BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg480236
Length=3708
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G07360.2 | Symbols: | SH3 domain-containing protein | chr2:... 6215 0.0
> AT2G07360.2 | Symbols: | SH3 domain-containing protein | chr2:3047252-3057196
REVERSE LENGTH=4065
Length=4065
Score = 6215 bits (3365), Expect = 0.0
Identities = 3596/3709 (97%), Gaps = 10/3709 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTCTTGTTGAATCGCCCGTCACTAAAATCCTCTCCGAGAATCCTCCTCCGATCTGCCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 TTGTCTTGTTGAATCGCCCGTCACTAAAATCCTCTCCGAGAATCCTCCTCCGATCTGCCA 91
Query 61 CTAACTATGGCGGAATCGTCTGGTACAACGCTAATGGATCTGATCTCGGCGGATCCAACC 120
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 CTAGCTATGGCGGAATCGTCTGGTACCACGCTAATGGATCTGATCTCGGCGGATCCAACC 151
Query 121 CCGGTTCCTGCACAATCAACTTCTTCGTCCGCCTCTTCCACGGCGTCTCAGCCGTCTCCT 180
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 152 CCGGTTCCTGCACAATCTACTTCTTCGTCCGCATCTTCCACGGCGTCTCAGCCGACTTCT 211
Query 181 GCTTCCGCATCGGCGGCTTCGCATCTGAACCATCCAATGTCGACGAAGACGACGCTAGGA 240
|||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 212 GCTTCCGCATCGTCTTCTTCCCATCTGCACCATCCAATGTCGACGAAGACGACTCTAGGA 271
Query 241 GAGAAGAAATCGAAGAGAGCTACTTTGATGCAGATCCAGAACGACACTATATCTGTTGCT 300
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 272 GAGAAGAAATCGAAGAGAGCCACTTTGATGCAGATCCAAAACGACACTATATCTGTTGCT 331
Query 301 AAAGCTGCACTGAATCCTGTGAAGGCCAATATCATGCCACAAAGGCAGAGACAGAAAAAG 360
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 AAAGCTGCACTGAATCCTGTTAAGGCCAATATCATGCCACAAAGGCAGAGACAGAAAAAG 391
Query 361 AAGCCAGTTTCCTATTCGCAACTTGCAAGGAGCATTCATGAATTAGCTGCCACCTTGGAT 420
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 392 AAGCCGGTTTCCTATTCGCAACTTGCAAGGAGCATTCATGAATTAGCTGCCACTTTGGAT 451
Query 421 CAGAAAAGTTCTCAGAAACAACTAGTGAATCATGTGTTCCCTAAGCTTGCTGTGTACAAC 480
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 CAGAAAAGTTCTCAGAAACAACTAGTGAATCACGTGTTCCCTAAGCTTGCTGTGTACAAC 511
Query 481 TCCGTTGATCCTTCTCTGGCCCCATCTCTACTTATGCTTAATCAGCAATGTGAAGATAGG 540
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 512 TCAGTTGATCCTTCTCTGGCCCCATCTCTTCTTATGCTTAATCAGCAATGTGAAGACAGG 571
Query 541 AATGTGCTACGCTATGTCTATTATTACCTAGCTAGAATTTTGTCCGATACGGGCATGACT 600
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 AATGTGCTACGATATGTTTATTATTACCTAGCTAGAATTTTGTCCGATACGGGCATGACT 631
Query 601 CCAGGGGGTGGTATCCCCACTCCTAACTGGGATGCTCTAGCAGATATTGATGCTGGTGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 CCAGGGGGTGGTATCCCCACTCCTAACTGGGATGCTCTAGCAGATATTGATGCTGGTGGA 691
Query 661 GGAGTCACAAGAGCTGATGTTGTTCCTCGGATAGTGAATCAACTTACAACCGAAGCTACA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 692 GGAGTCACAAGAGCTGATGTTGTTCCTCGGATAGTGAATCAACTTACAAACGAAGCTACA 751
Query 721 AATTCTGAATTTGAATTTCATGCTCGACGACTGCAAGCTTTAAAAGCTCTGACATATTCA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 752 AATTCTGAATTTGAATTTCATGCTCGACGACTGCAAGCTTTGAAAGCTCTGACATATTCA 811
Query 781 CCGTCAGGCAATTCTGAGCTTTTGTCAAAATTGTATGAGATTGTATTTGGCATTCTTGAA 840
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 CCATCAGGCAATTCTGAGCTTTTGTCAAAATTGTATGAGATTGTATTTGGCATTCTTGAA 871
Query 841 AAGGTTGGTGATGTTCCGCATAAACGAAAGAAAGGTGTATTTGGGACAAAAGGGGGTGAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 AAGGTTGGTGATGTTCCGCATAAACGAAAGAAAGGTGTATTTGGGACAAAAGGGGGTGAT 931
Query 901 AAAGAGTCGATTATGCGGAGTAACTTGCAATACGCTGCTATGAGTGCACTGAGAAGACTC 960
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 AAAGAGTCGATTATGCGAAGTAACTTGCAATACGCTGCTATGAGTGCACTGAGAAGACTC 991
Query 961 CCTCTTGATCCAGGAAATCCACTTTTTCTGCACCGTGCAGCTCAGGGTGTTTTCTTTGCT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 CCTCTTGATCCAGGAAATCCACTTTTTCTGCACCGTGCAGCTCAGGGTGTTTTCTTTGCT 1051
Query 1021 GACCCTGTTGCGGTAAGGCATTCACTGGAAATTCTATCTGAGTTAGCCACAAGAGACCCC 1080
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 GATCCTGTTGCGGTGAGGCATTCACTGGAAATTCTATCTGAGTTAGCCACAAGAGACCCC 1111
Query 1081 TATTCAGTAGCAATGACATTAGAAAAGCTTGCGTCTCCAGCAGGGGCCTTGCAAGATATC 1140
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1112 TATACAGTAGCAATGACATTAGAAAAGCTTGCGTCTCCAACAGGGGCTTTGCAAGATATC 1171
Query 1141 CTACATATGAATGATGTTCTTGCTAGAGTTTC-CTTGGCTAGGTTGTGCCACTCGATATC 1199
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1172 CTGCATATGAATGATGTTCTTGCTAGAGTTTCTCT-GGCTAGGTTGTGCCACTCAATATC 1230
Query 1200 TAGAGCTCGGGCATTAGATGAGAGGCCTGATATTAGGTCTCAGTTCAACTCAATTCTCTA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 TAGAGCTCGGGCATTAGATGAGAGGCCTGATATTAGGTCTCAGTTCAACTCAATTCTCTA 1290
Query 1260 TCAGCTACTCCTAGATCCAAGCGAACGGGTATGCTATGAGGCGATTTTGTGCATTCTGGG 1319
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 TCAGCTACTCCTAGATCCAAGCGAAAGGGTATGCTATGAGGCGATTTTGTGCATTCTGGG 1350
Query 1320 AAAATACGATAACACTGAGAGGCATGAGATGGATGAGCGTGCTGCTGGGTGGTACCGCTT 1379
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1351 AAAACACGATAACACTGAGAGGCATGAGATGGATGAGCGTGCTGCTGGGTGGTATCGCTT 1410
Query 1380 GACCAGAGAGATCCTGAAGCTGCCAGAAGCACCATCCTTGTCCTCCAAGGATAAATCTCA 1439
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1411 GACGAGAGAGATCCTGAAGCTGCCAGAAGCACCATCCTTGTCCTCCAAGGATAAATCTAA 1470
Query 1440 TAAAACCAAGCGTCCACAGCCCCTTATTAAGCTTGTAATGAGGAGGTTAGAGAGCTCATT 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 TAAAACCAAGCGTCCACAGCCCCTTATTAAGCTTGTAATGAGGAGGTTAGAGAGCTCATT 1530
Query 1500 TCGCAGTTTCTCAAGACCAGTACTTCATGCAGCAGCAAGGGTTGTGCAAGAGATGGGAAA 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 TCGCAGTTTCTCAAGACCAGTACTTCATGCAGCAGCAAGGGTTGTGCAAGAGATGGGAAA 1590
Query 1560 GAGCAGAGCAGCAGCGTTTGCAATGGGATTACAGGACATTGATGAATCCGTTCATGTAAA 1619
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 GAGTAGAGCAGCAGCGTTTGCTATGGGATTACAGGACATTGATGAATCCGTTCATGTAAA 1650
Query 1620 TGCATTTTCTGATGCTCTAGATGATGCTGAGACCAATGAAAGTTCTCATCCAGAAGGAAT 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 TGCATTTTCTGATGCTCTAGATGATGCTGAGACCAATGAAAGTTCTCATCCAGAAGGAAT 1710
Query 1680 ACGGAGAACATCATCCATATCCGCAGGGCCTGGTCGCAATGATACAATTGCAAGTTTGCT 1739
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 TCGGAGAACATCATCCATATCTGCAGGGCCTGGTCGCAGTGATACAATTGCAAGTTTGCT 1770
Query 1740 AGCTGCATTAATGGAGGTAGTTCGGACAACAGTAGCATGTGAGTGTGTGTATGTCCGGGC 1799
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1771 AGCTGCATTAATGGAGGTGGTTCGGACAACAGTAGCATGCGAGTGCGTGTATGTCCGGGC 1830
Query 1800 AATGGTTATCAAAGCATTGATATGGATGCAAAGTCCAGATGAATCGTTGGATGAGTTGAA 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1831 AATGGTTATCAAAGCATTGATATGGATGCAAAGTCCAGATGAATCATTGGATGAGTTAAA 1890
Query 1860 ATCAATCATTGCCTCAGAGCTTTCAGATCCTGGTTGGCCCGCAGCTCTAGTTAATGATGT 1919
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1891 ATCAATCATTGCCTCGGAGCTTTCAGATCCTGGTTGGCCTGCAGCTCTAGTCAATGATGT 1950
Query 1920 TTTGCTTACTTTGCATGCTCGCTTTAAGGCAACTCCAGATATGGCTGTTATTCTTCTCGA 1979
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 TTTGCTTACTTTGCATGCCCGCTTTAAGGCAACTCCAGATATGGCTGTTATTCTTCTCGA 2010
Query 1980 AATTGCCAGAATATTTGCCACCAAAGTTCCAGGGAAAATTGACGCTGATGTCTTACAGCT 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 AATTGCCAGAATATTTGCCACCAAAGTTCCAGGGAAAATTGACGCTGATGTCTTACAGCT 2070
Query 2040 ACTCTGGAAGACATGTCTTGTTGGAGCTGGTCCTGACGGGAAACACACAGCTCTGGAAGC 2099
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 GCTATGGAAGACATGTCTTGTTGGAGCTGGTCCTGACGGGAAACACACAGCTCTGGAAGC 2130
Query 2100 AGTCACAATAGTACTTGATCTACCACCTCCACAGCCGGGGTCCATGGCTGGACTGACATC 2159
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2131 AGTCACGATAGTACTCGATCTACCACCTCCACAACCGGGGTCCATGGCTGGACTGACATC 2190
Query 2160 AATTGATAGGGTCTCTGCATCAGATCCTAAGTCAGCTCTGGCGCTGCAGAAATTGGTTCA 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2191 AATTGATAGGGTCTCTGCATCAGATCCTAAGTCAGCTCTGGCGCTGCAGAAATTGGTGCA 2250
Query 2220 AGCAGCAGTATGGTTCCTTGGAGAAAATGCAAACTACGCTGCTTCAGAATACGCATGGGA 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 2251 AGCAGCAGTATGGTTCCTTGGAGAAAATGCAAACTACGCCGCATCAGAATATGCATGGGA 2310
Query 2280 ATCTGCAACTCCACCAGGCACAGCACTTATGATGTTGGATGCAGATAAAATGGTTGCTGC 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311 ATCTGCAACTCCACCAGGCACAGCACTTATGATGTTGGATGCAGATAAAATGGTTGCTGC 2370
Query 2340 TGCTAGTTCTCGCAATCCTACCCTAGCTGGTGCATTAACTCGCCTCCAGAGGTGTGCGTT 2399
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2371 TGCTAGTTCTCGCAATCCTACTCTAGCTGGTGCATTAACTCGCCTCCAGAGGTGTGCATT 2430
Query 2400 TAGTGGAAGCTGGGAGGTCCGAATTGTTGCAATTCAAGCTCTTACTACGATAGCCATTAG 2459
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2431 TAGTGGAAGCTGGGAGGTCAGAATTGTTGCAATTCAAGCTCTTACTACAATAGCCATTAG 2490
Query 2460 ATCTGGTGAACCTTTTAGGCTGCAGATATACGAGTTTTTGTACACCTTGGCAGAGGGTGG 2519
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2491 ATCTGGTGAACCTTTCAGGCTGCAGATATACGAGTTTTTGTACACCTTAGCAGAGGGTGG 2550
Query 2520 TGTACAGTCTCAACTTTCTGAAATGCACCTGAGTAATGGTGAAGACCAAGGAGCTAGTGG 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2551 TGTACAGTCTCAACTTTCTGAAATGCACCTGAGTAATGGGGAAGACCAAGGAGCTAGTGG 2610
Query 2580 TACAGGACTTGGAGTTTTAATAACTCCGATGTTAAAAGTTCTTGATGAAATGTATGTTGG 2639
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2611 TACAGGTCTTGGAGTTTTAATAACACCGATGTTAAAAGTTCTTGATGAAATGTATGTTGG 2670
Query 2640 ACAAGACGAATTAATCAAGGATATACGCCATCACGATAATGCAAACAAAGAATGGAAGGA 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 ACAAGACGAATTAATCAAGGATATACGCCATCACGATAATGCAAACAAAGAATGGAAGGA 2730
Query 2700 TGAGGAGCTGAAAAAACTCTACGAAAACCATGAGAGGCTGCTAGATTTTGTTTCAATGTT 2759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2731 CGAGGAGCTGAAAAAACTCTACGAAAACCATGAGAGGCTGCTGGATTTTGTTTCAATGTT 2790
Query 2760 TTGCTATATTCCTAGAGCCAAGTATTTACCACTGGGCCCGATAAGCGCAAAGCTCATTGA 2819
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2791 TTGCTTTATTCCTAGAGCCAAGTATTTACCACTGGGCCCGATAAGCGCGAAGCTCATTGA 2850
Query 2820 CATATACCGCACAAAACACAATATCACTGCATCTACTGGGTCCACCGATCCAGCTGTCGT 2879
|| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2851 CACATACCGTACAAAGCACAATATCACTGCATCTACTGGGTCCACCGATCCAGCTGTTGT 2910
Query 2880 TGCTACTGGAATTTCGGACTTAATTTACGAGTCCACTCAGCCTGCCCCCGCTGCCTCAAA 2939
||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2911 TGCTACTGGGATCTCGGACTTAATCTATGAGTCCACTCAGCCTGCCCCCGCTGCCTCAAA 2970
Query 2940 CTCCAGTGGTCTGGATGATGATTTGGTGAATGCTTGGGCTGCAAACCTTGGCGATGATGG 2999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2971 CTCCAGTGGTCTGGATGATGATTTGGTGAATGCTTGGGCTGCAAACCTTGGTGATGATGG 3030
Query 3000 TCTTCTTGGAAACAATGCCCCAGCAATGAGTAGGGTCAATGAATTCCTTTCTGGAGTCGG 3059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3031 TCTTCTTGGAAACAATGCCCCAGCAATGAGTAGGGTCAATGAATTCATTGCTGGAGTCGG 3090
Query 3060 AACAGATGCACCAGATGTTGAGGAGGAGAATGTCTTCTCTAGACCTTCAGTTGGCTATGA 3119
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3091 AACAGATGCACCGGATGTTGAGGAGGAGAATGTCTTCTCTAGACCTTCGGTTGGGTATGA 3150
Query 3120 TGACATGTGGGCTAAGACTCTTTTAGAAACTTCAGAATTGGAGGAAGAAGATGCGAGATC 3179
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3151 TGACATGTGGGCTAAAACTCTTTTAGAAACTTCAGAATTGGAGGAAGAAGATGCGAGATC 3210
Query 3180 AGGTTCATCGTCTCCAGATTCTACTGGATCAGTGGAAAGCTCTATATCCTCTCACTTTGG 3239
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3211 AGGTTCATCGTCTCCAGATTCTGCTGGATCAGTGGAAAGCTCAATATCCTCTCACTTTGG 3270
Query 3240 TGGAATGAACTACCCATCATTATTCAGTTCAAAGCCTTCCTCACAAGCAACGGCAAAATC 3299
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3271 TGGAATGAACTACCCATCATTGTTCAGTTCAAAGCCTTCCTCACAAGCAACGGCAAAATC 3330
Query 3300 GGGTGGAAGCAAATACCAGTCCACATATGAAGGCTATGGTTCCCCGATTAGAGAAGAGCC 3359
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3331 AGGTGGAAGTAAATACCAGTCCACATATGAAGGCTATGGTTCCCCAATTAGAGAAGAGCC 3390
Query 3360 TCCTCCGCCTTATTCATATTCTGAGCCACAAAGTCGTGAATCGTTTGAGAACCCTGTAGC 3419
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3391 TCCTCCGCCTTATTCGTATTCTGAGCCACAAAGTCGTGAATCGTTTGAGAACCCTGTAGC 3450
Query 3420 AGGGTCTGGTTCTCGAAGTTATGAATCAGATGATGAAGAACCTAGGAAATCTACTGGTAC 3479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451 AGGGTCTGGTTCTCGAAGTTATGAATCAGATGATGAAGAACCTAGGAAATCTACTGGTAC 3510
Query 3480 AAGATTTGGAACAGCGCTCTATGACTTCACTGCAGGAGGAGATGATGAGCTAAACTTGAC 3539
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3511 AAGATTTGGAACAGCGCTCTATGACTTCACAGCAGGAGGAGATGATGAGCTAAACTTGAC 3570
Query 3540 GGCAGAAGAGGAATTGGAGATAGAGTATGAAGTAGATGGCTGGTTTTACGTAAAGAAGAA 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3571 GGCAGAAGAGGAATTGGAGATAGAGTATGAAGTTGATGGCTGGTTTTACGTAAAGAAGAA 3630
Query 3600 GCGGCCTGGAAGAGATGGGAAGATGGCGGGACTAGTTCCCGTTCTTTACGTCAATCAATC 3659
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3631 GCGGCCTGGAAGAGATGGGAAGATGGCGGGACTTGTTCCTGTTCTATACGTCAATCAATC 3690
Query 3660 TTGAATTGGAtttttttttGGGAACGGCTTTAGACGTAGAAGCCAACAC 3708
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3691 TTGAATT---TTTG-----GGGAACGGCTTTAGACGTAGAAGCCAACAC 3731
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 184664517183
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5