BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg480572 Length=3600 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G16920.1 | Symbols: UBC23, PFU2 | ubiquitin-conjugating enzy... 5217 0.0 > AT2G16920.1 | Symbols: UBC23, PFU2 | ubiquitin-conjugating enzyme 23 | chr2:7334226-7339167 REVERSE LENGTH=3665 Length=3665 Score = 5217 bits (2825), Expect = 0.0 Identities = 3399/3663 (93%), Gaps = 92/3663 (3%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAGCATGAGCAACATGACCCTGGTACATCATCAACAAATGTTGGGGTTGACTCGCCA 60 ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || Sbjct 24 ATGGAGCATGAGCAAGATGACCCTGGT--A-CATCAACAAATGTAGGGGTTGACTCGTCA 80 Query 61 CCGCCACTTGATGATTCAACT-GTGA-TC-CATAGGTCTGATGATTCAGAGCATCCTAAT 117 | |||||||||||| | | | || | | | || ||||||||||||||||||| Sbjct 81 --G----TTGATGATTCAA-TGGCAAGTCTC-TCTATATG-TGATTCAGAGCATCCTAAT 131 Query 118 ATTTATCGACAAGATATTGTCAAAAACAATAGGACCGGTAGTATTGGGGTTGTCAGCGAA 177 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct 132 ATTTATCGACAAGATATTGTCAAAAACAAAAAGACCGGTAGTGTTGGTGTTGTCAGCGAA 191 Query 178 GTAGCTGGTGATTCTGACTCTGAGAGTGATATTAGTGAT------G-AG--GATGA--A- 225 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | Sbjct 192 GTAGCTGGTGATTCTGACTCTGATAGTGATATTAGTGATGAGGAAGAAGATGATGATGAT 251 Query 226 GAC-AACG--AA-GA--A-GATGAT---GATG-A-A-G-A-GG-AAAAGGCCAGTGAAGA 269 ||| || | || || | |||||| |||| | | | | || ||||||| |||||||| Sbjct 252 GACGAA-GATAATGATGATGATGATGAGGATGTAGAGGAAGGGAAAAAGGCTAGTGAAGA 310 Query 270 AAATGTTGGTGATGGAGATGGCGAGAAAAAACCCGATGGGAACTACAAATGTGGTGCCCT 329 |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| || Sbjct 311 AAATGTTGTTAATGGAGATGGCGAGAAAAAAGCTGATGGGAATTATAAATGTGGTGCACT 370 Query 330 TGACGGAGATCAGATTCGTGTGCTTTGGATGGATAACACTGAGCCTGTTCAAGATATTAA 389 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 371 TGAGGGAGATCAGATTCGTGTGCTTTGGATGGATAACACTGAGCCTGTTCAAGATATTAA 430 Query 390 TGATGTAACCGTTGTAGACCGTGGTTTCTTACATGGAGATTATGTTGCTTCGGCTTATGA 449 ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| Sbjct 431 TGATGTAACTGTTATAGACCGTGGTTTCTTACATGGTGATTATGTTGCTTCTGCTTCTGA 490 Query 450 GCCGACTGGCCAGGTGGGAGTTGTAGTGGATGTGAACATATCTGTTGATTTGTTGGCTCC 509 ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 491 GCCTACTGGTCAGGTGGGAGTTGTTGTGGATGTTAACATATCAGTTGATTTGTTGGCTCC 550 Query 510 TGATGGTTCTATCCACAAGGACATATCAACTAAGAATTTGAAACGCGTCAGGGATTTTGC 569 |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 551 TGATGGTTCTATTCACAAGGACATCTCTACCAAGAATTTGAAACGCGTCAGGGATTTTGC 610 Query 570 TGTTGGTGATTATGTGGTTCATGGACCATGGCTAGGTAGAATCGATGATGTATTGGACAA 629 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 611 TGTTGGTGATTATGTGGTTCATGGTCCATGGCTAGGTAGAATCGATGATGTGTTGGACAA 670 Query 630 TGTGACTGTCTTGTTTGATGATGGTTCCATGTGTAAAGTTCTACGTGTTGAACCCCTTCG 689 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 671 TGTGACTGTCTTATTTGATGATGGTTCCATGTGTAAAGTTCTACGTGTTGAACCTCTTCG 730 Query 690 ACTAAAACCTATTCCCAAGAATAATCTTGAAGAAGATGCTAATTTTCCTTATTATCCAGG 749 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 731 ACTTAAACCTATTCCGAAGAATAATCTTGAAGAAGATGCTAATTTTCCTTATTACCCAGG 790 Query 750 CCAGCGTGTTAGAGCAAGCTCCTCGTCGATTTTTAAGAATTCCCGGTGGTTATCTGGACT 809 ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 791 GCAGCGGGTTAAAGCAAGCTCCTCTTCGGTTTTTAAGAATTCGCGGTGGTTATCTGGACT 850 Query 810 GTGGAAGCCCAATCGTTTAGAAGGTACTGTGACCAAAGTTACTGCTGGATCTATTTTTGT 869 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 851 GTGGAAGCCTAATCGTTTAGAAGGTACGGTGACCAAAGTTACTGCGGGATCAATTTTTGT 910 Query 870 CTACTGGATTGCCTCAGCTGGCTTTGGCCCAGATTCTTCTGTTTCCCCACCTGAGGAGCA 929 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 911 CTACTGGATTGCCTCAGCTGGCTTTGGTCCAGATTCTTCTGTTTCCCCACCTGAGGAGCA 970 Query 930 GAATCCAAGTAATTTGACATTGTTGTCATGTTTCACTCATGCCAATTGGCAAGTGGGTGA 989 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 971 GAATCCAAGTAATTTGACATTGTTGTCATGTTTCACTCATGCCAATTGGCAAGTGGGTGA 1030 Query 990 CTGGTGCCTTCTTCCGTCGGTGAATCAATCTGCTACGATCCCCTTACACAAGCATGTATC 1049 ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1031 CTGGTGCCTTCTTCCATCTCTGAATCAATCTGCTACAATCCCCTTACACAAGCATGTATC 1090 Query 1050 TAAGTTACGAATTTATGATTCTCAAGCAAACTGTGCTGATCGGCAACAGAAAAGTGGGTG 1109 ||| ||| || |||||||||| | | || ||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 1091 TAAATTAAGACTTTATGATTC-C---C-AA----GCTGATCGGCAACAGAAAATTGGGCG 1141 Query 1110 CGATTTAGAAGATGTGCAAGATGGGGTAAGCGGAAAAG-T--------TGGTATTACTGC 1160 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| Sbjct 1142 TGATTTAGAAGATGTGCAAGATGAAGTAAGTGGAAAAGTTGAACCAGCTGGTATTACTGC 1201 Query 1161 TGAAGCTTTGCCAAAAGTGACTAGTGAAGATCCTTCTCAAAGAAATCCTTCTATTTCAAA 1220 |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1202 TGAAGCTTTGCCAAAAGTAACTAGTGACGATCCTCCTCAAAGAAATCCTTCTGTTTCAAA 1261 Query 1221 GGAGCCTGTTCATGAGCCTTGGCCTCTCCATCGTAAGAAGATTCGCAAACTTGTTATCAG 1280 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1262 GGAGCCTGTTCATGAGCCTTGGCCTCTCCATCGGAAGAAGATTCGCAAACTTGTTATCAG 1321 Query 1281 AAAGGACAAAAAGGTGAAGAAAAAAGAGGAAACCTTTGAACGAGCTCTTTTGGTAGTTAA 1340 ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1322 AAAGGACAAAAAGGTTAAGAAAAAAGAGGAAAGCTTTGAACAAGCTCTTTTGGTAGTTAA 1381 Query 1341 TAGCAGAACATGCGTTGATGTAGCCTGGCAGGATGGTACAATAGAATGTAGACGGGAAGC 1400 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1382 TAGCAGAACACGCGTTGATGTATCCTGGCAGGATGGTACAATAGAATGTAGACGGGAAGC 1441 Query 1401 GACAACATTGATTCCAATTGAGACTCCTGGTGATCATGAATTTGTCTCTGAGCAGTATGT 1460 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1442 GATAACATTGATTCCAATTGAGACTCCTGGTGATCATGAATTTGTCTCTGAGCAGTATGT 1501 Query 1461 GGTAGAGAAGACCTCTGATGATGGTGATAACACAAATGAACCTAGACGTGCTGGCGTTGT 1520 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1502 GGTAGAGAAGACCTCTGATGATGGTGATAACACAACTGAACCTAGACGTGCTGGCGTTGT 1561 Query 1521 GAAAAGTGTCAATGCAAAAGAACGTACCGCTTCTGTGAGGTGGCTAAAGCCACTTCTAAG 1580 |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 1562 AAAAAATGTCAATGCAAAAGATCGTACTGCTTCTGTGAGGTGGCTAAATCCACTTCGAAG 1621 Query 1581 GGCAGAAGAACCCCGTGAGTTTGAAAAGGAAGAAATTGTCAGTGTGTATGAGCTAGAGGG 1640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1622 GGCAGAAGAACCCCGTGAGTTTGAAAAGGAAGAAATTGTCAGTGTGTATGAGCTAGAGGG 1681 Query 1641 CCATCCAGATTATGACTACTGTTATGGGGATGTTGTTGTTCGCTTATCACCTGTTACCGT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct 1682 CCATCCAGATTATGACTACTGTTATGGGGATGTTGTTGTTCGCTTATCACCTATTGCCGT 1741 Query 1701 TGCGTTACCAGCATCTTCTCCCGGAAACTCTTTAGAGGAGGCAACACAGCAAGACAATGG 1760 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1742 TGCGTTACCAGCATCTTCTCCCGGAAACTCTTTTGAGGAGGCAACACAGCAAGACAATGG 1801 Query 1761 ATACCAAGATTCAGAATTCCATCAAGAAGCTAAAATCCGTAAGGATACTGAAGAAAACGA 1820 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| Sbjct 1802 ATACCAAGATTCAGAATCCCATCAAGAAGCTAAAATCCTTGTGGATAAGGAAGAAAACGA 1861 Query 1821 ATCTAATACGGACCTTTCAAAGCTCTCATGGGTTGGAAATATTACTGGCCTCAAGGATGG 1880 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1862 GCCTAGTACGGACCTTTCAAAGCTCTCATGGGTTGGAAATATTACTGGCCTCAAGGATGG 1921 Query 1881 TGATATTGAAGTAACATGGGCCGATGGAACAGTATCAACGGTTGGCCCTCATGCAGTTTA 1940 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1922 TGATATTGAAGTAACATGGGCCGATGGAACAATATCAACGGTTGGCCCTCATGCAGTTTA 1981 Query 1941 TGTAGTTGGACGGGATGATGATGATGAATC-GATTGCTGGAGAAAGTGAAGCAAGTGATG 1999 |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1982 TGTAGTTGGACGCGATGATGATGATGAATCAG-TTGCTGGAGAAAGTGAAACAAGTGATG 2040 Query 2000 CTGCTAGTTGGGAAACTTTAAACGATGATGATAGGGGTGCTCCTGAGATTCCTGAAGAGG 2059 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 CTGCTAGTTGGGAAACTTTAAACGATGATGATAGGGGTGCTCCTGAGATTCCTGAAGAGG 2100 Query 2060 AGCTTGGAAGGAGTAGTTCCATTGAGGGAAACTCTGATGCAGATGTCAATTCTGAGAACG 2119 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | Sbjct 2101 ACCTTGGAAGGAGTAGTTCCATTGAGGGAAACTCTGATGCAGATATCTACGCTGAGAATG 2160 Query 2120 ATTCTGGGAGGAACGGTGCCCTAGCTCTTCCGCTGGCTGCAATCGAATTTGTGACTCGAC 2179 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 ATTCTGGGAGGAACGGTGCCCTAGCTCTTCCTCTGGCTGCAATCGAATTTGTGACTCGAC 2220 Query 2180 TGGCTAGTGGAATCTTTTCCCGTGCCAGGAAATCTGTAGATTCTTCCAGTTCTGATTACA 2239 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2221 TGGCTAGTGGAATCTTTTCGCGTGCAAGGAAATCTGTAGATTCTTCCAGTTCTGATTACA 2280 Query 2240 CGGGGGAAAATGTATATATGCAAGCTGAGTTGACCAACTCTTCTGATGAAAGAGATTGTT 2299 ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| ||||| Sbjct 2281 CGGTTGAAAATGTATATAAGCAAGCTGAATCGACCAACCCGTCCGATGAAACAGATTC-- 2338 Query 2300 TCCTTGATGACCCTAGTCCTTCAAAGGTCAATGTGACTGATAATTGTGAGTCAAAGGGCA 2359 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2339 -CCTTGATGACCCTAGTCCTTCAAAAGTTAATGTGACTGATAATTGCGAGTCAAAGGGCA 2397 Query 2360 CTCAAGCAAATGCTGAGAATATTTTGAGTGGGGAAACCTCTACACTTTTAGAAGATGA-G 2418 ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct 2398 CTCAAGCAAATGCCAAGAATATTTTGAGCGGGGAAACCTCTACATTTTTAGAAGATGAAG 2457 Query 2419 -----CCAGTACCTTCTGATGGTGATAGCTGCAGTTTCAGACGCTTTGATATATCACAAG 2473 |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2458 ATAAGCCAGTACCTTCTGAAGGTGATAGTTGCAGTTTCAGACGCTTTGATATATCACAAG 2517 Query 2474 ATCCTCTGGACCACCATTTCCTTGGCGTAGATGGGCAGAAAACCAAAGAAAGACAGTGGT 2533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2518 ATCCTCTGGACCACCATTTCCTTGGCGTAGATGGGCAGAAAACCAAAGAAAGACAGTGGT 2577 Query 2534 TCAAGAAGGTTGATCAAGACTGGAAAATACTTCAGAACAATCTTCCGGATGGAATCTTTG 2593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2578 TCAAGAAGGTTGATCAAGACTGGAAAATACTTCAGAACAATCTTCCAGATGGAATCTTTG 2637 Query 2594 TTCGAGCTTACGAAGATAGAATGGATCTCTTGAGGGCCGTAATAGTTGGGGCATATGGAA 2653 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| Sbjct 2638 TTCGAGCTTACGAAGATAGAATGGATCTCTTGAGGGCAGTAATAGTCGGGGCATTTGGAA 2697 Query 2654 CACCATACCAAGATGGTCTCTTCTTTTTCGATTTTCACCTTCCATCTGACTACCCTAGTG 2713 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2698 CACCATACCAAGATGGTCTCTTCTTTTTTGATTTTCACCTTCCATCTGACTACCCTAGTG 2757 Query 2714 TGCCACCGTCAGCATATTATCATTCTGGTGGATGGAGGTTAAACCCCAATCTGTATGAAG 2773 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2758 TGCCACCGTCGGCATATTATCATTCTGGTGGATGGAGGTTAAACCCCAATCTGTACGAAG 2817 Query 2774 AAGGCAAGGTCTGTCTTAGCCTTCTCAATACCTGGACAGGCAGGGGAAATGAAGTCTGGG 2833 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2818 AAGGCAAAGTCTGTCTTAGCCTTCTCAATACCTGGACAGGCAGGGGAAATGAAGTCTGGG 2877 Query 2834 ATCCCAAATCATCTAGCATCCTTCAAGTTCTTGTTTCACTCCAGGGATTGGTGTTGAATT 2893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2878 ATCCCAAATCATCTAGCATCCTTCAAGTTCTTGTTTCACTCCAGGGATTGGTGTTGAATT 2937 Query 2894 CAAAGCCTTATTTCAATGAAGCCGGGTATGATAAGCAGGTCGGAACTGCGGAAGGAGaaa 2953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2938 CAAAGCCTTATTTCAATGAAGCCGGGTATGATAAGCAGGTCGGAACTGCGGAAGGAGAAA 2997 Query 2954 aaaaCTCACTGGGATACAACGAGAATACTTTCTTGCTAAATTGTAAAACCATGATGTATC 3013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2998 AAAACTCACTGGGATACAACGAGAATACTTTCTTGCTAAATTGTAAAACCATGATGTATC 3057 Query 3014 TTATGCGGAAACCACCAAAGGATTTTGAAGAACTCATCAAAGACCATTTCAGAAAACGCG 3073 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3058 TTATGCGGAAACCACCAAAGGATTTTGAAGAACTCATCAAAGATCATTTCAGAAAACGCG 3117 Query 3074 GCTATTACATTTTGAAGGCATGTGACGCCTACATGAAAGGATATCTCATAGGTTCCCTCA 3133 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3118 GATATTACATTTTGAAGGCATGTGACGCCTACATGAAAGGATATCTCATAGGTTCCCTCA 3177 Query 3134 CCAAAGATGCCTCGGTTATCGATGAACGCAGCAGTGCTAATTCCACTTCGGTTGGTTTTA 3193 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 3178 CCAAAGATGCCTCGGTTATCGATGAACGCAGCAGCGCTAATTCAACTTCAGTTGGTTTTA 3237 Query 3194 AGCTTATGTTGGCTAAGATAGCGCCAAAGCTTTTCTCAGCACTGAGCGAGGTAGGAGCTG 3253 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3238 AGCTTATGCTGGCTAAGATAGCACCAAAGCTTTTCTCAGCACTGAGCGAGGTAGGAGCTG 3297 Query 3254 ACTGCAATGAATTCAAGCATCTGCAGCAGCAATAACTTAAGCCTCAAAGGAGCTGGGTAC 3313 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| Sbjct 3298 ACTGCAATGAATTCCAGCATCTGCAGCAGCAATAACACAATCCTAAAAGGAGCTGGATAC 3357 Query 3314 ACCAACCATTGCCAATGAACCAAGTGAAGGTTTGCGGCTTCTTTACTGTTACAAGTTTCA 3373 ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3358 ACCGATCGTTGCCAATGAACCAAGTGAAGGTTTGCGGCTTCTTTACTATTACAAGTTTCA 3417 Query 3374 AATTCAGATATTTCTGAAATGTGTGTAATAGAGTTAtttttttGGAGTTATACAAGAATT 3433 ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3418 AATTCAGATATTTCTGAAACGTGTGTAGTAGAGTT-TTTTT--GGAGTTATACAAGAATT 3474 Query 3434 ACGCGTTGCTAAGTTGTAACCCCATCCGCTCCAACAATATCGGCAA-TG-----GTCTTG 3487 | ||| | |||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| || || ||| Sbjct 3475 AAGCGATACTAAGTTGTAACCCCATCTGGTCGAACAATATCGACAAATGAATTTGTTTTG 3534 Query 3488 TTT--TC--G----GGA-C-TACTTAACAGTTTTAGGGATGCACTTCAACACTTGTTTCT 3537 || || | || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 3535 GTTGGTCATGTTTTGGGGCCTACTTAAAAGTTTTAGGGGTGCACTTCAACACCTGTTTCT 3594 Query 3538 TGTGTCATGGGTTGTCAAATTACTTCTCTAACAAAGATTATTTAAGTGAAGTTGTTTCGC 3597 | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3595 TTTGTCATGGGTTGTCAAATTACTTTTCTAACAAAGATTATTTAAGTAAAGTTGTTTCGC 3654 Query 3598 TTT 3600 ||| Sbjct 3655 TTT 3657 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 179246487339 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5