BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg480129
Length=3786
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G05120.1 | Symbols: | Nucleoporin, Nup133/Nup155-like | chr... 4440 0.0
> AT2G05120.1 | Symbols: | Nucleoporin, Nup133/Nup155-like | chr2:1841909-1846858
REVERSE LENGTH=4018
Length=4018
Score = 4440 bits (2404), Expect = 0.0
Identities = 2622/2728 (96%), Gaps = 12/2728 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 32 AAAGCT-CACGCAATCGAGTCGCTCCACCGGATTCTCCAGTAACTCCGGCAACTCAAAAT 90
||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 AAAACTCCACGCAATCGAGTCCCTCCGCCGGATTCTCCAGTAACTCCGGCAACTCAAAAT 108
Query 91 CGGAACAATTTCATCTCAGATCGTCCCGCCACTGGAACTCCTGCTCCTTGGGCTCCTCGT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 CGGAACAATTTCATCTCAGATCGTCCCGCCACTGGAACTCCTGCTCCTTGGGCTCCTCGT 168
Query 151 TTATCTGTTCTCGCTAGAGTTTCTCCTGGGAACAATGGTGA-AAGAGGAGATGATTCAGA 209
||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 169 TTATCGGTTCTAGCTAGAGTTTCTCCTGGAAACAATGGTGACAA-AGGAGTTGATTCAGA 227
Query 210 TCAATTAAAGCCTGTATTCGTTGGAGAGTTTCCTCAATTGTTGCGAGATGAACAAAGTTA 269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 228 TCAATTAAAGCCTGTATTCGTTGGAGAGTTTCCTCAATTGTTGCGCGATGAACAAAGTTA 287
Query 270 TCCTGGTGATGCTTGTGTATCTGGTGGAATGGATAAAGAAACGTGTCTTTCTTGGTTTGT 329
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
Sbjct 288 TCCTGGTGATGCTTGTGTATCCGGTGGAATGGATAAAGAGACCTGTCTTTCTTGGTTTAT 347
Query 330 TACTGGAAGTAAACTTTTTGTATGGAGTCATTTGACGACGTTACCGTCGAGAAAATGTGT 389
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 348 TACTGGAAGTAAAGTTTTTGTATGGAGTCATTTGACGACTTTACCGTCGAGAAAATGTGT 407
Query 390 TGTTCTTGAACTTCCTGTTGGTGTTTTGGTTAATGAAGAGTCTGGTAGTGGTTTACAAGA 449
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 TGTTCTTGAACTTCCTGTTGTTGTTTTGGTTAATGAAGAGTCTGGTAGTGGTTTACAAGA 467
Query 450 TGGGAAAAGTTGGTTGATTAGTGTTGTGTCTTGGGATACTTCTGCTGGTGCAGCTACGAG 509
|||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468 TGGGAAAAGTTGGTTGGTTAATGTTGTATCTTGGGATACTTCTGCTGGTGCAGCTACGAG 527
Query 510 AGCTGCTCGGTCTCGTAGTCCTGTTGGTGTTGTTATGTGTAATAGAAAAACTCGAGCTGT 569
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 GGCTTCTCGGTCTCGTAGTCCTGTTGGTGTTGTTATGTGTAATAGAAAAACTCGAGCTGT 587
Query 570 TGTGTATTGGTCAGACATCTTTTCTGGTCAGGAAGCTGCCCCTGGTAGAAAAAGCTCAG- 628
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |
Sbjct 588 TGTGTATTGGTCAGACATATTTTCTGGTCAGGAAGCTGCACCT-GCAGAAAAGGCTC-GT 645
Query 629 CATTCAA-CAAGCGACAAAGCAATGGGATTAGAAGCAGTAGAGCTGAATATAGCAATCTC 687
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 646 CATTTAATTAAGCGACAAAGCAATGGGATTAGAAGCAGTAGAGCTGAAAATAGCGATCTC 705
Query 688 AATTCTTTGATTACTACTGCAGTTGCTACGGCTGAGCGCCTTTGTATTGCTATTGCTTGC 747
||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 706 AATTCTTTGATTACTACTGCAGTAGCTGCAGCTGAGCGTCTTTGTATTGCTATTGCTTGC 765
Query 748 AGTTCTAATGGTGAGCTATGGCAATTTACCTGTAGCCCCACAGGCGTTAAAAGTAATCAA 807
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 766 AGTTCTAACGGTGAGCTATGGCAATTTACCTGTAGCCCTACAGGCGTTAAAAGTAATCAA 825
Query 808 GTACAGGTGAACATCAGCTCTTCCTCTGTAAGTGAGGGGTATCCAAGGTCCTTGATCTGG 867
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 826 GTACAGTTGAACATTAGCTCTTCCTCTGTAAGTGAGGGGTATCCAAGGTCCTTGATTTGG 885
Query 868 CGGTTTTCGCAAGGATTGGCAAGAGAGTCGTGTTGGGAATTTTTTATGCTGACAGATTGT 927
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||
Sbjct 886 CGGTTTTCGCAAGGATTGGCAAGAGAGTCGTGTTGGGAATTTCTTATGTTGACAGACTGT 945
Query 928 GACATACATTGTTTTACTATTGAACCTTATCCTGATCTGACTGTTTCAAAAGTCTGGCAA 987
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 946 GACATACATTGTTTTACTATTGAGCCTTATCCTGATCTGACTGTTTCAGAAGTCTGGCAA 1005
Query 988 CATGAGATTGTTGGCACTGATGGTGATTCTGGTATCAAGAAAGATATAGCAAGTCAAAAG 1047
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1006 CATGAGATTGTTGGCACTGATGGTGATTCTGGTATCAAGAAAGATATAGCTAGTCAAAAG 1065
Query 1048 CAAATTTGGCCTCTAGATTTGCAGGT--A-GATCAGGGTAAAGTGATTACAGTTCTTGTT 1104
|| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 CAGATTTGGCCTCTAGATTTGCAGGTAGATGATCAGGGTAAAGTGATTACAGTTCTTGTT 1125
Query 1105 GCCACTATCTGCATGGACCGCGCCAGCAGTTCTAGCTATACACAATATTCGCTTTTAACC 1164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 GCCACTATCTGCATGGACCGCGCCAGCAGTTCTAGCTATACACAATATTCGCTTTTAACC 1185
Query 1165 TTGCAACATAAATCTGAGATGAGATTTGCTGATGGGAGAGAGGAAAAGGTTCTGGAGAAA 1224
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 CTACAACATAAATCTGAGATGAGATTTGCAGATGGGAGAGAGGAAAAGGTTCTGGAGAAA 1245
Query 1225 CAAGCTCCAATCCAAGTCATAATCCCAAAAGCAAGAGTGGAAGATAAAGACTTCTTATTC 1284
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1246 CAAGGTCCAATCCAAGTCATAATCCCAAAAGCAAGAGTAGAGGATAAAGACTTCTTATTC 1305
Query 1285 TCTATGAAACTTAGAGTTGGTGGTAGGCCCCCAGGGTCAGCTATAATTCTTTCAGGTGAT 1344
||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 TCTATGAGACTCAGAGTTGGTGGTAGACCCCCAGGGTCAGCTATAATTCTTTCAGGTGAT 1365
Query 1345 GGAACAGCCACAGTTTGCTACTGTCATGAAAGTTCTACCCGGCTCTATAAGTTTGATTTA 1404
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 GGAACAGCCACAGTTTGCTACTGTCATGGAAGTTCTACCCGGCTCTATAAGTTTGATTTA 1425
Query 1405 CCTTATGATGCTGGCAAGGTCTTGGATGCTTCAGTTCTTTCCTCCACTGATGAACATGAA 1464
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 CCTTATGATGCTGGCAAGGTTTTGGATGCTTCAGTTCTTTCCTCCACTGATGAACATGAA 1485
Query 1465 TATGGTGCATGGACTGTGCTAACTGAGAAAGCAGGAGTATGGGCAATACCAGAGAATGCA 1524
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1486 TATGGTGCATGGACTGTACTAACTGAGAAAGCAGGAGTGTGGGCAATACCAGAGAAAGCA 1545
Query 1525 GTTGTGCTTGGTGGAGTCGAACCTCCAGAGAGAAGTTTGTCTCGCAAAAATAGCTCCAAT 1584
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1546 GTTGTGCTTGGTGGAGTCGAACCTCCAGAGAGAAGTCTGTCACGCAAAAATAGCTCCAAT 1605
Query 1585 GAGAGGTCTACAGGAGATGAGACAAGGATAACACCATATGGCATTGATAGAACTGCCGGG 1644
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1606 GAGAGGTCTACACGAGATGAGACAAGGGTAACACCATATGGTGTTGATAGAACTGCC-GG 1664
Query 1645 AA-GGAGAATTCTGACGTACAGAATAGTGGAGACAAAGGAAATCCTAAAATGGGATTTAC 1703
|| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1665 AAGGGAGAATTCTGACATACAGAATATTGAAGACAAAGGAAACCCTAAAATGGGTTTTAC 1724
Query 1704 TCGTCAAACAGCCCGTGAGGAGGAATCAGAAGCTTTGCTTGGCCAGCTCTTTGAGGGTTT 1763
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1725 TCGTCAAACAGCCCGTGATGAGGAATCAGAAGCTTTGCTTGGCCAGCTCTTTGAGGGGTT 1784
Query 1764 TCTATTATCTGGGAAAGTTGATGGATCCTTGGAGAAGCTTAGTCAATCTGGTGCATTTGA 1823
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1785 TCTGTTATCTGGGAAAGTTGATGGATCCTTGGAGAAGCTTAGTCAGTCTGGTGCATTTGA 1844
Query 1824 TAGAGATGGAGAAACCAATGTTTTTGCTCGCAAAAGCAAATCTATAGTTGACACATTAGC 1883
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 TAGAGATGGAGAGGCCAATGTTTTTGCTCGCAAAAGCAAATCTATAGTTGACACATTAGC 1904
Query 1884 TAAGCATTGGACAACAACTAGAGGGGCTGAGATAGTAGCTATGACTGTTATATCTTCACA 1943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 TAAGCATTGGACAACAACTAGAGGGGCTGAGATAGTAGCTATGACTGTTATATCTTCACA 1964
Query 1944 ATTGGTTGAGAAACAACAGAAGCATGAGAATTTTCTACACTTTCTTGCTCTATCCAAATG 2003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 ATTGGTTGAGAAACAACAGAAGCATGAGAATTTTCTACACTTTCTTGCTCTATCCAAATG 2024
Query 2004 CCATGAGGAGCTGTGTTCTAAACAGAGACATTCTTTGCAAATAATTCTGGAAAATGGTGA 2063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 CCATGAGGAGCTGTGTTCTAAACAGAGACATTCTTTGCAAATAATTCTGGAAAATGGTGA 2084
Query 2064 AAAACTTGCTGCCATGATTCAACTCCGGGAACTGCAGAATATGATTAACCAGAACCGCTC 2123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2085 AAAACTTGCTGCCATGATTCAACTCCGGGAACTGCAGAATATGATTAACCAAAACCGCTC 2144
Query 2124 AGCTAGATTTGGCTCGCCGCAGGCTGGCTCAGAGGATCAAGTTTCATGTGCCCTTTGGGA 2183
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 AGCTAGATTTGGCTCGCCGCAAGCTGGCTCAGAGGATCAAGTTTCATGTGCCCTTTGGGA 2204
Query 2184 TCTTATTCAATTTGTAGGGGAGAGAACCCGGCGAAATACAGTTCTTTTGATGGACAGAGA 2243
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 TCTTATTCAATTTGTAGGGGAGAGAGCCCGGAGAAATACAGTTCTTTTGATGGACAGAGA 2264
Query 2244 TAATGCTGAAGTTTTCTACAGCAAGGTATCTGAACTTGAGGAAGTATTTTATTGTCTGAA 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2265 TAATGCTGAAGTTTTCTACAGCAAGGTATCTGAACTTGAGGAAGTGTTTTACTGTCTGAA 2324
Query 2304 CAGACAACTAGAATACATAATCAGAGCTGACCAACCACTGGGAACTCAAGTGCAGAGAGC 2363
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2325 CAGGCAACTAGAATACATAATCAGAGCTGACCAACCACTAGGAACTCAACTGCAGAGAGC 2384
Query 2364 CTGCGAACTCTCAAATGCATGTGTTACAATTCTTCAGACTGCCTTAGATTACAAAAATGA 2423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2385 CTGCGAACTCTCAAATGCATGTGTTACAATTCTTCAGACTGCCTTAGATTACAAAAACGA 2444
Query 2424 GCATCAAATGTGGTATCCACCACTTGAAGGTTTAATACCTTGGCACTGTCAGCCTGTTGT 2483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2445 GCATCAAATGTGGTATCCACCACTTGAAGGTTTAATACCTTGGCACTCTCAGACTGTTGT 2504
Query 2484 ATGTAATGGACTGTGGTGCATTGCGTCCTTTATGCTTCATCTGTTAACTGAGGCATCTAG 2543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 ATGTAATGGACTGTGGTGCATTGCGTCCTTTATGCTTCATCTGTTAACTGAGGCATCTAG 2564
Query 2544 GATTGACATCTCTGCTAAATCAGATATATACATGCATCTCGAAGTGCTTACTGAAGTTTT 2603
|||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 GATTGATATCTCTGCTAAATCAGACATATACACGCATCTCGAAGTGCTTACTGAAGTTTT 2624
Query 2604 ACTTGAGGCCTGTGCCGGTTCTACCTTTGCAAAATTGGAGAGGGAAGAGGAGAACAAAGG 2663
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2625 ACTTGAGGCTTGTGCCGGTTCTACCTTTGCAAAATTGGAGAGGGAAGAGGAGAACAAAGG 2684
Query 2664 TTTGCTTAATGAGTACTGGACTCGGCGGGATACTATTTTTGACTCTCTTTATCAACAAGC 2723
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2685 TTTGCTTAATGAATACTGGACTCGGCGGGATACTATTTTTGACTCTCTTTATCGACAAGC 2744
Query 2724 CAAAGAGTTTATGGAAGCAGAAATCCAG 2751
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 GAAAGAGTTTATGGAAGCAGAAATCCAG 2772
Score = 1509 bits (817), Expect = 0.0
Identities = 935/992 (94%), Gaps = 7/992 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2751 GCACGAAGGTGTGGGACCGCAAGGAGGGTTCAGCTACTTTGTGTTCCAGCAACTCTATGA 2810
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2925 GCACGAGGGTGTGGGACCACAAGGAGGGTTCAGTTACTTTGTTTTCCAGCAACTCTATGA 2984
Query 2811 TATGAAACAGTTCTCTAAGCTTCTACGGCTTGGGGAAGAATTCCAGGACGAGCTATTGAT 2870
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 TATGAAACAGTTCTCTAAGCTTCTACGGCTTGGAGAAGAATTCCAGGACGAGCTATTGAT 3044
Query 2871 ATTTCTAAAGCGCCATTCTGATCTGCTGTGGCTTCATCAGGTGTTTCTTCATCAGTTCTC 2930
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3045 ATTTCTAAAGCGCCATTCTGATCTGGTGTGGCTTCATCAGGTGTTTCTTCATCAATTCTC 3104
Query 2931 ATCTGCTTCTGACACTCTTCATACATTGGCTCTAGCACAAGATGAAGAGTCTATGACAAC 2990
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3105 ATCTGCGTCTGACACTCTTCATACATTGGCTCTATCACAAGATGAAGAGTCTATGACAAC 3164
Query 2991 TATTGAAGAAAGAACCGTG-CCAGAACCTGAAGATGCACAACCAACATTTGCAGACCGCA 3049
| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3165 TGTTGAAGAAAGAA-CGGGACCAGAACCTGAAGATGTACAACCAACATTCGCAGACCGCA 3223
Query 3050 AGCGGTTTCTGAACCTTTCAAAGATATCCTATGTGGCAGATAAGGTTGCTGATTCCGAAT 3109
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3224 AGCGGTTTCTGAACCTTTCAAAGATAGCCTATGTGGCAGATAAGGATGCTGATTCCGAAT 3283
Query 3110 CGAAAGTGAAGCGCATTGAAGCTGATCTCAACTTACTGAAGCTGCAGGAAGAAATAACAA 3169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 CGAAAGTGAAGCGCATTGAAGCTGATCTCAACTTACTGAAGCTGCAGGAAGAAATAACAA 3343
Query 3170 AAGCTTTGCCAAATGGAGAAGCTAGAAACCGGCTGTTCCGACCAGAGGAGCTCATTGAAA 3229
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3344 AAGCTTTGCCAAATGGAGAAGCTAGAAACCGGCTCTTCCGACCAGAGGAGCTCATTGAAA 3403
Query 3230 TCTGTCTCAATATCCAGGGTCGATGGACAGCTATAAAGGCTTTCGAGGTGTTTGCATGGA 3289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3404 CCTGTCTCAATATCCAGGGTCGATGGACAGCTATAAAGGCTTTCGAAGTATTTGCATGGA 3463
Query 3290 CAAGCTGTTCATTCCGTGAGAATCATAAGAGTCTCTTAGAAGAATGCTGGAGAAATGCTG 3349
| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 CGAGCTCTTCGTTCCGTGAGAATCATAGGAGTCTTTTGGAAGAATGCTGGAGAAATGCTG 3523
Query 3350 CGGATCAAGACGACTGGGACAGGC-TCCATCAAGCCTCTACTAATGAAGGTTGGAGCGAG 3408
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3524 CGGATCAAGACGACTGGGACAGGCATC-ATCAAGCCTCTACTAATGAAGGTTGGAGCGAG 3582
Query 3409 AAAGAAACATTACAGAATCTAAGGAACACGGCACTTTTCCAGGCTTCCAAAAGATCTTAT 3468
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3583 GAAGAAACATTACAGAATCTAAGGAACACGGCCCTTTTCCAGGCTTCCAAAAGGTGTTAC 3642
Query 3469 GGACCAACCCGAGTCAACTCTTTTGATGGAGATTTTGCAAAAGTCCTTCCCCTGAGACGA 3528
|||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||
Sbjct 3643 GGACCAACCCGAGTCAACACTTTTGATGGTGACTTTGCACAAGTCCTTCCTCTGAGAAGA 3702
Query 3529 GAGAACCCTGAGGATTCAACTCCTTCTGTAGAGGACGTGTTGATGAGCCACAAAGATTTC 3588
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||
Sbjct 3703 GAGAACCCTGAGGATTCAACTTCTTCTGTAGAGGACGTTTTGATGAGTCATAAAGATTTC 3762
Query 3589 GCTGAGGCGGGGAAACTGATGCTAACTGCAATCATGCTGGGTTGTGTAGAAGAAGAGGGT 3648
|||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3763 GCTGAGGCAGGGAAATTAATGCTAACTGCAATCATGCTTGGTTGTGTAGAAGAAGAGGGT 3822
Query 3649 AATGTAGCAGAAGAGTTCGCATCTCCAATGGAGTAGTTAAATTTTCTTTTTTAAGTAAAA 3708
| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
Sbjct 3823 ATTGTAGCAGAAGAGTTCTCATCTCCAATGGAGTAATTAAAATTTCTTTTT-AAGTAACA 3881
Query 3709 TTGACAATGTAAATG-GTTTTTAGTTGAAGAT 3739
|||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3882 GTGACAATGTAAATGAGTTTT-AGTTGAAGAT 3912
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-14
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTTCTCTCCATTGACGAAGAGAGCTAAGCAAAGCTCACGCAA 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTCTCTCCATTGACGAAGAGAGCTAAGCAAAGCTCACGCAA 44
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 188577538737
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5