BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479664
Length=3734
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G21430.2 | Symbols: ATALY3, ALY3 | DNA binding | chr3:754462... 6072 0.0
> AT3G21430.2 | Symbols: ATALY3, ALY3 | DNA binding | chr3:7544628-7553579
REVERSE LENGTH=3739
Length=3739
Score = 6072 bits (3288), Expect = 0.0
Identities = 3595/3744 (96%), Gaps = 17/3744 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAATCGCTCCTTCGATCGCTC--AAAACCCGCAGAAGCTCTGATCTGTTCATATTCCGAT 58
||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 CAATCTCTCTTTCGATCGCTCAAAAAACCCGAAGAAGCTCTGATCTGTTCATATTCCGAT 62
Query 59 CTCTTCCCGGATTTCTCCAATTTCTCTCTGTAATTTATTCTTCAAGTCCCGGCGATGGCT 118
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 CTCTTACCGGATTTCTCTAATTTCTCTCTGTAATTTCTTCTTCAAGTCCCGGCGATGGCT 122
Query 119 TCCAAGTGATTTTGGATTCT-TGTAGGTAACAGAAGAAC-TTAACTTATGGCGCCCTCAA 176
||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 123 TCCGAGTGATTTTGGATT-TGTGTAGGTAACAGAAGAGCTTTAACTTATGGCGCCCTCAA 181
Query 177 GATCAAAGAAATCTAAGTACAAGAAAAAGCCCCGTGCCAAAGCTGTTTCTCCTCACAAAG 236
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 GATCAAAGAAATCTAAGTACAAGAAGAAGCCTCGTGCTAAAGCTGTTTCTCCTCACAAAG 241
Query 237 ACGAAGATAGTATGAGCAAAACCAAACAACGGAAGAGGAAGCTGTCAGATATGTTAGGTC 296
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 242 ACGAAGAAAGTATGAGCAAAACTAAACAACGGAAGAGGAAGTTGTCGGACATGTTAGGTC 301
Query 297 CTCAGTGGAGCAAGGAAGAGTTGGAGCGCTTTTATGAAGGATACCGCAAATTCGGAAAAG 356
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 CTCAGTGGAGCAAGGAAGAGTTAGAGCGCTTTTATGAAGGATACCGCAAATTCGGAAAAG 361
Query 357 AATGGAAAAAGGTGGCTGCATTTGTACATAGCCGTTCTGCAGAAATGGTAGAGGCCCTAT 416
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 362 AATGGAAAAAGGTTGCTGGATTTGTACATAGCCGTTCTGCAGAAATGGTAGAGGCCTTAT 421
Query 417 ACACTATGAATAAGGCTTACTTGTCTCTTCCGGAAGGCACTGCTTCTGTGGTTGGCCTAA 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 422 ACACTATGAATAAGGCTTACTTGTCTCTTCCGGAAGGCACTGCATCTGTGGTTGGCCTAA 481
Query 477 ATGCAATGATGACGGATCACTACTCTGTTTTGCATGGAGGAAGTGACAGTGAGCAGGAAA 536
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 CTGCAATGATGACGGATCACTACTCTGTTCTGCATGGAGGAAGTGACAGTGAGCAGGAAA 541
Query 537 ACAATGAAGGTATTGAAACTCTGAGGTCAGCCCCTAAGCGCTCTAGAGTAAAATCCTCAG 596
| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 ATAATGAAGGCATTGAAACTCCGAGGTCAGCCCCTAAGCGCTCTAGAGTAAAATCCTCAG 601
Query 597 ATAATCCCTCTATAGGACTAGAGGGTCTGTCTGACCGCTTGCAATTTAGGTCCTCCTCAG 656
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 602 ATCATCCCTCTATAGGACTAGAGGGTCTGTCTGACCGCTTACAATTTAGGTCCTCCTCAG 661
Query 657 GCTTCATGCCGTCACTGAAGAAGAGACGTACTGAGACTATGCCTCGTGCTGTTGGAAAAA 716
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 GCTTCATGCCATCGCTGAAGAAGAGACGTACTGAGACTATGCCTCGTGCTGTTGGAAAAA 721
Query 717 GGACACCTAGAATTCCTATCTCATATACCCTTGAGAAGGATACTAGGGAAAGATATTTAT 776
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 GGACTCCTAGAATTCCTATCTCATACACCCTTGAGAAGGATACTAGGGAAAGATATTTAT 781
Query 777 CACCTGTTAAGAGAGGTCTAAATCAGAAGGGGGATGATACTGATGACGATATGGAACATG 836
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 782 CACCTGTTAAGAGAGGTTTAAATCAGAAGGGGGATGATACTGATGATGATATGGAACATG 841
Query 837 AGATAGCATTAGCATTGGCTGAGGCTTCACAACGAGGTGGCTCTACAAAGAATTCCCACA 896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 842 AGATAGCATTAGCATTGGCTGAGGCTTCACAACGAGGTGGCTCTACAAAGAACTCCCACA 901
Query 897 CACCAAATAGAAAAGCAAAGATGTACCCCCCTGATAAAAAGGGTGAAAGAATGCGTGCTG 956
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 902 CACCAAATAGAAAAGCAAAGATGTACCCCCCTGATAAAAAGGGTGAAAGAATGCGTGCCG 961
Query 957 ATATTGACTTGGCGATTGCCAAGCTTCATGCCACTGATATGGAAGATGTCCGATGTGAAC 1016
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 962 ATATTGACTTGGCGATTGCCAAGCTTCATGCCACTGATATGGAAGATGTCCGCTGTGAAC 1021
Query 1017 CAAGCTTAGGAAGCACTGAAGCTGATAATGGGGATTATTCTGGAGGTAGAAATGACTTGA 1076
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 CAAGCTTAGGAAGCACTGAAGCTGATAATGCGGATTATTCTGGAGGTAGAAATGACTTGA 1081
Query 1077 TGCATGGAGAAGGTTCTAGTGCCGTGGAAAAGCAGCAAAAAGGAAGAACATACTATAGGA 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 CACATGGAGAAGGTTCTAGTGCCGTGGAAAAGCAGCAAAAAGGAAGAACATACTATAGGA 1141
Query 1137 GGAGATTAGGCATTAAAGAAGAAGATGCAAAAGAAGCCTGCAGTGGTACAGACGAAGCAC 1196
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1142 GGAGAGTAGGCATTAAAGAAGAAGATGCAAAAGAAGCCTGCAGTGGTACAGATGAAGCAC 1201
Query 1197 CAAGCTTAGGGGCTCCCGATGAGAAATTTGAACCAGAAAGGGATGGGAAGTCTTTGAAAT 1256
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 1202 CAAGCTTAGGCGCTCCCGATGAGAAATTTGAACAAGAAAGGGAAGGGAAGGCTTTGAAAT 1261
Query 1257 TCACATATAAAGTTTCAAGGAGaaaaagtaaaaaaaGTCTCTTTACTGCAGATGAAGACA 1316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1262 TCACATATAAAGTTTCAAGGAGAAAAAGTAAAAAAAGTCTTTTTACTGCAGATGAAGACA 1321
Query 1317 CAGCATGTGATGCTCTCCAGACGCTGGCAGATTTATCGCTGATGATGCCTGAAACTGCCA 1376
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 CAGCATGTGATGCTCTCCATACGCTGGCAGATCTATCGCTGATGATGCCTGAAACTGCCA 1381
Query 1377 CAGATACTGAGTCATCAGTTCAAGCTGAGGAAAAGAGAGCTGGAAAAGCTTATGTTTCAG 1436
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1382 CTGATACTGAGTCATCAGTTCAAGCTGAGGAAAAGAAAGCTGGAGAAGCTTATGTTTCAG 1441
Query 1437 ATTTTAAAGGGACTGATCCAGCATCCATGTCTAAAAGTAGTTCTCTTAGAAACTCCAAAC 1496
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 ATTTTAAAGGGACTGATCCGGCATCCATGTCTAAAAGTAGTTCTCTTAGAAACTCCAAAC 1501
Query 1497 AGAGAAGATCCGGCACCAATGACCTTTGTGATACTGAACCCGAGCGAAAGAGTCCAAGTA 1556
||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||||
Sbjct 1502 AGAGAAGATACGGCAGCAATGACCTTTGTAACCCTGAACTCGAGAGAAAAAGTCCAAGTA 1561
Query 1557 GCTCTTTAATCCGAAAGAGACGGCAGAAAGTATTACCAGCTAAAGTAAGAGAAGATGTTC 1616
| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1562 GTTCTTTAATCCAAAAGAGACGGCAGAAAGCATTACCAGCTAAAGTAAGAGAAAATGTTC 1621
Query 1617 TTAAAGATGAGCTTGCTGCAAGCTCAAAAGTCATAGAGCCTAGTAATAACAAGGGAATAG 1676
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1622 TTAAAGATGAGCTTGCTGCAAGCTCACAAGTCATAGAGCCTTGTAATAGCAAGGGAATAG 1681
Query 1677 GTGAGGAAAATAAGCCTGTTGGTAGAGGTAAACGGTCCGCAAGTATTCGAAACTCACATG 1736
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 GTGAGGAATATAAGCCTGTTGGGAGAGGTAAACGGTCCGCAAGTATTCGAAACTCACATG 1741
Query 1737 AAAAGAAGTCTGTCAAACCTCATGATCGTACTTCGTCAAGTAACAACATAGTAGAAGAAG 1796
||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 AAAAGAAATCTGCCAAATCTCATGATCATACTTCGTCAAGTAACAACATAGTAGAAGAAG 1801
Query 1797 ATGAGTCAGCTCCATCAAATGCAGTCATTAAAAAACAAGTTAACTTGCCAACTAAAGTTA 1856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802 ATGAGTCAGCTCCATCAAATGCAGTCATTAAAAAACAAGTTAACTTGCCAACTAAAGTTA 1861
Query 1857 GGAGCAGAAGAAAGATAGTAACTGAGAAACCTCTAACTATTGATGACGGGAAAATTTCTG 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1862 GGAGCAGAAGAAAGATAGTAACTGAGAAACCTCTAACTATTGATGACGGGAAAATTTCTG 1921
Query 1917 AGACTCTAGAGAAGTTTTCGCATTACACATCTAGTTTCCGAGCACGAAGATGGTGTCTTT 1976
||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 1922 AGACTATAGAGAAGTTTTCGCATTGCATTTCTAGTTTCCGAGCACGGAGATGGTGTATTT 1981
Query 1977 TTGAGTGGTTCTACAGTGCAATTGACTATCCATGGTTTGCCAGACAAGAGTTTGTTGAGT 2036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982 TTGAGTGGTTCTACAGTGCAATTGACTATCCATGGTTTGCCAGACAAGAGTTTGTTGAGT 2041
Query 2037 ATTTGGATCATGTAGGGTTGGGTCATGTTCCTAGATTAACTCGCGTTGAATGGGGTGTCA 2096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 ATTTGGATCATGTAGGGTTGGGTCATGTTCCTAGATTAACTCGCGTTGAATGGGGTGTCA 2101
Query 2097 TAAGGAGTTCTCTTGGGAAACCGAGGCGATTTTCTGAACAGTTTTTGAAGGAGGAAAAAG 2156
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102 TAAGGAGTTCTCTTGGGAAACCAAGGCGATTTTCTGAACAGTTTTTGAAGGAGGAAAAAG 2161
Query 2157 AAAAGCTATACCTATACAGGGACTCTGTAAGAAAACATTATGATGAACTAAACACGGGCA 2216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2162 AAAAGCTATACCTATACAGGGACTCTGTAAGAAAACATTATGATGAACTAAACACGGGCA 2221
Query 2217 TGAGGGAAGGACTTCCAATGGATTTGGCCCGGCCTCTTAATGTTTCACAGAGAGTCATTT 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2222 TGAGGGAAGGACTTCCAATGGATTTGGCCCGGCCTCTAAATGTTTCACAGAGAGTCATTT 2281
Query 2277 CCCTGCATCCAAAGTCAAGAGAGATTCATGACGGCAGTGTCCTAACTGTTGATCACTGTA 2336
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282 GCCTGCATCCAAAGTCAAGAGAGATTCATGACGGCAATGTCCTAACTGTTGATCACTGTA 2341
Query 2337 GGTACCGGATTCAGTTTGACCACCCTGAATTAGGGGTAGAATTTGTTAAGGATACTGAAT 2396
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342 GGTACCGGATTCAGTTTGACAACCCTGAATTAGGGGTAGAATTTGTTAAGGATACTGAAT 2401
Query 2397 GCATGCCACTGAATCCTCTAGAAAACATGCCAGCATCGCTGGCAAGGCACTATGCTTTCT 2456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2402 GCATGCCACTGAATCCTCTAGAAAACATGCCAGCATCGCTGGCAAGGCACTATGCTTTCT 2461
Query 2457 CAAATTATCACATTCAGAATCCCGTTGAGGAGAAAATGCATGAGCGGGCAAAGGAAAGCA 2516
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2462 CAAATTATCACATTCAGAATCCCATTGAGGAGAAAATGCATGAACGGGCAAAGGAAAGCA 2521
Query 2517 TGTTGGAAGGATATCCCAAACTTTCTTGTGAGACTGGCCATCTCTTACCCTCACCAAATT 2576
|| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2522 TGCTGGAAGGATATCCCAAACTTTCGTGTGAGACAGGCCATCTCTTGTCCTCTCCAAATT 2581
Query 2577 ATAACATTAGCAATTCACTAAAGCAGGAAAAGGTAGATATCTCAAGTTCAAATCCACAAG 2636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2582 ATAACATTAGCAATTCACTAAAGCAGGAAAAGGTAGATATCTCAAGTTCAAATCCACAAG 2641
Query 2637 CTCAAGATGGAGTCGATGAGGCTCTTGATTTACAATTGTTTAATTCTCAGCCCTCAAGTA 2696
||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642 CTCAAGACGGAGTTGATGAGGCTCTTGCTTTACAATTGTTTAATTCTCAGCCCTCAAGTA 2701
Query 2697 TTGGACATATCCAGGCAAGAGAAGCTGATGTCCAAGCTCTTTCTGAACTAACACGTGCGC 2756
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2702 TTGGACAAATCCAGGCAAGAGAAGCTGATGTCCAAGCTCTTTCTGAACTAACGCGTGCGC 2761
Query 2757 TTGACAAGAAGGAGCTAGTTTTGAGGGAGCTAAAATGCATGAACGACGAGGTTGTGGAAA 2816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762 TTGACAAGAAGGAGCTAGTTTTGAGGGAGCTAAAATGCATGAACGACGAGGTTGTGGAAA 2821
Query 2817 GTCAGAAAGATGGACATAAT---GCTCTGAAGGATTCTGAATCTTTTAAGAAACAATATG 2873
|||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2822 GTCAGAAAGATGGACATAATAATGCCCTAAAGGATTCTGAATCTTTTAAGAAACAATATG 2881
Query 2874 CAGCAGTTCTCTTTCAGCTAAGCGAAATCAATGAGCAGGTTTCATTGGCACTTCTTGGCT 2933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2882 CAGCAGTTCTCTTTCAGCTAAGCGAAATCAATGAGCAGGTTTCATTGGCACTTCTTGGCT 2941
Query 2934 TGAGGCAACGAAATACTTACCAGGAGAATGTACCATATGCATCAATAAAACGCATGAATA 2993
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||
Sbjct 2942 TGAGGCAACGAAATACTTACCAGGAGAATGTACCATATTCATCAATAAGACGCATGAGTA 3001
Query 2994 AATCAGGGGAACCTGATGGTCAGTTGACCTACGTAGACAATTATGTATCTGACACTAATG 3053
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||
Sbjct 3002 AATCAGGGGAACCTGATGGTCAGTTGACATACGAAGACAATAATGCATCAGACACTAATG 3061
Query 3054 GATTCCATGTGTCTGAGATCGTCGAAAGTTCTAGAATAAAAGCACGGAAAATGGTAGACA 3113
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3062 GATTCCATGTGTCTGAGATCGTCGAAAGTTCTAGAATAAAAGCACGGAAAATGGTATACA 3121
Query 3114 GAGCTGTACAGGCATTGGCA-TTACTGAGGAAAGACGAAAATAATAATGTAAATATGGAA 3172
|||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3122 GAGCTGTACAGGCATTGG-AGTTACTGAGAAAAGACGAAAATAATAATGTAAATATGGAA 3180
Query 3173 GAAGTCATTGATTTTGTAAATAATCAGCTCTCAATAGATCAAACAGAAGGATCATCAGTC 3232
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 GAAGCCATTGATTTTGTAAATAATCAGCTCTCAATAGATCAAACAGAAGGATCATCAGTC 3240
Query 3233 CAGCAAACACAAGGTGCCCAGGATCAGCGCCTTCCATCTACACCAAATCCACCTAGCTCA 3292
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 CAGCAAACACAAGGTGGCCAGGATCAGCGTCTTCCCTCTACACCAAATCCACCTAGCTCA 3300
Query 3293 ACTCCTGCCAATGATTCCCACCTAAATCCA-CCCGATCAAAATGACCTGCAAATCCCGTC 3351
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3301 ACTCCTGCCAATGATTCCCACCTAAA-CCAACCCGATCAAAATGACCTGCAAGTCCCGTC 3359
Query 3352 TGAACTTGTGTCCCGATGTATGGCTACATTGCTTATGATTCAGAAATGTACAGAGAGGCA 3411
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 CGATCTTGTGTCCCGATGTATCGCTACATTGCTTATGATTCAGAAATGTACAGAGAGGCA 3419
Query 3412 ATTCCCACCAAGTGAAGTGGCCCAGGTTCTAGACTCTGCGGTGGCGAGTTTACAGCCTTG 3471
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 ATTCCCACCAAGTGAAGTAGCCCAGGTTCTAGACTCGGCAGTGGCGAGTTTACAGCCTTG 3479
Query 3472 CTGCTCACAAAACCTTCCTATCTATACAGAGATTCAGAAGTGCATGGGAATCATAAGAAA 3531
|||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 CTGCTCGCAGAACCTTCCGATCTATACAGAGATTCAGAAGTGCATGGGAATCATAAGAAA 3539
Query 3532 CCAGATTCTAGCCCTCGTACCCTCCTAAAGTAAGACTCCTAAAACCATAACTTTAACCTT 3591
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3540 CCAGATTCTAGCCCTCGTACCCTCCTAAAGTAAGAATCCTAAAACCATAACTT-AACCTT 3598
Query 3592 TGTGTCTCTTCATAGTGCTTGTTTCTCTT-GTAAAATCCCATATCTCCTTATAGGAAATC 3650
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 3599 TGTGTCTCTTCATAATGCTTGTTTCTCTTTGTAAAATCA-ATATCTCCTTATAGAAAATC 3657
Query 3651 CTTTTATATATACCTCATTTATTTGGAGTGACTCACAAAACTTTTTCGATTTCACATTTA 3710
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||
Sbjct 3658 CTTTTATATAC-CC-CATTTATTTGGAGTGACTCACAACAGTTTCTCGATTTCACATTTA 3715
Query 3711 TTTATATGTAACACATCATTTGTT 3734
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 TTTATATGTAACACATCATTTGTT 3739
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 185968857701
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5