BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg480238
Length=3582
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G07680.1 | Symbols: ATMRP11, MRP11, ABCC13 | multidrug resis... 5624 0.0
> AT2G07680.1 | Symbols: ATMRP11, MRP11, ABCC13 | multidrug resistance-associated
protein 11 | chr2:3514745-3522491 FORWARD
LENGTH=4244
Length=4244
Score = 5624 bits (3045), Expect = 0.0
Identities = 3404/3581 (95%), Gaps = 9/3581 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAACATGGCTCAGTGAAGCAGCTAGAATTTGAAAATCTGCTTCCACTACCACCTGAT 60
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 660 ATGAAACATGGCTCGGTGAAGCAGCTAGAATTGGAAAATCTACTTACACTACCACCTGAA 719
Query 61 ATGGATCCTTTTACATGTTGTGAGAATTTACTGAGATGCTGGCAACTTCAAGAGTGCAAT 120
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 720 ATGGATCCTTTTACATGTTGTGAGAATTTATTGAGATGTTGGCAACTTCAAGAGTGTAAT 779
Query 121 AATTACTCAACTCCATCACTAATTTGGTCAATATCTGGTGTATATGGATGGCCATATTTT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTACTCAACTCCATCACTAATTTGGTCAATATATGGTGTATATGGATGGCCATATTTT 839
Query 181 CGTCTTGGACTGTTAAAGGTGTTCAATGATTGCATTGGCTTTGCAGGCCCCTTATTTCTC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||
Sbjct 840 CGTCTTGGACTGTTAAAGGTGTTCAATGATTGCATTGGATTTGCTGGACCCTTACTTCTC 899
Query 241 AACAGACTTATCAAGTCTTTTCTTGATACACAATACACGTTTCGTCTGTCAAAGTTTAAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||
Sbjct 900 AACAGACTTATCAAGTCTTTTCTTGATACACAATACACGTTTCGTCTTTCAAAGCTGAAA 959
Query 301 TTAAAGCTCCGATCTAGTATAATGAGTGTCATCTACAGGAAGTGTTTGTGGGTGAACACA 360
| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CTCAAGCTACGGTCTAGTATAATGAGTGTCATCTACAGGAAGTGTTTGTGGGTGAACACA 1019
Query 361 GCAAACCGGTCAGGATTTTCTGAGGGCGAGATTCAAACATTTATGTCGGTAGATGCTGAC 420
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GCAAACCGGTCAGGATTTTCTGAAGGCGAGATTCAAACATTTATGTCGGTAGATGCTGAC 1079
Query 421 CGCATTGTTAACTTGTGCAACAGTTTGCATGACATGTGGAGCCTGCCTTTGCAAATTGGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CGCATTGTTAACTTGTGCAACAGTTTGCATGACTTGTGGAGCCTGCCTTTGCAAATTGGG 1139
Query 481 ATAGCTTTGTATCTTTTGTATACTCAAGTCAAGTTTGCTTTTCTGTCTGGACTTGCAATC 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1140 ATAGCTTTGTATCTTTTGTATACTCAAGTCAAGTTTGCTTTTCTTTCTGGACTTGCAATC 1199
Query 541 ACCATCTTGCTGATACCAGTCAATAAATGGATATCTGTGCTTATTGCATCTGCAACAGAG 600
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1200 ACCATCTTGCTGATACCAGTGAATAAATGGATATCGGTGCTGATTGCATCTGCAACAGAG 1259
Query 601 AAAATGATGAAGCTAAAAGATGAGAGGATTAGAAAAACAGGAGAGCTTTTAACAAACATA 660
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 AAAATGATGAAGCTTAAAGATGAGAGGATTAGAAAAACAGGAGAGCTTTTAACAAACATA 1319
Query 661 CGCACACTCAAAATGTATGGGTGGGACAACTGGTTTGCTGATTGGTTGAAGGAAACAAGG 720
|||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 CGCACACTTAAAATGTATGGATGGGATAACTGGTTTGCTGATTGGTTGAAGGAAACAAGA 1379
Query 721 GCCACCGAAGTGACTCACTTAGCGACTCGGAAGTATTTAGATGCTTGGTGTGTTTTCTTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GCCACCGAAGTGACTCACTTAGCGACTCGGAAGTATTTAGATGCTTGGTGTGTTTTCTTT 1439
Query 781 TGGGCAACAACACCAACTCTTTTTTCCCTTTGCACTTTTGGTCTCTTTGCTCTGATGGGT 840
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TGGGCAACAACACCAACTCTTTTTTCTCTTTGCACTTTTGGTCTCTTTGCTCTGATGGGT 1499
Query 841 CATCAACTTGATGCAGCAACGGTGTTTACTTGTCTTGCTTTGTTTAATAGCTTAATCTCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CATCAACTTGATGCAGCAACGGTGTTTACTTGTCTTGCTTTGTTTAATAGCTTAATCTCT 1559
Query 901 CCATTAAACTCGTTTCCATGGGTCATCAATGGTCTCATTGATGCCTTTATATCCACCAGG 960
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 CCATTAAACTCGTTTCCATGGGTCATCAACGGTCTCATTGATGCCTTTATATCCACCAGG 1619
Query 961 CGTGTGAGCAAGTTCTTGTGTTGTTTGGAACATAGTAGAGATTCTTCTTTAGATTCTGG- 1019
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 1620 CGTGTGAGCAAGTTCTTGTGTTGTTTGGAGCATAGTAGAGATTTTTCTATAGATTCTGGA 1679
Query 1020 TTTAACCTCTGAAGACTTAGCTGTGTTTGTGGAAGATGCATCTTCTACTTGGTCAAGTAA 1079
||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1680 TTT-ACATCTGAAGACTTAGCTGTATGTGTGGAAGATGCATCTTGTACTTGGTCAAGTAA 1738
Query 1080 CCTAGAAGAGGATTATAACTTGACAATAAAACATGTAAGCCTAAGAGTGCCAAAGGGATC 1139
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 CGTAGAAGAGGATTATAACTTGACAATAAAACAAGTAAGCCTAAGAGTGCCAAAGGGATC 1798
Query 1140 CTTTGTTGTAGTTATCGGTGAGGTTGGTTCAGGTAAAACATCTTTGTTGAATTCACTATT 1199
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1799 TTTTGTTGCAGTTATCGGGGAGGTTGGTTCAGGTAAAACATCGTTGTTGAATTCACTTTT 1858
Query 1200 AGGCGAAATGCGGTGTGTTCATGGATCAATACTATTAAATGGGTCTGTGGCATATGTACC 1259
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1859 AGGCGAAATGCGGTGTGTTCATGGATCTATACTATTAAATGGCTCTGTGGCATATGTACC 1918
Query 1260 ACAGGTCCCGTGGATTTTATCTGGAACTATACGCGAAAATATCTTATTCGGGAAGCCTTT 1319
||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1919 ACAGGTCCCATGGCTTTTGTCTGGAACTGTACGTGAAAACATTTTATTCGGGAAGCCTTT 1978
Query 1320 TGACTCCAAAAGCTATTTCGAGACATTGAGTGCTTGTGCACTAGATGTGGATATTTCACT 1379
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TGACTCCAAAAGGTATTTCGAGACATTGAGTGCTTGTGCACTAGATGTGGATATTTCACT 2038
Query 1380 TATGGCCGGAGGAGACATGGCGTGTATAGGCGATAAAGGAGTAAACTTATCCGGAGGACA 1439
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TATGGTCGGAGGAGACATGGCGTGTATAGGTGATAAAGGACTAAACTTATCCGGAGGACA 2098
Query 1440 AAGAGCTCGGCTTGCTTTGGCCAGGGCTGTTTATCATGGTTCAGACATGTACCTTCTTGA 1499
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 GAGAGCTCGGTTTGCTTTGGCCAGGGCTGTTTATCATGGTTCAGACATGTACCTTCTTGA 2158
Query 1500 TGATGTACTGAGTGCAGTGGATTCACAAGTAGGCTGCTGGATATTGCAAAGAGCACTTCT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 TGATGTACTGAGTGCAGTGGATTCACAAGTAGGATGTTGGATATTGCAAAGAGCACTTCT 2218
Query 1560 GGGTCCTCTGTTGAACAAAAAGACTCGCGTTATGTGCACTCACAACATTCAGGTGATATC 1619
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2219 GGGTCCTCTGTTGAACAAAAAGACTCGTGTTATGTGCACTCACAACATTCAGGCGATATC 2278
Query 1620 TTGTGCAGATATGATTGTTGTGATGGACAAAGGAAAAGTGAAATGGTCAGGAACTGTTAC 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2279 TTGTGCAGATATGATTGTTGTGATGGACAAAGGAAAAGTGAATTGGTCAGGAAGTGTTAC 2338
Query 1680 TGATATGCCTAAATCCATTTCCCCAACATTTTCTTTATCCAATGACTTTGATATGTCATC 1739
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2339 TGATATGCCCAAATCCATTTCTCCAACATTTTCTTTAACCAATGAATTTGATATGTCATC 2398
Query 1740 ACCAAATCACTTGACCAAAAGAAAAGA-ACCTCTATCTATCAAGAAAGACGATTTAGATG 1798
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | | ||||||
Sbjct 2399 ACCAAATCACTTGACCAAAAGAAAAGAGA-CTCTATCTATCAAGGAAGATGGTGTAGATG 2457
Query 1799 AAATTAGTGAAGCT---GCGGATATCGTCAAATTGGAGGAACGAAAAGAGGGTCGAGTTG 1855
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 AAATTAGTGAAGCTGCGGCGGATATCGTCAAATTAGAGGAACGAAAAGAGGGTCGAGTTG 2517
Query 1856 AAGTAACGGTTTATAGGAACTATGCTGCATTTTCTGGTTGGTTCATTGCTATTGTAATAT 1915
|| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2518 AAATGATGGTTTATAGGAACTATGCTGTGTTTTCTGGTTGGTTCATTACTATTGTAATAT 2577
Query 1916 TGGTTTCAGCGGTTTTAATGCAAGCTTCCCGTAATGGAAATGATTTGTGGCTATCATATT 1975
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 TGGTTTCAGCGGTTTTAATGCAAGGGTCTCGTAATGGAAATGATTTGTGGCTATCATATT 2637
Query 1976 GGGTTGACAAGACAGGAAGAGGAGTATCACATTACTCAACCTCGTTTTATTTGATGGTTC 2035
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 GGGTTGACAAGACAGGAAAAGGAGTATCGCATTACTCAACCTCGTTTTATTTGATGGTTC 2697
Query 2036 TCTGTATCTTTTGCATCATTAACTCAAT-TCTAACCTTGGTGAGAGCATTCTCGTTTGCA 2094
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2698 TCTGTATCTTTTGCATCATTAACTCAATAT-TAACCTTGGTGAGGGCATTCTCATTTGCA 2756
Query 2095 TTTGGAGGATTAAAAGCAGCAGTGCATGTTCATAGTGCATTGATCAGTAAGCTTATAAAT 2154
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2757 TTTGGAGGATTAAAAGCAGCAGTGCATGTTCATAATGCATTAATCAGTAAGCTTATAAAT 2816
Query 2155 GCACCTACACAGTTCTTTGATCAGACACCATGTGGAAGAATACTTAACAGGTTTTCCTCT 2214
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2817 GCACCTACACAGTTCTTTGATCAGACACCAAGTGGAAGAATACTTAATAGGTTTTCCTCT 2876
Query 2215 GATCTATATACCATCGATGACTCTCTCCCGTTTATTCTCAACATTCTTCTAGCAAATTTT 2274
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 GATCTATATACCATCGACGACTCTCTCCCGTTTATTCTCAACATTCTTCTAGCAAATTTT 2936
Query 2275 GTTGGCTTGTTAGGGATTATTGTAGTATTGTCTTATGTTCAGGTTCTATTCCTGCTTCTG 2334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2937 GTTGGCTTGTTAGGGATTATTGTAGTATTGTCTTATGTTCAGGTTCTATTCCTGCTTCTG 2996
Query 2335 CTTCTGCCATTTTGGTACATATACAGCAAGCTTCAGTTCTTCTACAGGTCAACGTCAAGG 2394
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2997 CTTCTGCCATTTTGGTACATATACAGCAAGCTTCAGGTCTTCTACAGGTCTACTTCAAGG 3056
Query 2395 GAACTACGAAGGTTGGACAGTGTTTCAAGATCACCGATCTATGCATCGTTCACGGAGACA 2454
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 GAACTACGAAGGTTGGACAGTGTTTCACGATCACCGATATATGCATCGTTCACGGAGACA 3116
Query 2455 CTTGATGGGTCATCAACTATCAGGGCTTTTAAGTCTGAGGAGCATTTCGTAGCTAGGTTT 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||
Sbjct 3117 CTTGATGGGTCATCAACTATCAGGGCTTTTAAGTCTGAGGAGCATTTTGTAGGTAGATTT 3176
Query 2515 ATTGAGCATTTGACGTTATACCAGCGGACTTCTTACTCAGAGATAATTGCAAGCTTGTGG 2574
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3177 ATTGAGCATTTGACGCTATACCAGCGGACTTCTTACTCAGAGATAATCGCAAGCTTGTGG 3236
Query 2575 CTCTCCTTGCGTCTTCAGTTGTTAGGAGCCATGATTGTCTTATTTGTCGCGGTAATGGCT 2634
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3237 CTCTCCTTGCGTCTTCAGTTGTTAGGATCAATGATTGTCTTATTTGTCGCTGTAATGGCT 3296
Query 2635 GTTTTCGGCTCCCGTGGGAACTTTCCAATCAGTTTTGGTACGCCTGGACTGGTGGGATTA 2694
|| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3297 GTCCTCGGCTCCGGGGGGAACTTTCCAATCAGTTTTGGTACACCTGGACTGGTGGGATTA 3356
Query 2695 GCTCTCTCATATGCAGCTCCACTGGTTTCTCTGTTAGGAAGCTTCTTAACAAGTTTTACT 2754
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3357 GCGCTCTCATATGCAGCTCCATTGGTTTCTCTGTTAGGAAGCTTGTTAACAAGTTTTACT 3416
Query 2755 GAAACAGAAAAGGAAATGGTTTCTGTTGAAAGGGTTCTCCAGTACATGGATGTGCCTCAA 2814
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3417 GAAACAGAAAAAGAAATGGTTTCTGTTGAAAGGGTTCTCCAGTACATGGATGTGCCTCAA 3476
Query 2815 GAAGAAGTTTCCGGTCGTCAATCTCTCAGCGGTAAGTGGCCGGTTCAAGGATTAGTTGAG 2874
||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 3477 GAAGAAGTTTCAGGTCCTCAATCTCTCAGCGATAAGTGGCCTGTTCACGGATTAGTTGAG 3536
Query 2875 TTTCAGAATGTGACAATGAGATACATCTCAACTCTGCCTCCAGCGCTCAACCACATTTCT 2934
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||
Sbjct 3537 TTTCACAATGTGACAATGAGATACATCTCAACTCTGCCTCCGGCCCTCACCCAAATTTCT 3596
Query 2935 TTTACAATCCAAGGAGGAATGCATGTAGGAGTAATTGGAAGAACTGGTGCCGGGAAATCT 2994
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3597 TTTACAATCCAAGGAGGAATGCATGTAGGAGTAATTGGAAGAACTGGTGCCGGGAAGTCC 3656
Query 2995 TCGATCTTGAATGCCCTTTTCCGGCTTAATCCTGTTTGTAATGGAGAGATATTGGTTGAT 3054
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 3657 TCGATCTTGAATGCGCTTTTCCGGCTTACTCCTGTTTGTAGTGGAGAGATATTGGTGGAT 3716
Query 3055 GGAATTAACATAAACCATCTTCTAATTAGAGAGCTCCGTTCTCGCCTCGCTGTTGTTCCT 3114
|||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3717 GGAAAAAACATAAGCCATCTTCCGATAAGAGAACTCCGTTCTTGCCTCGCTGTTGTTCCT 3776
Query 3115 CAGAGCCCTTTTCTGTTTCAAGGATCAATGAGGGATAACCTTGATCCTCTTGGGTTGAGT 3174
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3777 CAGAGCCCTTTTCTGTTTCAAGGATCACTGAGGGATAACCTTGATCCTCTTGGGTTGAGT 3836
Query 3175 GAGGATTGGAGAATCTGGGAGATCCTAGAGAAATGTAAAGTTAAGGCAGAGGTAGAAAGT 3234
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3837 GAGGATTGGAGAATCTGGGAGATCCTAGACAAGTGTAAAGTTAAGGCAGCGGTAGAAAGT 3896
Query 3235 GCAGGAGGGTTAGATTCAAATGTAAAGGAATCTGGATGTTCCTTTTCTGTTGGGCAGAGA 3294
| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3897 GTAGGAGGGTTAGATTCATATGTAAAGGAATCTGGTTGTTCCTTTTCTGTTGGACAGAGA 3956
Query 3295 CAGCTCCTGTGTCTTGCCCGTGCTCTACTCAAGTCATCTAAGATCCTATGCCTTGATGAA 3354
||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3957 CAGCTTTTGTGCCTTGCTCGTGCTTTGCTCAAGTCATCTAAGATCCTATGCCTTGATGAA 4016
Query 3355 TGCACCGCCAACATCGATGTTCACACAGCTTCACTACTGCACAACACAATATCGAGGGAA 3414
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 4017 TGCACCGCCAACATCGATGTTCACACAGCTTCCCTACTCCACAACACGATATCGAGTGAA 4076
Query 3415 TGCAAAGGCGTAACCGTCATTACCATTGCTCACCGCATTTCAACGGTTCTTGATTTGGAC 3474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct 4077 TGCAAAGGCGTAACCGTCATTACCATTGCTCACCGCATTTCTACGGTTGTTGATTTAGAC 4136
Query 3475 AACATCCTTATTCTTGATCACGGAATTCTTGTTGAACAAGGAAAACCGCAACATCTTTTG 3534
| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4137 AGCATCCTAATTCTTGATCGTGGAATTCTTGTTGAACAAGGAAAACCACAACATCTTTTG 4196
Query 3535 CAAGATGACTCCTCAACTTTCTCAAGCTTTGTCAGAGCTTC 3575
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4197 CAAGATGACTCCTCAACTTTTTCAAGCTTTGTCAGAGCTTC 4237
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 178343482365
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5