACTAGGTTC 3529
Query 3510 TCA-CCTTCCTCATACAGAAGCAATAACAGATATAACCTGTGACAATGGCCTAAACCTCT 3568
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3530 TCAGCCTTCCTCATACAGAAGCAATAACAGATATAACCTGTGACAATGGCCTAAACCTCT 3589
Query 3569 AACctttctttctttcttttttAAA--TGGTAAAAGTATTTTCAAATGTATACTGCATTG 3626
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3590 AACCTTTCTTTCTATCTTTTTTAAAAATGGTAAAAGTATTTTCAAATGTATACTGCAATG 3649
Query 3627 A--TCCAATTCTTTTGTCCCTTTTCATATTTCTTCTTTTTGTATGATGTAAAAGTGCAAC 3684
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 AGATCCAATTCTTTTGTCCCTTTTCATATTTCTTCTTTTTGTATGATGTAAAAGTGCAAC 3709
Query 3685 TGTGAATTGAATTGGATTTGTGGTTGTACTAACGAGGGTTTGGCTCAGTC 3734
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3710 TGTGAATTGAATTGGATTTGTGGTTGTACTAACGAGAGTTTGGCTCAGTC 3759
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 185968857701
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5