BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg480572

Length=3600
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT2G16920.1 | Symbols: UBC23, PFU2 | ubiquitin-conjugating enzy...  5217    0.0  


> AT2G16920.1 | Symbols: UBC23, PFU2 | ubiquitin-conjugating enzyme 
23 | chr2:7334226-7339167 REVERSE LENGTH=3665
Length=3665

 Score = 5217 bits (2825),  Expect = 0.0
 Identities = 3399/3663 (93%), Gaps = 92/3663 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGAGCATGAGCAACATGACCCTGGTACATCATCAACAAATGTTGGGGTTGACTCGCCA  60
             ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct  24    ATGGAGCATGAGCAAGATGACCCTGGT--A-CATCAACAAATGTAGGGGTTGACTCGTCA  80

Query  61    CCGCCACTTGATGATTCAACT-GTGA-TC-CATAGGTCTGATGATTCAGAGCATCCTAAT  117
               |    |||||||||||| | |  | || | |   | || |||||||||||||||||||
Sbjct  81    --G----TTGATGATTCAA-TGGCAAGTCTC-TCTATATG-TGATTCAGAGCATCCTAAT  131

Query  118   ATTTATCGACAAGATATTGTCAAAAACAATAGGACCGGTAGTATTGGGGTTGTCAGCGAA  177
             ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct  132   ATTTATCGACAAGATATTGTCAAAAACAAAAAGACCGGTAGTGTTGGTGTTGTCAGCGAA  191

Query  178   GTAGCTGGTGATTCTGACTCTGAGAGTGATATTAGTGAT------G-AG--GATGA--A-  225
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      | ||  |||||  | 
Sbjct  192   GTAGCTGGTGATTCTGACTCTGATAGTGATATTAGTGATGAGGAAGAAGATGATGATGAT  251

Query  226   GAC-AACG--AA-GA--A-GATGAT---GATG-A-A-G-A-GG-AAAAGGCCAGTGAAGA  269
             ||| || |  || ||  | ||||||   |||| | | | | || ||||||| ||||||||
Sbjct  252   GACGAA-GATAATGATGATGATGATGAGGATGTAGAGGAAGGGAAAAAGGCTAGTGAAGA  310

Query  270   AAATGTTGGTGATGGAGATGGCGAGAAAAAACCCGATGGGAACTACAAATGTGGTGCCCT  329
             |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||
Sbjct  311   AAATGTTGTTAATGGAGATGGCGAGAAAAAAGCTGATGGGAATTATAAATGTGGTGCACT  370

Query  330   TGACGGAGATCAGATTCGTGTGCTTTGGATGGATAACACTGAGCCTGTTCAAGATATTAA  389
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371   TGAGGGAGATCAGATTCGTGTGCTTTGGATGGATAACACTGAGCCTGTTCAAGATATTAA  430

Query  390   TGATGTAACCGTTGTAGACCGTGGTTTCTTACATGGAGATTATGTTGCTTCGGCTTATGA  449
             ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||
Sbjct  431   TGATGTAACTGTTATAGACCGTGGTTTCTTACATGGTGATTATGTTGCTTCTGCTTCTGA  490

Query  450   GCCGACTGGCCAGGTGGGAGTTGTAGTGGATGTGAACATATCTGTTGATTTGTTGGCTCC  509
             ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  491   GCCTACTGGTCAGGTGGGAGTTGTTGTGGATGTTAACATATCAGTTGATTTGTTGGCTCC  550

Query  510   TGATGGTTCTATCCACAAGGACATATCAACTAAGAATTTGAAACGCGTCAGGGATTTTGC  569
             |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551   TGATGGTTCTATTCACAAGGACATCTCTACCAAGAATTTGAAACGCGTCAGGGATTTTGC  610

Query  570   TGTTGGTGATTATGTGGTTCATGGACCATGGCTAGGTAGAATCGATGATGTATTGGACAA  629
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  611   TGTTGGTGATTATGTGGTTCATGGTCCATGGCTAGGTAGAATCGATGATGTGTTGGACAA  670

Query  630   TGTGACTGTCTTGTTTGATGATGGTTCCATGTGTAAAGTTCTACGTGTTGAACCCCTTCG  689
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  671   TGTGACTGTCTTATTTGATGATGGTTCCATGTGTAAAGTTCTACGTGTTGAACCTCTTCG  730

Query  690   ACTAAAACCTATTCCCAAGAATAATCTTGAAGAAGATGCTAATTTTCCTTATTATCCAGG  749
             ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  731   ACTTAAACCTATTCCGAAGAATAATCTTGAAGAAGATGCTAATTTTCCTTATTACCCAGG  790

Query  750   CCAGCGTGTTAGAGCAAGCTCCTCGTCGATTTTTAAGAATTCCCGGTGGTTATCTGGACT  809
              ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  791   GCAGCGGGTTAAAGCAAGCTCCTCTTCGGTTTTTAAGAATTCGCGGTGGTTATCTGGACT  850

Query  810   GTGGAAGCCCAATCGTTTAGAAGGTACTGTGACCAAAGTTACTGCTGGATCTATTTTTGT  869
             ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  851   GTGGAAGCCTAATCGTTTAGAAGGTACGGTGACCAAAGTTACTGCGGGATCAATTTTTGT  910

Query  870   CTACTGGATTGCCTCAGCTGGCTTTGGCCCAGATTCTTCTGTTTCCCCACCTGAGGAGCA  929
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911   CTACTGGATTGCCTCAGCTGGCTTTGGTCCAGATTCTTCTGTTTCCCCACCTGAGGAGCA  970

Query  930   GAATCCAAGTAATTTGACATTGTTGTCATGTTTCACTCATGCCAATTGGCAAGTGGGTGA  989
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971   GAATCCAAGTAATTTGACATTGTTGTCATGTTTCACTCATGCCAATTGGCAAGTGGGTGA  1030

Query  990   CTGGTGCCTTCTTCCGTCGGTGAATCAATCTGCTACGATCCCCTTACACAAGCATGTATC  1049
             ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1031  CTGGTGCCTTCTTCCATCTCTGAATCAATCTGCTACAATCCCCTTACACAAGCATGTATC  1090

Query  1050  TAAGTTACGAATTTATGATTCTCAAGCAAACTGTGCTGATCGGCAACAGAAAAGTGGGTG  1109
             ||| ||| || |||||||||| |   | ||    ||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct  1091  TAAATTAAGACTTTATGATTC-C---C-AA----GCTGATCGGCAACAGAAAATTGGGCG  1141

Query  1110  CGATTTAGAAGATGTGCAAGATGGGGTAAGCGGAAAAG-T--------TGGTATTACTGC  1160
              ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |        ||||||||||||
Sbjct  1142  TGATTTAGAAGATGTGCAAGATGAAGTAAGTGGAAAAGTTGAACCAGCTGGTATTACTGC  1201

Query  1161  TGAAGCTTTGCCAAAAGTGACTAGTGAAGATCCTTCTCAAAGAAATCCTTCTATTTCAAA  1220
             |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1202  TGAAGCTTTGCCAAAAGTAACTAGTGACGATCCTCCTCAAAGAAATCCTTCTGTTTCAAA  1261

Query  1221  GGAGCCTGTTCATGAGCCTTGGCCTCTCCATCGTAAGAAGATTCGCAAACTTGTTATCAG  1280
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1262  GGAGCCTGTTCATGAGCCTTGGCCTCTCCATCGGAAGAAGATTCGCAAACTTGTTATCAG  1321

Query  1281  AAAGGACAAAAAGGTGAAGAAAAAAGAGGAAACCTTTGAACGAGCTCTTTTGGTAGTTAA  1340
             ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1322  AAAGGACAAAAAGGTTAAGAAAAAAGAGGAAAGCTTTGAACAAGCTCTTTTGGTAGTTAA  1381

Query  1341  TAGCAGAACATGCGTTGATGTAGCCTGGCAGGATGGTACAATAGAATGTAGACGGGAAGC  1400
             |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1382  TAGCAGAACACGCGTTGATGTATCCTGGCAGGATGGTACAATAGAATGTAGACGGGAAGC  1441

Query  1401  GACAACATTGATTCCAATTGAGACTCCTGGTGATCATGAATTTGTCTCTGAGCAGTATGT  1460
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1442  GATAACATTGATTCCAATTGAGACTCCTGGTGATCATGAATTTGTCTCTGAGCAGTATGT  1501

Query  1461  GGTAGAGAAGACCTCTGATGATGGTGATAACACAAATGAACCTAGACGTGCTGGCGTTGT  1520
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1502  GGTAGAGAAGACCTCTGATGATGGTGATAACACAACTGAACCTAGACGTGCTGGCGTTGT  1561

Query  1521  GAAAAGTGTCAATGCAAAAGAACGTACCGCTTCTGTGAGGTGGCTAAAGCCACTTCTAAG  1580
              |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct  1562  AAAAAATGTCAATGCAAAAGATCGTACTGCTTCTGTGAGGTGGCTAAATCCACTTCGAAG  1621

Query  1581  GGCAGAAGAACCCCGTGAGTTTGAAAAGGAAGAAATTGTCAGTGTGTATGAGCTAGAGGG  1640
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1622  GGCAGAAGAACCCCGTGAGTTTGAAAAGGAAGAAATTGTCAGTGTGTATGAGCTAGAGGG  1681

Query  1641  CCATCCAGATTATGACTACTGTTATGGGGATGTTGTTGTTCGCTTATCACCTGTTACCGT  1700
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct  1682  CCATCCAGATTATGACTACTGTTATGGGGATGTTGTTGTTCGCTTATCACCTATTGCCGT  1741

Query  1701  TGCGTTACCAGCATCTTCTCCCGGAAACTCTTTAGAGGAGGCAACACAGCAAGACAATGG  1760
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1742  TGCGTTACCAGCATCTTCTCCCGGAAACTCTTTTGAGGAGGCAACACAGCAAGACAATGG  1801

Query  1761  ATACCAAGATTCAGAATTCCATCAAGAAGCTAAAATCCGTAAGGATACTGAAGAAAACGA  1820
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||
Sbjct  1802  ATACCAAGATTCAGAATCCCATCAAGAAGCTAAAATCCTTGTGGATAAGGAAGAAAACGA  1861

Query  1821  ATCTAATACGGACCTTTCAAAGCTCTCATGGGTTGGAAATATTACTGGCCTCAAGGATGG  1880
               ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1862  GCCTAGTACGGACCTTTCAAAGCTCTCATGGGTTGGAAATATTACTGGCCTCAAGGATGG  1921

Query  1881  TGATATTGAAGTAACATGGGCCGATGGAACAGTATCAACGGTTGGCCCTCATGCAGTTTA  1940
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1922  TGATATTGAAGTAACATGGGCCGATGGAACAATATCAACGGTTGGCCCTCATGCAGTTTA  1981

Query  1941  TGTAGTTGGACGGGATGATGATGATGAATC-GATTGCTGGAGAAAGTGAAGCAAGTGATG  1999
             |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1982  TGTAGTTGGACGCGATGATGATGATGAATCAG-TTGCTGGAGAAAGTGAAACAAGTGATG  2040

Query  2000  CTGCTAGTTGGGAAACTTTAAACGATGATGATAGGGGTGCTCCTGAGATTCCTGAAGAGG  2059
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2041  CTGCTAGTTGGGAAACTTTAAACGATGATGATAGGGGTGCTCCTGAGATTCCTGAAGAGG  2100

Query  2060  AGCTTGGAAGGAGTAGTTCCATTGAGGGAAACTCTGATGCAGATGTCAATTCTGAGAACG  2119
             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |
Sbjct  2101  ACCTTGGAAGGAGTAGTTCCATTGAGGGAAACTCTGATGCAGATATCTACGCTGAGAATG  2160

Query  2120  ATTCTGGGAGGAACGGTGCCCTAGCTCTTCCGCTGGCTGCAATCGAATTTGTGACTCGAC  2179
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2161  ATTCTGGGAGGAACGGTGCCCTAGCTCTTCCTCTGGCTGCAATCGAATTTGTGACTCGAC  2220

Query  2180  TGGCTAGTGGAATCTTTTCCCGTGCCAGGAAATCTGTAGATTCTTCCAGTTCTGATTACA  2239
             ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2221  TGGCTAGTGGAATCTTTTCGCGTGCAAGGAAATCTGTAGATTCTTCCAGTTCTGATTACA  2280

Query  2240  CGGGGGAAAATGTATATATGCAAGCTGAGTTGACCAACTCTTCTGATGAAAGAGATTGTT  2299
             |||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| |||||   
Sbjct  2281  CGGTTGAAAATGTATATAAGCAAGCTGAATCGACCAACCCGTCCGATGAAACAGATTC--  2338

Query  2300  TCCTTGATGACCCTAGTCCTTCAAAGGTCAATGTGACTGATAATTGTGAGTCAAAGGGCA  2359
              |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2339  -CCTTGATGACCCTAGTCCTTCAAAAGTTAATGTGACTGATAATTGCGAGTCAAAGGGCA  2397

Query  2360  CTCAAGCAAATGCTGAGAATATTTTGAGTGGGGAAACCTCTACACTTTTAGAAGATGA-G  2418
             |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct  2398  CTCAAGCAAATGCCAAGAATATTTTGAGCGGGGAAACCTCTACATTTTTAGAAGATGAAG  2457

Query  2419  -----CCAGTACCTTCTGATGGTGATAGCTGCAGTTTCAGACGCTTTGATATATCACAAG  2473
                  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2458  ATAAGCCAGTACCTTCTGAAGGTGATAGTTGCAGTTTCAGACGCTTTGATATATCACAAG  2517

Query  2474  ATCCTCTGGACCACCATTTCCTTGGCGTAGATGGGCAGAAAACCAAAGAAAGACAGTGGT  2533
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2518  ATCCTCTGGACCACCATTTCCTTGGCGTAGATGGGCAGAAAACCAAAGAAAGACAGTGGT  2577

Query  2534  TCAAGAAGGTTGATCAAGACTGGAAAATACTTCAGAACAATCTTCCGGATGGAATCTTTG  2593
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2578  TCAAGAAGGTTGATCAAGACTGGAAAATACTTCAGAACAATCTTCCAGATGGAATCTTTG  2637

Query  2594  TTCGAGCTTACGAAGATAGAATGGATCTCTTGAGGGCCGTAATAGTTGGGGCATATGGAA  2653
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||
Sbjct  2638  TTCGAGCTTACGAAGATAGAATGGATCTCTTGAGGGCAGTAATAGTCGGGGCATTTGGAA  2697

Query  2654  CACCATACCAAGATGGTCTCTTCTTTTTCGATTTTCACCTTCCATCTGACTACCCTAGTG  2713
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2698  CACCATACCAAGATGGTCTCTTCTTTTTTGATTTTCACCTTCCATCTGACTACCCTAGTG  2757

Query  2714  TGCCACCGTCAGCATATTATCATTCTGGTGGATGGAGGTTAAACCCCAATCTGTATGAAG  2773
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2758  TGCCACCGTCGGCATATTATCATTCTGGTGGATGGAGGTTAAACCCCAATCTGTACGAAG  2817

Query  2774  AAGGCAAGGTCTGTCTTAGCCTTCTCAATACCTGGACAGGCAGGGGAAATGAAGTCTGGG  2833
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2818  AAGGCAAAGTCTGTCTTAGCCTTCTCAATACCTGGACAGGCAGGGGAAATGAAGTCTGGG  2877

Query  2834  ATCCCAAATCATCTAGCATCCTTCAAGTTCTTGTTTCACTCCAGGGATTGGTGTTGAATT  2893
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2878  ATCCCAAATCATCTAGCATCCTTCAAGTTCTTGTTTCACTCCAGGGATTGGTGTTGAATT  2937

Query  2894  CAAAGCCTTATTTCAATGAAGCCGGGTATGATAAGCAGGTCGGAACTGCGGAAGGAGaaa  2953
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2938  CAAAGCCTTATTTCAATGAAGCCGGGTATGATAAGCAGGTCGGAACTGCGGAAGGAGAAA  2997

Query  2954  aaaaCTCACTGGGATACAACGAGAATACTTTCTTGCTAAATTGTAAAACCATGATGTATC  3013
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2998  AAAACTCACTGGGATACAACGAGAATACTTTCTTGCTAAATTGTAAAACCATGATGTATC  3057

Query  3014  TTATGCGGAAACCACCAAAGGATTTTGAAGAACTCATCAAAGACCATTTCAGAAAACGCG  3073
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  3058  TTATGCGGAAACCACCAAAGGATTTTGAAGAACTCATCAAAGATCATTTCAGAAAACGCG  3117

Query  3074  GCTATTACATTTTGAAGGCATGTGACGCCTACATGAAAGGATATCTCATAGGTTCCCTCA  3133
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3118  GATATTACATTTTGAAGGCATGTGACGCCTACATGAAAGGATATCTCATAGGTTCCCTCA  3177

Query  3134  CCAAAGATGCCTCGGTTATCGATGAACGCAGCAGTGCTAATTCCACTTCGGTTGGTTTTA  3193
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct  3178  CCAAAGATGCCTCGGTTATCGATGAACGCAGCAGCGCTAATTCAACTTCAGTTGGTTTTA  3237

Query  3194  AGCTTATGTTGGCTAAGATAGCGCCAAAGCTTTTCTCAGCACTGAGCGAGGTAGGAGCTG  3253
             |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3238  AGCTTATGCTGGCTAAGATAGCACCAAAGCTTTTCTCAGCACTGAGCGAGGTAGGAGCTG  3297

Query  3254  ACTGCAATGAATTCAAGCATCTGCAGCAGCAATAACTTAAGCCTCAAAGGAGCTGGGTAC  3313
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||
Sbjct  3298  ACTGCAATGAATTCCAGCATCTGCAGCAGCAATAACACAATCCTAAAAGGAGCTGGATAC  3357

Query  3314  ACCAACCATTGCCAATGAACCAAGTGAAGGTTTGCGGCTTCTTTACTGTTACAAGTTTCA  3373
             ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3358  ACCGATCGTTGCCAATGAACCAAGTGAAGGTTTGCGGCTTCTTTACTATTACAAGTTTCA  3417

Query  3374  AATTCAGATATTTCTGAAATGTGTGTAATAGAGTTAtttttttGGAGTTATACAAGAATT  3433
             ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||
Sbjct  3418  AATTCAGATATTTCTGAAACGTGTGTAGTAGAGTT-TTTTT--GGAGTTATACAAGAATT  3474

Query  3434  ACGCGTTGCTAAGTTGTAACCCCATCCGCTCCAACAATATCGGCAA-TG-----GTCTTG  3487
             | ||| | |||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||     || |||
Sbjct  3475  AAGCGATACTAAGTTGTAACCCCATCTGGTCGAACAATATCGACAAATGAATTTGTTTTG  3534

Query  3488  TTT--TC--G----GGA-C-TACTTAACAGTTTTAGGGATGCACTTCAACACTTGTTTCT  3537
              ||  ||  |    ||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct  3535  GTTGGTCATGTTTTGGGGCCTACTTAAAAGTTTTAGGGGTGCACTTCAACACCTGTTTCT  3594

Query  3538  TGTGTCATGGGTTGTCAAATTACTTCTCTAACAAAGATTATTTAAGTGAAGTTGTTTCGC  3597
             | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3595  TTTGTCATGGGTTGTCAAATTACTTTTCTAACAAAGATTATTTAAGTAAAGTTGTTTCGC  3654

Query  3598  TTT  3600
             |||
Sbjct  3655  TTT  3657



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 179246487339


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5