BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg480602
Length=1947
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G17200.1 | Symbols: DSK2 | ubiquitin family protein | chr2:7... 2726 0.0
AT2G17190.1 | Symbols: | ubiquitin family protein | chr2:74778... 1934 0.0
> AT2G17200.1 | Symbols: DSK2 | ubiquitin family protein | chr2:7481881-7485240
REVERSE LENGTH=2058
Length=2058
Score = 2726 bits (1476), Expect = 0.0
Identities = 1826/1985 (92%), Gaps = 63/1985 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTACCGAACCGACTTAGAGCTTTT--G---TCTAAATCT-TGATTGAATTTTTCTAGGG 54
||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||
Sbjct 27 TCTACCGAACCGACTCAGAGCTTTTGAGTCTTCTAAATCTCT-ATCGAATTTTTCTAGGG 85
Query 55 TTAGGGCTCCTGATCGATTTCGCGA-----GC--------------TTAGGATCCGAAAT 95
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 86 TTAGGGCTCCTGATCGATTTCGCGAGCTCTGCGATTATTTTAAGTATTAGGATCCGAAAT 145
Query 96 TAG-AATGGGTGGAGAGGGAGGAGATTCGAGTCAGCCGCAGACTGGAGAAGGAGAAGCTG 154
||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 146 TAGAAATGGGTGGAGA--G-GGAGATTCAAGTCAGCCGCAGAGTGGTGAAGGAGAAGCTG 202
Query 155 TCTCCGTGAACATCAGGTGCTCAAATGGCACGAAATTTAGTGTGAAGACGAGCCTTGATT 214
| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 203 TGGCTGTGAACATCAGGTGCTCTAATGGCACGAAATTTAGTGTGAAGACGAGTCTCGATT 262
Query 215 CGACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTGGTGGCTCAGAGCAGCGATGTTCCAGCCAATCAGC 274
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 263 CAACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTGGTGGCTCAGAGCAGCGATGTTCCAGCTAATCAGC 322
Query 275 AACGCTTGATTTATAAGGGTCGGATCCTCAAGGACGATCAAACTCTCCTCAGCTATGGTT 334
| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 AGCGCTTGATTTACAAGGGTCGTATCCTCAAGGACGATCAAACTCTCCTCAGCTATGGTT 382
Query 335 TGCAGGCTGATCACACAATTCATATGGTTCGAGGCTCTGCACCTTCTTCAGCACCACCTT 394
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 TGCAGGCTGATCACACCATTCATATGGTTAGAGGCTCTGCACCTTCTTCAGCACCACCTC 442
Query 395 CTGCTCCGGCTGCGAATGCTGGAAACCAAACCACTGCACCTAGTGTTACTCGAGGGGTTG 454
|||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 CTGCTCCGGC--C----GC---AAGCCAAACCACTGCACCTAGTGTTACTCGAGGGGTTG 493
Query 455 GTTCAGATAATAGCTCGAATCTAGGAGGAGCGGGTCCTGGGGAATCTTTGTTCCCTGGGC 514
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 GTTCAGATAATAGCTCGAATCTAGGAGGAGCGAGTCCTGGGGAATCTTTGTTCCCTGGGC 553
Query 515 TTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAATGCTATGGCTGGGTTATTTGGAGCTGGTCTTC 574
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 TTGGATTTAATCCTCTGGGTGGTGGAAATGCTATGTCTGGGTTATTTGGAGCTGGTCTTC 613
Query 575 CGGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTAGCTCAAAACCCTAATATGATTAGAGATATGA 634
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 614 CGGATCTTGTGCAGACACAGCAACAACTAGCTCAAAACCCTAACATGATTAGAGATATGA 673
Query 635 TGAATACACCAGCCATCCAGAATCTTATGAATAACCCAGAATTTATGAGGAGTATGATTA 694
||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 674 TGAATACTCCAGCCATCCAGAACCTTATGAACAACCCAGAGTTTATGAGGAGTATGATTA 733
Query 695 TGAGTAACCCACAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTTGGCCATGTGCTCA 754
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 734 TGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTTGGTCATGTGCTCA 793
Query 755 ATGACCCAAGCATCCTTCGGCAAACTTTAGAGGCAGCGAGAAACCCAGAGCTTATGCGTG 814
||||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 ATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTAGAAGCGGCAAGAAACCCAGAGCTTATGCGTG 853
Query 815 AAATGATGCGGAATACCGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATGCCTGAGGGATTTA 874
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 AAATGATGCGGAATACTGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATGCCTGAGGGATTTA 913
Query 875 ACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCTTTCTTGAATGCTACTACTATGT 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||
Sbjct 914 ACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCGTTAATGAATGCTACCACTATGT 973
Query 935 CAGGGAATGCTGGAAACAATACGA-GCTCCAATCCGTTTGCTGCTCTCCTGGGAAACCAG 993
| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 974 CCGGGAATGCTGGAAACAATAC-AGGCTCCAATCCATTTGCTGCTCTGTTGGGAAACCAG 1032
Query 994 GGGGTTACTACTCAAGGAAGTGTTGCTTCTAATAACTCTTCCACAACAAATACTGGAACG 1053
||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||
Sbjct 1033 GGGGTCACTACGCAAGGAAGTGATGCTTCTAATAATTCTTCGACACCAAATGCTGGAACG 1092
Query 1054 GGGACTATTCCGAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCTACGGGTGGCCAGACA 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1093 GGGACTATTCCGAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCTACAGGTGGTCAGACA 1152
Query 1114 ACTGTCCCTGGAAGGACCGATGCTGCTGGGGATGCGAGAAGCCCTGGCCTTGGCGGCC-T 1172
|||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |
Sbjct 1153 ACTGCCCCTGGAAGGACAAATGTTGGTGGGGATGCGAGGAGCCCTGGACTTGGTGGCCTT 1212
Query 1173 --TGG----GG--GTCTTGGAGGCCTCGGTGGACTTGGTATGCTTGGAGCGGATTCACCT 1224
||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 GGTGGTCTTGGAAGCCTTGGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTTGGAGCGGATTCACCT 1272
Query 1225 CTTGGTGCCACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAGTTATTGCAAAACCCAGCCATGTCG 1284
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1273 CTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAGTTATTGCAAAACCCAGCCATATCG 1332
Query 1285 CAGATGATGCAAAGCGTATTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAATCTTAAC 1344
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1333 CAGATGATGCAAAGCGTATTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAGTCTTAAC 1392
Query 1345 CCACAACTCCGAAGTATGCTAGATTCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAATCCA 1404
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1393 CCACAACTCCGAAGCATGCTAGATTCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAACCCA 1452
Query 1405 GATTTCCTTCGTCAGTTTAGTTCTCCGGAGATGATGCAGCAAATGATGACTCTACAGCAA 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 GATTTCCTTCGTCAGTTTAGTTCTCCGGAGATGATGCAGCAAATGATGACTCTACAGCAA 1512
Query 1465 TCACTTTTATCTCAGAATAGAAACGCAGCCAGCCAGGATGCGGGGCAAACTGGTGCTGCC 1524
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 TCACT---ATCTCAGAATAGAAATACAGCCAGCCAGGATGCGGGGCAAACTGGTGCTGCC 1569
Query 1525 ACAGGGACGAACAATAACGGGGGGCTGGATTTATTAATGAATATGTTTGGCAGTCTTGGT 1584
||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 ACAGG-A--AA---TAACGGGGGGCTGGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGTCTTGGT 1623
Query 1585 GCTGGCGGCCTGAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCCGAGGAGCGCTATGCTACT 1644
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||
Sbjct 1624 GCTGGCGGCCTGAGTGGCACGAACCAATCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGGTACGCTACT 1683
Query 1645 CAGTTGCAACAGTTACAGGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGAGCATTG 1704
|| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||
Sbjct 1684 CAATTGCAACAGTTGCAGGAAATGGGATTCTATGACAGAGCAGAGAACATTAGGGCGTTG 1743
Query 1705 CTTGCAACCAATGGTAACGTTAATGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATCGGACAG 1764
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1744 CTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATCGGACAG 1803
Query 1765 TAGCATACAGGTTGGTGAACTGAGGTTTCTCCATCTGGCTTCTCAGTTATAGAATAAACA 1824
||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 TAGCATACAGGTTCATGAACTGATGTCTCTCCATCTGGCTTCTCAGTTATAGAATAAACA 1863
Query 1825 GCTTGAATGTGTGTTTT-CAGTAATGAATATATTCATGGAATTCTTAAAA-TTTAATATA 1882
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||
Sbjct 1864 GCTTGAATGTGTGTTTTTCAGTAATGA-TATATTCATCGAATTCATAAAAATTTA-TATA 1921
Query 1883 TGATAGGATCGTGAACTTTGTGGATAGAAAAGCCGCATCAATACGGTATTTGTTTTCAGT 1942
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1922 TGATAGGATCGTGAACTTTGTTGATAGAAAAGCCGCATCAATACGGTATTTGTTATCAGT 1981
Query 1943 GGTCA 1947
|||||
Sbjct 1982 GGTCA 1986
> AT2G17190.1 | Symbols: | ubiquitin family protein | chr2:7477845-7481606
REVERSE LENGTH=2181
Length=2181
Score = 1934 bits (1047), Expect = 0.0
Identities = 1497/1707 (88%), Gaps = 59/1707 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 83 TAGGATCCGAAATTAGAATGGGTGGAGAGGGAGGAGATTCGAGTCAGCCGCAGACTGGAG 142
||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||| |
Sbjct 229 TAGGATCTGAAATTAGAATGGGTGGTGA---AGCAGATTCGAGGCAGCCGCTGACTGCTG 285
Query 143 AAGGAGAAGCTGTCT-CCGTGAACATCAGGTGCTCAAATGGCACGAAATTTAGTGTGAAG 201
|||| | |||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 286 AAGGCGTAGCTGT-TGCCGTGAACGTCAGATGCTCCAATGGCACGAAATTTAGTGTGACG 344
Query 202 ACGAGCCTTGATTCGACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTGGTGGCTCAGAGCAGCGATGTT 261
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||
Sbjct 345 ACGAGCCTCGATTCCACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTAATTGCGCAGAACAGCGATGTG 404
Query 262 CCAGCCAATCAGCAACGCTTGATTTATAAGGGTCGGATCCTCAAGGACGATCAAACTCTC 321
|| || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 405 CCGGCAAATCAGCAGCGTTTGATTTACAAGGGACGTATCCTCAAAGACGATCAGACTCTC 464
Query 322 CTCAGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACAATTCATATGGTTCGAGGCTCTGCACCTTCT 381
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||
Sbjct 465 CTCAGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGTTTTGTGCCTTCT 524
Query 382 TCAGCACCACCTTCTGCTCCGGCTGCGAATGCTGGAAACCAAACCACTGCACCTAGTGTT 441
| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 525 T------CTCCTTCTGCTCCCGCTGCAAATGCTGGAAACCAAACCACTG---C------T 569
Query 442 ACTCGAGGGGTTGGTTCAGATAATAGCTCGAATCTAGGAGGAGCGGGTCCTGGGGAATCT 501
||| || |||||||||| || ||||||| || || |||||| || | ||||||
Sbjct 570 CCTCAAGCGGTTGGTTCAAATGATAGCTCAAACCTCGGAGGA---GG---T---GAATCT 620
Query 502 TTGTTCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAATGCTATGGCTGGGTTATTT 561
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 621 TTGTTCCCTGGCCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAATGCTATGGCTGGATTATTT 680
Query 562 GGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTAGCTCAAAACCCTAATATG 621
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 681 GGATCTGGTCTTCCTGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTAGCTCAGAACCCTAACATG 740
Query 622 ATTAGAGATATGATGAATACACCAGCCATCCAGAATCTTATGAATAACCCAGAATTTATG 681
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 741 ATTAGAGAGATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAATCTTATGAACAACCCAGAATTTATG 800
Query 682 AGGAGTATGATTATGAGTAACCCACAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTT 741
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 801 AGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTT 860
Query 742 GGCCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGGCAAACTTTAGAGGCAGCGAGAAACCCA 801
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||
Sbjct 861 GGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTAGAAGCGGCGAGAAACCCA 920
Query 802 GAGCTTATGCGTGAAATGATGCGGAATACCGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATG 861
||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 GAGCTTATGCGTGAAATGATGAGAAATACTGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATG 980
Query 862 CCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCTTTCTTGAAT 921
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 981 CCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCGTTAATGAAT 1040
Query 922 GCTACTACTATGTCAGGGAATGCTGGAAACAATACGAGCTCCAATCCGTTTGCTGCTCTC 981
||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1041 GCTACCACTATGTCCGAGAATGCTGGAAACAATACGAGCTCTAATCCATTTGCTGCTCTT 1100
Query 982 CTGGGAAACCAGGGGGTTACTACTCAAGGAAGTGTTGCTTCTAATAACTCTTCCA-CAAC 1040
||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| | || | || |
Sbjct 1101 CTGGGAAACCAGGGGGTTACTACACAAGGAAGCGATACTTCTAATAA-TATTTCGGCACC 1159
Query 1041 AAATACTGGAACGGGGACTATTCCGAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCTAC 1100
||| ||| |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1160 GAATGCTGAAACGGGTAC-A--CCTAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCCAC 1216
Query 1101 GGGTGGCCAGACAACTGTCCCTGGAAGGACCGATGCTGCTGGGGATGCGAGAAGCCCTGG 1160
|| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | | | | |||
Sbjct 1217 GGCTGGCCAGACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGCTG--G---A--CTTG--G---TGG 1264
Query 1161 CCTTGGCGGCCTTGGGGGTCTTGGAGGCCTCGGTGGACTTGGTATGCTTGGAGCGGATTC 1220
||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct 1265 TCTTGG-----T-GGG---CTTGGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTGGGAGCGGACTC 1315
Query 1221 ACCTCTTGGTGCCACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAGTTATTGCAAAACCCAGCCAT 1280
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||
Sbjct 1316 ACCTCTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAAATACTGCAAAACCCCGCTAT 1375
Query 1281 GTCGCAGATGATGCAAAGCGTATTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAATCT 1340
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1376 GTCGCAGATGATGCAAAGCGTACTTTCCAATCCACAGTACATGAATCAGCTTATGAGTCT 1435
Query 1341 TAACCCACAACTCCGAAGTATGCTAGAT-TCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGA 1399
|||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 TAACCCACAACTCCGAAGCATGCTAGATAT-GAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGA 1494
Query 1400 ATCCAGATTTCCTTCGTCAGTTTAGTTCTCCGGAGATGATGCAGCAAATGATGACTCTAC 1459
| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1495 ACCCTGATTTCCTTCGCCAGTTTAGCTCTCCCGAGATGATGCAGCAAATGATGTCTCTAC 1554
Query 1460 AGCAATCACTTTTATCTCAGAATAGAAACGCAGCCAGCCAGGATGCGGGGCAAACTGGTG 1519
| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| | |||||||||||
Sbjct 1555 AACAATCACTTTTCTCTCAGAATAGGAACACGGCTGGCCAGGATCCTACGCAAACTGGTG 1614
Query 1520 CTGCCACAGGGACGAAC-AATAACGGGGGGCTGGATTTATTAATGAATATGTTTGGCAGT 1578
|||| |||||||| | | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1615 CTGCGACAGGGAC-AGCCAATAACGGAGGACTAGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGC 1673
Query 1579 CTTGGTGCTGGCGGCCTGAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCCGAGGAGCGCTAT 1638
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |
Sbjct 1674 CTTGGTGCTGGCGGCCTAAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGATTT 1733
Query 1639 GCTACTCAGTTGCAACAGTTACAGGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGA 1698
|| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 GCGACTCAGTTGCAACAGTTGCAAGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGG 1793
Query 1699 GCATTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAATGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATC 1758
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 GCTTTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATT 1853
Query 1759 GGACAGTAGCATACAGGTTGGTGAACT 1785
|| ||||| |||||||| | | |||||
Sbjct 1854 GGCCAGTAACATACAGGATCGCGAACT 1880
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 96435246945
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5