BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479946
Length=3652
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G24320.1 | Symbols: MSH1, CHM1, ATMSH1, CHM | MUTL protein h... 5555 0.0
> AT3G24320.1 | Symbols: MSH1, CHM1, ATMSH1, CHM | MUTL protein
homolog 1 | chr3:8822979-8829694 REVERSE LENGTH=3730
Length=3730
Score = 5555 bits (3008), Expect = 0.0
Identities = 3466/3681 (94%), Gaps = 55/3681 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAGGACTGTGAAATTGTGAATTGCAGCATA-TCGTCGTCTTCTGGCGGGAAACGAAGCC 59
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 AGAGGACTGTGAGATTGTGAATT---GCATAGTCGTCGTCTTCTGGCGGGAAAAGAAGCC 57
Query 60 CTAGAAAAAAGGTGACAGGTGAAGAA---AAGCTT-TTCTTCTTC-ACAGAGT--GACTG 112
||||||||| ||||| ||||||| || | ||| ||||||||| | | || ||
Sbjct 58 CTAGAAAAAGGGTGAAAGGTGAA-AACTCTA-CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGAGTG 115
Query 113 TGAGAGAGATGCATTGGATTGCGACCAGAAACGCCGTCGTTTCATTCCCCAAATGGCGAT 172
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 116 TGAGAGAGATGCATTGGATTGCTACCAGAAACGCCGTCGTTTCATTCCCAAAATGGCGGT 175
Query 173 TCCTCTTCCGCTCCTCATATCGCACTTACTCTTCCCTCAAACCCTCCTCCCCAATTCTAC 232
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 TCTTCTTCCGCTCCTCATATCGCACTTACTCTTCCCTCAAACCCTCCTCCCCAATTCTAC 235
Query 233 TTAATAGAAGGTACTCTGAGGGAATATAC-TGTCTCAGAGATCGAAAGTCTTT-AAAAGG 290
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||| |
Sbjct 236 TTAATAGAAGGTACTCTGAGGGGATAT-CTTGTCTCAGAGATGGAAAGTCTTTGAAAA-G 293
Query 291 AATCACAACGGCTTCTAAGAAAGTCAAGACGTCAAGTGATGTTCTCACTGACAAAGATCT 350
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 AATCACAACGGCTTCTAAGAAAGTGAAGACGTCAAGTGATGTTCTCACTGACAAAGATCT 353
Query 351 CTCTCATTTGGTTTGGTGGAAGGAGAGATTGCAGACATGTAAGAAACCATCTACTCTTCA 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 CTCTCATTTGGTTTGGTGGAAGGAGAGATTGCAGACATGTAAGAAACCATCTACTCTTCA 413
Query 411 GCTTATTGAAAGGCTTATGTACACCAATTTACTGGGTTTGGACCCTAGCTTGAGGAATGG 470
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 GCTTATTGAAAGGCTTATGTACACCAATTTACTTGGTTTGGACCCTAGCTTGAGGAATGG 473
Query 471 AAGTTTAAAAGATGGAAACCTCAACTGGGAGATGTTGCAGTTTAAGTCAAGGTTTCCACG 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 AAGTTTAAAAGATGGAAACCTCAACTGGGAGATGTTGCAGTTTAAGTCAAGGTTTCCACG 533
Query 531 CGAAGTTTTGCTCTGCAGAGTGGGAGACTTTTATGAGGCTATTGGAATAGATGCTTGTAT 590
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 CGAAGTTTTGCTCTGCAGAGTAGGAGAATTTTATGAGGCTATTGGAATAGATGCTTGTAT 593
Query 591 ACTCGTTGAATATGCTGGTCTAAATCCTTTTGGTGGTCTTCGATCAGATAGTATTCCAAA 650
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 ACTTGTTGAATATGCTGGTCTCAATCCTTTTGGTGGTCTTCGATCAGATAGTATTCCAAA 653
Query 651 GGCTGGCTGCCCAGTTGTGAATCTTCGACAGACTTTGGATGACCTGACACGCAACGGTTA 710
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 654 GGCTGGCTGCCCAATTATGAATCTTCGACAGACTTTGGATGACCTGACACGCAATGGTTA 713
Query 711 TTCAGTGTGCATTGTGGAGGAAGTTCAGGGGCCAACACAAGCGCGTTCTCGTAAAGGTCG 770
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||
Sbjct 714 TTCAGTGTGTATTGTGGAGGAAGTTCAGGGGCCAACACCAGCACGCTCCCGTAAAGGTCG 773
Query 771 ATTTATTTCAGGGCATGCACATCCAGGAAGTCCTTATGTATATGGGCTTGTTGGTGTTGA 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 774 ATTTATTTCAGGGCATGCACATCCAGGAAGTCCTTATGTATATGGGCTTGTCGGTGTTGA 833
Query 831 CCACGATCTTGACTTTCCTGAACCTATGCCTGTTGTTGGGATATCTCGTTCAGCAAGGGG 890
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 834 CCATGATCTTGACTTTCCTGATCCTATGCCTGTTGTTGGGATATCTCGTTCAGCAAGGGG 893
Query 891 GTATTGCATGATATCTATTTTCGAGACTATGAAAGCATATTCGCTAGATGATGGTCTAAC 950
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 894 GTATTGTATGATATCTATTTTCGAGACTATGAAAGCATATTCGCTAGATGATGGTCTAAC 953
Query 951 AGAAGAAGCCTTGGTTACTAAGCTCCGCACCCGTCGCTGTCATCATCTATTCTTACATGC 1010
|||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 954 AGAAGAAGCCTTAGTTACCAAGCTCCGCACTCGTCGCTGTCATCATCTTTTCTTACATGC 1013
Query 1011 ATCGTTGAGGCACAATGCATCAGGGACGTGCCGCTGGGGAGAGTTTGGGGAAGGGGGTCT 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 ATCGTTGAGGCACAATGCATCAGGGACGTGCCGCTGGGGAGAGTTTGGGGAAGGGGGTCT 1073
Query 1071 TCTCTGGGGAGAATGCAGTGGCAGGAATTTTGAATGGTTTGAAGGAGATACCCTTTCTGA 1130
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1074 ACTCTGGGGAGAATGCAGTAGCAGGAATTTTGAATGGTTTGAAGGAGATACTCTTTCCGA 1133
Query 1131 GCTCTTATCAAGGGTCAAAGATGTTTATGGTCTTGATGATGAAGTTTCCTTTAGAAATGT 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 GCTCTTATCAAGGGTCAAAGATGTTTATGGTCTTGATGATGAAGTTTCCTTTAGAAATGT 1193
Query 1191 CAATGTACCTTCAAAAAACCGGCCACGTCCTTTGCATCTTGGAACGGCTACACAAATT-G 1249
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1194 CAATGTACCTTCAAAAAATCGGCCACGTCCGTTGCATCTTGGAACGGCTACACAAATTGG 1253
Query 1250 -G----A---AGTTTAGGAGTGCCTTGTTTGTTGAAGGTGTTACTTCCATCTACGTGCAG 1301
| | | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TGCCTTACCTACTGAAGGAATACCTTGTTTGTTGAAGGTGTTACTTCCATCTACGTGCAG 1313
Query 1302 TGGTCTGCCTTCTTTGTATGTCCGAGATCTTCTTCTAAATCCTCCTGCTTATGACATTGC 1361
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||
Sbjct 1314 TGGTCTGCCTTCTTTGTATGTTAGGGATCTTCTTCTGAACCCTCCTGCTTACGATATTGC 1373
Query 1362 TCTGAAAATTCAAGAAACGTGCAAGCTCATGAGCATAGTAACTTGCTCAATTCCGGAGTT 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||
Sbjct 1374 TCTGAAAATTCAAGAAACGTGCAAGCTCATGAGCACAGTAACATGTTCAATTCCAGAGTT 1433
Query 1422 TACCTGCCTCTCGTCTGCTAAGCTTGTGAAGCTTCTAGAGCAACGTGAAGCCAACTACAT 1481
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1434 TACCTGCGTCTCTTCTGCTAAGCTTGTGAAGCTTCTTGAGCAACGGGAAGCCAACTACAT 1493
Query 1482 TGAGTTCTGCCGAATAAAAAATGTTCTTGATGATGTATTACATATGCATAGACATGCTGA 1541
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 TGAGTTCTGTCGAATAAAAAATGTGCTTGATGATGTATTACATATGCATAGACATGCTGA 1553
Query 1542 GCTTGTGGAAATCCTGAAATTATTGATGGATCCTACCTGGGTGGCTACTGGTTTGAAGAT 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1554 GCTTGTGGAAATCCTGAAATTATTGATGGATCCTACCTGGGTGGCTACTGGTTTGAAAAT 1613
Query 1602 TGACTTTGACACTTTTGTCAACGAATGTCATTGGGCGTCTGATACAATTGGTGAAATGAT 1661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 TGACTTTGACACTTTTGTCAACGAATGTCATTGGGCGTCTGATACAATTGGTGAAATGAT 1673
Query 1662 ATCTCTAGATGACAATGAAAGTCATCAGAATGTTAGTAAATGCG-CTAATGTTCCGAATG 1720
||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| |
Sbjct 1674 CTCTTTAGATGAGAATGAAAGTCATCAGAATGTAAGTAAATGTGAC-AATGTCCCGAACG 1732
Query 1721 AGTTCTTTTATGATATGGAGTCTTCATGGCGAGGTCGTGTTAAGGGAATTCATATAGA-G 1779
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1733 AATTCTTTTATGATATGGAGTCTTCATGGCGAGGTCGCGTTAAGGGAATTCATATAGAGG 1792
Query 1780 AAGGAAATCACTCAAGTGGAAAAATCAGCTGAGGCTTTATCTTTAGCTGTAGCTGAGGAT 1839
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1793 AA-GAAATCACTCAAGTAGAAAAATCAGCTGAGGCTTTATCTTTAGCAGTAGCTGAGGAT 1851
Query 1840 TTCCTCCCTATTATATCAAGAATTAAGGCCACCACTGCTTCACTTGGTGGCCCGAAGGGC 1899
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1852 TTTCACCCTATTATATCAAGAATTAAGGCCACCACTGCTTCACTTGGTGGCCCGAAAGGC 1911
Query 1900 GAAATTGCATATGCAAGAGAGCATGAGTCTGTTTGGTTCAAGGGGAAACGGTTTACACCA 1959
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1912 GAAATCGCATATGCAAGAGAGCATGAGTCTGTTTGGTTCAAGGGGAAACGGTTTACGCCA 1971
Query 1960 TCTATCTGGGCTGGTACTGCAGGGGAAGACCAAATTAAACAGCTGAAACCTGCTTTAGAC 2019
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1972 TCTATCTGGGCTGGTACTGCAGGGGAAGACCAAATAAAACAGCTGAAACCTGCCTTAGAC 2031
Query 2020 TCAAAAGGAAGAAAGGTTGGAGAAGAATGGTTTACGACTCCAAAGGTGGAAATTGCTTTA 2079
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 TCGAAAGGAAAAAAGGTTGGAGAAGAATGGTTTACGACCCCAAAGGTGGAAATTGCTTTA 2091
Query 2080 GTCAGATACCATGAAGCTAGTGAGAATGCAAAAGCTCGGGTGTTGGAACTGTTGCGCGAG 2139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2092 GTCAGATACCATGAAGCTAGTGAGAATGCAAAAGCTCGGGTGTTGGAACTGTTGCGCGAG 2151
Query 2140 TTATCTGTTAAATTGCAAACAAAAATTAATGTTCTTGTCTTTGCATCTATGCTTCTGGTC 2199
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 TTATCCGTTAAATTGCAAACAAAAATAAATGTTCTTGTCTTTGCATCTATGCTTCTGGTC 2211
Query 2200 ATTTCTAAAGCATTATTTGCCCATGCTTGTGAAGGGAGAAGGCGAAAGTGGGTTTTTCCA 2259
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 ATTTCAAAAGCATTATTTTCCCATGCTTGTGAAGGGAGAAGGCGAAAGTGGGTTTTTCCA 2271
Query 2260 ACGCTTGTCGGATTCAGTACAGATGAGGGCGCAAAACCATTAGATGGTGCCAGTCGAATG 2319
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 ACGCTTGTCGGATTCAGTTTAGATGAGGGCGCAAAACCATTAGATGGTGCCAGTCGAATG 2331
Query 2320 AAGCTGACAGGCCTATCACCGTATTGGTTTGATGTATCTTCTGGAACCGCTGTTCACAAT 2379
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 AAGCTGACAGGCCTGTCACCTTATTGGTTTGATGTATCTTCTGGAACCGCTGTTCACAAT 2391
Query 2380 ACTGTTGACATGCAATCACTGTTTCTTCTAACTGGACCTAATGGTGGTGGTAAATCTAGT 2439
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 2392 ACCGTTGACATGCAATCACTGTTTCTTCTAACTGGACCTAACGGTGGTGGTAAATCGAGT 2451
Query 2440 TTGCTCAGATCAATATGCGCAGCTGCTCTACTTGGAATTTCCGGTTTAATGGTTCCAGCT 2499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 TTGCTCAGATCAATATGCGCAGCTGCTCTACTTGGAATTTCCGGTTTAATGGTTCCAGCT 2511
Query 2500 GAATCAGCTTCTATCCCTCACTTTGATTCCATCATGCTTCACATGAAATCCTATGACAGC 2559
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2512 GAATCAGCTTGTATTCCTCACTTTGATTCCATCATGCTTCACATGAAATCATATGACAGC 2571
Query 2560 CCTGTAGATGGAAAAAGTTCTTTCCAGGTAGAAATGTCGGAAATACGATCTATCGTAAGC 2619
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2572 CCTGTAGACGGAAAAAGTTCTTTCCAGGTAGAAATGTCGGAAATACGATCTATTGTAAGC 2631
Query 2620 CAGGCTACTTCAAGAAGCCTAGTGCTTATAGACGAGATATGCCGAGGGACAGAGACAGCA 2679
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 CAGGCTACTTCGAGAAGCCTAGTGCTTATAGATGAGATATGCCGAGGGACAGAGACAGCA 2691
Query 2680 AAAGGCACCTGTATCGCTGGTAGTGTGGTAGAGAGTCTTGACACAAGTGGTTGTTTGGGT 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 AAAGGCACCTGTATCGCTGGTAGTGTGGTAGAGAGTCTTGACACAAGTGGTTGTTTGGGT 2751
Query 2740 ATTGTATCTACTCATCTCCATGGAATCTTCAGTTTACCTCTTGCTGCCAAAAACATCACA 2799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||
Sbjct 2752 ATTGTATCTACTCATCTCCATGGAATCTTCAGTTTACCTCTTACAGCGAAAAACATCACA 2811
Query 2800 TATAAAGCAATGGGAGCCGAAAATGTCGAAGGGCAAACTAAGCCAACTTGGAAATTGACA 2859
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 TATAAAGCAATGGGAGCCGAAAATGTCGAAGGGCAAACCAAGCCAACTTGGAAATTGACA 2871
Query 2860 GATGGAGTCTGCAGAGAGAGTCTTGCGTTTGAAACAGCTAAGAGAGAAGGTGTTCCCGAG 2919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2872 GATGGAGTCTGCAGAGAGAGTCTTGCGTTTGAAACAGCTAAGAGGGAAGGTGTTCCCGAG 2931
Query 2920 ACAATCATCCAAAGAGCCGAAGCTCTTTACCTCTCGGTTTATGCAAAAGATGCATCATCT 2979
|| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2932 TCAGTTATCCAAAGAGCTGAAGCTCTTTACCTCTCGGTCTATGCAAAAGACGCATCAGCT 2991
Query 2980 GAAGTTGTCAAACCCGACAAAATCGTAACTGCATCCAACAATGACCAGCAGATCCGCAAA 3039
|||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2992 GAAGTTGTCAAACCCGACCAAATCATAACTTCATCCAACAATGACCAGCAGATCCAAAAA 3051
Query 3040 CCAGTCAGTTCTGAGAGAAGTTTGGAGAAGGACTTGGCAAAAGCTATCGTTAAAATCTGT 3099
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3052 CCAGTCAGCTCTGAGAGAAGTTTGGAGAAGGACTTAGCAAAAGCTATCGTCAAAATCTGT 3111
Query 3100 GGAAAAAAGATGATTGAGCCTGAAGCATTAGAATGTCTTTCAATCGGTGCTCGAGAGCTT 3159
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 3112 GGGAAAAAGATGATTGAGCCTGAAGCAATAGAATGTCTTTCAATTGGTGCTCGTGAGCTT 3171
Query 3160 CCACCTCCATCTACAGTTGGTTCTTCATGCGTGTATGTGATGCGTAGACCCGATAAGAGA 3219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3172 CCACCTCCATCTACAGTTGGTTCTTCATGCGTGTATGTGATGCGGAGACCCGATAAGAGA 3231
Query 3220 TTGTACATTGGACAGACGGATGATCTTGAAGGAAGAATACGTGCGCATCGAGCAAAGGAA 3279
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3232 TTGTACATTGGACAGACCGATGATCTTGAAGGACGAATACGTGCGCATCGAGCAAAGGAA 3291
Query 3280 GGACTGCAAGGGTCAAGTTTTCTATACCTTATGGTGCAAGGTAAGAGCATGGCTTGTCAG 3339
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3292 GGACTGCAAGGGTCAAGTTTTCTATACCTTATGGTTCAAGGTAAGAGCATGGCTTGTCAG 3351
Query 3340 CTAGAGACTCT-TCTGATTAACCAACTCCATGAACAAGGCTACTCTCTGGCTAACCTAGC 3398
|||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3352 TTAGAGACTCTAT-TGATTAATCAACTCCATGAACAAGGCTACTCTCTGGCTAACCTAGC 3410
Query 3399 CGATGGAAAGCACCGGAATTTCGGAACATCCACAAGCTTGAGTGCATCAGATGTAGTCAG 3458
||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 3411 CGATGGAAAGCACCGTAATTTCGGAACGTCCTCAAGCTTGAGTACATCAGACGTAGTCAG 3470
Query 3459 TATCTCATAGTTTGAAACATTAGCTATGTTTGTAATTGATCATCTCTCT----A---GAA 3511
|||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||
Sbjct 3471 CATCTTATAGTTTGAAACATTAGCTGTGTTTGTAGTTGATCATCTCTATGTGCAATTGAA 3530
Query 3512 CTAG--AGT-----AGA--T----TAC-T-ACTAAGCATGCATGCCGTTTTTCTTTTTGA 3556
| || ||| ||| | || | |||||| | ||||||||||||| ||||||
Sbjct 3531 CAAGTCAGTTTGCTAGAACTAGAGTAGATTACTAAGAAACCATGCCGTTTTTCATTTTGA 3590
Query 3557 GATTTTGTTAAACGGCACGCAGTTCAGGCAA-TCGGATGCAGCAATTACCAATTTTGGGT 3615
||||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3591 GATTTTGCAAAACGGCATGCAGTTCGGGTAAGTCGGATGCCGCAATTACCAATTTTGGGT 3650
Query 3616 CAGTCGGTGTAATTGTCGTTT 3636
||||| |||||||||||||||
Sbjct 3651 CAGTCTGTGTAATTGTCGTTT 3671
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 181855168375
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5