BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg480549
Length=3873
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G16640.1 | Symbols: ATTOC132, TOC132 | multimeric translocon... 4750 0.0
AT3G16620.1 | Symbols: ATTOC120, TOC120 | translocon outer comp... 3193 0.0
> AT2G16640.1 | Symbols: ATTOC132, TOC132 | multimeric translocon
complex in the outer envelope membrane 132 | chr2:7211112-7215553
REVERSE LENGTH=3975
Length=3975
Score = 4750 bits (2572), Expect = 0.0
Identities = 2987/3177 (94%), Gaps = 70/3177 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 719 GACAGAACAAGATGTTG-AGGATGGTGAAGGAACAACTAAAAATCTGTTTGAGGAAA-GG 776
||||||| |||| |||| | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |
Sbjct 847 GACAGAAGAAGAGGTTGTA-GAAGGTGAAGGAACAAGTAAGAATCTATTTGA-GAAACAG 904
Query 777 ACAGAAGAAGAAGTTGT-GAATGGTGCAGGAACAGGTAAGAATCTATTTGAGAATGGTTC 835
|||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 905 ACAGAACAAGATGTTGTGGAA-GGTGAAGGAACAAGTAAGGATCTATTTGAGAA------ 957
Query 836 TGGTTCAGTATGTATAGACAATGAGTCCGAGGCAAAAACAAACGGTGAGACTGGTGCCGC 895
||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 958 TGGTTCAGTATGTATGGACAGTGAGTCCGAGGCAGAAAGAAATGGTGAGACTGGTGCCGC 1017
Query 896 CTACACAAGTGATATTGAAACTAATGCTTCAGGTGACAAATCTGTGAATGATAGTACTGA 955
|||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||| | || | | |
Sbjct 1018 CTACACAAGTAATATCGTTACTAATGCTTCAGGTGAC-AA----TGAA-G-TA-T-C--A 1066
Query 956 AGTAGCAAGTGCTGAGACTTCATCTCCATTGGATAAATCTAGTTCCGGGGAAAAGGGAGA 1015
||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067 AGT-GC---TG-T--GACTTCATCTCCATTGGAGGAATCTAGTTCCGGGGAAAAGGGAGA 1119
Query 1016 GACTGAAGGGGACAGTACTTGTTTAAAACCAGAGCAACAATTGGCTTCTTCGCTGAACTC 1075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||
Sbjct 1120 GACTGAAGGGGACAGTACTTGTTTAAAACCAGAGCAACACTTGGCTTCTTCGCCGCACTC 1179
Query 1076 AAATCCTGAGTCTACTGAAATTCGA-AGCAATAGTGGCTCCCCTGGGGTAACTTCTAGAG 1134
| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1180 ATATCCTGAGTCAACTGAAGTTC-ACAGCAATAGTGGCTCCCCTGGGGTAACTAGTAGAG 1238
Query 1135 AAAACGAGA-CAGTTAGAAA-TTCTAATGGAGGACATGATGTCCAACAGAGGCCTCAACC 1192
|| || | | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1239 AACAC-AAACCAGTT-CAAAGTGCTAATGGAGGACATGATGT---TCAGAGTCCTCAACC 1293
Query 1193 TAATAAGGAACTTGAGAAGCAGCAAAGCAGCAGAGTAAATGTAGATCCAGAGATTA-AGG 1251
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
Sbjct 1294 AAATAAGGAGCTTGAGAAGCAGCAAAGCAGCAGAGTACATGTAGATCCAGAGATTACA-G 1352
Query 1252 AAAATTCACATGTGGAAACAGAAGCTGAGGTAGTAAGTTCTGTTTCACCAACAGAGTCTA 1311
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353 AAAATTCACATGTGGAAACAGAACCTGAGGTAGTAAGTTCTGTTTCACCAACAGAGTCTA 1412
Query 1312 GAAGTAATCCTGCAGCATTACCACCTGCTCGTCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTTCTCCTC 1371
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413 GAAGTAATCCTGCGGCATTACCACCTGCTCGTCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTTCTCCTC 1472
Query 1372 TTTTGGAACCTGCATCACGTGCTCCTCAACAGTCTCATGTCAATGGGAATGGGTCTCACA 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 TTTTGGAACCTGCATCACGTGCTCCTCAACAGTCTCGCGTCAATGGGAATGGGTCTCACA 1532
Query 1432 ATCAGTCTCAGCAAGCTGAGGACTCTACCACTGTAGAGACTGATGAGCATGATGAGACTC 1491
|||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 1533 ATCAGTTTCAGCAAGCTGAAGACTCTACCACTACAGAGGCTGATGAGCATGATGAGACCC 1592
Query 1492 GTGAGAAGCTCCAGTTGATCAGGGTAAAATTTTTGAGGCTTGCACATAGACTAGGGCAAA 1551
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 GCGAGAAGCTCCAGTTGATCAGGGTAAAATTTTTGAGGCTTGCACATAGACTAGGGCAAA 1652
Query 1552 CCCCGCATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTATACAGGCTTGGATTGGCTGAGCAGTTGA 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1653 CCCCGCATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTATACAGGCTTGGATTGGCTGAGCAGTTGA 1712
Query 1612 GGGGCAGAAATGGAAGCCGTGTTGGTGCTTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGCCATGGCAG 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1713 GGGGCAGAAATGGAAGCCGTGTTGGTGCTTTTAGTTTTGATCGCGCTAGTGCCATGGCAG 1772
Query 1672 AACAGCTTGAGGCTGCTGGACAGGATCCACTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTTCTTG 1731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1773 AACAGCTTGAGGCTGCTGGACAGGATCCACTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTTCTCG 1832
Query 1732 GTAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACGATCAATTCTATATTTGATGAAGTGAAATCTT 1791
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1833 GAAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACGATCAATTCTATATTTGATGAAGTGAAATTTT 1892
Query 1792 GTACTGATGCATTCCAGATGGGTACAAAGAGGGTTCAAGATGTTGAGGGTTTGGTTCAGG 1851
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 GTACTGATGCATTCCAGATGGGGACAAAGAGGGTTCAAGATGTTGAGGGTTTGGTTCAGG 1952
Query 1852 GAATTAAGGTACGGGTGATTGACACTCCCGGTCTCTTACCTTCCTGGTCTGATCAAGCCA 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1953 GAATTAAGGTACGGGTGATTGACACTCCCGGTCTCTTACCTTCCTGGTCTGATCAAGCCA 2012
Query 1912 AGAATGAGAAGATCCTGAATTCTGTTAAGGCTTTCATCAAGAAGAATCCACCTGACATTG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013 AGAATGAGAAGATCCTGAATTCTGTTAAGGCTTTCATCAAGAAGAATCCACCTGACATTG 2072
Query 1972 TACTATATCTTGATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCCTGC 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TACTATATCTTGATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCCTGC 2132
Query 2032 GCACCATAAGTGATGTTTTTGGTCCATCGATTTGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTC 2091
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2133 GCACCATAAGTGATGTTTTTGGTCCTTCGATATGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTC 2192
Query 2092 ATGCCGCTTCTGTTCCACCAGATGGCCCAAATGGCACTGCTTCTAGCTATGACATGTTTG 2151
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2193 ATGCCGCTTCTGTTCCACCAGATGGCCCAAATGGCACTGCTTCTAGCTATGATATGTTTG 2252
Query 2152 TAACACAACGCTCTCACGTCATCCAGCAGGCTATTCGCCAAGCAGCTGGAGATATGAGGC 2211
| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TTACACAACGTTCTCATGTCATCCAGCAGGCCATTCGCCAAGCAGCTGGAGATATGAGGC 2312
Query 2212 TCATGAACCCTGTTTCTTTAGTTGAGAATCACTCAGCTTGCAGGACTAATCGGGCAGGCC 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2313 TCATGAACCCTGTTTCTTTAGTTGAGAATCACTCAGCTTGCAGGACTAATCGGGCAGGCC 2372
Query 2272 AGAGAGTATTACCAAATGGCCAAGTGTGGAAGCCACATTTGTTGTTACTCTCATTTGCAT 2331
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2373 AGAGAGTATTACCGAATGGCCAAGTGTGGAAGCCACATTTGTTGCTACTCTCATTTGCAT 2432
Query 2332 CTAAGATTCTAGCAGAAGCAAATGCTCTTTTGAAGTTACAAGATAATATTCCAGGGAGAC 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433 CTAAGATTCTAGCAGAAGCAAATGCTCTTTTGAAGTTGCAAGATAATATTCCAGGGAGAC 2492
Query 2392 CATTTGCAGCTCGTTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTTCTCCTATCATCGCTTCTGCAAT 2451
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2493 CATTTGCAGCTCGGTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTTCTCCTTTCATCGCTTCTGCAAT 2552
Query 2452 CAAGACCACAACCTAAGCTTCCTGAACAACAGTATGGTGATGAAGAAGATGAAGATGATT 2511
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2553 CAAGACCACAACCTAAGCTTCCTGAACAGCAGTATGGTGATGAAGAAGATGAAGATGATT 2612
Query 2512 TGGACGAATCATCAGATTCAGACGAAGAATCAGAGTATGATCAGCTTCCTCCCTTTAAGA 2571
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2613 TAGAAGAATCATCAGATTCAGACGAAGAATCAGAGTATGATCAGCTTCCTCCGTTTAAGA 2672
Query 2572 GTTTGACTAAAGCTCAAATGGCTACACTTAGTAAATCTCAGAAGAAGCAGTATCTCGATG 2631
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2673 GTTTGACTAAAGCTCAGATGGCTACGCTTAGTAAATCTCAGAAGAAGCAGTATCTCGATG 2732
Query 2632 AAATGGAGTACCGGGAGAAACTATTAATGAAGAAGCAAATGAAAGAGGAAAGAAAGCGAC 2691
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2733 AAATGGAGTACCGAGAGAAACTTTTAATGAAGAAGCAAATGAAAGAGGAAAGAAAGAGAC 2792
Query 2692 GTAAGATGTTTAAGAAATTTGCTGCAGAGATTAAAGATTTGCCTGATGGGTTTAGTGAAA 2751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2793 GTAAGATGTTTAAGAAATTTGCTGCAGAGATTAAAGATTTGCCTGATGGGTATAGTGAAA 2852
Query 2752 ATGTGGAAGAGGAGAGTGGTGGACCTGCATCAGTTCCAGTTCCCATGCCAGATTTATCTC 2811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2853 ATGTGGAAGAGGAGAGTGGTGGACCTGCATCAGTTCCAGTTCCTATGCCAGATTTATCTC 2912
Query 2812 TACCTGCGTCTTTTGACTCTGATAACCCTACTCACCGCTACCGCTACCTTGATTCCTCCA 2871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2913 TACCTGCGTCTTTTGACTCTGATAACCCTACTCACCGCTACCGGTACCTTGATTCCTCCA 2972
Query 2872 ATCAGTGGCTTGTTAGGCCCGTTCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATG 2931
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2973 ATCAGTGGCTTGTTAGGCCAGTCCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATG 3032
Query 2932 AAGGTGTGAATGCAGAACGGCTCTTTGTTGTAAAAGACAAAATACCAATATCTGTCTCAG 2991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3033 AAGGTGTGAATGCAGAACGGCTCTTTGTTGTAAAAGAAAAAATACCAATATCTGTCTCAG 3092
Query 2992 GTCAAGTGACAAAGGACAAGAAGGATGCAAATGTGCAGCTGGAAATGGCCAGCTCGGTTA 3051
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3093 GTCAAGTGACAAAAGACAAGAAGGATGCAAATGTGCAGCTAGAAATGGCCAGCTCGGTTA 3152
Query 3052 AACATGGAGAGGGTAAATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAACTGTTGGAAAGGAAT 3111
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3153 AACATGGAGAGGGTAAATCAACTTCCCTAGGTTTCGACATGCAAACTGTTGGAAAGGAAT 3212
Query 3112 TGGCTTATACTCTTCGAAGCGAAACGAGATTTAACAACTTCAGGAGAAACAAAGCTGCAG 3171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3213 TGGCTTATACTCTTCGAAGCGAAACGAGATTTAACAATTTCAGGAGAAACAAGGCTGCAG 3272
Query 3172 CTGGTCTTTCTGTAACACTCTTGGGTGATTCAGTTTCTGCGGGGCTGAAAGTTGAAGATA 3231
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 3273 CTGGTCTTTCTGTAACACACTTGGGTGATTCGGTTTCTGCGGGGTTGAAAGTCGAAGATA 3332
Query 3232 AGTTGATTGCTAGTAAATGGTTCAGAATGGTAATGTCTGGTGGAGCTATGACTAGTCGGG 3291
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3333 AGTTTATTGCTAGTAAATGGTTCAGAATCGTAATGTCTGGTGGAGCTATGACTAGTCGGG 3392
Query 3292 GAGATTTTGCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTGAGAGATAAAGATTATCCGCTTG 3351
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3393 GAGATTTTGCTTATGGTGGTACTTTGGAAGCTCAGTTGAGAGATAAAGATTATCCGCTTG 3452
Query 3352 GCCGGTTTTTGACTACTCTTGGACTTTCTGTAATGGATTGGCACGGTGATCTTGCTATCG 3411
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3453 GTCGGTTTTTGACTACTCTTGGACTTTCTGTAATGGATTGGCACGGTGATCTTGCTATTG 3512
Query 3412 GAGGGAACATACAGTCTCAGGTTCCCATTGGACGTTCCTCTAATTTAATTGCTCGTGCTA 3471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3513 GAGGGAACATACAGTCTCAGGTTCCCATTGGACGTTCCTCTAATTTAATTGCTCGTGCTA 3572
Query 3472 ATCTGAATAATAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGTGTCCGTGTAAACAGCTCCGAGCAGCTCC 3531
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3573 ATCTGAACAATAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGTGTTCGTGTTAACAGCTCCGAGCAGCTCC 3632
Query 3532 AACTTGCTATGGTGGCAATTGTTCCTCTCTTCAAGAAGCTACTTAGTTATTGTTACCCGC 3591
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3633 AACTTGCTATGGTTGCGATTGTTCCTCTCTTCAAGAAGCTACTTAGTTATTATTACCCGC 3692
Query 3592 AAACGCAATATGGACAATGATGAAGAAACATTTAGGCTGATTTCACTTCCATCCCTTTGC 3651
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3693 AAACGCAATATGGACAATGATTAAGAAACATTTAGGCTGATTTCACTTCCATCCCTTTGC 3752
Query 3652 AATGGAGTATTAGGAAAT-GATTAGTCAAAAGAACACGTTAGAGTGAGTTTATAAGGTAC 3710
| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |
Sbjct 3753 ACTGGAGTATTAGGAA-TCGATTAGTCACAAGAACATGTTAGAGTGAGTT-----G--A- 3803
Query 3711 AAAAGGAGCTGTCTGCTAGTAAAAGACCAATTGATGGACCAAAGCCTGTGTTTTGAAATA 3770
||| ||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 3804 AAA-GGATCTGTCTGGTAGCAAGAGACCAATTGTTGGAGGAAAGTTTGTGTCTTGAAATA 3862
Query 3771 GCCAGAAACATAACAGGACGTTCCTTGTCTGATATATAATA--T---T--TT-------C 3816
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |
Sbjct 3863 GCCAGAA-CATAACA---CGTTCCTTGTCTGATATATAATAGCTCAGTGGTTTGTTTTTC 3918
Query 3817 TTCTATTTCTAAGACCTTGTGATCTCTCTTATGAATGAAGCATATCTATTTTTGTTC 3873
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3919 TTCTATTTCTAAGACCTTGTGATCTCCCTTATGAATGAAGCATATCTACTTTTGTTC 3975
Score = 854 bits (462), Expect = 0.0
Identities = 668/763 (88%), Gaps = 31/763 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 84 GATAGAATTAGCGATGAGCAAGTAGCGAAGAATGAGTTGTTGGGATCTGTTGAAGTAAAG 143
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| |
Sbjct 152 GATAGAATTAGTGATGAGCAAGTAGTGAAGAATGAGTTGGTGAGATCTGATGAAGTAAGG 211
Query 144 GATGAGAAAGAAGATGAGGTTTTTGAGGAAGCGATTGGTTCAGAGAATGATGAGC----- 198
||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 GATGATAACGAGGACGAGGTTTTTGAGGAAGCGATTGGTTCAGAGAATGATGAGCAGGAG 271
Query 199 -AGGAGGAGGATCCAAAACGTGAATTGTTGGAGCCCGATGAATTACCTTTAGAGGAAACT 257
|||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||| |||||||
Sbjct 272 GAGGAGGAGGATCCAAAACGTGAATTGTTTGAATCTGATGATTTGCCTTTAGTGGAAACT 331
Query 258 CGTCAAAGTTCTATGGTTGAGAATGAAGTGGATGATTTTGAAGAGGCAGTGGGTGATTTG 317
| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 CTTAAAAGTTCTATGGTTGAGCATGAAGTGGAGGATTTTGAAGAGGCAGTGGGTGATTTG 391
Query 318 GATGAAACAAGTAGTAATGAAGGGGGTGTTAAAGATTTGAATGTTGATTATTCGGTTGTT 377
|||||||| ||||| ||||||||||||||| || | | | || ||| ||| ||||
Sbjct 392 GATGAAACGAGTAGCAATGAAGGGGGTGTT-AA-A---G-A--TT--TTA--CGGCTGTT 439
Query 378 GGAGAGAGCCATGGTGCGGGAGAGGCTGGATTTGATGCTGTGACTCCGAAAATGAATGGT 437
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || | ||||||||||||
Sbjct 440 GGAGAGAGCCATGGTGCGGGAGAGGCTGAATTTGATGTTTTGGCTACTAAAATGAATGGT 499
Query 438 GATACGGGGGAAGGTGGTGCAGGTGATTCTTGTGGTAAAGTTGAATCGAGGTTGGATGTT 497
|||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 500 GATAAGGGGGAAGGAGGTGGAGGTGGTTCTTATGATAAAGTTGAATCGAGCTTGGATGTT 559
Query 498 GTTGAGAACACTGAGAA-G--------GGTGATACTAATGGTTCGAATTTAGCGGCTGAG 548
||||| | ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 560 GTTGATACCACTGAGAATGCTACATCAACTAATACTAATGGTTCCAATTTAGCAGCTGAG 619
Query 549 GATGTGAGTATTGAAAACGGAAAGACTCATTCTTTTTTGGGAAATGGAATCGTCTCTCCT 608
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 620 CATGTGGGTATTGAAAACGGAAAGACTCATTCTTTTTTGGGAAATGGAATCGCCTCTCCT 679
Query 609 AAGAATATAGAAGTGGTGGCTGAAGTTATTTCAAAAGATGATGGGATTGAGGAACCATGG 668
|| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 AAAAATAAAGAAGTGGTGGCTGAAGTTATCCCTAAAGATGATGGGATTGAGGAACCATGG 739
Query 669 AATGATGGCGTTGAAGTTGAAAATTGGGAGGAAAGAGTTGATGGCGTACAGACAGAACAA 728
||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 740 AATGATGGCATTGAAGTCGATAATTGGGAGGAAAGAGTTGATGGCATACAGACAGAACAA 799
Query 729 GATGTTGAGGATGGTGAAGGAACAACTAAAAATCTGTTTGAGGAAA-GGACAGAAGAAGA 787
|| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 800 GAGGTTGAGGAAGGTGAAGGAACAACTGAAAATCAATTTGAG-AAACGGACAGAAGAAGA 858
Query 788 AGTTGT-GAATGGTGCAGGAACAGGTAAGAATCTATTTGAGAA 829
||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 859 GGTTGTAGAA-GGTGAAGGAACAAGTAAGAATCTATTTGAGAA 900
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-14
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGATCTTCACACTTTTTCACCTTCTCTCTATTTCTCTCTATCTCT 47
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4 AAGGATCTTCACACTTTTTCACCTTCTCTCTATTTCTCTCTCTCTCT 50
> AT3G16620.1 | Symbols: ATTOC120, TOC120 | translocon outer complex
protein 120 | chr3:5658317-5661963 REVERSE LENGTH=3473
Length=3473
Score = 3193 bits (1729), Expect = 0.0
Identities = 2214/2451 (90%), Gaps = 22/2451 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1187 TCAACCTAATAAGGAACTTG-AGAAGCAGCAAAG-CAGCAGAGTAAATGTAGATCCAGAG 1244
|||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||
Sbjct 894 TCAATCTAATAAGGAAATTGTA-AAGCAGC-AAGATAGCAGTGTAAATATAGGTCCAGAG 951
Query 1245 ATTAAGGAAAATTC-ACATGTGGAAACAGAAGCTGAGGTAGTAAGTTCTGTTTCACCAAC 1303
||||||| ||| | |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 952 ATTAAGG-AAAGCCAACATATGGAAAGAGAATCTGAGGTATTAAGTTCTGTTTCACCAAC 1010
Query 1304 AGAGTCTAGAAGTAATCCTGCAGCATTACCACCTGCTCGTCCAGCAGGTCTTGGTCGTGC 1363
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 AGAGTCTAGAAGTGATACTGCAGCATTACCACCTGCTCGCCCAGCAGGTCTTGGTCGTGC 1070
Query 1364 TTCTCCTCTTTTGGAACCTGCATCACGTGCTCCTCAACAGTCTCATGTCAATGGGAATGG 1423
| |||| ||||||||||||||| |||| | | | |||||| ||| ||||||||| ||||
Sbjct 1071 TGCTCCACTTTTGGAACCTGCACCACGCGTTACACAACAGCCTCGTGTCAATGGAAATGT 1130
Query 1424 GTCTCACAATCAGTCTCAGCAAGCTGAGGACTCTACCACTGTAGAGACTGATGAGCATGA 1483
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1131 GTCTCACAATCAGCCTCAGCAAGCTGAAGACTCTACCACTGCAGAGACAGATGAGCATGA 1190
Query 1484 TGAGACTCGTGAGAAGCTCCAGTTGATCAGGGTAAAATTTTTGAGGCTTGCACATAGACT 1543
|||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1191 TGAGACCCGTGAGAAGCTCCAGTTTATCAGGGTCAAATTTTTGAGGCTTTCACATAGATT 1250
Query 1544 AGGGCAAACCCCGCATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTATACAGGCTTGGATTGGCTGA 1603
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 AGGGCAAACTCCACATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTGTACAGGCTTGGATTGGCTGA 1310
Query 1604 GCAGTTGAGGGGCAGAAATGGAAGCCGTGTTGGTGCTTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGC 1663
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 ACAGTTGAGGGGCAGAAACGGAAGCCGTGTTGGTGCCTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGC 1370
Query 1664 CATGGCAGAACAGCTTGAGGCTGCTGGACAGGATCCACTTGATTTTTCTTGTACGATTAT 1723
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 CATGGCAGAACAGCTTGAGGCAGCTGCACAAGATCCCCTTGATTTTTCTTGTACGATTAT 1430
Query 1724 GGTTCTTGGTAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACGATCAATTCTATATTTGATGAAGT 1783
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1431 GGTGCTTGGTAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACCATCAATTCTATTTTTGATGAACT 1490
Query 1784 G-AAATCTTGTACTGATGCATTCCAGATGGGTACAAAGAGGGTTCAAGATGTTGAGGGTT 1842
| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||
Sbjct 1491 GAAAAT-TAGTACTGATGCATTCCAGGTGGGGACAAAGAAGGTTCAGGATATTGAGGGTT 1549
Query 1843 TGGTTCAGGGAATTAAGGTACGGGTGATTGACACTCCCGGTCTCTTACCTTCCTGGTCTG 1902
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1550 TTGTTCAGGGAATTAAGGTACGGGTAATTGACACTCCCGGTCTCTTACCATCCTGGTCAG 1609
Query 1903 ATCAAGC-CAAGAATGAGAAGATCCTGAATTCTGTTAAGGCTTTCATCAAGAAGAA-TCC 1960
||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||
Sbjct 1610 ATCAA-CACAAGAATGAGAAGATCCTGAAGTCTGTTAGGGCATTCATCAAGAA-AAGTCC 1667
Query 1961 ACCTGACATTGTACTATATCTTGATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACAT 2020
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 GCCTGACATTGTGTTATATCTTGATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACAT 1727
Query 2021 GCCTCTCCTGCGCACCATAAGTGATGTTTTTGGTCCATCGATTTGGTTTAATGCCATTGT 2080
||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1728 GCCTCTCTTACGCACCATCACTGATGTTTTTGGACCATCAATATGGTTTAATGCCATTGT 1787
Query 2081 GGGTTTGACTCATGCCGCTTCTGTTCCACCAGATGGCCCAAATGGCACTGCTTCTAGCTA 2140
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1788 GGGTTTGACTCATGCCGCTTCGGCTCCACCAGATGGCCCAAATGGTACTGCTTCTAGCTA 1847
Query 2141 TGACATGTTTGTAACACAACGCTCTCACGTCATCCAGCAGGCTATTCGCCAAGCAGCTGG 2200
|||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1848 TGACATGTTTGTGACACAACGTTCTCATGTCATCCAGCAGGCCATTCGCCAAGCAGCGGG 1907
Query 2201 AGATATGAGGCTCATGAACCCTGTTTCTTTAGTTGAGAATCACTCAGCTTGCAGGACTAA 2260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1908 AGATATGAGGCTCATGAACCCTGTTTCTTTAGTTGAGAACCACTCTGCTTGCAGGACAAA 1967
Query 2261 TCGGGCAGGCCAGAGAGTATTACCAAATGGCCAAGTGTGGAAGCCACATTTGTTGTTACT 2320
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1968 TCGGGCAGGCCAGAGAGTATTACCTAATGGCCAAGTGTGGAAGCCTCATTTGTTATTACT 2027
Query 2321 CTCATTTGCATCTAAGATTCTAGCAGAAGCAAATGCTCTTTTGAAGTTACAAGATAATAT 2380
|||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 2028 CTCATTTGCATCCAAGATTCTTGCCGAAGCAAATGCTCTTCTGAAATTACAAGATAATAT 2087
Query 2381 TCCAGGGAGACCATTTGCAGCTCGTTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTTCTCCTATCATC 2440
||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||
Sbjct 2088 TCCAGGGGGACAATTTGCAACTCGGTCCAAGGCTCCGCCACTACCATTGCTCCTCTCATC 2147
Query 2441 GCTTCTGCAATCAAGACCACAACCTAAGCTTCCTGAACAACAGTATGGTGATGAAGAAGA 2500
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||
Sbjct 2148 GCTTCTGCAATCAAGACCACAAGCTAAGCTTCCTGAGCAACAGTACGATGATGAAGACGA 2207
Query 2501 TGAAGATGATTTGGACGAATCATCAGATTCAGACGAAGAATCAGAGTATGATCAGCTTCC 2560
|||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2208 TGAAGATGATTTAGACGAATCATCAGATTCTGAGGAAGAATCAGAGTATGATGAGCTTCC 2267
Query 2561 TCCCTTTAAGAGTTTGACTAAAGCTCAAATGGCTACA-CTTAGTAAATCTCAGAAGAAGC 2619
|||||||||| | ||||||||||| | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||
Sbjct 2268 TCCCTTTAAGCGGTTGACTAAAGCAGAGATGACTA-AGCTTAGCAAATCTCAGAAGAAGG 2326
Query 2620 AGTATCTCGATGAAATGGAGTACCGGGAGAAACTATTAATGAAGA-AGCAAATGAAAGAG 2678
| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | || |||||||||
Sbjct 2327 AATATCTCGATGAGATGGAGTATCGGGAGAAACTATTTATGAAGAGA-CAGATGAAAGAG 2385
Query 2679 GAAAGAAAGCGACGTAAGATGTTTAAGAAATTTGCTGCAGAGATTAAAGATTTGCCTGAT 2738
||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
Sbjct 2386 GAAAGAAAGAGACGTAAGTTGTTGAAGAAATTTGCTGCTGAGATTAAAGATATGCCTAAC 2445
Query 2739 GGGTTTAGTGAAAATGTGGAAGAGGAGAGTGGTGGACCTGCATCAGTTCCAGTTCCCATG 2798
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2446 GGGTATAGTGAAAATGTGGAAGAGGAGAGAAGTGAACCTGCATCTGTTCCAGTTCCAATG 2505
Query 2799 CCAGATTTATCTCTACCTGCGTCTTTTGACTCTGATAACCCTACTCACCGCTACCGCTAC 2858
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||
Sbjct 2506 CCAGATTTATCTCTACCTGCATCTTTTGACTCTGACAATCCTACTCATCGGTACCGGTAC 2565
Query 2859 CTTGATTCCTCCAATCAGTGGCTTGTTAGGCCCGTTCTGGAAACTCATGGGTGGGATCAT 2918
|||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566 CTTGATACCTCCAATCAATGGCTTGTTAGGCCAGTGCTGGAAACTCATGGGTGGGATCAT 2625
Query 2919 GATATTGGTTATGAAGGTGTGAATGCAGAACGGCTCTTTGTTGTAAAAGACAAAATACCA 2978
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2626 GATATTGGTTATGAAGGTGTGAATGCGGAACGACTATTTGTTGTTAAAGACAAAATACCA 2685
Query 2979 ATATCTGTCTCAGGTCAAGTGACAAAGGACAAGAAGGATGCAAATGTGCAGCTGGAAATG 3038
||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 2686 GTATCTTTCTCTGGCCAAGTGACAAAGGACAAGAAGGATGCACATGTGCAGCTAGAATTG 2745
Query 3039 GCCAGCTCGGTTAAACATGGAGAGGGTAAATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAACT 3098
||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2746 GCCAGCTCGGTTAAACATGGAGAAGGTAGATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAAAT 2805
Query 3099 GTTGGAAAGGAATTGGCTTATACTCTTCGAAGCGAAACGAGATTTAACAACTTCAGGAGA 3158
| ||| |||||||| || || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |
Sbjct 2806 GCTGGGAAGGAATTAGCGTACACTATTCGAAGTGAAACAAGATTTAACAAGTTTAGGAAA 2865
Query 3159 AACAAAGCTGCAGCTGGTCTTTCTGTAACACTCTTGGGTGATTCAGTTTCTGCGGGGCTG 3218
|||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2866 AACAAAGCAGCAGCTGGTCTCTCTGTTACGCTCTTAGGTGATTCAGTTTCCGCGGGACTA 2925
Query 3219 AAAGTTGAAGATAAGTTGATTGCTAGTAAATGGTTCAGAATGGTAATGTCTGGTGGAGCT 3278
||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2926 AAAGTCGAAGATAAGTTGATTGCTAATAAACGGTTCAGGATGGTTATGTCAGGTGGAGCA 2985
Query 3279 ATGACTAGTCGGGGAGATTTTGCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTGAGAGATAAA 3338
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2986 ATGACTAGTCGTGGAGATGTTGCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTTCGAGATAAA 3045
Query 3339 GATTATCCGCTTGGCCGGTTTTTGA-CTACTCTTGGACTTTCTGTAATGGATTGGCACGG 3397
|||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3046 GATTATCCGCTTGGTCGGTTTTT-ATCAACTCTTGGACTCTCTGTGATGGATTGGCATGG 3104
Query 3398 TGATCTTGCTATCGGAGGGAACATACAGTCTCAGGTTCCCATTGGACGTTCCTCTAATTT 3457
|||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3105 CGATCTTGCTATCGGAGGGAATATACAGTCTCAAGTACCCATTGGACGTTCCTCTAATCT 3164
Query 3458 AATTGCTCGTGCTAATCTGAATAATAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGTGTCCGTGTAAACAG 3517
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 3165 CATTGCTCGTGCTAATCTGAATAACAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGCATCCGCGTAAACAG 3224
Query 3518 CTCCGAGCAGCTCCAACTTGCTATGGTGGCAATTGTTCCTCTCTTCAAGAAGCTACTTAG 3577
||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3225 CTCTGAGCAGCTTCAACTTGCTGTGGTTGCACTTGTTCCTCTGTTCAAGAAGCTTCTTAC 3284
Query 3578 TTATTGTTACCC-G--CAAACGCAATATGGACAATGATGAAGAAACATTTA 3625
||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 3285 TTATTATTCCCCTGAGCAAATGCAATATGGACACTGATGA-GTAACATTTA 3334
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 192942062778
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5