BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg480269

Length=4888
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT2G07682.1 | Symbols:  | transposable element gene | chr2:3292...  8794    0.0   
  ATMG00880.1 | Symbols: ORF187 | hypothetical protein | chrM:237...  1026    0.0   
  ATMG00870.1 | Symbols: ORF184 | hypothetical protein | chrM:236...  1014    0.0   
  ATMG00860.1 | Symbols: ORF158 | DNA/RNA polymerases superfamily...   843    0.0   
  ATMG00840.1 | Symbols: ORF121B | hypothetical protein | chrM:23...   658    0.0   
  ATMG00850.1 | Symbols: ORF107E | DNA/RNA polymerases superfamil...   586    7e-166


> AT2G07682.1 | Symbols:  | transposable element gene | chr2:3292516-3297403 
REVERSE LENGTH=4888
Length=4888

 Score = 8794 bits (4762),  Expect = 0.0
 Identities = 4857/4899 (99%), Gaps = 22/4899 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ACTTTGCGGCGTGCTCTCTGGGAGCAGTTGAGTAGCTTGGCATCTATGATATCTGATCCT  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ACTTTGCGGCGTGCTCTCTGGGAGCAGTTGAGTAGCTTGGCATCTATGATATCTGATCCT  60

Query  61    TGGCTAATAGGTGGGGGGACTTTCATTCCATTCTGTGTAGTTCAGAGAGCCGGGGTGGCT  120
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  61    TGGCTAATAGGTGGGGGGACTTTCATTCCATTCTGTGTAGTTCAGATAGCCGGGGTGGCT  120

Query  121   CAGCTAGTGGTAATCGGCCGTGTCGTTTGAGTTGGTTCCATTCCTCTAGTCTCTATGACA  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CAGCTAGTGGTAATCGGCCGTGTCGTTTGAGTTGGTTCCATTCCTCTAGTCTCTATGACA  180

Query  181   TGAAGTTCGTTGGTCCGAAGTTGACTTGGGCTCGCAAGGGTTTGCTGAAGCGTTTAGATA  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   TGAAGTTCGTTGGTCCGAAGTTGACTTGGGCTCGCAAGGGTTTGCTGAAGCGTTTAGATA  240

Query  241   GAGCTACACTTGAGAGTCTTTCTATTACTTCCTTGCTTACCTGGCTCACTTCGCAACAAA  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   GAGCTACACTTGAGAGTCTTTCTATTACTTCCTTGCTTACCTGGCTCACTTCGCAACAAA  300

Query  301   GAGAAGTTGTTTATTTGCTTGCTTAGCTAGAAGATGCCAACTTCGTTCACTTACGTCTCT  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   GAGAAGTTGTTTATTTGCTTGCTTAGCTAGAAGATGCCAACTTCGTTCACTTACGTCTCT  360

Query  361   CGTTTACTTGTTAGCTAGCCCTATTCCTCACCTTTGCTTTGAGGGTATCTAAATaaaaaa  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CGTTTACTTGTTAGCTAGCCCTATTCCTCACCTTTGCTTTGAGGGTATCTAAATAAAAAA  420

Query  421   aaTATACAGTGGTGTGCTCGTTAGAGGATGCTTTTTTAGTTAGCTAAGCGACTACCTTAG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   AATATACAGTGGTGTGCTCGTTAGAGGATGCTTTTTTAGTTAGCTAAGCGACTACCTTAG  480

Query  481   TTGAAGGTGGGAGGAGAGCAGCAAAGTCTCTTATCTTTCCAAAGAAGGCGGAAATCGAGA  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   TTGAAGGTGGGAGGAGAGCAGCAAAGTCTCTTATCTTTCCAAAGAAGGCGGAAATCGAGA  540

Query  541   TGTGAGAAAAAGAATAGCTATTCACTCTCCAAAGAAGCCCTCAAAATTCTTTCTAGCAGA  600
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  541   TGTGAGAAAAAGAATAGCTATTCACTCTCCAAAGAAGCCCTCAAAATTCTTTCTAGCAAA  600

Query  601   TGTGAAGAGAGGATTGTTGACAATTCAATAACCACTGCAATACCCTCTTACGGAATGATC  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   TGTGAAGAGAGGATTGTTGACAATTCAATAACCACTGCAATACCCTCTTACGGAATGATC  660

Query  661   TCGGTGTTCTCGCTATGTCGTCAATCTCAGTATACGGAAATGGTCTGACCAAGAGGCATC  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   TCGGTGTTCTCGCTATGTCGTCAATCTCAGTATACGGAAATGGTCTGACCAAGAGGCATC  720

Query  721   GATCTGGAGTGGGTCTTGCATTGCCGGATGACAGGAGCCCTTTACCTCCACTCTTCAATT  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   GATCTGGAGTGGGTCTTGCATTGCCGGATGACAGGAGCCCTTTACCTCCACTCTTCAATT  780

Query  781   ATATCCATACCAGGTGAACACAGATGATCGACCTTCAGTGCCTGGTCAACCATTAAAGAA  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   ATATCCATACCAGGTGAACACAGATGATCGACCTTCAGTGCCTGGTCAACCATTAAAGAA  840

Query  841   GAGAAGAGGAGCGGAACAATGAGAAGGAGTTCGTAGCCCTCCAACCAGAACTAATCAACC  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   GAGAAGAGGAGCGGAACAATGAGAAGGAGTTCGTAGCCCTCCAACCAGAACTAATCAACC  900

Query  901   CGCCTCTTCAACATCTCCATTTCCCATTCCATCTCTGGGATCCAATGCTTCTTCACCGGG  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   CGCCTCTTCAACATCTCCATTTCCCATTCCATCTCTGGGATCCAATGCTTCTTCACCGGG  960

Query  961   CCCGCCCGATCCCCAGAACGTAAAATGGAACCATACCGGAAACCGTTTGATCAGGATAGA  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   CCCGCCCGATCCCCAGAACGTAAAATGGAACCATACCGGAAACCGTTTGATCAGGATAGA  1020

Query  1021  AAGAGCAAGGGGCTTTGTTTTCGTTGTGGTGACAAGTGGAATCCTGGTCACAGATGTAAG  1080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  AAGAGCAAGGGGCTTTGTTTTCGTTGTGGTGACAAGTGGAATCCTGGTCACAGATGTAAG  1080

Query  1081  GGCAGAGAATTCAAGTATATGGCTGTGGATGAAGGAGATGAGTTGGATGAGGCTGATGAA  1140
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  GGCAGAGAATTAAAGTATATGGCTGTGGATGAAGGAGATGAGTTGGATGAGGCTGATGAA  1140

Query  1141  GCTGAAACAGGGAAAAAGATAGAAGAATCAGATGAGGATGAAGTAAAGGAATTACTCTGG  1200
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1141  GCTGAAACAGGGAAAAAGATAGAAGAATCAGATGAGGATGAAGTAAAGGAATTACTCTGG  1200

Query  1201  TTGTCTTTGCGGTCGATGGCAGGTTTAACAACTGAGAGATCCATGAGGATGAGAGGACAA  1260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1201  TTGTCTTTGCGGTCGATGGCAGGTTTAACAACTGAGAGATCCATGAGGATGAGAGGACAA  1260

Query  1261  ATTGCAGGACAAGAAGTCATTGTTTTAATTGATTCAGGGGCTACAAGCAATTTCATAGCA  1320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1261  ATTGCAGGACAAGAAGTCATTGTTTTAATTGATTCAGGGGCTACAAGCAATTTCATAGCA  1320

Query  1321  GAGAGTGTAGCACATCGGTGTGGTCTGCAAATCACAGAAACTCGTGGATTTGGGGTTTCT  1380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1321  GAGAGTGTAGCACATCGGTGTGGTCTGCAAATCACAGAAACTCGTGGATTTGGGGTTTCT  1380

Query  1381  ATTGGAAATGGTCAAGTCGTTCCAAGTGCCGGGAAATGCAGCGGAGTAGAGCTAACGGTC  1440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1381  ATTGGAAATGGTCAAGTCGTTCCAAGTGCCGGGAAATGCAGCGGAGTAGAGCTAACGGTC  1440

Query  1441  CAAGATGTGCAGATACGTGCGGACTTCTTCCTGTAACCACGGATATAGTGCTGGGTTATG  1500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1441  CAAGATGTGCAGATACGTGCGGACTTCTTCCTGTAACCATGGATATAGTGCTGGGTTATG  1500

Query  1501  CGTGGTTGGCCACTCTGGGTGACACCAGAATGAATTGGGGAAGACACACCTTGAGTTTCC  1560
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1501  CGTGGTTGGCTACTCTGGGTGACACCAGAATGAATTGGGGAAGACACACCTTGAGTTTCC  1560

Query  1561  GTAGGGAAGATCAGTGGGTCACCTTAGCAGGCGATCCGTCACTGGTGCGAGCTCAAATCT  1620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1561  GTAGGGAAGATCAGTGGGTCACCTTAGCAGGCGATCCGTCACTGGTGCGAGCTCAAATCT  1620

Query  1621  CTCTCAATTCAATGGAGAGGGTAGTCAAAGAGGGAAGGAAGGC---TTATCTCCTAGAGC  1677
             ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||
Sbjct  1621  CTCTCAATTC---------GGTAGTCAAAGAGGGAAGGAAGGCTTATTATCTCCTAGAGC  1671

Query  1678  TCACCGCACTG-TTTGCAGGAGGAATTAAGACTCAAAATTTTCCTGAGGATGCTCAAGTG  1736
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1672  TCACCGCACTGTTTTGCAGGAGGAATTAAGACTCAAAATTTTCCTGAGGATGCTCAAGTG  1731

Query  1737  AAACAGTTGTTGGAATGGCATGAAAACGTGTTTGAGATGCCGCAAGGATTACCCCCAAAA  1796
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1732  AAACAGTTGTTGGAATGGCATGAAAACGTGTTTGAGATGCCGCAAGGATTACCCCCAAAA  1791

Query  1797  CGTGGCAGGGAACATGCTATCAACCTTAAGGAAGGAGCAGAACCAGTTAACATCCGTCCT  1856
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1792  TGTGGCAGGGAACATGCTATCAACCTTAAGGAAGGAGCAGAACCAGTTAACATCCGTCCT  1851

Query  1857  TACCGGTATACATATACTCAGAAGGACGAGATTGAAAAATTGGTTAGGGAGATGTTAGAA  1916
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1852  TACCGGTATACATATACTCAGAAGGACGAGATTGAAAAATTGGTTAGGGAGATGTTAGAA  1911

Query  1917  GCACGGATCATCCAGCCGAGCATCAGTCCATATTCAAGTCCAGTTTTGCTCGTCCAAAAG  1976
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1912  GCACGGATCATCCAGCCGAGCATCAGTCCATATTCAAGTCCAGTTTTGCTCGTCCAAAAG  1971

Query  1977  AAGGACGGAGGATGGCCTACGGCGCGTGGATTACCGAGCCTTTTACAAGCTCACGGTACC  2036
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1972  AAGGACGGAGGATGGCCTACGGCGCGTGGATTACCGAGCCTTTTACAAGCTCACGGTACC  2031

Query  2037  AGACAGGTACCCAATTCCCGTGATCGAGGAACTGTTGGATGAGTTACAAGGAGCTTCTGT  2096
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2032  AGACAGGTACCCAATTCCCGTGATCGAGGAACTGTTGGATGAGTTACAAGGAGCTTCTGT  2091

Query  2097  ATTCTCCAAACTCGATCTCAAATCCGGGTACCACCAAATACGTGTACGAGCCACAGACGT  2156
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2092  ATTCTCCAAACTCGATCTCAAATCCGGGTACCACCAAATACGTGTACGAGCCACAGACGT  2151

Query  2157  GAAGAAAACTGCCTTTCGAACTCACGAAGGGCACTATGAGTTCCTGGTCATGCCATTTGG  2216
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2152  GAAGAAAACTGCCTTTCGAACTCACGAAGGGCACTATGAGTTCCTGGTCATGCCATTTGG  2211

Query  2217  GCTTACCAACGCACCAGCAACATTCCAATCCGTGATGAACGATATTTTCCGCAGGGAAGT  2276
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2212  GCTTACCAACGCACCAGCAACATTCCAATCCGTGATGAACGATATTTTCCGTAGGGAAGT  2271

Query  2277  TTGTGTTGGTATTTTTTGATGACATACTAGTCTATAGCAAGGGCACGGAGGAACACATGA  2336
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2272  TTGTGTTGGTATTTTTTGATGACATACTAGTCTATAGCAAGGGCACGGAGGAACACATGA  2331

Query  2337  ATCACTTGGGAATGGTGCTCCAGATTTGGGAACAACACCAGTTTTATGCAAACAGAAAGA  2396
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2332  ATCACTTGGGAATGGTGCTCCAGATTTGGGAACAACACCAGTTTTATGCAAACAGAAAGA  2391

Query  2397  AGTGTGCTTTTGGACAACCACAGATTGCATATTT-GG-----GACATATTATATCGGGCG  2450
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||
Sbjct  2392  AGTGTGCTTTTGGACAACCACAGATTGCATATTTGGGACATAGACATATTATATCGGGCG  2451

Query  2451  AAGGGGTGTCAGCTGATCCAGCTAAGTTAGAAGCAATGGTGGGTTGGCCAGAACCAAAGA  2510
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2452  AAGGGGTGTCAGCTGATCCAGCTAAGTTAGAAGCAATGGTGGGTTGGCCAGAACCAAAGA  2511

Query  2511  ACACAACAGAATTGCGAGGCTTCTTGGGCTTGACGGGGTACTACAGGAGATTCGTTAAGA  2570
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2512  ACACAACAGAATTGCGAGGCTTCTTGGGCTTGACGGGGTACTACAGGAGATTCGTTAAGA  2571

Query  2571  ATTATGGGAAAATTGTGAGACCGTTGACCGAGTTACTCAAAAAGAACAGTTTAAAATGGA  2630
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2572  ATTATGGGAAAATTGTGAGACCGTTGACCGAGTTACTCAAAAAGAACAGTTTAAAATGGA  2631

Query  2631  CAGAAATGGCAGCACTAGCTTTCAAGGCTCTCAAAGGAGCAGTGACGACGCTTCCTGTTC  2690
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2632  CAGAAATGGCAGCACTAGCTTTCAAGGCTCTCAAAGGAGCAGTGACGACGCTTCCTGTTC  2691

Query  2691  TAGCCTTGCCAGATTTGAAGCTACCTTTTGTGACCCGCGTCGGGAAATGGAATTGGAGCT  2750
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2692  TAGCCTTGCCAGATTTGAAGCTACCTTTTGTGACCCGCGTCGGGAAATGGAATTGGAGCT  2751

Query  2751  GTTTTATTACAAGGGAACAGGCCTGTTGCGTATCTCAGCCAAGGGTTTTCTGAAAAGGGG  2810
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2752  GTTTTATTACAAGGGAACAGGCCTGTTGCGTATCTCAGCCAAGGGTTTTCTGAAAAGGGG  2811

Query  2811  AGCTTGAAATCAGTGTACGAACGAGAGCTCTTAGCAATAGTCTTGGCAGTCCAACGTTGG  2870
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2812  AGCTTGAAATCAGTGTACGAACGAGAGCTCTTAGCAATAGTCTTGGCAGTCCAACGTTGG  2871

Query  2871  AGACATCAGGGCAACGTTTCACGATACGCACAGACCAGAAGAGTCTAAAGCACTTGCTGG  2930
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2872  AGACATCAGGGCAACGTTTCACGATACGCACAGACCAGAAGAGTCTAAAGCACTTGCTGG  2931

Query  2931  AACAAAGGTTTGTCACCAAGGAACAACAGAGGATGGGCTACCAAACTGTTAGGCTTGGAT  2990
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2932  AACAAAGGTTTGTCACCAAGGAACAACAGAGGATGGGCTACCAAACTGTTAGGCTTCGAT  2991

Query  2991  TTTCTCATTGAGTATAAGCCGGGAACTGAAAATAAGGCTGCTGATGCGTTGTCAAGACGA  3050
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2992  TTTCTCATTGAGTATAAGCCGGGAACTAAAAATAAGGCTGCTGATGCGTTGTCAAGACGA  3051

Query  3051  GTGCAACCTGAGCGTCTGTTGGAACTTGTATTCGCACCTCCTCCCTCTTTCGATGCAGCA  3110
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3052  GTGCAACCTGAGCGTCTGTTGGAACTTGTATTCGCACCTCCTCCCTCTTTCGATGCAGCA  3111

Query  3111  GAATTACTATCTCAAGTTGAAGCTGATCCGGAGTTAAGAACTGTGTTACAACAAGCCCGA  3170
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3112  GAATTACTATCTCAAGTTGAAGCTGATCCGGAGTTAAGAACTGTGTTACAACAAGCCCGA  3171

Query  3171  GATGGAAAGAACCTGGAATCTGGTTATACGGAAAAAAGAGGGGCTGCTATGTAAAGATGG  3230
              | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3172  TAGGGAAAGAACCTGGAATCTGGTTATACGGAAAAAAGAGGGGCTGCTATGTAAAGATGG  3231

Query  3231  AAGAGTGGCGTCTCGAATCAGCCAAGCTTTCTCCCAATTTCTTCTATATTTTCATCTCTT  3290
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3232  AAGAGTGGCGTCTCGAATCAGCCAAGCTTTCTCCCAATTTCTTCTATATTTTCATCTCTT  3291

Query  3291  TCTCTATTCTACCGAGAAGATCCATCTCGGGTCTTATCAGATGGTATCAGAGCCTTCGGT  3350
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3292  TCTCTATTCTACCGAGAAGATCCATCTCGGGTCTTATCAGATGGTATCAGAGCCTTCGGT  3351

Query  3351  CTTCTGACTGTGGGTATCCAACGACGATTTCGACAATGGGTTTGGATAGTAACGATATAG  3410
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3352  CTTCTGACTGTGGGTATCCAACGACGATTTCGACAATGGGTTTGGATAGTAACGATATAG  3411

Query  3411  CGCTGATCAGGCGGATTCTCGCTCGGGTGGAGCAGATGtttttttCCATCGCATGACGAC  3470
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3412  CGCTGATCAGGCGGATTCTCGCTCGGGTGGAGCAGATGTTTTTTTCCATCGCATGACGAC  3471

Query  3471  GATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCGTCGCTTGGGAAATT  3530
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3472  GATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCGTCGCTTGGGAAATT  3531

Query  3531  CATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCATCCGGAGCTTTTGC  3590
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3532  CATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCATCTGGAGCTTTTGC  3591

Query  3591  GACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGCAAGCGCAACTACCG  3650
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3592  GACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGCAAGCGCAACTACCG  3651

Query  3651  CAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCGTCCAAGGTTAGATC  3710
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3652  CAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCGTCCAAGGTTAGATC  3711

Query  3711  TAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTCCGATCTCCTACTTT  3770
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3712  TAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTCCGATCTCCTACTTT  3771

Query  3771  GCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTTGGTTACGATAGTAT  3830
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3772  GCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTTGGTTACGATAGTAT  3831

Query  3831  GTCGCTGAAGAGCACTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCTGGACGAGCTAACCA  3890
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3832  GTCGCTGAAGAGCGCTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCTGGACGAGCTAACCA  3891

Query  3891  TGTGTGGGAGCCGGGTGGATTATCGCCTGAACAAGCTCAGTGGGACTGGGTAGGGAAGGT  3950
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3892  TGTGTGGGAGCCGGGTGGATTATCGCCTGAACAAGCTCAGTGGGACTGGGTAGGGAAGGT  3951

Query  3951  TTACAGTCGTGATAGAGTTCTGAAGCTAATGGGAGAGCTTCATGAATTGGGTTTACAGGG  4010
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3952  TTACAGTCGTGATAGAGTTCTGAAGCTAATGGGAGAGCTTCATGAATTGGGTTTACAGGG  4011

Query  4011  AATCAGGAAGACGGTAAGGATCTTAGATTGTCAAGGATCTTCCTCATAAACACGTTTCCG  4070
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4012  AATCAGGAAGACGGTAAGGATCTTAGATTGTCAAGGATCTTCCTCATAAACACGTTTCCG  4071

Query  4071  CTTGCAGCTGAAACAAGCGGAGAAGATGGGACCAACGGGATCAGCCACCAGGAAGTTAAT  4130
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct  4072  CTTGCAGCTGAAACAAGCGGAGAAGATGGGACCAACGAGATCAGCCACGAGGAAGTTAAT  4131

Query  4131  AAGATCTGATTTTTGGCATCCTTTGATCCTGGAGGAACTTGTGCTGAAAAGTGAGTTCGT  4190
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4132  AAGATCTGATTTTTGGCATCCTTTGATCCTGGAAGAACTTGTGCTGAAAAGTGAGTTCGT  4191

Query  4191  CAAAGAGCTCTGGCGAGGCATTAGAGCTGTGAAGGGAAAGAAGGTTAAGAAGAGGAAGAA  4250
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4192  CAAAGAGCTCTGGCGAGGCATTAGAGCTGTGAAGGGAAAGAAGGTTAAGAAGAGGAAGAA  4251

Query  4251  ACGGGAACCTAGCCTGCCAGCTTTGGAACCCCAGAATTTTCCCTGTGTTGGGGGGTTGGA  4310
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4252  ACGGGAACCTAGCCTGCCAGCTTTGGAACCCCAGAATTTTCCCTGTGTTGGGGGGTTGGA  4311

Query  4311  GGTATGATTAGTAGGCTTAATTATAAAGTTCTCGTTCAACCAGAACTAGATAAAGCTACA  4370
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4312  GGTATGATTAGTAGGCTTAATTATAAAGTTCTCGTTCAACCAGAACTAGATAAAGCTACA  4371

Query  4371  AGGGCAGTCTCTAGAATTACTTACGGATTGGTTGCTGTTGGTAAAGCTGATGGGTATAAT  4430
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4372  AGGGCAGTCTCTAGAATTACTTACGGATTGGTTGTTGTTGGTAAAGCTGATGGGTATAGT  4431

Query  4431  TTTGAGGTTGTGGATTGTGATCAAGTTAACTCCACTGACGAAGATAAGCTTGTGAGTTTC  4490
             |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4432  TTTGAGGTTGTGGATTG--ATCAAGTTAACTCCACTGACGAAGATAAGCTTGTGAGTTTC  4489

Query  4491  ATTGGATCTGGTGGGTGTCAAACACACTTTAAGAAGCAGCTAGTAGCAAGGGAGTTAGCA  4550
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  4490  ATTGGATCTGGTGGGTGTCAAACACACTTTAAGAAGCAGCTAGTAGCAAGGAAGTTAGCA  4549

Query  4551  TTGTTTAATCCCGAAAAAT-CATGAACCTAAGACTACCTCATGACAAGGGAATTCTAGTC  4609
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4550  TTGTTTAATCCCGAAAAATTCATGAACCTAAGACTACCTCATGACAAGGGAATTCTAGTC  4609

Query  4610  TTTGCTGGTCATAGAATTGCTCAAACCACATTGTGAGATTGATGCCATTTTGATAGAAAT  4669
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4610  TTTGCTGGTCATAGAATTGCTCAAACCACATTGTGAGATTGATGCCATTTTGATAGAAAT  4669

Query  4670  CGTCGGTATATAAAGAGAAAGTTTGCGATGTAAGATGTGCTCTTACGAAGGAAAATAGGA  4729
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4670  CGTCGGTATATAAAGAGAAAGTTTGCGATGTAAGATGTGCTCTTACGAAGGAAAATAGGA  4729

Query  4730  TTGCTAACTTTTGCATCTATATAAAATGAAAAGCAAGTTTTTGTATCAGGAAAGAGGCAA  4789
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4730  TTGCTAACTTTTCCATCTATATAAAATGAAAAGCAAGTTTTTGTATCAGGAAAGAGGCAA  4789

Query  4790  GGACAGATCCGCCGAAGAAGGATCGGGGTTAGAACTAGTCTGAAGCTTAAGGCTTTTGCT  4849
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4790  GGACAGATCCGCCGAAGAAGGATCGGGGTTAGAACTAGTCTGAAGCTTAAGGCTTTTGCT  4849

Query  4850  ATTCAAGAAGGCTCTCCCTGCTGGCTCCATGTATGCTAT  4888
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4850  ATTCAAGAAGGCTCTCCCTGCTGGCTCCATGTATGCTAT  4888


> ATMG00880.1 | Symbols: ORF187 | hypothetical protein | chrM:237053-237616 
FORWARD LENGTH=564
Length=564

 Score = 1026 bits (555),  Expect = 0.0
 Identities = 562/565 (99%), Gaps = 1/565 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3463  ATGACGACGATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCGTCGCTT  3522
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGACGACGATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCGTCGCTT  60

Query  3523  GGGAAATTCATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCATCCGGA  3582
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  61    GGGAAATTCATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCATCTGGA  120

Query  3583  GCTTTTGCGACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGCAAGCGC  3642
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GCTTTTGCGACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGCAAGCGC  180

Query  3643  AACTACCGCAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCGTCCAAG  3702
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   AACTACCGCAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCGTCCAAG  240

Query  3703  GTTAGATCTAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTCCGATCT  3762
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   GTTAGATCTAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTCCGATCT  300

Query  3763  CCTACTTTGCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTTGGTTAC  3822
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   CCTACTTTGCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTTGGTTAC  360

Query  3823  GATAGTATGTCGCTGAAGAGCACTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCTGGACGA  3882
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GATAGTATGTCGCTGAAGAGCGCTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCTGGACGA  420

Query  3883  GCTAACCATGTGTGGGAGCCGGGTGGATTATCGCCTGAACAAGCTCAGTGGGACTGGGTA  3942
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   GCTAACCATGTGTGGGAGCCGGGTGGATTATCGCCTGAACAAGCTCAGTGGGACTGGGTA  480

Query  3943  GGGAAGGTTTACAGTCGTGATAGAGTTCTGAAGCTAATGGGAGAGCTTCATGAATTGGGT  4002
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  481   GGGAAGGTTTACAGTCGTGATAGAGTTCTGAAGCTAATGGGAGAGCTTCATGAATTGG-T  539

Query  4003  TTACAGGGAATCAGGAAGACGGTAA  4027
             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   TTACAGGGAATCAGGAAGACGGTAA  564


> ATMG00870.1 | Symbols: ORF184 | hypothetical protein | chrM:236927-237481 
REVERSE LENGTH=555
Length=555

 Score = 1014 bits (549),  Expect = 0.0
 Identities = 553/555 (99%), Gaps = 0/555 (0%)
 Strand=Plus/Minus

Query  3337  TCAGAGCCTTCGGTCTTCTGACTGTGGGTATCCAACGACGATTTCGACAATGGGTTTGGA  3396
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555   TCAGAGCCTTCGGTCTTCTGACTGTGGGTATCCAACGACGATTTCGACAATGGGTTTGGA  496

Query  3397  TAGTAACGATATAGCGCTGATCAGGCGGATTCTCGCTCGGGTGGAGCAGATGtttttttC  3456
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495   TAGTAACGATATAGCGCTGATCAGGCGGATTCTCGCTCGGGTGGAGCAGATGTTTTTTTC  436

Query  3457  CATCGCATGACGACGATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCG  3516
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435   CATCGCATGACGACGATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCG  376

Query  3517  TCGCTTGGGAAATTCATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCA  3576
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375   TCGCTTGGGAAATTCATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCA  316

Query  3577  TCCGGAGCTTTTGCGACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGC  3636
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  315   TCTGGAGCTTTTGCGACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGC  256

Query  3637  AAGCGCAACTACCGCAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCG  3696
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255   AAGCGCAACTACCGCAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCG  196

Query  3697  TCCAAGGTTAGATCTAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTC  3756
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195   TCCAAGGTTAGATCTAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTC  136

Query  3757  CGATCTCCTACTTTGCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTT  3816
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  135   CGATCTCCTACTTTGCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTT  76

Query  3817  GGTTACGATAGTATGTCGCTGAAGAGCACTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCT  3876
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75    GGTTACGATAGTATGTCGCTGAAGAGCGCTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCT  16

Query  3877  GGACGAGCTAACCAT  3891
             |||||||||||||||
Sbjct  15    GGACGAGCTAACCAT  1


> ATMG00860.1 | Symbols: ORF158 | DNA/RNA polymerases superfamily 
protein | chrM:235916-236392 FORWARD LENGTH=477
Length=477

 Score =  843 bits (456),  Expect = 0.0
 Identities = 471/477 (99%), Gaps = 6/477 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2333  ATGAATCACTTGGGAATGGTGCTCCAGATTTGGGAACAACACCAGTTTTATGCAAACAGA  2392
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGAATCACTTGGGAATGGTGCTCCAGATTTGGGAACAACACCAGTTTTATGCAAACAGA  60

Query  2393  AAGAAGTGTGCTTTTGGACAACCACAGATTGCATATTT-GG-----GACATATTATATCG  2446
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||
Sbjct  61    AAGAAGTGTGCTTTTGGACAACCACAGATTGCATATTTGGGACATAGACATATTATATCG  120

Query  2447  GGCGAAGGGGTGTCAGCTGATCCAGCTAAGTTAGAAGCAATGGTGGGTTGGCCAGAACCA  2506
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GGCGAAGGGGTGTCAGCTGATCCAGCTAAGTTAGAAGCAATGGTGGGTTGGCCAGAACCA  180

Query  2507  AAGAACACAACAGAATTGCGAGGCTTCTTGGGCTTGACGGGGTACTACAGGAGATTCGTT  2566
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   AAGAACACAACAGAATTGCGAGGCTTCTTGGGCTTGACGGGGTACTACAGGAGATTCGTT  240

Query  2567  AAGAATTATGGGAAAATTGTGAGACCGTTGACCGAGTTACTCAAAAAGAACAGTTTAAAA  2626
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   AAGAATTATGGGAAAATTGTGAGACCGTTGACCGAGTTACTCAAAAAGAACAGTTTAAAA  300

Query  2627  TGGACAGAAATGGCAGCACTAGCTTTCAAGGCTCTCAAAGGAGCAGTGACGACGCTTCCT  2686
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TGGACAGAAATGGCAGCACTAGCTTTCAAGGCTCTCAAAGGAGCAGTGACGACGCTTCCT  360

Query  2687  GTTCTAGCCTTGCCAGATTTGAAGCTACCTTTTGTGACCCGCGTCGGGAAATGGAATTGG  2746
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   GTTCTAGCCTTGCCAGATTTGAAGCTACCTTTTGTGACCCGCGTCGGGAAATGGAATTGG  420

Query  2747  AGCTGTTTTATTACAAGGGAACAGGCCTGTTGCGTATCTCAGCCAAGGGTTTTCTGA  2803
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   AGCTGTTTTATTACAAGGGAACAGGCCTGTTGCGTATCTCAGCCAAGGGTTTTCTGA  477


> ATMG00840.1 | Symbols: ORF121B | hypothetical protein | chrM:234538-234903 
REVERSE LENGTH=366
Length=366

 Score =  658 bits (356),  Expect = 0.0
 Identities = 363/366 (99%), Gaps = 2/366 (1%)
 Strand=Plus/Minus

Query  953   TCACCGGGCCCGCCCGATCCCCAGAACGTAAAATGGAACCATACCGGAAACCGTTTGATC  1012
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366   TCACCGGGCCCGCCCGATCCCCAGAACGTAAAATGGAACCATACCGGAAACCGTTTGATC  307

Query  1013  AGGATAGAAAGAGCAAGGGGCTTTGTTTTCGTTGTGGTGACAAGTGGAATCCTGGTCACA  1072
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  306   AGGATAGAAAGAGCAAGGGGCTTTGTTTTCGTTGTGGTGACAAGTGGAATCCTGGTCACA  247

Query  1073  GATGTAAGGGCAGAGAATTCAAGTATATGGCTGTGGATGAAGGAGATGAGTTGGATGAGG  1132
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  246   GATGTAAGGGCAGAGAATTAAAGTATATGGCTGTGGATGAAGGAGATGAGTTGGATGAGG  187

Query  1133  CTGATGAAGCTGAAACAGGGAAAAAGATAGAAGAATCAGATGAGGATGAAGTAAAGGAAT  1192
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  186   CTGATGAAGCTGAAACAGGGAAAAAGATAGAAGAATCAGATGAGGATGAAGTAAAGGAAT  127

Query  1193  TACTCTGGTTGTCTTTGCGGTCGATGGCAGGTTTAACAACTGAGAGA--TCCATGAGGAT  1250
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
Sbjct  126   TACTCTGGTTGTCTTTGCGGTCGATGGCAGGTTTAACAACTGAGAGAGATCCATGAGGAT  67

Query  1251  GAGAGGACAAATTGCAGGACAAGAAGTCATTGTTTTAATTGATTCAGGGGCTACAAGCAA  1310
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  66    GAGAGGACAAATTGCAGGACAAGAAGTCATTGTTTTAATTGATTCAGGGGCTACAAGCAA  7

Query  1311  TTTCAT  1316
             ||||||
Sbjct  6     TTTCAT  1


> ATMG00850.1 | Symbols: ORF107E | DNA/RNA polymerases superfamily 
protein | chrM:235338-235661 FORWARD LENGTH=324
Length=324

 Score =  586 bits (317),  Expect = 7e-166
 Identities = 322/324 (99%), Gaps = 1/324 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1756  ATGAAAACGTGTTTGAGATGCCGCAAGGATTACCCCCAAAACGTGGCAGGGAACATGCTA  1815
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGAAAACGTGTTTGAGATGCCGCAAGGATTACCCCCAAAATGTGGCAGGGAACATGCTA  60

Query  1816  TCAACCTTAAGGAAGGAGCAGAACCAGTTAACATCCGTCCTTACCGGTATACATATACTC  1875
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TCAACCTTAAGGAAGGAGCAGAACCAGTTAACATCCGTCCTTACCGGTATACATATACTC  120

Query  1876  AGAAGGACGAGATTGAAAAATTGGTTAGGG-AGATGTTAGAAGCACGGATCATCCAGCCG  1934
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   AGAAGGACGAGATTGAAAAATTGGTTAGGGGAGATGTTAGAAGCACGGATCATCCAGCCG  180

Query  1935  AGCATCAGTCCATATTCAAGTCCAGTTTTGCTCGTCCAAAAGAAGGACGGAGGATGGCCT  1994
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   AGCATCAGTCCATATTCAAGTCCAGTTTTGCTCGTCCAAAAGAAGGACGGAGGATGGCCT  240

Query  1995  ACGGCGCGTGGATTACCGAGCCTTTTACAAGCTCACGGTACCAGACAGGTACCCAATTCC  2054
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   ACGGCGCGTGGATTACCGAGCCTTTTACAAGCTCACGGTACCAGACAGGTACCCAATTCC  300

Query  2055  CGTGATCGAGGAACTGTTGGATGA  2078
             ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   CGTGATCGAGGAACTGTTGGATGA  324



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 243861509923


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5